Protocolo de Práctica de Laboratorio Virtual de Bioquimica
Protocolo de Práctica de Laboratorio Virtual de Bioquimica
Protocolo de Práctica de Laboratorio Virtual de Bioquimica
20 de septiembre de 2020
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Manual Laboratorio Virtual
BIOQUIMICA
https://www.google.com/search?q=imagenes+laboratorio+quimica&rlz
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1. PRESENTACIÓN DE COMPONENTE PRÁCTICO
(LABORATORIO VIRTUAL)
ESTUDIANTE
Realizacion de la práctica virtual basandose en las guía
suministradas
Elaboración del informe con los lineamientos indicados y
Normas APA.
Evaluación final en linea.
TUTOR
LABORATORIO
Acompañamiento sincrónico, seguimiento del proceso con
cada uno de los estudiantes
Generación y Registro de nota en el OIL.
Docentes que acompañaran el desarrollo de las prácticas.
ROGER RABELO: [email protected]
MARISOL VILLALOBOS: [email protected]
DIRECTOR DE
CURSO
Orientación del proceso.
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2. CARACTERÍSTICAS GENERALES
OBJETIVOS GENERAL:
Que el estudiante adquiera una preparación en
Bioquímica que le permita comprender la transversalidad
que tiene la actividad práctica, tanto en otros cursos del
programa de estudio como en las actividades
profesionales que él desempeñará, así mismo que le
permitan desarrollar una actitud de pensamiento crítico
y de liderazgo en el trabajo que se de en el grupo.
METAS:
Aplicar los conceptos relacionados con la
Bioquímica a través de actividades experimentales
simuladas.
Los estudiantes observan, analizan, simulan,
comprueban y dan solución adecuada a problemas
5
de interés disciplinar para el desarrollo de
habilidades de pensamiento y destrezas
instrumentales que puedan ser aplicadas en el
ejercicio de su profesión, su campo de interés y la
vida diaria.
Práctica No 1: Reconocimiento de materiales de
Denominación de laboratorio y normas de seguridad de trabajo en el
prácticas laboratorio.
Práctica No 2: Identificación cualitativa de aminoácidos
y proteínas.
Práctica No 3: Identificación y propiedades de Lípidos.
Práctica No 4: Factores físicos y químicos en la
actividad enzimática.
Práctica No 5: Cuantificación de proteínas.
Práctica No. 6: Evaluación en línea.
Número de horas 18
La rúbrica de evaluación del laboratorio 25% del curso,
Porcentaje
equivalente a 125 puntos de 500 Totales.
Curso Evaluado por
SI_X__ NO__
proyecto
El desarrollo del laboratorio virtual de Bioquímica se
realiza de manera individual. Cada estudiante entrega un
único informe que contenga la totalidad de las prácticas
de laboratorio cumpliendo con los requisitos de:
Portada
Informe o Introducción
productos a Desarrollo de la guía
entregar Conclusiones
Referentes Bibliográficos
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3. DESCRIPCIÓN DE PRÁCTICAS
PRACTICA No. 1 – RECONOCIMIENTO DE MATERIALES DE LABORATORIO Y
NORMAS DE SEGURIDAD DE TRABAJO EN EL LABORATORIO
Fundamentación Teórica
FORMA DE TRABAJO.
Individual.
PROCEDIMIENTO.
Matraz
volumétrico
Tubo de
Centrífuga
Probeta graduada
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Tubo de ensayo
Cristalizador
Tripode
Espátula
Aro Metálico
MATERIAL DE Mortero
PORCELANA
Crisol
EQUIPOS Centrifuga
Placa
calefacatora
Baño de agua
Tabla 1. Material de uso frecuente en el laboratorio identificado en el simulador
“Chemix-Draw Lab”.
Pictograma Definición
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4. En cuanto accidentes en el laboratorio, Enumere las medidas que se
toman en caso de presentarse fuego en el laboratorio y realice un
cuadro donde explique las categorías de identificación de extintores.
13
7. Enumere cuales son las normas básicas de bioseguridad que se deben
tener en cuenta de acuerdo a los videos.
8. Describir cuales son los equipos de protección colectiva para situaciones
de accidentes o emergencias que se observan el en video de prevención,
indicando su función.
9. Menciones posibles riesgos que representas las diferentes sustancias
químicas para la salud.
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PRACTICA No. 2 – IDENTIFICACION CUALITATIVA DE AMINOACIDOS Y
PROTEINAS
Tipo de práctica
Presencia Autodirigida Remota
l
Otra Simulado
¿Cuál
Porcentaje de 14,4%
evaluación
Horas de la práctica 3
Temáticas de la Propiedades bioquímicas de aminoácidos y
práctica proteínas.
Intencionalidades PROPÓSITOS
formativas Diferenciar algunos métodos colorimétricos
para identificar aminoácidos y proteínas.
Adquirir destreza para la realización de los
métodos cualitativos
OBJETIVO GENERAL
Comprobar mediante diferentes pruebas la
presencia de aminoácidos o proteínas en
diferentes muestras.
COMPETENCIA
Que los estudiantes, se familiaricen con los
métodos colorimétricos.
Fundamentación Teórica
Referente teórico de proteínas y aminoácidos.
Las proteínas son macromoléculas complejas desde los puntos de vista físico
y funcional, que desempeñan múltiples funciones de importancia crucial. La
función de una proteína depende de su estructura tridimensional o
conformación. Están formadas por cadenas lineales de aminoácidos, unidos
por enlaces peptídicos, sin orden aparente. Los aminoácidos son
compuestos orgánicos que contienen grupos amino y carboxilo y por lo
tanto poseen propiedades acidas y básicas.
Todos los organismos emplean los mismos 20 aminoácidos como
bloques constructivos para armar las moléculas de proteína. A estos 20
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aminoácidos se les llama aminoácidos comunes, estándar o normales.
A pesar de la poca cantidad de los aminoácidos, se puede obtener una
variedad enorme de distintos polipéptidos al unir los 20 aminoácidos
comunes para formar distintas combinaciones. En los 20 aminoácidos
comunes, los grupos amino y carboxilo están unidos al mismo átomo de
carbono: el átomo de carbono alfa. Así, todos los aminoácidos estándar
que contienen las proteínas son alfa-aminoácidos. La síntesis de las
proteínas ocurre mediante la unión entre sí de las cadenas de aminoácidos.
Los distintos aminoácidos imparten diferentes comportamientos químicos en
la estructura de las proteínas. Debido a la presencia de diferentes
aminoácidos en las uniones peptídicas las proteínas reaccionan con una
variedad de compuestos formando productos coloreados.
Nomenclatura.
Un Tre Nombre
Clasificación
a s
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let letra
ra s
A Ala Alanina
G Gly Glicina
Apolares alifáticos
I Ile Isoleucina Ae
L Leu Leucina Ae
V Val Valina
F Phe Fenilalanina Ae
Apolares aromáticos
W Trp Triptófano Ae
C Cys Cisteina
Apolares con azufre
M Met Metionina Ae
N Asn Asparagina
S Ser Serina
T Thr Treonina Ae
Y Tyr Tirosina Polar aromático y sin carga
R Arg Arginina
K Lys Lisina
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P Pro Prolina Iminoacido
Ae = Aminoácido esencial
Tomado de: Manual de Prácticas de Laboratorio de bioquímica, Universidad
Nacional Autónoma de México.
Descripción de la práctica
Esta práctica se dividirá en dos partes:
La primera se dedicará para que el estudiante refuerce los
conocimientos de las propiedades Bioquímicas de los aminoácidos y
proteínas.
En la segunda, observar la realización de los análisis para detección
cualitativa de aminoácidos y proteínas
Recursos a utilizar en la práctica (Equipos / instrumentos)
Equipo de computo con conexión a internet.
Software a utilizar en la práctica u otro tipo de requerimiento para el
desarrollo de la práctica
Video de identificación de aminoácidos y proteínas. Laboratorio
https://www.youtube.com/watch?v=V6TV6aeJQQA Link consultado
el 30 de abril del 2020.
Video de Aminoácidos y proteínas: Identificación cualitativa
https://www.youtube.com/watch?v=xubq3xOssWU
Metodología
CONOCIMIENTOS PREVIOS PARA EL DESARROLLO DE LA PRÁCTICA.
El estudiante debe conocer:
El manejo del material básico del laboratorio.
las normas de seguridad y el reglamento de trabajo en el laboratorio.
Propiedades de aminoácidos y proteínas.
Pruebas bioquímicas para identificación cualitativa de proteínas y
aminoácidos.
FORMA DE TRABAJO.
Individual.
PROCEDIMIENTO.
PARTE I- CONOCIMIENTOS DE LAS PROPIEDADES BIOQUIMICAS
Para desarrollar la práctica y comprender los términos deben acceder al
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enlace que se encuentran en la Figura 1 (si presenta dificultades para
cargar el simulador debido al Plug-in de flash player, consultar el siguiente
enlace: https://www.java.com/es/download/help/enable_browser.xml).
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Figura 2. Identificación de aminoácidos y proteínas: laboratorio UPV.
https://www.youtube.com/watch?v=V6TV6aeJQQA Link consultado el 30 de
abril de 2020.
ANÁLISIS DE RESULTADOS :
Responder las preguntas anteriormente descritas y esto se consignarán en el
Informe final de la práctica.
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PRACTICA No. 3 – IDENTIFICACION Y PROPIEDADES DE LIPIDOS
Tipo de práctica
Presencia Autodirigida Remota
l
Otra Simulado
¿Cuál
Porcentaje de 14,4%
evaluación
Horas de la práctica 3
Temáticas de la Identificación y propiedades de los lípidos.
práctica
Intencionalidades PROPÓSITO
formativas Comprobar mediante un experimento de
laboratorio y describir los conceptos de lípidos.
OBJETIVO GENERAL
Identificar las propiedades de los lípidos
COMPETENCIAS
Qué el estudiante adquiera habilidad de
observación, análisis y deducción con los
conceptos de estas moléculas orgánicas.
Fundamentación Teórica
Los lípidos (del griego lypos, grasa) son biomoléculas orgánicas que estan
básicamente constituidas por Carbono, Hidrógenos y Oxígeno, aunque
este último elemento se encuentra en proporciones mucho más bajas que
los dos primeros, son insolubles en agua, se encuentran en los tejidos
adiposos y en otras partes del cuerpo animal y humano. Además, pueden
contener Fosforo, Nitrógeno y Azufre, son solubles en disolventes
orgánicos como el benceno, bencina y cloroformo. Constituyen un grupo de
sustancias muy heterogéneas con características químicas diversas, pero
con algunas propiedades físicas comunes, que podrían resumirse en estas
dos:
_ Son mayoritariamente insolubles en agua.
_ Son solubles en disolventes orgánicos, tales como éter, cloroformo,
alcanos (ej: hexano), benceno, acetona y alcoholes.
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de acuerdo al contenido en su composición ácidos grasos (Lípidos
saponificables) o no lo posean (Lípidos insaponificables).
Descripción de la práctica
Esta práctica se dividirá en tres partes:
La primera se dedicará para que el estudiante haga un repaso de
Identificación de Lípidos.
En la segunda; observarán el procedimiento de análisis de laboratorio
de la reacción con Sudan III y la interpretación cualitativa.
En la tercera; se observa el procedimiento de análisis de laboratorio
mediante la saponificación de lípidos.
Recursos a utilizar en la práctica (Equipos / instrumentos)
MATERIALES , EQUIPOS Y REACTIVOS
Equipo de computo con conexión a internet.
Software a utilizar en la práctica u otro tipo de requerimiento para el
desarrollo de la práctica
Características de Lípidos
Vídeo Identificación de Lípidos. García A, 2020. Identificación de
Lípidos [Archivo de video] recuperado en
https://youtu.be/h9L_994VXyk Link consultado el 30 de abril de 2020.
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FORMA DE TRABAJO.
Individual.
PROCEDIMIENTO.
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Figura 2. Video Laboratorio experimental- Lípidos U. Nacional sede Manizales.
https://www.youtube.com/watch?v=Dsx00q1voC4 Link consultado el 30 de abril de
2020
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SUSTANCIA REACTIVO IMAGEN
Saponificación NaOH
Saponificación KOH
5. Observe y resuelva.
a. Qué tipo de reacción química ocurre con los lípidos cuando se realiza
el proceso de saponificación?
b. Identifique las tres fases hidróxido de sodio, aceite y lípido
saponificado en la imagen resultado del proceso de saponificación.
c. Qué son los jabones? ¿Cómo se pueden obtener los jabones?
d. ¿Por qué en la saponificación la glicerina aparece en la fase acuosa?
e. ¿Qué enzima logra en el aparato digestivo la hidrólisis de las grasas?
ANÁLISIS DE RESULTADOS :
Responder las preguntas anteriormente descritas y esto se consignarán en el
Informe final de la práctica.
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PRACTICA No. 4 – FACTORES FISICOS Y QUIMICOS EN LA
ACTIVIDAD ENZIMATICA
Tipo de practica Presencial Autodirigida Remota
Otra ¿Cuál SIMULADA
Porcentaje de 14,4%
evaluación
Horas de la 3
practica
Temáticas de la Factores físicos, químicos y actividad
práctica enzimática.
Intencionalidades PROPÓSITO
formativas Qué los estudiantes apliquen los
conocimientos de cinética e inhibición
enzimática, a partir de ensayos de
laboratorio.
OBJETIVO GENERAL
Encontrar las condiciones óptimas de pH y
temperatura para la enzima.
COMPETENCIAS
El estudiante relaciona los procedimientos de
laboratorio de la actividad enzimática y las
condiciones del medio ambiente en el que se
encuentra.
Fundamentación Teórica
Las enzimas son macromoléculas proteínicas cuya función es catalizar
reacciones químicas, realizando un cambio químico específico sobre el sustrato
sobre el que actúan, poseen grupos químicos ionizables (carboxilos -COOH;
amino -NH2; tiol -SH; imidazol, etc.) en las cadenas laterales de sus
aminoácidos. El pH óptimo de una enzima puede guardar relación con cierta
carga eléctrica de la superficie, o con condiciones óptimas para la fijación de la
enzima a su sustrato. Cuando hay un exceso de iones hidrogeno, las enzimas
los unen a sus moléculas y ante un déficit los ceden. Según el pH del medio,
estos grupos pueden tener carga eléctrica positiva, negativa o neutra. Como la
conformación de las proteínas depende, en parte, de sus cargas eléctricas,
habrá un pH en el cual la conformación será la más adecuada para la actividad
catalítica, este es el llamado pH óptimo. Cuando la concentración de iones
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hidrógeno es muy baja en comparación con la concentración óptima, la
molécula los cede desapareciendo cargas positivas o apareciendo cargas
negativas en su superficie. Ante una concentración elevada de iones
hidrógeno, algunos se fijan a la molécula desapareciendo cargas (-) o
poniendo cargas (+) que no existían. 57 La mayoría de las enzimas son muy
sensibles a los cambios de pH. Desviaciones de pocas décimas por encima o
por debajo del pH óptimo pueden afectar drásticamente su actividad. Así, la
pepsina gástrica tiene un pH óptimo de 2, la ureasa lo tiene a pH 7 y la
arginasa lo tiene a pH 10. Como ligeros cambios del pH pueden provocar la
desnaturalización de la proteína, los seres vivos han desarrollado sistemas
más o menos complejos para mantener estable el pH intracelular: Los
amortiguadores fisiológicos. La temperatura a la cual la actividad catalítica es
máxima se llama temperatura óptima. La actividad catalítica es afectada por
influencia de la temperatura ya que un incremento de 10°C duplica la
velocidad de reacción, hasta ciertos límites. El calor es un factor que
desnaturaliza las proteínas, por lo tanto si la temperatura se eleva demasiado,
la enzima pierde su actividad, por otra parte la concentración de la enzima
influye siempre y cuando haya sustrato disponible, un aumento en la
concentración de la enzima aumenta la velocidad enzimática hacia cierto
límite. Las reacciones catalizadas por enzimas siguen esta ley general. Sin
embargo, al final, si la energía cinética de la enzima excede a la barrera
energética, se rompen los enlaces débiles de hidrogeno que conservan su
estructura secundaria y terciaria. A esta temperatura predomina la
desnaturalización con pérdida precipitada de la actividad catalítica. Por tanto
las enzimas muestran una temperatura óptima de acción. Los límites de
actividad para la mayor parte de las enzimas tiene lugar entre los 10°C y
50°C; la temperatura óptima para las enzimas en el cuerpo se halla alrededor
de 37°C.
Descripción de la práctica
En la práctica se determinará el efecto de factores físicos y químicos en la
cinética enzimática de la enzima 6-O-α-L-ramnosil-D-glucosidasa, mediante el
análisis de cambios colorimétricos a través de espectrofotometría en
simulador.
Recursos a utilizar en la práctica (Equipos / instrumentos)
MATERIALES , EQUIPOS Y REACTIVOS
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Equipo de computo con conexión a internet.
Software a utilizar en la práctica u otro tipo de requerimiento para el
desarrollo de la práctica
Simulador en línea Herráez A. s.f. Biomodel. Laboratorios virtuales .
ensayo de actividad enzimática [disponible en línea] recuperado en
http://biomodel.uah.es/lab/abs/activ_enz.htm link consultado el 12 de
abril de 2020
Metodología
CONOCIMIENTOS PREVIOS PARA EL DESARROLLO DE LA PRÁCTICA.
Conceptos de Actividad enzimática y su utilización clínica.
Entender y practicar los principios de espectrofotometría
FORMA DE TRABAJO.
Individual.
PROCEDIMIENTO.
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Figura 1. Simulador de ensayo de actividad enzimática disponible en línea
Consultado el 13 de abril de 2020 y disponible en línea:
http://biomodel.uah.es/lab/abs/activ_enz.htm
30
se observa en la parte derecha del simulador, si desea puede utilizar
esta tabla e ir agregando filas durante la simulación del experimento.
4. Seleccionar 3 temperaturas en un rango de 30◦C a 80◦C y seleccionar 3
pH en el rango de 3 a 11, en lo posible buscar que tanto las
temperaturas como los pH tengan representantes en toda la amplitud
de los rangos. Para seleccionar el pH o la temperatura debe desplazar
los controles hacia arriba o hacia abajo.
5. Construir una tabla donde realice las combinaciones de cada
temperatura con cada pH como se indica en la tabla 1, si no la
construye{o antes de iniciar el experimento y no va a usar la tabla del
simulador). Al final deberá tener 9 combinaciones entre las dos
condiciones a evaluar (reemplace las temperatura 1 a 3 y pH 1 a 3
seleccionados por usted en el punto 1), y registre la absorbancia
obtenida al realizar la simulación.
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PRACTICA No. 5 – CUANTIFICACION DE PROTEINAS
Tipo de práctica
Presencia Autodirigida Remota
l
Otra Simulado
¿Cuál
Porcentaje de 14,4%
evaluación
Horas de la práctica 3
Temáticas de la Propiedades estructurales de aminoácidos y
práctica proteínas.
PROPÓSITO
Familiarizar a los estudiantes con las proteinas
y aminoácidos.
Relacionar las propiedades estructurales y
químicas de los aminoácidos y proteínas, a
partir de procedimientos de laboratorio que
describen su comportamiento bioquímico.
OBJETIVOS
Conocer métodos de cuantificación de proteínas
y aplicar los conceptos de curva de calibración.
COMPETENCIA
El estudiante relaciona los procedimientos de
laboratorio sobre estructura de las proteínas,
43 a través de medidas experimentales físicas
y químicas.
Fundamentación Teórica
Para el estudio de la estructura de una proteína, de la actividad de una
enzima o el contenido proteínico de un alimento, es necesario conocer
cuantitativamente la concentración de las proteínas. Existen diferentes
métodos para la cuantificación de proteínas.
Muchos de estos métodos se basan en: a) la propiedad intrínseca de las
proteínas para absorber luz en el UV, b) para la formación de derivados
químicos, o c) la capacidad que tienen las proteínas de formar complejos.
Entre los métodos que se basan en la formación de complejos colorimétricos
entre las proteínas y reactivos específicos se encuentran: Bradford, Lowry y
33
Biuret.
Descripción de la práctica
En esta práctica se evaluará la concentración de proteínas en una
muestra mediante la cuantificación por métodos espectrofotométricos
simulados.
Recursos a utilizar en la práctica (Equipos / instrumentos)
MATERIALES , EQUIPOS Y REACTIVOS
Equipo de computo con conexión a internet.
Software a utilizar en la práctica u otro tipo de requerimiento para el
desarrollo de la práctica
Vídeo de cuantificación de proteínas. Fundamentos de la de
cuantificación de proteínas Peñaranda L. 2020. Práctica # 5:
Cuantificación de proteínas [Archivo de vídeo] recuperado en
https://youtu.be/NH7BBGUXqos
Simulador en línea Herráez A. s.f. Biomodel. Laboratorios virtuales .
Espectrofotómetro UV-VIS Virtual [disponible en línea] disponible en
http://biomodel.uah.es/lab/abs/espectro.htm Link consultado el 2 de
mayo de 2020
Metodología
CONOCIMIENTOS PREVIOS PARA EL DESARROLLO DE LA PRÁCTICA.
El estudiante debe conocer a cerca de la cuantificación de proteínas.
FORMA DE TRABAJO.
Individual.
PROCEDIMIENTO.
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PARTE I-Cuantificación de proteínas.
35
Práctica 5. Disponible en el link: https://youtu.be/sTdNFBhE9eA. Consultado 3 de
mayo de 2020
ANALISIS DE RESULTADOS.
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FUENTES DOCUMENTALES
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