BACTERIAS
BACTERIAS
BACTERIAS
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Figura 2. Árbol filogenético del domino Bacterias.
3.1. Taxonomía.
Taxos en griego significa estructuración u orden y Nomos ley, por lo tanto
Taxonomía es la ciencia de la identificación, clasificación y nomenclatura, la
taxonomía de las bacterias por consecuencia se divide en estos tres aspectos:
identificación, clasificación y nomenclatura.
Identificación.
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Tabla 1. Identificación de bacterias.
Identificación
Rapidez de crecimiento.
Morfología de las colonias del medio de
5. Características de crecimiento.
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Clasificación.
Clasificación Otros
Dominio Bacteria
Phylum Proteobactería
α-proteobacteria
Clase γ-proteobacteria β-proteobacteria
δ-proteobacteria
ε-proteobacteria
Chromatiales
Thiotrichales
Orden Enterobacteriales Legionellales
Pseudomonadales
Vibrionales
Pasteurellales
Familia Enterobacteriaceae
Enterobacter
Escherichia
Género Shigella Klebsiella
Proteus
Salmonella
Yersinia
Especie S. boydii
S. dysenteriae
S. flexneri
S. sonnel
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[CITATION Kon06 \l 2058 ].
Ejemplo (Reino:
Clasificación
Procaryotae)
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de cultivos y es importante con fines de nomenclatura, ya que el nombre
específico va ligado a ella.
División Método de
Nombre Propiedades
Taxonómica confirmación
Microscopia,
análisis de
Células bacterianas, secuencia del RNA
secuencias de RNA ribosómico 16S,
Dominio Bacteria
ribosómico típicas de presencia de
bacterias. biomarcadores
únicos como
péptidoglicano.
Bacterias Gram-negativas,
Gammaproteob secuencias de RNA Tinción Gram,
Clase
a-cteria ribosómico típicas de microscopía.
Gammaproteobacterías.
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observación de
cultivos al
microscopio para
determinar
presencia de S0.
Medida de las
células en el
Células de 3.5 a 4 m x 5 a microscopio usando
11 m; almacenan azufre un micrómetro;
Especie Warmingii
principalmente en los determinando la
polos de las células posición de los
glóbulos de S0
dentro de la célula.
[ CITATION MarcadorDePosición2 \l 2058 ].
Tipos de clasificaciones.
Clasificaciones artificiales.
Las primeras clasificaciones bacterianas se basan en la ordenación con fines
prácticos de las diferentes especies creadas por la agrupación de cepas
caracterizadas por su igualdad o semejanza de algunas características básicas:
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Relaciones ecológicas: producción de enfermedades, parasitismo, entre
otras.
Clasificación numérica.
Consiste en determinar un gran número de características independientes, 100 a
120, de todas las cepas en estudio. Se realiza una comparación con un coeficiente
de semejanza del 100% para dos cepas idénticas.
Nomenclatura.
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publicaron en el International Journal of Systematic Bacteriology (IJSB); esta lista
ha sido renovada constantemente.
Nomenclatura Ejemplo
Escherichia coli
6. El nombre del género y la especie deben ir subrayados, en
Escherichia coli
cursiva o en itálica.
Escherichia coli
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Si se encuentra que una cepa de referencia en realidad
pertenece a otro género, el género de la cepa de
referencia no es considerado válido.
Si un microorganismo se incluye en dos o más géneros o
tiene dos o más designaciones de especie, el nombre de
género/especie que contiene la cepa de referencia
correcta se considera como válido.
9. Después de haber escrito el nombre completo del
microorganismo, al escribirlo por segunda ocasión (dentro de un Escherichia coli
mismo texto) se puede abreviar.
Abreviación:
Se coloca la primera letra del género seguida por un
E. coli
punto.
Posteriormente se coloca la especie (nombre completo).
[CITATION Kon06 \l 2058 ].
4.2. Morfología.
Microbiológicamente el término morfología hace referencia a la forma de las
células. Las células bacterianas son de diversas formas y tamaños. Existen
algunas que pueden medir hasta 100 µm. Epulopiscium fishelsonii, la bacteria más
grande encontrada hasta la actualidad, vive en el intestino de un pez y mide 600
µm por 80 µm.[CITATION Mon08 \l 2058 ].
Características morfológicas
Mayores
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Depende de la pared celular que les proporciona rigidez
y elasticidad.
Forma
Cada forma es propia de cada especie, por lo que
encontramos cocos, bacilos y espirales.
obligadas
el nucleoide.
Estructuras Cápsula, limo, glicocáliz, gránulos de almacenamiento,
facultativas flagelos, fimbrias, pili y esporo.
Nota: Las características morfológicas menores son estructuras finas. [ CITATION Mon08 \l 2058 ].
Estreptococos Streptococcus
pyogenes
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Tétradas
Micrococcus
tetragenus
Estafilococos
Staphylococcus
aureus
Sarcinas
Sarcina ventriculi
Estreptobasilos
Ovillos o rosetas
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Vibrios o vibriones
Vibrio cholerae
Espirales o
helicoidales Células bacterianas que
no presentan Espirilos
ordenamiento específico
porque generalmente se Spirillum volutans
encuentran aisladas con
una o varias curvaturas.
Espiroquetas
Treponema
pallidum
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Figura 3. Bacteria Grampositiva y Gramnegatia.
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Figura 5. Diferencias entre la membrana externa de células Grampositivas y Gramnegativas.
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Estas moléculas a su vez forman parte de estructuras celulares más complejas,
como la pared celular y la membrana citoplasmática.
Una de las características de los seres vivos es la capacidad para sintetizar sus
propios constituyentes a partir de nutrientes que toman del medio externo.
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las reacciones óxido – reducción debe ser almacenada y trasportada
(ATP). [CITATION MarcadorDePosición2 \l 2058 ].
Obtención de nutrientes.
Una vez dentro de la célula muchos nutrientes actúan como materias primas a
partir de las cuales se producen metabolitos precursores para los procesos
biocinéticas que llevan a cabo las bacterias. Estos metabolitos se producen por
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tres vías metabólicas centrales: Vía de Embden-Myerhof-Parnas (EMP), Ciclo del
ácido tricarboxílico (TCA) y Vía de la pentosa fosfato. La vía de Entner-Douderoff
desempeña funciones clave en el re-direccionamiento y el re-abastecimineto de
los precursores a medida que son utilizados en procesos interiores.
Metabolitos precursores
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Esquema 1. Aspectos generales del metabolismo bacteriano, que incluye los procesos de nutrición,
biosíntesis, polimerización y ensamblaje.
Nutrientes:
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Esquema 2. Diagrama general de la visión global de las vías metabólicas centrales
(EMP), Ciclo de los ácidos tricarboxílicos (TCA) y Ciclo de las pentosas fosfato
Producción de energía
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En células bacterianas los dos mecanismos generales para la producción de ATP
son la fosforilación a nivel de sustrato y el trasporte de electrones, denominado
fosforilación oxidativa. En la fosforilación a nivel de sustrato los enlaces fosfato
de alta energía producidos por las vías metabólicas centrales son donados al
Difosfato de Adenosina (ADP) para formar ATP. Por otra parte el piruvato, un
intermediario fundamental en las vías metabólicas centrales sirve como sustrato
inicial para otras vías que generan ATP por fosforilación a nivel de sustrato. Estas
otras vías metabólicas constituyen el metabolismo fermentativo, que no requiere
oxígeno y genera diversos productos terminales como alcohol, ácidos, CO 2 e
Hidrógeno. Las vías metabólicas fermentativas y los productos terminales
generados dependen del tipo de bacteria.
El conocimiento de las rutas metabólicas que utilizan las bacterias parar generar
ATP es importante para el diseño de los protocolos de laboratorio para el cultivo y
la identificación de estos microorganismos. [CITATION For09 \l 2058 ].
Fermentación.
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energía potencial contenida. Por lo tanto el rendimiento energético de este
proceso es menor que el de la respiración.
La vía de Entner-Doudoroff.
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Esquema 3. Esquema de la vía glucolítica o de EMP.
Tipos de fermentaciones:
Fermentación heteroláctica
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Característica en bacterias anaerobias como: Propionibacterium (bacilo Gram+ no
esporulado). En este tipo de fermentaciones se genera una molécula más de ATP.
Fermentación ácido-mixta
Respiración.
Respiración aerobia
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Esquema 4. Ciclo de Krebs.
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Respiración anaerobia
Las bacterias son favorecidas por medios de reacción neutra (pH de 6.5 - 7.5) y
debido a su rápida multiplicación se ha encontrado que mutan más rápido que los
hongos.[CITATION RFr80 \l 2058 ].
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Cultivo por dilución y agitación.
Aislamiento con carilla angular de vidrio.
Aislamiento con aplicadores de algodón.
Siembra por picadura.
Las bacterias junto con levaduras y hongos se han utilizado durante miles de años
para la preparación de alimentos fermentados, como quesos, mantequilla, salsas,
vinagre, vinos y yogur.
Industria Productos
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Existe un tipo de bacterias que se emplean para el control microbiológico de
algunas plagas de insectos. [CITATION RFr80 \l 2058 ].
Otra aportación de las bacterias lácticas son los probióticos, los cuales son
microorganismos vivos que al ingerirse en cantidades adecuadas, confieren
efectos benéficos al huésped. Los efectos benéficos de los probióticos se
relacionan con la modulación de la microbiota intestinal, mediante la regulación del
equilibrio existente entre bacterias benéficas y dañinas. Los probióticos son
también capaces de actuar directamente sobre el sistema inmunitario aumentando
tanto la respuesta inespecífica (fagocitosis, actividad de células natural killer)
como la específica (producción de anticuerpos, citocinas y proliferación de
linfocitos).La bacteria láctica (BL) mejor caracterizada es Lactoccocus lactis esto
debido a que es un microorganismos de fácil manipulación, fue la primer BL cuyo
genoma se secuencio y tiene un gran número de herramientas genéticas
desarrolladas. [CITATION Agr12 \l 2058 ].
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Esquema 5. Aplicaciones de las bacterias ácido lácticas e Ingeniería metabólica.
Tabla 10. Ventajas y desventajas del uso de bacterias ácido lácticas para la bio-
producción de productos químicos y metabolitos.
Compuestos químicos
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La síntesis de Butanol se lleva a cabo con nutricional.
poca cantidad de microorganismos.
Se puede tener inhibición
Ingredientes alimenticios
Nutracéuticos
Polisacáridos
Exopolisacárido No patógenos.
s
Producción in situ durante la fermentación.
No descritas hasta el
Actividades de prebióticos o probióticos. momento.
Ácido
hialurónico Producción y distribución de antígenos en
cápsulas.
[CITATION Gas13 \l 2058 ].
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Bacterias en la Industria Alimentaria.
Bacterias Lácticas.
Las bacterias lácticas (BL) no solo son importantes en la Industria Farmacéutica
ya que al ser excelentes fermentadoras las convierte en herramientas propicias
para la Industria Alimenticia (quesos, leches fermentadas, panes, vinos, yogurt,
carnes, etc.) adicional contribuyen en la formación del sabor, conservación y
producción de aditivos o suplementos. Las BL se asocian a la preservación de
alimentos fermentados desde el 8000 a.C.
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Esquema 6. Rutas metabólicas vía Embden-Meyerhof (a) bacterias homofermentativas y (b)
bacterias heterofermentativas.
Producción de sabores.
Desde la antigüedad los sabores emergen como productos secundarios de las
fermentaciones de los alimentos. Actualmente la adición de cultivos iniciadores
como: Lactobacilli, Pediococci, Streptococci, Propionibacteria, Saccharomyces y
Aspergillus proporcionan sabores no tóxicos para el ser humano al consumirse
con moderación.
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tostadas)
2-acetil-1-pirrolina (pan y
Bacillus cereus
palomitas de maíz)
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Halobacterium salinarum
Alimento para
Escherichia coli
animales.
Rojo Proyecto de
Canthaxantina Bradyrhizobium sp.
oscuro investigación
Producción
Ficocianina Athrospira platensis industrial y
alimentos.
Azul
Producción
Indigo Escherichia coli industria e Industria
Textil
Alimento para
Flavobacterium sp.
animales.
Zeaxantina Amarillo
Paracoccus Proyecto de
zeaxanthinifaciens investigación
[CITATION Ber \l 2058 ].
El suelo nos provee de alimentos, el agua es vital para la vida de los seres vivos y
sin el aire no podríamos vivir. Una alternativa ante la problemática del medio
ambiente es la implementación de productos biodegradables a base de bacterias y
enzimas.
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El tratamiento de aguas residuales es un sistema utilizado para remover
contaminantes del agua. Eventualmente el agua contaminada se descontamina a
través de medios naturales, los cuales requieres mucho tiempo, en una planta de
tratamiento se acelera este proceso. De esta manera se logra reutilizar el agua en
actividades como agricultura, industrias y recreación.
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Tratamiento físico.
Remoción de sólidos (basura y arena).
PRETRATAMI-
ENTO
Físico o fisicoquímico.
Tanques de sedimentación.
TRATAMIENTO Se remueven contaminantes y se retiran como lodos (reutilizados como
PRIMARIO abono).
Tramiento biológico.
Se emplean bacterias para consumir los contaminantes que no se han
TRATAMIENTO
removido.
SECUNDARIO La aireación contribuye al crecimiento bacteriano.
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Figura 6. Planta de tratamiento de aguas residuales.
Por otra parte los metales pesados liberados en el medio ambiente representan
una amenaza significativa para los ecosistemas naturales y la salud pública debido
a su toxicidad y la su persistencia en la cadena alimenticia. La utilización de
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biosorción para el tratamiento de metales pesados es de especial importancia,
existen microrganismos capaces de absorber metales pesados del suelo y de
aguas residuales.
Costos bajos.
Utiliza lodos biológicos
Recuperación del metal.
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Descarga de Aguas Residuales.
Lodos y Biosílidos.
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NMX-AA-036-SCFI-2001 Análisis de agua- Determinación de acidez
y alcalinidad en aguas naturales, residuales y residuales tratadas.-
Método de prueba.
NMX-AA-072-SCFI-2001 Análisis de agua- Determinación de dureza
total en aguas naturales, residuales y residuales tratadas.- Método
de prueba.
NMX-AA-093-SCFI-2000 Análisis de agua-Determinación de la
conductividad electrolítica.- Método de prueba.
Biogas.
Bacteria Características
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Ruminococcus Bacteria anaerobia, Gram (+) que sintetiza enzimas con
flavefaciens actividades celulolíticas y hemicelulolíticas.
Biorremediación.
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debido a la naturaleza fitotóxico de los hidrocarburos, y la inmovilización de los
nutrientes en el suelo. Propiedades mutagénicas inherentes de algunos
hidrocarburos y sus bajas tasas de degradación requieren especial atención para
remediar estos contaminante. La biorremediación se ha sugerido como un método
de mitigación de contaminantes en el suelo. En este método la capacidad de los
agentes biológicos se explota para degradar hidrocarburos.
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suelos arenosos, removiendo más del 70% de estos contaminantes en 270 días
aproximadamente. La aplicación de tensiactivos es una manera posible para
desorber hidrocarburos a partir de arcilla y mejorar su biodisponibilidad. Materiales
orgánicos de desecho es otro método posible para mejorar la biorremediación de
suelos arcillosos. [CITATION Hag16 \l 2058 ].
Los detergentes modifican la tensión superficial del agua para llevar a cabo el
proceso limpiador.
Propiedades:
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Tabla 14. Enzimas involucradas en la producción de biodetergentes.
Enzima Características
No actúan sobre las manchas, sino sobre los las fibras celulósicas
(algodón) eliminando las microfibrillas de las fibras evitando las
Celulasas
bolitas en la ropa, restauran colores, suavizan los tejidos, pulen la
superficie y elimina las partículas de suciedad.
Lipasas carboxílicos.
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Biominería.
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Paso 3: El Fe(III) generado se emplea para oxidar Cu(I) en la forma soluble
Cu(II).
Biopolimeros.
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Inglaterra,
actualmente lo Puede ser moldeado
y cubiertos), forro de
produce y formado por
pañales, entre otros.
Metabolix en inyección a vacío.
Estados Unidos.
Materiales de
embalaje, películas
de bolsas,
contenedores de
cosméticos, botellas,
vasos, cartones de
Mitsubishi Biopolímero a partir leche, látex, papel,
desarrolló un de metanol. desechable,
Biogreen producto a partir productos de higiene
de metanol y lo Consiste en poli 3- fenemina, bolígrafos,
nombra Biogreen. hidroxibutirato. peines, balas,
pelotas de golf,
aditivos alimentarios
(sustituyendo crema
de leche), placas
óseas, injertos
vasculares etc.
[CITATION Anj16 \l 2058 ].
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Esquema 8. Ruta metabólica para la biosíntesis de PHA´s.
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Esquema 9. Ruta metabólica para la biosíntesis de mcl-PHA
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Tabla 17. Microorganismos productores de biopolímeros.
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Esquema 10. Producción de diversos monómeros (diaminas, ácidos dicarboxílicos, hidroxi ácidos,
dioles y productos aromáticos) a partir de microorganismos.
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