Informe 11 - PCR Reacción en Cadena de La Polimerasa

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PCR REACCIÓN EN CADENA DE LA POLIMERASA

Informe Laboratorio Virtual de Bioquímica

Valentina Gamboa Zapata

Tecnología en Química Industrial y de Laboratorio – Facultad de Ciencias


Básicas, Politécnico Colombiano Jaime Isaza Cadavid
Medellín, Mayo de 2020

RESULTADOS

Imagen 1: parámetros de reacción

Imagen 2: resultados obtenidos

Imagen 3: diagrama de resultados


del Thermus aquaticus, una bacteria
termófila que vive en la proximidad de
manantiales de agua caliente.

En la PCR se separan las cadenas de


la doble hélice del ADN mediante
desnaturalización térmica a
temperaturas en torno a los 95°C, lo
que conduciría a la inactivación de las
DNA polimerasas ordinarias. La
polimerasa Taq, en contraste, tiene
su máxima actividad a 72 °C y su
termo estabilidad es tal que su vida
media a 95°C es de 40 minutos, lo
que la hace idónea para este tipo de
Imagen 4: tabla de resultados procesos.

ANÁLISIS DE RESULTADOS En él experimentó virtual realizado se


realizó éste proceso de amplificación
En esta experiencia se dio a conocer en la secuencia del ADN. En la
por métodos analíticos en una ejecución de él experimentó uno, se
plataforma virtual el funcionamiento utilizaron ciertas cantidades dadas
de los procesos que se dan en la para llevar a cabo el proceso de
PCR (Polymerase Chain Reaction) él reacción con tanto alta pureza cómo
cuál es un proceso enzimático que rendimiento. El proceso se llevó a
permite la amplificación de una cabo durante 30 segundos en él cuál
secuencia específica del ADN, este se completaron ciertamente 30 ciclos
se basa en el uso de dos en los cuáles ocurrió la
oligonucleótidos que, luego de desnaturalización del ADN.
reconocer la secuencia
complementaria en la molécula de
ADN, son alargados cíclicamente CONCLUSIONES
siendo mediado por la acción del
ADN Polimerasa. ● Se dio a conocer los procesos
analíticos por los cuáles se
Cada ciclo de la técnica lleva a cabo la amplificación de
generalmente 20 ó 30 en total, una secuencia de ADN para
implica la desnaturalización del ADN, generar un crecimiento
el apareamiento de los exponencial de sus propias
oligonucleótidos y la síntesis del copias.
nuevo fragmento de ADN a partir del
oligonucleótido, lo que resulta en un ● Se reconoció el proceso por el
crecimiento exponencial de millones cual los virus actúan de tal
de copias del fragmento forma para poder esparcir su
seleccionado. La reacción de síntesis capacidad de infección.
ocurrida es catalizada por un ADN
Polimerasa termoestable, obtenida
● Lavarse las manos con jabón específico y mediante su
es por el momento la mejor amplificación utilizando la Taq
opción para prevenir el polimerasa podemos posteriormente
contagio con el SARS-CoV-2. clonar ese DNA amplificado en un
vector de expresión y obtener dicha
● El Coronavirus pudo haber proteína,
sido creado en un laboratorio,
pero hasta ahora no se tiene DEOXINUCLEOSIDO TRIFOSFATO.
certeza de eso. R/ Las muestras de DNA se disponen
en 4 tubos de reacción donde se
ANEXOS añade a todos ellos un cebador que
permita la acción de la DNA
1. EXPLICA LA FUNCIÓN DE CADA polimerasa y desoxinucleótidos
UNO DE ESTOS REACTIVOS trifosfato para polimerizar la cadena
complementaria de las hebras
● 2 primers disponibles.
● Taq polimerasa
● Desoxinucleótido trifosfato Cada vez que la DNA polimerasa use
(dNTPs) uno de estos didesoxinucleótidos
● Solución Buffer trifosfato para incorporarlo a la
● Agua destilada cadena, la síntesis de esa hebra se
● Plantilla de ADN / ARN paralizará por la no disponibilidad de
extremos 3′-OH.
PRIMER / CEBADOR
R/ Un iniciador o cebador se refiere a SOLUCIÓN BUFFER
un número reducido de nucleótidos Las soluciones tampón, denominadas
del ADN, por lo general de 18 a 24 también soluciones buffer, son
pares de bases de longitud. Un aquéllas que ante la adición de un
cebador puede ser utilizado para ácido o base son capaces de
muchos procesos experimentales reaccionar oponiendo la parte de
diferentes. Se puede utilizar en una componente básica o ácida para
reacción de PCR para llegar a un mantener fijo el pH. Es una o varias
locus determinado y así amplificarlo sustancias químicas que afectan a la
para su posterior análisis. Es una concentración de los iones de
manera de seleccionar una secuencia hidrógeno (o hidronios) en el agua.
muy específica del ADN. Siendo que pH no significa otra cosa
que potencial de hidrogeniones (o
TAQ POLIMERASA. peso de hidrógeno), un buffer (o
R/ la Taq polimerasa es la principal "amortiguador") lo que hace es
enzima que se utiliza para amplificar regular el pH.
secuencias del genoma humano, así Cuando un buffer es añadido al agua,
como de genomas de otros reinos, el primer cambio que se produce es
géneros y especies que existen en la que el pH del agua se vuelve
tierra. constante. De esta manera, ácidos o
bases (álcalis = bases) adicionales no
Actualmente es posible retro- podrán tener efecto alguno sobre el
transcribir un RNA mensajero
agua, ya que esta siempre se El virus, por otra parte, se encuentra
estabilizará de inmediato. dentro de un organismo vivo, del que
requiere sus células para poder
AGUA DESTILADA
replicarse.
Si bien existen quienes alientan su
consumo, amparándose en su
¿QUÉ SON LOS CORONAVIRUS?
pretendida pureza, el agua destilada
R/ Los coronavirus son una extensa
en realidad es un producto de uso
familia de virus que causan
industrial. Se emplea en laboratorios,
infecciones respiratorias que pueden
para preparar mezclas que exigen
ir desde el resfriado común hasta
márgenes altísimos de contaminación
enfermedades más graves como el
en el agua, o que precisan sus
síndrome respiratorio de Oriente
propiedades aislantes y
Medio (MERS) y el síndrome
diamagnéticas.
respiratorio agudo severo (SRAS). El
En la fabricación de baterías, coronavirus que se ha descubierto
cosméticos y reactivos analíticos se más recientemente causa la
emplea agua destilada. También se la enfermedad por coronavirus COVID-
usa en la industria del vidrio y el 19.
cristal, e incluso como punto de
partida en la elaboración de ¿QUÉ SON LAS ZOONOSIS?
productos comestibles y bebidas. R/ Se considera zoonosis a cualquier
enfermedad y/o infección que es
PLANTILLA ADN/ARN naturalmente “transmisible desde
Una plantilla es un modelo animales vertebrados al hombre”, es
proporcionado para que otros lo clasificada como una zoonosis de
copien. El proceso de construir una acuerdo a la publicación de la
molécula de ARN a partir de ADN se Organización Panamericana de la
denomina transcripción. La doble Salud (OPS) “Zoonosis y
hélice de ADN se desenrolla y una enfermedades transmisibles comunes
enzima, ARN polimerasa, construye al hombre y los animales”. Más de
el ARNm usando el ADN como 200 zoonosis han sido descritas y son
plantilla. conocidas desde siglos atrás. Ellas
involucran todo tipo de agentes:
¿CUÁL ES LA DIFERENCIA ENTRE bacteria, parásitos, virus y agentes no
UN VIRUS Y UN VIRIÓN? convencionales.
R/ Las diferencias entre virus y virión
están relacionadas con el entorno en ¿QUÉ ES N95 Y KN95?
el que se encuentran, siendo el virión R/ La mascarilla N95 o cubre bocas
la partícula infectante viral que se N95 es un tipo de mascarilla filtradora
encuentra en el medio ambiente. de partículas que cumple con el
estándar N95 del Instituto Nacional
El virión corresponde a la partícula para la Seguridad y Salud
viral con capacidad patogénica de Ocupacional de los Estados Unidos.
producir enfermedades que se
encuentra libre en el ambiente. La KN95 es un modelo de China que
están diseñadas para filtrar las
partículas, aerosoles líquidos y
patógenos presentes en el medio
ambiente, impidiendo que sean
inhaladas por la persona.

¿QUÉ EFECTO TIENEN EL GEL


ANTIBACTERIAL Y EL JABÓN EN
EL VIRUS?
R/ Con respecto al gel antibacterial,
las funciones de este producto son
limpiar y desinfectar, actuando ante
diferentes bacterias, hongos y virus.
Sin embargo, la concentración de
alcohol con la que están elaborados
es tan baja que no garantiza la
eliminación de microorganismos
bacterianos.

El doctor e infectólogo Carlos Javier


Sánchez del Hospital General de
México mencionó a la agencia de
noticias Notimex que "el gel
antibacterial con alcohol, en lugar de
proteger, hace que se adhieran más
bacterias". Imagen 5: descripción gráfica de cómo
reacciona el coronavirus ante el jabón
El jabón no solo afloja al virus de la
piel, sino que hace que la envoltura ¿QUÉ OTRAS SUSTANCIAS
viral se disuelva, de manera que las TIENEN CAPACIDAD DE ELIMINAR
proteínas y el ARN se deslíen y el EL VIRUS?
virus metafóricamente muere
realmente se desactiva, pues los R/ Amonio cuaternario, Hipoclorito de
virus no están precisamente vivos. sodio, Timol, Cloruro de sodio,
Peróxido de hidrógeno, Hipoclorito de
sodio, Ácido hipocloroso, etc.

¿PUDO SER EL VIRUS CREADO


EN UN LABORATORIO? EXPLIQUE

R/ Sí, en los laboratorios siempre hay


virus aislados y es posible que, al
estar trabajando con uno de ellos,
este pudo haber mutado y propagado
primero en los animales de prueba
(murciélagos) y por último en los
humanos.

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