Organización Del Genoma y Flujo de Información en Bacterias (10-12)
Organización Del Genoma y Flujo de Información en Bacterias (10-12)
Organización Del Genoma y Flujo de Información en Bacterias (10-12)
En este módulo se tratarán las bases de la variabilidad y herencia genética en organismos procariotas y
eucariotas. La doctora Jenny Llanos se encargará de abordar a los primeros y los doctores Mario Párraga y
Joan Villena se referirán a los segundos.
El orden de las clases sobre procariotas sería:
1. Organización del genoma en bacterias
2. Mutaciones y elementos genéticos extracromosomales
3. Recombinación en bacterias
Correo de la profesora: [email protected]
INTRODUCCIÓN
1
Si bien la profesora comenta que tanto las arqueobacterias como eubacterias pertenecen al reino monera,
en la actualidad se encuentra obsoleto.
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DIFERENCIAS ENTRE CÉLULAS EUCARIOTAS Y PROCARIOTAS
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VENTAJAS DE LAS BACTERIAS EN ESTUDIOS GENÉTICOS
- Las bacterias son haploides, es decir, su material genético se encuentra dispuesto en cromosomas
simples y su dotación genética se representa como “n”2.
Nosotros, a diferencia de los organismos procariotas, tenemos una dotación genética diploide puesto que
contamos con cromosomas duplicados cuyas cromátidas se encuentran unidas entre sí por un centrómero.
Cada cromátida es aportada por uno de los dos progenitores del individuo diploide. La dotación genética humana
se representa como “2n” puesto que cada cromosoma con el que contamos es doble. Los seres humanos
tenemos 23 pares de cromosomas, 22 autosómicos y 1 par sexual, o bien 46 cromosomas simples unidos entre
sí, 44 autosómicos y 2 sexuales.
- Tienen una única molécula de ADN que no se encuentra fragmentada como en el caso de los organismos
eucariotas.
- Cuentan con un tiempo de generación sumamente breve que les permite multiplicarse en dos células en
20, 30 o 40 minutos en condiciones de laboratorio. Naturalmente existen variedades de bacterias, cuyos
tiempos de reproducción pueden variar. Resulta muy útil en estudios este corto periodo de división y
surgimiento de generaciones filiales, porque se pueden obtener resultados en un día de actividades o
propiedades a estudiar.
- Presentan transferencia lateral de genes.
- Las mutaciones bacterianas se pueden identificar fácilmente. Esto permite estudiar el efecto de ciertos
agentes o elementos sobre el material genético y si producen o no mutaciones en las secuencias
nucleotídicas del mismo.
OBJETIVO ESPECÍFICO
“Describir cómo se organiza el material genético en bacterias, enfatizando las diferencias fundamentales con
eucariotas.”
En los años 40 del siglo XX la naturaleza química del material hereditario era aún una incógnita por descubrir.
Los datos disponibles en aquel entonces señalaban a dos posibles moléculas candidatas: el ADN y las
proteínas. La mayoría de los estudios e investigadores se inclinaban por las proteínas, puesto que se trataba
de moléculas con estructuras más complejas, en comparación a la molécula de ADN que parecía ser bastante
simple, demasiado como para tener un rol tan importante como es el contener la información de los genes.
Los isótopos son variantes de un átomo determinado que cuentan con más neutrones en el núcleo que el
elemento convencional. Es decir, átomos de un mismo elemento con el mismo Z (número atómico) pero con
diferente A (número másico).
Por ejemplo, el C tiene 6 protones, 6 neutrones y 6 electrones, su isótopo radiactivo C14 tiene 6 protones, 8
neutrones y 6 electrones. La mayor presencia de neutrones hace más inestable al átomo, produciendo la
liberación de energía en forma de radiación para estabilizarlo.
Ponían a los virus marcados en presencia de las bacterias. Estas últimas eran infectadas y permitían la
liberación de la progenie viral. Estas nuevas partículas virales tenían fósforo radiactivo en el interior de su
material genético, lo que les permitió demostrar que el ADN es la molécula transmisora de la información
genética.
Este experimento se llamó “de la batidora” porque después de que las bacterias tenían contacto con los virus
marcados, metían a la suspensión en una especie de batidora o centrifugadoras para que las partículas virales
que están sobre la superficie se soltaran y quedaran solamente las células que habían incorporado el material
genético que ya habían sido infectadas. Se producía esta separación puesto que las bacterias son más pesadas
que los virus, quedando las primeras en el fondo del tubo.
“Es un buen discurso, pero tardío. Siempre es bueno denunciar las discriminaciones, pero es infinitamente
mejor no efectuarlas”5
4
Esto fue tomado de “La ciencia y sus demonios”, link por si quieren revisarlo:
https://lacienciaysusdemonios.com/2011/05/09/el-machismo-en-la-ciencia-de-mitad-del-siglo-xx/#more-19626
5
La profe dice que es algo que todos debemos tener en presente y además que nos quiso hacer esta capsula para que
supiéramos cómo se llegaron a determinar los elementos que estaremos estudiando.
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ORGANIZACIÓN DE GENOMA EN BACTERIAS
HELICOIDAL
La estructura se enrolla en sí misma, de tal manera de obtener la estructura helicoidal.
CIRCULAR
Aquí empieza a haber diferencia con el ADN de las eucariotas. En las bacterias este
se dispone de manera circular, es decir, que los extremos de las hebras están unidos.
HIPER ENROLLADO
Se super enrolla ya que tiene que estar contenido en un espacio muy pequeño, la bacteria. Sin embargo,
también se puede presentar de manera laxa/relajada, ocupando más espacio en el citoplasma.
NO UNIDO A HISTONAS
Pero hay proteínas no histonas, las que se unen a la hebra de
ADN y forman dominios. Son importantes porque otorgan
estabilidad a la molécula, ya que al hiper enrollarse, las cargas
negativas del grupo fosfato se encuentran, por lo que se
tendrían que repeler, y eso podría generar una tensión que
rompiera la hebra de ADN. Estas proteínas impiden que ocurra
eso, estabilizándola7.
Las proteínas “ancladoras” se disponen de tal manera que en la zona hiper enrollada se forman estos dominios.
Por acción de algunas proteínas se puede distender un dominio, manteniendo los otros dominios hiper
enrollados. Esto para poder leer la información de un gen en una zona sin abrir toda la molécula.
6 El que se marcaba con fósforo radiactivo para poder determinar que el material genético era el ADN.
7 También se presentan cuando la estructura está relajada.
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En la imagen se ve una bacteria sometida a un tratamiento químico que no lisa la bacteria
de golpe, sino que se generan poros por los cuales se libera el contenido celular sin ser
dañado. Toda la hebra amarilla corresponde al contenido genético que se encuentra
dentro de la bacteria.
En una bacteria como la Escherichia coli, el eucromosoma corresponde a 4x10^6 pares
de bases, que a su vez corresponden a 4700 genes aprox. Si nosotros tomáramos esta
hebra, hiciéramos un corte y la estiráramos veríamos que esta, en relación con la
bacteria, es muchísimo más larga. La bacteria se mide en 1 o 2 micrómetros y la hebra de ADN se mide en
milímetros.
8 Organizado en eucariotas como cromosomas, o en bacterias como una doble hebra circular hiper enrollada
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REPLICACIÓN EN BACTERIAS
Corresponde a la duplicación del genoma bacteriano. En esta, se copia todo el genoma, es decir, desde el
primer par de bases hasta el último.
Este proceso es semiconservativo, lo que quiere decir que la hebra se abre en dos, donde ambas van a servir
de molde (templado) para sintetizar la hebra complementaria. Por ende, cuando tengamos el DNA duplicado,
tendremos un doble hebra, donde una de las cadenas vendrá de la hebra originaria mientras que la otra
corresponderá a la cadena recientemente sintetizada (ver explicación de la imagen).
MECANISMO DE REPLICACIÓN
Debemos recordar que esto no es distinto a lo ocurrido en eucariotas. La replicación ocurre en sentido 5’ → 3’
debido a que la enzima comenzará a leer la hebra molde en dirección 3’ → 5’. Como la hebra producida por la
enzima es la antiparalela a la hebra molde, que está siendo leída en dirección 3’ → 5’, va a tener la dirección
de 5’ → 3’.
Al igual que en eucariotas, se requiere que en el
medio donde ocurre la replicación estén los
precursores nucleósidos 5’-trifosfato, que son la
materia prima para formar la hebra de DNA.
La primera enzima en participar es la RNA
polimerasa, la cual es un primasa. Su función es
sintetizar un primer, el cual es un fragmento de RNA de aproximadamente 11 pares de bases. Este primer es
necesario ya que la DNA polimerasa, que será la enzima que formará la hebra complementaria, no sintetiza de
novo, es decir, no se va a unir a la hebra molde si es que no hay algo preformado.
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La doble hebra de DNA se abrirá, formando la horquilla de replicación, para que toda la maquinaria de
replicación pueda empezar a sintetizar.
Sin embargo, debemos recordar la disposición circular de DNA en las bacterias. La doble hebra circular de DNA
bacteriano se abrirá en el punto marcado por el origen de replicación. Desde allí comenzará la replicación de
las dos hebras (tanto la roja como la verde), la que además será en ambos sentidos del origen de replicación
(flechitas en la imagen de la derecha)
ENZIMAS IMPLICADAS
9 Es una topoisomerasa. La topoisomerasa I, para eliminar la tensión, corta solo 1 cadena de la doble hebra de DNA.
Por su parte, la topoisomerasa II, para eliminar la tensión, corta las 2 cadenas de la doble hebra del DNA.
10 También se les llama proteínas SSB.
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• DNA polimerasa III: Será la que sintetiza la nueva hebra de DNA, complementaria a la hebra molde.
En la imagen anterior se puede ver la maquinaria de replicación completa. La cadena superior corresponde a
la hebra continua o conductora, mientras que la inferior es la hebra discontinua o retardada.
Debemos recordar que la polimerasa lee en sentido 3’ → 5’; y sintetiza en sentido 5’ → 3’.
La hebra continua corresponde a la cadena original de DNA que tiene dirección 3’ → 5’, por lo que no hay
problema para que la polimerasa la lea en esa dirección y sintetice en sentido 5’ → 3’.
La hebra retardada corresponde a la otra cadena original de DNA, que por ser antiparalela a la anterior, tiene
dirección 5’ → 3’. Esto genera un problema ya que la polimerasa solo lee en sentido 3’ → 5’. Para logarlo, debe
leerla en el sentido “opuesto” a la hebra continua (ver las flechas rojas en la imagen anterior). Cuando la
polimerasa de la hebra retardada sintetiza la nueva cadena, la horquilla de replicación sigue avanzando, por lo
que queda un segmento que no ha sido replicado. Para ello, la polimerasa debe volver a colocarse al inicio de
la horquilla de replicación para sintetizar ese segmento. Esto genera que la hebra discontinua se replique por
fragmentos, llamados fragmentos de Okazaki (los cuales son aproximadamente 1000 pares de base).
Al igual que en eucariotas, el proceso es bastante regulado, por lo que en la medida que se sintetiza el DNA,
también se va revisando que no haya errores. De haberlos, estos van siendo reparados.
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Tanto en eucariotas como procariotas las enzimas son las mismas. La única diferencia sería que si
secuenciáramos los genes de una enzima en eucariotas y la misma enzima pero en procariotas,
encontraríamos diferencias menores en las secuencias nucleotídicas de una y la otra. Estas
discordancias responden a mecanismo evolutivos; sin embargo, la función (ya sea en procariotas o
eucariotas) sigue siendo la misma puesto que los sitios activos se han mantenido iguales.
TRANSCRIPCIÓN
La transcripción es el proceso mediando el cual se convierte DNA a RNA. Esta requiere de un templado de DNA
y, a diferencia de la replicación, se necesita solo un fragmento de este material genético, el cual corresponde a
un gen o un grupo de genes. Se lleva a cabo en dirección 5’ → 3’. El gen posee dos secuencias nucleotídicas
específicas denominadas promotor y sitio de término, las cuales son reconocidas por la RNA polimerasa. La
enzima es capaz de identificar las secuencias codificantes que necesita transcribir a través de su unión con el
promotor. Debido a que la RNA polimerasa desempeña distintas funciones, es ayudada por el factor sigma, el
cual es responsable del posicionamiento correcto de la enzima en el promotor.
11
Es difícil explicar estos procesos por escrito de manera entendible, pero con los videos creo que queda mucho más
claro .
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EUCARIOTAS
Existen 3 RNA polimerasas en su núcleo, las cuales requieren de factores para reconocer el sitio promotor. La
unidad de transcripción está compuesta por el sitio promotor, el gen a transcribir y el sitio de término.
BACTERIAS
No requiere procesamiento, ya que la secuencia del gen es colineal con el RNAm. Todo lo transcrito se traduce
a polipéptido de manera directa.
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EL RNAM EN BACTERIAS ES POLICISTRÓNICO
Esto significa que un RNAm codifica para más de un
polipéptido (se traduce en varios polipéptidos). A través de
esta idea llegamos al concepto de operón: grupo de genes
transcritos en conjunto a un simple RNAm y sometidos al
mismo mecanismo de regulación.
TRADUCCIÓN EN PROCARIOTAS
INICIO DE LA TRADUCCIÓN
El Corresponde a la formación del complejo de inicio, en el cual la unidad menor del ribosoma se unirá al RNAm,
seguido del RNAt en el sitio P (sitio del enlace peptídico) y de la subunidad mayor ribosomal. El primer codón
corresponde al AUG (metionina).
Mientras tanto, en el sitio A se añadirá el siguiente RNAt complementario al segundo codón de RNAm. Entre
ambos aminoácidos presentes se generará un enlace y, a medida que se va desplazando el ribosoma por el
RNAm, se irán añadiendo nuevos RNAt, extendiendo la cadena. Este proceso continúa hasta que se llegue al
codón de STOP.12, 13
TÉRMINO DE LA TRADUCCIÓN
Cuando se llega al codón de término, hay un factor de liberación que hace que se desensamble la maquinaria
de traducción, finalizando con el proceso. Es importante considerar que varios ribosomas pueden traducir un
RNAm al mismo tiempo, formándose un polisoma. Esta estructura permitirá que se realice el mismo proceso,
pero de una menor cantidad de tiempo, siendo más eficiente.
12 El antibiótico macrosólido Eritromicina se une a la subunidad 50S del ribosoma y evita que ocurra la síntesis de
proteínas, ya que inhibe la traducción y, por ende, destruye a la bacteria
13 El antibiótico aminoglucósidos Gentamicina se une a la subunidad 30S del ribosoma ribosoma y evita que ocurra la
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EUCARIOTAS V/S PROCARIOTAS
14Bueno llegaron al final de la primera TCP del último módulo de EFC (por fin!), de verdad son terrible secos kbres y si
no entienden tranquilein john Wayne por que quedaron muchos videítos para entender mejor y, si se están aburriendo
mucho hay un anexo abajo para que se rían un rato <3<3<3<3, ánimo ánimo ánimo que queda poquito. (cualquier error
que se haya pasado le dicen a la Salma <3)
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ANEXO
La doctora Jenny Llanos, más conocida por nosotros como una gran actriz, cantante y
campeona de artes marciales, es en realidad una connotada bióloga y pedagoga de
profesión egresada de la Universidad Católica de Valparaíso en 1983. Realizó un magíster
en microbiología en la Pontificia Universidad Católica de Chile del cual egresó en 1994 y,
posteriormente, se doctoró en bacteriología en el año 2000 en la Université de Bretagne
Occidentale, gracias a una beca del gobierno francés.16
Las habilidades de la doctora Llanos no sólo quedan evidenciadas en el mundo de los organismos y agentes
procariotas y acytota al que tanto tiempo ha dedicado. Afortunadamente, los diferentes talentos de nuestra
profesora, que trascienden la ciencia convencional, han quedado inmortalizados en diversos registros
audiovisuales que circulan por internet.
ACTUACIÓN Y CANTO
La doctora en bacteriología ha tenido apariciones estelares en videos como:
- “La Caja”17, en donde demuestra una actuación fluida y espontánea, a la vez
que logra dar la tensión adecuada a la escena en la que se encuentra. A la
par, mantiene una notable interpretación de la famosa canción “Yo soy un
estafilococo”18 de Analin.
- “Primum non nocere”19, interpretando a una deslenguada abuela gringa.
- “La voz de los Alexa”20, cantando en la introducción y mostrando su destreza en el arte de hacer y matar
piscolas en matraces de Erlenmeyer.
- “El vídeo era más largo.mp4”21 interpretando de manera impecable el papel de Gabriella, de High School
Musical, cantando “Breaking Free”.
ARTES MARCIALES
La profesora Llanos deja en evidencia su magistral dominio de
las artes marciales asiáticas en el video “Baby 2° es un ciclo”22.
15 También conocida como Jenny Thanos, por su temido porcentaje de exigencia en PyD, o Jenny Montaños.
16 https://investigadores.anid.cl/es/public_search/researcher?id=24725
17 https://youtu.be/G5cTVdXxNa0?t=323
18 https://youtu.be/dRNYWX4v0VE
19 https://youtu.be/gFevtCDiJ0I?t=273
20 https://youtu.be/uwE7HDoOdxQ
21 https://youtu.be/-IZUt5Z98Lw?list=PLLmgtaLjHBolJCfTycliV8w__2MaEwd5O&t=235
22 https://youtu.be/Aew5cexixW4
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