BIO 141c

Unidad I

Clase 3
Aminoácidos y Proteínas
Objetivos de aprendizaje
§  Conocer como están formadas la proteínas

§  Comprender la estructura general de los amino ácidos y la formación del

enlace peptídico.

§  Conocer los distintos niveles estructurales de las proteínas.

§  Comprender el concepto de dominio proteico.

§  Conocer los distintos tipos de interacciones y enlaces que estabilizan la

estructura de las proteínas.

§  Conocer las funciones de las proteínas en la célula y comprender que

éstas funciones dependen de una estructura específica.
Funciones de las proteínas
• Enzimas
• Transporte
• Movimiento
• Defensa
• Estructura
• Reserva
• Hormonas
 Los aminoácidos son las unidades
monoméricas de las proteínas

MONÓMERO POLÍMERO
H O
H2 N C C OH
R R1 R2 R3 R4
Aminoácido Péptido
 Aminoácidos
Alanina H Carbono a
Grupo
Amino H2N C COOH Grupo
Carboxilo

CH3
Forma no ionizada Grupo R
(cadena lateral)
Alanina Alanina

Representaciones de
la Molécula
 Que pasa a pH=7?

Los grupos amino y

carboxilo de los
aminoácidos se
e n c u e n t r a n
ionizados a pH 7
(zwitterión)

Figure 2-23 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)

 Aminoácidos Esenciales

Que es la fenilcetonuria?
Averigua que otras funciones tienen los aminoacidos Glutamato y Glicina
Estructura de los 20 Aminoácidos

Las clasificaciones pueden

variar ligeramente de texto
a texto

Los grupos funcionales de

l o s R d e e s t o s
aminoácidos se encuentran
ionizados a pH 7
 Los Aminoácidos se clasifican en relación a la
polaridad de sus cadenas laterales

Averigua cuales son los aminoácidos esenciales.

Que es la fenilcetonuria?
Averigua que otras funciones tienen los aminoácidos Glutamato y Glicina
Figure 3-2 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
 Formación de un Enlace Peptídico
H R1 H O
H
N
C
C
O H
+ H N C
O
H
C
H O R2 H
Aminoácido 1 Aminoácido 2
H 2O
H R1 H O
H C N C H
N-terminal C C O C-terminal
N
H O R2 H
Reacción de condensación ocurre a 37°C (se pierde una molécula de agua)
Es catalizada por enzimas (ribosoma)
Y el enlace activado esta en la cadena en crecimiento
 Formación de un Enlace Peptídico
H R3
+ H N
C
C
O H

H O
Aminoácido 3
H 2O
RH H O O
H
H R1 H1 R3
H C C NC C OC H O H
H N NC C
N C C N C
N-terminal H O R 2 H C-terminal
H O R2 H H O
Polipéptido
Esta reacción se repite n veces (polipéptido o proteína en crecimiento)
 Polipéptido
Una cadena Polipeptídica resulta de la repetición de un Esqueleto
Central y Cadenas Laterales Particulares

Figure 3-1 (part 2 of 2) Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Las proteínas presentan las mas diversas estructuras
Estructuras de una proteína modelo
2a 3a

1a
Subunidad
proteica

α-hélice
4a

aminoácido

Proteína compuesta
De 4 subunidades
 Estructura Primaria
NH3+ – Cys – Tyr – Thr – Lys – Thr – Trp – COO-

•  Corresponde al polímero
lineal de aminoácidos
•  Contiene toda la
información requerida
para la estructura 3-D

El enlace peptídico es
plano. Estos pueden
rotar en el carbono alfa,
lo que define los angulos
phi y psi
 Estructura Secundaria
La Alfa hélice (α -hélice)
Vista de una
sección Cruzada

Estructura se repite cada 5.4 Aº a lo largo del eje de la hélice. Los grupos R de los
aminoácidos protruyen hacia afuera de la hélice del esqueleto polipeptídico.
Son abundantes en proteínas de membrana, receptores y canales y proteínas fibrosas
 Estructura Secundaria
La alfa hélice (α -hélice)
Los aminoácidos en una
hélice α están dispuestos
en una estructura
helicoidal dextrógira, con
unos 3,6 aminoácidos por
vuelta.

El α -hélice está
estabilizada por puentes
de hidrógeno entre un
grupo amino y el grupo
carbonilo de la siguiente
vuelta de la hélice (4 aa
distante)
Linus Pauling, Robert Corey, y Herman Branson en 1951 basándose en estructuras
cristalográficas de aminoácidos y péptidos y en la predicción de la forma planar de los
enlaces peptídicos
 Hebra-β y Hoja β

Los zig-zags de una hebra-β tienen una conformación más extendida que en
una α-hélice.
 Hebra-β y Hoja β o Lámina β
Se forma por el
posicionamiento paralelo
o antiparalelo de dos
cadenas de aminoácidos
dentro de la misma
proteína.

Las hebras-β se asocian

a través de puentes de
hidrógeno entre las
cadenas polipeptídicas
para formar una hoja-β

Los grupos R de los aminoácidos vecinos en una hebra-β apuntan en

direcciones opuestas
 Estructura Terciaria y Cuaternaria
Terciaria
Formada por el
plegamiento de elementos
de estructura secundaria
en una o más unidades
compactas

Cuaternaria
La proteína final puede
estar constituida de
varias cadenas
polipeptídicas

Al generarse las estructuras terciaria y cuaternaria, aminoácidos que están lejos en

la secuencia pueden quedar cercanos en la forma 3-D y formar una región funcional
como por ejemplo el sitio activo de una enzima.
¿Cómo se estabiliza la estructura tridimensional
de una proteína?
Puentes de
hidrógeno

Interacciones
Interacciones iónicas
hidrofóbicas

Puentes
disulfuro
La cadena lateral de la serina puede formar un enlace de hidrógeno con la
cadena lateral de cuál de los siguientes aminoácidos? Elija todos los que
correspondan.
 
1. Isoleucina
2. Alanina
3. Treonina
4. Asparigina
5. Prolina
 Estructura terciaria proteínas globulares
Cadenas laterales Cadenas laterales
polares apolares

cadenas laterales
Centro hidrofóbico polares
contiene hacia el exterior
cadenas laterales forman puentes de
apolares hidrógeno con el
agua
Proteína desplegada Proteína plegada en ambiente acuoso
 Las proteínas presentan distintos dominios
funcionales

Figure 3-10 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)

 Dominios proteicos
Los dominios proteicos corresponden a la combinación de estructuras
secundarias en regiones particulares y tienen una función determinada.
 Las proteínas modulares
Las proteínas presentan dominios proteicos que son compartidos por
otras proteínas.
 Estructura Terciaria y Cuaternaria
Origina dos categorías fundamentales globulares y fibrosas
Fibrosas: ej. α-queratina Globulares: ej. Hemoglobina
 Estructura proteínas fibrosas

Franja de aminoácidos
hidrofóbicos

Superhélices o hélices sobrenrolladas

Las hélices que las forman son anfipáticas
 Enlaces Disulfuro
Insulina funcional tiene enlaces –S-S-
intra- e inter-catenarios

redución

oxidación

Se forman por oxidación de los SH

de las cisteínas para formar cistinas

Los enlaces de disulfuro estabilizan la estructura

de la proteínas por puentes intermoleculares.
Abundantes en las proteínas extracelulares
Figure 3-28 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
 Estructura Cuaternaria:
Proteínas formadas por múltiples cadenas polipeptídicas o subunidades

Figure 3-24 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)

 Ensamble de virus

Virus del tomate Virus SV40

Fago lamda

Interacciones débiles en las proteínas de la envoltura

 El plegamiento de las próteinas

El tubo
- espontáneo
-  no-catalizado
-  Christian Anfinsen
-  1961 Ribonucleasa,
La célula
-  Chaperonas
-  Disulfuro ismerasas
-  Peptidil-prolil
isomerasas
 Proteínas Conjugadas:
Las proteínas pueden unir otras moléculas

Clase Grupo (moléculas, ion o grupo prostético)

Lipoproteína Lípido (lipoproteína plasmática)

Glicoproteína Carbohidratos (Inmunoglobulinas)
Fosfoproteína Fosfato (Caseína de la leche)

Hemoproteína Hemo (Hemoglobina)

Flavoproteína FAD (Succinato deshidrogenasa)
Metaloproteína Fe3+ (Ferritina)
Zn2+ (Alcohol deshidrogenasa)
Ca2+ (Calmodulina)
 Calmodulina

Activada por Ca++

Ca2+ (une 4 Ca++)
El Ca++ interactúa
con los átomos de
oxigeno del motivo
Proteína hélice-loop-hélice
blanco

La unión de Ca++ causa un cambio conformacional en la

calmodulina, permitiéndole unirse a otras proteínas.
 La función de proteínas es modificada por
modificaciones postraduccionales

Por ejemplo el factor de transcripción p53 cuya

función es altamente regulada por fosforilación,
ubiquitinación, sumilación, metilación o acetilación
¿Qué enunciado es verdadero con respecto a la estructura de las proteínas?
 
A. La estructura primaria es la secuencia de aminoácidos.
B. Las hélices alfa y las láminas beta son ejemplos de estructura secundaria.
C. Las cadenas laterales (grupos R) de los aminoácidos pueden ser hidrófilas o
hidrófobas.
D. Las proteínas compuestas por dos o más cadenas polipeptídicas tienen
estructura cuaternaria.
E. Todas las declaraciones son verdaderas

¿En qué nivel (s) de estructura proteica esperaría encontrar puentes disulfuro?
primario
secundario
terciario
cuaternario
sólo en b y c
 Estructura y función
Hemoglobina: Transporte de oxígeno

La función de las proteínas es absolutamente

dependiente de su estructura tridimensional
 Hemoglobina en la anemia falciforme
GUG CAC CUG ACU CCU GAG GAG AAG mRNA Normal
val his leu thr pro glu glu lys proteína Normal

GUG CAC CUG ACU CCU GUG GAG AAG mRNA Mutante
val his leu thr pro val glu lys proteína Mutante

1 2 3 4 5 6 7 8

Glutamato, un aminoácido
cargado negativamente, es
reemplazado por una Valina
aminoácido hidrofóbico
 https://www.youtube.com/watch?v=GcKyu9YGqbk

Nature: NEWS 06 JANUARY 2020 Quest to use CRISPR against disease gains
ground. As the first clinical-trial results trickle in, researchers look ahead to more
sophisticated medical applications for genome editing.
 Puedes estudiar en......

• Molecular Biology of the Cell. Alberts et al. 5ª Ed o 6ª Ed. Capítulo 3 pags

125-165
• Introducción a la Biología Celular. Alberts et al. 2ª Ed Capítulo 4, pags.
119-159
• . BIO 141c
Para estudiar:

Palabras claves:
Cadena lateral, conformación, dominio proteico, enlace disulfuro, enzima,
esqueleto polipeptídico,, estructura secundaria, fosforilación, alfa-hélice,
hoja-beta, estructura terciaria, modificaciones post-traducionales,
proteína fibrosa, proteína globular.

Conceptos claves revisados:

Enlace peptídico
Estructura de proteínas y niveles de organización
 
La revolución del plegamiento de las proteínas

https://www.youtube.com/watch?v=cAJQbSLlonI
Modelo de Hoja β-Plegada de Proteínas

•  Paralela
•  Antiparalela
Los grupos R de los aminoácidos vecinos en una •  Mixta
hebra-β apuntan en direcciones opuestas