Solemne 3 Biocel Parte 1

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Unidad 3

Biología Celular
Estructura del ADN y del ARN
La importancia que tienen los ácidos nucleicos en nuestras células tiene que
ver con la información genética y actualmente el flujo de ésta se identifica a
través del dogma de la biología molecular.
El material genético se aloja en el ADN el cual se encuentra en las células,
esta información es traspasada a moléculas de ARN
Los tres tipos de ARN participan activamente en la síntesis de proteínas
• ARNm (mensajero): llega al ribosoma, llevando la ‘’receta’’ con la cual
se tiene que construir la proteína.
• ARNr (ribosomal): sintetiza subunidades de ribosomas, actúa catalizando
la síntesis de proteínas.
• ARNt (transferencia): llega al ribosoma aportando los aminoácidos que
se utilizaran en la construcción de la proteína.
• Formado por nucleótidos: adenina, timina, guanina y citosina.
• Cada nucleótido está formado por:
Azúcar (desoxirribosa) + grupo fosfato + base nitrogenada
El grupo fosfato permite ir anclando uno tras otro los nucleótidos a través del
enlace fosfodiéster.
• La cadena de nucleótidos forma una doble hélice con
otra cadena de nucleótidos que es complementaria,
las cuales están unidas por puentes de hidrogeno.
• Los nucleótidos se unen entre si formando una
cadena con polaridad química, con dos extremos
diferenciales (extremo 5’ y 3’)
• El extremo 5’ se reconoce porque queda un grupo
fosfato sin anclarse a otro azúcar.
• El extremo 3’ se reconoce porque el azúcar no forma parte de otro enlace
fosfodiéster y por aquí se agregarán nuevos nucleolos.

1. Dos largas cadenas polinucleotídicas enrolladas alrededor de un eje central,


formando una doble hélice enrollada hacia la derecha (dextrógira).
2. Dos cadenas antiparalelas.
3. Bases apiladas unas sobre otras.
4. Emparejamientos A-T y G-C
5. Cada vuelta contiene 10 bases.
6. Surco mayor y surco menor.
7. Doble hélice de 2nm de diámetro.
• El ADN codifica información en el orden o secuencia de los nucleótidos a
lo largo de la cadena (genes).
• Cada una de las letras (A, T, G, C) puede considerarse como una letra de
un alfabeto de cuatro letras utilizado para escribir mensajes biológicos
(código genético).
• La secuencia de nucleótidos de un gen deletrea la secuencia de aminoácidos
de una proteína.
• El conjunto completo de información genética de un organismo se denomina
Genoma y contiene toda la información de todas las proteínas y moléculas
de RNA que va a sintetizar dicho organismo.
• La célula duplica su genoma en cada división celular para transmitirlo a las
células hijas.

En las células eucariotas el ADN está confinado en el núcleo y en el se presenta


en forma de cromatina.
Existen 2 tipos de cromatina en el núcleo:
1. Eurocromatina: representa la cromatina descondensada durante la interfase.
2. Heterocromatina: representa una forma condensada de cromatina que no
altera su nivel de compactación durante el ciclo celular.
• Proteínas que se unen a ADN Eucariota: proteínas Histonicas y proteínas no
Histonicas.
• ADN + Proteínas forman la cromatina
• Las histonas son las responsables del primer nivel de organización del
cromosoma: los nucleosomas.

Los nucleosomas suelen estar empaquetados juntos formando una fibra


compacta de cromatina de 30nm de diámetro.

El empaquetamiento del ADN forma la


cromatina, la cual se puede encontrar en
forma de Eucromatina o Heterocromatina
(altamente condensada)
Cada molécula de ADN que forma un cromosoma lineal debe contener un
centrómero, dos telómeros y orígenes de replicación
Telómeros: son los extremos de los cromosomas, no contienen genes, son
secciones que permiten proteger al cromosoma de la perdida de información
cuando un cromosoma se acorta.
Orígenes de replicación: puntos de separación de la doble hélice y es en donde
se comenzará la copia del material genético
Centrómero: es una secuencia por donde se mantendrán unidas dos hebras de
ADN (mientras estén unidas se llaman cromátidas hermanas)

A lo largo de la vida de una célula los cromosomas adoptan diferentes estados,


dependiendo de las necesidades.

• Almacenamiento de información
• Codificación de proteínas
• Autoduplicación
• Transmisión de información genética a la descendencia
• Es la identificación de cada organismo
• Variabilidad genética y adaptación mediante mutaciones
• Ácido nucleico más abundante de la célula, una célula típica contiene 10
veces más RNA que DNA
• Cadena de polinucleótidos (monocatenaria)
• Nucleótidos con el Azúcar ribosa
• EL nucleótido timina es reemplazado por Uracilo
• Varios tipos de ARN: ARNt, ARNr, ARNm
• Se piensa que pudo haber sido el primero biopolímero en formarse
• Almacenamiento de información (en algunos virus)
Tipos de ARN Funciones
ARNm Codifican proteínas
ARNr Forman estructura básica de los ribosomas y catalizan la
síntesis de proteínas
ARNt Cruciales en la síntesis de proteínas como adaptadores entre el
ARNm y los aminoácidos
ARNsn Participan en varios procesos nucleares, incluyendo la
maduración (ayuste) del pre-ARNm
ARNsno Participan en el procesamiento y modificación química de los
ARNr
ARNsca Participan en la modificación de ARNsno y ARNsn
ARNmi Generalmente regulan la expresión génica bloqueando la
traducción de ARNm selectivos
ARNsi Anulan la expresión de un gen mediante degradación directa de
ARNm selectivos y el establecimiento de estructuras compactas
de cromatina
Otros ARN no Como la síntesis de los telómeros, la inactivación del
codificante cromosoma x y el transporte de proteínas al ER
Estructuras del ARN
Aunque el ARN consiste en una sola cadena continua, a menudo se pliega
sobre sí mismo para producir moléculas con extensos segmentos con enlaces
dobles y una estructura tridimensional compleja.
Estructura secundaria:
REPLICACIÓN DEL ADN
Es el proceso según el cual una molécula de ADN de doble hélice da lugar a
otras dos moléculas de ADN con la misma secuencia de bases, es decir, se
genera una copia del material genético en cada división celular.
Cada cadena de ADN puede actuar como un molde para la síntesis de una
nueva cadena complementaria. Para esto La molécula de ADN se abre por el
medio y las bases apareadas se separan a nivel de los puentes de hidrógeno.

Características generales de la
R E P L I C A C I Ó N

La doble hebra de ADN actúa como molde de su


propia duplicación, por lo tanto, cada una de ellas
especifica la síntesis de una cadena hija
complementaria.

Ambas hebras se van alargando progresivamente, gracias a las burbujas de


replicación.
La forma en a cual se va alargando la hebra nueva es a través de la colocación
de nucleótidos nuevos en el extremo 3’ a través de un primer o cebador.
ADN polimerasa: se encarga de la adición de nucleótidos
Enzimas Reacciones que catalizan

ADN-polimerasa α Sintetiza los fragmentos de ADN discontinuos a partir del


cebador y tiene actividad primase

ADN-polimerasa β Rellena los huecos dejados por el cebador (ambas hebras)


y repara errores como un segundo sistema de reparación.

ADN-polimerasa δ Sintetiza la hebra continua a partir del cebador (extremo


3’), necesita de PCNA y actividad exonuecleasa

ADN-polimerasa  Replicación de ADN mitocondrial, necesita de PCNA

ADN-polimerasa  Reemplaza a ADN-polimerasa δ en procesos de reparación

ADN-polimerasa  Replicación y reparación durante el desarrollo embrionario


(ciclo del embrión temprano)

Esta en una zona interna del cromosoma, las proteínas iniciadoras de la


replicación reconocen secuencias de ADN en los orígenes de replicación y
separan las dos cadenas de la doble hélice para llevar a cabo la síntesis de
ADN.
Las horquillas o burbujas de replicación se alejan en direcciones opuestas
(bidireccionalmente) desde múltiples orígenes de replicación en un cromosoma
eucarionte hasta que se juntan entre sí separándose completamente los dos
cromosomas, en eucariontes quedan unidas por el centrómero.

La replicación progresa en dos direcciones a partir de un punto: Horquillas o


burbujas de replicación
Solo se agregan nucleótidos nuevos en sentido 3’, esto provoca la restricción
para la dirección de la hebra nueva.
En el caso de la síntesis de la cadena atrasada se forma en dirección de 5’ a
3’ pero se agregan los nucleótidos retrocediendo, es decir, de 3’ a 5’.

Una hebra se replica de forma directa = hebra


guía o líder (continua)
La otra hebra se replica formando fragmentos de
Okazaki = hebra rezagada (hebra discontinua),
esto pasa ya que se agregan los nucleótidos
retrocediendo
Lo amarillo de la foto es el primer

La hebra continua, necesita solo un primer, en cambio, la hebra discontinua


necesita un cebador por cada hebra de Okazaki.
ETAPAS DE LA REPLICACIÓN

• Reconocimiento de orígenes de replicación por enzimas (helicasa).


• Separación de hebras y formación de la horquilla de replicación.
• Posicionamiento de maquinaria enzimática.
Comienza en el punto de origen de la replicación
•ARS (secuencia de replicacion autonoma) → eucariontes (+ ORC)
•OriC → procariontes
Replisomas: unidad proteíca necesaria para construir nuevas herbras en un
punto de crecimiento. (llevan a cabo la replicación)
ADN polimerasas: enzimas que crean las hebras.
ADN helicasa: rompen los puentes de hidrogenos que unen a ambas hebras
del ADN
Proteína SSB: sujetan a la monohebra para que no vuelva a cerrarse la hebra.
ADN primasa: se encuentra anclada a la helicasa, construye lobos cebadores
Primasa + Helicasa: primosoma
ADN topoisomerasas: estan más delante del punto de cremiciento, deshace
las vueltas adicionales del ADN por efecto del estiramiento de la helice que
ocurre en la burbuja.
ADN ligasa: enzima que une a los fragmentos que estan recien sintetizados,
es decir, crea el último enlace fosfodiester entre los nucleótidos adyacentes
en una hebra de ADN.
• Crecimiento bidireccional de las horquillas de replicación.
• Replicacion semiconservativa, semidiscontinua, coordinada.
Fragmentos de Okazaki
Cada uno de unos 200 nucleotidos aproximadamente, se encuentran en la
hebra discontinua, corresponden al ARN cebador o partidos más el fragmento
sintetizado.
La AND ligasa va a ir uniendo los fragmentos.

• Reconocimiento de señales de terminación.


• Desensamble de replisomas.
En los telómeros existen secuencias de señales de termino, que implica el
desensamble de todo el replisoma, de esta manera, obtenemos un cromosoma
duplicado completamente en donde las dos cromátidas se encuentran unidas
por el centrómero.
Producto del efecto que tiene el uso de partidores para construir la replicación
al final de los cromosomas provocan un efecto de acortamiento, que ciclo tras
ciclo van acortando el cromosoma.
Enzima telomerasa: permite alargar los telomeros para hacer frente a la
perdida de extremos cromosomicos por cada ciclo de replicación. Evitando la
perdida de información genética.

NS
Este dogma dice que la información que hay
contenida en el ADN será traspasada al ARN a través
del proceso de transcripción y luego esta molécula
de ARN participa en el procedo de traducción para la
formación de proteínas.

¿Qué es un Gen?
Unidad de información del ADN que tiene suficiente información para sintetizar
una proteína.
Estructura de un Gen eucarionte:
Amplificadores o Enhancers: potencian la frecuencia con la cual el Gen va a
ser transcrito.
Silenciadores o inhibidores: detienen la transcripción.
Estos dos anteriores son reguladores
Promotor: región rio arriba, ya que esta antes del inicio de la región codificante.
Permite identificar cual es el gen que se tiene que transcribir, da inicio a la
transcripción.
• Secuencias de inicio: caja TATA 25 nucleótidos y caja CAAT 75 nucleótidos.
Exones: regiones codificantes, tienen información.
Al finalizar, el ultimo exón tiene una señal de término que permite identificar
la detención de la lectura (cola poli-A)
Intrones: no codificantes, no contienen información para sintetizar una proteína
ARN POLIMERASA
• ARN polimerasa I: síntesis, reparación y revisión. Sintetiza precursores de
ARN ribosómico. Actúa en el nucleolo.
• ARN polimerasa II: reparación, Sintetiza precursores de ARN mensajero
microARNs y otros tipos de ácido ribonucleico. Esta polimerasa es el tipo
más estudiado, y se requieren factores de transcripción para que se una a
los promotores del ADN.
• ARN polimerasa III: sintetiza ARN de transferencia ARN ribosómico de 5S y
otros pequeños ARN (ARNpequeños) encontrados en el núcleo celular
(ARNp nucleares) y en el citoplasma (ARNp citoplasmáticos)
• ARN Polimerasa mitocondrial: El ARNPmt interviene en la transcripción y
replicación del genoma mitocondrial
*Adicionalmete a las ARNP eucariotas mencionadas, en plantas se encuentran
la polimerasa IV y polimerasa V para reparación en condiciones únicas y síntesis
de ARNip
TRANSCRIPCIÓN
Síntesis de moléculas de ARN a partir de una de las cadenas del ADN, a esta
cadena se denomina molde, templado, complementario o no codificadora y
va en dirección de 3’ a 5’, en cambio a la otra hebra se le denomina
codificadora o no complementaria.
• Unión entre sí de nucleótidos A, U, C, G, ordenados de acuerdo con la
secuencia de los nucleótidos complementarios en el ADN
• La transcripción se va armando de 5’ a 3’.
La síntesis de ARN no requiere cebador (primer o partidor), sino que se inicia
en secuencias denominadas PROMOTORES.
PROMOTORES: permiten el anclaje de proteínas llamadas factores de
transcripción la cuales tienen por función marcar el lugar del gen que se
necesita.
Factores de transcripción: cuando se anclan uno de estos separa la doble hélice
y permite el anclaje del ARN polimerasa en la burbuja, luego de esto la ARN
polimerasa sigue avanzando.
Para que avance la ARN polimerasa requiere ADN templado, ribonucleótidos
(ATP, GTP, UTP, CTP), además de Mg+2
ETAPAS

1° I N I C I O DE LA TRANSRIPCIÓN
La ARN polimerasa se une con el promotor, indicando el inicio de la
transcripción.
En procariontes existe solo un tipo de ARN polimerasa que permite transcribir
todos los tipos de ARN.
El promotor es reconocido por la subunidad sigma y termina en la región Stop

En eucariontes existen 3 tipos distintos de ARN polimerasa


1. ARN polimerasa I: transcribe el ARNr (ribosomal)
2. ARN polimerasa II: transcribe el pre-ARNm y algunos ARNsn, el promotor
de esta en la secuencia llamada caja TATA y el sitio de inicio de la
transcripción es la secuencia TAC.
3. ARN polimerasa III: transcribe el ARNt.
2° E L O N G A C I Ó N DE LA TRANSCRIPCIÓN
En la burbuja de transcripción comienza la elongación.
Después de unirse al promotor, el ARN polimerasa abre una región localizada
en la doble hélice, de forma que expone los nucleótidos de ambas cadenas de
una pequeña zona del ADN (gen).
Una de las dos cadenas expuestas del ADN actúa como patrón para el
apareamiento de las bases complementarias y se inicia la formación de una
cadena de ARN, la cual va creciendo de 5´a 3’
Necesita de factores de elongación que son proteínas que ayudan a estabilizar
el ADN mientras va avanzando la polimerasa, evitando que se enrolle.
Se forman de los tripletes de ADN tripletes complementarios de ARNm.
Una sucesión de 3 nucleótidos en una molécula de ARNm se llama codón.
La etapa finaliza al encuentro de la enzima con la señal de termino.
3° T E R M I N A C I O N DE LA TRANSCRIPCIÓN
En eucariontes existen diversas señales de terminación en el ADN molde que
son secuencias formadas por uno de los siguientes tríos de nucleótidos: ATT,
ACT O ATC los que desencadenan la separación de la enzima ARN polimerasa
de la cadena molde y del ARN transcrito.

En procariontes existe el punto stop o de término y una vez que se detiene la


polimerasa se puede ayudar en algunos casos del Factor rho que separa el
ARN de la cadena molde.

PROCESO DE MADURACIÓN
Es un proceso exclusivo de eucariontes en donde los distintos ARN transcritos
llamados transcritos primarios son modificados, esto ocurre antes de que sean
transportadas al citoplasma (en donde ocurre la traducción).

PRE- ARNm ARNm

a) Adición del CAP: un nucleótido modificado de guanina (CAP) se añade al


extremo 5’ del mensajero. Esta ‘’protección’’ es imprescindible para la unión
del ARNm al ribosoma y protege al ARNm de la degradación por
exonucleasas citoplasmáticas.

b) Poliadenilación: en el extremo 3’ del ARNm hay una secuencia de señal a


la que se unen factores específicos y la enzima poli-A polimerasa, la cual
agrega una cola de adeninas. La longitud de esta cola determina el tiempo
de vida del ARNm en el citoplasma.
Nucleasas: degradan el ARNm, por lo que una cola más larga del ARNm
alarga la vida.
c) Corte y empalme o splicing: el ARNm sufre procesos de corte y
eliminación de secuencias que no llevan información llamadas intrones, y el
posterior empalme de los exones, secuencias que si llevan información.
Pasos:
1) Se unen al ARNm inmaduro unas pequeñas partículas de ARN nucleares
asociadas con proteínas denominadas snRNP.
2) Las snRNP se unen a secuencias cortas ubicadas entre los intrones y los
exones.
3) Se añaden más proteínas y forman un gran complejo con el ARN que se
denomina spliceosoma.

Los ARN son exportados al citoplasma, atraviesan el complejo del poro de la


carioteca con ayuda de factores de exportación, si la célula se arrepiente de
enviar al ARN al citoplasma, simplemente le niega estos factores de
exportación.

Regulación de la transcripción
Factores de transcripción: se encargan de regular la expresión de los genes
constitutivos, los cuales se ocupan de la síntesis de péptidos que se utilizan
de manera continua en las células.
TRADUCCIÓN
La síntesis de las cadenas polipeptídicas es la segunda etapa observada en el
dogma central. Es el proceso por el cual la información lineal (nucleótidos), se
traduce en información tridimensional (aminoácidos).

En eucariontes y procariontes el inicio de la traducción ocurre en el citoplasma.

El ribosoma está compuesto por una subunidad mayor y otra menor las cuales
están compuestas por ARNr (ribosómico) y proteínas.
En eucariontes las subunidades ribosomales se ensamblan en el nucleolo y se
exportan hacia el citoplasma a través de los poros nucleares.
La subunidad menor presenta el sitio de reconocimiento y unión al ARNm y la
mayor posee la ribozima peptidil transferasa, la cual cataliza la unión entre los
aminoácidos, también se reconocen 3 sitios para los ARNt
• Sitio P (peptidil), punto de elongación de la cadena polipeptídica.
• Sitio A (aminoacil), entrada de un ARNt cargado con su aminoácido.
• Sitio E (exit), punto de salida del ARNt solo.

Son los traductores del mensaje genético del ARNm, tienen forma semejante
a un trébol y dos sitios de unión, el anticodón que es una secuencia de 3 bases
por la cual se une por complementariedad de bases a un codón específico del
ARNm y el sitio aceptor de aminoácidos, este siempre posee una secuencia de
nucleótidos CCA y se une con uno de los 20 aminoácidos.
Cada aminoácido se activa por su aminoacil-
ARNt sintetasa correspondiente, hay 20 enzimas
distintas, una para cada aminoácido.
La energía usada en la carga del aminoácido a
su correspondiente ARNt queda depositada en la
unión química de este aminoácido y el ARNt.
Esta energía será utilizada posteriormente por la
actividad de la peptidil transferasa presente en
la subunidad mayor del ribosoma para la
formación del enlace peptídico.
Aminoácido + ATP + ARNt Aminoacil-ARNt- + AMP +PPi

1 aminoacil ARNt sintetasa para cada aminoácido en Eucariontes


1º: Selección por especificidad
2º: Edición del error por degradación hidrolítica
1 error cada 40.000 aa incorporados

Se hace mediante la síntesis de proteínas, en donde el ARN de transferencia,


hace interactuar su anticodón con el codón del ARN mensajero
El ARN mensajero es una secuencia de nucleótidos, la cual se va leyendo de 3
en 3, esos tripletes, se llaman codones, y cada codón interactúa con un
anticodón del ARN de transferencia.
En el sitio de la traducción, el ARN de transferencia,
solo se queda si se reconoce el codón con el anticodón.
Entre ellos, se generan puentes de hidrogeno si es que
las bases nitrogenadas son complementarias, para esto,
hay un factor de elongación que chequea el anclaje.
ETAPAS DE LA TRADUCCIÓN

En el sitio de la traducción, el ARN de transferencia, solo se queda si se


reconoce el codón con el anticodón. Entre ellos, se generan puentes de
hidrogeno si es que las bases nitrogenadas son complementarias, para esto,
hay un factor de elongación que chequea el anclaje.
• COMPLEJO DE PREINICIACION
Lo primero que se va a crear en el citoplasma
es el complejo de pre-iniciación, que es un
complejo que todavía no presenta el ARN
mensajero, está hecho del ARN de
transferencia iniciador y la subunidad menor
del ribosoma. Estos se anclan gracias a un
factor de iniciación (EIF2).
Una vez se unen, llega el ARN mensajero, que
viene transportado por factores de iniciación
de la traducción.
• FACTOR DE INICIACION ESPECIAL
En el extremo 5’, se le ancla a la caperuza (cuadrito
rosado en la imagen) un factor de iniciación especial, que
va a ayudar a encajar adecuadamente el ARN mensajero a
la subunidad menor. Cuando se juntan, se obtiene el
complejo de iniciación.
Luego, la subunidad menor, se mueve hacia el codón de
inicio AUG. Ahí, interactúa el ARN de transferencia
iniciador con el primer codón.
Luego, se van todos los factores de iniciación, se ubica la
subunidad mayor, completando el ribosoma e inicia la
elongación.
Cuando está posicionada la subunidad mayor con el primer
ARN en el sitio P, está libre el sitio A para que llegue un
nuevo ARN de transferencia con el segundo aminoácido.
Con los aminoácidos lado a lado, la subunidad mayor crea
el enlace peptídico en un sitio catalítico que está controlado
por el ARN ribosomal
Una vez generado el enlace peptídico, se separa la unión de
la metionina y el ARN de transferencia, entonces el
ribosoma se va a mover un espacio más allá, desplazando
automáticamente al ARN de transferencia morado al sitio
de salida, y al ARN de transferencia azul al sitio P, liberando
el sitia A para que llegue un nuevo aminoácido
Así sucesivamente, se va a ir translocando el ribosoma de codón en codón,
permitiendo la salida de los ARN de transferencia que ya están sin aminoácido.

El ribosoma se va a ir desplazando hasta que llegue a un


codón de termino, recordar que hay tres posibles:
UAG – UGA – UAA
Cada uno de los codones de termino va a llamar a una
proteína llamada factor de liberación, ésta es una molécula
que tiene una forma parecida a un ARN de transferencia,
por eso cabe sin problema en el sitio A, a ese fenómeno se
le llama camuflaje molecular .
Luego, se libera el péptido y llegan otras proteínas que
ayudan a desensamblar más aun el sistema de traducción:
separan a la subunidad mayor, sacan al ARN mensajero y se
separa el ultimo ARN de transferencia del ribosoma.
En procariontes tienen más de un factor de liberación posible,
tienen tres factores, y se les llama RFs 1, 2 y 3

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