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Anaconda

El documento describe los pasos para instalar Anaconda y paquetes adicionales como nglview y pandas. Primero se descarga e instala Anaconda de acuerdo al sistema operativo. Luego se abre Anaconda Navigator para acceder a CMD.exe Prompt y así instalar paquetes usando comandos como "conda install". Algunos paquetes requieren activación adicional en Jupyter Notebook antes de su uso. Finalmente, se cierra la terminal y se abre Jupyter Notebook para comenzar a programar en Python.

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Karina Albán
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El documento describe los pasos para instalar Anaconda y paquetes adicionales como nglview y pandas. Primero se descarga e instala Anaconda de acuerdo al sistema operativo. Luego se abre Anaconda Navigator para acceder a CMD.exe Prompt y así instalar paquetes usando comandos como "conda install". Algunos paquetes requieren activación adicional en Jupyter Notebook antes de su uso. Finalmente, se cierra la terminal y se abre Jupyter Notebook para comenzar a programar en Python.

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En primer lugar, se ingresar a la página web

https://www.anaconda.com/products/individual y se dirige a la zona de instaladores. Se


procede a descargar e instalar la aplicación correspondiente a su sistema operativo, ya
sea Windows, MacOS y Linux. Una vez instalada la aplicación, se debe abrir el acceso
directo que se encontrará en el escritorio o en el menú de inicio. Caso contrario, se
dirige al buscador para encontrar la aplicación. Tras ejecutar Anaconda Navigator, se
abrirá una pantalla como esta. Anaconda es un programa de código abierto que abarca
una serie de aplicaciones, librerías y conceptos diseñados para el desarrollo de la ciencia
de datos. Bien, anaconda nos permite programar en Python, para lo que utilizaremos
Jupyter Notebook y para la instalación de paquetes, CMD.exe Prompt
_______________________________________________________________---
Para la instalación de los paquetes, debemos ingresar a CMD.exe Prompt por medio de
Anaconda Navigator.
Por ejemplo, para instalar el paquete nglview el cual sirve para observar estructuras
proteicas en 3D. Utilizamos el código: conda install nglview -c conda-forge. Se debe
escribir este código en la terminal y se da ENTER. A continuación, en la pantalla se
observará que el paquete se encuentra recolectando la información necesaria para su
instalación.
Una vez recolectada la información, se acepta en la terminal la instalación escribiendo
yes/y y dando ENTER.
_____________________________________________________________________
Cuando la instalación haya culminado, la ruta del usuario aparecerá nuevamente en la
terminal. Algunos paquetes necesitan de su activación para ser usado en jupyter
notebook. Tal es el caso de nglview, por lo que se debe ejecutar el código jupyter-
nbextension enable nglview --py –sy, en la terminal.
En la figura de la derecha inferior podemos ver la interfaz de jupyter.
Para instalar cualquier paquete para ser usado en Anaconda se repetir el proceso. Para
encontrar el código de instalación de diversos paquetes y su disponibilidad para
determinado sistema operativo nos dirigimos al siguiente enlace:
https://anaconda.org/anaconda
Algunos ejemplos de paquetes:
conda install -c anaconda pandas
conda install -c anaconda biopython
Estos paquetes son utilizados para el análisis de secuencias.
Por último, se cierra la terminal y se ejecuta Jupyter notebook. De inmediato se abrirá
una ventana en el navegador predeterminado.

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