Tema 2: Interacciones Moleculares

TEMA 2: INTERACCIONES MOLECULARES Y EQUILIBRIOS
ACUOSOS
1. ENLACES QUE CONSTITUYEN LAS BIOMOLÉCULAS

● Enlaces fuertes que permiten formar una estructura sólida. Se necesita mucha energía para romperlos, por eso se
usan para las estructuras primarias . Un ejemplo son los covalentes
● Enlaces débiles, son aquellos que se rompen con facilidad y permiten interacciones entre estructuras biológicas. Se
usan para las estructuras secundarias, terciarias y cuaternarias. Un ejemplo son los no covalentes.
1.1 DINÁMICA NECESARIA PARA LA VIDA (HEMOGLOBINA)

Se producen cambios en la estructura de la hemoglobina al unirse un oxígeno al grupo hemo, lo que favorece la union de
más oxigenos al resto de grupos hemo, generando un mejor transporte. Al unirse una molécula de oxígeno, el resto lo hacen
con mayor facilidad.
Los enlaces covalentes son mucho más fuertes y difíciles de romper que los no covalentes.
2. INTERACCIONES NO COVALENTES
2.1 INTERACCIONES CARGA-CARGA
Son enlaces iónicos o puentes salinos. En la célula hay millones de moléculas, cationes,etc de carga positiva y negativa que
ejercen una fuerza sobre la carga contraria.
● Son interacciones entre partículas cargadas, relativamente fuertes a mayor distancia que el
resto
● La fuerza con la que se atraen dos cargas separadas en el vacío está determinada por la ley
de coulomb. Si la F es positiva significa repulsión, mientras que si es negativa significa
atracción. En la biología estas cargas estan separadas por agua u otras moléculas. De esta
forma las moléculas del medio rodean las partículas con carga + o - apantallandolas haciendo
que la atracción entre ambas sea menor . Este efecto apantallador se representa mediante la
siguiente ecuación junto a la constante dieléctrica.
● Entendemos por energía de interacción como la energía necesaria para separar dos partículas cargadas desde una
distancia r a una distancia infinita superando la fuerza electrostática.
2.2 INTERACCIONES DE DIPOLOS PERMANENTES

Son moléculas que tienen una distribución interna asimétrica de la carga como es el caso del CO o el H2O que tienen un
extremo ligeramente mas electronegativo. A estos se les denomina dipolos permanentes o moléculas polares que tienen un
dipolo permanente.
● Se da por una diferencia de electronegatividades de los átomos

y se representa con vectores desde δ- a δ+. Si una molécula tiene
más de un enlace, el momento dipolar es la suma de cada enlace
y se representa como suma de los vectores. Es importante la
distancia que separa las partículas y la geometría de la molécula
● La carga del enlace no es estática, si no que varía en función de en que zona pasan más tiempo los electrones.
● La energía de interacción es 1/r2 en carga-dipolo, y 1/r3 en dipolo-dipolo
2.3 DIPOLOS INDUCIDOS

● Son moléculas polarizables , es decir, puede convertirse en dipolos si se
encuentran en un campo eléctrico (partícula cargada o dipolar). Al acercarse
un anión o catión puede inducir este dipolo .
● La energía de interacción es inversamente proporcional a la distancia 1/r4

en carga-dipolo inducido a 1/r5 en dipolo-dipolo inducido.
● Tienen una interacción direccional , es decir, depende de por donde se

acerque la carga.
● Son fuerzas de corto alcance , ya que las moléculas depen estar muy cerca
para interaccionar. A pesar de tener una distribución simétrica de la carga, se puede generar el dipolo al acercar una
carga + ya que los electrones se concentran en esa zona.
2.4 FUERZAS DE DISPERSIÓN
Moléculas no cargadas y no polarizables.
● Se producen entre moléculas no polares, mediante variaciones en la distribución de la carga , de esta forma se
generan zonas más ricas en electrones o dipolos instantáneos.. Por ello es
una interacción direccional .Dicha interacción es inversamente proporcional
a la distancia 1/r6
● Para que sea posible, las moléculas deben estar muy próximas . Dos
moléculas apolares pueden inducir momentos dipolares al aproximarse, sus
nubes electrónicas se repelen y se sincronizan .
● Son de corto alcance, por eso necesitan estar muy próximos para darse.
● Son fuerzas que están haciendo y deshaciendo los enlaces continuamente, lo que hace que sean muy débiles pero
muy importantes
2.5 RADIO DE VANDERWAALS

Cuando las moléculas unidas por enlaces no covalentes se acercan mucho,
existe un punto en el que se genera una repulsión por solapamiento de orbitales.
Esta repulsión es mayor a medida que se van acercando a sus centros. De esta
forma, el radio de vanderwaals es la distancia más pequeña a la que se pueden
acercar dos moléculas sin crear un enlace y sin repelerse
● Mínima Energía: Existe una distancia en la que las moléculas alcanzan

su mínima interacción, es decir, son estables.
● Maxima distancia de acercamiento: distancia a la que ya no se pueden
acercar dos moléculas pues se repelen.
2.6 ENLACES DE HIDRÓGENO

Se da entre un H δ+ unido de forma covalente a un grupo donador (que dona el
H) y un grupo con un par de electrones libre conocido como grupo aceptor.
Dichas interacciones se deben a la diferencia de electronegatividades.
● Grupo dador: debe ser un compuesto muy electronegativo

● Grupo aceptor: debe tener un par de electrones libres.
● Tiene propiedades mixtas (entre covalentes y no covalentes
(carga-carga)):
- La distancia entre el H y el aceptor es menor que la esperada
segun el radio de Vanderwalls pero mayor que en los enlaces
covalentes.
- Su energía de enlace es superior a los enlaces no covalentes pero inferior a los covalentes
- Son direccionales y con una distancia de enlace fija.
2.7 ENLACES DE HIDRÓGENO EN ÁCIDOS NUCLÉICOS

Se dan entre las bases nitrogenadas. Entre citosina y guanina se crean 3
enlaces de hidrógeno, mientras que entre adenina y guanina solo 2
2.8 ENLACES DE HIDRÓGENO EN PROTEÍNAS
Se encargan de mantener las estructuras secundarias como lamina beta o helice alfa

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1. ENLACES QUE CONSTITUYEN LAS BIOMOLÉCULAS

1.1 DINÁMICA NECESARIA PARA LA VIDA (HEMOGLOBINA)

2.2 INTERACCIONES DE DIPOLOS PERMANENTES

● Se da por una diferencia de electronegatividades de los átomos

● La energía de interacción es 1/r2 en carga-dipolo, y 1/r3 en dipolo-dipolo

2.3 DIPOLOS INDUCIDOS

● La energía de interacción es inversamente proporcional a la distancia 1/r4

● Tienen una interacción direccional , es decir, depende de por donde se

2.5 RADIO DE VANDERWAALS

● Mínima Energía: Existe una distancia en la que las moléculas alcanzan

2.6 ENLACES DE HIDRÓGENO

● Grupo dador: debe ser un compuesto muy electronegativo

2.7 ENLACES DE HIDRÓGENO EN ÁCIDOS NUCLÉICOS

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