Splicing ARN
Splicing ARN
Splicing ARN
Splicing de ARN
El splicing de ARN o empalme de ARN(del inglés RNA splicing) es un proceso co-transcripcional de corte y
empalme de ARN. Este proceso es muy común en eucariotas, pudiéndose dar en cualquier tipo de ARN aunque es
más común en el ARNm. También se ha descrito en el ARNr y ARNt de procariotas y bacteriófagos. Normalmente
consiste en eliminar los intrones del transcrito primario y posteriormente unir los exones; aunque existen otros tipos
de ajuste donde se eliminan exones y/o retienen intrones (véase splicing alternativo).
Rutas de splicing
En la naturaleza existen diversos
métodos de splicing del ARN. El
mecanismo de splicing depende de la Ilustración del proceso de splicing desde pre-ARN a ARN.
estructura del fragmento de ARN que
pasará por este proceso.
Spliceosoma
El Spliceosoma es un complejo formado por cinco ribonucleoproteínas nucleares pequeñas o snRNP (complejo
formado por unas diez proteínas más una pequeña molécula de ARN). El ARN de los snRNP es el encargado de
reconocer el intrón. Se han identificado dos tipos de spliceosomas, el mayor y el menor[cita requerida], cada uno de los
cuales contiene diferentes tipos de snRNP.
Spliceosoma mayor
Esta formado por los snRNP U1, U2, U4, U5 y U6. Reconoce la secuencia consenso GU (Guanina-Uracilo) del
extremo 5’ del intrón así como la secuencia consenso AG del extremo 3’. El 99% de los intrones, ayustados mediante
ayustosomas, lo hacen a través de este mecanismo.
• Complejo E: U1 se une a la secuencia consenso GU del extremo 5’ del sitio de corte del intrón, junto con las
proteínas accesorias ASF/SF2, U2AF, SF1/BBP.
• Complejo A: U2 se une al sitio de ramificación e hidroliza ATP. El sitio de ramificación se sitúa a una distancia
de 20-40 nucleótidos del extremo 3’ del intrón y en él se localiza la secuencia consenso CURAY.
• Complejo B1: U5, U4 y U6 trimerizan, y U5 se une al exón 5’ y U6 a U2.
• Complejo B2 – U1 es liberado, U5 pasa del exón al intrón y U6 se une al extremo 5’ del sitio de corte.
• Complejo C1: U4 es liberado, U5 se une al sito de empalme del extremo 3’ del exón, U6 y U2 catalizan la
reacción de transesterificación y el extremo 5’ del intrón es cortado; como resultado se forma una estructura en
lazo característica denominada lariat.
• Complejo C2: el extremo 3’ del intrón es cortado lo que provoca la liberación del lazo de ARN. A continuación
los exones son ligados, lo que conlleva gasto de ATP. Por último, el complejo se disocia.
Splicing de ARN 2
Spliceosoma menor
Es similar al Spliceosoma mayor aunque los intrones eliminados mediante este mecanismo son escasos, y además
presentan diferencias en los sitios de corte y empalme. También se diferencian en las secuencias consenso
reconocidas, que en este caso son AU y AC para los extremos 3’ y 5’, respectivamente. Además, salvo la partícula
snRNP U5, el resto son análogos funcionales denominadas U11 (análogo funcional de la U1), U12 (U2), U4atac
(U4) y U6atac(U6).
Splicing en trans
También se puede denominar transempalme o empalme en trans. Consiste en el empalme de exones de dos
transcritos primarios distintos, con la consiguiente formación de un ARN híbrido.
Autosplicing
Corte y empalme en el que el propio intrón actúa como catalizador en su eliminación, por lo que no se requiere de
proteínas. Cuando un fragmento de ARN tiene actividad catalítica se le denomina ribozima. Para que el mecanismo
de autosplicing sea preciso se requiere de la hidrólisis de ATP. Existen dos tipos de intrones que actúan como
ribozimas, los intrones del grupo I y los del grupo II. La similitud en el mecanismo de corte y empalme de estos
intrones y el spliceosoma sugiere que probablemente evolucionaron juntos aunque también se ha propuesto que el
autosplicing surgió durante el mundo de ARN.
• El grupo OH 3’ de un nucleósido
libre de guanina o del propio intrón
o un cofactor (GMP, GDP o GTP)
ataca al fosfato del sitio de corte 5’.
Lo que da lugar al corte del intrón
por su extremo 5’ y a la formación
del lariat (estructura en lazo).
• El grupo OH 3’ del exón lleva a
cabo un ataque nucleofílico contra
el extremo 3’ del intrón, lo que
origina su corte y la liberación de la
estructura en lazo.
• Los exones son unidos. Ilustración del mecanismo bioquímico del autoayuste.
Splicing de ARNt
Es un mecanismo de corte y empalme poco usual que se observa en ARNt. El mecanismo involucra diferentes rutas
bioquímicas como la splceosomal y el autosplicing.
Errores en el Splicing
Las mutaciones pueden afectar a los sitios de splicing, lo que puede influir sobre la síntesis proteica de distintas
formas:
• Pérdida del sitio de splicing: puede originar la aparición prematura de un codón de stop, la pérdida de un exón
o la inclusión de un intrón.
• Reducir la especificidad: puede variar la localización del sitio de splicing, lo que origina la inserción o
deleción de aminoácidos o la pérdida de la pauta de lectura.
• Transposición del sitio de splicing: origina la inserción o deleción de ARN, lo que origina cadenas de ARN
más cortas o largas.
Splicing alternativo
El splicing alternativo permite obtener a partir de un transcrito primario de ARN distintas moléculas de ARN
maduras. Este proceso ocurre principalmente en eucariotas aunque también puede observarse en virus. Para más
información consultar el artículo principal: Splicing alternativo.
Véase también
• Splicing
• Splicing alternativo
• Spliceosoma
• Exón
• Intrón
Fuentes y contribuyentes del artículo 4
Licencia
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