Síntesis Proteínas - Parte I

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Traducción

generalidades

• Las proteínas son los productos finales de la mayoría de las rutas


de la información.
• Las proteínas se sintetizan en respuesta a las necesidades
celulares del momento, se transportan hasta la localización
celular adecuada y se degradan cuando ya no son necesarias.
• Muchos de los componentes y de los mecanismos utilizados por
la maquinaria de la síntesis proteica están muy conservados
desde bacterias hasta eucariotas superiores.
• La síntesis proteica consume hasta el 90% de la energía química
utilizada por la célula en todas las reacciones biosintéticas.
• Las células tienen desde unas cuantas hasta millares de copias de
cada tipo de proteína y de RNA.
• A pesar de la complejidad de la maquinaria de síntesis, en E. coli
(a 37C) se sintetiza una cadena polipeptídica completa de 100
residuos en unos 5 segundos.
• La síntesis de los millares de proteínas diferentes de una célula
está estrechamente regulada para que sólo se fabrique la
cantidad necesaria en las condiciones metabólicas imperantes
generalidades

• Tres importantes descubrimientos allanaron el camino


hasta el conocimiento presente de la síntesis proteica:
✓ Las proteínas se sintetizan en los ribosomas
✓ Los aminoácidos se unen al tRNA y forman aminoacil-tRNA
✓ El tRNA traduce la secuencia nucleotídica de un mRNA a la
secuencia de aminoácidos de un polipéptido.
El código genético

• El código de cuatro letras del DNA en grupos


de 2 sólo puede dar 42=16 combinaciones
diferentes, que no son suficientes para
codificar 20 aminoácidos.
• Sin embargo cuatro bases en grupos de 3
pueden dar 43=64 combinaciones diferentes
• Algunas características esenciales del código
genético fueron establecidas rápidamente
mediante experimentos genéticos.
• Un codón es un triplete de nucleótidos que
codifica un aminoácido específico. La
traducción tiene lugar de manera que los
tripletes son leídos sucesivamente y sin
solapamiento.
• Un primer codón específico en la secuencia
determina el marco de lectura, en el que un
nuevo codón empieza cada 3 nucleótidos.
• La secuencia de aminoácidos de una proteína
está definida por una secuencia lineal de
tripletes contiguos.
El código genético

• Cualquier secuencia de DNA de cadena sencilla o de mRNA tiene 3 posibles marcos de lectura.

• Cada marco de lectura da una secuencia diferente de codones, pero sólo una es probable que
codifique una proteína determinada.
• Mediante la utilización de diferentes mRNA artificiales producidos por la polinucleótido
fosforilasa a partir de mezclas de partida diferentes de ADP, GDP, UDP y CDP, se identificó la
composición de bases de los tripletes que codifican la casi totalidad de los aminoácidos.
• Los ribosomas aislados de E. coli fijan un aminoacil-tRNA específico en presencia del
correspondiente polinucleótido mensajero sintético. Ej. Ribosomas incubados con poli(U) y
fenilalanil-tRNAPhe fijan ambos RNA, pero si los ribosomas se incuban con poli(U) y algún otro
aminoacil-tRNA, el aminoacil-tRNA no se fija porque no reconoce los tripletes UUU del poli(U).
• De esta forma se determinó qué aminoacil-tRNA se fijaba a unos 50 de los 64 codones de
tripletes posibles. Con algunos codones, o no se fijaba ningún aminoacil-tRNA o se fijaba más
de uno.
El código genético

• Los resultados de muchos experimentos permitieron la asignación de 61 de los 64 codones


posibles. Los otros 4 se identificaron como codones de terminación, porque destruían los
patrones de codificación de aminoácidos cuando estaban presentes en los polímeros de RNA
sintético.
• El significado de todos los tripletes fue establecido ya en 1966.
El código genético

• Los codones son la clave de la traducción de la información genética, que hace posible la
síntesis de proteínas específicas
• El marco de lectura se establece cuando empieza la traducción de una molécula de mRNA y se
mantiene mientras la maquinaria de síntesis lea secuencialmente un triplete tras otro.
• Si el marco de lectura inicial se desplaza una o dos bases o si la traducción pasa por alto un
nucleótido en el mRNA, todos los codones siguientes estarán fuera de registro, dando una
proteína “sin sentido” con una secuencia de aminoácidos alterada.
• Varios codones tienen funciones especiales
✓ Codón de inicio AUG. Es la señal más común del principio de las
cadenas polipeptídicas. También codifica Met en posiciones
internas.
✓ Codones de terminación UAA, UAG y UGA. Normalmente señalan
el final de la síntesis de un polipéptido y no codifican ninguno de
los aminoácidos conocidos.
✓ Uno de cada 20 codones de cada marco de lectura es un codón
de terminación. Si se encuentra un marco de lectura sin un codón
de terminación en 50 o más codones, se denomina marco de
lectura abierto (ORF). Los marcos de lectura abiertos largos
normalmente corresponden a genes que codifican proteínas.
• El código genético es degenerado: un aminoácido determinado
puede venir especificado por más de un codón.
• El código genético es casi universal
Algunos tRNA reconocen mas de un codón

• Cuando un aminoácido es especificado por varios


codones, la diferencia entre ellos se encuentra,
normalmente, en la tercera base (en el extremo
3’). Los codones de casi todos los aminoácidos se
pueden simbolizar como XYAG o XYUC
• Las dos primeras letras de cada codón son los
determinantes primarios de la especificidad
• Los RNA de transferencia se aparean con los
codones del mRNA mediante una secuencia de
tres bases del tRNA denominada anticodón.
• La primera base del codón del mRNA se aparea
con la tercera base del anticodón
• Crick determinó que la tercera base de la mayoría
de los codones se aparea débilmente con la
correspondiente base de los anticodones.
• Este fenómeno lo denominó balanceo, creando
un conjunto de cuatro relaciones denominadas
hipótesis del balanceo
Hipótesis del balanceo

1. Las primeras dos bases de un codón del mRNA


siempre forman pares de bases fuertes del tipo
Watson-Crick con las bases correspondientes del
anticodón del tRNA, y son responsables de la
mayor parte de la especificidad del código.
2. La primera base del anticodón (leído en la
dirección 5’-3’ y apareado con la tercera base del
codón) determina el número de codones
reconocidos por el tRNA.
✓ Cuando la primera base del anticodón es C o A, el
apareamiento es específico y sólo un codón es
reconocido por el tRNA
✓ Cuando la primera base es U o G, la unión es menos
específica y pueden leerse 2 codones
3. Cuando un aminoácido es especificado por varios
codones diferentes, los codones que difieren en
cualquiera de las dos primeras bases requieren
tRNA diferentes
4. Para traducir los 61 codones se requiere un
mínimo de 32 tRNA (31 para codificar los
aminoácidos y 1 para el inicio)
Sintesis de proteínas: resumen
Sintesis de proteínas: resumen
El ribosoma

• Los ribosomas bacterianos contienen un 65% de rRNA y un 35% de proteína.


• Están compuestos de dos subunidades diferentes con coeficientes de sedimentación de 30S y
50S y un coeficiente de sedimentación combinado de 70S.
• Ambas subunidades contienen docenas de proteínas ribosómicas y al menos un rRNA de gran
tamaño.

• Ambas subunidades ribosómicas pueden disociarse en sus componentes de RNA y proteína y


ser después reconstituidas in vitro.
• Las dos subunidades ribosómicas encajan y forman una hendidura a través de la cual pasa el
mRNA a medida que el ribosoma se desplaza durante el proceso de traducción.
El ribosoma

• Los ribosomas de las células eucarióticas son


mayores y más complejos que los ribosomas
bacterianos.
• Tienen un coeficiente de sedimentación de 80S.
• Tienen 2 subunidades cuyo tamaño varía según las
especies, pero que por término medio corresponde a
60S y 40S.
• Los ribosomas eucarióticos contienen en total más
de 80 proteínas diferentes.
• Los ribosomas de mitocondrias y cloroplastos son
algo menores y más sencillos que los ribosomas
bacterianos.
• La estructura y la función de los ribosomas es
sorprendentemente similar en todos los organismos
y orgánulos.
Los t-rna

• Los tRNA son relativamente pequeños y consisten en


una sola hebra de RNA plegada en una estructura
tridimensional precisa.
• Las células poseen al menos una clase de tRNA para
cada aminoácido; se requieren al menos 32 tRNA
para reconocer todos los codones de los
aminoácidos.
• La comparación de muchos tRNA de varias especies,
ha puesto de manifiesto muchos aspectos
estructurales comunes:
✓ La mayoría de tRNA tienen un residuo de guanilato
(pG) en el extremo 5’
✓ Todos los tRNA tienen la secuencia trinucleotídica CCA
(3’) en el extremo 3’
✓ Cuando se representan en 2 dimensiones, la
disposición de los puentes de hidrógeno de todos los
tRNA forma una estructura en forma de hoja de trébol
con cuantro brados
✓ Los tRNA más largos tienen un quinto brazo o brazo
extra.
Los t-rna

✓ En tres dimensiones, el tRNA tiene forma de L


retorcida.
• Dos de los brazos del tRNA son esenciales para su
función de adaptador
✓ Brazo del aminoácido: lleva un aminoácido específico
esterificado por su grupo carboxilo al grupo hidroxilo
2’ o 3’ del residuo de A del extremo 3’ del tRNA.
✓ Brazo del anticodón: contiene el anticodón
• Existen otros brazos en el tRNA que contribuyen al
plegamiento de los tRNAs
✓ Brazo D
✓ Brazo TC: interacciona con el rRNA de la subunidad
grande

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