Bioinformática
Bioinformática
Bioinformática
Asignatura: Bioinformática
Código de asignatura: 49153215 Plan: Grado en Biotecnología (Plan 2015)
Año académico: 2017-18 Ciclo formativo: Grado
Curso de la Titulación: 3 Tipo: Obligatoria
Duración: Segundo Cuatrimestre
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ELEMENTOS DE INTERÉS PARA EL APRENDIZAJE DE LA ASIGNATURA
Justificación de los contenidos
La Bioinformática es un campo de estudio que comprende un gran abanico de disciplinas en las que participan científicos de muy diversa
índole. Por ello, la Bioinformática podría definirse como una ciencia multidisciplinar donde convergen en armonía los planteamientos
experimentales de la Biología Molecular y Genética, con los enfoques metodológicos y tecnológicos de la Ciencia de la Computación y la
Ingeniería Informática, todo ello dirigido hacia la administración, el análisis y la comprensión del conocimiento Biológico y Científico.
El desarrollo de herramientas bioinformáticas ha experimentado una importante revolución en la última década, provocada por la
combinación del impacto de Internet y los espectaculares avances en el campo de la Genómica y Proteómica, los cuales generan
ingentes cantidades de datos, cuya gestión y análisis plantean numerosos problemas que deben ser resueltos desde una perspectiva
bioinformática. Conocer cómo abordar y solucionar estos problemas son competencias que deberían poseer los investigadores y
trabajadores en cualquiera de los ámbitos de la Biotecnología.
COMPETENCIAS
Competencias Generales
Competencias Trasversales de la Universidad de Almería
Competencias Básicas
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PLANIFICACIÓN
Temario
Tema 6: Manejo y análisis computacional de datos de secuenciación masiva de nueva generación (NGS)
Secuenciación de genomas: ensamblaje de novo y alineamiento a genomas de referencia. Identificación de variantes genéticas: variant
calling format. Expresión diferencial con datos RNASeq. Clustering sobre datos de expresión génica: visualización mediante heatmaps.
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PROCEDIMIENTO DE EVALUACIÓN DE LAS COMPETENCIAS
Criterios e Instrumentos de Evaluación
* Prueba final teórico-práctica (50%) donde se valorará el nivel de conocimientos, las capacidades de relación de distintos conceptos de
la asignatura, la precisión en la redacción de las ideas, la claridad en las explicaciones y la concreción en las respuestas.
* Valoración de las aptitudes adquiridas para la resolución de cuestiones prácticas (40%). Se realizara una evaluación continua de las
prácticas, valorando la asistencia y capacidad de obtención de datos y su posterior análisis con las herramientas bioinformáticas
utilizadas. Además, se evaluara el informe final de prácticas atendiendo a la interpretación de los resultados obtenidos.
Mecanismos de seguimiento
Asistencia a tutorías
Asistencia y participación en seminarios
Entrega de actividades en clase
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BIBLIOGRAFÍA
Bibliografía recomendada
Básica
Roldán Martínez, David. Bioinformática: el ADN a un solo clic. RA-MA EDITORIAL. 2015.
St. Clair, Caroline. Visick, Jonathan. Exploring bioinformatics a project--based approach. Burlington, Massachusetts Jones & Bartlett Learning.
2015.
Supratim Choudhuri. Bioinformatics for Beginners: Genes, Genomes, Molecular Evolution, Databases and Analytical Tools. Academic Press.
2014.
Teresa K. Attwood, David J. Parry-Smith. Introducción a la bioinformática. Madrid: Prentice Hall. 2002.
Teresa K. Attwood, Stephen R. Pettifer, David Thorne. Bioinformatics Challenges at the Interface of Biology and Computer Science: Mind the
Gap. Wiley-Blackwell. 2016.
Complementaria
Otra Bibliografía
Puede ver la bibliografía existente en la actualidad en el Sistema de Gestión de Biblioteca consultando en la siguiente dirección:
http://almirez.ual.es/search/e?SEARCH=BIOINFORMATICA
DIRECCIONES WEB
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