CARTOGRAFÍA CROMOSÓMICA

EN EUCARIOTAS
Segunda ley de Mendel
Los genes se segregan de manera independiente. Los alelos de
dos (o más) genes diferentes se reparten en los gametos de
forma independiente el uno del otro.
B
A
AB B
A
A B Ab
A
B
b aB
a
a b
b
a
ab
a b
Genotipos F1 Gametos Genotipos F2
Investigaciones en varios organismos revelaron que ciertos
genes se segregan como si estuvieran juntos.
Ligamiento: Asociación de genes en el mismo cromosoma,
formando grupos de ligamiento

Gametos
(100% gametos parentales)
AB / ab 50 % AB 50 % ab
Investigaciones en varios organismos revelaron que ciertos
genes se segregan como si estuvieran juntos
Ligamiento: Asociación de genes en el mismo cromosoma,
formando grupos de ligamiento
CHROMOSOME 2
B
B b b

recombinantes

A
a A a

Gametos
Gametos
(parentales; recombinantes)
AB / Ab / aB / ab
 Resultado de la formación de gametos cuando se encuentran dos genes
heterocigotos:

1:1:1:1
La frecuencia de recombinación entre dos genes ligados es proporcional a
la distancia entre ellos
La frecuencia de gametos recombinantes (FR) debe estar entre el ligamiento
total (0%) y la segregación independiente (50%)
0%  FR  50%
Distancia entre genes y Ligamiento

Morgan. Análisis de mutaciones de Drosophila en el cs. X

Experimentos de
Genes Ligados
Mendel

Ubicación Genes en cromosomas Genes en el mismo

del gen separados cromosoma

Mayor número de
Igual número de todas
Tipos de combinaciones
las posibles
gametos parentales que
combinaciones alélicas
recombinantes
 Cruces de genes ligados al cromosoma X

Proporciones
fenotípicas diferentes
 Entrecruzamientos sencillos
Dependiendo del lugar donde ocurra, altera el
ligamiento entre dos genes
 A B C

Las frecuencias de entrecruzamiento, y por tanto la frecuencia de

recombinación, depende de la distancia entre genes
•Mayor distancia entre loci --> Mayor número de
entrecruzamientos

•Más Entrecruzamientos ---> Más Recombinación

A mayor frecuencia de recombinación

mayor la distancia entre loci
 vestigial (vg): Alas muy reducidas
purple eyes (pr) = ojos color sepia
Cuál es la frecuencia de recombinación? Cromosoma 2
Fenotipo No. descendientes
pr+ vg+ 1339
pr vg 1195
Fenotipos F2
pr+ vg 151 305
pr vg+ 154 Recombinantes
Total 2839
𝑁𝑜. 𝑅𝑒𝑐𝑜𝑚𝑏𝑖𝑛𝑎𝑛𝑡𝑒𝑠 305
𝐹𝑅 = × 100 𝐹𝑅 = × 100 = 10.7 𝑐𝑀
𝑇𝑜𝑡𝑎𝑙 𝑑𝑒𝑠𝑐𝑒𝑑𝑖𝑒𝑛𝑡𝑒𝑠 2839
Unidad que se utiliza para medir el
enlace genético

1% FR 1cM

Si la separación entre 2 genes es mayor que 50 u.m. (unidad de mapa),

también denominada centimorgan (cM), se puede esperar recombinación
entre ellos en el 100% de las tétradas
Cartografía genética:

La cartografía genética asigna el lugar cromosómico de un

gen (o locus) y su relación de distancia con otros genes (o
loci) en un cromosoma dado

A. Sturtevant (1913). La distribución y el

orden lineal de los genes se pueden
establecer experimentalmente mediante el
análisis genético
 Sturtevant. Recopiló datos sobre numerosos cruces que
implicaban la recombinación entre y, w, y m
yellow, white 0,5% Mayor exactitud a
Frecuencia de ∑ distancias pequeñas
white, miniature 34,5%
recombinación (5 y 10 cM)
yellow, miniature 35,4%

Las frecuencias de recombinación entre genes ligados

son aditivos, y permiten estimar la distancia relativa entre
dos genes a lo largo del cromosoma.

Unidad de mapa (u.m.) 1% de recombinación entre dos genes (loci)

centimorgan (cM)
Las distancias de mapa no son completamente aditivas
 ¿Por qué?

Los dobles recombinantes entre dos marcadores A y C no se

detectan en un cruce de dos puntos, subestimándose la distancia
AyC
A C A C
A C A C
a c a c
a c a c
La relación entre la distancia real de mapa y la frecuencia de recombinación
entre dos loci no es lineal. Entre mayor sea la distancia, peor es la estimación
 Probabilidad de doble = Producto de las
punto de recombinación probabilidades individuales

Ejemplo:

Gametos recombinantes entre A y B = 20%

Gametos recombinantes entre B y C = 30%
Probabilidad de obtener gametos
doble recombinantes?
𝑝 = 0,2 ∗ 0,3 = 0,06
= 6%

Para detectar sucesos de doble recombinación es necesario analizar un

gran número de descendientes
 Mapa de tres puntos en Drosophila

Ej. Cruce de 3 genes mutantes recesivos ligados al X

(ec, y , w)
P ♀ (triple mutante) X ♂ (silvestre) wild type

F2 Fenotipo No. Fenotipo No.

white
observado observado observado observado
Triple
4685 yellow-white 193
mutante
echinus
Silvestre 4759 echinus 207

yellow 80 yellow-echinus 3
white-
70 white 3
echinus
TOTAL 10000
1. Qué fenotipos de F2 corresponden a categorías
recombinantes y no recombinantes?
Los fenotipos no recombinados se encuentran en mayor
proporción en los descendientes
Los fenotipos doblemente recombinados se muestran en
menor número
2. Cálculo de la distancia intergénica
La distancia entre 2 genes es la suma de los porcentajes
de todos los intercambios que los relacionan
 Para hacer el esquema del cruce, es necesario asumir algún orden teórico

w ec y w+ ec+ y+ w y ec w+ y+ ec+ y w ec y+ w+ ec+

w ec y w y ec y w ec

w ec y w+ ec+ y+

w ec y w y ec w y ec y w ec y w ec
w ec y

w+ ec+ y+ w+ y+ ec+ y+ w+ ec+

 Para hacer el esquema del cruce, es necesario asumir algún orden teórico

w ec y w+ ec+ y+ w y ec w+ y+ ec+ y w ec y+ w+ ec+

w ec y w y ec y w ec

w ec y w+ ec+ y+

w ec y w y ec w y ec y w ec y w ec
w ec y

w+ ec+ y+ w+ y+ ec+ y+ w+ ec+

Origen de los gametos maternos Origen de los gametos maternos Origen de los gametos maternos

w ec y w ec y w y ec w y ec y w ec y w ec

w+ ec+ y+ w+ ec+ y+ w+ y+ ec+ w+ y+ ec+ y+ w+ ec+ y+ w+ ec+

w ec y w ec y w y ec w y ec y w ec y w ec

w+ ec+ y+ w+ ec+ y+ w+ y+ ec+ w+ y+ ec+ y+ w+ ec+ y+ w+ ec+

 𝑵𝒐. 𝑹𝒆𝒄𝒐𝒎𝒃𝒊𝒏𝒂𝒏𝒕𝒆𝒔
𝑭𝑹 = × 𝟏𝟎𝟎
𝑻𝒐𝒕𝒂𝒍 𝒅𝒆𝒔𝒄𝒆𝒅𝒊𝒆𝒏𝒕𝒆𝒔
 Ejemplo:
Tres mutantes marcadores (cromosoma 2)
b = Cuerpo negro; pr = Ojos Púrpura; c = alas curvadas
Los tres alelos son recesivos respecto al silvestre

P pr+pr+ c+c+ b+b+ X bb prpr cc

F1 pr+pr c+c b+b X bb pr pr cc

Si no están ligados Si están ligados

1/8 bb prpr cc 1/2 bb prpr cc

1/8 bb prpr c+c 1/2 b+b pr+pr c+c
1/8 bb pr+pr cc
F2 1/8 bb pr+pr c+c
1/8 b+b prpr cc
1/8 b+b prpr c+c
1/8 b+b pr+pr cc
1/8 b+b pr+pr c+c
Resultados del cruzamiento prueba, F2

Fenotipo Genotipo Número

Salvaje b+b pr+pr c+c 5701
Black, purp, cur bb prpr cc 5617
Purp,curved b+b prpr cc 388
Black bb pr+pr c+c 367
Curved b+b pr+pr cc 1412
Black,purp bb prpr c+c 1383
Purp b+b prpr c+c 60
Black,curved bb pr+pr cc 72

Total 15 000
 Resultados del cruzamiento prueba, F2

Fenotipo Genotipo Número

Salvaje b+b pr+pr c+c 5701
Black, purp, cur bb prpr cc 5617
Purp,curved b+b prpr cc 388
Black bb pr+pr c+c 367
Curved b+b pr+pr cc 1412
Black,purp bb prpr c+c 1383
Purp b+b prpr c+c 60
Black,curved bb pr+pr cc 72

Total 15 000

Porcentaje de recombinación 5,9% 19,5% 23,7%

El gen pr está en el medio

 Tetrada meiótica Gametos

Entrecruzamiento entre b y pr

b pr c b pr c
b pr c b pr+ c+
b+ pr+ c+ b+ pr c
b+ pr+ c+ b+ pr+ c+

Doble entrecruzamiento en la región b-pr-c

b pr c b pr c
b pr c b pr+ c
b+ pr+ c+ b+ pr c+
b+ pr+ c+ b+ pr+ c+
 Mapa genético de los marcadores
25,4

b 5,9 pr 19,5 c

24,5 Distancia b-c

27
 INTERFERENCIA
Un entrecruzamiento en una región inhibe un segundo evento
en áreas cercanas
bm (nervadura marrón)
Cruce del maíz v (brote virescente)
pr (aleurona púrpura)
cromosoma 9
Frecuencia esperada de dobles recombinantes

𝐷𝑅𝑒𝑠𝑝 = 0.223 𝑥 0.434 = 0.097 = 9.7%

𝐷𝑅𝑜𝑏𝑠 = 7.8%

Cálculo de diferencias por interferencia

𝐷𝑅𝑜𝑏𝑠
𝐶= ൗ𝐷𝑅𝑒𝑠𝑝 = 0.078Τ0.097 = 0.804 𝐼 = 1 − 𝐶 = 0.196

Coeficiente de coincidencia 19.6% menos de

(Cuantifica las diferencias que resultan dobles recombinantes
de la interferencia)
 Porcentaje teórico y detectable de cromátides recombinantes en
función de la distancia del mapa

El grado de imprecisión aumenta a medida que lo hace la distancia

Los genes de Drosophila
han sido ampliamente
cartografiados
Zea mays
Homo sapiens
El número de genes de un organismo no está
correlacionado con el tamaño del genoma

2% de genes
La realización de mapas cromosómicos no es posible en
muchos organismos

Análisis directo del ADN

Marcador genético: Sitio de heterocigosidad de ADN, de

ubicación conocida, no asociado necesariamente a una
variación fenotípica, que se utiliza como etiqueta de un locus
cromosómico particular
¿Qué son?
,
,
Cómo se forman?
Dónde se encuentran en bacterias?
En humanos?
Función en bacterias?
Función en humanos?
Por qué se conocen como satélite?
Cuál es la diferencia entre satélite,
minisatélites y microsatélites?
MARCADORES GENÉTICOS
 Taq:
Thermus aquaticus

PCR
(Reacción en cadena
de la polimerasa)
Usos

Sociedad Internacional
de Genética Animal
Esclarece y/o garantiza la
genealogía de los animales

Pruebas de paternidad
 Estudio de poblaciones
La población experimentó varios descensos drásticos en
los últimos 80 años. Phoca largha

fluorescent dye
Diversidad genética intermedia entre los loci
evaluados
Índice Garza-Williamson (M): Relación entre el número de alelos y el intervalo
alélico: M = k/(R+1), k: número de alelos
R: rango
Poblaciones que no han sufrido una reducción de tamaño: 0,82
Valor crítico: 0.70 Li, et al. 2010. Trends in Evolutionary Biology, 2(1): e6
Genética forense
Detección en cáncer
 • RFLP • RAPD
• AFLP
• SSR (Microsatélites)
• SNP
• CAPS
• SCAR

Técnicas no Técnicas
basadas en PCR basadas en PCR

Tipo de Descripción Ventajas Desventajas

marcador
RFLP
Polimorfismos de longitud de
fragmentos de restricción

La longitud de los fragmentos distinguen secuencias que han ganado o perdido

sitios específicos de restricción de la enzima usada
 Permite asociar variaciones con enfermedades o
(SNP)
un carácter de interés, proporcionando un medio
para identificar y localizar genes relacionados
Basado en PCR con cebadores Basado en PCR de secuencias
arbitrarios específicas
Cebadores aleatorios Utiliza la información de
No se requiere conocimiento secuencias publicadas de
previo de la secuencia para el genomas
análisis por PCR
RAPDs Microsatélites
AFLPs SNPs
SCARs
CAPS
SRAP
TRAP
SSCP
 MseI EcoRI

Amplified fragment length polymorphism

Cleaved amplified polymorphic sequences

 (35°C)

(17-21 nts)

(50°C)

Nts
selectivos

Sequence-related amplified polymorphism

Núcleos ricos
Amplificar marcos de lectura abierta en AT y GC
  Análisis de cambios en la movilidad de
secuencias de ADN de cadena sencilla

 Detecta polimorfismos producidos por el

plegamiento diferencial de ADN de cadena
sencilla debido a diferencias sutiles en la
secuencia (a menudo un solo par de bases)

 El plegamiento diferencial está dado por

complementariedad de bases intracadena,
NaOH treatment
or salt
lo que da como resultado bucles y pliegues,
generando una estructura 3D única que
puede ser alterada considerablemente
debido al cambio de base única que resulta
en movilidad diferencial

 Permite la detección de diversas

mutaciones, incluidas las sustituciones,
inserciones y deleciones de nucleótidos
Single strand conformation polymorphism individuales, en fragmentos de ADN
amplificados por PCR