NUCLEÓTIDOS

Bioquímica 2. Pilar Negreros

 Nucleótidos
 Algunas funciones:
- precursores de ácidos nucleicos,
- el metabolismo de la energía,
- la síntesis de proteínas,
- la regulación de la actividad enzimática y
- la transducción de señales.
 Nucleótidos
 Cuando se enlazan a vitaminas o derivados
de vitaminas, los nucleótidos forman parte
de muchas coenzimas.
 Enlazados a azúcares o lípidos, pueden ser
intermediarios biosintéticos.
 Los derivados del azúcar, UDP glucosa y UDP
galactosa participan en las interconversiones
del azúcar y en la síntesis del almidón y del
glucógeno.
 los derivados nucleósido-lípido, como el CDP
acilglicerol son intermediarios para la síntesis de
lípidos.
 Las funciones de los nucleótidos en la
regulación metabólica incluyen la fosforilación
de enzimas metabólicas clave dependientes
de ATP, regulación alostérica de enzimas por
ATP, ADP, AMP Y CTP.
 Los nucleótidos cíclicos, AMPC y CTPc sirven
como los segundos mensajeros en reacciones
reguladas por hormonas, y el GTP y GDP
desempeñan funciones importantes.
 Además, de las funciones en el metabolismo,
tienen aplicaciones médicas que incluyen:
- el uso de análogos de purinas y pirimidinas
sintéticos que contienen halógenos, tioles o
átomos de nitrógeno adicionales en la
quimioterapia de cáncer y SIDA,
- y como supresores de la respuesta
inmunitaria durante el trasplante de órganos.
 Propiedades químicas de
purinas, pirimidinas, nucleósidos
y nucleótidos
Las bases nitrogenadas son compuestos
orgánicos cíclicos, que incluyen dos o más
átomos de nitrógeno.
Son parte fundamental de los nucleósidos,
nucleótidos, nucleótidos cíclicos (mensajeros
intracelulares) y ácidos nucléicos.
Existen seis bases nitrogenadas relevantes (hay
muchas más), que se clasifican en tres grupos:
bases isoaloxazínicas (derivadas de la
estructura de la isoaloxazina)
bases púricas o purinas (derivadas de la
estructura de la purina) y
bases pirimidínicas o pirimidinas (derivadas
de la estructura de la pirimidina).
La flavina (f) es isoaloxazínica; la adenina (a) y
la guanina (g) son púricas; y la timina (t),
la citosina (c) y el uracilo (u) son pirimidínicas.
 Las purinas y pirimidinas son heterociclos
que contienen nitrógeno.
 Las purinas y pirimidinas con un grupo NH2
son bases débiles, aunque el protón
presente a pH bajo está asociado no con
el grupo amino exocíclico, sino con un
nitrógeno de anillo, típicamente N1 en
adenina, N7 en guanina y N3 en citocina.
 La naturaleza planar de las purinas y las
pirimidinas facilita su asociación estrecha,
o apilamiento ,que estabiliza el ADN
bicaternario.
 Los grupos oxo y amino de purinas y
pirimidinas muestran tautomerismo ceto-enol y
amina-imina, aunque las condiciones
fisiológicas favorecen fuertemente las formas
amino-oxo.
 El tautomerismo entre cetona y alcohol se da
en g, c, t y u. El tautomerismo entre amina e
imina se da en G, A y C.
Los dobles enlaces conjugados de
derivados de purina y pirimidina
absorben luz ultravioleta.

Si bien los espectros son dependientes

del pH, a pH de 7.0 todos los nucleótidos
comunes absorben luz a una longitud
cercana a los 260 nm.
De esta manera, la concentración de
nucleótidos y ácidos nucleicos suele
expresarse en términos de
absorbancia a 260 nm. Y se puede
saber la “cantidad” de material
genético de una muestra
relacionándolo con su absorbancia.

La luz ultravioleta puede tener un

efecto mutagénico en los ácidos
nucléicos.
Estructura
 Los nucleósidos son derivados de purinas y
pirimidinas que tienen un azúcar enlazado a un
nitrógeno del anillo de una purina o de una
pirimidina.
 El azúcar en los ribonucleósidos es d-ribosa y en
los desoxirribonucleósidos es la 2 desoxi-d-ribosa.
 Ambos azúcares están unidos al heterociclo por
medio de un enlace b-n-glucosídico, casi
siempre n-1 de una pirimidina o n-9 de una
purina.
 Los mononucleótidos son nucleósidos con un
grupo fosforilo esterificado a un grupo
hidroxilo del azúcar.
 Pueden tener grupos fosforilo adicionales,
ligado por enlaces anhídrido de ácido al
grupo fosforilo de un mononucleótido, forman
nucleósidos difosfato y trifosfato.
Estructuras adicionales
 Pequeñas cantidades de purinas y pirimidinas
adicionales se encuentran en el ADN y en el
ARN.

 Por ejemplo 5 metil citocina del ADN

bacteriano y seres humanos, 5 hidroxi metil
citocina de ácidos nucleicos virales y
bacterianos, y adenina y guanina mono y di-
n-metiladas de ARN mensajeros de mamíferos,
que funcionan en el mantenimiento de la
estructura del ARN.
 Existen además bases heterocíclicas libres,
como la hipoxantina, xantina y ácido úrico,
que son intermediarios en el catabolismo de
adenina y guanina.

 Existen también heterociclo metilados de

vegetales, que son derivados de las xantinas,
como la cafeína, la teofilina y la teobromina.
Los nucleótidos trifosfato tienen dos
enlaces anhídrido y un enlace éster. A
diferencia de los ésteres, los anhídridos
ácidos tienen un potencial alto de
transferencia de grupo.
Este potencial alto de transferencia de
grupo permite que los nucleósidos
trifosfato purina y pirimidina funcionen
como reactivos de transferencia de
grupo.
La reacción es exergónica, por lo que
puede ser utilizada para biosíntesis.
Ejemplos de nucléotidos
útiles en el cuerpo
Adenosín trifosfato (ATP) humano
Gran cantidad de energía para las funciones
biológicas se almacena en los enlaces de alta
energía que unen los grupos fosfato y se liberan
cuando uno o dos de los fosfatos se separan de
las moléculas de ATP:

ATP + H2O → ADP + P (ADP: Adenosín difosfato)

AMPc (Adenosin monofosfato cíclico)

 Función importante de señalización celular

 Se usa como aditivo alimentario para
reducir la sensación de amargor
 NAD+

 Dinucleótido de nicotinamida y adenina

 Coenzima necesaria para actividad de
enzimas (acarrea moléculas)
 El ADN y el ARN son
polinucleótidos
 El grupo 5´-fosforilo de un mononucleótido
puede esterificar un segundo grupo hidroxilo,
en el carbono 3´de otro mononucleótido, lo que
forma un fosfodiéster.
 Como resultado se forma un
dinucleótido, en el cual las
porciones pentosa están enlazadas
mediante un enlace 3’, 5´-
fosfodiéster.
 Los enlaces fosfodiéster unen los
carbonos 3´y 5´de monómeros
adyacentes.
 Cada extremo de un polímero de
nucleótido es distinto, por lo tanto si
se hace referencia al extremo 5´o el
extremo 3´de un polinucleótido, el
extremo 5´es aquel con un grupo
hidroxilo libre, o fosforilado.
 Complementariedad
de base nitrogenadas
 Por la forma en que se enlazan, las purinas y
pirimidinas son complementarias entre sí, es
decir, forman parejas de igual manera que lo
harían una llave y su cerradura; son los
denominados apareamientos de Watson y
Crick.
 La adenina y la timina son complementarias
(A=T), unidas a través de dos puentes de
hidrógeno, mientras que la guanina y
la citosina (G≡C) se unen mediante tres puentes
de hidrógeno.
 Dado que el ARN no contiene timina, la
complementariedad se establece entre
adenina y uracilo (A=U) mediante dos puentes
de hidrógeno.
 Complementariedad
de base nitrogenadas

A-T

G-C