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Complejo PDH

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PIRUVATO DESHIDROGENASA

• El complejo piruvato deshidrogenasa y las enzimas del ciclo del ácido cítrico existen en la matriz de la
mitocondria en eucariotas.

• El Piruvato por glucogenesis se encuentra en el citosol y necesita ser trasladado a la mitocondria.

• La oxidación completa del piruvato y la transferencia de los electrones al oxígeno se realiza en la


mitocondria: Oxidación del piruvato y ciclo de Krebs en la matriz mitocondrial Transporte de electrones
y fosforilación oxidativa en la membrana interna.

ESTRUCTURA MITOCONDRIAL

- Las mitocondrias tienen doble sistema de membranas


• Membrana externa: permeable a moléculas pequeñas
• Membrana interna: NO permeable - Tiene transportadores de proteínas integrales específicos de la membrana
• Región entre las dos membranas = espacio intermembrana
• La membrana interna está muy doblada y forma un límite con el interior lleno de fluido = MATRIX
o Matrix tiene una consistencia "similar a un gel"
o Contiene las proteínas del ciclo TCA
• Otras proteínas responsables del metabolismo aeróbico adicional están en la matriz o están unidas a la membrana
interna El piruvato generado en el citosol ingresa a la mitocondria (destino aeróbico de piruvato)

- Difunde a través de la membrana externa


- La piruvato translocasa transporta el piruvato a las mitocondrias en forma compatible con H +

CONVERSIÓN DE PYRUVATO A ACETYL COA


El complejo de piruvato deshidrogenasa ENLACE GLICOLISIS AL CICLO DEL TCA - También ocurre en las
mitocondrias. Es un complejo multienzimático que contiene: 3 enzimas + 5 coenzimas + otras proteínas (+ coenzima
ATP como regulador)

E1 = piruvato deshidrogenasa: 24 cadenas polipeptídicas, contiene TPP (pirofosfato de tiamina, vitamina B1,
interviene en reacciones de decarboxilación).

E2 = dihidrolipoamida acetiltransferasa: 24 cadenas polipeptídicas, contiene 2 moléculas de ácido lipoico (interviene


en la transferencia de grupos acilo) unidas covalentemente mediante un enlace amida (lipoamida).

E3 = dihidrolipoamida deshidrogenasa: 12 cadenas polipeptídicas, contiene FAD (Flavina adenina dinucleótido). En


eucariotas además contiene pequeñas cantidades de una quinasa y de una fosfatasa que fosforilan/defosforilan 3 Ser
de E1.

El núcleo del complejo está formado por 60 subunidades E2 dispuestas en forma de un dodecaedro pentagonal (12
pentágonos unidos por sus orillas formando una pelota). Esta forma tiene 20 vértices y cada uno está ocupado por un
trímero de E2. Cada una de las subunidades E2 tiene una región enlazante que sobresale hacia arriba de la superficie.
Este enlazante toca un anillo externo de subunidades E1 que rodean al núcleo interno. La región enlazante contiene
al brazo oscilante de lipoamida.
La capa externa tiene 60 subunidades E1. Cada enzima E1 toca a una de las enzimas E2 subyacentes y hace
contactos adicionales con sus vecinas. La enzima E1 consiste en dos subunidades α y dos subunidades β (α 2 β 2), por
lo que es bastante más grande que la enzima E2 en el núcleo. La enzima E3 (un dímero de α 2 ) está en el centro del
pentágono formado por las enzimas nucleares E2. Hay 12 enzimas E3 en el complejo total que corresponden a los
12 pentágonos del dodecaedro pentagonal. En los eucariotas, las enzimas E3 se asocian a una pequeña proteína
enlazante (BP, binding protein) que es parte del complejo.
Reacción general del complejo de piruvato deshidrogenasa

• piruvato + CoASH + NAD + → acetil-CoA + CO2 + NADH + H


Roles de las coenzimas del complejo de PDH

- TPP (pirofosfato de timina)


El pirofosfato de tiamina es la coenzima de todas las descarboxilaciones de los a-cetoácidos. El TPP contiene dos
anillos heterocíclicos: una pirimidina sustituida y un tiazol, el anillo de tiazol del TPP es la parte funcional de la
coenzima, que la permiten unir y transferir aldehidos activados.
• Forma activa de tiamina
o Vitamina B1
o Frijoles, vegetales verdes, maíz dulce, yema de huevo, hígado, harina de maíz, arroz integral
o Deficiencia = beriberi

- Ácido lipoico
Unido a la cadena lateral de un residuo de lisina mediante un enlace amida. La porción lopil-lisilo es el grupo
prostético de la dihidrolipoil transferasa (E2). El grupo lipoilo puede hallarse oxidado (disulfuro) o bien reducido
(ditiol) y actúa como un transportador de hidrógeno y de grupos acetilo (u otros grupos acilo)
• Reacciones de oxidación y transferencia de acetil. - FAD y NAD +
• Agente oxidante / aceptores de electrones.

- Coenzima A (CoA-SH)
Un grupo hidroxilo del ácido pantoténico se une a una porción de ADP a través de un enlace éster fosfato, y su
grupo carboxilo a β-mercaptoetilamina por un enlace amida. El grupo hidroxilo en la posición 3´ de la porción ADP
presenta un grupo fosforilo del cual carece el propio ADP. El grupo –SH de la porción mercaptoetilamina forma un
tioéster con el acetato en el acetilcoenzima A (acetil-CoA)
•Sintetizado a partir de la vitamina ácido pantoténico
o Energiza las moléculas
o Hace que sea más inestable y más propenso a reaccionar y liberar energía

REGULACIÓN DE LA PIRUVATO DESHIDROGENASA

• El complejo piruvato deshidrogenasa (PDH) se inhibe por acetil-CoA y NADH: una alta concentración de dos de
los productos de la reacción, acetil-CoA y NADH (producto principal de la vía completa, además de producto de la
reacción) impiden que la enzima siga funcionando.

• PDH también se regula mediante fosforilación/defosforilación (en eucariotas) de 3 Ser de la piruvato


deshidrogenasa (E1) (la forma fosforilada es inactiva), que llevan a cabo la piruvato deshidrogenasa quinasa (PDK)
y la piruvato deshidrogenasa fosfatasa (PDP). PDK y PDP forman parte de complejo piruvato deshidrogenada
La descarboxilación oxidativa del piruvato se puede dividir en cinco pasos. (En cada paso, en las
siguientes reacciones, se indican en gris los destinos de los átomos procedentes del piruvato).

1. El componente E1 contiene el grupo prostético pirofosfato de tiamina (TPP, thiamine


pyrophosphate). La TPP (vitamina B1) tiene función catalítica en varias reacciones de la descarboxilasa.
La reacción inicial causa la formación de un compuesto intermedio de hidroxietilo—TPP y la liberación
de CO2.

MECANISMO:

Un grupo carboxilo de glutamato de la enzima atrae a un protón ligado al N-l de la pirimidina, el cual a
su vez aumenta la basicidad del grupo amino y facilita la desprotonación del C-2 del anillo de tiazol.

Este carbono forma un carbanión, que a su vez puede atacar al carbono carbonílico de los a-cetoácidos,
como el piruvato, dando un compuesto de adición. El compuesto de adición experimenta una
descarboxilación no oxidativa, en la que el anillo de tiazol actúa como sumidero de electrones al formar
una eneamina estabilizada por resonancia. La protonación da lugar a una especie molecular denominada
acetalde- hído activo o, más exactamente, hidroxietil-TPP

2. En el segundo paso, el grupo hidroxietilo, con dos carbonos, es transferido al grupo lipoamida de E2.
El grupo lipoamida está formado por ácido lipoico unido en forma covalente por un enlace de amida a
un residuo de lisina en una subunidad E2. Esta coenzima en especial sólo se encuentra en enzimas de
piruvato deshidrogenasa y afines. La reacción de transferencia es catalizada por el componente E1 del
complejo piruvato deshidrogenasa. En esta reacción, la oxidación del hidroxietilo—TPP se acopla con la
reducción del disulfuro de la lipoamida y el grupo acetilo se transfiere a uno de los grupos sulfhidrilo de
la coenzima.

La transferencia de la porción aldehido activa desde el TPP al azufre del carbono 6 de la


lipoamida comporta la oxidación simultánea del aldehido, acoplada a la reducción del disulfuro. Ello
genera un grupo acilo que, en la piruvato deshidrogenasa, se transfiere posteriormente a la coenzima A.
Así pues, la lipoamida es a la vez un transportador electrónico y un transportador de grupos acilo

3. El tercer paso consiste en la transferencia del grupo acetilo al HS—CoA, formando acetil-CoA y
dejando a la lipoamida en la forma reducida de ditiol. El componente E2 del complejo es el que cataliza
esta reacción.

4. La lipoamida reducida de E2 debe volver a oxidarse a fin de regenerar el grupo prostético para que
pueda participar en más reacciones. Eso se hace en el paso 4 por transferencia de dos protones y dos
electrones de la forma ditiol de la lipoamida al FAD (flavina adenina dinucleótido). El FAD es el grupo
prostético de E3 y la reacción redox produce la coenzima reducida FADH2.

5. En el paso final se vuelve a oxidar E3-FADH2 para formar FAD. Esta reacción se acopla con la
+¿ ¿
reducción de NAD La oxidación de E3-FADH2 regenera el complejo original de piruvato
+¿¿
deshidrogenasa, completando el ciclo catalítico. En el paso 5 se producen NADH y H . Un protón se
libera en el paso 5, y un protón se toma en el paso 1, por lo que la estequiometría general de la reacción
de piruvato deshidrogenasa no tiene ganancia ni pérdida neta de protones

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