El documento describe el proceso de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para amplificar una secuencia específica de ADN. Explica que la PCR utiliza la Taq polimerasa para desnaturalizar y copiar el ADN de forma cíclica, lo que resulta en millones de copias del fragmento seleccionado. También presenta los resultados de un experimento virtual de PCR, mostrando la amplificación exitosa del ADN a través de 30 ciclos de reacción.
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El documento describe el proceso de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para amplificar una secuencia específica de ADN. Explica que la PCR utiliza la Taq polimerasa para desnaturalizar y copiar el ADN de forma cíclica, lo que resulta en millones de copias del fragmento seleccionado. También presenta los resultados de un experimento virtual de PCR, mostrando la amplificación exitosa del ADN a través de 30 ciclos de reacción.
Título original
Informe 11 - PCR Reacción en cadena de la polimerasa
El documento describe el proceso de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para amplificar una secuencia específica de ADN. Explica que la PCR utiliza la Taq polimerasa para desnaturalizar y copiar el ADN de forma cíclica, lo que resulta en millones de copias del fragmento seleccionado. También presenta los resultados de un experimento virtual de PCR, mostrando la amplificación exitosa del ADN a través de 30 ciclos de reacción.
El documento describe el proceso de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para amplificar una secuencia específica de ADN. Explica que la PCR utiliza la Taq polimerasa para desnaturalizar y copiar el ADN de forma cíclica, lo que resulta en millones de copias del fragmento seleccionado. También presenta los resultados de un experimento virtual de PCR, mostrando la amplificación exitosa del ADN a través de 30 ciclos de reacción.
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PCR REACCIÓN EN CADENA DE LA POLIMERASA
Informe Laboratorio Virtual de Bioquímica
Valentina Gamboa Zapata
Tecnología en Química Industrial y de Laboratorio – Facultad de Ciencias
Básicas, Politécnico Colombiano Jaime Isaza Cadavid Medellín, Mayo de 2020
RESULTADOS
Imagen 1: parámetros de reacción
Imagen 2: resultados obtenidos
Imagen 3: diagrama de resultados
del Thermus aquaticus, una bacteria termófila que vive en la proximidad de manantiales de agua caliente.
En la PCR se separan las cadenas de
la doble hélice del ADN mediante desnaturalización térmica a temperaturas en torno a los 95°C, lo que conduciría a la inactivación de las DNA polimerasas ordinarias. La polimerasa Taq, en contraste, tiene su máxima actividad a 72 °C y su termo estabilidad es tal que su vida media a 95°C es de 40 minutos, lo que la hace idónea para este tipo de Imagen 4: tabla de resultados procesos.
ANÁLISIS DE RESULTADOS En él experimentó virtual realizado se
realizó éste proceso de amplificación En esta experiencia se dio a conocer en la secuencia del ADN. En la por métodos analíticos en una ejecución de él experimentó uno, se plataforma virtual el funcionamiento utilizaron ciertas cantidades dadas de los procesos que se dan en la para llevar a cabo el proceso de PCR (Polymerase Chain Reaction) él reacción con tanto alta pureza cómo cuál es un proceso enzimático que rendimiento. El proceso se llevó a permite la amplificación de una cabo durante 30 segundos en él cuál secuencia específica del ADN, este se completaron ciertamente 30 ciclos se basa en el uso de dos en los cuáles ocurrió la oligonucleótidos que, luego de desnaturalización del ADN. reconocer la secuencia complementaria en la molécula de ADN, son alargados cíclicamente CONCLUSIONES siendo mediado por la acción del ADN Polimerasa. ● Se dio a conocer los procesos analíticos por los cuáles se Cada ciclo de la técnica lleva a cabo la amplificación de generalmente 20 ó 30 en total, una secuencia de ADN para implica la desnaturalización del ADN, generar un crecimiento el apareamiento de los exponencial de sus propias oligonucleótidos y la síntesis del copias. nuevo fragmento de ADN a partir del oligonucleótido, lo que resulta en un ● Se reconoció el proceso por el crecimiento exponencial de millones cual los virus actúan de tal de copias del fragmento forma para poder esparcir su seleccionado. La reacción de síntesis capacidad de infección. ocurrida es catalizada por un ADN Polimerasa termoestable, obtenida ● Lavarse las manos con jabón específico y mediante su es por el momento la mejor amplificación utilizando la Taq opción para prevenir el polimerasa podemos posteriormente contagio con el SARS-CoV-2. clonar ese DNA amplificado en un vector de expresión y obtener dicha ● El Coronavirus pudo haber proteína, sido creado en un laboratorio, pero hasta ahora no se tiene DEOXINUCLEOSIDO TRIFOSFATO. certeza de eso. R/ Las muestras de DNA se disponen en 4 tubos de reacción donde se ANEXOS añade a todos ellos un cebador que permita la acción de la DNA 1. EXPLICA LA FUNCIÓN DE CADA polimerasa y desoxinucleótidos UNO DE ESTOS REACTIVOS trifosfato para polimerizar la cadena complementaria de las hebras ● 2 primers disponibles. ● Taq polimerasa ● Desoxinucleótido trifosfato Cada vez que la DNA polimerasa use (dNTPs) uno de estos didesoxinucleótidos ● Solución Buffer trifosfato para incorporarlo a la ● Agua destilada cadena, la síntesis de esa hebra se ● Plantilla de ADN / ARN paralizará por la no disponibilidad de extremos 3′-OH. PRIMER / CEBADOR R/ Un iniciador o cebador se refiere a SOLUCIÓN BUFFER un número reducido de nucleótidos Las soluciones tampón, denominadas del ADN, por lo general de 18 a 24 también soluciones buffer, son pares de bases de longitud. Un aquéllas que ante la adición de un cebador puede ser utilizado para ácido o base son capaces de muchos procesos experimentales reaccionar oponiendo la parte de diferentes. Se puede utilizar en una componente básica o ácida para reacción de PCR para llegar a un mantener fijo el pH. Es una o varias locus determinado y así amplificarlo sustancias químicas que afectan a la para su posterior análisis. Es una concentración de los iones de manera de seleccionar una secuencia hidrógeno (o hidronios) en el agua. muy específica del ADN. Siendo que pH no significa otra cosa que potencial de hidrogeniones (o TAQ POLIMERASA. peso de hidrógeno), un buffer (o R/ la Taq polimerasa es la principal "amortiguador") lo que hace es enzima que se utiliza para amplificar regular el pH. secuencias del genoma humano, así Cuando un buffer es añadido al agua, como de genomas de otros reinos, el primer cambio que se produce es géneros y especies que existen en la que el pH del agua se vuelve tierra. constante. De esta manera, ácidos o bases (álcalis = bases) adicionales no Actualmente es posible retro- podrán tener efecto alguno sobre el transcribir un RNA mensajero agua, ya que esta siempre se El virus, por otra parte, se encuentra estabilizará de inmediato. dentro de un organismo vivo, del que requiere sus células para poder AGUA DESTILADA replicarse. Si bien existen quienes alientan su consumo, amparándose en su ¿QUÉ SON LOS CORONAVIRUS? pretendida pureza, el agua destilada R/ Los coronavirus son una extensa en realidad es un producto de uso familia de virus que causan industrial. Se emplea en laboratorios, infecciones respiratorias que pueden para preparar mezclas que exigen ir desde el resfriado común hasta márgenes altísimos de contaminación enfermedades más graves como el en el agua, o que precisan sus síndrome respiratorio de Oriente propiedades aislantes y Medio (MERS) y el síndrome diamagnéticas. respiratorio agudo severo (SRAS). El En la fabricación de baterías, coronavirus que se ha descubierto cosméticos y reactivos analíticos se más recientemente causa la emplea agua destilada. También se la enfermedad por coronavirus COVID- usa en la industria del vidrio y el 19. cristal, e incluso como punto de partida en la elaboración de ¿QUÉ SON LAS ZOONOSIS? productos comestibles y bebidas. R/ Se considera zoonosis a cualquier enfermedad y/o infección que es PLANTILLA ADN/ARN naturalmente “transmisible desde Una plantilla es un modelo animales vertebrados al hombre”, es proporcionado para que otros lo clasificada como una zoonosis de copien. El proceso de construir una acuerdo a la publicación de la molécula de ARN a partir de ADN se Organización Panamericana de la denomina transcripción. La doble Salud (OPS) “Zoonosis y hélice de ADN se desenrolla y una enfermedades transmisibles comunes enzima, ARN polimerasa, construye al hombre y los animales”. Más de el ARNm usando el ADN como 200 zoonosis han sido descritas y son plantilla. conocidas desde siglos atrás. Ellas involucran todo tipo de agentes: ¿CUÁL ES LA DIFERENCIA ENTRE bacteria, parásitos, virus y agentes no UN VIRUS Y UN VIRIÓN? convencionales. R/ Las diferencias entre virus y virión están relacionadas con el entorno en ¿QUÉ ES N95 Y KN95? el que se encuentran, siendo el virión R/ La mascarilla N95 o cubre bocas la partícula infectante viral que se N95 es un tipo de mascarilla filtradora encuentra en el medio ambiente. de partículas que cumple con el estándar N95 del Instituto Nacional El virión corresponde a la partícula para la Seguridad y Salud viral con capacidad patogénica de Ocupacional de los Estados Unidos. producir enfermedades que se encuentra libre en el ambiente. La KN95 es un modelo de China que están diseñadas para filtrar las partículas, aerosoles líquidos y patógenos presentes en el medio ambiente, impidiendo que sean inhaladas por la persona.
¿QUÉ EFECTO TIENEN EL GEL
ANTIBACTERIAL Y EL JABÓN EN EL VIRUS? R/ Con respecto al gel antibacterial, las funciones de este producto son limpiar y desinfectar, actuando ante diferentes bacterias, hongos y virus. Sin embargo, la concentración de alcohol con la que están elaborados es tan baja que no garantiza la eliminación de microorganismos bacterianos.
El doctor e infectólogo Carlos Javier
Sánchez del Hospital General de México mencionó a la agencia de noticias Notimex que "el gel antibacterial con alcohol, en lugar de proteger, hace que se adhieran más bacterias". Imagen 5: descripción gráfica de cómo reacciona el coronavirus ante el jabón El jabón no solo afloja al virus de la piel, sino que hace que la envoltura ¿QUÉ OTRAS SUSTANCIAS viral se disuelva, de manera que las TIENEN CAPACIDAD DE ELIMINAR proteínas y el ARN se deslíen y el EL VIRUS? virus metafóricamente muere realmente se desactiva, pues los R/ Amonio cuaternario, Hipoclorito de virus no están precisamente vivos. sodio, Timol, Cloruro de sodio, Peróxido de hidrógeno, Hipoclorito de sodio, Ácido hipocloroso, etc.
¿PUDO SER EL VIRUS CREADO
EN UN LABORATORIO? EXPLIQUE
R/ Sí, en los laboratorios siempre hay
virus aislados y es posible que, al estar trabajando con uno de ellos, este pudo haber mutado y propagado primero en los animales de prueba (murciélagos) y por último en los humanos.