X

UNIVERSIDAD
AUTÓNOMA DE ZACATECAS
“Francisco García Salinas”

Doctorado en Ciencias
Básicas
Plan de Estudios - Versión 2018

UACB
Doctorado en Ciencias Básicas

Directorio Institucional

Dr. Antonio Guzmán Fernández
Rector

Dr. Rubén Ibarra Reyes
Secretario General

Dr. Luis Alejandro Aguilera Galaviz
Secretario Académico

Dr. Agustín Serna Aguilera
Secretario Administrativo

Dr. David Armando Contreras Solorio
Coordinador del Área de Ciencias Básicas

I


Directorio DES Ciencias Básicas

Dr. Felipe Román Puch Ceballos
Director Unidad Académica de Física

Dr. J. Ignacio Dávila Rangel
Director Unidad Académica de Estudios Nucleares

Dra. Leticia Adriana Ramírez Hernández
Directora Unidad Académica de Matemáticas

Dra. Marisa Mercado Reyes
Directora Unidad Académica de Ciencias Biológicas

II


Créditos y comités académicos
Comités Académicos del Doctorado en Ciencias Básicas
Coordinador del Doctorado en Ciencias Básicas

Dr. Juan Carlos Martínez Orozco

Responsables por orientación

Física: Dr. Isaac Rodríguez Vargas
Matemáticas: Dr. Miguel Ángel Maldonado Aguilar
Ciencias Biológicas: Dr. Juan José Bollaín y Goytia De La Rosa
Estudios Nucleares: Dr. Fernando Mireles García

Comités Académicos Doctorales de Orientación (CADO)
Física Matemáticas
Dr. Isaac Rodríguez Vargas Dr. Santos Hernández Hernández
Dr. Hugo Tototzintle Huitle Dr. Jesús Leaños Macías
Dr. Miguel Ángel García Aspeitia Dr. Miguel Ángel Maldonado Aguilar
Dr. Andrey Chubikalo Dr. Luis Manuel Rivera

Estudios Nucleares Ciencias Biológicas
Dr. Fernando Mireles García Dr. Rafael Herrera Esparza
Dr. Carlos Ríos Martínez Dr. Jesús Adrián López
Dr. Eduardo Manzanares Acuña Dra. Esperanza del Refugio Avalos Díaz
Dr. José Luis Pinedo Vega Dr. Juan José Bollaín y Goytia De La Rosa

III


Datos Generales del Programa
Educativo
Doctorado en
Nombre del Programa Educativo:
Ciencias Básicas
Tipología: Básico
Modalidad Educativa: Escolarizada
Créditos: 180
Horas: 4,870
Grado que se otorga: Doctorado
Título que se obtiene: Doctor en Ciencias
Generación a partir de la que se aplica el programa educativo: 2018
IV


ÍNDICE

PRESENTACIÓN ............................................................................................................................ 1
ANTECEDENTES ........................................................................................................................... 5
JUSTIFICACIÓN .......................................................................................................................... 15
RASGOS DESEABLES ................................................................................................................. 19
Misión ............................................................................................................................................... 19
Visión 2025 ...................................................................................................................................... 19
Perfil de egreso ................................................................................................................................ 20
Perfil y requisitos académicos de ingreso ..................................................................................... 21
ESTRUCTURA CURRICULAR .................................................................................................. 23

Mapa Curricular ............................................................................................................................... 23
Estructura general ........................................................................................................................... 24
Asignaturas de Formación Básica (AFB) ....................................................................................... 26
Asignaturas de Formación Específica (AFE) ................................................................................. 27
Proyecto de Tesis Doctoral ............................................................................................................. 27
Seminario de Tesis (I, II, III y IV) .................................................................................................... 27
Investigación (I, II, III y IV) ............................................................................................................. 28
Estancia de Investigación ............................................................................................................... 28
Acreditación de Tesis Doctoral ....................................................................................................... 28
Seminario Doctoral .......................................................................................................................... 29
Líneas de Investigación: .................................................................................................................. 31
Biología Evolutiva y Biodiversidad (BEB) ....................................................................................... 31
Biología Celular y Molecular Integrativa (BCMI) ........................................................................... 34
Ciencias Nucleares (CN) ................................................................................................................. 35
Partículas, Campos y Física-Matemática (PCFM) .......................................................................... 37
Modelación, Síntesis y Caracterización de Materiales (MSCM) .................................................... 38
Matemáticas Básicas (MBa) ......................................................................................................... 41
Investigadores ................................................................................................................................. 42
NORMATIVIDAD ........................................................................................................................ 45
Capítulo I. De la estructura operativa ............................................................................................ 45
Capítulo II. Del Comité Académico Doctoral de Ciencias Básicas ................................................ 45
Capítulo III. De los Comités Académicos Doctorales de Orientación ........................................... 46
Capítulo IV. Del comité de tutores .................................................................................................. 47
Capitulo V. Apoyo Administrativo .................................................................................................. 48
Capítulo VI. Del ingreso ................................................................................................................... 49
Capítulo VII. De la convalidación, equivalencia y revalidación de estudios ................................ 51
Capítulo VIII. De la permanencia .................................................................................................... 51
V


Capítulo IX. De las evaluaciones ..................................................................................................... 52
Capítulo X. De la movilidad estudiantil y de académicos ............................................................. 52
Capítulo XI. Del egreso .................................................................................................................... 53
Capítulo XII. Profesores activos ...................................................................................................... 54
Capítulo XIII. De las Líneas de Investigación ................................................................................. 55
Capítulo XIV. De las omisiones ....................................................................................................... 56
EFICACIA DEL PROGRAMA ..................................................................................................... 57

Estrategias ....................................................................................................................................... 57
Estrategias para garantizar el ingreso al Programa Académico ................................................... 57
Estrategias para garantizar una alta tasa de titulación ............................................................... 58
Estrategias para garantizar la calidad académica ........................................................................ 58
ANEXO A ....................................................................................................................................... 60
ASIGNATURAS DE FORMACIÓN BÁSICA ............................................................................ 60
Biología de la interacción planta-microorganismo ....................................................................... 61
Bioinformática ................................................................................................................................. 64
Fisiología vegetal ............................................................................................................................. 66
Biología del estrés abiótico y biótico en planta e intercomunicación ......................................... 68
Biología molecular ........................................................................................................................... 70
Biodiversidad ................................................................................................................................... 72
Biogeografía ..................................................................................................................................... 74
Evolución biológica ......................................................................................................................... 76
Ecología ............................................................................................................................................ 78
Sistemática biológica ....................................................................................................................... 80
Detección de la radiación nuclear .................................................................................................. 83
Física nuclear ................................................................................................................................... 86
Seguridad radiológica ..................................................................................................................... 88
Mecánica clásica .............................................................................................................................. 91
Introducción a la electrodinámica .................................................................................................. 94
Mecánica cuántica ........................................................................................................................... 96
Física estadística .............................................................................................................................. 98
Geometría Algebraica .................................................................................................................... 101
Teoría de Gráficas .......................................................................................................................... 103
Teoría algebraica de los números ................................................................................................ 105
ANEXO B ..................................................................................................................................... 107

ASIGNATURAS DE FORMACIÓN ESPECÍFICA .............................................................. 107
Biocontrol de enfermedades en plantas ...................................................................................... 108
Biotecnología para remediación del estrés en plantas ............................................................... 110
Ingeniería Metabólica de Microorganismos de Importancia Biotecnológica y Agrícola .......... 112
Bio-georeferenciación ................................................................................................................... 114
VI


Biología comparada ....................................................................................................................... 116
Diversidad Bacteriana ................................................................................................................... 119
Evolución y diversidad de invertebrados .................................................................................... 121
Evolución y diversidad de vertebrados ....................................................................................... 123
Interacciones simbióticas ............................................................................................................. 125
Sistemática molecular ................................................................................................................... 128
Microbiología molecular ............................................................................................................... 131
Inmunobiología ............................................................................................................................. 133
Patogénesis Bacteriana ................................................................................................................ 135
Biología celular y cáncer ............................................................................................................... 137
RNAs no codificantes ..................................................................................................................... 139
Espectrometría de la radiación nuclear ....................................................................................... 141
Espectrometría de neutrones ....................................................................................................... 143
Física de la atmósfera .................................................................................................................... 145
Química radioanalítica .................................................................................................................. 147
Radiobiología ................................................................................................................................. 149
Radioinmunoanálisis ..................................................................................................................... 151
Radioquímica ................................................................................................................................. 153
Teoría de blindajes ........................................................................................................................ 155
Astronomía extragaláctica y cosmología ..................................................................................... 157
Estructura galáctica y dinámica estelar ....................................................................................... 160
Relatividad general ....................................................................................................................... 162
Teoría cuántica de campo ............................................................................................................. 164
Teorías de norma en física de partículas ..................................................................................... 167
Teoría general de campos clásicos ............................................................................................... 169
Tópicos avanzados de Física-Matemática .................................................................................... 171
Tópicos avanzados de mecánica clásica ...................................................................................... 173
Cálculo de propiedades electrónicas ............................................................................................ 175
Caracterización de materiales ...................................................................................................... 177
Física del estado sólido ................................................................................................................. 179
Física de semiconductores ............................................................................................................ 181
Heteroestructuras cuánticas ........................................................................................................ 183
Holografía digital ........................................................................................................................... 185
Ingeniería óptica ............................................................................................................................ 187
Introducción al análisis multivariante ......................................................................................... 189
Introducción a las espectroscopias vibracionales ...................................................................... 191
Introducción a la física de bajas temperaturas ........................................................................... 193
Óptica de Fourier ........................................................................................................................... 195
Propagación de ondas en medios multicapas ............................................................................. 197
Química de materiales ................................................................................................................... 199
Técnicas de crecimiento de materiales ........................................................................................ 201
VII


Geometría discreta ........................................................................................................................ 203
Geometría Diofantina .................................................................................................................... 205
Superficies algebraicas .................................................................................................................. 206
Tópicos Selectos de la Biología ..................................................................................................... 207
Tópicos Selectos de la Matemática ............................................................................................... 207
Tópicos Selectos de la Física ......................................................................................................... 208
Tópicos Selectos de las Ciencias Nucleares ................................................................................. 208

VIII


PRESENTACIÓN

El presente programa está enmarcado dentro del Modelo UAZ Siglo XXI el cual
promueve una formación integral al enfatizar las habilidades del aprendizaje
permanente, así como vincular directamente el contenido de los conocimientos con
las nuevas tecnologías, estimular la permeabilidad a otros idiomas y culturas, y
despertar aptitudes emprendedoras y el carácter para enfrentar lo nuevo en cualquier
ámbito. En este contexto la ciencia y la cultura juegan un papel central. En particular,
se vuelve prioritaria la educación sustentada en la investigación, los procesos de
aprendizaje del estudiante, los currículos abiertos y flexibles, y la incorporación y
generalización del uso de las nuevas tecnologías ligadas a la información y a la
comunicación.
Así pues el modelo de la UAZ promueve, a través de su oferta educativa y los planes y
programas que la concretan, una formación con las características señaladas para la
educación de alta calidad: pertinencia, relevancia, eficiencia, eficacia, trascendencia y
equidad, mediante tareas educativas que tienen una mayor correspondencia entre los
contenidos, procesos y resultados del quehacer académico en respuesta a las
necesidades y expectativas de la sociedad y los estudiantes. Igualmente ofrece
programas que permiten lograr los objetivos institucionales al menor costo posible y
con el menor desgaste humano, con oportunidades equitativas para el ingreso y la
permanencia a través de estrategias para que los estudiantes culminen con éxito una
formación que les permita la inserción al mercado laboral y su desarrollo como
ciudadanos.
Este proyecto está conformado por cinco grandes secciones con diferentes apartados
que se describen a continuación.

La primera sección contempla los apartados antecedentes y justificación. En el
primero de ellos se aborda el contexto internacional y nacional de la educación
superior dejando en claro la necesidad de ofertar programas educativos que
1


respondan a las necesidades actuales de un mundo cada vez más globalizado. En
particular, se hace una descripción de la situación de los posgrados en el país siendo
evidente que aunque se han hecho esfuerzos importantes para generar recursos
humanos de alto nivel, no son suficientes. En el segundo apartado se trata de justificar
el presente proyecto desde la perspectiva de la sociedad o economía del conocimiento
poniendo de manifiesto lo imperante que resulta generar los recursos humanos
necesarios y suficientes para transitar hacia una sociedad sustentada en recursos
intangibles. Igualmente, se presentan datos fehacientes que indican claramente la
oportunidad inmejorable que presenta el Área de Ciencias Básicas de la UAZ para
sustentar un posgrado de calidad dados los recursos humanos calificados con los que
cuenta. Así mismo, el presente proyecto representaría para la UAZ y el Estado de
Zacatecas el primer programa de Doctorado en Ciencias Básicas en su historia.

La segunda sección denominada Rasgos Deseables está constituida por los apartados
de Misión, Visión, Perfil de Egreso y Perfil de Ingreso, respectivamente. Los dos
primeros apartados describen el objetivo central del programa que consiste en formar
investigadores con actitudes, habilidades y conocimientos sólidos que les permitan
analizar, generar, aplicar, transmitir y difundir el conocimiento. Los dos apartados
restantes por un lado explicitan las competencias que los estudiantes adquirirán al
término del programa. Entre ellas, una de las más importantes, la capacidad de
plantear, realizar y evaluar proyectos de investigación originales, en especial en el
ámbito de su campo disciplinario. Por otro lado se enlistan cada uno de los requisitos
que el aspirante al programa debe reunir para poder acceder al mismo.

La tercera sección corresponde a la Estructura Curricular la cual cuenta con siete
apartados: Estructura del Programa, Asignaturas de Formación Básica y Específica,
Proyecto de Tesis Doctoral, Estancia de Investigación, Acreditación de Tesis Doctoral,
Seminario Doctoral, y Líneas de Investigación. Cada uno de estos apartados describe
las diferentes características y fases del programa. Dentro de las más importantes
podemos mencionar: el proceso de admisión que consiste en un examen escrito y un
2


oral aplicado por un comité constituido ad hoc para tales fines de manera que se
asegure que los aspirantes seleccionados transiten exitosamente a través del
programa y la defensa del proyecto de tesis doctoral ante un jurado que valore por un
lado la viabilidad del proyecto y por otro los conocimientos mínimos necesarios que el
estudiante debe reunir para el desarrollo del mismo. En este sentido, las materias de
formación básica y específica sirven de refuerzo para tales fines. Las etapas
correspondientes a la Acreditación de Tesis Doctoral y el Seminario Doctoral tienen
como objetivo, avalar al estudiante como doctor, examinando de manera exhaustiva al
mismo, de tal manera que la misión del programa sea cabalmente cumplida. Para
acceder hasta este punto el estudiante deberá presentar semestralmente, ante su
Comité Tutorial los avances de su proyecto de tesis doctoral; así como un reporte de
las actividades académicas realizadas, siendo importantes para estos procesos las
estancias nacionales o internacionales contempladas en el programa. En el último
apartado se da una descripción de las líneas de investigación que constituyen el
programa donde se especifican los principales objetivos de cada una de ellas, así como
la relación de los investigadores que las sustentan.

La cuarta sección concierne a la Reglamentación la cual está constituida por once
apartados siendo estos la columna vertebral del programa: 1) De la estructura
operativa, 2) Del Comité Académico Doctoral de Ciencias Básicas, 3) De los Comités
Académicos Doctorales de Admisión, 4) Del Comité de Tutores, 5) De la Unidad de
Apoyo Escolar y Administrativo, 6) Del ingreso, 7) De la convalidación, equivalencia y
revalidación de estudios, 8) De la permanencia, 9) De las evaluaciones, 10) De la
movilidad estudiantil y de académicos, y 11) Del egreso. Los apartados mencionados
están debidamente ceñidos a los lineamientos generales de la normatividad
universitaria siendo del 1 al 5 fundamentales para el buen funcionamiento del
programa, ya que estos corresponden a comités en los cuales se tomarán las
decisiones más importantes en prácticamente todos los aspectos del programa.

3


En último lugar, se encuentra la sección de Eficacia del Programa la cual consiste en
dos apartados: 1) Estrategias y 2) Plan de desarrollo orientado a las dos primeras
generaciones. El primer apartado consiste en tres puntos que versan sobre las
estrategias para garantizar: el ingreso al programa académico, una tasa de titulación
alta y la calidad académica tanto de los egresados como de los investigadores
participantes en el programa. En general las estrategias mencionadas descansan sobre
los comités que conforman la estructura organizacional ya que son estos lo que
garantizan que los estudiantes seleccionados cumplan con todos los requisitos y
características necesarias para transitar de manera exitosa en el programa; así mismo
se encargan de acompañar muy de cerca al alumno a lo largo de sus estudios cuidando
que cada una de las actividades académicas contempladas en la currícula sean
debidamente cumplidas. En el caso del segundo apartado se plantean diferentes
acciones al corto plazo para establecer y consolidar el programa, entre ellas figuran:
1) la difusión, 2) el comité de calidad, 3) el apoyo institucional, y 4) la gestión.

Es importante mencionar que con la creación, establecimiento y consolidación de
proyectos como el presente, la UAZ cumple con su misión y responde al compromiso
que tiene con la sociedad.
4


ANTECEDENTES

Nuestra época se caracteriza por profundas transformaciones en prácticamente todos
los órdenes de la vida humana. Las transformaciones sociales, económicas, políticas,
culturales y educativas, tan intensas y cotidianas, tienen alcances que apenas se
vislumbran. Los cambios se están gestando en múltiples campos de la vida humana:
en el desarrollo de la ciencia y la tecnología, que ha revolucionado la organización de
los procesos productivos como nunca antes se había visto en la historia; en el acceso y
la distribución de la información a través del uso de los medios informáticos; en las
formas de organización de las economías de los países que se han agrupado en
bloques regionales para obtener mayor ventaja en la competencia internacional, y
dentro de una economía cada vez más globalizada pero segmentada entre países
pobres y países ricos.

Inmersa en una comunidad mundial cada vez más interdependiente, la sociedad
mexicana vive, a su vez, un proceso de transición en todos los órdenes: económico,
político, social y cultural. El cambio debe implicar necesariamente a todos, pero aún
no se ha dado de manera homogénea en los distintos ámbitos de la sociedad. En lo
económico, se han puesto en operación en los últimos tres lustros estrategias que
buscan la incorporación de México a los mercados mundiales, el aumento de la
competitividad de la planta productiva y la modernización de las unidades
económicas. En lo político, el país ha venido ampliando su vida democrática con la
consolidación de la estructura de partidos y asociaciones políticas, la alternancia en el
poder y la emergencia de nuevos actores en el seno de la sociedad civil. En lo social,
han aparecido nuevos procesos y estructuras que apuntan a la conformación de una
sociedad más urbana y moderna, pero al mismo tiempo se tienen amplias regiones del
país, sectores y grupos sociales que todavía no participan de los beneficios del
crecimiento económico. En el ámbito cultural, están apareciendo nuevos fenómenos
como son el avance acelerado de los conocimientos científicos, humanísticos y
5


tecnológicos, la creciente escolaridad de la población en los niveles de la educación
básica y los avances en las tecnologías de la información y la comunicación.

Una sociedad, sea mundial o nacional, inmersa en un proceso de cambio acelerado en
todas las esferas de la vida humana exige transformaciones profundas en la
organización y operación de la educación en general y la educación superior en lo
particular. El cambio es constante, acelerado y afecta a toda la vida de la sociedad; se
da en la actividad económica, en las formas de organización del trabajo y en las bases
técnicas de la producción, surgiendo nuevas necesidades y exigencias relativas a las
competencias y conocimientos de los hombres y mujeres para insertarse activamente
en el mundo laboral. Con el cambio se extienden las actividades que requieren de
innovaciones continuas y de una mayor participación de la dimensión intelectual del
trabajo; se modifican las costumbres, los patrones de conducta y los modos de vida de
los individuos y de los grupos sociales; se extienden los ámbitos de acción de la
sociedad civil; se redefinen los campos de intervención del Estado y se va
conformando una sociedad más democrática y más participativa.

Un ámbito que particularmente incide en el desarrollo de la educación superior es el
relativo a la revolución científica y tecnológica que se vive en el planeta. La progresión
geométrica de los acervos de conocimientos científicos y tecnológicos y de las nuevas
tecnologías de la información y la comunicación, presentan múltiples oportunidades
para el desarrollo de la educación superior (Internet, acceso a bases de datos,
enseñanza a distancia, redes virtuales de intercambio, flexibilidad en el proceso de
formación, etcétera). El fácil acceso a la información y a su distribución por medios
electrónicos multiplica el impacto formativo de las Instituciones de Educación
Superior. Asimismo, la mayor interacción entre las comunidades académicas permite
un proceso continuo de mejoramiento de la calidad educativa; la apertura a la
interacción mundial potencia los procesos de transformación de las instituciones
educativas, y el surgimiento de nuevos valores en la sociedad permite la construcción
de espacios académicos más consolidados. Sin embargo, México enfrenta la amenaza,
6


al igual que otros países, de quedar rezagado en el desarrollo científico y tecnológico.
El gran reto es disminuir la brecha existente entre países ricos y países pobres,
disminución que exige de una nueva distribución del conocimiento a nivel mundial.

De este modo, no puede entenderse a la educación superior sin tener como referente
este contexto de transición mundial y nacional. Las instituciones educativas actúan
hoy en contextos cualitativamente distintos a aquéllos en que, las más de ellas,
iniciaron operaciones tan sólo apenas hace algunas décadas. Ante situaciones,
problemas y necesidades emergentes, las respuestas a los nuevos retos tendrán que
darse bajo paradigmas novedosos puesto que ya no son viables las respuestas
pensadas para condiciones de épocas pasadas. Así pues son múltiples y muy diversos
los desafíos que la educación superior tiene ante sí. Su contexto social no es siempre
favorable para el óptimo desempeño de sus funciones y en ocasiones le presenta
amenazas que tiene que sortear con estrategias creativas; pero el contexto social
cambiante también le abre nuevas oportunidades de acción.

Una sociedad basada cada vez más en el conocimiento, “la educación superior y la
investigación forman hoy en día la parte fundamental del desarrollo cultural,
socioeconómico y ecológicamente sostenible de los individuos, las comunidades y las
naciones. Por consiguiente, y dado que tiene que hacer frente a imponentes desafíos,
la propia educación superior ha de emprender la transformación y la renovación más
radicales que jamás haya tenido por delante”1.

Lo anterior se agudiza si tomamos en cuenta que el crecimiento de la matrícula y la
diversificación de las opciones educativas en el nivel superior es una de las tendencias
más observadas a nivel mundial en el transcurso de las últimas décadas. El
crecimiento de la matrícula ha sido acelerado: de 13 millones de estudiantes en 1960
se pasó a 82 millones en 1995, 85 millones en el año 2000 y para el año 2015 se
espera tener más de 100 millones estudiantes en las distintas modalidades de la
educación superior1 terciaria.
7


Dos aspectos merecen especial atención: el aumento de la participación de la mujer y
el aumento de la tasa bruta de la matrícula. La participación de la mujer ha avanzado
aceleradamente, siendo en la actualidad superior al 50%1, situación que es similar a la
existente en México.

Por su parte, el rango teórico de edad de los jóvenes que pueden asistir a la educación
superior es de 18 a 22 años, si bien se utilizan distintos rangos en los diferentes
países. De acuerdo con la información de la UNESCO1, a nivel mundial este porcentaje
ha venido aumentando: mientras que en 1980 fue en promedio del 12.2%, en 1995 se
incrementó al 16.2%, porcentaje similar al de nuestro país, pero con grandes
desequilibrios entre países y regiones: en el caso de Canadá, en 1985, el 69.4% de los
jóvenes en la cohorte de edad correspondiente cursaba educación superior y para
1999 se reportaron cifras aún mayores, cercanas al 100%. Otro caso es el de los
Estados Unidos, que en 1985 tenía el 60.2%, y en 1995 llegó al 81%. Países con grados
de desarrollo comparables con los de México han alcanzado porcentajes importantes;
casos como los de Argentina con 36.2%, Chile 28.2% y Uruguay con 29.4%.

México se clasifica, de acuerdo con la UNESCO, entre los países menos desarrollados.
Los países más desarrollados son los que mostraron un aumento constante en la tasa
de matrícula y a un nivel muy superior, al pasar de 37.2% en 1980 al 59.6% en 1995,
en comparación con un crecimiento del 5.1% al 8.8% en los países menos
desarrollados1.

En el contexto nacional el Sistema Educativo se integra por tres niveles: 1) educación
básica compuesta por la educación preescolar, primaria y secundaria; 2) educación
media superior que comprende el bachillerato o estudios equivalentes y los estudios
de técnico profesional y, 3) educación superior que comprende los estudios de técnico
superior o profesional asociado, de licenciatura y de posgrado, que a su vez incluye los
estudios de especialización, maestría y doctorado.
8


El nivel superior comprende aquella educación que se imparte después del
bachillerato o sus equivalentes y las funciones que realizan las instituciones, en lo
sustantivo, se refieren a la formación de recursos humanos en los distintos campos de
la ciencia, la tecnología y las humanidades. En 1999 el sistema de educación superior
en México estaba conformado por 1250 instituciones (considerando sólo las unidades
centrales) que ofrecen programas escolarizados: 515 públicas y 735 particulares.
Obedeciendo a su coordinación, dependencia o régimen, ellas se clasifican en seis
grandes grupos: subsistema de universidades públicas; subsistema de educación
tecnológica; subsistema de universidades tecnológicas; subsistema de instituciones
particulares; subsistema de educación normal y subsistema de otras instituciones
públicas.

El subsistema de universidades públicas: Este subsistema se integra por 45
instituciones, considerando sólo las unidades centrales, las cuales realizan las
funciones sustantivas de docencia, investigación y extensión de la cultura y los
servicios. En este conjunto están las universidades federales y estatales. La mayor
parte de las universidades públicas son autónomas. Por Ley tienen la responsabilidad
de gobernarse a sí mismas; realizar sus fines de educar, investigar y difundir la cultura
de acuerdo a los principios del Artículo Tercero Constitucional, respetando la libertad
de cátedra e investigación y de libre examen de las ideas. En este subsistema se realiza
más del 50% de la investigación en México y se atiende al 52% de los estudiantes de
licenciatura y al 48% de los de posgrado.

El subsistema de educación tecnológica: Está conformado por un total de 147
instituciones que en conjunto atienden al 19% de la matrícula de licenciatura y al 6%
de los estudiantes inscritos en el nivel de posgrado. De las 147 instituciones, 102 de
ellas, entre las que se encuentran el Centro de Investigación y Estudios Avanzados del
Instituto Politécnico Nacional, el Instituto Politécnico Nacional, los institutos
tecnológicos federales, los agropecuarios, los de ciencias del mar, así como un
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tecnológico forestal, son coordinadas por el Gobierno Federal a través de la
Subsecretaría de Educación e Investigación Tecnológicas de la Secretaría de
Educación Pública. Las 45 instituciones restantes son institutos descentralizados de
los gobiernos estatales. Éstos, además, de los programas regulares, ofrecen un sistema
de programas de tres años de duración: dos años de tronco común y uno de
especialidad. Esta opción favorece una rápida salida al mercado de trabajo y abre la
posibilidad de continuar estudios superiores al egresado que así lo quiera.

El subsistema de otras instituciones públicas: agrupa a 67 instituciones no
comprendidas en los dos conjuntos anteriores, como son las instituciones
dependientes de la Secretaría de Educación Pública y de otras secretarías de estado.
Este grupo atiende el 1.1% de la población total de licenciatura y el 7.5% de la de
posgrado.

El subsistema de universidades tecnológicas: Las universidades tecnológicas son
organismos públicos descentralizados de los gobiernos estatales. En su creación
intervienen los tres niveles de gobierno: federal, estatal y, en su caso, municipal.

Las universidades tecnológicas fueron creadas a partir de 1991 y ofrecen programas
de dos años a través de los cuales se forman profesionales asociados. En el ciclo
escolar 1998-1999 se contaba con 36 universidades tecnológicas distribuidas en 19
entidades federativas, con una población escolar que representa el 1.1% de la
matrícula total de educación superior. Conviene aclarar que este tipo de estudios
también lo ofrecen otras instituciones del nivel superior.

El subsistema de instituciones particulares: Se compone por 598 organismos, sin
incluir las escuelas normales, y se clasifican según su nombre oficial en 5 conjuntos:
universidades (168), institutos (171) y centros, escuelas y otras instituciones (259).
Los estudios impartidos por los particulares requieren, en su caso, del
Reconocimiento de Validez Oficial de Estudios (RVOE) de la Secretaría de Educación
10


Pública o de los gobiernos de los estados o, bien, estar incorporados a una institución
educativa pública facultada para ello. En el nivel de licenciatura, este subsistema
atiende al 27.6% de la matrícula y en el posgrado al 36.5%.

El subsistema de educación normal: Prepara a los educandos para que ejerzan la
actividad docente en los distintos tipos y niveles del Sistema Educativo Nacional. La
carrera tiene una duración de cuatro a seis años y actualmente se forman licenciados
en educación preescolar, en educación primaria, en educación secundaria, en
educación especial y en educación física. En 1984 el Gobierno de la República elevó a
nivel de licenciatura la educación normal, aumentando con ello el número de años de
escolarización de los profesores. El conjunto de instituciones que conforma este
subsistema ascendió a 357 escuelas en 1999, de las cuales 220 son públicas y 137
particulares, las cuales atienden al 11.5% de la población escolar de educación
superior del país.

En lo referente al posgrado como resultado de la acelerada expansión de la matrícula
ésta alcanzó la cifra de 107,149 en 1998 y de 111,247 alumnos en 1999, inscritos en
un total de 3,470 programas escolarizados a nivel de especialización, maestría o
doctorado.

La mayor parte de los estudiantes de posgrado en 1998 se ubican en programas de
maestría representando el 69.5% (77,279) de la matricula total del nivel, seguido en
importancia por los programas de especialización con el 23.4%, es decir, 26,057
alumnos, mientras que en el doctorado contaba únicamente con el 7.1% (7,911
estudiantes). En las instituciones de educación superior públicas se atiende al 63.5%
de la matrícula y en las particulares al 36.5%.

La matrícula de posgrado muestra una alta concentración geográfica, ya que de los
111,247 estudiantes, 37,855 se encontraban cursando sus estudios en las
instituciones educativas ubicadas en el Distrito Federal, 9,898 en Nuevo León, 8,312
11


en Puebla, 8,003 en Jalisco y 8,200 en el Estado de México. En 1999 el 34% de la
matrícula se ubicó en programas ofrecidos por las instituciones del Distrito Federal,
situación que se agudizó en el doctorado al ascender al 57% de la matrícula de
posgrado. De los 33,800 alumnos de nuevo ingreso al posgrado en 1997, 7,049
procedieron de otras entidades federativas y 458 del extranjero, lo que muestra una
movilidad geográfica de poco más de la quinta parte de los estudiantes de nuevo
ingreso.

La distribución de la matrícula del ciclo lectivo 1997-1998 por área del conocimiento
y por nivel, muestra diferencias importantes: en los programas de especialización, el
57.5% de la población escolar se concentra en el área de Ciencias de la Salud y el
29.1% en Ciencias Sociales y Administrativas, mientras que las Ciencias Agropecuarias
y las Ciencias Naturales y Exactas absorben el 0.7% y el 0.6% respectivamente. En el
nivel de maestría, la mayor concentración se ubica en el área de Ciencias Sociales y
Administrativas (48.2%); le sigue el área de Educación y Humanidades (26.8%);
Ingeniería y Tecnología (15.4%), y Ciencias Agropecuarias, de la Salud y Naturales y
Exactas (2.1%, 3.2% y 4.3% respectivamente). En el nivel de doctorado la mayor
concentración de la matrícula se ubicaba en los programas de Ciencias Naturales y
Exactas (26.2%), y en los de Ciencias Sociales y Administrativas (22.3%); seguidos por
los de Educación y Humanidades (18.5%), Ingeniería y Tecnología (15%); Ciencias de
la Salud (11.1%) y Ciencias Agropecuarias (6.9%).

Los programas de doctorado tienen el propósito de formar recursos humanos
altamente calificados para generar y aplicar el conocimiento en forma original e
innovadora. De ahí que resulte de primera importancia fortalecer este nivel educativo
y garantizar su calidad a través de la evaluación. El indicador "número de graduados
de doctorado por millón de habitantes" se triplicó en el periodo 1990-1998 al pasar de
2.5 al inicio del periodo, a 7.7 en 1998.

En las últimas décadas, el crecimiento del posgrado ha sido desigual, tanto en la
12


calidad de los programas, como en la atención de las distintas áreas del conocimiento;
en algunos casos muestra una escasa relación con las necesidades sociales y del
aparato productivo. La alta concentración de la matrícula en algunos campos ha
limitado la formación de una base científica y tecnológica lo suficientemente
diversificada y sólida para enfrentar los retos del desarrollo del país. La comunidad
científica, aún insuficiente para las necesidades nacionales, se encuentra concentrada
en las instituciones educativas del nivel superior, situación derivada de la escasa
inversión del sector productivo en las actividades de investigación y desarrollo
tecnológico.

En el ciclo escolar 1997-1998 las instituciones de educación superior ofrecieron 2,411
programas de posgrado a nivel de maestría y doctorado: 369 de doctorado y 2,042 de
maestría. Las principales áreas del conocimiento en las que se concentraron los
programas fueron las de Ciencias Sociales y Administrativas, con 838 programas,
Ingeniería y Tecnología, con 501 y Educación y Humanidades, con 429.

Con la finalidad de reconocer y fortalecer la calidad de los programas de maestría y
doctorado que se ofrecen en el país, el Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología
(CONACyT) comenzó a operar en 1991 el Padrón de Programas de Posgrado de
Excelencia, con 328 programas, cantidad que aumenta a 478 en 1998; de ellos 160
fueron de doctorado y 318 de maestría. Con relación al total de programas de
maestría y de doctorado que se ofrecieron al inicio del ciclo escolar 1997-1998, y que
ascendieron a 2,411 de acuerdo con la información disponible en la ANUIES, sólo 478
programas se encuentran incorporados al Padrón del CONACyT (20%).

El universo de instituciones que ofrecen estudios de posgrado está integrado por 402
instituciones dispersas en todo el territorio, con diferente estructura académica y
distintas formas de organización que obedecen a la pluralidad de regímenes jurídicos.

Al analizar por áreas del conocimiento la relación de los programas de excelencia con
13


respecto a los que se ofrecían en todo el país, se observa que el 54% de los que se
impartían en el área de Ciencias Exactas y Naturales eran de excelencia; el 26% en el
área de Ciencias Agropecuarias; el 21% en Ingeniería y Tecnología; el 17% en Ciencias
de la Salud y, finalmente, el 12% y el 10%, respectivamente en las áreas de Ciencias
Sociales y Administrativas y de Educación y Humanidades.

Para mayores detalles acerca de la Educación Superior y en particular la situación del
posgrado y la investigación en el país se puede consultar la excelente radiografía
hecha por la Asociación Nacional de Universidades e Instituciones de Educación
Superior (ANUIES)1.

1 La Educación Superior en el Siglo XXI: Líneas estratégicas del desarrollo, ANUIES, 2000.
14


JUSTIFICACIÓN

La economía basada en el conocimiento se está diseminando cada vez más en todo el
planeta. Una economía del conocimiento depende esencialmente del capital humano y
el pensamiento estratégico así como de la habilidad para crear condiciones favorables
que aseguren su implementación2. Lo anterior no es algo nuevo ya que el
conocimiento ha estado en el corazón del crecimiento económico y la mejora de los
niveles de vida desde tiempos inmemoriales.

La habilidad para inventar e innovar, esto es para crear conocimiento e ideas nuevas
que en la medida de lo posible se transformen en productos procesos y
organizaciones, ha servido siempre como punta de lanza del desarrollo3. El término
“Economía basada en el conocimiento” se ha acuñado recientemente, debido
principalmente a la velocidad sin precedente a la que el conocimiento es creado,
acumulado y más aún la relevancia y el valor económico que representa.

Las economías basadas en el conocimiento no están restringidas al reino de la alta
tecnología, por el contrario, la ciencia y la tecnología juegan un papel central en
nuevos sectores (farmacéutico, instrumentación científica, tecnologías de la
información y la comunicación, aeronáutica, nuevos materiales, etc.) dando un
impulso adicional al crecimiento económico como un todo. Este desarrollo se refleja
directamente en la proliferación de un creciente número de trabajos relacionados con
la producción, procesamiento y transferencia de conocimiento e información:
tendencia que gradualmente se está esparciendo a lo largo y ancho de la economía,
llevando a la sociedad a actividades totalmente basadas en el conocimiento.

Los historiadores de la economía indican que hoy por hoy la disparidad en la
productividad y crecimiento de los diferentes países tiene cada vez menos que ver con

2 Scientika, Mexico City: a Knowledge Economy, 2010: http://www.scientika.mx.
3 P. A. David and D. Foray, International Social Science Journal 54, 9 (2002).
15


su abundancia o carencia en recursos naturales, sino más con las capacidades de
mejorar el capital humano y los factores de producción, en otras palabras para crear
conocimiento e ideas, e incorporarlas en equipo y personas.

Una característica relacionada al crecimiento económico, es la creciente importancia
del capital intangible en la generación de riqueza y el aumento del producto interno
bruto atribuible a este capital4,5. Por ejemplo, en los Estados Unidos el valor actual del
capital intangible (dedicado a la creación del conocimiento y capital humano)
claramente pesa más que el valor del capital tangible (infraestructura física y equipo,
recursos naturales). Por el contrario, en México la relación entre capital intangible y
tangible es evidentemente desproporcionada si tomamos en cuenta que las
principales fuentes de ingresos del país son el petróleo y las remesas de los
inmigrantes6.

A este respecto, el gobierno federal, con la finalidad de cambiar esta tendencia e
integrar a México en el corto y mediano plazo a una economía sustentada en el
conocimiento, ha plasmado tanto en el Plan de Desarrollo Nacional como en la Ley de
Ciencia y Tecnología las bases para alcanzar tales objetivos7,8. Como punto nodal se
plantea incrementar la formación de científicos y tecnólogos de tal manera que
contribuyan al establecimiento del círculo virtuoso entre generación de conocimiento,
desarrollo tecnológico e innovación y así resolver problemas nacionales
fundamentales, cuya resolución contribuya al desarrollo del país y eleve el bienestar
de la población en todos sus aspectos.

4 M. Abramovitz and P. A. David, “Technological Change and the Rise of Intangible Investments: the US Economy’s Growth-path in
the Twentieth Century”, in D. Foray and B. A. Lundvall, (eds.), Employment and Growth in the Knowledge-based Economy, OECD
Documents, Paris: OECD, 1996.
5 M. Abramovitz and P. A. David, “American Macroeconomic Growth in the Era of Knowledge-Based Progress: The Long-Run
Perspective,” in S. L. Engerman and R. E. Gallman, eds., An Economic History of the United States: The Twentieth Century, Vol. 3,
New York: Cambridge University Press, pp. 1-92, 2000.
6 Banco Central de México: http://www.banxico.org.mx/.
7 Plan Nacional de Desarrollo 2007-2012: http://pnd.presidencia.gob.mx.
8 Diario Oficial de la Federación, Ley de Ciencia y Tecnología, 5 de Junio de 2002:
http://www.diputados.gob.mx/LeyesBiblio/pdf/242.pdf.
16


Igualmente, se plantea la descentralización o desarrollo regional mediante el
establecimiento de redes o alianzas para las investigaciones científicas, el desarrollo
tecnológico y la innovación. Para esto último, tanto la federación como los estados,
juegan un papel fundamental proporcionando las condiciones necesarias y suficientes
para el florecimiento de los cuadros científicos y tecnológicos que coadyuven a la
resolución de problemáticas regionales.

En este sentido, para el estado de Zacatecas, es imperante que aquellos programas
educativos que cuenten con los recursos humanos calificados en el corto plazo,
obtengan el reconocimiento como programas de calidad por las instancias
correspondientes, e igualmente brinden las condiciones a los campos del
conocimiento que sean estratégicos para el estado y que aún no cuenten con los
cuadros científicos y tecnológicos calificados para que en el mediano y largo plazo
detonen el círculo virtuoso entre generación de conocimiento, desarrollo tecnológico
e innovación9.

Para tales fines la Universidad Autónoma de Zacatecas (UAZ), como la Institución de
Educación Superior más importante en el Estado, juega un papel preponderante.
Sabedora de su posición, responsabilidad y relevancia, la UAZ deja clara en su Plan de
Desarrollo Institucional10 la necesidad de re-estructurar los procesos y programas
educativos con el fin de superar una profunda crisis en todos los órdenes: económico,
académico, social y cultural, a fin de mantener y acrecentar la política de calidad de la
educación que hoy caracteriza a nuestra Universidad; diversificar la oferta educativa
con pertinencia social y acorde a la demanda laboral, responder con investigación,
innovación y creatividad a los problemas nodales y estructurales de nuestro Estado;
con la alta misión de coadyuvar en la creación de políticas públicas que permitan
encontrar mejores niveles de crecimiento, desarrollo y progreso.

9 Plan Estatal de Desarrollo 2011-2016 Gobierno del Estado de Zacatecas: http://www.zacatecas.gob.mx.
10 Plan de Desarrollo Institucional 2008-2012 Universidad Autónoma de Zacatecas:
http://www.uaz.edu.mx/planeacion/Documentos/PDI_2008-2012.pdf.
17


En particular, en las políticas institucionales de las funciones sustantivas resaltan dos
puntos, a saber:
• Fortalecer el desarrollo y consolidación de los cuerpos académicos, a través
de redes de colaboración regional, nacional e internacional, aprovechando las
fortalezas de los cuerpos académicos consolidados.
• Ofrecer programas de posgrado socialmente pertinentes, sustentados en
criterios de factibilidad y calidad reconocida; promover su reordenamiento
que permitan la incorporación de esquemas flexibles por áreas de
conocimiento con opciones y el óptimo aprovechamiento de los recursos
humanos, materiales y financieros.

En la presente actualización del plan de estudios se sigue mejorando la oferta
educativa a nivel doctorado en el ACB en el estado de Zacatecas aprovechando las
fortalezas con las que cuenta ACB en cuanto a capital humano y con base en ellas, se
ha estado implementando el programa que fundamenta el Programa Académico de
Doctorando en Ciencias Básicas (PADCB). Dicho programa está organizando en cuatro
orientaciones: Ciencias Biológicas, Matemáticas, Física y Estudios Nucleares de las
cuales se cuenta actualmente con las siguientes líneas de investigación: “Biología
Celular y Molecular Integrativa”, “Biología Evolutiva y Biodiversidad” “Ciencias
Nucleares, “Matemáticas Básicas”, “Partículas, Campos y Física-Matemática”, y
“Modelación, Síntesis y Caracterización de Materiales”.

Cabe mencionar que, respecto del plan de estudios original, en esta nueva versión la
UAZ tiene alrededor de dos decenas de programas PNPC y no cinco como en aquel
entonces, con lo cual se puede decir que ha aumentado los índices de calidad de
nuestros posgrados y en la presente revisión del PADCB, que será evaluada ante el
PNPC, pretendemos pasar al siguiente nivel en la estructura de calificación de
programas PNPC, dadas las estadísticas del programa.

18


RASGOS DESEABLES

El Área de Ciencias Básicas de la Universidad Autónoma de Zacatecas oferta el
Programa Académico de Doctorado en Ciencias Básicas. La misión y la visión del
Programa Académico son:
Misión
El Área de Ciencias Básicas a través de su programa académico de Doctorado en
Ciencias Básicas tiene como misión formar investigadores con actitudes, habilidades y
conocimientos sólidos que les permita analizar, generar, aplicar, transmitir y difundir
el conocimiento. En particular, nuestro programa genera recursos humanos que son
capaces de resolver problemas de forma científica y creativa, para con ello contribuir
al impulso del desarrollo científico, tecnológico, económico y social del estado de
Zacatecas, de la región, y de México en las temáticas de Biología Celular y Molecular
Integrativa, Biología Evolutiva y Biodiversidad, Ciencias Nucleares, Partículas, Campos
y Física-Matemática, Modelación, Síntesis y Caracterización de Materiales y
Matemáticas Básicas.
Visión 2025
Es un programa competitivo a nivel nacional e internacional con una sólida formación
en los fundamentos de Biología Celular y Molecular Integrativa, Biología Evolutiva y
Biodiversidad, Ciencias Nucleares, Partículas, Campos y Física-Matemática,
Modelación, Síntesis y Caracterización de Materiales, y Matemáticas Básicas; esta
especialización se apoya en las diversas áreas que se cultivan desde los Cuerpos
Académicos. Además, fomenta la movilidad académica a nivel nacional e internacional
dada la posibilidad de una trayectoria académica personalizada. Es un Programa
Académico con reconocimiento del Programa Nacional de Posgrados de Calidad del
CONACyT y de los Comités Interinstitucionales para la Evaluación de la Educación
Superior de la SEP-ANUIES. Es también, un programa de competencia internacional.

19


Cuenta con una planta académica de carrera con grado de doctor con reconocimiento
en el Programa de Mejoramiento al Profesorado (PROMEP) e Investigador Nacional
(SNI). Se tienen nuevos Cuerpos Académicos que desarrollan Líneas de Generación y
Aplicación del Conocimiento que fortalecen la misión del Programa Académico. Se
desarrollan Líneas de Generación y Aplicación del Conocimiento vinculadas a los
sectores social, público, productivo y de servicios, atendiendo las necesidades de la
región. Los Cuerpos Académicos participan en Redes de Colaboración Académica en
los ámbitos nacional e internacional.

Los egresados se vinculan con labores de investigación y docencia del más alto nivel.
Se cuenta con un Sistema de Evaluación, Seguimiento e Información en el marco del
Modelo Educativo Institucional; así como con un Sistema Institucional de Tutorías
para la formación integral y pertinente del estudiante, que brinda servicios oportunos.
Se cuenta con un conjunto de normas internas que permite el ágil funcionamiento de
los procesos educativos, y un aparato administrativo eficiente y confiable que facilita
dichos procesos.
A nivel institucional, se cuenta con una normatividad que regula las actividades
académicas y administrativas. Así como con los mecanismos suficientes para
promover la movilidad de los estudiantes y los docentes. La Universidad Autónoma de
Zacatecas pertenece al Consorcio de Universidades Mexicanas CUMEX, por lo que la
movilidad se apoya institucionalmente, y permite que los estudiantes participen en
otros Programas Académicos para mejorar su formación.
Perfil de egreso
Los egresados se caracterizan por ser investigadores del más alto nivel académico,
capaces de realizar investigación original de manera independiente, en las líneas
de generación y aplicación del conocimiento del Área de Ciencias Básicas. Ello
propicia la elevación del nivel de la investigación científica y la enseñanza en las
diferentes áreas del conocimiento de interés del Doctorado en Ciencias Básicas.
Fomenta la realización de estudios multi e interdisciplinarios, así como la
20


ampliación de grupos de alto nivel capaces de formar recursos humanos para el
desarrollo de la ciencia y la tecnología en México. Tener un compromiso firme con
la ética, la moral, el bienestar social, el desarrollo sustentable, mejoramiento y
conservación del ambiente.

Los egresados del programa de Doctorado en Ciencias Básicas:
• Conocerán de manera profunda las bases científicas y tecnológicas de su
campo del conocimiento;
• Conocerán ampliamente los conceptos, métodos y técnicas de su campo
disciplinario;
• Serán capaces de plantear, realizar y evaluar proyectos de investigación
original, en especial en el ámbito de su campo disciplinario;
• Formarán recursos humanos de alta calidad para la investigación y la
docencia que sean de competencia internacional;
• Promoverán los valores humanísticos, éticos, morales, culturales, y
ambientales;
• Contribuirán al impulso del desarrollo científico, tecnológico, económico y
social del estado de Zacatecas, de la región y de México.

Perfil y requisitos académicos de ingreso

El Comité Académico Doctoral de Ciencias Básicas (CADCB) decidirá sobre la
aceptación de los aspirantes a ingresar al doctorado. Para ello, se apoyará en el
Comité Académico Doctoral de Orientación (CADO). Todo alumno tendrá un
máximo de dos oportunidades para cumplir con el proceso de ingreso al
doctorado, debiendo transcurrir un mínimo de un semestre entre ambas.

Para ingresar al Doctorado en Ciencias Básicas se requiere:
1) Tener el grado de Maestro en Ciencias de un programa afín, a juicio del
CADCB.
21


2) Tener promedio mínimo de 8 en sus estudios de maestría, o 7.8 en cuyo
caso no podría ser postulado a beca sino hasta que tenga recuperado el
promedio, según la convocatoria PNPC CONACyT.
3) Ser propuesto por escrito por el profesor investigador del programa de
doctorado que acepta ser su asesor de tesis.
4) Presentar y aprobar un examen general de conocimientos (EXANI III
con puntaje mínimo de 1000 puntos) con vigencia no mayor a dos años.
5) Presentarse a una entrevista con el CADO.
6) Demostrar la comprensión del idioma inglés (EXAMEN TOEFL o su
equivalente), con vigencia no mayor a dos años y en caso de no tener
500 puntos tiene hasta dos años para acreditar el puntaje una vez
inscrito al programa (requisito de permanencia).
7) Cuando el español no sea la lengua materna del aspirante demostrar un
conocimiento suficiente del idioma español.
8) Establecer el compromiso de dedicar tiempo completo a la realización
de los estudios de doctorado (En los términos requeridos por el
CONACyT).
9) Cubrir los trámites respectivos ante el Departamento Escolar de la UAZ.

Los estudiantes aceptados en el programa de doctorado recibirán del CADCB un
dictamen aprobatorio de suficiencia académica para cursar estudios de doctorado.

Los procedimientos respectivos de aplicación y certificación de los requisitos de
ingreso serán establecidos en las normas operativas.
22


ESTRUCTURA CURRICULAR
Mapa Curricular
La estructura curricular está centrada en el estudiante y con la finalidad de desarrollar
las siguientes competencias generales11:
• Demostrar un entendimiento sistemático del campo de estudio y tener las

habilidades y dominio de los diferentes métodos de investigación asociados
con el campo de estudio.
• Demostrar la habilidad de concebir, diseñar, implementar y adaptar una parte
sustancial de su investigación con la docencia.
• Hacer contribuciones a través de una investigación original que extienda las
fronteras del conocimiento al haber hecho una parte sustancial de esta
investigación que además pueda ameritar la publicación en revistas
internacionales de arbitraje estricto.
• Ser capaz de hacer un análisis crítico, de evaluar y sintetizar ideas complejas y
nuevas.
• Tener la habilidad de comunicación con la comunidad científica y con la
sociedad en general sobre sus logros en su campo de investigación.
• Promover, en un contexto académico y profesional, avances tecnológicos,
culturales y sociales.

Un sistema basado en créditos12 es una herramienta que nos permite planear y
manejar el tiempo necesario que el estudiante empleará para obtener las
competencias antes mencionadas. El sistema es acumulativo, dando créditos a las
actividades académicas del programa: cursos, seminarios de investigación, estancias
académicas nacionales y/o internacionales, acreditación de tesis, etc. La cantidad de
créditos totales es de 180, teniendo el debido cuidado que los créditos mencionados
sean cumplidos en los tiempos que marca el programa.

11 Tuning: http://www.unideusto.org/tuning.
12 Sistema de Asignación y Transferencia de Créditos Académicos, SEP-ANUIES 2007.
23


Todo egresado debe cumplir con un plan de trabajo que se ajuste al Mapa Curricular.
Este último comprende lo siguiente: Proceso de aceptación de los aspirantes al
Doctorado en Ciencias Básicas, desde su entrevista inicial hasta el momento en que es
aceptado, requisitos de permanencia en el doctorado que básicamente son la
aceptación de su proyecto de tesis, y si fuera el caso la aprobación de una asignatura
de formación básica, así como la aprobación de una asignatura de formación
específica, actividades de Investigación, asistencia y/o presentación de los coloquios
de área y seminarios departamentales, estancia de investigación y finalmente de la
aceptación y presentación de su tesis.
La descripción y definición de las asignaturas de formación básica y específica; de las

estancias de investigación, acreditación de la tesis doctoral y de la defensa de tesis
doctoral se describen en lo siguientes apartados. También se describen las líneas de
investigación y sus participantes. Finalmente, la lista de las asignaturas de formación
básica y específica así como los temarios de cada una de ellas se presentan en los
Apéndices A y B.
Estructura general
En este apartado se presenta la estructura general del plan de estudios del programa
de Doctorado en Ciencias Básicas del Área de Ciencias Básicas de la Universidad
Autónoma de Zacatecas. El Doctorado en Ciencias Básicas tiene una duración de ocho
semestres, este periodo se considera desde la aceptación del aspirante al programa y
hasta la titulación. Durante este periodo se deberá cumplir con todas las actividades
académicas y de investigación. Dichas actividades serán establecidas por el alumno, el
asesor de tesis y el Comité Tutorial.
Se considerarán aspirantes todos aquellos interesados que cumplan con el perfil de

ingreso y con los requisitos establecidos en la convocatoria del proceso de ingreso
único de la UAZ.
A continuación se establecen los parámetros para aceptar o rechazar un aspirante así

como su permanencia en el programa.
24


Dado el amplio perfil de ingreso para el programa de Doctorado en Ciencias Básicas se
tiene contemplada una etapa de selección, esta primera etapa consiste en una revisión
curricular por parte del CADCB en el cual se evaluará el perfil del aspirante y se
determinará si cumple con la formación para ingresar al Doctorado. Basado en la
solicitud del aspirante, su currículum y cartas de recomendación, el CADCB turnará la
solicitud al CADO.
El CADO se entrevistará con el aspirante con la finalidad de darle a conocer el proceso

de admisión. Este proceso consiste en un examen escrito y oral (en ese orden) los
cuales se denominan exámenes generales. Dichos exámenes serán elaborados y
aplicados por el CADO y se basarán en los contenidos de los correspondientes cursos
de las asignaturas básicas por cada orientación, el objetivo es determinar sí el
aspirante tiene las herramientas básicas para ingresar al programa de Doctorado en
Ciencias Básicas en la Orientación que haya elegido. En caso de aprobar los exámenes
generales, el aspirante es aceptado al programa (se le denominará candidato) y se
procede a los trámites correspondientes. El aspirante tiene dos oportunidades para
aprobar los exámenes generales, de no ser así, deja de ser un aspirante a ingresar al
programa de Doctorado en Ciencias Básicas.
Una vez aprobados los exámenes generales se le asignará un Comité Tutorial por
parte del CADCB. El objetivo de este Comité es velar por el cumplimiento de las
actividades académicas asignadas al candidato semestralmente. El Comité Tutorial
estará constituido por tres investigadores de reconocido prestigio, siendo uno de ellos
el asesor de tesis quien se reunirá semestralmente para analizar y en su caso, validar
las actividades académicas realizadas por el estudiante, asimismo analizará y validará
el plan de trabajo propuesto para el semestre siguiente.
En el momento en que el estudiante es aceptado al programa, se le dará un plazo de

cinco meses para que con ayuda de su asesor y en su caso co-asesor, presente su
proyecto de tesis doctoral, el cual será evaluado por un Comité (Comité de Evaluación)
constituido por cuatro investigadores (al menos uno externo a la UAZ) de reconocido
prestigio, entre ellos podrán estar el asesor de tesis y los demás integrantes del comité
25


tutoral y/o investigadores a nivel nacional y/o internacional. Dicho comité será
aprobado por el CADCB, a propuesta del CADO correspondiente, donde el asesor
podrá sugerir por lo menos tres evaluadores internos y tres evaluadores externos a la
UAZ. El Comité de Evaluación tendrá la función de ver la viabilidad del proyecto.
En caso de haber aprobado los exámenes generales bajo la recomendación de cursar

una asignatura de formación básica, el candidato debe cursar y aprobar dicha materia
dentro de los dos primeros semestres de su doctorado. La permanencia del candidato
estará condicionada a la aprobación de dicha asignatura.
El candidato podrá cursar asignaturas de formación específica dependiendo de la

naturaleza y necesidades particulares de su proyecto de tesis. El asesor de tesis
propondrá la o las asignaturas al Comité Tutorial, siendo éste último el responsable de
avalar la petición. Este curso se podrá tomar en otra institución previa aprobación del
CADCB. Dicha institución debe de ser de reconocido prestigio nacional o internacional.
El candidato a doctor podrá realizar sus actividades de investigación en instituciones

de reconocido prestigio nacional e internacional. Se denominarán de reconocido
prestigio nacional a aquellas instituciones que al menos tengan el reconocimiento de
PNPC por parte del CONACYT. En el caso de internacional quedará a juicio del CADCB
a recomendación del Comité Tutorial.
Finalmente, el candidato debe estar dedicado de tiempo completo al cumplimiento de

sus obligaciones dentro del programa. En caso contrario el candidato será dado de
baja del programa.
Asignaturas de Formación Básica (AFB)

Se denominan asignaturas de formación básica a aquellas que comprenden el núcleo
de asignaturas que determinen las diferentes líneas de investigación como las básicas
que el alumno debe dominar. Dichas asignaturas serán la base de los exámenes
generales. El contenido específico de cada una de ellas se puede ver en el Apéndice A
del presente documento.
26


Asignaturas de Formación Específica (AFE)
Se denominan asignaturas de formación específica aquellas que determinan la
especialización en alguna Orientación, que ayuden o conlleven al fortalecimiento, y
enriquecimiento académico del candidato en su tema de investigación. Dicha
asignatura se podrá cursar en otro centro o universidad nacional o internacional a
recomendación del Comité Tutorial con la debida autorización del CADCB. El
contenido específico de cada una de ellas se puede ver en el Apéndice B del presente
documento, 12 créditos.
Proyecto de Tesis Doctoral

Una vez que el candidato a doctor comienza formalmente su programa doctoral, la
primera actividad a realizar será la de una presentación de su proyecto de
investigación. Dicha actividad será denominada proyecto de tesis doctoral el cual será
elaborado por el candidato junto con su asesor y en su caso co-asesor. Esta deberá
presentarse en el primer semestre de su doctorado ante el Comité de Evaluación. En
caso de ser aprobado el proyecto de tesis, el candidato continuará con su programa de
doctorado. En caso de ser aprobatorio con condicionantes, el candidato atenderá
dichas sugerencias y re-estructurará su proyecto haciendo llegar a los miembros del
Comité de Evaluación una versión por escrito de dichas modificaciones después del
cual el comité resolverá con base en dichas modificaciones si es aprobado ó no
aprobado. En caso de ser no aprobado el candidato tendrá que re-estructurar,
modificar y hasta cambiar el proyecto de tesis. Se tendrá hasta un plazo de un año
como máximo para presentar y aprobar su proyecto de tesis, 10 créditos.
Seminario de Tesis (I, II, III y IV)

Este seminario contempla todas las actividades complementarias al proceso de
investigación, entre las que figuran presentación de trabajos para seminarios locales
(asistencia y presentación), reuniones periódicas con el asesor de tesis, preparación
de pláticas y posters para congresos, así como reportes escritos en general, que son
parte de las actividades que permitirán al candidato tener una formación integral,
dichas actividades serán las propuestas en la reunión tutorial previa. El candidato
27


presentará sus avances semestrales de investigación ante la comunidad académica en
un seminario abierto. El seminario estará abierto al escrutinio de los asistentes, y la
evaluación será emitida por el Comité Tutorial del candidato, quien debe entregar
constancias académicas de las actividades realizadas durante el semestre, 8 créditos.
Investigación (I, II, III y IV)

El candidato realizará las actividades propias de la investigación según lo establecido
en el protocolo de investigación presentado y aprobado por el comité de evaluación
en sus etapas teóricas y/o experimentales, según sea el caso y se presentará sus
avances semestrales de investigación ante el Comité Tutorial en una evaluación
cerrada. Durante la evaluación el Comité revisará los avances de investigación,
desempeño y crecimiento académico del candidato. Además, el comité revisará,
emitirá recomendaciones y avalará las actividades académicas, 12 créditos.
Estancia de Investigación
El candidato podrá realizar trabajo teórico o experimental mediante estancias de
investigación en centros o instituciones del país o el extranjero. Se llevarán a cabo en
los lugares seleccionados entre el tutor y el alumno avalado por el Comité Tutorial y se
evaluará con los reportes de dichas estancias, que serán avalados por el comité
tutorial en la reunión correspondiente y una presentación. Es importante señalar que
es recomendable promover la movilidad y el enriquecimiento en la investigación. Ésta
puede durar tanto como el CADCB lo autorice. En caso de que esta no se lleve a cabo,
esta será equivalente a las actividades de Investigación y seminario de tesis, del
semestre correspondiente, 20 créditos.
Acreditación de Tesis Doctoral

Espacio dedicado a la presentación de los resultados de investigación o en su caso, a la
presentación de los artículos científicos publicados o aceptados para su publicación. El
tema de investigación de cada estudiante deberá estar vinculado directa o
indirectamente con las líneas de Investigación de alguna Orientación. El seminario se
evalúa con la defensa ante un Comité de Evaluación constituido bajo los mismos
28


criterios que el comité del protocolo de tesis. La calificación se expresa mediante la
opción aprobado o no aprobado, 30 créditos.
Seminario Doctoral
Se asignaran los créditos correspondientes a esta actividad una vez obtenidos los
votos aprobatorios del trabajo de tesis. Para poder presentar este seminario es
necesario que el candidato cuente con, al menos, un artículo de investigación
publicado en revistas indexadas (Thomson-Scopus). (Inicia trámite de Certificado). El
CADCB analizará cada caso y determinará si esta opción es acreditable por el
candidato tomando en cuenta la calidad indudable de las revistas donde se han
publicado los trabajos derivados de la tesis (cada CADO debe de validar y certificar,
mediante minuta de reunión, que el articulo publicado esta indexado en Thomson-
Scopus), 20 créditos.
La estructura curricular y la organización de este programa, permiten a un estudiante,

ser aceptado al programa en dos situaciones posibles que están dictadas por los
resultados de sus exámenes generales. El reglamento de este programa doctoral sólo
permite a potenciales candidatos enrolarse sí y solo sí: 1) Un candidato apruebe los
exámenes generales en su totalidad de materias, satisfactoriamente, sin tener ninguna
observación y/o recomendación. 2) En el caso de que un candidato apruebe tres de las
cuatro materias de que constan los exámenes generales y sea recomendado a cursar
una de ellas para reforzar y completar su requisito de ingreso. El candidato será
aceptado al programa con la condicionante de cursar y aprobar la asignatura de
formación básica recomendada.
Tomando como base los criterios de SATCA para doctorado, se elabora un esquema de
la estructura general del plan de doctorado en ciencias básicas a cuarenta y ocho
meses. Tomando en cuenta las diferentes actividades como lo son: Docencia (D) 16
hrs.=1 crédito, actividades de aprendizaje individual o independiente (AAII) 20 hrs.= 1
crédito y trabajo de campos profesional supervisado (TCPS) 50 hrs = 1 crédito.
29


Tabla 1: Estructura General del Plan de Estudios de Doctorado en Ciencias básicas. 48 meses

(D) h/s/m (AAII) h/s/m (TCPS) h/s/m
Sem Actividad Académica Horas / Créditos
(x16 semanas) (x16 semanas) (h/Semestre)
Protocolo de tesis doctoral 10(140 h)=7c 10(150 h)=3c 10
Asignatura de formación
1 6T(96)h=6c 5 (80 h)=2c 12
específica 4P(64)h=4c
Seminario de protocolo 8 (120 h)=6c 7 (110 h) =2c 8
Total semestre (160 h)=10c (260 h) = 13c (150 h) =7c 570 h / 30c
2 Investigación I 10(140 h)=7c 15(240 h)=5c 12
Seminario de tesis I 8(120 h)=6c 7(110 h) =2c 8
Total semestre 18(260 h)= 13c 22(350 h) =7c (610 h) 20c
Investigación II 10(140 h)=7c 15(240 h)=5c 12
3 Seminario de tesis II 8(120 h)=6c 7(110 h) =2c 8

Total de semestre 18(260 h)= 13c 22(350 h) =7c (610 h) 20c

Investigación III 10(140 h)=7c 15(240 h)=5c 12
4 Seminario de tesis III 8(120 h)=6c 7(110 h) =2c 8
5 Investigación IV 10(140 h)=7c 15(240 h)=5c 12
Seminario de tesis IV 8(120 h)=6c 7(110 h) =2c 8
6 Estancia de Investigación* 18(260 h)= 13c 22(350 h) =7c 20
7 Acreditación de tesis doctoral 35(560 h)=28c 5(80 h)=2c 30
Total de semestre 35(560 h)=28c 5(80 h)=2c (640 h) 30c
8 Seminario doctoral 18(260 h)= 13c 22(350 h) =7c 20
Totales (160 h)=10c (2380 h)=119c (2,330 h)=51c (4,870)h 180c
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Líneas de Investigación:
Biología Evolutiva y Biodiversidad (BEB)

La línea de conocimiento en Biología Evolutiva y Biodiversidad, dentro de la
orientación de Ciencias Biológicas en el Doctorado en Ciencias de la Universidad
Autónoma de Zacatecas, se aborda desde un enfoque multidisciplinario, y es sostenida
por la planta académica conformada en su totalidad los profesores-investigadores de
esta orientación han obtenido su último grado en instituciones diferentes a la UAZ
(CINVESTAV Irapuato, Universidad de Guanajuato, Escuela Nacional de Ciencias
Biológicas del IPN y de la UNAM) y todos cuentan con nivel de Doctorado, tres de ellos
con estancias posdoctorales; el 60% son miembros del Sistema Nacional de
Investigadores (SNI) y el 100% cuentan con reconocimiento perfil PRODEP. Las líneas
de generación y aplicación del conocimiento que dirigen dichos investigadores,
incidien directamente para el soporte de la calidad del programa.
La orientación tiene como objetivo fundamental, la generación de recursos humanos

altamente calificados, competitivos, con visión crítica y analítica, excelencia
académica, capaces de realizar investigación científica básica, integral y original, que
contribuya al estudio del origen y evolución de la diversidad organísmica a diferentes
niveles de organización como son el genético, específico y ecosistémico. Esta
formación académica les permitirá generar conocimiento novedoso, identificar
problemas y proponer estrategias de resolución con el uso de tecnologías de punta,
con la finalidad de atender las necesidades regionales y nacionales, que incidan en el
contexto internacional para el estudio de la diversidad biológica. Esta formación del
alumnado esta dirigida a la independiencia como investigadores con capacidad de
gestión y trabajo multidisciplinario.
La Biología Evolutiva estudia los procesos y patrones de la Biodiversidad en todos sus

niveles de organización (genético, de especies y ecosistémico), así como las
diferencias y similitudes entre organismos y sus características adaptativas y no
adaptativas. Las escalas de análisis son amplias, incluyen análisis de diversidad
taxonómica, morfológica y molecular. Además, se exploran patrones biogeográficos y
31


filogenéticos relacionados con el origen, la diversidad genética e interacciones
bióticas; así como estrategias adaptativas al estrés biótico y abiótico.
Las líneas de investigación se abordan en los enfoques macro y

microevolutivos, desde una perspectiva histórica y/o ecológica. El nivel de estudio
considera diferentes escalas como genes, genomas, individuos, poblaciones y
comunidades. También se analizan las interacciones entre ellas y con el medio
circundante en condiciones naturales y/o artificiales. La importancia de estos estudios
recae en aspectos de variabilidad genética, biogeográfia, filogenética, adaptación y
estrés celular; que en su conjunto juegan un papel importante como indicadores de la
vida silvestre y de los ecosistemas. Esta orientación ofrece la oportunidad de ampliar
el conocimiento sobre la descripción, el origen y la evolución de la diversidad
biológica, a través de la historia evolutiva de los organismos y su aplicación en las
diferentes áreas biológicas relacionadas.
La región Centro-Norte del país constituye una región con potencial para la
realización de diversos estudios en Biología Evolutiva y Biodiversidad. Esta
orientación ofrece la oportunidad de ampliar el conocimiento sobre el origen y la
evolución de la diversidad biológica de esta región, con trascendencia a nivel regional
y nacional. En la LGAC se estudian diversos grupos de organismos que incluyen los
tres dominios Archea, Bacteria y Eucaria, tales como arqueas, eubacterias, chromistas,
arqueozoos, protozoarios, hongos, plantas y animales. Esta LGAC se enfoca en:
a) La biodiversidad de las interacciones simbióticas de organismos de vida

silvestre se abordan desde una perspectiva taxonómica, ecológica,
biogeográfica, filogenética molecular, variabilidad genética, códigos de barra de
la vida y diversidad genómica.
b) Estudios en organismos de vida silvestre que involucran diferentes aspectos
macroevolutivos en la resolución de preguntas referentes a la sistemática
filogenética, diversidad, variación molecular y biogeografía.
c) Con el uso de marcadores genéticos se responden preguntas orientadas a
definir los mecanismos microevolutivos (mutación, selección natural,
32


migración, deriva génica) que intervienen en el modelado de la variabilidad
genética en poblaciones de organismos de vida silvestre.
d) Estudios de diversidad genética bacteriana de (Bacteria y Archaea), analizando
la extremadamente alta plasticidad genómica, son los seres vivos con mayor
diversidad genética y constituyen una gran parte de la biomasa de la Tierra.
e) Los mecanismos que promueven la diversidad genética bacteriana, como son la
generación de mutaciones y la transferencia horizontal de genes, a través de
los cuales producen variabilidad genética.
f) La adaptación a diferentes condiciones ambientales (determinada por su
diversidad genética) promovida por la adquisición de determinantes genéticos
que permiten adaptaciones evolutivas hacia condiciones ambientales extremas.
g) El análisis de la diversidad genética-funcional bacteriana y vegetal que han
permitido su sobrevivencia promovida por la presión selectiva causada por las
condiciones ambientales extremas, entre ellas los metales pesados.
Temas Principales de investigacion.
• Estudios de biodiversidad en diferentes grupos.

• Evolución e interacciones simbióticas.
• Evolución y marcadores genéticos adaptativos.
• Filogenética molecular, metagenómica y genómica.
• Filogeográfia y genética poblacional.
• Plasticidad genética bacteriana
• Adaptaciones evolutivas a condiciones de estrés en plantas y bacterias.
• Taxonomía y Biogeografía en grupos selectos.

Integrantes.
• Dra. Melina Del Real Monroy.

• Dra. Elizabeth Aurelia Martínez Salazar.
• Dr. Rogelio Rosas Valdez.
• Dr. Lenin Sánchez Calderón.
• Dra. Luz Elena Vidales Rodríguez.
• Dra. Gloria Guerrero Manríquez.
33


Biología Celular y Molecular Integrativa (BCMI)
La línea de investigación “Biología Celular y Molecular Integrativa” dentro del
Programa de Doctorado en Ciencias Básicas de la Universidad Autónoma de Zacatecas,
es abordada desde un enfoque integral y multidisciplinario con fundamento en que los
avances científicos desde la regulación génica, la secuenciación de genomas, RNAs y
proteínas, rutas metabólicas que modulan las funciones celulares como proliferación,
migración, invasión, diferenciación, las respuestas de los sistemas biológicos al estrés
ambiental, y de microorganismos, demandan un alto nivel de integración del
conocimiento con apoyo en la biología celular, molecular, computacional y de
sistemas. Esta forma de abordaje multidisciplinar permitirá aproximaciones hacia
nuevas aplicaciones biotecnológicas y biomédicas. Se busca formar investigadores que
desarrollen avances científicos innovadores, competitivos y de alto impacto.
Temas Principales de investigacion.
• Biología celular y molecular en estrés biótico y abiótico.

• Función y regulación de microRNAs en la respuesta al estrés abiótico y biótico.
• Función y regulación de microRNAs en cáncer
• Mecanismos de regulación a patologías de intéres nacional
• Mecanismos de patogenicidad microbiana y respuesta de defensa.
• Alternativas biotecnológicas en la atención a problemas de patógenos.
• Biomarcadores en enfermedades autoinmunes
• Enfoque genómico de la biología ante el estrés biótico y abiótico.
• Aspectos moleculares de la exposición a metales pesados.
• Enfoque metabolómico de la respuesta de los sistemas biológicos a estrés
ambiental
• Enfermedades autoinmunes.

Esta Línea de Investigación es atendida por un grupo de docentes investigadores y
Cátedras CONACYT, integrados en Cuerpos Académicos, todos con nivel de Doctorado,
el 66% de los miembros pertenecen al Sistema Nacional de Investigadores, y en su
mayoría con Perfil PRODEP.
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Integrantes.
• Dr. Jesús Adrián López.

• Dr. Juan José Bollain y Goytia de la Rosa.
• Dr. Yamilé López Hernández (Cátedra CONACyT)
• Dr. César E. Rivas Santiago (Cátedra CONACyT)
• Dr. Saúl Fraire Velázquez.
Ciencias Nucleares (CN)

La orientación de Ciencias Nucleares está adscrita al Doctorado en Ciencias Básicas de
la Universidad Autónoma de Zacatecas y es atendida por integrantes de la planta
académica de la orientación Académica de Estudios Nucleares, aglutinados en dos
Cuerpos Académicos reconocidos como consolidados con el 55% de los miembros
pertenecen al Sistema Nacional de Investigadores. En esta orientación se trabaja en
química radioanalítica, radioquímica, espectrometría y dosimetría, y seguridad y
protección radiológica.

Química radioanalítica: Orientada al desarrollo y/o implementación de métodos
radioanalíticos, para el análisis de radiación en diferentes matrices ambientales,
siendo las especialidades el análisis por centelleo líquido, la espectrometría gamma, la
espectrometría alfa y otras técnicas usadas principalmente para la medición del radón
ambiental. Otra vertiente de esta línea es el estudio de la composición elemental de
diversas matrices utilizando técnicas nucleares de análisis, como el análisis por
activación mediante neutrones térmicos y rayos gamma inmediatos.

Radioquímica: Con énfasis en los aspectos radioquímicos del estudio de retención e
inmovilización de contaminantes estables y radiactivos en minerales no metálicos
(aluminosilicatos), y en el estudio de compuestos de renio y sus análogos con 99mTc,
entre otros.

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Espectrometría y dosimetría: Cuyo propósito es la detección y caracterización de
campos de radiación ionizante y ultra violeta (UV), de origen natural o antropogénico,
y la cuantificación de la energía que depositan en el cuerpo humano con fines de su
protección y evaluación de posibles riesgos a la salud, así como la composición de las
fuentes emisoras.

Seguridad y Protección Radiológica: Cuyo fin es obtener los conocimientos básicos
para la protección de los trabajadores de la radiación y del público en general contra
los efectos dañinos de la radiación ionizante y no-ionizante; además del uso de
métodos exactos, numéricos y Monte Carlo para el diseño de blindajes, para el
confinamiento de fuentes de radiación, y el cálculo de la dosis por fuentes de
radiación abiertas y cerradas, y fuentes de radiación por reacciones nucleares, con
fines de la protección radiológica y la seguridad nuclear.

Temas principales de investigación:
Espectrometría de neutrones, partículas alfa, rayos gamma y radiación UV; estudios
de compuestos de 99mTc utilizando HPLC, química del renio, estudio de las
propiedades de adsorción e intercambio iónico de minerales no metálicos
(aluminosilicatos) en el tratamiento de contaminantes radiactivos y no radiactivos,
estudios de riesgos radiológicos por el contenido natural y antropogénico de
elementos radiactivos en el ambiente, simulación del transporte de la radiación por el
método Monte Carlo, estudios de campos de radiación, aplicación de la tecnología de
la inteligencia artificial en la reconstrucción de espectros y dosis, estudio de
bioindicadores de exposición a la radiación, estudios de dosimetría de estado sólido,
desarrollo y caracterización de materiales como blindaje de radiación, desarrollo de
fuentes realísticas, desarrollo de tecnología para la determinación del equivalente de
dosis ambiental, análisis por activación con neutrones térmicos y rayos γ prontos.

Integrantes:

• Dr. J. Ignacio Dávila Rangel
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• Dr. Eduardo Manzanares Acuña
• Dr. Fernando Mireles García
• Dr. José Luis Pinedo Vega
• Dr. Carlos Ríos Martínez
• Dra. Sonia Azucena Saucedo Anaya
• Dr. Héctor René Vega Carrillo
• Dra. Consuelo Letechipía de León
• Dr. Valentín Badillo Almaraz

Partículas, Campos y Física-Matemática (PCFM)

La línea de investigación de Partículas, Campos y Física-Matemática adscrita al
Doctorado en Ciencias Básicas de la Universidad Autónoma de Zacatecas, está
encaminada al estudio de aspectos formales de la cuantización por métodos
algebraicos, formalismos de alto espín, origen de masa, Física no-conmutativa, y
teorías de norma, ya sea a nivel clásico o cuántico, gravitación, cosmología, y en
general, el estudio de las simetrías relacionadas con cada uno de estos temas. Así
mismo se desarrolla a nivel fenomenológico la línea de producción de bosones
vectoriales y de Higgs en el modelo estándar. Al ser primordialmente líneas teóricas,
se promueve la generación del conocimiento, y los desarrollos relacionados con
posibles cuestiones técnicas relacionadas con otras ramas de la Física. A nivel
matemático, se desarrollan técnicas encaminadas a describir de manera geométrica
cantidades invariantes asociadas a un sistema físico. En particular son desarrolladas
técnicas de geometría diferencial, álgebras geométricas, y estructuras simplécticas no-
conmutativas. Los estudiantes que se adhieran a alguno de los proyectos
desarrollados por los miembros de esta línea de investigación, estarán directamente
ligados a la investigación, por lo que es de esperarse que su participación sea activa y
se vea reflejada en el Seminario conjunto de Gravitación y Campos organizado por los
miembros del mismo, además de participar en visitas de investigación a otras
Universidades con las que se tienen convenios, ya sea a nivel institucional o bien,
personal.
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Temas principales de investigación:
Álgebras geométricas, Astrofísica, bosón de Higgs, branas y cuerdas, Cosmología,
cuantización, Electromagnetismo, espín, Geometría diferencial, Gravitación, modelo
estándar de partículas, no-conmutatividad, simetrías, supersimetría, teoría cuántica
de campo, teoría de grupos, teorías de Yang-Mills.

Integrantes:
• Dr. Andrew Chubykalo Eugenievich

• Dr. Amado Augusto Espinoza Garrido
• Dr. Alejandro Birgilio Gutiérrez Rodríguez
• Dr. Valeri Vladimirovich Dvoeglazov
• Dr. Carlos Alberto Ortiz González
• Dr. Alejandro González Sánchez
• Dr. Julio César López Domínguez
• Dr. Sinhué Lizandro Honojosa Ruiz
• Dr. Miguel Ángel García Aspeitia
• Dr. Alejandro Puga Candelas
Modelación, Síntesis y Caracterización de Materiales (MSCM)

El desarrollo de las sociedades humanas ha estado históricamente ligado a su
capacidad para producir los materiales necesarios para satisfacer sus necesidades. La
física de los materiales ha contribuido a causar verdaderas revoluciones científicas y
tecnológicas a través de la generación de nuevos materiales como polímeros,
cerámicas, compósitos y aleaciones; así como en la invención y mejoramiento del
transistor, los dispositivos ópticos y magnéticos de almacenamiento de datos, el láser,
los LED, fibras ópticas, superconductores, celdas solares y una enorme lista de otros
dispositivos de estado sólido que tienen aplicación prácticamente en todos los
aspectos de la vida cotidiana. Es por esto justamente, que un alto porcentaje de la
investigación que se realiza a nivel mundial tiene que ver con la física de los
materiales.
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La línea de investigación de “Modelación, Síntesis y Caracterización de Materiales” del
Programa de Doctorado en Ciencias Básicas de la Universidad Autónoma de Zacatecas,
está soportada por 18 investigadores, 83 % de ellos en el Sistemas Nacional de
Investigadores (SNI) y la mayoría cuentan con el reconocimiento a profesores con
Perfil Deseable, los cuales se encuentran distribuidos en cuatro Cuerpos Académicos.
Uno de ellos teórico-experimental y uno más de carácter teórico. Los objetivos
principales de esta línea son: 1) el desarrollo de nuevos materiales con aplicaciones en
la tecnología, crecimiento y caracterización de sistemas físicos novedosos, así como en
el cálculo de sus propiedades físicas; 2) el estudio las propiedades ópticas,
electrónicas y magnéticas de estructuras semiconductoras volúmicas y de baja
dimensión desde el punto de vista teórico-numérico. Para ello se emplean
esencialmente metodologías como Teoría de Masa Efectiva, Método k.p y Tight-
Binding semiempírico; y 3) radiometría y fotometría de fuentes alternas de
iluminación, técnicas de metrología óptica, como holografía digital, interferometría
holográfica, microscopía holográfica, fotografía de Speckle y shearography. Estas
técnicas permiten medir interferométricamente distintas cantidades físicas en todo
tipo de material con una muy alta resolución espacial y temporal. Son técnicas de
campo completo, no invasivas y no destructivas. Espectroscopias vibracionales,
fotoacústica y fotopiroeléctrica para distintos fines, desarrollando proyectos de
investigación encaminados en el estudio y caracterización de materiales biológicos,
orgánicos e inorgánicos, con aplicaciones en el área industrial, farmacéutica,
microbiológica, de alimentos y biomédica, por mencionar algunas.

La cantidad de temas de investigación que se desprenden de esta línea de
investigación, es suficientemente vasta como para plantear y llevar a cabo
investigaciones de suma importancia, tanto desde el punto de vista teórico como
experimental, así como de estudios conjuntos teóricos-experimentales. Esta
versatilidad es debido a la cantidad de técnicas, tanto teóricas como experimentales,
para la fabricación y caracterización de materiales.

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Temas de Investigación:
Depósito físico por sputtering. Evaporación y ablación láser. Depósito Químico por sol
gel. Caracterización por difracción de rayos x. Espectroscopias y caracterización
eléctrica C-V e I-V. Cálculos de la estructura electrónica de materiales por métodos de
primeros principios, así como empíricos y semiempíricos. Estudios de las
propiedades de transmisión electrónica, óptica y acústica de sistemas multicapas,
estructura electrónica de materiales volúmicos, así como de pozos cuánticos y
superredes de AlAs, GaAs, Si, ZnSe, nitruros, grafeno y materiales similares. Estudio de
la estructura de niveles de transistores efecto de campo con pozos delta dopados de
impurezas. Radiometría y fotometría de fuentes alternas de iluminación.
Instrumentación óptica, polarización de la luz, teoría del color, visión humana,
cáusticas ópticas, filtros de películas delgadas, y en óptica geométrica de cristales uni-
axiales. Interferometría holográfica, microscopia holográfica, fotografía de moteado y
shearography. Espectroscopias vibracionales, fotoacústica y fotopiroeléctrica.

Lo anteriormente descrito, da muestra de la multidisciplinariedad de esta línea de
investigación, permitiendo así, la interacción con las diferentes disciplinas que
conforman el núcleo básico del presente programa de doctorado. Asimismo, los
becarios doctorales que ingresen al programa eligiendo esta línea, se involucrarán en
proyectos de investigación multidisciplinarios que les brindarán una amplia
formación profesional, académica y científica.

Integrantes:
• Dr. José de Jesús Araiza Ibarra

• Dr. Sinhué Lizandro Hinojosa Ruiz
• Dr. Felipe Román Puch Ceballos
• Dr. Hugo Tototzintle Huitle
• Dr. Leticia Pérez Arrieta
• Dr. David Armando Contreras Solorio
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• Dr. Juan Carlos Martínez Orozco
• Dr. Agustín Enciso Muñoz
• Dr. Jesús Madrigal Melchor
• Dr. Isaac Rodríguez Vargas
• Dr. Iván Moreno Hernández
• Dr. Cuauhtémoc Araujo Andrade
• Dr. Tonatiuh Saucedo Anaya
• Dr. Rumen Ivanov Tsonchev
• Dr. Sergio Molina Valdovinos
• Dr. José Juan Ortega Sigala
• Dr. José Samuel Pérez Huerta
• Dra. Perla Xochil Viveros Méndez
Matemáticas Básicas (MBa)

Esta línea de investigación está dedicada al estudio de temas básicos de las
matemáticas. El estudio de las matemáticas “básicas” o “puras” es escencial para el
desarrollo científico y tecnológico. Prácticamente no existe área de las ciencias
naturales (e incluso algunas socilaes) que no requieran en mayor o menor medida
dematemáticas sofisticadas. Nuestra línea de investigación ofrece introducir al
estudiante en la investigación de atractivas líneas de gran interés en la actualidad:
geometría algebraica y teoría de números, análisis, matemáticas discretas. Además de
la calidad del núcleo académico asociado a la orientación, los investigadores
participantes garantizan contactos e intercambios con reconocidos especialiestas
nacionales e internacionales.

Temas de investigación:
Geometría de las superficies fibradas y variedades abelianas con acciones de grupos,
Teoría de los números con especial énfasis en problemas diofantinos y análisis
diofantino, Teoría topológica de gráficas, geometría discreta y combinatoria,
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Combinatoria algebraica, teoría combinatoria de grupos, combinatoria de
permutaciones, Análisis no-estandar, Topología general y algebraica.

Integrantes:
Dr. Alexis García Zamora.
Dr. Santos Hernández Hernández.
Dr. Jesús Leaños Hernández.
Dr. Alexander Pyshchev.
Dr. Luís Manuel Rivera Martínez.
Dr. Miguel Angel Maldonado Aguilar.
Dr. Ram Gopal Vishwakarma
Investigadores
En este último apartado concerniente a la sección de Estructura Curricular se
mostrará una tabla en la cual se puede encontrar el listado completo de
investigadores que participan en el núcleo académico básico (NAB) del PADCB, así
como la cualificación de los mismos en términos de la pertenencia o no al Sistema
Nacional de Investigadores (SNI), la LGAC así como la orientación en la que participan.

Nombre del Investigador SNI LGAC Orientacion (Sede)
Cesar Enrique Rivas Santiago I BCMI UACB-Catedra
Elizabeth Aurelia Martínez Salazar I BEB UACB
Gloria Guerrero Manríquez I BCMI UACB
Jesús Adrián López BCMI UACB
Juan José Bollain y Goytia de la Rosa I BCMI UACB
Lenin Sánchez Calderón BEB UACB
Luz Elena Vidales Rodríguez BEB UACB
Melina del Real Monroy C BEB UACB
Rogelio Rosas Valdez I BEB UACB
Saúl Fraire Velázquez BCMI UACB
Yamile López Hernández I BCMI UACB-Catedra
Carlos Ríos Martínez CN UAEN
Consuelo Letechipía de León CN UAEN
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Eduardo Manzanares Acuña I CN UAEN
Fernando Mireles García I CN UAEN
Héctor René Vega Carrillo II CN UAEN
Ignacio Dávila Rangel I CN UAEN
José Luis Pinedo Vega I CN UAEN
Sonia Azucena Saucedo Anaya CN UAEN
Valentín Badillo Almaraz CN UAEN
Agustín Enciso Muñoz I MSCM UAF
Alejandro Birgilio Gutiérrez Rodríguez II PCFM UAF
Alejandro González Sánchez PCFM UAF
Alejandro Puga Candelas PCFM UAF
Amado Augusto Espinoza Garrido I PCFM UAF
Andrew Chubykalo Eugenievich PCFM UAF
Carlos Alberto Ortiz González PCFM UAF
Cuauhtémoc Araujo Andrade II MSCM UAF
David Armando Contreras Solorio II MSCM UAF
Felipe Román Puch Ceballos MSCM UAF
Hugo Tototzintle Huitle MSCM UAF
Isaac Rodríguez Vargas II MSCM UAF
Iván Moreno Hernández III MSCM UAF
Jaime Raúl Suárez López I MSCM UAF
Jesús Madrigal Melchor I MSCM UAF
José de Jesús Araiza Ibarra I MSCM UAF
José Juan Ortega Sigala C MSCM UAF
José Samuel Pérez Huerta C MSCM UAF
Juan Carlos Martínez Orozco II MSCM UAF
Julio César López Domínguez PCFM UAF
María Leticia Pérez Arrieta I MSCM UAF
Perla Xochil Viveros Méndez MSCM UAF
Rumen Ivanov Tsonchev II MSCM UAF
Sergio Molina Valdovinos C MSCM UAF
Sinhué Lizandro Hinojosa Ruiz PCFM UAF
Tonatiuh Saucedo Anaya I MSCM UAF
Valeri Vladimirovich Dvoeglazov I PCFM UAF
Miguel Ángel García Aspeitia I PCFM UAF-Catedra
Alexander Pyshchev MBa UAM
Alexis Miguel García Zamora II MBa UAM
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Jesús Leaños Macías I MBa UAM
Luis Manuel Rivera Martínez I MBa UAM
Miguel Ángel Maldonado Aguilar C MBa UAM
Ram Gopal Vishwakarma I MBa UAM
Santos Hernández Hernández I MBa UAM

El NAB del PADCB, a enero 2018, cuenta con 55 investigadores de los cuales el 76 %
de sus investigadores están en el SNI. De esos el 9 % son Candidatos del SNI (SNI-C),
42 % son Nivel 1 del SNI (SNI-1), 15 % son Nivel 2 del SNI (SNI-2) y el 2 % son SNI III.
44


NORMATIVIDAD
Capítulo I. De la estructura operativa
Artículo 1: La estructura operativa del Programa de Doctorado en Ciencias Básicas
(PADCB) será responsabilidad de los siguientes órganos:
a) Comité Académico Doctoral de Ciencias Básicas (CADCB).

b) Comité Académico Doctoral de Orientación (CADO).
c) Comités Tutoriales (CT).
d) Apoyo Administrativo.
Capítulo II. Del Comité Académico Doctoral de Ciencias Básicas
Artículo 2: El CADCB estará conformado por cuatro integrantes (Uno por cada
orientación) y un coordinador, nombrados por la planta docente participante en el
PADCB de las Unidades Académicas del Área de Ciencias Básicas (Con el aval del
Consejo de Unidad de cada orientación) y el coodinador por Consejo Académico del
Área de Ciencias Básicas (Con el aval del Consejo de Área), respectivamente. El CADCB
será renovado en su totalidad cada cuatro años.

Artículo 3: El CADCB sesionará una vez por mes durante cada periodo semestral,
aunque, a juicio del responsable o a solicitud expresa de alguno de los CADO se
puede(n) programar una o más sesiones adicionales.
Artículo 4: Las decisiones y resolutivos del CADCB se tomarán por consenso. En caso
de no tener un consenso el coordinador del doctorado tendrá voto de calidad.
Artículo 5: Para ser integrante del CADCB se deberán reunir las características
siguientes:
a) Poseer grado académico de Doctor en Ciencias.
b) Estar activo en investigación y ser miembro del SNI.
c) Tener su adscripción de base en alguna de las Unidades Académicas del Área
de Ciencias Básicas.
d) No ser funcionario de la Universidad Autónoma de Zacatecas.
45


Artículo 6: Son atribuciones y obligaciones del CADCB las siguientes:
a) Implementar el PADCB y velar por el nivel académico del mismo.

b) Autorizar la inscripción al PADCB de los aspirantes seleccionados por los
CADO.
c) Analizar, proponer y avalar modificaciones al mapa curricular y contenidos de
los programas de las materias ofertadas.
d) Autorizar temas propuestos para tesis atendiendo a las recomendaciones
emitidas por los CADO.
e) Impulsar y orientar las acciones relacionadas con la movilidad estudiantil.
f) Promover y orientar la movilidad docente y estancias posdoctorales de la
planta docente del PADCB.
g) Avalar los jurados propuestos por los CADO para los exámenes de grado.
h) Coordinar las acciones del apoyo administrativo para la elaboración de
proyecciones en materia de necesidades del PADCB en cuanto a equipo,
materiales e insumos, para su inclusión en la gestión periódica de recursos vía
convocatorias FOMIX, PIFI, CONACYT, etc.
i) Proponer las políticas del ejercicio financiero para la adquisición de equipo,
materiales e insumos, definiendo y anteponiendo las prioridades del PADCB.
j) Establecer las cuotas de inscripción, colegiaturas y derechos de uso de
laboratorios en el PADCB.
k) Coordinar y supervisar las actividades escolares y administrativas del PADCB.
l) Coordinar las actividades de difusión y promoción del PADCB.

Capítulo III. De los Comités Académicos Doctorales de Orientación

Artículo 7: El CADO de cada orientación estará conformado por cuatro integrantes,
uno de ellos será el miembro del CADCB ya elegido y tres más nombrados por la
planta docente integrada al PADCB de las orientaciones participantes. El CADO será
renovado en su totalidad cada cuatro años.
46


Artículo 8: El representante del CADCB de cada orientación será el responsable de
coordinar las actividades del CADO.
Artículo 9: El CADO sesionará una vez por mes durante cada periodo semestral.
Aunque, a juicio del responsable o a solicitud expresa de alguno de los docentes
participantes en PADCB se puede(n) programar una o más sesiones adicionales.
Artículo 10: Las decisiones y resolutivos del CADOse tomarán por consenso. En caso
de no tener consenso la desición la tomará el miembro del CADCB.
Artículo 11: Para ser integrante del CADO se deberán reunir las características
señaladas en el artículo 5.
Artículo 12: Son atribuciones y obligaciones del CADO las siguientes:

a) Tener la responsabilidad y la conducción del proceso de selección de
aspirantes por orientación en cada promoción generacional al PADCB.
b) Emitir resultados y recomendaciones referentes a la elegibilidad de los
aspirantes al CADCB.
c) Analizar temas propuestos para tesis en la orientación específica y emitir
recomendaciones sobre su autorización al CADCB.
d) Designar los comités tutoriales que acompañarán al alumno en su desarrollo en
el PADCB.
e) Coordinar las actividades académicas en la orientación específica.

Capítulo IV. Del comité de tutores

Artículo 13: El Comité Tutorial será asignado por el CADO con el aval del CADCB y
estará integrado por el director de tesis y dos tutores académicos pudiendo ser uno de
éstos, externo a la institución.
Artículo 14: El académico que funja como director de tesis o tutor, deberá acreditar
previamente ante el CADO y el CADCB los requisitos siguientes:
a) Poseer grado de doctor en la disciplina correspondiente o en un área afín.
47


b) Tener una producción académica permanente de alta calidad, basada en
trabajos de investigación originales.
c) Tener dedicación a la formación de recursos humanos para la docencia y la
investigación.
Artículo 15: El Comité Tutorial tendrá como funciones las siguientes:
a) Planear, organizar y evaluar las actividades académicas y de investigación, de
manera conjunta con el alumno.
b) Revisar, orientar, dirigir y avalar el proyecto de tesis, para su presentación y
eventual aprobación final en la evaluación semestral correspondiente.
c) Emitir recomendaciones en lo referente a solicitud(es) de cambios en
proyectos de tesis, suspensión temporal de estudios, bajas de materias, cambio
de tutor(es) y director de tesis, para que sean considerados por los CADO y el
CADCB.
d) Proponer al CADO y al CADCB a los integrantes del jurado en los exámenes de
posgrado.
Capitulo V. Apoyo Administrativo

Artículo 16: El apoyo administrativo se conformará por un asistente del coordinador
y por los cuatro departamentos de control escolar de cada orientación de los alumnos
inscritos al PADCB, así como por un responsable del manejo de los recursos
financieros del PADCB por cada orientación.
Artículo 17: El perfil y funciones del responsable del control escolar serán:
a) El responsable de control escolar será un técnico con la capacitación indicada
para un desempeño adecuado en su interacción con el departamento escolar de
la institución.
b) Tendrá a su cargo las actividades de inscripciones, reinscripciones, control de
kárdex, expedición de constancias y otras propias de su responsabilidad.
c) El responsable administrativo será un profesional en el área administrativa o
contable.
48


d) Tendrá a su cargo las funciones de compras y control de recursos materiales,
manejo de proveedores, concesión de gastos de viaje y viáticos, y de respaldo
en la elaboración de proyecciones en materia de infraestructura y solicitudes
de apoyos financieros ante diferentes instancias, en lo referente a la
integración de proyectos en la parte de costos, cotizaciones y otras propias de
su responsabilidad.
Artículo 18: El funcionamiento del Apoyo Administrativo estará coordinado por el
CADCB, siendo el coordinador del CADCB el interlocutor directo con los responsables
de cada orientación.
Capítulo VI. Del ingreso

Artículo 19: Para ser aspirante a ingresar al programa de doctorado en ciencias
básicas se deberá tener el siguiente perfil:
a) Poseer título de maestría en ciencias (matemáticas, biología, física, nucleares) o
en alguna otra área del conocimiento afín, a juicio del comité de admisión
(CADO), otorgado por una institución de educación superior pública o por
instituciones particulares con autorización y reconocimiento de validez oficial
de los estudios, por la Secretaría de Educación Pública, o por alguna institución
extranjera con la revalidación correspondiente de acuerdo al Reglamento
Escolar General (REG) (artículos del 72 al 75).
b) Haber obtenido un promedio mínimo de 8.0 en sus estudios de maestría.

Artículo 20: Análisis del perfil académico del aspirante, por el CADCB, que consiste
en:
a) Entrega de carta de motivos para ingresar al doctorado.
b) Entrega de 2 cartas de recomendación expedidas por investigadores del área.
c) Entrega de currículum vitae respaldado con documentos probatorios.
d) Una entrevista personal.
e) El CADCB comunicará el resultado al CADO sobre la elegibilidad del aspirante.

49


Artículo 21: En caso de ser elegible, el aspirante será sujeto al proceso de selección
que consiste en:
a) Presentar el EXANI III conforme lo establece el Reglamento Escolar General
institucional (REG) y de acuerdo a los tiempos y formas de la convocatoria
respectiva.
b) Presentar los exámenes generales de conocimientos uno escrito y otro oral que
versarán sobre los contenidos de las asignaturas básicas de cada orientación,
mismos que serán aplicados por el CADO. Con la presencia de al menos dos
miembros del CADCB como observadores.
c) Presentar constancia de suficiencia en el manejo del idioma inglés (TOEFL
institucional de 500 puntos o equivalente con alguna otra herramienta de
evaluación), con vigencia no mayor a dos años y en caso de no tener 500
puntos tiene hasta dos años para acreditar el puntaje una vez inscrito al
programa.

Artículo 22: Para ser admitido en el Programa de Doctorado en Ciencias Básicas

(PADCB) el aspirante deberá:
a) Obtener calificación aprobatoria en los exámenes de conocimientos. El
aspirante puede ser admitido con la recomendación por el CADO de tomar por
una única vez un curso de una materia en la que haya obtenido una calificación
insuficiente, dicha materia debe ser cursada dentro de los dos primeros
semestres del PADCB y no tendrá valor en créditos. El aspirante tiene dos
oportunidades de aprobar los exámenes de conocimientos para ingresar al
PADCB ajustadas en tiempo a la apertura de las promociones generacionales,
en caso contrario deja de ser considerado como tal.
b) La inscripción al PADCB se realizará de acuerdo a lo establecido en el estatuto
general (EG) y según lo señalado en el RGE, cubriendo las respectivas cuotas de
inscripción, colegiatura y derechos de uso de laboratorios.

50


Capítulo VII. De la convalidación, equivalencia y revalidación de estudios
Artículo 23: La convalidación de estudios se acatará a lo establecido en el Reglamento
Escolar General vigente en la institución [artículos del 53 al 55].
Artículo 24: La equivalencia de estudios se normará por lo señalado en el Reglamento

Escolar General vigente en la institución [artículos del 56 al 71].
Artículo 25: La revalidación de estudios se efectuará de acuerdo a los lineamientos

establecidos en el Reglamento Escolar General vigente en la institución [artículos del
72 al 75].
Capítulo VIII. De la permanencia

Artículo 26: El límite máximo que tendrá un alumno para estar inscrito en el PADCB
será de cuatro años (ocho semestres), según [artículo 14 del REG].
Artículo 27: El tiempo que comprenda un permiso(s) solicitado por el alumno y

autorizado por el CADCB, no se computará para los efectos del artículo 27 del
presente reglamento.
Artículo 28: La reinscripción al PADCB se efectuará a partir del segundo semestre y

para el efecto se seguirá el proceso detallado en [Titulo II, cap. I, artículos del 76 al 80
del REG].
Artículo 29: Los alumnos causarán baja, además de los motivos establecidos en
[Titulo II, cap. II, artículos 81 al 84 del REG] por:
a) Solicitud propia presentada por escrito al CADCB.
b) Abandono de sus estudios por un periodo mayor a seis meses sin previa
autorización del CADCB.
c) No presentar sus informes escrito y oral de avances semestrales al director de
tesis y a los CT y CADO, correspondientes a dos periodos escolares
consecutivos.
d) No acreditar una materia cursada en segunda ocasión.
e) No acreditar todas las materias cursadas en un semestre.
51


Capítulo IX. De las evaluaciones

Artículo 30: De acuerdo al mapa curricular el PADCB requiere de evaluaciones
semestrales como son:
a) en el primer semestre, al ingreso, protocolo de tesis doctoral, asignatura de
formación específica y seminario de protocolo.
b) en el segundo semestre, investigación I y seminario de tesis I.
c) en el tercer semestre, investigación II y seminario de tesis II.
d) en el cuarto semestre, investigación III y seminario de tesis III.
e) en el quinto semestre, investigación IV y seminario de tesis IV.
f) en el sexto semestre, estancia de investigación I.
g) en el séptimo semestre examen, seminario de acreditación de tesis doctoral.
h) en el octavo semestre, seminario doctoral.

Artículo 31: Como parte de la evaluación semestral, el director de tesis,
conjuntamente con el alumno, presentarán al Comité Tutorial el expediente de
desempeño académico.

Artículo 32: Como parte de la evaluación semestral, el director de tesis,
conjuntamente con el alumno, presentarán al Comité Tutorial el plan de trabajo con
las actividades realizadas y actividades por realizar para el semestre siguiente.
Artículo 33: En los casos en los que las evaluaciones tengan asignados créditos, la
calificación será en escala de 0 a 10, siendo 8 la calificación mínima aprobatoria.
Capítulo X. De la movilidad estudiantil y de académicos

Artículo 34: La movilidad estudiantil (estancias para cubrir materias y/o de
investigación) será impulsada e implementada por el CADCB a través de la búsqueda y
formalización de convenios institucionales y/o individuales de colaboración con
grupos y/o universidades e instituciones de investigación que oferten programas de
estudios afines con reconocimiento nacional e internacional.
52


Artículo 35: En todos los casos las propuestas de movilidad estudiantil serán
consensadas por el CADCB.
Artículo 36: La movilidad de académicos se dará por estancias de investigación y

posdoctorales a través de convenios de colaboraciones institucionales y/o
individuales con grupos y/o universidades e instituciones de investigación de
reconocido prestigio tanto a nivel nacional como internacional.
Artículo 37: En todos los casos las propuestas de movilidad académica serán
consensadas por el CADCB.
Capítulo XI. Del egreso

Artículo 38: Para obtener el grado de Doctor, será necesario:
a) Haber cubierto todos los requisitos contemplados en el plan de estudios.
b) Estar al corriente en pago de cuotas (inscripciones, reinscripciones,
colegiaturas) y pago de derechos de examen de posgrado.
c) Que el candidato a doctor cuente con al menos un artículo de investigación
como primer autor, publicado en alguna revista indexada determinada por el
Science Citation Index. El artículo debe de aparecer en una revista que
aparezca en dicho índice a la fecha de su publicación.
d) Acreditar el seminario doctoral (examen de posgrado) mediante la elaboración
y defensa oral de una tesis, de una investigación original de alta calidad ante un
jurado propuesto por el CADO y avalado por el CADCB, integrado por cinco
sinodales de los cuales por lo menos uno deberá ser externo a la UAZ, siendo
éste un académico de reconocido prestigio, experto en el área del tema de tesis.
El director de tesis no podrá fungir como presidente del jurado.
e) En cualquier caso, el resultado del seminario doctoral (examen de posgrado) se
expresará en términos de lo reglamentado en el estatuto general [artículo 190]
y en el RGE [cap. III, secc. II, artículo 191], a saber:
i.no aprobado
ii.aprobado por mayoría (voto aprobatorio de tres de los cinco jurados)
iii.aprobado por unanimidad (voto aprobatorio de los cinco jurados)
53


iv.aprobado por unanimidad con mención honorífica (voto aprobatorio de
los cinco jurados y bajo las consideraciones ahí señaladas)
f) En caso de que el resultado sea no aprobado, el candidato tendrá una segunda y
última oportunidad de acreditar el seminario doctoral en un plazo no menor de
seis meses y no mayor a un año, a partir de la fecha en que se efectuó el primer
examen de posgrado, según el RGE [cap. III, secc. I, II, artículos 190 y 191].
Capítulo XII. Profesores activos

Artículo 39: Ingreso
Los docentes-investigadores que forman parte del PADCB son docentes-

investigadores de una de las Unidades Académicas del área de Ciencias Básicas de la
UAZ. Estos pueden ser de tiempo determinado o de base.
Los requistos para ingresar al programa son:
a) Ser docente-investigador de tiempo completo en la UAZ.

b) Tener el grado de doctor en las orientaciones participantes en el programa.
c) Tener producción científica sostenida y reciente. Esto puede avalarse por la
permanencia en el SNI.

Los docentes-investigadores de tiempo completo, son docentes-investigadores de
tiempo determinado o de base en el área de ciencias básicas de la UAZ.
Artículo 40: Permanencia
Los requistos para permanecer al programa son:
a) Cumplir con los requisitos establecidos en el Artículo 39.

b) En caso de haber dirigido estudiantes del programa, que éstos hayan obtenido
el grado en los tiempos marcados en los planes de estudio.

Aquellos docentes-investigadores que dejen de ser activos por no cumplir con el
criterio establecido en el Artículo 39, inciso c, pero que sean directores de tesis,
podrán continuar realizando su trabajo; no se les asignarán estudiantes u otras
responsabilidades hasta que se reintegren al programa por sus méritos académicos.
54


Artículo 41: Obligaciones
Son obligaciones de los docentes-investigadores del PADCB además de las

establecidas en el reglamento de ingreso, egreso y permanencia de la Ley Órganica de
la UAZ:
a) Impartir los cursos del programa que el CADCB le solicite.

b) Participar de manera activa en las reuniones y evaluaciones de CT, CADO y
CADCB según corresponda. Especialmente en aquellos que tienen que ver con
los estudiantes que dirige.
c) Velar por el desarrollo adecuado y a tiempo de los proyectos de investigación
de los estudiantes que dirige.
d) Incluir en los créditos de los productos de investigación generados a los
candidatos que participan en la investigación asignada a dicho candidato y a la
unidad académica correspondiente.
e) Entregar a la CADCB copias de los productos de investigación generados
producto del trabajo de los candidatos.
f) A solicitud del CADCB, entregar en tiempo y forma la información que se le
solicite para mantener actualizado el archivo estadístico.
Capítulo XIII. De las Líneas de Investigación

Artículo 42: Ingreso
Los docentes-investigadores que participan en el Doctorado de Ciencias Básicas que

deseen registrar una línea de investigación en el PADCB deberán de cumplir los
siguientes requisitos:
a) Cumplir con los requisitos del artículo 39 en todos sus incisos.

b) Demostrar con productos científicos productividad en la línea de investigación
a registrar al PADCB.
c) La línea de investigación debe de estar conformada por al menos tres
integrantes que cumplan el artículo 39 en todos sus incisos.
d) Los integrantes no deberán de participar en más de dos líneas de investigación.

55


Artículo 43: Permanencia
Las líneas de investigación que participan en el Doctorado de Ciencias Básicas

deberán de probar mantener una productividad científica de acuerdo al número de
participantes en dicha línea. Un producto por participante anual es el mínimo
requerido para que dicha línea no sea dada de baja de acuerdo al artículo 42 de este
reglamento.
Capítulo XIV. De las omisiones

Artículo 44: Cualquier asunto no especificado en este reglamento será resulto por el
CDCB y su decisión será inobjetable.
56


EFICACIA DEL PROGRAMA

En el programa de Doctorado en Ciencias Básicas se han implementado un conjunto
de estrategias y un plan de desarrollo para garantizar la eficacia del mismo en sus
diferentes etapas: ingreso, permanencia y titulación. Estas estrategias y plan de
desarrollo se diseñaron tomando en consideración los recursos con que cuentan las
Unidades Académicas que lo conforman.
Estrategias
Están integradas dentro del programa académico, y fueron determinantes para el
diseño del perfil de ingreso y egreso, la organización interna, el mapa curricular y los
contenidos de las asignaturas. A continuación, se enuncian las estrategias para
garantizar la eficacia del Programa Académico:
Estrategias para garantizar el ingreso al Programa Académico

En este apartado se busca fomentar la demanda de estudiantes en el programa
doctoral. Para lo cual se proponen los siguientes puntos:

1. Promocionar el Doctorado en Ciencias Básicas en diferentes entidades académicas
de la región. Difusión mediante una página “web”, la prensa y divulgación interna en
la UAZ.
2. Otorgar becas de tiempo completo a los estudiantes ya que el Doctorado pretende
ingresar al PNPC.
3. Facilitar el apoyo económico a los estudiantes de tiempo completo que ingresen al
programa, mediante un esquema interno de becas de la UAZ y del Consejo
Zacatecano de Ciencia y Tecnología (COZCYT), mientras Consejo Nacional de
Ciencia y Tecnología (CONACYT) libera el recurso de becas.
4. Permitir el ingreso de perfiles académicos afines a las líneas de investigación
ofrecidas en el programa.
5. Ofertar especialidades únicas en la región. (Ejemplo: “Matemáticas Básicas”,
“Ciencias Nucleares”, etc.)
6. Vincular los programas académicos de maestría en Ciencias Básicas y áreas afines
que oferta la UAZ.
7. Aprovechar el perfil de los profesionistas que egresan de las instituciones de
educación superior de la UAZ y de otras instituciones educativas del estado.
57


Estrategias para garantizar una alta tasa de titulación
En este apartado se presentan las medidas necesarias para obtener una alta eficiencia
terminal, punto fundamental en los programas de calidad nacional.

1. Comité Académico Doctoral de Orientación. Dicho comité se encarga de avalar el
ingreso y el egreso del estudiante.
2. Comité Tutorial. Este comité está formado por académicos involucrados en el
proyecto de investigación (asesor, co-asesor y tutores de las áreas que componen el
doctorado). Dicho comité da un seguimiento cercano al desarrollo de la
investigación del estudiante, garantizando el término de la misma.
3. El alumno debe estar incluido en un proyecto de investigación con objetivos
claramente determinados, su factibilidad y alcance, así como los productos
secundarios de la investigación.
4. Ofrecer un mapa curricular flexible considerando la trayectoria académica y acorde
al perfil académico.
5. Dado que el programa pertenece al PNPC, esto le permite al estudiante acceder a
becas posdoctorales en instituciones nacionales o del extranjero, o incorporarse al
mercado laboral de manera adecuada.
Estrategias para garantizar la calidad académica

Los puntos planteados en esta sección están encaminados a mantener los altos
estándares académicos requeridos en los programas de doctorado dentro del PNPC.

1. Comité Académico Doctoral de Orientación. La presencia del CADO garantiza que el
estudiante tenga el perfil deseado y que el trabajo final cumpla con los lineamientos
del perfil de egreso.
2. Comité Tutorial. Este comité garantiza la calidad del trabajo realizado por el
estudiante.
3. La inclusión de seminarios de investigación y de tesis, permitirá la evaluación
continua del estudiante durante sus estudios y la inculturación científica de los
mismos.
58


4. Que el alumno cuente con una propuesta de trabajo de algún investigador que
pertenezca al programa de doctorado.
5. Contar con un expediente académico que refleje a detalle la trayectoria académica
del estudiante.
6. Fomentar la publicación de resultados del proyecto de investigación del estudiante
y su presentación en congresos nacionales o internacionales, así como la realización
de estancias cortas de trabajo en otras instituciones nacionales o extranjeras.

59


ANEXO A
ASIGNATURAS DE
FORMACIÓN BÁSICA

60


Biología de la interacción planta-microorganismo

• Número de créditos: 12
• Semestre recomendado: 1 ó 2
• Horas a la semana: 16
• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: ninguno
• Clave: AFB-1
• Asignatura: Básica
• Materia asociada a la Línea de investigación: BCMI

Descripción de la asignatura: En el curso del ciclo biológico de cualquier especie vegetal, sea
cultivada o silvestre, una constante es la interacción con una infinidad de microorganismos
sean bacterias, hongos, virus, micoplasmas e incluso nematodos. En estas interacciones
pueden suceder relaciones benéficas o detrimentales para la planta o para ambos agentes en
interacción. Las herramientas de agrobiotecnología moderna demandan cada vez un mayor
conocimiento de la biología celular y molecular que se establece cuando un tejido de la planta
o todo el sistema vegetal entra en interacción con determinado microorganismo, panorama
molecular que está íntimamente ligado con las condiciones del medio ambiente
prevalecientes.
Para optimizar las interacciones beneficiosas y limitar los efectos negativos ejercidos por los
agentes patógenos, es de suma importancia conocer los mecanismos de ambos tipos de
interacciones, tanto benéficas como detrimentales, así como las mínimas diferencias que
existen entre ellos. El resultado de las relaciones planta-microorganismo depende de las
capacidades individuales de los agentes que interaccionan, así como de sus relaciones con el
medioambiente.

Índice temático:
1. Eventos moleculares durante el proceso de reconocimiento temprano. El

concepto de inmunidad en plantas. Inmunidad basal disparada por MAMPs y PAMPs
en plantas. Activación de cascadas de señalización. Canales iónicos. Canales de calcio.
Explosión oxidativa.
2. Participación de MAPKs, CDPKs, factores de transcripción y hormonas. MAPKs.
Proteínas de unión a Calcio. Factores de transcripción. Hormonas.
3. Regulación transcripcional de las respuestas de defensa en plantas. Cascadas de
señalización en inmunidad de plantas. Compuestos reguladores en las señales de
defensa. Genes de defensa y elementos de respuesta en región de los promotores.
4. Biología de una interacción de susceptibilidad en planta. Anclaje del patógeno en
tejido vegetal. Emisión de efectores. Actividad enzimática contra estructuras de tejido
61


vegetal. Desarrollo de estructuras de penetración. Desarrollo de estructuras de
colonización. Características de la respuesta de defensa de la planta en susceptibilidad.
5. Biología de una interacción de resistencia en planta. Conceptos clásicos de la
resistencia: barreras preformadas, defensas inducidas. Genes de resistencia:
características y clasificación de los genes de resistencia, motivos de las proteínas R y
su función potencial. Genes de defensa: control transcripcional de los genes de defensa
ante patógenos, elementos de respuesta, participación de factores de transcripción.
Perfiles moleculares asociados a microorganismos y a microorganismos patógenos.
Activación de cascadas de señalización. Producción de proteínas relacionadas con la
patogénesis (proteínas PR). Rutas de biosíntesis de fitoalexinas. Respuesta de
hipersensibilidad.
6. Interacciones entre planta y hongos no patogénicos. Hongos endofíticos. Hongos
oportunistas simbióticos. Mecanismos de defensa inducidos por hongos no
patogénicos.
7. Activación de resistencia sistémica en tejido vegetal. Concepto de resistencia
sistémica. Señales moleculares de activación de resistencia sistémica. Utilidad
agrotecnológica de la resistencia sistémica en campo.
8. Particularidades de los microorganismos y desarrollo de la enfermedad.
Desarrollo de la enfermedad causada por hongos: razas de especies de hongos,
virulencia y avirulencia, mecanismos de variación genética, Transferencia horizontal
de genes, Elementos transponibles y micovirus. Desarrollo de la enfermedad causada
por bacterias: quorum sensing, expresión de genes, penetración del tejido vegetal,
Anclaje, Determinantes de especificidad, Función de plásmidos. Desarrollo de la
enfermedad causada por virus: estructura de los virus fitopatógenos, infección viral,
virus de RNA hebra positiva y hebra negativa, virus de RNA doble hebra, virus de DNA
hebra simple y de doble hebra.
9. Protocolos de transformación para protección de cultivos. Resistencia derivada de
patógenos: Resistencia mediada por proteína de cubierta de virus, resistencia mediada
por RNA, resistencia derivada de patógeno contra enfermedades por hongos y
bacterias. Sobre-expresión de genes de defensa. Vectores: vectores binarios y cepas
bacterianas A. tumefaciens y A. rhyzogenes
10. Prácticas de citología y biología molecular. Observación de estructuras de
fitopatógenos por microscopia en contraste de fase. Detección de fitopatógenos por
PCR simple para ITS. Detección de fitopatógenos por PCR multiplex para ITSs.
Detección de fitopatógenos por PCR a tiempo real para ITSs. Detección de respuestas
de defensa en tejido vegetal (HR, Especies oxígeno-activas, fase necrotrófica de
hongos).

Bibliografía:
• L.C. Van Loon and Jean-Claude Kader Eds. Advances in botanical Research: Plant
Immunity. Vol. 51. Academic Pres. USA. 2009.
• Kamal Bouarab, Norman Brisson. Molecular Plant-Microbe Interactions. CABI Pub.
USA. 2009.
• Matthew Dickinson. Plant Molecular Pathology. BIOS Scientific Pub. USA. 2003.
62


• Vidhyasekaran, P. Molecular Biology and Host Defense Mechanisms. Marcel Dekker,
Inc. USA. 2001.
• Nicholas Talbot. Plant-Pathogen interactions. Blackwell Pub. U.K. 2004.
• Robert Burns. Plant Pathology. Techniques and Protocols. Humana Press.UK. 2010.
• Michel Nicole and Vivienne Gianinazzi-Pearson. Hystology, Ultrastructure and
Molecular Cytology of Plant-Microorganism Interactions. Kluwer Academic Press. USA.
1997.

63


Bioinformática
___________________________________________________________________________
• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFB-2
___________________________________________________________________________
Descripción de la asignatura: Desde que Frederick Sanger determinó la secuencia de la

primer proteína a mediados de los cincuentas y desarrolló el método para secuenciar DNA a
mediados de los setentas, se inicia una nueva era en la Biología Molecular. Con la obtención de
las secuencias, surge la necesidad de que éstas sean analizadas y comparadas entre ellas, y
que la información generada sea almacenada de manera organizada, para lo cual se recurrió a
la informática, naciendo así la bioinformática. En las últimas décadas, la cantidad de
información generada debido a los grandes avances tecnológicos y científicos en biología
molecular y la naciente genómica es basta, por lo que es necesario el manejo de herramientas
bioinformáticas especializadas que nos permitan entender la complejidad existente en los
datos generados. La materia de formación básica está diseñada para aquellos investigadores
en formación que requieren tanto de las ciencias de la información como de la computación
para entender procesos biológicos. Se requiere que el aspirante tenga un conocimiento básico
de computación y biología molecular. Durante el curso se presentarán las metodologías y
herramientas bioinformáticas básicas y especializadas haciendo énfasis en los conceptos
básicos de biología molecular y evolución molecular que han sido usados para desarrollarlas.

Contenido:
• Introducción a la bioinformática y a los sistemas biológicos.

• Bases de datos.
• Búsqueda, comparación y análisis de datos.
• Biología estructural.
• Filogenia molecular.
• Temas selectos de bioinformática.

Índice temático:
1. Introducción a la bioinformática y a los sistemas biológicos. Organismos y

células, Las moléculas de la vida, Proteínas, El DNA, El RNA, Genes y genomas,
Transmisión de la información, Definición de bioinformática, Desarrollo y avances
de la bioinformática, Bioinformática y la internetBases de datos. NCBI – ENTREZ ,
GenBank, SwissProt, KEGG, JCVI, Expasy, String, Brenda, Metacyc, The Gene
Ontology Project.
64


2. Búsqueda, comparación y análisis de datos. Herramienta de predicción de
genes,Búsquedas por palabra, Búsquedas por similitud, Alineamientos de
secuencias, Búsquedas de motivos, Búsquedas de promotores, Identificación de
consensos.

3. Biología estructural. Predicción de estructura secundaria, Bases de datos de

estructuras, Predicción automática de la estructura terciaria, Visualización y
presentación de estructuras.

4. Filogenia molecular. Evolución y Filogenia molecular, Reconstrucción de
filogenias, Métodos de reconstrucción y modelos de sustitución.

5. Temas selectos de bioinformática. Omicas, Modelaje molecular, Acoplamiento
molecular, El arte de la programación, Uso de Perl, Bioperl, MySQL, Integración de
un servidor HTML, Aplicación de la bioinformática en temas biotecnológicos,
Aspectos futuros de la bioinformática.

Bibliografía básica:
• David W. Mount. (2007) Bioinformatics Sequence and Genome Analysis. 2 Ed. Cold
Spring Harbor laboratory Press.
• Lesk A. (2008) Introduction to Bioinformatics. Tercera edición. Oxford University
press. UK.
• Michael Agostino. (2012) Practical Bioinformatics. Garland Science.
• Artículos selectos de vanguardia en los diferentes temas.

Bibliografía complementaria:
• Andreas D. Baxevanis & B.F. Francis Ouellette. (2004) Bioinformatics, 3ed. Wiley-
Interscience.
• Pevsner J. (2009) Bioinformatics and Functional Genomics. Wiley-Blackwell.

65


Fisiología vegetal

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFB-3

Descripción de la asignatura: Las plantas y nosotros, compartimos un ancestro común, el

cual vivió hace tres billones de años. Después de divergir de nuestro linaje y del linaje de los
hongos, el ancestro de las plantas adquirió la capacidad de convertir la energía solar en
energía química incorporando bacterias fotosintéticas dentro de su célula. Esta capacidad de
fotosintetizar le permitió ocupar un nicho completamente diferente, pero altamente
compatible con el de nuestros ancestros y además cambiaron radicalmente las condiciones
bioquímicas de nuestro planeta. Con el devenir del tiempo adquirieron pluricelularidad y
radiaron para formar el grupo de las algas. Las plantas fueron los organismos pioneros en la
colonización del medio terrestre y prepararon las condiciones ecológicas para que tanto
animales como hongos colonizaran la tierra. Actualmente las plantas son un grupo muy
diverso y se encuentran en casi todos los ecosistemas de la tierra. Ellas son las productoras
primarias en todos los ecosistemas terrestres, todo el alimento que consumimos los animales
viene directa o indirectamente de su actividad fotosintética, además producen el oxígeno que
requerimos para respirar. Dentro de la Biología el entender el funcionamiento vegetal es un
campo altamente interesante y apasionante. Esta materia de formación básica está diseñada
para investigadores en formación, que sin tener antecedentes de fisiología vegetal, estén
interesados en conocer cómo las plantas surgieron, han evolucionado y funcionan en su
ambiente. Haciendo uso de herramientas de bioquímica, biología molecular, genómica y
fisiología clásica, el estudiante podrá entender de manera integral el funcionamiento de las
plantas tomando en cuenta su diversidad y su evolución, además, conocerá las últimas
tendencias de investigación en esta área.

Contenido:
• Introducción a la biología vegetal.

• Transporte y translocación de agua y solutos.
• Metabolismo.
• Crecimiento y desarrollo vegetal.
• Desarrollo reproductivo.
• Reguladores del crecimiento vegetal.

Índice temático:
66


1. Introducción a la biología vegetal. Conceptos básicos de morfología y anatomía
vegetal. Conceptos básicos de sistemática y taxonomía. Origen y evolución de las
plantas. Ciclos de vida. Diversidad vegetal.
2. Transporte y translocación de agua y solutos. Componentes del transporte.
Membrana celular. Pared celular. Propiedades del agua. Toma de agua. Transporte de
solutos a través de membranas.
3. Metabolismo. Fotosíntesis. Translocación vía floema. Respiración y metabolismo de
lípidos. Asimilación de nutrimentos minerales. Metabolitos secundarios.
4. Crecimiento y desarrollo vegetal. Ciclo celular. Expansión celular. Desarrollo
embrionario. Desarrollo postembrionario.
5. Desarrollo reproductivo. Desarrollo floral. Mitosis y Formación de Gametos.
Germinación del polen. Autoincompatibilidad. Fertilización y análisis genético.
Formación de la semilla.
6. Reguladores del crecimiento vegetal. Auxinas. Giberelinas. Citocininas. Etileno.
Ácido abscísico. Brasinoesteroides. Ácido jasmónico. Ácido salicílico.
7. Prácticas de fisiología vegetal. Técnicas de microscopia. Análisis del desarrollo
embrionario usando mutantes en la señalización de reguladores de crecimiento.
Análisis del postembrionario usando líneas transgénicas marcadoras de ciclo celular,
respuesta a reguladores de crecimiento y toma de nutrimentos.

• Lincoln Taiz, Eduardo Zeiger (2010) Plant physiology. Quinta edición. Sinauer
Associates. 782 pp.
• Peter H. Raven, Ray F. Evert y Susan E. Eichhorn (2005) Biology of plants. Séptima
edición. W.H. Freeman and Company. 683 pp.

• Bob B. Buchanan, Wilhelm Gruissem, and Russell L. Jones (2006) Biochemistry &
Molecular Biology of Plant. American society of plant Biologist. 1367 pp.
• The Arabidopsis Book, publicación en línea http://www.bioone.org/loi/arbo.j

67


Biología del estrés abiótico y biótico en planta e intercomunicación

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFB-4

Descripción: de la asignatura: Las plantas se han adaptado a las diferentes formas de estrés
biótico y abiótico impuesto por el medio ambiente, el cual es frecuentemente adverso. Al
censar el estrés, las plantas inducen una cascada de señales que activan canales iónicos,
cascadas de quinasas, producción de especies oxígeno reactivas, acumulación de hormonas
tales como el ácido salicílico, etileno, ácido jasmónico y ácido abscísico. Estas señales
finalmente inducen la expresión de una colección de genes que conllevan al ensamble de la
reacción global de defensa. Los genes de defensa en las especies vegetales son activados
transcripcionalmente por patógenos, por diferentes formas de estrés ambiental, e incluso, la
inducción de genes de defensa específicos en respuesta ante ciertos patógenos, son
dependientes de condiciones de humedad y temperatura muy particulares, sugiriendo la
existencia de un sistema complejo de señalamiento que permite a la planta reconocer y
protegerse así misma contra patógenos y contra estrés abiótico. Así entonces, los
componentes de las vías de señalización son compartidos por diferentes rutas de
señalamiento ante estrés, de tal manera que las respuestas de las plantas a estrés biótico y
abiótico comúnmente se traslapan. Además, no es raro que las cascadas de señalamiento
activadas actúen vía acciones sinergistas o antagonistas.
Los intrincados y finamente sintonizados mecanismos moleculares activados en plantas, en

respuesta ante factores ambientales tanto bióticos como abióticos, aún no son bien
entendidos y menos se conoce acerca de las señales integrativas y puntos de convergencia en
diferentes grupos de reacciones parcialmente traslapantes. Las herramientas moleculares
nuevas incluyendo el análisis de transcriptomas y proteomas, secuenciación de genomas
enteros, análisis bioinformáticos y estudios funcionales, permitirán la disección de más
componentes de los sistemas como factores clave en las respuestas de defensa en general al
estrés biótico y abiótico, y en la intercomunicación de las cascadas de señalización ante estas
formas de estrés.
Índice temático:
1. Introducción.
2. Calcio (Ca2+) y especies oxígeno reactivas (EOR) y óxido nítrico (ON). Calcio como
segundo mensajero en respuestas ante estrés abiótico y biótico. Explosión oxidativa y
68


especies oxígeno reactivas como segundos mensajeros. Óxido nítrico como segundo
mensajeros. Intercomunicación entre Ca2+, EOR y ON en reacciones de respuesta ante
estrés ambiental.
3. Proteínas kinasas dependientes de calcio (CDPKs) y proteínas quinasas
activadas por mitógeno (MAPKs). Proteínas quiinasas dependientes de calcio
(CDPKs). Proteínas quinasas activada por mitógeno (MAPKs). Intercomunicación
entre CDPKs y MAPKs en las respuestas de defensa en plantas ante estrés abiótico y
biótico.
4. Intercomunicación entre las rutas genéticas en respuesta a estrés abiótico y
biótico.
5. Fitohormonas y función central en señalamiento en la respuesta ante estrés
abiótico y biótico. Ácido salicílico. Etileno. Ácido jasmónico. Ácido abscísico. Sistemas
de señalización por fitohormonas. Ácido abscísico en la intercomunicación en
respuestas ante estrés abiótico y biótico.
6. Factores WRKY y otros factores de transcripción en respuesta ante estrés
abiótico y biótico. Factores de transcripción. Factores de transcripción de la familia
WRKY.
7. Regulación de la expresión de genes de defensa ante estrés. Características
estructurales de los genes de defensa ante estrés. Particularidades en los elementos de
respuesta en región de los promotores. Co-inducción de genes de defensa por diversos
factores ambientales adversos.
8. Herramientas para la búsqueda de genes de tolerancia a estrés abiótico y biótico
en plantas.
9. Prácticas de biología molecular. Detección de co-inducción de genes por estrés
abiótico y biótico por reacción RT-PCR simple y multiplex. Detección de co-inducción
de genes por estrés abiótico y biótico por reacción PCR en tiempo real. Detección de
co-inducción de genes por estrés abiótico y biótico por técnica de northern blot.

Bibliografía:
• Signal Crosstalk in Plant Stress Responses. Wiley-Blackwell Eds. USA. 2009.

• Frans Maathuis. Ion Channels and Plant Stress Responses (Signaling and
Communication in Plants). Springers. USA. 2010.
• Heribert Hirt and Kazuo Shinozaki. Plant Responses to Abiotic Stress (Topics in
Current Genetics) Springer. USA. 2003.
• Matthew A. Jenks and Andrew J. Wood. Genes for Plant Abiotic Stress. Wiley-Blackwell
Eds. USA. 2010.
• Selección de paquete de artículos científicos de actualidad.

69


Biología molecular

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFB-5

Descripción de la asignatura: Con los estudios pioneros de Avery, MacLeod y McCarty,

acerca de la naturaleza química del material genético y con la descripción de la estructura del
ADN por Watson y Crick a mediados del siglo pasado, surge la biología molecular. Con el
devenir del tiempo y los nuevos descubrimientos como las enzimas de restricción, la reacción
en cadena de la polimerasa (PCR) y la secuenciación del los ácidos nucleicos, han permitido
que esta disciplina sea uno de los puntales mayores de la biología.
El curso de biología molecular está dirigido a estudiantes de doctorado interesados en

el entendimiento y estudio de los genes y cómo estos se regulan, haciendo énfasis en vegetales
como modelo de estudio. Este curso se enfocará en el entendimiento de los conceptos y
mecanismos básicos de biología molecular con mayor atención en las peculiaridades que las
plantas presentan. También discutiremos y llevaremos a la práctica las técnicas y tecnologías
de vanguardia que se están usando para el análisis molecular de eventos fisiológicos
presentes en las plantas. El curso sirve de inducción para los interesados en hacer
investigación en las líneas encaminadas a entender las bases moleculares de la adaptación de
las plantas a estrés biótico y abiótico.

Contenido:
• Introducción a la Biología Molecular.

• La dinámica del DNA.
• Del RNA a las Proteínas.
• Epigenética.
• El genoma.

Índice temático:
1. Introducción a la Biología Molecular. Descubrimiento del material genético. Del

gen a los genomas.
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2. La dinámica del DNA. Propiedades Físico-químicas del DNA. Principales tipos de
ADN en eucariotes. Topología del ADN. Empaquetamiento del ADN. Replicación en
eucariotas y procariotas. Reparación de DNA.
3. Del RNA a las proteínas. Flujo de la información génica. Estructura y tipos de RNA.
Transcripción en procariote y eucariotes. Eventos post-transcripcionales del RNA
mensajero. Regulación transcripcional de la expresión génica. Traducción en
procariotes y eucariotes. Regulación post-transcripcional de la expresión génica.
4. Epigenética. Procesos epigenéticos. Definición y bases moleculares de la impronta
genómica, efecto materno y paramutación.
5. El genoma. Dinámica del genoma. Genómica funcional. Genómica comparativa.
6. Prácticas de biología molecular. Preparación y análisis de DNA y RNA. Reacción en
cadena de la polimerasa (PCR). Análisis de secuencias in silico y diseño de iniciadores.
Análisis de expresión genética (RT-PCR tiempo final y tiempo real). Expresión de una
proteína heteróloga en eucariotes.

• Lewins B. Krebs, JE. Goldstein, ES. Kilpatrick, ST. (2011) Lewin’s genes X . Decima
Edición Oxford University. Press, Oxford. 930 pp.
• Weaver RF (2011) Molecular Biology. Quinta edición McGraw-Hill.

• Sambrook J. (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Tercera Edición. Tres

tomos Third Edition.
• Watson, Hopkins, Roberts, Steitz and Weiner, Molecular Biology Of The Gene sexta
edición. The Benjamin/Commings Publishing Company Inc.

71


Biodiversidad

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFB-6
• Materia asociada a la Línea de investigación: BEB

Descripción de la asignatura: El término Biodiversidad (o Diversidad biológica) incluye la

variabilidad de los organismos, al menos en tres niveles. Estos niveles son la variabilidad a
nivel de genes, de especies y de ecosistemas. El objetivo del curso es conocer y entender los
conocimientos acerca de estos tres niveles para valorar la importancia de la biodiversidad
desde el punto de vista evolutivo y social.
Al finalizar el curso, el estudiante tendrá un conocimiento general de qué es la biodiversidad,

la manera en la que es medida, su importancia y las diferentes formas en que los humanos la
aprovechan y modifican. Se discutirán patrones históricos de la Biodiversidad, patrones
actuales y se estudiaran casos particulares que ejemplifican el uso, aprovechamiento y
repercusión de las actividades humanas.
Índice temático:
1. Introducción a la biodiversidad. Definición. Historia del concepto. Uso del término

biodiversidad. Niveles de Biodiversidad: genes, especies y ecosistemas. Evolución
histórica de la biodiversidad. La Biodiversidad actual. Valores de la biodiversidad
(directo, indirecto, estético, intrínseco).
2. Medición de la biodiversidad. Diversidad genética, alfa, beta y gamma. Distribución
actual de la biodiversidad en el planeta.
3. Patrones actuales de la biodiversidad. Patrones taxonómicos regionales: Florísticos
y faunísticos. Especies invasoras. Patrones geográficos globales. Biodiversidad de
México.
4. Factores actuales que amenazan la biodiversidad. La humanidad y la
biodiversidad: aprovechamiento y servicios de los ecosistemas. Conocimiento,
monitoreo, leyes y reglamentos. Educación, conservación in-situ y exsitu.

72


• Bryant, P. J. Biodiversity and Conservation, A Hypertext Book. School of Biological

Sciences, University of California, Irvine.
• Conabio, 1998. La diversidad biológica de México: Estudio de País, 1998. Comisión
Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad. México.
• Conabio, 2000. Estrategia nacional sobre biodiversidad de México. Comisión Nacional
para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, México.
• Conabio. 2008. Capital natural de México, vol. I: Conocimiento actual de la
biodiversidad. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad,
México.
• Conabio. 2008. Capital natural de México, vol. III: Políticas públicas y perspectivas de
sustentabilidad. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad,
México
• Conabio. 2009. Capital natural de México, vol. II: Estado de conservación y tendencias
de cambio. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, México.
• Gaston, K. J. & J. I. Spicer. 2004. Biodiversity: An introduction. Second Edition.
Blackwell Publishing. Malaysia.
• Gaston, K. J. 2003. The structure and dynamics of geographic ranges. Oxford University
Press.
• Hernández, H. M. et al (Compiladores). 2001. Enfoques contemporáneos para el
estudio de la biodiversidad. UNAM-FCE.
• La Biodiversidad en Aguascalientes: Estudio de Estado. 2008. Comisión Nacional para
el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO), Instituto del Medio Ambiente
del Estado de Aguascalientes (IMAE), Universidad Autónoma de Aguascalientes (UAA).
México.
• Lomolino, M. V., and L. R. Heaney. (Editors). 2004. Frontiers of Biogeography. Sinauer
Associates, Inc.
• Lomolino, M. V., B. Riddle. y J. H. Brown. 2006. Biogeography. Tercera Edición. Sinauer
Associates, Inc. Publishers. Sunderland, USA.
• Maclaurin, J. & K. Sterelny. 2008. What is biodiversity? The University of Chicago
Press.
• Maczulak, A. E. 2010. Biodiversity: Conserving Endangered Species. Green Technology.
• Magurran, A.E., y B. J. McGill. 2011. Biological Diversity: Frontiers in Measurement
and Assessment. Oxford University Press
• Ruiz, M. G., y J. T. Carlton. 2003. Invasive Species: Vectors and Management Strategies
• Sarukhán, J., et al. 2009. Capital natural de México. Síntesis: conocimiento actual,
evaluación y perspectivas de sustentabilidad. Comisión Nacional para el Conocimiento
y Uso de la Biodiversidad, México.
• Zachos, F. E. y J. C. Habel. 2011. Biodiversity Hotspots: Distribution and Protection of
Conservation Priority Areas. Springer.

73


Biogeografía

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: Sistemática biológica
• Clave: AFB-7

Descripción de la asignatura:
La biogeografía es la disciplina que estudia la distribución de los seres vivos en el espacio y a

través del tiempo. Sus objetivos principales son describir y comprender los patrones de
distribución geográfica de las especies y taxones supraespecíficos. Dentro de este curso se
revisara el panorama general de los métodos que sustentan el estudio de la distribución
geográfica de la diversidad biológica, a través de las diferentes corrientes de pensamiento de
esta disciplina, con énfasis en la biogeografía histórica. El alumno tendrá un conocimiento
general de las principales corrientes de pensamiento, métodos de análisis, terminología,
conceptos básicos y literatura. Finalmente, reconocerá de manera general los procesos y
patrones de la distribución de los seres vivos en el espacio y el tiempo.
Índice temático:
1. Introducción. Definición, objeto de estudio y subdivisiones de la biogeografía.

Unidades en biogeografía. Concepto de homología en biogeografía. Patrones y
procesos en biogeografía. Historia de la biogeografía y tendencias actuales.
2. Biogeografía ecológica. Teoría de refugios pleistocénicos. Biogeografía de islas y la
conservación de áreas naturales. Biogeografía cuantitativa y métodos de análisis.
Macroecología.
3. Áreas de distribución y áreas de endemismo. Áreas de distribución geográfica y
métodos. Bio-georeferenciación y modelaje de nichos ecológicos. Áreas de endemismo
y métodos de identificación.
4. Regionalización biogeográfica y provincias bióticas. Regionalización.
Regionalización del mundo, América Latina y el Caribe. Regionalización en México.
Aplicación de la regionalización biótica en la conservación.
5. Dispersalismo, biogeografía filogenética y panbiogeografía. Biogeografía
dispersionista y criterios para la determinación de centros de origen. Conceptos
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básicos del dispersalismo. Conceptos básicos de biogeografía filogenética.
Filogeografía. Bases conceptuales de la panbiogeografía. Conceptos básicos y métodos
de la panbiogeografía. La panbiogeografía en la conservación de áreas naturales.
6. Biogeografía cladística. Bases conceptuales de la biogeografía cladística. Cladograma
taxonómico de áreas. Cladogramas resueltos de áreas. Supuestos 0, 1 y 2. Cladograma
general de áreas. Métodos cladísticos. La biogeografía cladística conservación de áreas
naturales.

• Cox, C. B., and P. D. Moore. 2000. Biogeography. An ecological and evolutionary

approach. 6th ed. Blackwell, Oxford.
• Crisci J. V., L. Katinas, and P. Posadas. 2003. Historical Biogeography. Harvard
University Press. Cambridge, Massachusetts. London England. 250pp.
• Llorente, J. y J.J. Morrone (eds.). 2001. Introducción a la Biogeografía en América
Latina: Teorías, conceptos, métodos y aplicaciones. Las Prensas de Ciencias, Facultad
de Ciencias. UNAM. México, D.F. 277 p.
• Llorente, J. y J.J. Morrone (eds.). 2003. Una perspectiva Latinoamericana de la
Biogeografía. Las Prensas de Ciencias, Facultad de Ciencias. UNAM. México, D.F. 307 p.
• Lomolino, M. V., B. R. Riddle, and J. H. Brown. 2006. Biogeography. 3ª ed. Sinauer.
Associates Inc. Publishers, Sunderland, Massachusetts
• Morrone, J. J. 2003. El lenguaje de la cladística, Programa Libro de Texto Universitario,
Dirección General de Publicaciones y Fomento Editorial, UNAM,, México, D.F.
• Morrone, J. J. 2004. Homología biogeográfica: Las coordenadas espaciales de la vida.
Cuadernos del Instituto de Biología 37. 199 p.
• Morrone, J. J. 2009. Evolutionary Biogeography: An Integrative Approach with Case
Studies. Columbia University Press. 304pp.
• Morrone, J. J. y T. Escalante. 2009. Diccionario de biogeografía. Las prensas de
Ciencias. México, D. F. 230 p.
• Parenti, L. R., and M. C. Ebach. 2009. Comparative biogeography. University of
California Press. 312pp.
• Zunino, M. y A. Zullini. 2003. Biogeografía: La dimensión espacial de la evolución.
Fondo de Cultura Económica. Sección de Ciencia y Tecnología. México D.F. 359 p.

75


Evolución biológica
________________________________________________________________________________
• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFB-8

Descripción de la asignatura: Explorar los patrones y los procesos evolutivos que producen
la diversidad biológica que existe en el planeta. Al finalizar el curso, el estudiante tendrá una
comprensión general de la manera en la que la diversidad biológica ha evolucionado hasta
nuestros días. Se revisará el significado y la historia de la evolución biológica, así como sus
patrones y procesos. Se revisaran temas básicos como la evolución por medio de selección
natural, la historia geológica del planeta, la manera de organizar la diversidad biológica,
genética evolutiva, adaptación, especiación, extinción y macroevolución.
Índice temático:
1. Introducción a la evolución. Evolución. Síntesis evolutiva. Evolución como un hecho

y como teoría. Clasificación y filogenia. Origen de la vida. El registro fósil.
2. Mecanismos evolutivos. Introducción a la Genética de poblaciones, flujo génico,
mutación, deriva génica. Selección natural. Especies y especiación. Éxito reproductivo
(fitness). Evolución de genes y genomas.
3. Macroevolución. Tasas de evolución. Extinción. Gradualismo y equilibrio puntuado.
Ontogenia y Filogenia.
4. Temas evolutivos selectos. Evolución humana. Evolución del parasitismo,
Adaptación, Coevolución.

• Brooks and D. A. McLennan. 1993. Parascript: Parasites and the language of evolution.
Smithsonian Institution Press, Washington, D.C.
• Brooks, D. R. and D. A. McLennan 2002. The Nature of Diversity. Chicago: Univ. Chicago
Press, 668 p.
• Futuyma, D. J. 2005. Evolutionary Biology, 3rd edition. Sinauer, Sunderland, Mass.
76


• Kardong, K. V. 2003. Vertebrados 4th ed. Anatomía comparada, función y evolución.
McGraw-Hill Interamericana.
• Minelli, A. 2009. Perspectives in animal phylogeny and evolution, Oxford University
Press, Oxford.
• Núñez-Farfán, J. y L. E. Eguiarte, eds. 1999. La evolución biológica. , UNAM. , México
D.F, 457 p.
• Page R. D. M. and E. C. Holmes. 1998. Molecular evolution: A phylogenetic approach.
Blackwell, Oxford.
• Pough, F. H., J.B. Heiser, and W.N. Mcfarland. 2008. Vertebrate life 8th ed. Prentice Hall
International.
• Randall, D. J., W. W. Burggren, et al. 1997. Eckert animal physiology: mechanisms and
adaptations. New York, W. H. Freeman and Co.
• Ridley, M. 2004. Evolution 3rd ed. Oxford readers. Oxford University press.
77


Ecología

• Semestre recomendado: 1, 2 ó 3
• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio:6
• Requisitos: ninguna
• Clave: AFB-9

Descripción de la asignatura: Revisar los conceptos generales de la ciencia de la ecología, o

el estudio de los organismos y el ambiente que habitan, para explicar la manera en las que
esta disciplina es importante para la conservación de los componentes natural y las relaciones
entre ellos, y de manera última, de nuestro planeta. El estudiante comprenderá los diferentes
niveles de organización del planeta: poblaciones, comunidades y ecosistemas, y conocerá las
relaciones entre los factores bióticos y abióticos en el ecosistema. Se presentará la aplicación
de la ecología en los niveles revisados con la finalidad de complementar la revisión teórica y
demostrar la importancia de esta disciplina en el desarrollo científico y en la conservación de
los recursos naturales del planeta.
Índice temático:
1. El estudio de la ecología. ¿Qué es la ecología? Recursos. Temperatura. Agua. Energía

y nutrientes. Historias de vida. Competencia intraespecífica. Aplicaciones de la
ecología al nivel de organismos.
2. Ecología de poblaciones. Genética de poblaciones. Distribución y abundancia.
Dinámica de poblaciones. Competencia interespecífica. Predación. Descomponedores y
detritívoros. Mutualismo. Aplicaciones de la ecología de poblaciones.
3. Ecología de comunidades y ecosistemas. Abundancia y diversidad de especies.
Interacciones entre especies y estructura de las comunidades. Producción primaria y
flujo de energía. Ciclos de nutrientes. Redes tróficas. Aplicaciones de la ecología de
comunidades y ecosistemas
4. Ecología por arriba del nivel de ecosistemas. Ecología del paisaje. Ecología
geográfica. Macroecología. Ecología global. Aplicaciones de la ecología de gran escala.

78


• Campbell, N. A. and J. B. Reece. 2005. Biology 7th ed. Benjamin/Cummings Publishing
Company, Menlo Park, CA. or 2002 6th edition
• Cain, M. L., Bowman, W. D., and S. D. Hacker. 2008. Ecology. Sinauer Associated, Inc.,
Sunderland, MA.
• Gotelli, N .J. 2001. A Primer of Ecology. 3rd ed. Sinauer Associates, Inc. Sunderland, MD,
U.S.A.
• Krebs, C. J. 2007. Ecology: The Experimental Analysis of Distribution and Abundance:
Hands-On Field Package (5th Edition) Hardcover: 608 pages. Benjamin-Cummings.
• Molles, M. C. Jr.1999. Ecology: Concepts and Applications 1st Edition, WCB/McGraw-
Hill. Boston.
• Molles, M. C. Jr.2006. Ecology:Concepts and Applications 3rdEdition,McGraw-Hill Co.
• Odum, E. P. 1971. Fundamentals of Ecology 3rdEdition ,W. B. Saunders Company.
• Smith, R. L., T. M. Smith, Graham C. Hickman, and S. M. Hickman. 2006. Elements of
Ecology (5th Edition) by, Paperback: 682 pages. Benjamin-Cummings

79


Sistemática biológica

• Semestre recomendado: 1
• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio:6
• Requisitos: ninguna
• Clave: AFB-10
• Asignatura: básica

Descripción de la asignatura: Introducir a los estudiantes en aspectos generales de la

historia de las ideas, teoría y metodología de la sistemática biológica, por medio de la
exposición, discusión de los conceptos y terminología en la reconstrucción filogenética y
clasificación. Examinar los fundamentos de las principales escuelas de sistemática biológica.
El alumno al final el curso tendrá un conocimiento general de panorama histórico, reconocerá
sus principales corrientes de pensamiento (Fenética, Evolutiva y Cladista) y métodos de
análisis, así como su terminología, conceptos básicos y literatura.
Índice temático:
1. Introducción a la sistemática biológica. Breve historia de la sistemática. Relación de

la sistemática con otras disciplinas. Taxon (taxa), categorías taxonómicas, jerarquía y
rango taxonómico. Taxonomía alfa, beta y gamma. Actividades de los taxónomos.
2. Conceptos de especie y las escuelas de sistemática. Breve historia de la sistemática.
Relación de la sistemática con otras disciplinas. Taxon (taxa), categorías taxonómicas,
jerarquía y rango taxonómico. Taxonomía alfa, beta y gamma. Actividades de los
taxónomos.
3. Concepto básicos. Carácter y estado de carácter. Tipos de caracteres: morfológicos,
ecológicos, moleculares, etc. Tipo de caracteres y codificación de caracteres.
Transformación entre caracteres. Filogenia, homología, homoplasia, grupos
monofiléticos, parafiléticos y polifiléticos, monofilia, cladograma, grupo interno, grupo
externo, grupos naturales y artificiales, nodo, raíz, etc. Homoplasia.
4. Reconstrucción de cladogramas: sistemática filogenética. Homología y el principio
de Parsimonia. Pasos de un análisis cladístico. Construcción de cladogramas. Técnicas
básicas en la reconstrucción. Criterios de optimización. Tipos de búsquedas. Medidas
de ajuste de los caracteres. Tipos de consenso. La comparación con el grupo externo.
Pesado de caracteres. Sistemática filogenética y la conservación. Construcción de
árboles por medio de algunas herramientas bioinformáticas.
80


5. Clasificación, taxonomía filogenética y colecciones. Jerarquía Linneana.
Transformar un cladograma en una clasificación cladística: Subordinación y
Secuenciación. Clasificación y reglas de clasificación filogenética. Códigos de
nomenclatura biológica. Elementos del nombre científico. Nomenclatura taxonómica y
tipos. Literatura taxonómica. Describiendo especies. Uso de claves de identificación.
Colecciones biológicas. Jardines Botánicos y zoológicos. Colecciones y biodiversidad.
Sistemática, conservación y biodiversidad
6. Generalidades de la sistemática molecular. Caracteres moleculares. Genes
ortólogos, parálogos y xenólogos. Los marcadores y métodos de reconstrucción
filogenética empleando caracteres moleculares. Cladogramas de genes y de especies.
Breve explicación de los métodos: distancia, parsimonia y máxima verosimilitud.

• Avise, J. C.2004. Molecular markers, natural history and evolution. Sinauer Associates
, Inc. Publishers. 2nd Edition. 684pp.
• Avise, J.C. 2000. Phylogeography. The history and formation of species. Harvard
University Press. USA.
• Brooks, D. R. and D. A. McLennan. 1991. Phylogeny, Ecology, and Behavior. A Research
Program in Comparative Biology. The University of Chicago Press.
• Brooks, D.R., J.N. Caira, T.R. Platt, and M.R. Pritchard. 1982. Principles and methods of
phylogenetic systematics workbook. University of Kansas, Museum of Natural History.
• Eldredge, N. y J. Cracraft. 1980. Phylogenetic patterns and the evolutionary process.
Columbia University Press, New York.
• Forey, P. L., C. J. Humphries, I. L Kitching, R. W. Scotland, D. J. Siebert y D. M. Wiiliams.
1992. Cladistics. A practical course in systematics. The Systematics Association,
Publicación No. 10.
• Hennig, W. 1966. Phylogenetic Systematics. University of Illinois Press. 263 pp.
• Hillis, D. M., Moritz, C. and B. Mable (Eds.) 1996. Molecular Systematics. Second
Edition. Sinauer Associates, Inc. Publ. Sunderland Massachusetts, USA. 655 pp.
• Howard, D. J. and S. H. Berlocher (eds) 1998. Endless Forms: Species and Speciation.
Oxford University Press, New York, New York. 470 pp.
• Humphries, C.J., Parenti, L.R., and C. J. Humphries, C.J. 1999. Cladistic Biogeography:
Interpreting Patterns of Plant and Animal Distributions. Oxford University Press,
Oxford.
• Kitching, I.A., Forey, P.L, Humphries, C.J, and D. M. Williams. 1998. Cladistics: The
Theory and Practice of Parsimony Analysis. Oxford University Press Inc., New York.
• Lee, W. L., B. M. Bell y J. F. Sutton (eds.). 1982. Guidelines for acquisition and
management of biological specimens. Association of Systematic Collections, Lawrence.
• Lipscomb, D. 1998. Basic Cladistic analysis. Washington D. C. George Washington
University.
81


• Llorente, J. B. 1990. La búsqueda del Método Natural. No. 95 en Colección La Ciencia
desde México. Fondo de Cultura Económica. México. 160pp.
• Llorente, J. e I. Luna (eds.). 1994. Taxonomía biológica. Fondo de Cultura Económica-
UNAM, México, D.F.
• Mayr, E. 1942. Systematic and the origin of species. New York. Columbia University
Press.
• Mayr, E. y P. Ashlock. 1991. Principles of systematic zoology. McGraw-Hill, Nueva York.
• Morrone, J. 2000. El lenguaje de la cladistica. 1ª. Edición. Dirección General de
Publicaciones y Fomento editorial, UNAM, México. D. F. 109 pp.
• Morrone, J. 2001. Sistemática, Biogeografía y Evolución. Los patrones de la diversidad
en tiempo-espacio. Las prensas de Ciencias, UNAM. Facultad de Ciencias, UNAM.
124pp.
• Nelson, G. y N. Platnick. 1981. Systematics and biogeography: Cladistics and
vicariance. Columbia University Press. New York. 567pp.
• Page, R. and E. C. Holmes. 1998. Molecular Evolution. A phylogenetic approach.
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• Panchen, A.L. 1992. Classification, evolution and the nature of biology. Cambridge
University Press, Cambridge.
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• Schuh, R. T. 2000. Biological systematics: Principles and applications. Comstock
Publishing Associates, Cornell University Press, Ithaca y Londres.
• Simpson, G. G. 1961. Principles of Animal Taxonomy. Columbia Univ. Press., New York,
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• Sokal, R. R., and P. H. Sneath. 1963. Principles of numerical taxonomy. W. H. Freeman
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• Soltis D. E., Soltis, P. S. y Doyle, J.J. 1998. Molecular systematics of plants II DNA
sequencing. Kluwer Academic Press. USA.
• Wheeler, Q. D., and R. Meier (eds). 2000. Species concepts and phyylogenetic theory.
• Wiens, J.J. 2000. Phylogenetic analysis of morphological data. Smithsonian Institution
Press.
• Wiley, E. 1981. Phylogenetics: The theory and practice of phylogenetic systematics.
John Wiley and Sons Inc. New York. 439pp.
• Wiley, E. O., D. Siegel-Causey, D. R. Brooks and V. A. Funk. 1991. The compleat cladist:
A primer of phylogenetic procedures. Kansas. University of Kansas Museum of Natural
History. No. Special 19: 1-158pp.
• Winston, J.E. 1999. Describing species: Practical taxonomic procedure for biologists.

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Detección de la radiación nuclear

§ Número de créditos: 12
§ Semestre recomendado: 1 ó 2
§ Horas a la semana: 16
§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: Ninguno.
§ Clave: AFB-11
§ Asignatura: Básica
§ Materia asociada a la Línea de investigación: CN

Descripción de la asignatura: Los sistemas y dispositivos para la detección de la radiación

nuclear, han experimentado un desarrollo paralelo al desarrollo de la tecnología ya que el
estado del arte en electrónica, computación y materiales, se ha incorporado en las
innovaciones de estos sistemas. Partiendo del concepto del detector básico y su aplicación a
las diferentes radiaciones nucleares, con energías menores a los 20 MeV, se desarrollan los
conceptos y modelos fundamentales que permiten estudiar las características de operación de
los dispositivos e instrumentos utilizados para la detección de la radiación nuclear y de los
mecanismos de interacción en los que basan su funcionamiento para desarrollar la capacidad
de seleccionar y operar el sistema de detección apropiado para determinar las propiedades de
los distintos campos o fuentes de radiación.
Contenido:
• Errores estadísticos en el conteo de radiación nuclear.

• Principios de física atómica y nuclear.
• Pérdida de energía y penetración de la radiación en la materia.
• Detectores gaseosos.
• Detectores de centelleo.
• Detectores de estado sólido.
• Espectrometría de radiación nuclear.
• Electrónica nuclear.
• Espectrometría de rayos x y rayos gamma.
• Espectrometría de partículas cargadas.
• Detección y espectrometría de neutrones.

Índice temático:
1. Introducción a la medición de la radiación. ¿Qué es la Radiación Nuclear?.

Naturaleza estadística de la radiación. Tipos de errores, error y precisión de las
mediciones. Instrumentación nuclear
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2. Errores estadísticos en el conteo de radiación nuclear. Definición de probabilidad.
Teoremas básicos de probabilidad. Distribuciones de probabilidad y variables
aleatorias. Propagación de errores. Actividad mínima detectable.
3. Principios de física atómica y nuclear. Elementos de Cinemática Relativista. Energía de
amarre y niveles energéticos de átomos y núcleos. Energía y leyes del decaimiento
radioactivo. Reacciones nucleares.
4. Pérdida de energía y penetración de la radiación en la materia. Mecanismos de pérdida
de energía para partículas cargadas. Poder de frenado por ionización y excitación.
Cálculo de dE/dx para compuestos o mezclas. Rango de las partículas cargadas.
Interacción de partículas neutras y fotones.
5. Detectores gaseosos. Mecanismos de interacción, colección de carga y alto voltaje.
Tipos de detectores con gas. Cámara de ionización, detector proporcional, Geiger
Mueller. Detectores de flujo.
6. Detectores de centelleo. Centelladores inorgánicos. Centelladores orgánicos.
Centelladores gaseosos. Relación entre altura de pulso, energía depositada y tipo de
radiación. Tubos fotomultiplicadores. Guías de luz.
7. Detectores de estado sólido. Clasificación eléctrica de los sólidos. Semiconductores. La
unión p-n. Tipos y características de los detectores semiconductores. Daño por
radiación a los detectores semiconductores.
8. Espectrometría de radiación nuclear. Efectos geométricos. Efectos de fuente. Efectos
de detector. Eficiencia absoluta y relativa. Espectro de altura de pulsos (energía).
Espectro integral y espectro diferencial. Resolución. Función de respuesta. Proceso de
calibración.
9. Electrónica nuclear. Circuito diferenciador e integrador. Líneas de retraso de los
pulsos. Sincronización. Mediciones en coincidencia y en anticoincidencia.
Discriminación por la forma del pulso. Preamplificadores. Amplificadores. Convertidor
análogo a digital. Monocanal y multicanal.
10. Espectrometría de rayos x y rayos gamma. Modos de deposición de energía.
Eficiencias. Detección de fotones con el cristal de NaI(Tl). Detección de fotones con el
NE213. Detección de rayos x con un contador proporcional. Detección de gammas con
un HPGe. Detector de Si(Li). Detección de rayos x con un espectrómetro de cristal.
11. Espectrometría de partículas cargadas. Dispersión (straggling) de energía.
Espectroscopia de electrones. Espectroscopia de protones, alfas, deuterones.
Espectrómetro de centelleo líquido. Espectrómetro de tiempo de vuelo. Detectores
telescopio. Espectrómetros magnéticos y electrostáticos. Detectores sensibles a la
posición.
12. Detección y espectrometría de neutrones. Detección por reacción (n, partícula
cargada). Cámara de fisión. Laminillas de activación. Espectroscopia por reculamiento
de protones. Detección de neutrones rápidos.

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• N. Tsoulfanidis and S. Landsberger, Measurement and Detection of Radiation, Third

Edition, CRC Press, 2010.
• G.F. Knoll; Radiation Detection and Measurement, John Wiley & Sons, Third Edition,
2000.
• G. Guilmore, Practical Gamma Ray Spectrometry, Second Edition, Wiley, 2008.

Bibliografía complementaria
• Krzysztof Iniewski ed., Electronics for Radiation Detection, CRC Press, 2011.
• Gerhard Lutz, Semiconductor Radiation Detectors, Springer. 2nd Print, 2007

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Física nuclear

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Clave: AFB-12

Descripción de la asignatura: Es la rama de la física aplicada, surgida tras el descubrimiento

de la radiactividad, que se ocupa de la caracterización de los núcleos atómicos y las
radiaciones emitidas por éstos. En un contexto más amplio, se define la física nuclear y física
de partículas como la rama de la física que estudia la estructura fundamental de la materia y
las interacciones entre las partículas subatómicas. Su desarrollo se apoyó fundamentalmente
en la física moderna y particularmente de la Mecánica Cuántica, así como en la Teoría
Electromagnética. Rápidamente adquirió el carácter de disciplina formal. En esencia es de
carácter teórico-experimental.
Contenido:
• Carga del núcleo atómico.

• Radiactividad.
• Reacciones nucleares.
• Masa y tamaño nuclear.
• Decaimiento alfa.
• Decaimiento beta.
• Radiación gamma.
• Física de neutrones y fisión nuclear.

Índice temático:
1. Introducción. Fundamentos de física atómica.

2. Carga del núcleo atómico. Dispersión de rayos x. Número de electrones por átomo y
número atómico.
3. Radiactividad. Identidad de los diferentes tipos de radiaciones nucleares y no
nucleares. Ley de decaimiento radiactivo. Ley de decaimientos sucesivos. Equilibrio
radiactivo. Series de decaimiento radiactivo. Actividad y unidades de radiactividad.
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4. Reacciones nucleares. Introducción. Leyes de conservación en las reacciones
nucleares. Reacciones nucleares en coordenadas de centro de masa. Energía umbral
para reacciones nucleares endoergéticas. Secciones trasversales. Razón de reacción.
5. Masa y tamaño nuclear. Introducción. Espectrómetro de masas. Método de ajuste de
dobletes. Medición de masas mediante datos de desintegraciones. Energía de
empaquetamiento y energía de enlace de nucleones. Fórmula semiempírica para el
cálculo de masas atómicas. Efecto isobárico. Dispersión de partículas alfa y parámetro
de impacto.
6. Decaimiento alfa. Introducción. Energía cinética de las partículas alfa. Rango y poder
de frenado. Sistemática del decaimiento alfa. Teoría del decaimiento alfa.
7. Decaimiento beta. Introducción. Condiciones de la emisión espontánea de las
partículas beta. Medición de la energía cinética de las partículas beta. Interacción de
las partículas beta con la materia. Teoría del decaimiento beta (hipótesis del neutrino).
Sistemática del decaimiento beta.
8. Radiación gamma. Introducción. Interacción de la radiación gamma con la materia.
Efecto fotoeléctrico. Efecto Compton. Producción de pares. Conversión interna. Efecto
Auger. Conversión de pares interna.
9. Física de neutrones y fisión nuclear: Introducción. Interacción de los neutrones con
la materia. Producción de neutrones. Fisión nuclear.

• R. Gautreau &W Savin, Física Moderna, Mc. Graw Hill (2001).

• R. D. Evans, Atomic Nucleus, Mc Graw Hill (1975).
• Atam P. Arya, Fundamentals of Nuclear Physics, Allyn and Bacon, Inc. (1966).


• Búsqueda bibliográfica a asignar durante el curso.

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Seguridad radiológica

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: Ninguno
§ Clave: AFB-13

Descripción de la asignatura: La seguridad radiológica provee los conocimientos básicos

para la protección de los trabajadores de radiaciones y del público en general contra los
efectos dañinos de la radiación ionizante y no-ionizante. La seguridad radiológica es la
responsable de los aspectos de seguridad en los procesos del diseño, el equipo, y las
instalaciones que utilicen fuentes de radiación, de tal manera que la exposición del personal
sea minimizada, y que en todo momento esté dentro de los límites aceptables. La filosofía de
la seguridad radiológica es mantener al personal y al medio ambiente bajo una constante
vigilancia con el fin de comprobar que sus diseños son en realidad efectivos. Si las medidas de
control se encontraran que fueran deficientes, o si fueran incumplidas, debe ser capaz de
evaluar el grado de peligro, y hacer las recomendaciones con respecto a las acciones
correctivas.
Contenido:
• Repaso de los principios físicos.

• Estructura atómica y nuclear.
• Radiactividad.
• Interacción de radiación con la materia.
• Dosimetría de la radiación.
• Efectos biológicos de la radiación.
• Guías de protección radiológica.
• Instrumentación en protección radiológica.
• Protección contra radiación externa.
• Protección contra radiación interna.
• Criticalidad nuclear
• Evaluación de medidas de protección
• Radiación no-ionizante
• Método Monte Carlo y aplicaciones a seguridad radiológica, dosimetría y blindaje.

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Índice temático:
1. Repaso de los principios físicos. Mecánica. Electricidad. Transferencia de energía.

Teoría cuántica.
2. Estructura atómica y nuclear. Estructura del átomo, modelos atómicos. Estructura
del núcleo, isótopos, energía de amarre.
3. Radiactividad. Radiactividad y mecanismos de transformación. Cinética de la
transformación, vida media. Actividad, radiactividad natural, series de decaimiento
radiactivo.
4. Interacción de la radiación con la materia. Procesos de interacción con la materia
de las partículas beta, partículas alfa, rayos gamma, rayos x, y neutrones.
5. Dosimetría de la radiación. Unidades, intensidad de la fuente y constante de
radiación gamma específica, radiación beta, Radionúclidos depositados internamente;
neutrones.
6. Efectos biológicos de la radiación. Características de la dosis-respuesta. Las bases
biológicas para la dosimetría interna. Efectos de la radiación. El Sievert y el rem.
7. Guías de protección radiológica. Organismos que establecen estándares de
protección radiológica. Filosofía de la protección radiológica. Criterio básico de
seguridad radiológica de Comisión Internacional de Protección Radiológica (ICRP, por
sus siglas en inglés). Comisión Nacional de Seguridad Nuclear y Salvaguardas (CNSNS)
8. Instrumentación en protección radiológica. Detectores de radiación. Instrumentos
de medición de dosis. Medición de neutrones, calibración. Estadística de conteo.
9. Protección contra radiación externa. Principios básicos: tiempo, distancia, blindaje.
Rayos x, neutrones. Optimización.
10. Protección contra radiación interna. Daño por radiación interna, principios de
control. Límites de contaminación superficial. Gestión de residuos radiactivos.
Evaluación de peligro.
11. Criticalidad nuclear. Peligro de criticalidad nuclear. Fisión nuclear. Productos de
fisión. Criticidad nuclear.
12. Evaluación de medidas de protección. Vigilancia médica. Estimación de la
radiactividad depositada internamente. Monitoreo individual. Radiación y evaluación
de contaminación.
13. Radiación no-ionizante. Láseres, radiación de radio frecuencia y microondas.
Principios de protección radiológica.
14. Método Monte Carlo y aplicaciones a seguridad radiológica, dosimetría y
blindaje. Utilización de códigos basados en el Método Monte Carlo para el transporte
de la radiación en problemas de dosimetría y blindaje.

• Herman Cember and Thomas Johnson. Introduction to Health Physics, Fourth Edition,
McGraw Hill, 2009.
89


• Jacob Shapiro, RADIATION PROTECTION a Guide for Scientists and Physicians.
Harvard University Press, Third Edition, 1990.


• Health Physics Journal, publicación mensual de la Health Physics Society, USA.
• Protección Radiológica, revista publicada por la SMSR, México.
• Reglamento General De Seguridad Radiológica, Editado por la CNSNS, 1996.
• B. Shleien and M.S. Terpilak, The Health Physics And Radiological Health Handbook,
Nucleon Lectern Associates, 1984.
• ICRP Publication 103. The 2007 Recommendation of the International Commission on
Radiological Protection. ELSEVIER, Volume 37 Nos. 2-4 ,2007

90


Mecánica clásica

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: Ninguno
§ Clave: AFB-14
§ Materia asociada a la Línea de investigación: PCFM, MSCM

Descripción de la asignatura: La mecánica clásica, es una formulación de la mecánica para

describir el movimiento de sistemas de partículas físicas, de sistemas macroscópicos y a
velocidades pequeñas comparadas con la velocidad de la luz. Existen varias formulaciones
diferentes, atendiendo a los principios que utilizan, de la mecánica clásica que describen un
mismo fenómeno natural. Independientemente de aspectos formales y metodológicos, llegan a
la misma conclusión. La mecánica analítica (analítica en el sentido matemático de la palabra y
no filosófico). Sus métodos son poderosos y trascienden de la Mecánica a otros campos de la
Física. Se puede encontrar el germen de la mecánica analítica en la obra de Leibniz que
propone para solucionar los problemas mecánicos otras magnitudes básicas (menos oscuras
según Leibniz que la fuerza y el momento de Newton), pero ahora escalares, que son: la
energía cinética y el trabajo. Estas magnitudes están relacionadas de forma diferencial. La
característica esencial es que, en la formulación, se toman como fundamentos, principios
generales (diferenciales e integrales), y que a partir de estos principios se obtengan
analíticamente las ecuaciones de movimiento.
Contenido:
• Formulación lagrangiana.
• Principios variacionales.
• Leyes de conservación.
• Campo central.
• Oscilaciones.
• Cuerpo rígido.
• Formulación hamiltoniana.
• Transformaciones canónicas.
• Teoría de Hamilton-Jacobi.
• Variables de acción y ángulo.
• Teoría de perturbaciones y sistemas no integrables.

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Índice temático:
1. Introducción. (repaso de mecánica newtoniana): Ecuaciones diferenciales. Espacio

fase. Puntos fijos. Ciclos límite. Análisis cualitativo de sistemas mecánicos en el espacio
fase. Mecánica de sistemas con N partículas. Energía, momento lineal, momento
angular. Concepto de caos. Ejemplos.
2. Formulación lagrangiana. Coordenadas generalizadas. Problemas con constricciones
holonómicas y no holonómicas. Ecuaciones de Euler-Lagrange. Covariancia. Principio
de D'Alembert. Trabajos virtuales. Ejemplos.
3. Principios variacionales. Cálculo de variaciones. Principios de Hamilton y Fermat.
Equivalencia con la formulación lagrangiana. Ejemplos.
4. Leyes de conservación. Integrales de movimiento. Simetrías y cantidades
conservadas. Teorema de Noether. Ejemplos.
5. Campo central. Formulación lagrangiana. Problema de Kepler. Dispersión. Ejemplos.
6. Oscilaciones. Oscilaciones pequeñas (lineales). Modos normales. Límite de sistemas
continuos: introducción a campos clásicos. Oscilaciones no lineales. Ejemplos.
7. Cuerpo rígido. Sistemas de referencia no inerciales. Fuerza de Coriolis.
Transformaciones ortogonales. Teorema de Euler. Rotaciones. Dinámica de cuerpo
rígido. Ejemplos.
8. Formulación hamiltoniana. Espacio fase. Transformada de Legendre. Estructura
simpléctica. Función hamiltoniana. Ecuaciones de Hamilton. Paréntesis de Lagrange y
de Poisson. Simetrías. Teoremas de Liouville y de recurrencia de Poincaré. Ejemplos.
9. Transformaciones canónicas. Preservación de la estructura simpléctica. Funciones
generadoras. La evolución temporal como una transformación canónica. Ejemplos.
10. Teoría de Hamilton-Jacobi. La ecuación de Hamilton-Jacobi. Separación de variables.
Solución completa. Ejemplos.
11. Variables de acción y ángulo. Sistemas totalmente integrables. Sistemas no
integrables. Ejemplos.
12. Teoría de perturbaciones y sistemas no integrables. Expansión en serie.
Resonancias y denominadores pequeños. Invariancia adiabática. Discusión cualitativa
del teorema de Kolmogorov, Arnold y Moser. Introducción al caos en sistemas
hamiltonianos. Ejemplos: mapeos que preservan el área, el oscilador no lineal forzado.

• Goldstein, H. A., Classical Mechanics, 2a edición , Addison-Wesley, 1980

• Landau, L. D. and Lifshitz, E. M., Mechanics, Pergamon Press.
• Jorge V. José y Eugene J. Saletan, Classical dynamics: a contemporary approach.
Cambridge U. P., 1998
• Neil Rasband S., Dynamics. John Wiley and Sons, 1983.

92


• Arnold, V. I. Mathematical methods of classical mechanics, 2a edición. Springer-Verlag,

1989.
• Matzner, R. A. and Shepley, L. S. Classical mechanics, Prentice Hall, 1991.

93


Introducción a la electrodinámica

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Clave: AFB-15

Descripción de la asignatura: El objetivo de este curso, es dar los principios fundamentales

de la electrodinámica clásica. Se revisarán de manera profunda, los conceptos básicos que se
estudian en curso de electromagnetismo y electrodinámica precedentes, inclusive desde una
matemática diferente, poniendo énfasis en las ideas que dieron lugar a la unificación eléctrica
y magnética, su relación con fuentes materiales y su interacción con la materia. También se da
una descripción de la interacción campos-materia. Se hace énfasis en la solución de problemas
y en el desarrollo matemático.
Contenido:
• Las ecuaciones de Maxwell.

• Electrostática.
• El campo magnético.
• Leyes de conservación.
• Ondas electromagnéticas.
• Campos de cargas en movimiento.
• Formulación covariante.
• Las ecuaciones de Maxwell en medios materiales.
• La función dieléctrica.

Índice temático:
1. Las ecuaciones de Maxwell. El concepto de campo. Las ecuaciones de Maxwell en el

vacío. Los potenciales electromagnéticos. Ecuaciones para los potenciales
electromagnéticos. Conservación de la carga e invariancia de norma.
2. Electrostática. Las ecuaciones de Laplace y Poisson. Teorema de unicidad. Solución del
problema electrostático con condiciones de frontera con la ayuda de la función de
Green. Momentos multipolares de una distribución de cargas. Energía del campo
electrostático.
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3. El campo magnético. La ley de Biot-Savart. La ley de Ampere. Potencial vectorial.
Momentos multipolares de una distribución de corrientes. La ley de inducción.
Coeficientes de autoinducción e inducción mutua. Energía del campo magnético.
4. Leyes de conservación. El teorema de Poynting. El tensor de esfuerzos de Maxwell. El
momento angular.
5. Ondas electromagnéticas. La ecuación de onda para los campos y los potenciales.
Ondas planas. Polarización. Ondas no monocromáticas. Descomposición espectral. El
problema de las condiciones iniciales. Propagación de pulsos.
6. Campos de cargas en movimiento. La ecuación de onda con fuentes. Función de Green
de la ecuación de onda. Potenciales retardados. Radiación de sistemas simples.
Radiación de antenas. Radiación de una partícula puntual en movimiento. Distribución
angular y espectral de la radiación. Desarrollo multipolar del campo de radiación.
7. Formulación covariante. Transformación de fuentes, potenciales y campos. Ecuaciones
de Maxwell en forma covariante. Invariantes y leyes de conservación. Formulación
lagrangiana.
8. Las ecuaciones de Maxwell en medios materiales. Las ecuaciones de Maxwell
microscópicas.
9. El concepto de campo promedio. Definición de los campos materiales y las
ecuaciones constitutivas. La deducción de las ecuaciones macroscópicas.
Contribuciones multipolares a los campos materiales.
10. La función dieléctrica. El concepto de tensor dieléctrico. Dispersión temporal,
causalidad y propiedades analíticas de la función dieléctrica. Su relación con la
susceptibilidad y la conductividad.
11. El modelo de Drude. La relación de Clausius-Mossotti.

• J. D. Jackson, Classical electrodynamics, 3nd. Edition. Wiley, 1999.

• Greiner W., Classical electrodynamics, Springer, 1991.
• David J. Griffiths, Introduction to Electrodynamics, Prentice-Hall, 1999.
• L. Eyges. The Classical Electromagnetic Field, Dover Publications Inc.

• L. D. Landau and E. M. Lifshitz, The classical theory of fields (Course of theoretical
physics), 4th edition, Butterworth-Heinemann (1995).
• J. Vanderlinde, J., Classical electromagnetic theory (Fundamental Theories of
Physics), Wiley, New York, 1993.
95


Mecánica cuántica

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Clave: AFB-16

Descripción de la asignatura: Un cambio revolucionario en el entendimiento de los

fenómenos microscópicos tomó lugar durante los primeros 30 años del siglo XX, no tiene
precedente en la historia de las ciencias naturales. La validez de la teoría clásica mostraba
serias limitaciones, y es así como surge una teoría alternativa que remplaza la física clásica en
el mundo microscópico y con una rica aplicabilidad, cuyos resultados son evidentes en la
vasta tecnología de materiales y de la electrónica, así como en el entendimiento de los
constituyentes fundamentales de la materia, durante la segunda mitad del siglo XX. Se
pretende el conocimiento, manejo y uso del razonamiento inductivo-deductivo como forma de
pensamiento para poder comprender conceptos como: estado cuántico de un sistema y sus
representaciones, medidas observables e incertidumbre en mecánica cuántica, evolución de
un estado cuántico, momento angular y espin. Además, impacta directamente en el estudio del
estado sólido, de la física estadística avanzada y del estudio de partículas elementales y altas
energías.
Contenido:
• Fundamentos conceptuales.
• Dinámica cuántica.
• Teoría general del momento angular.
• Métodos de aproximación.
• Partículas idénticas.
• Teoría de dispersión.
Índice temático:
1. Fundamentos conceptuales. El experimento de Stern-Gerlach. Herramientas

matemáticas: Kets, Bras y operadores. Bases y representaciones matriciales. Medidas
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observables y relaciones de incertidumbre. Cambios de base. Posición, momento y
traslación. Función de onda en el espacio de posiciones y de momentos.
2. Dinámica cuántica. Evolución temporal y la ecuación de Schrödinger. El marco de
Schrödinger y el Marco de Heisenberg. Partícula libre y potenciales constantes a
tramos. El oscilador armónico. El átomo de hidrógeno.
3. Teoría general del momento angular. Rotaciones y relaciones de conmutación del
momento angular. Sistemas de espin ½. Eigenvalores y eigenestados del momento
angular. Momento angular orbital. Adición del momento angular.
4. Métodos de aproximación. Teoría de perturbaciones independientes del tiempo.
Átomos hidrogenoides. Método variacional. Teoría de perturbaciones dependiente del
tiempo. Aplicaciones a interacciones con radiación.
5. Partículas idénticas. Simetrización. Sistema de dos electrones.
6. Teoría de dispersión. La ecuación de Lippmann-Schwinger. La aproximación de Born.
Método de ondas parciales. Partículas idénticas y dispersión.

• Modern Quantum Mechanics (2nd Edition) (Hardcover) by J. J. Sakurai

• Quantum Mechanics (International Pure & Applied Physics Series) (Hardcover)
by L. I. Schiff.

• Quantum Mechanics (2 vol. set) (Paperback) by Claude Cohen-Tannoudji, Bernard

Diu, Frank Laloe.
• Quantum Physics by Stephen Gasiorowicz.
• Introduction to Quantum Mechanics (2nd Edition) by David J. Griffiths
• Quantum Mechanics by Eugen Merzbacher.
• Introductory Quantum Mechanics (4th Edition) by Richard Liboff .
97


Física estadística

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Clave: AFB-17

Descripción de la asignatura: Se desarrolla la estructura teórica de primeros principios para

comprender los fenómenos físicos colectivos de muchos cuerpos y se establecen las
conexiones precisas entre las leyes de termodinámica clásica, quedando esta última contenida
como un resultado inherente al formalismo mecánico estadístico. Principalmente está
dividida en cuatro grandes contenidos temáticos. Primero, se revisan los conceptos y
teoremas más fundamentales en los que descansa toda la mecánica estadística de equilibrio:
el teorema de Lioville, el teorema de Poincaré, y la hipótesis ergódica. Segundo, se construyen
los diferentes ensambles estadísticos tomando como base el postulado de igual probabilidad a
priori en el ensamble microcanónico y usando el método del reservorio, de energía (caso
canónico), de partículas y energía (caso gran canónico). Además se introducen algunos
conceptos de la teoría general de ensables y otras vías para deducir las diferentes
distribuciones de probabilidad, tales como el método de la distribución más probable, el
método complejo de Darwin-Fowler y el método de la máxima entropía. Tercero, estudio de
las estadísticas cuánticas, que consiste básicamente en utilizar el formalismo ya desarrollado
para el análisis de sistemas con propiedades cuánticas tales como la indistinguibilidad, el
espín, entre otros que dan lugar a nuevas propiedades colectivas y una nueva clasificación de
la materia la cual obedece la estadística de Bose-Einstein y la de Fermi-Dirac. Finalmente, se
atacan una serie de problemas clásicos y no clásicos, y así ilustrar la potencia del formalismo.
Entre los problemas que se atacan son tanto gases ideales clásicos como cuánticos, también
gases imperfectos, partículas diatómicas. Se revisa algunas teorías de fenómenos críticos y
teoría de fluctuaciones.
Contenido:
• Introducción y revisión de la termodinámica.

• Fundamentos de la física estadística.
• Aplicaciones a sistemas simples y con interacción.
• Estadísticas cuánticas y sus propiedades.
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• Sistemas cuánticos ideales.
• Transiciones de fase.
• Fluctuaciones y procesos aleatorios.

Índice temático:
1. Introducción y revisión de la termodinámica. Gas ideal. Gas de van der Waals.

Conjunto de osciladores simples. Diagramas de fase. Variables termodinámicas y
funciones trabajo. Termodinámica analítica. Proceso de Joule. Equilibrio
termodinámico en sistemas cerrados. Sistemas abiertos y disponibilidad.
2. Fundamentos de la física estadística. Principio de equiprobabilidad. Conjunto micro
canónico, canónico y gran canónico. Otros conjuntos. Funciones de partición y gran
función de partición. Maximización de la función de partición. Espacio fase. Teorema
de equipartición. Otros conjuntos. Fluctuaciones. Distintas estadísticas.
3. Aplicaciones a sistemas simples y con interacción. Sistemas simples: gas ideal,
molécula biatómica, cristales. Sólido de Einstein y Debye. Modelo de Ising en una
dimensión. Paramagnetismo. Sistemas con interacción: ferromagnetismo, fluido de
van der Waals, gases densos y líquidos, gases imperfectos, desarrollo del virial,
funciones de Mayer. Introducción teoría de cúmulos.
4. Estadísticas cuánticas y sus propiedades. Estadísticas cuánticas. Fermiones y bosones.
Estadística de Bose-Einstein. Estadística de Fermi-Dirac. Gas cuántico ideal. Límite
clásico. Matriz de densidad.
5. Sistemas cuánticos ideales. Gas de Fermi. Energía de Fermi. Límite de baja
temperatura. Entropía y capacidad calorífica a bajas temperaturas. Paramagnetismo
de Pauli. Diamagnetismo de Landau. Gas de Bose. Condensación Bose-Einstein.
Radiación de cuerpo negro. Fonones. Ondas de espín.
6. Transiciones de fase. Transiciones de fase y teoría de campo medio. Comportamiento
crítico.
7. Transiciones de fase continuas. Renormalización en una dimensión. Aplicaciones de
renormalización.
8. Fluctuaciones y procesos aleatorios. Fluctuaciones en las variables termodinámicas.
Distribución de probabilidad de las fluctuaciones. Fluctuaciones en puntos críticos.
Ruido térmico. Movimiento Browniano. Variables aleatorias y ecuación de Langevin.
Teorema fluctuación-disipación. Difusión simple. Difusión en campos externos.
Problema de Kramers. Ecuaciones de difusión generalizadas.
• R. K. Pahtria, Statistical mechanics, Butterworth-Heinemann, Oxford, 1996.

• L. D. Landau, E. M. Lifshitz y L. P. Pitaevskii, Statistical physics, Pergamon Press,
1980.
• G. F. Mazenko, Equilibrium statistical mechanics, Wiley-Interscience, 2000.
• L. E. Reichl, A modern course in statistical mechanics, John Wiley & Sons, Inc., 1998.
• L. P. Kadanoff, Statistical physics, World Scientific, Singapore, 2000.
99


• K. Huang, Statistical mechanics, John Wiley & Sons, Inc., 1987.

• D. A. MacQuarrie, Statistical mechanics, Harper and Row, 1976.
• R. Kubo, Statistical mechanics, North Holland, 1988.
• H. B. Callen, Thermodynamics and an introduction to thermostatistics, John Wiley &
Sons, Inc., 1985.
100


Geometría Algebraica

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: Ninguno
• Clave: AFB-18
• Asignatura: Específica
• Materia asociada a la Línea de investigación: MBa

Descripción de la asignatura: La materia cubrirá los tópicos básicos de Geometría

Algebraica, desde el punto de vista de variedades algebraicas y con énfasis en la utilización de
las técnicas de haces coherentes y cohomología. La última unidad tendrá un carácter
informativo, omitiendo demostraciones y avanzando hasta donde el tiempo lo permita.
Contenido:
Conceptos fundamentales. Lema de Normalización de Noether y Teorema de los Ceros.

Correspondencia entre cerrados afines e ideales de k[x_1,…,x_n]. Haces, definiciones básicas.
Haces definidos en una base y su extensión a todo el espacio. Germen en un punto. Morfismos
inyectivos y sobreyectivos. Sucesiones exactas de haces. Espacios anillados.La categoría de
prevariedades. Variedades afines como espacios anillados. Definición de prevariedades y
morfismos. Productos en la categoría de prevariedades. Axioma de Haussdorff y definición de
variedades.Teoría de dimensión. Teorema del ideal principal y morfismos finitos.
Caracterizaciones de dimensión. El teorema de dimensión de las fibras.Variedades completas.
El lema de Chow. Topología fuerte, variedades complejas. Caracterización de variedades
complejas completas.
Fibrados vectoriales y divisores. Variedades no singulares y normales. Definiciones básicas.

Diferenciales de Khaler, vectores tangentes y espacios vectoriales. Estudio diferencial de un
morfismo. Normalización y desingularización. El caso de curvas.Correspondencia entre
divisores de Cartier, haces invertibles y fibrados en rectas. Divisores de Weil y de Cartier.
Equivalencia lineal y grupo de Picard.Cohomología de Cech. La sucesión larga en cohomología.
Haces coherentes, teoremas de finitud de cohomología para haces coherentes definidos en
variedades proyectivas.Sistemas lineales, morfismos asociados a sitemas lineales. Haces
amplios y muy amplios. El Teorema de Bertini. Teorema de la sección hiperplana de
Serre.Dualidad de Serre. El caso de curvas: Teorema de Riemann-Roch. La aplicación canónica.
101


Variedades complejas.Variedades no singulares y variedades complejo-analíticas. El
principio GAGA. Clases de Chern. Resultados principales de la Teoría de Hodge.

• D. Mumford, The Red Book of Varieties and Schemes. Springer Verlag LNM 1358,
1999.
• R. Hartshorne, Algebraic Geometry. Springer Verlag GTM 52, 1977.
• P. Griffiths and J. Harris. Principles of Algebraic Geometry, John Wiley & Sons, Inc.
1978.
• J.P. Serre. Faisceaux Algebriques Coherents., Annals of Mathematics vol 61 no2 1955,
197-278.

102


Teoría de Gráficas

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFB-19

Descripción de la asignatura: A través de una revisión exhaustiva sobre algunos de los

resultados clásicos de la teoría de gráficas, se pretende introducir al estudiante en las técnicas
y métodos estándar del área. Al mismo tiempo, se discutirá sobre el impacto que dichos
resultados han tenido o pueden tener en áreas como la optimización combinatoria, las
ciencias computacionales, la investigación de operaciones, etc. Como un refuerzo en la
comprensión tanto de los teoremas analizados y sus aplicaciones como de las técnicas
utilizadas en sus demostraciones, se contemplan las siguientes actividades por parte del
estudiante: resolución frecuente de ejercicios, lectura de artículos científicos relacionados,
exposiciones sobre aplicaciones de los teoremas discutidos en clase, etc.

Contenido:
• Apareamientos.
• Conexidad.
• Gráficas planares.
• Coloraciones.
• Flujos.
• Teoría extremal de gráficas.

Índice temático:

1. Apareamientos. Caminos aumentantes. Teorema de Berge. Teorema de Hall.
Apareamientos y cubiertas. Teorema de Tutte-Berge. Apareamientos perfectos y factores.
Teorema de Tutte. T-Uniones.
2. Conexidad. Conexidad por vértices. Teorema de Menger. Estructura de las gráficas 3-

conexas. Teorema de Mader. Conexidad por aristas. Teorema de Nash-William.
3. Gráficas planares. Preliminares topológicos. Gráficas planas. Dibujos. Teorema de la curva

de Jordan. Menores. Teorema de Kuratowski. Criterio algebraico de planaridad. Gráfica dual
plana. Teorema de Wagner. Característica de Euler.
103


4. Coloraciones. Coloraciones de mapas. Número cromático. Teorema de Brook. Conjetura de
la partición por caminos. Teorema de las gráficas perfectas. Teorema fuerte de las gráficas
perfectas. Polinomio cromático. Índice cromático. Teorema de Vizing. Teorema de los 5-
colores. Teorema de los 4-colores.
5. Flujos. Teorema de flujo máximo y corte mínimo. Algoritmo de Ford-Fulkerson.

Circulaciones. Flujos en redes. K-flujos. Teorema de Tutte sobre 1-factores. Conjetura de
Tutte para flujos.
6. Teoría extremal de gráficas. Caminos y ciclos. Subgráficas completas. Caminos y ciclos de

Hamilton. Menores. Conjetura de Hadwiger. Lema de Szemeredi.
• J. A. Bondy and U. S. R. Murty, Graph theory, 1st. Edition. Springer, 2008.

• Reinhard Diestel, Graph theory, 4th Edition. Springer, 2010.

• Béla Bollobas, Modern graph theory, 1st. Edition. Springer, 1998.

104


Teoría algebraica de los números

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFB-20

Descripción de la Asignatura: Se pretende que el alumno conozca cuatro resultados

importantes en esta teoría: Sea Q el campo de los números racionales y sea k una extensión
finita sobre Q. Sea O_k el anillo de enteros algebraicos de k. Se probará que O_k es
noetheriano, el teorema de Dedekind sobre la descomposición de ideales de O_k, el teorema
de las unidades de Dirichlet y la finitud del número de clase de k. Tambien se estudia el punto
de vista de las valuaciones. En particular, la formula del producto sera importante.
Contenido:
• Anillos de Dekind y anillos de enteros algebraicos

• Campos Completos

Indice Tematico:
1. Anillos de Dekind. Módulos y módulos sobre dominios de ideales principales. Anillos

locales. Cerradura entera. Anillos de valuación discreta y anillos de Dedekind. Ideales
fraccionarios y el grupo de clase. Normas y trazas. Extensiones de anillos de Dedekind.
Ramificación. Terminología de campos de números algebraicos. Finitud del grupo de
clase. Teorema de las unidades de Dirichlet. Ejemplos: Campos cuadráticos y campos
ciclotómicos.
2. Campos Completos. Valuaciones y completaciones. Valuaciones arquimedianas y no-
arquimedianas. La topología de las completaciones de campos de números
algebraicos. La fórmula del producto.

• Kenneth Ireland, Michael Rosen, A Classical Introduction to Modern Number, Springer-

Verlag, 1990.
• Gerald J. Janusz, Algebraic Number Fields, American Math. Society, 1996.
• serge Lang, Algebraic Number Theory, Springer-Verlag, 19904.
105


• Pierre Samuel, Théorie Algébrique des Nombres, Hermann Éditeurs des Sciences et
Arts, 2003.

106


ANEXO B
ASIGNATURAS DE
FORMACIÓN ESPECÍFICA

107


Biocontrol de enfermedades en plantas

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-1

Descripción de la asignatura: Con el mayor entusiasmo observado hacia la biotecnología, en

las últimas décadas, se ha derivado en una nueva área promisoria de aplicación tecnológica
referida comúnmente como biotecnología microbiana. Un beneficio potencial de la
biotecnología microbiana es el desarrollo de estrategias de biocontrol contra las
enfermedades y plagas en plantas, o productos promotores del crecimiento de los cultivos.
Una forma exitosa para el manejo de las enfermedades, plagas y malezas en la agricultura sin
el uso de pesticidas, es el control biológico utilizando agentes de biocontrol, en donde el
principio activo son organismos vivos que permiten la regulación del nivel de incidencia de
patógenos, plagas y malezas. El término biocontrol ha sido aplicado también al uso de
productos naturales extraídos o fermentados a partir de varias fuentes de organismos;
productos naturales que pueden ser ingredientes simples o mezclas complejas con efectos
múltiples en la planta hospedero así como en el patógeno o plaga, tales productos se conocen
como biofertilizantes o biopesticidas. El control biológico comprende el uso de parásitos,
predatores, antagonistas, microorganismos de rápido crecimiento, atrayentes sexuales,
productos de microorganismos, entre otras formas de biocontrol. El desarrollo de nuevas
estrategias y su efectiva adopción requiere cada vez más, de un mayor entendimiento de las
interacciones complejas entre plantas, microorganismos (patógenos y benéficos) y el medio
ambiente.

Índice temático:
1. Introducción.
2. El concepto de control biológico y agente de biocontrol.
3. Tipos de interacciones entre especies y su impacto en el control biológico.
Mutualismo, comensalismo, protocooperación, neutralismo, antagonismo, parasitismo
y predación.
4. Mecanismos de acción de los agentes de biocontrol. Competencia por espacio.
Síntesis de aleloquímicos: competencia por hierro y siderófofos, antibiosis, hidrolasas
y actividad hiperparasítica. Detoxificación y degradación de factores de virulencia.
Inducción de resistencia ante patógeno en hospedero.
108


5. Inducción de resistencia sistémica en planta. Elicitores. Genes de resistencia y
genes de defensa. Resistencia sistémica adquirida (RSA) y Resistencia sistémica
inducida (RSI). Variabilidad de la resistencia sistémica y factores ambientales.
6. Sistemas de biocontrol más utilizados contra microorganismos y nematodos.
Agentes bacterianos: Pseudomonas sp. Agentes fúngicos: micorrizas, Rhizoctonia
binucleada. Enzimas líticas y otros metabolitos de microorganismos con actividad
anti-fitopatógeno. Fitoproteínas antivirales. Micoviruses.
7. Respuestas de defensa en raíz ante invasión por microorganismos simbiontes:
Reacciones celulares asociadas con micorrizas arbusculares. Reacciones celulares
asociadas con bacterias noduladoras. Bacterias promotoras del crecimiento vegetal.
8. Sistemas de biocontrol contra malezas: Microherbicidas. Otros microorganismos.
9. Búsqueda de agentes de biocontrol: Selección de microorganismos. Incremento de
actividad antagónica contra patógenos.
10. Técnicas de biocontrol en pruebas de laboratorio e invernadero.

Bibliografía:
• Greg J. Boland, David Kuykendall. Plant-Microbe Interactions and Biological control.

Marcel Dekker, Inc. USA. 1999.
• R. K. Upadhyay, K. G. Mukerji, and B.P. Chamola. Biocontrol Potential and its
Exploitation in Sustainable Agriculture. Vol. I. CropDiseases, Weeds, and Nematodes. .
Kluwer Academic/Plenun Pub. USA. 2000.
• Michel Nicole and Vivienne Gianinazzi-Pearson. Hystology, Ultrastructure and
Molecular Cytology of Plant-Microorganism Interactions. Kluwer Academic Press. USA.
1997.

109


Biotecnología para remediación del estrés en plantas

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-2

Descripción de la asignatura: La generación de productos agroalimentarios enfrenta

nuevos retos, incluido el cambio climático que impone principalmente, escases de agua y altas
temperaturas. La producción sustentable requerirá mejor uso de los recursos, nuevas
herramientas y nuevas tecnologías. La innovación agrícola mediante la creación de nuevas
soluciones desempeña una función central en la productividad de largo alcance, y en la
preservación del medio ambiente.
Por su parte, en un organismo, incluidas las plantas, su comportamiento en interacción con el

medio ambiente es extremadamente complicado. La respuesta de las plantas al estrés
impuesto por factores ambientales adversos, depende de una multitud de ajustes en la
expresión de genes y en las rutas metabólicas con numerosas interconexiones entre ellas. En
un sistema tan intrincado, los mecanismos responsables de la respuesta son difíciles de
descifrar. Con el avance científico se han perfeccionado herramientas de biología molecular
que permiten descubrir con mayor celeridad, moléculas o conjuntos de moléculas implicadas
en la integración de las respuestas de adaptación, de tolerancia o de resistencia a diversos
tipos de estrés ambiental, tanto biótico como abiótico, que pueden ser usadas para desarrollos
biotecnológicos. Del mismo modo, el avance del conocimiento de la biodiversidad ha
permitido establecer que en el ambiente comúnmente se encuentran especies con capacidad
de coexistir, e incluso interactuar en un sentido de cooperación para beneficio mutuo. Las
plantas son capaces de interactuar con una infinidad de microorganismos habitantes
naturales en la rizósfera y en la filósfera. La agrobiotecnología se basa en el aprovechamiento
de un conjunto de herramientas desde el mejoramiento genético asistido con el uso de
marcadores moleculares, el uso de microorganismos o sus productos para potenciar el
crecimiento de las plantas o protegerlas contra plagas y enfermedades, hasta la modificación
genética de alguna especie para introducir la característica deseada para la solución de un
problema específico.

Índice temático:
1. Introducción.
2. Señales de transducción durante estrés abiótico y biótico.
3. Complejidades en la expresión de genes en planta ante estrés.
110


4. Promotores y factores de transcripción en la expresión de genes en respuesta a
estrés.
5. Recursos para la identificación de nuevos genes clave (tipo factores de
transcripción).
6. Estudios de genómica para el entendimiento de la respuesta en plantas ante
estrés.
7. El proteoma y el interactoma en la respuesta ante estrés en plantas.
8. Biodiversidad de microorganismos en la rizósfera y filósfera.
9. Selección de especies de microorganismos benéficos.
10. Herramientas de biotecnología de utilidad para la agricultura. Mejoramiento
genético asistido con marcadores moleculares. Búsqueda de genes con utilidad
potencial en la respuesta a estrés en plantas: In vivo mediante genética directa y
genética reversa, In silico (bases de datos, bioinformática). Inserción de secuencias en
genomas de especies vegetales. Inserción de secuencias en genomas de
microorganismos. Sobreexpresión y silenciamiento de genes endógenos de utilidad
ante estrés en plantas. Técnicas de micropropagación de especies vegetales. Diseño de
productos bioactivos para fines agrícolas: a base de microorgansimos vivos o lisados, a
base de productos de secreción de microorganismos, formulación de combinados de
microorganismos o productos de microorganismos.
11. Prácticas en laboratorio (y campo). Identificación de marcadores moleculares en
genomas de plantas. Aislamiento de microorganismos silvestres: a partir de muestreo
de suelos agrícolas y forestales, a partir de tejido radical de especies agrícolas y
silvestres, a partir de tejido foliar y tallo de plantas silvestres y cultivadas.
Formulación de bioactivos de aplicación agrícola. Transformación genética en
bacterias (Escherichia coli, Agrobacterium tumefaciens). Transformación genética en
planta: en planta completa, en raíz (planta compuesta, solo raíz transformada).
Micropropagación de especies vegetales: en cactáceas, en especies forestales. en
especies agrícolas.

Bibliografía:
• S.K. Sopory, Hans J. Bohnert, Govindjee. Abiotic Stress Adaptation in Plants:

Physiological, Molecular and Genomic Foundation. Springer. USA. 2010.
• H.R. Lerner. Plant Responses to Environmental Stresses: From Phytohormones to
Genome Reorganization: Marcel Dekker, Inc.. USA. 2001.
• James N. Seiber, Mahesh K. Bhalgat, William P. Ridley, Allan S. Felsot. Agricultural
Biotechnology: Challenges and Prospects (ACS Symposium) American Chemical
Society. USA. 2004.
• Francesco Francioni and Tullio Scovazzi Biotechnology and International Law (Studies
in International Law). HART Pub. USA 2006.

111


Ingeniería Metabólica de Microorganismos de Importancia
Biotecnológica y Agrícola
________________________________________________________________________________
• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-3

Descripción de la asignatura: El uso de microorganismos de interacción benéfica con

plantas es una alternativa emergente para dar solución sustentable a problemas agrícolas
(suelos con pobreza nutrimental, enfermedades causadas por fitopatógenos, bajo rendimiento
agrícola, etc.). Dicha interacción benéfica planta-microorganismo está en gran parte mediada
por la síntesis de metabolitos microbianos especializados que desencadenarán acciones
protectivas para la planta. Con ello se hace obligatorio estudiar a detalle el metabolismo de
estos microorganismos y su regulación. Dada la enorme diversidad metabólica microbiana
representa por un lado un abanico de oportunidades para su aplicación biotecnológica y a la
vez un reto científico para su completa caracterización. En este sentido la aplicación de
estrategias de Ingeniería de vías metabólicas ha generado desarrollos de aplicación tales
como la síntesis de metabolitos de interés en la industria alimentaria, farmacéutica y química.
Además ha generado importante información a nivel de enzimas metabólicas clave, vías
metabólicas y metabolismo global. Con lo anterior este curso está enfocado a estudiar el
metabolismo microbiano asociado con las características de promoción del crecimiento
vegetal y de biocontrol de agentes fitopatógenos de una forma holística, en la cual se integre
información transcriptómica, proteómica, fluxómica, metabolómica, etc. Dicha integración
tendrá como finalidad el entendimiento fino de la interacción benéfica planta-microorganismo
y permitirá un diseño racional de metabotipos microbianos que atiendan las necesidades
agrícolas y ambientales emergentes.
Índice temático:
1. Metabolismo microbiano central y energético.

2. Metabolismo secundario y su regulación.
3. Metabolismo microbiano asociado a la promoción del crecimiento vegetal.
4. Metabolismo microbiano asociado al biocontrol de fitopatógenos.
5. Aplicación de estrategias de Ingeniería Genética en la construcción de
organismos recombinantes. Sistemas de integración e interrupción de genes a
112


nivel cromosomal. Evolución de Proteínas. Ingeniería de promotores.
Recombineering.
6. Ingeniería metabólica tradicional, de evolución e inversa.
7. Análisis de flujos metabólicos.
8. Ingeniería metabólica y biología de sistemas.
9. Diseño racional de metabotipos microbianos.

• Smolke, C. 2010. The Metabolic Engineering Handbook. Volumen1. Fundamentals,

Tools & Applications, CRC Press, Boca Raton, FL.
• Stephanopoulos, G. N.,Aristidou, A. 1998 Nielsen, J. Metabolic Engineering,Academic
Press, N.Y.
• Fu, P., Panke, S. 2009. Systems biology and Synthetic Biology. 1ª Edición. Wiley. New
Jersey.
• Ahmad, I., Pichtel, J., Hayat, S. 2008. Plant-Bacteria Interactions. Strategies and
Techniques to Promote Plant Growth, Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim.
• de Bruijn, FJ. 2011. Handbook of molecular microbial ecology I : metagenomics and
complementary approaches. Wiley-Blackwell. Hoboken, New Jersey
113


Bio-georeferenciación

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFE-4
• Asignatura: específica

Descripción de la asignatura: Aplicar la técnica de georeferenciación en la conservación de

la biodiversidad. Georeferenciación: relación de información a su localidad geográfica. Al
finalizar el curso, el estudiante tendrá un conocimiento general de qué es la georeferenciación
y la manera en la que esta técnica se puede aplicar en la conservación de la biodiversidad de
nuestro planeta.
Índice temático:
1. Introducción a la georeferenciación. Definición de georeferenciación. Tipos de

información geográfica. Cartografía y sistemas de información geográfica. Fuentes de
información geográfica. INEGI, CONABIO, IUCN, NASA.. Catálogos de localidades. Bases
de datos taxonómicos
2. Sistemas de información geográfica. Usar algunos programas de cómputo para el
manejo y edición de información tabular y geográfica. Diva GIS. Manifold GIS. Arc GIS.
SIIGE e IRIS. Otros sistemas de información geográfica.
3. Georeferenciación práctica. Precisión de datos de localidades. GPS, coordenadas,
datum, elevación. Métodos para georeferenciar. Georeferenciación de puntos
(práctica). Georeferenciación de puntos antiguos (práctica). Georeferenciación de
áreas (práctica). Google earth (práctica).El deporte de los geógrafos Geocaching.
4. Aplicaciones de datos georeferenciados en ecología, evolución y biodiversidad.
Datos georeferenciados en estudios de ecología, evolución y biodiversidad. Predicción
de la distribución de especies usando el modelado de nicho ecológico (práctica).
Análisis de la evolución del nicho en especies (práctica). Evolución de la biodiversidad
y sus correlaciones ecológicas, ambientales y evolutivas (práctica).
• Chapman, A.D. and J. Wieczorek (eds). 2006. Guide to Best Practices for
Georeferencing. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility.
114


• Gaston, K. J. & J. I. Spicer. 2004. Biodiversity: An introduction. Second Edition.
Blackwell Publishing. Malaysia.
• Hijmans, R.J., Guarino, L., Bussink, C., Mathur, P., Cruz, M., Barrentes, I. and Rojas, E.
2005. DIVA-GIS Version 5.2 A geographic information system for the analysis of
biodiversity data.
• Hill, L. L. 2006. Georeferencing: the geographic associactions of information.
Massachusetts Institute of Technology. Cambridge.
• Museum of Vertebrate Zoology. 2006. MVZ Guide for Recording Localities in Field
Notes. Wieczorek, J. 2001. MaNIS/HerpNet/ORNIS Georeferencing Guidelines.

115


Biología comparada

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFE-5

Descripción de la asignatura: La biología comparada estudia la diversidad de estructuras,
funciones y organismos, tomando en cuenta sus cambios temporales y espaciales. Al analizar
la diversidad de especies y taxones superiores, nos permitirá comprender los procesos y
patrones evolutivos. Basándonos en la sistemática biológica y en un enfoque
multidisciplinario (biogeografía, paleontología y embriología) nos permitirá introducirnos en
estudios de biología comparada.
Índice temático:
1. Introducción y conceptos básicos. Biología evolutiva. Biología comparada. Historia y

escuelas de la sistemática biológica. Sistemática filogenética. Construcción de
cladogramas. Determinación de estados plesiomórficos y apomórficos. Métodos de
reconstrucción. Optimización. Cladogramas de consenso. Cladogramas y confianza.
2. Especies y especiación. Conceptos de especie. Hibridación y especies cripticas.
Subespecies. Modelos de especiación. Límites entre especies mediante análisis
filogenéticos.
3. Clasificación filogenética. Clasificación. Jerarquía. Subordinación y secuenciación,
sedis mutabilis e incertae sedis. Taxones fósiles. Híbridos.
4. Coevolución, adaptación y etología. Conceptos de coevolución. Filogenia y
coevolución. Diversificación adaptativa. Convergencia adaptativa. Constreñimientos
filogenéticos. Diversificación etológica.
5. Paleontología. Fósiles y ancestros. Grupos tronco y corona. Estratigrafía.
6. Ontogenia. Desarrollo ontogenético. Constreñimientos del desarrollo. Heterocronía
(peramorfosis y pedomorfosis).
7. Biogeografía y conservación. Biogeografía cladística. Cladogramas taxonómicos,
resueltos y generales de área. Métodos. Filogeografía. Biogeografía de la conservación.
Índices de peso taxonómico y divergencia taxonómica. Dispersión taxonómica.
Complementariedad.
116


• Avise, J. C. 2004. Molecular markers, natural history and evolution. Sinauer Associates
, Inc. Publishers. 2nd Edition. 684pp.
• Avise, J.C. 2000. Phylogeography. The history and formation of species. Harvard
University Press. USA.
Press, 668 p.
• Cracraft, J. and M. J. Donoghue. 2004.Assembling the tree of life, Oxford University
Press, Oxford,
• Eldredge, N. and J. Cracraft. 1980. Phylogenetic patterns and the evolutionary process.
• Felsenstein, J. 2004. Inferring phylogenies, Sinauer, Sunderland, Massachusetts.
• Forey, P. L., C. J. Humphries, I. L Kitching, R. W. Scotland, D. J. Siebert and D. M.
Wiiliams. 1992. Cladistics. A practical course in systematics. The Systematics
Association, Publicación No. 10.
• Hennig, W. 1966. Phylogenetic Systematics. University of Illinois Press. 263 pp.
• Howard, D. J. and S. H. Berlocher (eds) 1998. Endless Forms: Species and Speciation.
Oxford University Press, New York, New York. 470 pp.
• Humphries, C. J., Parenti, L. R., and C. J. Humphries, C.J. 1999. Cladistic Biogeography:
Interpreting Patterns of Plant and Animal Distributions. Oxford University Press,
Oxford.
• Kitching, I. A., Forey, P. L, Humphries, C. J, and D. M. Williams. 1998. Cladistics: The
• Lecointre, G. and H. Le Guyader. 2006.The tree of life: A phylogenetic classification,
Harvard University Press,
• Lipscomb, D. 1998. Basic Cladistic analysis. Washington D. C. George Washington
University.
• Llorente, J. e I. Luna (eds.). 1994. Taxonomía biológica. Fondo de Cultura Económica-
UNAM, México, D.F.
• Morrone, J. 2000. El lenguaje de la cladistica. 1ª. Edición. Dirección General de
Publicaciones y Fomento editorial, UNAM, México. D. F. 109 pp.
117


• Morrone, J. 2001. Sistemática, Biogeografía y Evolución. Los patrones de la diversidad
en tiempo-espacio. Las prensas de Ciencias, UNAM. Facultad de Ciencias, UNAM.
124pp
• Morrone, J. J. 2009. Evolutionary biogeography: An integrative approach with case
studies, Columbia University Press, Nueva York
• Nelson, G. and N. Platnick. 1981. Systematics and biogeography: Cladistics and
vicariance. Columbia University Press. New York. 567pp.
• Schuh, R. T. 2000. Biological systematics: Principles and applications. Comstock
Publishing Associates, Cornell University Press, Ithaca y Londres.
• Wheeler, Q. D., and R. Meier (eds). 2000. Species concepts and phyylogenetic theory.
• Wiens, J. J. 2000. Phylogenetic analysis of morphological data. Smithsonian Institution
Press.
• Wiley, E. 1981. Phylogenetics: The theory and practice of phylogenetic systematics.
John Wiley and Sons Inc. New York. 439pp.
• Wiley, E. O., D. Siegel-Causey, D. R. Brooks and V. A. Funk. 1991. The compleat cladist:
A primer of phylogenetic procedures. Kansas. University of Kansas Museum of Natural
History. No. Special 19: 1-158pp.
• Winston, J. E. 1999. Describing species: Practical taxonomic procedure for biologists.

118


Diversidad Bacteriana

• Teoría: 10
• Práctica:
• Autoestudio: 6
• Clave: AFE-6

Descripción de la asignatura. La transferencia horizontal de genes es un proceso que
permite la movilidad de información genética y con ello, nuevas oportunidades para la
colonización de nuevos nichos, actuando como un proceso catalizador de la adaptación y
evolución de las especies. Por otro lado, los mecanismos de Mutagénesis de Fase Estacionaria
(Mutación Adaptativa) y Mutagénesis Asociada a la Transcripción, son procesos que
contribuyen a la adaptación y evolución de los organismos vivos en sus ambientes naturales y
que además podrían tener implicaciones en el aumento de la diversidad genética en células
diferenciadas desarrollo del cáncer y envejecimiento celular. Por lo anterior, el presente
programa está orientado al estudio de dichos mecanismos, permitiendo al alumno un mejor
entendimiento de los procesos de adaptación y evolución bacteriana.
Índice temático:
1. Transferencia Horizontal de Genes. Implicaciones en procesos evolutivos.

Contribución a la generación de diversidad bacteriana.
2. Mantenimiento de plásmidos entre poblaciones bacterianas: Eficiencia de
autotransferencia. Genes con ventaja selectiva. Regulación de la síntesis del
aparato conjugativo. Mutaciones compensatorias. Transferencia entre especies.
Formación de biopelículas.
3. Procesos involucrados en la generación de diversidad génica. Transferencia
Horizontal de genes. Duplicación de Genes. Rearreglo de genes. Diversidad génica
y Recombinación.
4. Mutagénesis de Fase Estacionaria. Modelos de estudio. Factores Implicados.
Teoría de la Hipermutabilidad Transitoria. Mutagénesis Asociada a la
Transcripción.

Bibliografía básica.
119


• Francino, P. M (Ed). 2012. Horizontal Gene Transfer in Microorganisms. Caister
Academic Press. 202pp.
• Robleto E.A., Yasbin R., Ross C., and M. Pedraza-Reyes. 2007. Stationary Phase
Mutagenesis in B. subtilis: A Paradigm to Study Genetic Diversity Programs in Cells
Under Stress. Crit. Rev. Biochem. Molecular Biology 42: 327–339.
• Yasbin, R. E., and M. Pedraza-Reyes. 2004. Stationary phase-induced mutagenesis: is
directed mutagenesis alive and well within neo-Darwinian theory. In R. Miller (ed.),
Microbial evolution: gene establishment, survival, and exchange. ASM Press,
Washington, DC.
• Cairns, J., J. Overbaugh, and S. Miller. 1988. The origin of mutants. Nature 335: 142–
145.
• Kasak, L., R. Horak, and M. Kivisaar. 1997. Promoter-creating mutations in
Pseudomonas putida: a model system for the study of mutation in starving bacteria.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94: 3134–3139.
• Halas, A., H. Baranowska, and Z. Policinska. 2002. The influence of the mismatch repair
system on stationary-phase mutagenesis in the yeast Saccharomyces cerevisiae. Curr.
Genet. 42: 140–146.

120


Evolución y diversidad de invertebrados

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFE-7

Descripción de la asignatura: Los primeros restos de muchos filos animales modernos

(metazoa: eucarionte, heterotrófos, multicelulares se que alimentan por ingestión) se
remontan a época de Edicara, y con ello la aparición de los animales caracterizados por la
ausencia de vertebras. Los invertebrados son el resultado de millones de años de evolución
sobre el planeta, de los más numerosos y habitan casi todos los ambientes desde el marino,
estuarino, aguas epicontinentales hasta el terrestre, con formas de vida libre y parásitas. El
curso se reconocerá de manera global la diversidad de invertebrados, los patrones evolutivos
más importantes en arquitectura corporal, desarrollo, ciclos de vida, análisis sobre las
diferentes hipótesis sobre su origen y radiación evolutiva. Finalmente, se hará una reflexión y
en el contexto actual de su conservación y paralelamente, explorar su utilidad,
aprovechamiento y nocividad para grupos selectos de invertebrados.
Índice temático:
1. Introducción y origen de los eucariontes: El árbol de la vida y la multicelularidad:

filogenias génicas y organismicas. Registro fósil. Orígenes inciertos, orígenes
independientes, orígenes mixtos.
2. La arquitectura animal general y su organización: Simetría corporal, celularidad,
tamaño corporal, hojas embrionarias y cavidades corporales. Locomoción y
transporte, alimentación, excreción y osmorregulación, respiración.
3. Desarrollo animal, ciclos de vida, patrones: Huevo y embriones. Desarrollo y ciclo
de vida. Reproducción y sexualidad. Genes y desarrollo animal. Evolución de la
arquitectura corporal animal: aparición del sistema nervioso y órganos.
4. Diversidad taxonómica de los animales (excepto vertebrados): Origen y
diversidad de los grupos basales de los metazoarios. Hipótesis filogenéticas
alternativas y controversias. ¿Radiata vs. bilateria? Origen y diversidad de los grupos
bilateria. Metazoarios: Ej. Acoela, Nemertodermatida, Gastrotricha, Gnathostomulida,
Cycliophora, Ectoprocta, Entoprocta, Orthonectida, Cycliophora, Ectoprocta,
121


Entoprocta, Orthonectida, Rhombozoa, Nemertea, Phoronozoa, Mollusca, Annelida,
Loricifera, Sipuncula, Priapulida, Nematoda, Nematomorpha, Tardigrada,
Onychophora, Platyhelminthes, etc.
5. Síntesis y perspectivas: Novedades evolutivas y perspectivas. Utilidad,
aprovechamiento y nocividad. Patrones de diversidad mundial y conservación de
invertebrados.

• Ax, P. 2000. Multicellular animals. The phylogenetic system of the Metazoa, vo. II.
Springer, Verlag, Berlin.
• Brusca, R. C. and G. J. Brusca. 2003. Invertebrates, 2nd ed. Sinauer Associates,
Sunderland.
• Cracraft, J. and M. J. Donoghue. 2004. Assembling the tree of life, Oxford University
Press, Oxford.
• Koenemann, S. and R. A. Jenner (eds.). 2005. Crustacea and arthropod relationships. ,
Taylor & Francis Group, Boca Raton.
• Lecointre, G. and H. Le Guyader.2006 The tree of life. A phylogenetic classification.
Harvard University Press, Cambridge.
• Minelli, A. 2009. Perspectives in animal phylogeny and evolution, Oxford University
Press, Oxford.
• Nielsen, C. 2001. Animal evolution. Interrelationships of the living phyla, 2da ed.
Oxford University Press, Oxford.
• Valentine, J. W. 2004. On the origin of phyla. The University of Chicago Press, Chicago.
614pp.

122


Evolución y diversidad de vertebrados

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFE-8

Descripción de la asignatura: Los vertebrados (Vertebrata) se originaron durante la

explosión cámbrica, a principios del Paleozoico, es un grupo muy diverso que incluye desde
las lampreas hasta el hombre. Se caracterizan principalmente por una columna vertebral. La
evolución desde los primeros vertebrados hasta los que actualmente viven ha sido un proceso
con etapas claves como la aparición de mandíbulas, osificación del esqueleto, y aparición de
extremidades, entre otras. Al finalizar el curso, el estudiante habrá comprendido la evolución,
la importancia biológica y el estado del conocimiento de este grupo de organismos.
Índice temático:
1. Generalidades de vertebrados: Clasificación tradicional y filogenética.

Características generales de los grandes grupos (Hyperoartia, Chondrichtyes,
Actynoptherygii y Sarcopterygii)
2. Evolución de los vertebrados: Etapas claves en la evolución de los grupos, aparición
de mandíbulas, osificación del esqueleto, evolución de extremidades, invasión al
medio terrestre, aparición del huevo amniota.
3. Adaptación y diversificación de los grandes grupos. Diversificación de los
vertebrados a lo largo de la historia. Diferencias en hábitats, número de especies,
reproducción y aprovechamiento de nichos. Ectotermia y endotermia.
4. Grupos extintos de vertebrados. Registro fósil y extinciones de vertebrados.
Declinación de vertebrados en la actualidad.
5. Patrones de diversidad mundial y su comparación con la diversidad en México.
Diversidad mundial. Conocimiento actual de los vertebrados de México.
6. Herramientas para el conocimiento de la diversidad de vertebrados.
Documentación y registro de organismos. Descripción de nuevas especies. Lista Roja.
Iniciativas de Conservación.
123


Bibliografía Básica:
• Carroll, R. L. 1988. Vertebrate Paleontology and Evolution. W. H. Freeman & Co.

• Bellairs, A. de A. 1969. The life of reptiles. London, Widenfeld & Nicholson.
• Boitani, L. and T. K. Fuller. 2000. Research techniques in animal ecology:
controversies and consequences. Columbia University Press.
• Gergus, E. W. A. and G. W. Schuett. 2000. Labs for vertebrate zoology: an evolutionary
approach. Traverse City, MI, Cooper Publishing Group, LLC.
• Halliday, T. and K. Adler. 2002. Firefly Encyclopedia of Reptiles and Amphibians.
Firefly books LTD.
• Hickman, C. P., L. S. Roberts, et al. 1993. Integrated principles of zoology. St. Louis,
Mosby.
• Hickman, C. P., L. S. Roberts, et al. 2000. Animal diversity. Boston, McGraw-Hill.
• Kardong, K. V. 2003. Vertebrados. Anatomía comparada, función y evolución. McGraw-
Hill Interamericana. 4th ed.
• Kardong, K. V. 2008. Vertebrates. McGraw-Hill. 5a. Ed.
• Krebs, C. J. 1999. Ecological methodology. Wesley Adison. 2da Ed.
• Mcdonald, D. 1985. The Encyclopedia of Mammals. Facts on File.
• Pough, F.H., Heiser, J.B. and Mcfarland, W. N. 2008. Vertebrate life. Prentice Hall
International. 8th ed.
• Perrins, C. 2003. Firefly encyclopedia of Birds. Firefly Books LTD.
• Pough, F. H. 2003. Herpetology. Prentice Hall. 3rd ed.
• Randall, D. J., W. W. Burggren, et al. 1997. Eckert animal physiology: mechanisms and
adaptations. New York, W.H. Freeman and Co.
• Vaughan, T. A., J. M. Ryan and N. J. Czaplewski. 2011. Mammalogy. 5th Edition. Jones &
Bartlett Learning.
• Winston, J. E. 1999. Describing species: Practical taxonomic procedure for biologists.

124


Interacciones simbióticas

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFE-9

Descripción de la asignatura: La simbiosis es una de las fuerzas motrices de la evolución. El

presente curso hará una revisión desde los conceptos básicos, fundamentos y análisis de
literatura especializada sobre las diferentes relaciones simbióticas, grupos representantes,
ciclos de vida y evolución de la diversidad simbiótica. Profundizará sobre las hipótesis de la
evolución y diversidad de organismos simbióticos. Finalmente, se analizará y promoverá la
investigación de las interacciones simbióticas en el mundo actual, mostrando una galería de
ejemplos concretos de coevolución enfocados al sistema hospedero-parásito en metazoarios.
Índice temático:
1. Simbiosis en la evolución temprana de la vida: teorías sobre el origen de la vida.

Definición de simbiosis. Introducción a la teoría endosimbiótica. La simbiogénesis
Endosimbiosis seriada. Obteniendo genomas.
2. Conceptos básicos e Interacciones entre las comunidades: Interrelaciones
positivas (Foresis, Comensalismo, Inquilinismo, Metabiótico, Mutualismo no
obligatorio o Protocooperación, Simbiosis) e Interrelaciones negativas (Amensalismo,
Competencia, Depredación, Parasitismo, Parasitoidismo).
3. Cooperación y evolución. Origen de las interacciones simbióticas. Teorías sobre el
origen del sexo y reproducción. Teorema de Fisher. Hipótesis de la Reina roja.
4. Interacciones: Microorganismos simbióticos. Interacciones entre microorganismos y
plantas. Líquenes y las micorrizas. Corales. Interrelaciones intraespecíficas.
Asociaciones coloniales. Asociaciones Gregarias. Asociaciones Estatales.
Territorialidad. Relaciones de convivencia. Técnicas generales de obtención de
organismos simbióticos. Del antagonismo al mutualismo. Polinizadores: Recompensas,
beneficios y engaños.
5. Interacciones simbióticas parásito-hospedero: coespeciación parasito- hospedero.
El arte de ser un parásito. Parasitismo accidental, ocasional o facultativo. Tipos de
parasitismos en función del origen de su alimentación. Especificidad parasitaria.
125


Monoxenias o heteroxenias. Vectores. Zoonosis. Breve introducción a la ecología de
parásitos.
6. Coevolución parásito-hospedero. Conceptos básicos en coevolución. Coevolución
específica o difusa. Coevolución de escape y radiación. Especificidad, Reciprocidad y
Simultaneidad. Coespeciación por descendencia o Colonización. Adaptación.
Coevolución gen-a-gen. Filogenias y coevolución. Análisis de parsimonia de Brooks y
árboles reconciliados. Sistemática, biogeografía y conservación de invertebrados
parásitos.

• Abrahamson W.G. y A. E. Weis 1997.Evolutionary ecology across three trophic levels.

Princeton University Press, Princeton.
• Ax, P. 2000. Multicellular animals. The phylogenetic system of the Metazoa, vo. II.
Springer, Verlag, Berlin.
Press, 668 p.
• Brusca, R. C. y G. J. Brusca. 2003. Invertebrates, 2nd ed. Sinauer Associates,
Sunderland.
• Bush A.O. et al. 2001 Parasitism: the Diversity and Ecology of Animal Parasites.
Cambridge University Press.
• Coyne J. A. y H. A. Orr. 2004. Speciation. Sinauer, Sunderland, Massachusetts.
• Cracraft, J. y M. J. Donoghue. 2004. Assembling the tree of life. Oxford University Press,
Oxford.
• Douglas, A. E. 1994. Symbiotic interactions. Oxford University Press.
• Freeman, S., and J. C. Herron. 2001. Evolutionary analysis. 2nd edition. Englewood
Cliffs, N. J. Prentice Hall.
• Gregory. T. R. 2005. Evolution of the Genome. Elsevier, San Diego.
• Hickman, C. P., L. S. Roberts, et al. 2000. Animal diversity. Boston, McGraw-Hill.
• Kozo-Polyansky, B. M., L. Margulis, V. Fet and Peter H. Raven.2010. Symbiogenesis: A
New Principle of Evolution. Harvard University Press, Cambridge, MA
• Lecointre, G. y H. Le Guyader. 2006. The tree of life: A phylogenetic classification.
Harvard University Press,
• Lynch, M. 2007. The origins of genome architecture. Sinauer Associates, Sunderland,
Massachusetts, USA.
• Margulis, L. 1999. Symbiotic Planet: A New Look At Evolution. Basic Books.
• Margulis, L. and D. Sagan. 1990. Origins of Sex: Three Billion Years of Genetic
Recombination. Yale University Press; Edición: New edition
126


• Margulis, L. and D. Sagan. 2002. Acquiring genomes: a theory of the origins of species.
Basic Books. New York, NY, USA. 240pp.
• Margulis, L. y Schwartz, K. 1985. Cinco reinos: guía ilustrada de los phyla de la vida en
la Tierra. Labor, Barcelona.
• Minelli, A. 2009.Perspectives in animal phylogeny and evolution. Oxford University
Press, Oxford.
• Nielsen, C. 2001. Animal evolution. Interrelationships of the living phyla. 2da ed.
Oxford University Press, Oxford.
• Price, P. W. 2003. Species interactions and the evolution of biodiversity. C. M. Herrera
and. O. Pellmyr (eds).
• Roberts L. S. and Janovy, J. 2000. Foundations of Parasitology. McGraw Hill.
• Sapp, J. 1994.Evolution by association. A history of symbiosis. Oxford Univ. Press,
Oxford, pp. 256.
• Strauss, S. y A. R. Zangerl. 2002. Plant-insect interactions in terrestrial systems.
Goldenrods, galimakers and natural enemies, In. Herrera, C.
• Williams, G. C. 1992. Natural Selection, Oxford University Press.

127


Sistemática molecular

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFE-10

Descripción de la asignatura: Introducir al estudiante en las técnicas y métodos utilizados
en la sistemática molecular. Brindar al estudiante los elementos necesarios para la
interpretación de los datos moleculares, con énfasis en la sistemática filogenética. El alumno
al final el curso manejara los conceptos básicos y terminología. Reconocerá algunos de los
métodos de análisis actuales de la sistemática molecular, así como su literatura. Utilizara
algunas herramientas informáticas para la construcción de árboles filogenéticos.
Índice temático:
1. Introducción a la sistemática molecular. Breve historia. Controversias. Conceptos

básicos, ácidos nucleicos: estructura y función. Genes ortólogos, parálogos y
xenólogos. Árboles de genes y árboles de especies. Transporte horizontal,
polimorfismo y sorteo de linajes.
2. Técnicas y marcadores moleculares. Planteamiento del problema. Recolección y
preservación de tejidos. Diferentes marcadores moleculares: genes ribosomales y
mitocondriales. Estructura del genoma. Cromosomas y proteínas. Hibridización DNA-
DNA. RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism). RAPD (Random
Amplification of Polymorphic DNA). AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism
PCR). Reacción en cadena de la polimerasa (PCR, por sus siglas en inglés).
Secuenciación de ácidos nucléicos.
3. Alineación de secuencias. Homología en datos moleculares. Obtención de secuencias
y bases de datos (GenBank, EMBL, etc.). Basic Local Alignment Search Tool (BLAST).
Tipos de alineamiento. Análisis de las secuencias. Gaps. Variabilidad de secuencias y
rango taxonómico a analizar.
4. Filogenias moleculares: Parsimonia. Criterio de optimización: máxima parsimonia.
Estrategias en la búsqueda de árboles de máxima parsimonia. Árboles de consenso y
apoyo de ramas. Longitud del árbol, cálculos de los índices de consistencia y de
homoplasia. Análisis de secuencias nucleotídicas por medio de algunas herramientas
bioinformáticas.
128


5. Análisis de similitud y modelos de sustitución. Criterio de optimización: distancia.
Métodos de distancia (UPGMA, mínima evolución y neighbor-joining). Modelos de
sustitución: Jukes-Cantor, Kimura81, Felsenstein81, HKY85 y GTR. Modelos de
sustitución para aminoácidos y codones.
6. Filogenias moleculares: máxima verosimilitud. Criterio de optimización: maximum
likelihood. Selección de modelo de substitución. Métodos de máxima verosimilitud.
Similitudes y diferencias con parsimonia.
7. Filogenias moleculares: análisis bayesiano. Criterio de optimización: Análisis
Bayesiano. Método de Inferencia Bayesiana. Relación con máxima verosimilitud.
Parsimonia o probabilidad.
8. Incongruencia en particiones moleculares. Variabilidad de secuencias y rango
taxonómico a analizar. Congruencia taxonómica o análisis separados. Evidencia total o
congruencia de caracteres. Combinación condicionada.
9. Tendencias actuales. Importancia del uso de las secuencias de ADN en las tendencias
actuales para el estudio de la diversidad biológica: evolución de genes, medicina, reloj
molecular. Análisis filogeográfico. Filogeografía comparada y biodiversidad.
Taxonomía molecular, códigos de barra, delimitación de especies, filogenia,
biogeografía y conservación.

• Avise J.C. 2000. Phylogeny: The history and formation of species. Harvard University
Press, Cambridge, Massachusetts.
• Avise, 1994. Molecular markers natural history and evolution. Sinauer.
• Cracraft, J. y M. J. Donoghue. 2004. Assembling the tree of life, Oxford University Press,
Oxford.
• Dale, J. W. y Malcolm von Schantz. 2002. From genes to genomes. Concepts and
applications of DNA Technology, Ed. Jhon Wiley and Sons, Ltd., USA.
• Felsenstein, J. 2004. Inferring phylogenies, Sinauer Associates, Inc., Sunderland, MA,
• Freeman, S. and J. C. Herron. 1998. Evolutionary Analysis. Prentice Hall.
• Hall, B. G. 2008. Phylogenetic trees made easy. 2a ed. Sinauer.
• Hall, B. G. 2001. Phylogenetic trees made easy. A how-to manual for molecular
biologists. Sinauer Associates, Inc., Sunderland, Massachusetts. 179 pp.
• Kitching, I.A., Forey, P.L, Humphries, C.J, and D. M. Williams. 1998. Cladistics: The
• Lemey, P., Salemi, M. y A. M. Vandamme (eds.) 2009. Phylogenetic handbook: a
practical approach to phylogenetic analysis and hypothesis testing. Segunda edición,
Cambridge University Press, Cambridge.
129


• Lewis. O. P. 1998. Maximum likelihood as an alternative to parsimony for inferring
phylogeny using nucleotide séquense data. En: Molecular systematics of plants II, DNA
sequencing. Eds, D. E. Soltis, P.E. Soltis y J. Doyle. Capítulo 5.
• Li, W. 1997. Molecular Evolution. Sunderland: Sinauer Associates.
• Lynch, M. 2007. The originis of genome architecture. Sinauer Associates, Sunderland,
Massachusetts, USA.
• Morrone, J. J. 2000. El lenguaje de la cladística. Universidad Autónoma de México.
México. 109 pp.
• Mount, D. W. 2001. Bioinformatics. Sequence and genome analysis. Cold Spring Harbor
Laboratory Press, New York, USA.
• Nei, M. and S. Kumar. 2000. Molecular Evolution and Phylogenetics. , Oxford University
Press, Oxford.
• Page, R. D. M. and E. C. Holmes. 1998. Molecular Evolution. A phylogenetic approach.
Blackwell Science, Oxford. 346 pp.
• Soltis, D.E., P.S. Soltis, and J. J. Doyle. 1998. Molecular Systematics of Plants II. DNA
Sequencing. Kluwer Academic Publishers, Boston, USA.

130


Microbiología molecular

• Teoría: 10
• Práctica: no
• Autoestudio: 6
• Clave: AFE-11

Descripción de la asignatura: El estudio de la Microbiología mediante el uso de técnicas de

Biología Molecular se ha incrementado significativamente en las últimas décadas, de manera
que el desarrollo d técnicas moleculares específicas para la manipulación genética de los
microorganismos es un tema emergente. Es por eso que los temas incluidos en el presente
programa abarcan los fundamentos de los métodos clásicos de biología molecular utilizados
en microorganismos representativos de los dominios de la vida Bacteria y Archaea que
permitirán al alumno reforzar los conocimientos de genética clásica de los microorganismos
y métodos emergentes desarrollados para su estudio. Además, comprenderá los Fundamentos
de las Técnicas más utilizadas para el estudio de la microbiología Molecular y sus aplicaciones.
Índice temático:
1. Genética molecular de los microorganismos. Análisis del contenido

guanina+citosina del DNA. Análisis de composición de bases mediante reasociación de
DNA-DNA. Análisis de composición de bases mediante secuenciación de rRNAs.
2. Análisis de ácidos nucleicos. Análisis de secuencias de DNA y métodos de
secuenciación. Análisis de uniones DNA-proteína. Ensayos de protección de DNA
(footprinting). Mapeo de RNA transcrito.
3. Mutagénesis por transposones. Mecanismo de movilización de elementos transponibles.
Transposón Tn5 como modelo de estudio. Mutación mediada por transposones. Mutagénesis
aleatoria mediada por el transposón Tn5. Vectores suicidas del fago lambda. Vectores suicidas
plasmídicos. Mapeo de mutaciones por inserción inducidas por Tn5. Clonación de genes
mutados por Tn5. Mutagénesis dirigida mediada por el transposón Tn5. Vectores utilizados.
Mapeo de inserción de plásmidos. Vectores de remplazamiento génico. Uso de transposones
derivados del transposón Tn5.
4. Estudio molecular de DNA plasmídico. Características de los plásmidos bacterianos.
Usos y aplicaciones de los plásmidos. Caracterización molecular de plásmidos
bacterianos. Tamaño. Número de Copias. Composición de bases. Replicación y
mantenimiento de funciones. Incompatibilidad. Nuevas aplicaciones del DNA
plasmídico.
131


5. Transferencia de genes en bacterias Gram-negativas. Integración de DNA exógeno
en el cromosoma bacteriano. Recombinación homóloga (sistema RecA).
Recombinación no homóloga. Sistemas de recombinación en bacteriófagos. Métodos
para la introducción de DNA a sitios específicos en el cromosoma bacteriano.
Introducción de genes utilizando plásmidos como vectores. Introducción de DNA
exógeno mediante transducción. Transferencia de DNA por transducción en E. coli.
Transferencia de DNA por transducción en otros sistemas bacterianos. Aplicaciones.
Introducción de DNA exógeno mediante transformación. Fundamentos y métodos
para la introducción de DNA exógeno. Aplicaciones. Transferencia de DNA mediante
conjugación.
6. Intercambio genético entre bacterias Gram-positivas. Mecanismos de
transferencia de genes y sus aplicaciones. Conjugación. Transducción. Transformación.
Transferencia de genes en varios grupos de bacterias Gram positivas. Streptococos.
Estafilococos. Enterococos. Lactococos y bacterias fermentativas relacionadas. Bacilli.
Clostridia. Micobacterias. Actinomicetos.
7. Genética molecular del grupo Archaea. Microorganismos halofílicos. Introducción.
Cultivo y técnicas de transformación. Vectores utilizados para transformación.
Microorganismos metanogénicos. Cultivo y técnicas de transformación. Vectores
utilizados para la transformación. Microorganismos. Hipertermofílicos. Cultivo y
técnicas de transformación. Vectores utilizados para la transformación.
8. Manipulación genética mediante la utilización de fagos. Introducción a la genética
de fagos y sus aplicaciones. Aislamiento y caracterización de fagos. Construcción de
librerías genómicas. Utilización de los fagos como vectores.

• Gerhardt P., R.G.E. Murray. W.A. Wood, and N. R. Krieg. 1994. Methods for General and
Molecular Bacteriology. American Society of Microbiology. Washington D.C.
• Reddy C.A., T.J., Beveridge, J.A., Breznak, G.A. Marzluf, T.M., Schmidt, and L.R. Snyder.
2007. Methods for General and Molecular Microbiology. 3rd. Edition. ASM Press.
Washington D.C.
• Summers, D.K. 1996. The Biology of Plasmids. Blackwell.Science Ltd., Oxford, Unidted
Kingdom.
• Sambrook, J., and Russell. 2001. Molecular Cloning: a laboratory Manual. 3rd. ed. Cold
Spring Harbor Laboratory Press , Cold Spring Harbor, NY.
• Sonenshein A.L., J.A. Hoch., and R. Losick. 1993. Bacillus subtilis and Other Gram
Positive bacteria: Biochemistry, Physiology, and Molecular Genetics. ASM Press,
Washington. DC.
• Sonenshein A.L., J.A. Hoch., and R. Losick. 1993. Bacillus subtilis and Its Closest
Relatives: from Genes to Cells. ASM Press, Washington. DC.

132


Inmunobiología

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFE-12

Descripción de la asignatura. Este curso se dirige a estudiantes de posgrado para

prepararlos en el campo de la investigación y docencia en el área. Y se propone que los
estudiantes al finalizar el curso, conozcan y comprendan los conceptos básicos de la Biología
Celular y Molecular del desarrollo de sistema inmune, manejen los conceptos de inmunidad
frente a las infecciones y conozcan las herramientas de laboratorio que son utilizadas en la
Inmunobiología.
Índice temático:
1. Introducción e historia de la inmunología. Conceptos básicos de inmunobiología.

Científicos que han aportado su creatividad al conocimiento de esta ciencia y premios
Nobel.
2. Órganos linfoides, células de la respuesta inmune y productos solubles. Células
del sistema inmune. Células madre pluripotenciales. Órganos linfoides primarios y
secundarios. Productos solubles.
3. Respuesta inmune innata. Barreras físicas, químicas y biológicas. Reconocimiento de
los mecanismos de la respuesta inmune innata. Sistema del complemento. Fagocitosis
e inflamación.
4. Respuesta inmune adaptativa. Respuesta inmune humoral (estructura general
anticuerpos, propiedades biológicas, diversidad). Respuesta inmune celular.
Receptores de antígenos. Interacción con el anticuerpo.
5. Procesamiento y presentación de antígenos. Procesamiento y presentación de
antígeno. Complejo mayor de histocompatibilidad.
6. Modulación del sistema inmune. Regulación de interacción antígeno-anticuerpo.
Citocinas. Modulación de la respuesta inmune por Th1 y Th2. Red de regulación del
sistema inmune-endocrino y nervioso.
7. Respuesta inmune contra infecciones bacterianas. Diferencias entre la respuesta
inmune a bacterias intracelulares e intercelulares. Evasión bacteriana a los
133


mecanismos de defensa del huésped. Contribución de la respuesta inmune a la
patogénesis bacteriana.
8. Respuesta inmune contra infecciones parasitarias. Diferencias entre los distintos
tipos de parásitos (protozoarios / helmintos). Evasión del sistema inmune por
parásitos. Enfermedades causadas por protozoarios. Enfermedades causadas por
helmintos.
9. Respuesta inmune contra infecciones provocadas por hongos. Clasificación de
enfermedades por hongos. Control de la inmunidad innata a las infecciones por
hongos. Inmunidad adquirida contra hongos.
10. Respuesta inmune contra infecciones virales. Composición viral, Virus
neutralizados por anticuerpos. Importancia de la inmunidad mediada por células para
el control viral. Evasión de los virus a los mecanismos de defensa del huésped.
11. Cáncer. Origen y terminología. Transformación maligna de células. Oncogenes e
inducción del cáncer. Tumores del sistema inmune. Antígenos tumorales. evasión
tumoral del sistema inmune. Inmunoterapia del cáncer.
12. Tolerancia y autoinmunidad. Establecimiento y mantenimiento de tolerancia.
Enfermedades autoinmunes órgano-específicas. Enfermedades autoinmunes
sistémicas. Modelos animales para enfermedades autoinmunes. Participación de:
células T CD4+, MHC y TCR en autoinmunidad. Mecanismos propuestos para inducción
de autoinmunidad.
13. Sistemas experimentales. Modelos animales experimentales. Cultivo de células.
Tecnología de ADN recombinante. Microarreglos. Inmunofluorescencia.

• Primer to The Immune Response. Tak W. Mak and Mary E. Saunders. ELSEVIER 2011.
• Roitt. Inmunología Fundamentos. Delves/Martín Burton/Roitt. Médica Panamericana.
11ava Edición. 2008.
• Inmunología Celular y Molecular. Abbul K. Abbas/Andrew H. Lichtman/Shiv Pillai.
ELSEVIER. 6ta Edición 2008.
• Inmunología de Kuby. Thomas J. Kindt/Richard A. Goldsby/Barbara A. Osborne.
McGrawHill. 6ta Edición 2007.

134


Patogénesis Bacteriana

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFE-13

Descripción de la asignatura: Uno de los grandes logros en Salud Pública durante el siglo XX
fue la reducción significativa de la incidencia de enfermedades infecciosas debido a las
mejoras en la higiene, vacunas y agentes antimicrobianos. Sin embargo, las enfermedades
infecciosas siguen siendo problemas importantes de mortalidad global. Para comprender los
complejos fenómenos de la patogénesis bacteriana es indispensable analizar la interacción de
la célula hospedera con el patógeno bacteriano, lo cual refleja el balance co-evolutivo que
asegura la propia sobrevivencia así, las bacterias desarrollan entre sus factores de virulencia
mecanismos para interferir en respuestas celulares en su propio beneficio y por su parte el
hospedero cuenta con una serie de mecanismos para protegerse de los patógenos bacterianos,
además el medio ambiente juega un papel importante en este evento. En décadas recientes, el
desarrollo de la biología molecular y las herramientas genéticas han permitido el estudio de
aspectos celulares y moleculares de los factores de virulencia de las bacterias patógenas. Este
conocimiento es de incalculable valor para el desarrollo de nuevos medicamentos, vacunas o
métodos de diagnóstico necesarios para el control de las enfermedades infecciosas. Al
finalizar el curso el alumno comprenderá los principios básicos de la patogénesis bacteriana y
conocerá las herramientas que le permitan abordar aspectos específicos de ésta.

Índice temático:
1. Estudio de la Patogénesis Bacteriana. Modelos utilizados para el Estudio de

Patogénesis Bacteriana. Estrategias para la Identificación de Genes de Patogenicidad
Bacterianos. Determinantes Genéticos de la Patogenicidad Bacteriana.
2. Comunicación bacteriana en la infección. Señalización intracelular en procariontes.
Transducción de señales: sistema de dos componentes. Otros tipos de transducción de
señales en bacterias. Monitoreo bacteriano del medio ambiente. Señalización célula-
célula en bacterias: Quórum sensing y citocinas bacterianas. Recepción bacteriana de
señales del hospedero.
3. Adhesión Bacteriana a la superficie celular y matriz extracelular de tejidos del
hospedero. Adhesinas FImbriales: Moléculas de Adhesión. Adhesinas no-Fimbriales.
Biopelículas: Ruta secreta de las Comunidades Microbianas.
135


4. Daño al Hospedero causado por la Producción de Toxinas . Daño a Membranas
Celulares por Toxinas: Modelos y Características Moleculares. 2. Toxinas con Blancos
Intracelulares.
5. Invasión celular por patógenos bacterianos. Mecanismos de la entrada bacteriana a
las células del Hospedero. Vida Bacteriana dentro de Vacuolas. La Vida bacteriana en
el Citosol.
6. Evasión de las defensas del Hospedero. Evasión de las defensas inmunes de las
superficies mucosas: Evasión de la IgA secretora. Evasión bacteriana a las citocinas, a
los mecanismos de inmunidad innata, a la fagocitosis y al procesamiento de antígenos.
Evasión de la inmunidad adquirida: Evasión de anticuerpos. Superantígenos y evasión
de respuesta por linfocitos T. Obtención y uso de Nutrientes del Hospedero: El Modelo
del Hierro. Resistencia Bacteriana al Sistema del Complemento. Resistencia
bacteriana a Péptidos Antimicrobianos. Inducción bacteriana de la muerte del
Hospedero.
7. Diseño de las nuevas vacunas y estrategias de modulación de la respuesta inmune.
Propiedades de una vacuna. Inmunización pasiva. Vacunas de subunidades. Vacunas
de conjugados. Nuevos adyuvantes. Programación de la inmunidad adaptativa.
Inmunidad a mucosas. Tecnología de vacunas de DNA.
8. El futuro del estudio de la patogenicidad y en el control de enfermedades bacterianas
Caenorhabditis elegans y la virulencia bacteriana. Estudio de mecanismos de
patogenicidad en humanos y animales. Desarrollo de nuevos antibacterianos:
Inhibición de la adhesión bacteriana. Péptidos antibacterianos. Uso de la genómica
para identificar candidatos para vacunas.
• Bacterial Disease Mechanisms. An introduction to cellular microbiology. Ed by Wilson

M, McNab R y Henderson B. Cambridge University Press. 2008.
• Cellular Microbiology. Cossart P, Boquet P, Normark S y Rappuoli R. Cellular Microbiology. ASM
Press. 2008.
• Virulence mechanisms of Bacterial pathogens. Brogden K, Roth J, Stanton T, Bolin CA, Minion
FC, Wannemuehler MJ. Third Ed. ASM Press. 2000.
• Bacterial pathogenesis. A Molecular Approach. Wilson B, Salyers A, Whitt D, Winkler M. Third
edition. ASM Press. 2011
• Virulence mechanisms of bacterial pathogens. Roth J. A. ASM Press Washington D.C. 1994.
• Reddy C.A., T.J., Beveridge, J.A., Breznak, G.A. Marzluf, T.M., Schmidt, and L.R. Snyder. 2007.
Methods for General and Molecular Microbiology. 3rd. Edition. ASM Press. Washington D.C.
136


Biología celular y cáncer

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFE-14

Descripción de la asignatura: La Biología Celular es fundamental para el conocimiento de la

función y organización de órganos, tejidos y organismos. El objetivo del curso es que el
alumno adquiera y discuta las bases teóricas adquiridas de los diversos temas relacionados
con la estructura y función celular y las alteraciones para la progresión hacia cáncer.
Al finalizar el curso, el estudiante tendrá el conocimiento de la estructura y función celular

eucariote. Además será capaz de desarrollar y discutir a profundidad los aspectos celulares
involucrados en las 8 características que conducen al cáncer con la finalidad de proponer
alternativas para terapia, diagnóstico y pronóstico.
Índice temático:
1. Las membranas celulares. Estructura y composición química. Propiedades:

semipermeabilidad, asimetría, fluidez, elasticidad, resistencia. Especializaciones de
membrana.
2. Núcleo y organización del material genético. Envoltura nuclear. Matriz nuclear.
Poro nuclear. Transporte dentro y fuera de núcleo. Cromosomas. Cromatina.
Eucromatina. Heterocromatina.
3. Citoesqueleto, matriz extracelular, uniones celulares y señalización celular.
Componentes de la matriz extracelular. Proteínas que participan como: laminina,
fibrinectina y colágenos. Citoesqueleto. Microfilamentos. Filamentos intermedios.
Microtúbulos. Uniones celulares. Tipos de uniones celulares. Transducción de señales.
Señales químicas. Proteínas G. Segundos mensajeros. Señales mediadas por receptores
intracelulares. Transducción de señales intracelulares por receptores de membrana,
calcio, AMPc. Adaptación de la célula blanco.
4. Transporte celular. Transporte a través de las membranas citoplasmáticas.
Transporte de pequeñas moléculas. Transporte pasivo. Transporte activo. Transporte
137


mediante vesículas: Endocitosis y Exocitosis. Retículo endoplasmático, complejo de
Golgi y lisosomas.
5. Origen del cáncer. Jerárquica y estocástica. Células troncales formadoras de cáncer.
Características celulares que inducen cáncer. Incremento de la proliferación celular.
Disminución de la muerte celular programada. Evasión de las señales inhibidoras de
crecimiento. Replicación ilimitada. Inducción de la angiogénesis. Incremento de
migración e invasión. Inflamación y metabolismo celular. El microambiente contribuye
a la formación de cáncer. Nichos celulares importantes en la formación de cáncer. Los
diferentes tipos celulares que contribuyen a la formación de cáncer. Metástasis de
células madre formadoras de cáncer y células accesorias.
6. Subtipos de carcinomas. Cáncer cérvico-uterino y virus de papiloma humano (VPH).
Virus de papiloma humano. Proteínas tardías. Proteínas tempranas. Interacción de
proteínas celulares y virales. Inmortalización por VPH. Eliminación de virus de
papiloma humano y progresión maligna de cáncer cérvico-uterino. Lesiones pre-
malignas y malignas cervicales. Neoplasia intraepitelial cervical I, II y III. Carcinoma in
situ e invasor. Cáncer de mama. Genética y cáncer de mama. Medio ambiente y cáncer
de mama. BCRA1 y 2 y cáncer de mama. Genes responsables de la alteración de la
proliferación, ciclo celular, apoptosis y metástasis celular en cáncer de mama. Lesiones
pre-malignas. Papiloma intraductual. Adenoma del pezón. Papilomatosis del pezón.
Complejos moleculares proteína-ácido nucleico. Lesiones malignas de mama.
Carcinoma tubular in situ. Carcinoma ductual in situ. Comedo carcinoma. Tipo sólido.
Tipo cribriforme. Micropapilar. Papilar in situ. Microinvasivo.
7. Modelos de multietapas de carcinogénesis. Genes involucrados en cáncer. Genes
que se alteran en cada una de las etapas de cáncer cérvico-uterino. Genes que se
alteran en cada una de las etapas de cáncer de mama. Propuesta de nuevos
marcadores.

• Molecular Cell Biology. Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser Ch., Krieger M., Zipursky
L, and Darnell J. Edition 5th. 2004. Freeman and Company.
• Molecular Biology of the Cell. Alberts B, Bray D, Lewis J, Raff M, Roberts K and Watson
JD. Garland Publishing, Inc. 2008. Fourth Edition.
• Molecular and Cell Biology. Stephen L. Wolf. Wadsworth Publishing Co.
• Development Biology. Leon W Browder, Carol A Erickson and William R. J Saunders
College Publishing.
• Guidebook to the Extracellular Matrix and Adhesion Proteins. Kreis T. and V R
Sambrok & Tooze Publication at Oxford University Press.
• Cell and Molecular Biology. Concepts and Experiments. Gerald Karp. 6th. Edition 2010
• Molecular Biology. Robert F. Weaver. WCB Mc Graw-Hill.
• Cells. Benjamin Lewin, Lynne Cassimeris, Vishwanath R. Lingappa and George
Plopper. 2007 Jones and Bartlett Publishers.
• Cell Biology. Thomas D. Pollard and William C. Earnshaw. 2008 Edition 2nd. Saunders
Elsevier.
138


RNAs no codificantes

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Clave: AFE-15

Descripción de la asignatura: El descubrimiento de los RNAs no codificantes ha

revolucionado el conocimiento de la biología y el genoma humano, además proveer una
regulación comprensible de los mecanismos de los genes codificantes y no codificantes. El
equilibrio entre estos genes permite que los procesos celulares como proliferación, apoptosis,
diferenciación, migración, invasión y senescencia se lleven de manera normal. La
desregulación de genes no codificantes afecta de manera sustancial los procesos celulares
conduciendo a varias enfermedades como infartos, cáncer, diabetes, etc. Se han descubierto
varios RNAs no codificantes como microRNAs, piRNAs, lncRNAs, que están involucrados en el
desarrollo embrionario, en la progresión hacia cáncer, sin embrago, constantemente se siguen
descubriendo nuevos tipos de RNAs con funciones reguladoras que impactan directamente en
la salud humana. Al término el estudiante conocerá los tipos de RNAs que se han descubierto
hasta el día de hoy y su relación con los mecanismos de regulación molecular que se llevan a
cabo en la célula.
Índice temático:
1. MicroRNAs, piRNAs y lncRNAs: Biogénesis. Unidades transcripcionales. Transcritos

primarios. Estructura y secuencias que los caracterizan. Regulación transcripcional.
Procesamiento nuclear. Proteínas que inducen y/o reprimen el procesamiento en el
núcleo. Exporte nuclear.
2. MicroRNAs, piRNAs y lncRNAs: Reconocimiento por RNasas tipo III, Procesamiento
en el citoplasma. Proteínas que inducen y/o reprimen el procesamiento en el
citoplasma.
3. Pseudogenes. Localización y número de pseudogenes. Expresión de pseudogenes.
Mecanismos moleculares de regulación. Esponjas moleculares. Reguladores de la
expresión de genes.
4. Estabilidad de mRNA. Proteínas que se unen a la región 5’UTR y 3’UTR.
Deadenilación por Poli (A) nucleasas. Remoción de la caperuza. Degradación vía 3’ y 5’.
Composición del exosoma. Enzimas XRNs. Modificaciones nucleotídicas. Corpúsculos
de procesamiento de mRNAs. Sistemas de supervivencia. NMD, NSD, NGD. Localización
139


de mRNAs en la célula.
5. MicroRNAs y cáncer: Oncogenes y genes supresores de tumores. OncomiRs y Anti-
oncomiRs. mRNAs regulados por OncomiRs y Anti-oncomiRs. Proliferación y apoptosis
regulada por OncomiRs y Anti-miRs. Metástasis e invasión reguladas por OncomiRs y
Anti-miRs. Construcción de modelos de multietapas usando microRNAs.
6. MicroRNAs en el mejoramiento de la salud: microRNAs como agentes terapéuticos.
microRNAs como marcadores genéticos. microRNAs como marcadores de diagnostico
y pronostico. Uso de OncomiRs y Anti-miRs como marcadores tumorales.
8. Herramientas de perdida y ganancia de función para microRNAs: Antisentidos,
Modificaciones de primera, segunda y tercera generación. LNAs. Morfolinos. Vectores
de expresión de primera y segunda generación. Métodos químicos y mecánicos para
transportar microRNAs. Vesículas transportadoras de microRNAs.

• Genes X. Jocelyn E. Krebs, Elliot S. Goldstein. Stephen T. Kilpatrick. 2011 Edition 10th.
Jones and Bartlett Publishers.
• Molecular Cell Biology. Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser Ch., Krieger M.,
Zipursky L, and Darnell J. Edition 5th. 2004. Freeman and Company.
• Molecular Biology of the Cell. Alberts B, Bray D, Lewis J, Raff M, Roberts K and
Watson JD. Garland Publishing, Inc. 2008. Fourth Edition
• Molecular and Cell Biology. Stephen L. Wolf. Wadsworth Publishing Co.
• Development Biology. Leon W Browder, Carol A Erickson and William R. J Saunders
College Publishing.
• Molecular Biology. Robert F. Weaver. WCB Mc Graw-Hill.
• Cells. Benjamin Lewin, Lynne Cassimeris, Vishwanath R. Lingappa and George
Plopper. 2007 Jones and Bartlett Publishers.
140


Espectrometría de la radiación nuclear

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-16
§ Asignatura: Específica

Descripción de la asignatura: La determinación de los componentes de un campo de

radiación nuclear, así como de su energía y la abundancia relativa de cada uno de ellos
conlleva al conocimiento de la naturaleza de la fuente emisora y a través de ello, permite
conocer cualitativamente y cuantitativamente la naturaleza misma de la muestra. Las
implicaciones analíticas de la espectrometría de la radiación nuclear han dado origen a una
gran variedad de técnicas analíticas nucleares, las que comparten a la espectrometría nuclear
como un medio para el estudio y la metrología de las radiaciones emitidas en un evento
nuclear espontáneo o inducido.
Contenido:
• Espectrometría de radiación nuclear.

• Mediciones relativas y absolutas.
• Fuentes de referencia para espectrometría.
• Electrónica nuclear.
• Espectrometría de partículas cargadas.
• Espectroscopia de rayos x y rayos gamma.
• Aseguramiento de calidad en espectrometría nuclear.
• Aplicaciones.

Índice ttemático:
1. Espectrometría de radiación nuclear. Espectro de energía. Medición de un espectro

integral con un analizador monocanal. Medición de un espectro diferencial con un
analizador monocanal. Relación entre distribución de altura de pulso y espectro de
energía. Resolución de Energía. Calibración de un analizador multicanal.
2. Mediciones relativas y absolutas. Efectos de la geometría. Efectos de la fuente.
Efectos del detector. Relación entre el conteo y la intensidad de la fuente.
141


3. Fuentes y muestras para espectrometría. Fuentes de referencia en actividad y en
energía. Muestras líquidas. Muestras sólidas. Muestras gaseosas.
4. Electrónica nuclear y análisis espectral. Electrónica asociada. Calibración avanzada
del espectrómetro. Suma de pulsos por coincidencia real. Análisis computarizado de
espectros.
5. Espectroscopia de partículas cargadas. Dispersión (straggling) de energía.
Espectroscopia de radiación beta (electrones). Espectroscopia de protones, alfas,
deuterones. Espectrómetro de centelleo líquido. Detectores telescopio.
Espectrómetros magnéticos y electrostáticos. Detectores sensibles a la posición.
Medición de emisores alfa en muestras ambientales. Medición de emisores beta en
muestras ambientales.
6. Espectroscopia de rayos x y rayos gamma. Modos de deposición de energía.
Eficiencias. Detección de fotones con el cristal de NaI(Tl). Detección de gammas con un
HPGe. Detector de Si(Li). Detección de rayos x con un espectrómetro de cristal.
Medición de emisores gamma en muestras ambientales. Medición de rayos x en
muestras ambientales. Análisis elemental de muestras ambientales por rayos x.
Aplicaciones radioanalíticas.
7. Aseguramiento de calidad en espectrometría nuclear. Datos Nucleares. Estándares
radiactivos. Mantenimiento de la confianza en el equipo. Mejoramiento de confianza
en el análisis espectral. Mantenimiento de registros. acreditación.
8. Aplicaciones. Espectrometría gamma de materiales de origen natural. Espectrometría
de partículas cargadas en muestras ambientales. Sistemas de baja razón de conteo.
Sistemas de alta razón de conteo.

• G. Guilmore, Practical Gamma Ray Spectrometry, Second Edition, Wiley, 2008.

• N. Tsoulfanidis and S. Landsberger, Measurement and Detection of Radiation, Third
Edition, CRC Press, 2010.
• G.F. Knoll; Radiation Detection and Measurement, John Wiley & Sons, Third Edition,
2000.

• Krzysztof Iniewski ed., Electronics for Radiation Detection, CRC Press, 2011.
• Gerhard Lutz, Semiconductor Radiation Detectors, Springer. 2nd Print, 2007

142


Espectrometría de neutrones

§ Teoría: 5
§ Práctica: 5
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-17
§ Asignatura: Formación Específica

Descripción de la asignatura: En la Espectrometría de Neutrones se analiza el estado de la

cuestión en la determinación, por métodos experimentales y analíticos, de la distribución de la
energía de los neutrones y su impacto en la dosis efectiva, equivalente ambiental y dosis
equivalente personal.
Contenido:
• El neutrón.
• Reconstrucción de espectros.
• Sistemas de medición de neutrones.
• Matriz de respuesta.
• Códigos de reconstrucción.
• Calibración de espectrómetros y monitores.
• Problemas especiales.

Índice temático:
1. El neutrón. Características sui géneris de los neutrones. Distribución de velocidad y de

energía. Mecanismos de interacción. Leyes de conservación.
2. Reconstrucción de espectros. Ecuación de Fredholm de primer tipo. Versión
discreta. Matriz de respuesta. Métodos de reconstrucción: iterativos, paramétricos.
Monte Carlo e inteligencia artificial.
3. Sistemas de medición de neutrones. Medios moderadores. Detectores de neutrones.
Sistemas de uno, dos y varios moderadores.
4. Matriz de respuesta. Cálculo de las funciones de respuesta de diferentes detectores y
moderadores. Calidad de la matriz. Impacto de la calidad de la matriz en la
determinación de los espectros de neutrones y las magnitudes asociadas.
5. Códigos de reconstrucción. BUNKI, BUNKIUT, BUNKIUAZ, MITOM, FRUIT, NSDUAZ,
NSDann. Inteligencia artificial: redes neuronales artificiales y algoritmos genéticos.
143


6. Calibración de espectrómetros y monitores: Métodos de calibración de
espectrómetros con múltiples moderadores y diferentes detectores. Monitores de
área. Propagación de incertidumbres. Impacto en las magnitudes asociadas.
7. Problemas especiales. Aceleradores lineales para radioterapia. Ciclotrones para PET.
Aceleradores para análisis por dispersión de Rutherford. Plasmas. Fuentes isotópicas.
Fuentes de neutrones cósmicos y fuentes ambientales.

• Chi Leung Patrick Hui (Editor), Artificial Neural Networks-Application, Ed. INTECH,
2011.
• RPD, Handbook on Neutron spectrometry in mixed fields, Radiation Protection
Dosimetry, 2006.

• T. Routti and J.V. Sandberg, Unfolding activation and multisphere detector data, Radiat.
Prot. Dosim. 10: 103-110 (1985).
• A.V. Alevra, Neutron spectrometry, Radioprotection 34: 305-333 (1999)
• M. Matzke, Propagation of uncertainties in unfolding procedures, Nucl. Instrum. Meth.
Phys. Res. A 476: 230-241 (2002).
• H.R. Vega-Carrillo and A. Baltazar-Raigosa, Photoneutron spectra around an 18 MV
linac, J. Radioanal. Nucl. Chem., 287: 323-327 (2011).
• L. Hernández-Adame, H. Contreras, H.R. Vega-Carrillo and L.H. Perez, Design of a
treatment room for an 18 MV linac, Nuclear Technology 175: 105-113 (2011).
• Vega-Carrillo, H.R. et al., Artificial Neural Networks in Spectrometry and Neutron
Dosimetry, American Institute of Physics Procc. 1310. (2010).
• Vega-Carrillo, H.R. et al., Monte Carlo calculation of the response matrix of a Bonner
sphere spectrometer. IAEA Procceding Series STI/PUB/1460. International Atomic
Energy Agency.

144


Física de la atmósfera

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-18

Descripción de la asignatura: Es la rama de la Física que utiliza fundamentos físicos y

químicos para describir la naturaleza y comportamiento de la atmósfera. La física de la
atmósfera utiliza los fundamentos de la mecánica de fluidos, de la termodinámica, de la física
de radiaciones y de los procesos de transferencia de energía para crear modelos que explican
el comportamiento de la atmósfera.
Contenido:
• Panorama global de la atmósfera.

• Termodinámica de gases.
• Radiación atmosférica.
• Aerosoles y nubes.
• Movimientos atmosféricos.
• Ecuación de movimiento de la atmósfera.
• Movimiento a gran escala.
• Capa Limite planetaria.
• Circulación general.
• La estratósfera media.

Índice temático:
1. Panorama global. Geometría. Estructura de la atmósfera. Distribución vertical de

temperatura. Capas de la atmósfera. Relación entre presión y densidad: balance
hidrostático. Estructura vertical de presión y densidad. Composición química.
2. Balance global de energía. Temperatura de emisión del planeta. Espectro de
absorción del planeta. Efecto invernadero. Modelo simple de efecto invernadero.
Retroalimentación del clima.
145


3. Termodinámica de gases. Conceptos. La primera ley de la termodinámica. Capacidad
calorífica. Procesos adiabáticos. Procesos no adiabáticos. Procesos naturales y
reversibles. Entropía y la segunda ley de la termodinámica. Relaciones fundamentales.
4. Convección. Convección superficial. Convección en agua. Atmósfera en condiciones
estables. Inversiones de temperatura. Convección húmeda. Convección en la
atmósfera. Equilibrio radiativo-convectivo.
5. Estructura meridional de la atmósfera. Fuerzas Radiativas y temperatura. Presión y
altura geopotencial. Humedad. Vientos.
6. Ecuación del movimiento de fluidos. Ecuación de movimiento para un fluido sin
rotación. Conservación de la masa. Ecuación termodinámica. Integración, condiciones
a la frontera y restricciones en la aplicación. Ecuación de movimiento para un fluido en
rotación.
7. Flujo balanceado. Movimiento geostrófico. Teorema Taylor-Proudman. Ecuación
térmica de viento. Flujo subegostrófico: Capa Ekman.
8. Circulación general de la atmósfera. Mecánica de la circulación. Energética de la
ecuación térmica de vientos. Balance de momentum y de calor atmosférico a gran
escala. Variaciones latitudinales del clima.
9. La atmósfera media. Fotoquímica del ozono. Implicaciones del óxido nitroso,
clorofluorocarbonos y metano. Calentamiento estratosférico. Oscilación quasibienal.
Interacciones con la tropósfera. Reacciones químicas heterogéneas.

• Salby M.L. Fundamental of Atmospheric Physics, Academic Press, 1996

• Búsqueda bibliográfica a asignar durante el curso.

146


Química radioanalítica

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-19

Descripción de la asignatura: La Química Radioanalítica es considerada una especialidad

dentro de las subdisciplinas de Química Nuclear y Radioquímica. Ésta se encarga del análisis
de muestras debido a su contenido de radionúclidos, combinando las técnicas de
identificación y purificación de radioelementos por métodos químicos convencionales, y la
identificación de radionúclidos y determinación de la actividad, por medio de métodos
nucleares. Los radionúclidos son monitoreados en el ambiente, así como en efluentes y
corrientes de proceso de plantas nucleares, en personal de laboratorios de investigación
nuclear, agencias de mediciones radiológicas y gubernamentales, entre otros. Juega un papel
importante en la Química, Física, Medicina, Farmacología, Biología, Ecología, Hidrología,
Geología, ciencias forenses y atmosféricas, protección de salud, Arqueología e Ingeniería.
Contenido:
• Trazadores y acarreadores.
• Métodos de separación.
• Principios y prácticas de química radioanalítica.
• Muestreo.
• Preparación de la muestra para su medición.
• Identificación del radionúclido.
• Métodos radioanalíticos.
• Otros métodos físicos de análisis.

Índice temático:
1. Trazadores y acarreadores. Concepto de pureza. Conceptos de trazador y

acarreador. Efecto isotópico. Intercambio isotópico
147


2. Métodos de separación. Precipitación y coprecipitación. Extracción líquido-líquido.
Cromatografía. Electrodeposición. Electroforesis.
3. Principios y prácticas de química radioanalítica. Inestabilidad de los compuestos
marcados. Comportamiento de soluciones muy diluidas y cantidades pequeñas.
Preservación de la muestra.
4. Muestreo. Información de la muestra. Muestras gaseosas, líquidas y sólidas.
5. Preparación de la muestra para su medición. De partículas alfa y beta con el
detector proporcional de gas. De partículas alfa y beta con el detector de centelleo
líquido. De partículas alfa con detectores de silicio. De rayos gamma con detectores de
germanio.
6. Identificación del radionúclido. Conocimiento y aplicación del esquema de
decaimiento. Equilibrios radiactivos. Cálculo de vidas medias. Caracterización de
radionúclidos para ocurrencias de rutina y especiales. Necesidades de identificación.
7. Métodos radioanalíticos. Métodos de determinación directa. Métodos que
involucran la adición de radionúclidos. Métodos de análisis por activación.
8. Otros métodos físicos de análisis. Fluorescencia de rayos x. Emisión de rayos x
inducidos por partículas (PIXE). Espectrometría Mössbauer.

• B. Kahn, Radioanalytical Chemistry, Springer, 2007.

• G.R. Choppin, J.O. Liljenzin and R.J. Rydberg, Nuclear Chemistry, Theory and
Applications, Pergamon Press, 3ra ed. 2002.
• W. D. Ehmann and D. E. Vance, Radiochemistry and Nuclear Methods of Analysis, JOHN
WILEY & SONS, INC., 1991.
• K. H. Lieser, Nuclear and Radiochemistry, Fundamentals and Applications, WILEY-

VCH, 2nd ed., 2001.
• G. D. Chase and J. R. Rabinowitz, Principles of Radioisotope Methodology, Burgess, 3rd
ed., 1967.
148


Radiobiología

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-20

Descripción de la asignatura: Ciencia que establece la comprensión de la respuesta del

material biológico a las radiaciones, así como los nuevos avances en el conocimiento de los
efectos biológicos de la radiación ionizante y su aplicación en diagnóstico y tratamiento de
patologías.
Contenido:
• Física básica y mecanismos químicos.

• Radiobiología celular.
• Respuesta de tejidos y órganos.
• Efectos genéticos.
• Marcación de moléculas biológicas (diagnóstico y tratamiento).
• Fuentes de exposición.
• Dosis máxima permisible.
Índice temático:
1. Física básica y mecanismos químicos. Excitación. Ionización (partículas neutras y

cargadas). Producción de radicales libres (acción directa e indirecta). Transferencia
Lineal de Energía (LET), dosis.
2. Radiobiología celular. Ley de Bergonie y Tribondeau. Sensibilidad durante el ciclo
celular. Curva de sobrevida celular. Teoría del tiro al blanco.
3. Respuesta de tejidos y órganos. Tejidos sensibles (gónadas, sistema
hematopoyético, intestino). Dosis bajas (genética). Desarrollo fetal.
4. Efectos genéticos. Mutaciones. Seres humanos y otros animales. Sobrevivientes de
Hiroshima y Leucemias. Reportes BEIR (Biological Effects of Ionizing Radiations).
149


5. Marcación de moléculas biológicas (diagnóstico y tratamiento) Radiofarmacia
hospitalaria y centralizada. Características y clasificación radiofarmacocinética y
Radiofarmacodinamia. Radiotrazadores. Mecanismos de acción. Radiofármacos para
diagnóstico y tratamiento.
6. Fuentes de exposición. Radiación ambiental natural. Radiación médica. Otras fuentes
artificiales.
7. Dosis máxima permisible. Reglamento de la Comisión Nacional de Seguridad y
Salvaguardia. Recomendaciones (CNPR, ICRU, ETC.).

Bibliografía :
• Radiation dosimetry . Instrumentation and Methods. Second Edition. 2001.

• Nuclear Medicine Manual. International Atomic Agency Vienna, 2006.
• Radiology Sourcebook . A practical guide for Reference Training. Douglas P. Beall MD.
Ed. Human Press 2002.
• Radiation Dosimetry. Instrumentation and Methods. Second Edition.
• Practical radiation protection and applied radiobiology. Dowd S. B., W. B. Saunders,
Second Edition, 1999.
• Radiobiolgy for the radiologist. Hall E. J., Lippincott Williams and Wilkins, 4° Ed. 1994.
• The Physcics of radiology. Johns H. E. Cunningham J.R., 4° Ed. Charles C. Thomas, 1983.
• National Research Council, Reportes BEIR (Biology Effects of ionizing Radiations):
• Health Risks of radon and other internally deposited alphaemitters: Beir IV, 1988.
• Health effects of exposure to low levels of ionizing radiation: Beir V, 1990.
• Health effects of exposure to radon: Beir VI, 1999.
• United Nations, Sources and effects of ionizing radiation: United Nations Scientic
Committee on the effect of atomic radiation (UNCEAR). Reports to the General
Assembly, with Scientific Annexes-Sources, 2000.
• Molecular biology of the cell., Alberts B.., Dray., Lewis J., Raff M., Roberts K., Watson
J.D., Garland Publ., 1994.

150


Radioinmunoanálisis

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-21

Descripción de la asignatura: Las técnicas analíticas que utilizan radioisótopos como el

radioinmunoanálisis (RIA) y el análisis inmunoradiométrico (IRMA) confirman que el
conocimiento y la aplicación de las ciencias nucleares para fines pacíficos, como en la
medicina nuclear, siguen siendo importantes y de gran utilidad para contribuir a un
diagnóstico oportuno de enfermedades, o bien, para respaldar los resultados de algunas
investigaciones.

Contenido:
• Principios generales del radioinmunoanálisis.

• Análisis relacionados con la estructura molecular y la función biológica.
• La reacción antígeno-anticuerpo.
• Los reactivos primarios.
• La curva estándar.
• Métodos de separación.
• Métodos alternativos al radioinmunoanálisis.

Índice temático:
1. Principios generales del radioinmunoanálisis. . Terminología.

2. Análisis relacionados con la estructura molecular y con la función biológica.
Análisis por unión a proteínas.
3. La reacción antígeno-anticuerpo. Los reactivos primarios. La curva estándar.
Métodos de separación. Métodos alternativos del radioinmunoanálisis.
4. Control de calidad del radioinmunoanálisis. Características del antígeno marcado
para el uso en el RIA.
5. Definiciones y objetivos. Exactitud. Precisión. Reproducibilidad. Especificidad.
Sensibilidad. Confiabilidad.
151


6. Criterios de confiabilidad. Desviación estándar. Coeficiente de variación. Carta de
Shewhart.
7. Clasificación de errores. Aleatorios. Sistemáticos.
8. Control de calidad interno, control de calidad externo. Evaluación a corto y largo
plazo. Manejo de muestras. Análisis de datos internacionales.
9. Control de calidad intra-análisis y control de calidad inter-análisis. Evalúo de la
curva dosis-respuesta. Perfil de imprecisión.

• Zambrano, Fernando, El Radioinmunoanálisis y su Control de Calidad, Instituto

Nacional de Investigaciones Nucleares, 1996.

• Ivan Roitt, Jonathan Brostoff y David Male. Inmunología. Madrid : Harcourt Brace.
1997.ISBN: 84-8174-180-9.

152


Radioquímica
________________________________________________________________________________
§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-22

Descripción de la asignatura: La Radioquímica, se ocupa del estudio de las propiedades

químicas, la preparación y el manejo de substancias radiactivas; así como de las aplicaciones
del fenómeno del decaimiento radiactivo en la solución de problemas de índole química.
Contenido:
• Composición de átomos y estabilidad nuclear.

• Efectos químicos producidos por radiación.
• Elementos radiactivos.
• Radionúclidos en el medio ambiente.
• Tratamiento de desechos nucleares.
• Aplicaciones de la radiación nuclear.

Índice temático:
1. Composición de átomos y estabilidad nuclear. Descubrimiento de la radiactividad y

evolución de la teoría nuclear. Núclidos. Estabilidad nuclear. Carta de los núclidos.
Cadenas de decaimiento naturales. Esquemas de decaimiento y sus ramificaciones.
2. Efectos químicos producidos por radiación. Modos de interacción de la radiación
con la materia. Formación de especies reactivas: iones, moléculas excitadas y
radiacales. Efectos químicos en sistemas gaseosos, acuosos y orgánicos.
3. Elementos radiactivos. Radioelementos naturales: polonio, ástato, radón, francio,
radio, actinio, torio, protactinio y uranio. Radioelementos artificiales: tecnecio,
prometio, elementos transuránicos y elementos transactínidos.
4. Radionúclidos en el medio ambiente. Origen de radionúclidos. Movilidad de
radionúclidos en la geósfera. Reacciones de radionúclidos con los componentes de
matrices acuosas. Interacciones de radionúclidos con componentes de matrices
sólidas. Radionúclidos en los seres vivos.
153


5. Tratamiento de desechos nucleares. Clasificación de los desechos nucleares.
Desechos generados en: mineria de uranio, conversión a UF6, enriquecimiento,
fabricación del combustible. Tratamiento del combustible gastado: reprocesamiento,
proceso PUREX, vitrificación, reciclaje de plutonio como combustible de mezcla de
óxidos, reciclaje de uranio, disposición directa de desechos de alto nivel, disposición
geológica.
6. Aplicaciones de la radiación nuclear. Radionúclidos en las ciencias de la vida.
Aplicaciones técnicas e industriales.

• K. H. Lieser. Nuclear and Radiochemistry, Fundamentals and Applications. WILEY-

VCH, 2nd ed., 2001.
• G.R. Choppin, J.O. Liljenzin and R.J. Rydberg. Nuclear Chemistry, Theory and
Applications. Pergamon Press, 3ra ed. 2002.
• W. D. Ehmann and D. E. Vance, Radiochemistry and Nuclear Methods of Analysis, JOHN
WILEY & SONS, INC., 1991.
• K. Schwochau, Technetium: Chemistry and Radiopharmaceutical Applications, WILEY-

VCH, 1st ed., 2000.
• Handbook of Nuclear Chemistry, Volume 1. Series editors: A. Vértes, S. Nagy, Z.
Klencsár. Basics of Nuclear Science. Volume editor: R. Lovas, Appendix editor: G. L.
Molnár. Kluwer Academic Publishers, Amsterdam, 2003.
Klencsár. Elements and Isotopes: Formation, Transformation, Distribution. Appendix
editor: G. L. Molnár. Kluwer Academic Publishers, Amsterdam, 2003.
Klencsár. Chemical Applications of Nuclear Reactions and Radiations. Appendix editor:
G. L. Molnár. Kluwer Academic Publishers, Amsterdam, 2003.
Klencsár. Radiochemistry and Radiopharmaceutical Chemistry in Life Sciences. Volume
editor: F. Rösch. Kluwer Academic Publishers, Amsterdam, 2003.
Klencsár. Instrumentation, Separation Techniques, Environmental Issues. Appendix
editor: G. L. Molnár. Kluwer Academic Publishers, Amsterdam, 2003.
• J.R. Cooper, K. Randle, R. S. Sokhi, Radioactive Releases in the Environment, Impact and
Assessment. John Wiley & Sons, Ltd., 2003.

154


Teoría de blindajes

§ Teoría: 5
§ Práctica: 5
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-23

Descripción de la asignatura: En la teoría de blindajes se analizan los elementos asociados

con el transporte de la radiación ionizante, cargada y neutra, dentro de los diferentes
materiales con el fin de diseñar sistemas que blinden la radiación. Los blindajes son diseñados
mediante el uso de métodos exactos y aproximados, usando paquetes de cómputo
especializado.
Contenido:
• Campos y fuentes.
• Errores conceptuales en los procesos de interacción de la radiación con la materia.
• Fuentes de radiación.
• Funciones de respuesta.
• Cálculo de dosis.
• Teoría de transporte: Métodos exactos y aproximados.
• Blindaje para fotones.
• Blindaje para neutrones.
• Blindaje para partículas cargadas.

Índice temático:
1. Campos y fuentes. Dirección y ángulos sólidos. Fluencia. Flujo. Características de las

fuentes de radiación. Fuentes discretas.
2. Errores conceptuales en los procesos de interacción de la radiación con la
materia. Coeficiente de interacción. Sección eficaz microscópica. Leyes de
conservación en reacciones de dispersión. Secciones eficaces para interacción con
fotones. Interacción de neutrones. Interacción de partículas cargadas.
Bremsstrahlulng.
3. Fuentes de radiación. Fuentes de neutrones. Fuentes de fotones. Fuentes de rayos X.
155


4. Funciones de respuesta. Magnitudes dosimétricas y unidades. Función respuesta.
Equilibrio electrónico. Magnitudes de protección y magnitudes operacionales
5. Cálculo de dosis. Radiación directa y dispersa. Dosis directas por fuentes distribuidas.
Kernel puntual. Funciones de Green. Medios homogéneos e infinitos. Factores
geométricos. Efecto de los cambios de densidad. Transformaciones geométricas.
6. Teoría de transporte: Métodos aproximados y exactos. Ecuación de transporte.
Métodos aproximados. Métodos exactos. Métodos Monte Carlo.
7. Blindaje para fotones. Apilamiento. Apilamiento en medios heterogéneos.
Atenuación de fotones de haz ancho. Albedo. Fotones en ductos. Heterogeneidades en
blindaje. Skyshine, Groundshine.
8. Blindaje para neutrones. Moderación. Termalización. Sección eficaz de remoción.
Teoría de difusión. Métodos de la edad de Fermi. Atenuación de fotones de captura.
Albedo de neutrones. Skyshine y Groundshine.
9. Blindaje para partículas cargadas. Partículas alfas y betas. Kernel puntual y plano.
Rayos x discretos y continuos. Bremsstrahlung.

• J. Kenneth Shultis and Richard E. Faw; Radiation Shielding, Prentice Hall, 1996.
• T. Rockwell III (Editor), Reactor Shielding Design Manual, D. Van Nostrand, 1956.

• Reportes de la International Commission on Radiological Units

• Reportes del National Council on Radiation Protection and Measurements.

156


Astronomía extragaláctica y cosmología

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-24
§ Materia asociada a la Línea de investigación: PCFM

Descripción de la asignatura: Las galaxias son tema de síntesis astronómica donde

confluyen las grandes escalas del Universo con las escalas galácticas e intergalácticas. En el
tema convergen varias ramas de la Astronomía: cosmología, medio interestelar, dinámica,
formación y evolución de estrellas y galaxias, astrofísica de altas energías, que nos dan una
descripción del Universo a gran escala y qué física y fenómenos son los que le han dado la
estructura que observamos. Se cubrirán también diversos temas, no muy profundamente,
para que el estudiante llegue a apreciar, entender y discutir los problemas actuales de
astronomía extragaláctica y cosmología.
Contenido:
• Características observacionales de las galaxias.

• Física de las galaxias.
• Galaxias peculiares y núcleos activos de galaxias.
• Cúmulos de galaxias y la estructura en gran escala del Universo.
• Modelos cosmológicos estándares.
• Métodos de la cosmología observacional.
• Formación de las estructuras cósmicas.

Índice temático:
1. Características observacionales de las galaxias. Esquemas de clasificación morfológica.

Propiedades fotométricas y espectrales de galaxias normales; magnitudes, colores,
brillo superficial, isofotas, luminosidades absolutas, diámetros fotométricos.
Poblaciones estelares y medio interestelar de los diferentes tipos morfológicos. La
relación de Tully-Fisher. La relación de Faber-Jackson. Composición y evolución
química. Propiedades de las galaxias en radio, infrarrojo, UV, rayos x y rayos gamma.
Materia obscura. Grupos y cúmulos de galaxias. Función de luminosidad de galaxias
enanas y de bajo brillo superficial.
157


2. Física de las galaxias. Sistemas en equilibrio; cúmulos globulares, galaxias elípticas y
discos galácticos. Determinación de masas y del cociente masa a luminosidad de
galaxias espirales y elípticas. Detección de materia. Galaxias barradas e irregulares.
Formación estelar en otras galaxias. La conexión halo-disco. Función inicial de masa.
3. Galaxias peculiares y núcleos activos de galaxias. Propiedades de los diferentes
núcleos activos de galaxias. Distribución espectral de la energía. Galaxias huésped y
actividad inducida. El modelo unificado. Implicaciones cosmológicas y evolución.
4. Cúmulos de galaxias y la estructura en gran escala del Universo. Propiedades
estructurales y dinámicas de los cúmulos de galaxias. Relación morfología densidad.
Interacción entre las galaxias en cúmulos. Función de correlación entre galaxias.
Formación de la estructura del Universo a gran escala; Observaciones y simulaciones
numéricas. El Universo en el infrarrojo, en rayos x, en microondas y el visible.
5. Modelos cosmológicos estándares. Las ecuaciones de Einstein. Los modelos de
Friedmann. La evolución térmica del Universo. Nucleosíntesis. Bariogénesis. Inflación.
El espectro primordial de las fluctuaciones. La radiación de fondo. Evolución lineal y
no lineal del espectro de fluctuaciones; formación de las estructuras cósmicas. Energía
obscura y la necesidad de una constante cosmológica.
6. Métodos de la cosmología observacional. Confrontación de los modelos cosmológicos
con las observaciones. Determinación de los parámetros cosmológicos. Determinación
de distancias. Lentes gravitacionales. Conteo de galaxias y la función de Press-
Schecter. La radiación de fondo.
7. Formación de las estructuras cósmicas. Teoría lineal de las perturbaciones. Procesos
disipativos de la materia bariónica y obscura. Evolución no lineal de las
perturbaciones. Materia obscura fría con constante cosmológica. Adquisición de
momento angular. Formación de galaxias, cúmulos y estructura filamentaria.

• Appenzeller, Y., Habing, H.J. y Lena, P. (eds) "Evolution of Galaxies. Astronomical

Observations" Lecture Notes in Physics 333, Springer Verlag, Berlín, 1989.
• Blandford, R.D., Netzer, H., y Woltjer, L. "Active Galactic Nuclei", Springer-Verlag,
Berlín, 1990.
• Gilmore, G., "The Milky Way as a Galaxy", Univ. Science Books, Mill Valley, Cal., 1990
• Kolb, E.W., Turner, M.S. "The Early Universe" Addison Wesley Publishing Co.,
California, 1990.
• Linde, A.D., "Inflation and Quantum Cosmology", Academic Press. Inc., Boston, 1990.
• 6. Ohanian, H.C., Ruffini, R. "Gravitation and Spacetime", Second Edition, W.W. Norton
& Company, New York, 1994.
• Padmanabhan, T. "Structure Formation in the Universe, Cambridge Univ.Press.,
Cambridge, 1993.
• Peebles, P.J.E. "Physical Cosmology" Princeton Univ. Press., Princeton, 1993.
• Sandage, A., Sandage, M. y Kristina, J. "Galaxies and the Universe: Volume IX of Stars.
• and Stellar Systems" Univ. of Chicago Press, Chicago, 1975.

158


• Tinsley, B.M. y Larson, R. "The Evolution of Galaxies and Stellar Populations", New
• Haven, Yale Univ. Printing Service, Yale,1977.
• Vorontsov-Vel'yaminov, B.A., "Extragalactic Astronomy", Harwood Academic.
• Publishers, Chur, Switzerland, 1987.
• Weinberg, S. "Gravitation and Cosmology", Wiley, New York, 1972.

159


Estructura galáctica y dinámica estelar

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-25

Descripción de la asignatura: Proporcionar las bases físicas, observacionales y teóricas para

el análisis de la cinemática y la dinámica de sistemas estelares, y de la estructura orbital, de su
contenido en estrellas y gas de las galaxias.
Contenido:
• La distribución espacial de las estrellas.

• Cinemática estelar.
• Rotación galáctica.
• La estructura de la galaxia.
• Dinámica estelar y galáctica.
• Competencias a desarrollar.

Índice temático:
1. La distribución espacial de las estrellas. Distribución análisis de las estrellas en

nuestra vecindad. Efectos de absorción. Función de densidad y de luminosidad estelar.
El espectro de masas estelares.
2. Cinemática estelar. Distancias, movimientos propios y velocidades radiales.
Determinación del movimiento del Sol y del sistema local de reposo (SLR).
Movimiento del SLR en la galaxia y el elipsoide de velocidades. Estrellas de alta
velocidad y velocidades residuales.
3. Rotación galáctica. Cinemática de la rotación. Las constantes de Oort y su significado
físico. Determinación de las constantes locales de la rotación; A, B, W y Ro. Las
observaciones en radio y en el óptico para la determinación de una ley general de
rotación. Aplicación a la determinación de distancias. La curva de rotación en otras
galaxias.
160


4. La estructura de la galaxia. La distribución del gas. Evidencia observacional y
cinemática de la estructura espiral en nuestra y otras galaxias. Distribución estelar y
de los elementos químicos en el disco, el bulbo y halo galácticos. Propiedades
estructurales globales; el núcleo, el bulbo, el disco y el halo. Determinación de algunos
modelos de potenciales galácticos.
5. Dinámica estelar y galáctica. El problema fundamental de la dinámica estelar. La
ecuación de Boltzmann y el teorema de Jeans. Ecuaciones de la hidrodinámica estelar.
Potenciales de esferoides y discos. Modelos auto consistentes y estructura orbital de
galaxias. Dinámica de la estructura espiral; ondas de densidad. Dinámica de cúmulos
estelares; mezcla orbital, relajación, estado de equilibrio virial, disolución. Ecuación de
Fokker-Planck. Fricción dinámica y catástrofe gravo térmica.

• Binney, J. y Tremaine, S. "Galactic Dynamics" Princeton Series in Astrophysics,

Princeton University Press, Princeton, 1987.
• King, I. "Galactic Dynamics" San Francisco, 1996.
• Gilmore, G., y Carswell, R. "The Galaxy" Dordrecht, Reidel, 1987.
• Mihalas, D. y Binney, J. "Galactic Astronomy" Freeman, San Francisco, 1981.
• Shapiro, S.L. & Teukolsky, S.A. "Black Holes, White Dwarfs and Neutron Stars", Wiley-
Interscience, New York, 1983.
• Gilmore, G., King, I., y Van Der Kuit, P. "The Milky Way as a Galaxy" University Science
Books, Mill Valley, California, 1989.
• Ogorodnikov, K.F. "Dynamics of Stellar Systems" Pergamon, London, 1965.
• Van Woerden, H., Allen, R.J., y Burton, W.B. "The Milky Way Galaxy, Simp. 106, IAU"
Dordrecht, Reidel, 1985.
• Spitzer, L. "Dynamical Evolution of Globular Clusters" Princeton University Press,
Princeton, 1987.
161


Relatividad general

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFB-26

Descripción de la asignatura: La Cosmología, la ciencia del Universo, se ha convertido en

una de las ramas de la ciencia más populares y respetadas en la actualidad. La gran riqueza de
investigaciones teóricas y de observaciones tanto a nivel astrofísico como cosmológico, han
puesto a éste tema en la frontera de la Física teórica moderna. El objetivo del curso será el
impartir el conocimiento de la teoría de la relatividad general, o bien, las teoría de Einstein de
la gravitación, la cual es la base para entender a la cosmología moderna. Se contempla
entender los principios y postulados tanto geométricos como físicos que sirven para formular
dicha teoría y se pretende generar discusiones sobre las soluciones generales a las ecuaciones
de Einstein, poniendo especial énfasis en soluciones de tipo cosmológico. Se discutirán los
postulados sobre los cuales está fundamentado el modelo cosmologico estándar. Después se
abordaran distintas soluciones cosmológicas a las ecuaciones de campo de Einstein, las cuales
representan distintos modelos cosmológicos para el Universo que tienen características y
propiedades espacio temporales muy particulares. Dichos modelos son de gran relevancia en
la cosmologia ya que modelan distintas etapas y/o regiones del Universo durante su
evolución.
Contenido:
• Variedades y campos tensoriales.

• Curvatura.
• Ecuaciones de Einstein.
• Solución de Schwarzschild.
• Cosmología.
• Distintas formulaciones de la relatividad general.
• Tópicos avanzados.

Índice temático:
1. Variedades y campos tensoriales. Variedades. Planos tangentes y cotangentes.

Tensores. Tensor métrico. Notación tensorial abstracta.
162


2. Curvatura. Transporte paralelo y derivación covariante. Curvatura. Identidades de
Bianchi. Geodésicas. Técnicas para el cálculo de curvatura.
3. Ecuaciones de Einstein. Covarianza. Relatividad general. Límite Newtoniano.
Radiación gravitacional.
4. Solución de Schwarzchild. Derivación de la solución de Schwarzchild. Soluciones en el
interior. Geodésicas para el espacio de Schwarzchild. Corrimiento al rojo gravitacional.
Desviación de la luz. Extensión de Kruskal.
5. Cosmología. Homogeneidad e isotropía. Dinámica de un universo homogéneo e
isotrópico Corrimiento al rojo cosmológico. Horizontes. Evolución de nuestro
universo.
6. Distintas formulaciones de la relatividad general. Homogeneidad e isotropía. Dinámica
de un universo homogéneo e isotrópico. Corrimiento al rojo cosmológico. Horizontes.
Evolución de nuestro universo.
7. Tópicos avanzados. Modelos cosmológicos. Agujeros negros.

• R. M. Wald, General relativity (University of Chicago Press, 1984).

• C. W. Misner, K. S. Thorne, and J. A. Wheeler, Gravitation (Freeman, 1973).
• B. O’Neill, Semi-Riemannian Geometry With Applications to Relativity (Volume

103 Pure and Applied Mathematics) (Academic Press, 1983).
• C. T. J. Dodson, and T. Poston, Tensor Geometry: The Geometric Viewpoint and its
Uses (Graduate Texts in Mathematics) (Springer, 1991).
• M. Nakahara, Geometry, Topology and Physics, Second Edition (Graduate Student
Series in Physics) (Taylor & Francis, 2003)
• S. W. Hawking and G. F. R. Ellis, The Large Scale Structure of Space-Time
(Cambridge Monographs on Mathematical Physics) (Cambridge University Press,
1975)
• T. Thiemann, Modern Canonical Quantum General Relativity (Cambridge
Monographs on Mathematical Physics) (Cambridge University Press, 2008).
163


Teoría cuántica de campo

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFB-27

Descripción de la asignatura: La intención primordial del curso, es introducir al estudiante

en el desarrollo de algunas teorías de campos invariantes ante las transformaciones de
Lorentz a nivel cuántico. Se pondrá especial énfasis en los aspectos cuánticos que pueden ser
descritos en términos clásicos, y se manejará como ejemplo central al campo
electromagnético. Se tiene contemplado, además, formalizar las bases para llevar a cabo la
cuantización de los tipos esenciales de campos dinámicos que juegan un papel importante en
la Física de altas energías, a saber: los campos escalar, espinorial (Dirac) y vectorial (esencial
en la cuantización de la electrodinámica). La invarianza de las teorías de campo se discutirá en
términos de lagrangianos y del teorema de Noether. Se introducirán además teorías de norma
no-Abelianas como generalización de la electrodinámica maxwelliana. Algunos puntos
importantes serán la formulación de la cuantización a través de integrales de trayectoria y el
estudio de las reglas de Feynman, así como los propagadores asociados a los campos de
norma. Así mismo, se pretende impactar en las Líneas de Física-Matemática y Cuantización,
siendo que ambas Líneas se relacionan con estructuras de interés para teorías de norma y que
están contempladas como parte de dichas líneas. El estudiante se verá por lo tanto beneficiado
al considerar la cuantización de teorías de norma por los métodos de teoría cuántica de
campos y dará cuenta de que los problemas que enfrenta su cuantización serán
imprescindibles para el desarrollo de las habilidades necesarias en el estudiante para llevar a
cabo cuantización de teorías de norma por diversos métodos tanto canónicos como
geométricos.
Contenido:
• Ecuaciones para una partícula.

• Simetrías y campos de norma.
• Cuantización canónica.
• Integrales de trayectoria.
• Reglas de Feynman.
• Modelo de Weinberg-Salam.
• Renormalización.

164


Índice temático:
1. Ecuaciones para una partícula. Ecuación de Klein-Gordon. Representaciones del grupo

de Lorentz. Ecuación de Dirac. Grupo de Poincaré. Ecuaciones de Maxwell y Proca.
Ecuaciones de Yang-Mills.
2. Simetrías y campos de norma. Formulación lagrangiana. Formulación hamiltoniana.
Teorema de Noether. Campo escalar. Campo electromagnético. Campo de Yang-Mills.
Geometría de los campos de norma.
3. Cuantización canónica. Campo de Klein-Gordon. Campo de Dirac. Campo
electromagnético. Campo vectorial masivo.
4. Integrales de trayectoria. Formulación de la mecánica cuántica por integrales de
trayectoria. Teoría de perturbaciones. Matriz S. Dispersión de Coulomb. Propiedades
de las integrales de trayectoria.
5. Reglas de Feynman. Derivación e integración funcional. Funcionales generadores para
el campo escalar.
6. Funciones de Green para la partícula libre. Funcionales generadores para campos
interactuando.
7. Teorías φ4. Funcionales generadores para diagramas conexos. Propagadores. Método
de Faddeev-Popov. Auto-energía y funciones vértice. Identidades de Ward-Takahashi.
Transformación de Becchi-Rouet-Stora.
8. Modelo de Weinberg-Salam. Teorema de Goldstone. Rompimiento espontáneo de
simetrías de norma.
9. Modelo de Weinberg-Salam.
10. Renormalización. Divergencias en teorías φ4. Regularización dimensional en teorías
φ4. Renormalización de teorías φ4. Grupo de renormalización. Divergencias y
regularización dimensional para QED. Renormalización para QED.

• L. H. Ryder, Quantum field theory (Cambridge University Press, 1996).

• M. Kaku, Quantum field theory (Oxford University Press, 1993).
• M. E. Peskin and D. V. Schroeder, An introduction to quantum field theory (Addison-

Wesley, 1996).
• E. Zeidler, Quantum Field Theory Vol II: Quantum Electrodynamics: A Bridge between
mathematicians and physicistss (Springer, 2009).
• M. Maggiore, A modern introduction to Quantum Field Theory (Oxford Master Series

in Statistical, computational and theoretical Physics) (Oxford University Press, 2005)
165


• S. Weinberg, The Quantum Theory of fields Vol I: Foundations (Cambridge University
Press, 2005).
• T. Thiemann, Modern Canonical Quantum General Relativity (Cambridge Monographs

on Mathematical Physics) (Cambridge University Press, 2008).
166


Teorías de norma en física de partículas

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-28

Descripción de la asignatura: El estudio de las Teorías de Norma es crucial para la

comprensión de ramas tan diversas de la física actual como lo son la Física de las Partículas
Elementales, los Modelos Nucleares y la Cosmología. Los conocimientos y habilidades que se
adquieren a través del estudio de esta asignatura, permiten acceder a una de las fronteras más
activas de la física contemporánea, además de constituir una primera aproximación de una
teoría física que combina la Mecánica Cuántica, la Teoría de la Relatividad y la Mecánica
Cuántica Relativista. El estudiante adquirirá los conocimientos y habilidades necesarias para
comprender el contenido físico de las teorías de norma. Podrá calcular secciones eficaces de
los procesos más simples de la interacción de la materia con la radiación e interpretara los
resultados de experimentos que involucran partículas de altas energías. Esta materia tiene
relación con las ligas de generación y aplicación del conocimiento de: propiedades
electromagnéticas del neutrino y con la producción de bosones vectoriales y bosones de
Higgs.
Contenido:
• Simetría Global no-Abeliana.

• Simetría de Gauge Local no-Abeliana.
• Rompimiento Espontáneo de una Simetría Global.
• Rompimiento Espontáneo de una Simetría Local.
• Fenomenología de Interacciones Débiles.
• La Teoría de Gauge de Weinberg-Salam-Glashow de las Interacciones Electrodébiles.

Índice temático:
1. Simetría Global no-Abeliana. La simetría de sabor SU(2). La simetría de sabor SU(3).

Simetría global no-Abeliana en lagrangianos de teoría cuántica de campos.
2. Simetría de Gauge Local no-Abeliana. Simetría local SU(2): la derivada covariante e

interacciones con materia. Derivada covariante y transformación de coordenadas.
167


Curvatura geométrica y el tensor intensidad de campo de gauge. Simetría local SU(3).
Simetría local no-Abeliana en lagrangianos de teoría cuántica de campos.
3. Rompimiento Espontáneo de una Simetría Global. Introducción. El teorema de Fabri-

Picasso. Simetría rota espontáneamente en física de materia condensada. El
ferromagnetismo. Teorema de Goldstone. Simetría global SU(1) rota
espontáneamente. Simetría global no-Abeliana rota espontáneamente.
4. Rompimiento Espontáneo de una Simetría Local. Partículas vectoriales sin masa y

partículas vectoriales masivas. Rompimiento espontáneo de una simetría local U(1).
Rompimiento espontáneo de una simetría local SU(2)XU(1).
5. Fenomenología de Interacciones Débiles. Teoría de Fermi del decaimiento beta

nuclear. Violación de paridad en interacciones débiles. Teoría V-A: quiralidad y
helicidad. Número leptónico. Teoría corriente-corriente para interacciones débiles de
leptones. Cálculo de la sección eficaz nu_mu+e- à mu+un_e. Corriente neutra débil
leptónica.
6. La Teoría de Gauge de Weinberg-Salam-Glashow de las Interacciones Electrodébiles.

Isospín débil e hipercarga: el grupo SU(2)XU(1) de las interacciones electrodébiles. La
corriente leptónica. La corriente de quarks. Predicciones simples a nivel árbol. El
descubrimiento de W+- y Z en el CERN. La masa de fermiones. Mezcla de tres familias.
El Quark top. El sector de Higgs.
• J. R. Aitchison, A. J. G. Hey. Gauge Theories in Particle Physics, Institute of Physics

Publishing, 2004.
• H. M. Pilkuhn, Relativistic Quantum Mechanics, Springer, 2003.

• W. Greiner, J. Reinhardt, Quantum Electrodynamics, Springer 1994.
• Halzen, A. D. Martin, Quarks and Leptons: An Introductory Course in Modern Particle
Physics, Wiley, 1984.
168


Teoría general de campos clásicos

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFB-29

Descripción de la asignatura: Este curso está destinado a los candidatos que dominan los
cálculos diferencial e integral, el análisis vectorial y los fundamentos de la teoría de la
relatividad especial; elementos del álgebra y análisis tensorial se exponen en el curso según
vayan siendo necesarios. El propósito fundamental de este curso es esclarecer el sentido
matemático y el contenido de teoría de campos clásicos.
Contenido:
• Estructura del espacio-tiempo.

• Principios generales de la descripción de campos en la teoría clásica.
• Campo escalar non-lineal.
• Fundamentos de electrodinámica clásica.
• Principios de la teoría de campos de calibración.
• Gravitación.

Índice temático:
1. Principios generales de la teoría clásica del campo. Transformaciones de Lorentz.

Cinemática relativista. Transformaciones generales de Lorentz. Principio variacional.
Teorema de Noether. Campo escalar.
2. Campo electromagnético. Ecuaciones de Maxwell. Acción para sistema de cargos y
campos. Ecuación de movimiento de partícula cargada en el campo electromagnético.
Obtención de ecuaciones de Maxwell del principio de la acción mínima. Tensor de
energía-momento del campo electromagnético. Teorema de Umov-Poynting. Campo
eléctrico constante. Campo magnético constante. Ondas electromagnéticas. Funciones
de Green de ecuación de ondas. Potenciales retardados. Radiación de ondas
electromagnéticas por una partícula cargada. Ecuación de Dirac-Lorentz.
169


3. Campos de Yang-Mills. Electrodinámica escalar. Grupo de calibración no-abeliana.
Campos de Yang-Mills auto-duales. Violación espontánea de la simetría. Soluciones
mono polares de ecuaciones de Yang-Mills.
4. Gravitación: Campo gravitacional en la teoría relativista. Teoría lineal del campo libre
sin masa con el espin 2. Interacción con materia. Campo gravitacional y la métrica.
Invariancia de calibración y curvatura. Ecuaciones de Einstein.

• D.V. Galtzov, Y.B.Gratz, V.C. Zhukovskii. Campos Clásicos. (Universidad de Moscu,

1991) en ruso.
• L. D. Landau and E. M. Lifshitz, The classical theory of fields (Course of theoretical

physics), 4th edition, Butterworth-Heinemann (1995).
• J. D. Jackson, Classical electrodynamics, 3nd. Edition. Wiley, 1999.
170


Tópicos avanzados de Física-Matemática

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-30
Descripción de la asignatura: La Física intenta comprender el universo elaborando un

modelo matemático y conceptual de la realidad que se utiliza para racionalizar, explicar y
predecir los fenómenos de la naturaleza, planteando una teoría física de la realidad. Su núcleo
central es la Física Matemática, aunque también se usan otras técnicas conceptuales. La Física
teórica constituye la rama de la Física que, basándose fuertemente en la Matemática, elabora
teorías y modelos con el fin de explicar y comprender fenómenos físicos, aportando las
herramientas necesarias no sólo para el análisis sino para la predicción del comportamiento
de los sistemas físicos. La Física teórica basa su progreso en el uso de la Matemática para
predecir fenómenos que aún no han sido observados experimentalmente así como otros que
nos permiten conocer el universo en formas no accesibles experimentalmente, en base a
principios bien demostrados experimentalmente. El estudio de esta materia proporcionará las
herramientas matemáticas para desarrollar diferentes líneas de la Física teórica, así mismo
dan el lenguaje requerido para presentar la Física con un formalismo más riguroso. Dentro de
los temas de, las formas diferenciales es común en varias áreas de la Física, por ejemplo, la
termodinámica, electrodinámica y la teoría de la relatividad. Las álgebras graduadas de Lie,
dan la matemática para trabajar modelos supersimétricos, la cual impacta en la línea de
investigación de modelos extendidos de partículas. Las variedades de Kälher, dan una
herramienta para tratar problemas físicos, ya que son variedades complejas con estructura
adicional, y esta variedad es una generalización de la geometría simpléctica El estudiante se
verá beneficiado con las diferentes herramientas necesarias para entender el lenguaje en que
las teorías modernas como la teoría de cuerdas o gravitación cuántica están cimentadas y
supersimetría.
Contenido:
• Formas diferenciales.
• Álgebras de Clifford.
• Álgebras graduadas de Lie.
• Variedades de Kähler.
• Teoría espectral.

171


Índice temático:
1. Formas diferenciales. Formas y tensores. Álgebra exterior. Derivada exterior.

Variedades e integración. Aplicaciones en Física.
2. Álgebra de Clifford. Bivectores y k-vectores. Álgebra de Pauli. Espinores. Álgebra de
Dirac. Identidades de Fierz. Aplicaciones en Física.
3. Álgebras graduadas de Lie. Números de Grassmann. Fermiones y anticonmutación.
Álgebra de Grassmann. Mecánica clásica para variables anticonmutativas. Fantasmas.
Álgebras diferenciales graduadas.
4. Variedades de Kähler. Variedades complejas. Cálculo en variedades complejas. Formas
diferenciales complejas. Variedades ermíticas y geometría diferencial ermítica.
Variedades de Kähler. Mecánica cuántica.
5. Teoría espectral. Espacios métricos. Espacios de funciones. Espacios Lp. Espacios de
Hilbert. Operadores en espacios de Hilbert. Teoría espectral.

• H. Flanders, Differential forms with applications to the Physical sciences (Dover,

1989).
• P. Lounesto, Clifford algebras and spinors (Cambridge University Press, 2001).
• M. Henneaux, and C. Teitelboim, Quantization of gauge systems (Princeton University
Press, 1992).
Series in Physics) (Taylor & Francis, 2003).
• L. Hansen, Functional anlysis: Entering Hilbert space (World Scientific, 2006).

• C. Godbillon, Geometrie Differentielle et Mecanique analytique (Hermann-Paris, 1969).

• D. Hestenes, Clifford algebra to geometric calculus: a unified language for mathematics
and physics (Springer, 1987).
• S. Weinberg, The quantum theory of fields, Vol III (Cambridge University Press, Taylor
& Francis, 2000).
• G. F. Simmons, Introduction to topology and modern analysis (Krieger Publishing
company, 2003

172


Tópicos avanzados de mecánica clásica

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-31

Descripción de la asignatura: La formulación de la mecánica clásica basada en un principio

variacional (mínima acción) además de elegante contiene muchas ventajas tanto teóricas
como técnicas al momento de atacar diversos problemas. Quizá una de las ventajas más
importantes de este formalismo no vectorial de la física clásica es el enlace que se da con la
mecánica cuántica por medio de cuantización canónica, integral de camino o bien cuantización
por deformación. Por otra parte el principio de mínima acción se puede ampliar a sistemas
que no se atacan en mecánica como electrodinámica, física de partículas, relatividad general,
teoría de cuerdas, alguno de estos casos lejos del alcance del formalismo en que se plantea la
mecánica clásica usual. El estudio de la presente materia repercute directamente en la línea de
Física Matemática. Al finalizar el curso el estudiante tendrá las herramientas matemáticas y el
conocimiento de los problemas físicos para proponer nuevas soluciones a problemas ya
resueltos de forma tradicional.
Contenido:
• Formas diferenciales.
• Variedades Simplécticas.
• Formalismo Canónico.
• No-conmutatividad.
• Formalismo de Nambu.

Índice temático:
1. Formas diferenciales. Formas externas. Multiplicación externa. Formas diferenciales.

Integración de formas diferenciales. Diferenciación externa.
2. Variedades Simplécticas. Estructuras simplécticas en variedades. Álgebra de Lie de
campos vectoriales. Álgebra de Lie de funciones hamiltonianas. Geometría simpléctica.
Atlas simpléctico.
173


3. Formalismo Canónico. La integral invariante de Poincaré-Cartan. Aplicaciones de la
integral invariante de Poincaré-Cartan. Principio de Hugens. Método de Hamilton-
Jacobi. Funciones generadoras.
4. No conmutatividad. Introducción. Teorema de Darboux. Mecánica clásica no
conmutativa. Producto Moyal. Principio de incertidumbre generalizado. Aplicaciones.
5. Formalismo de Nambu. Introducción. Corchetes canónicos de Nambu. Variedades de
Nambu-Poisson. Formalismo canónico y acción. Cuantización. Aplicaciones.

• Arnold, Mathematical Methods of Classical Mechanics (Springer, 2000).

• Leon a. Takhtajan Quantum Mechanics for mathematicians (American mathematical
Society, 2008.
• Darryl D Holm, Geometrics Mechanics Part I (Imperial College Press, 2008).
• L. Takhtajan, On Foundation of Generalized Nambu Mechanics (Comm. Math. Phys.
Volume 160, Number 2 (1994), 295-315, 2006).

• C. Godbillon, Geometrie Differentielle et Mecanique analytique (Hermann-Paris, 1969).

Series in Physics) (Taylor & Francis, 2003).
• G. F. Simmons, Introduction to topology and modern analysis (Krieger Publishing
company, 2003).

174


Cálculo de propiedades electrónicas

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-32
• Materia asociada a la Línea de investigación: MSCM

Descripción de la asignatura: La posibilidad de generar corrientes eléctricas en los

materiales depende de la estructura e interacción de los átomos que los componen. Los
átomos están constituidos por partículas cargadas positivamente (los protones),
negativamente (los electrones) y neutras (los neutrones). La conducción eléctrica de los
materiales sólidos, cuando existe, se debe a los electrones más exteriores, ya que tanto los
electrones interiores como los protones de los núcleos atómicos no pueden desplazarse con
facilidad. Los materiales conductores por excelencia son metales, como el cobre, que
usualmente tienen un único electrón en la última capa electrónica. Estos electrones pueden
pasar con facilidad a átomos contiguos, constituyendo los electrones libres responsables del
flujo de corriente eléctrica. En otros materiales sólidos los electrones se liberan con dificultad
constituyendo semiconductores, cuando la liberación puede ser producida por excitación
térmica, o aisladores, cuando no se logra esta liberación. Los mecanismos microscópicos de
conducción eléctrica son diferentes en los materiales superconductores y en los líquidos. En
los primeros, a muy bajas temperaturas y como consecuencia de fenómenos cuánticos, los
electrones no interactúan con los átomos desplazándose con total libertad (resistividad nula).
En los segundos, como en los electrólitos de las baterías eléctricas, la conducción de corriente
es producida por el desplazamiento de átomos o moléculas completas ionizadas de modo
positivo o negativo. Los materiales superconductores se usan en imanes superconductores
para la generación de elevadísimos campos magnéticos.
Contenido:
• Estados electrónicos.
• Estructura electrónica de sólidos.
• Estados de volumen y superficie.
• Propiedades electrónicas de metales, semiconductores y aislantes.
• Métodos empíricos.
• Métodos de primeros principios.

175


Índice temático:
1. Estados electrónicos. Mecánica cuántica. Estructura electrónica de los átomos.

Estructura electrónica de moléculas pequeñas. Enlace polar simple. Moléculas
diatómicas.
2. Estructura electrónica de sólidos. Bandas de energía. Dinámica del electrón.
Características de diferentes tipos de sólidos.
3. Estados de volumen y superficie.
4. Propiedades electrónicas de metales, semiconductores y aislantes.
5. Métodos empíricos. Teorema de Bloch. Modelo tight binding. Método SGHM.
6. Métodos de primeros principios. Método LMTO. Método APW. Método LAPW-lo

• Electronic structure and the properties of solids, Walter Harrison, W. H. Freeman and
Company, San Francisco, USA (1989).
• Elementary Electronic Structure, Walter Harrison, World Scientific, London (1999).
• Introduction to the electronic Properties of Material, 2nd Edition, David. C. Jiles, Nelson
Thornes Ltd, UK (2001).
• Theory of single and multiple interfaces: The method of surfaces Green Function
Matching, Federico Garcia Moliner and Victor R. Velasco, World Scientific Publishing
Co. London (1992).
176


Caracterización de materiales

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-33
§ Materia asociada a la Línea de investigación: MSCM

Descripción de la asignatura: El alumno analizará los fundamentos (aspectos físico-

químicos) y aplicaciones de algunas de las técnicas de caracterización más utilizadas para
determinar las propiedades físicas, químicas, estructurales, etc., de materiales, haciendo
énfasis en los aspectos prácticos. Además, se ejemplificará el uso de estas técnicas, con la
caracterización de algunos materiales representativos.
Contenido:
• Propiedades estructurales.
• Propiedades térmicas.
• Propiedades eléctricas.
• Propiedades ópticas.
• Propiedades magnéticas.
• Propiedades químicas.

Índice temático:
1. Propiedades estructurales. Técnica de rayos x. Microscopio de fuerza atómica.

Microscopio de efecto túnel.
2. Propiedades térmicas. Capacidad calorífica. Foto acústica. Análisis termo gravimétrico.
Calorimetría diferencial de barrido. Análisis térmico diferencial.
3. Propiedades eléctricas. Efecto Hall. Técnica de impedancia. Conductividad. Radio
frecuencia y microondas.
4. Propiedades ópticas. Técnicas de microscopía óptica. Técnica de absorción. Reflexión.
Fotorreflectancia. Espectroscopia Raman. Espectroscopia Infrarroja.
Fotoluminiscencia.
5. Propiedades magnéticas. Introducción a las propiedades magnéticas de los materiales.
Medición de estabilidad térmica de propiedades magnéticas. Medición del loop de
histéresis (Mr, Ms, S*, Hc, Mrt, SFD). Magnetización Inicial. Medición de anisotropía
magnética. Medición de pérdida de histéresis rotacional.
177


6. Propiedades químicas. Alcances y limitaciones de las técnicas orientadas al análisis
elemental. Descripción de técnicas comunes en el Análisis Elemental. Revisión de los
criterios en la selección de la técnica de análisis. Preparación de muestras.
Interpretación de resultados.

§ Optical Processes in Semiconductors, Pankove, Dover publications.

§ Introducción a la ciencia de materiales, J. M. Arbelia, A. M, Cintas, Consejo Superior de
Investigaciones Científicas.
§ The physical chemistry of solids, R.J. Borg and G. J. Dienes, Academic Press.
§ Química, Raymond Chang, 4ta edición, McGraw-Hill
§ Characterization techniques for semiconductor technology, Proceedings of SPIE Vol.
276, 188 (1981).
§ Elements of X-Ray Diffraction, Cullity B. D., Addison-Wesley, Mass., 1956.
§ Laboratory Notes in Electrical and Galvanomagnetic Measurement (Materials Science),
H.H. Wieder, Elsevier Science, 1979.

178


Física del estado sólido

§ Semestre recomendado: 2 o 3
§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-34
Descripción de la asignatura: Presentar los fundamentos sobre los diferentes fenómenos

físicos que se dan en los sólidos. En particular, que se tenga conocimiento de cómo la bastedad
de átomos confabula para dar origen a los sorprendentes y variados fenómenos físicos en un
sólido.
Contenido:
• Introducción.
• Excitaciones elementales.
• Estructura y enlaces en sólidos.
• Teoría de bandas.
• Semiconductores.
• Defectos y difusión.
• Aislantes y sus propiedades.
• Dispositivos semiconductores.
• Más sobre excitaciones elementales.
• Magnetismo.

Índice temático:
1. Introducción. Teorías y modelos en la física del estado sólido. Aproximaciones al

problema de muchos cuerpos. Fenómenos colectivos. Fenómenos emergentes: física
de partículas y vacío.
2. Excitaciones elementales. Fonones y el gas de Fermi. Capacidad calorífica de aislantes
y metales. Aproximación semiclásica del transporte electrónico. Apantallamiento y
teoría de Thomas-Fermi. Conductividad óptica de metales.
3. Estructura y enlaces en sólidos. Variedad de estados de la materia. Tipos de enlaces.
Sólidos periódicos. Estructura y enlaces. Rayos x y espacio recíproco.
4. Teoría de bandas. Aproximación de un solo electrón. Potencial periódico y el teorema
de Bloch. Modelo de Kronig-Penney. Aproximación de electrones casi-libres.
179


Aproximación de amarre fuerte. Estructura de bandas de materiales reales: conductor,
semiconductor y aislante.
5. Semiconductores. Semiconductores intrínsecos y extrínsecos. Estadística de electrones
y huecos. Energía de ionización de impurezas. Estadística de semiconductores
extrínsecos. Unión pn.
6. Defectos y difusión. Condiciones termodinámicas para el equilibrio. Defectos de la red.
Entropía configuracional. Difusión.
7. Aislantes y sus propiedades. Teoría de campo local. Relación de Clausius-Mossotti.
Teoría de Polarizabilidad. Modos ópticos en cristales iónicos. Propiedades ópticas de
cristales iónicos. Aislantes covalentes.
8. Dispositivos semiconductores. LED, celda solar, láser semiconductor, y transistor de
efecto de campo.
9. Más sobre excitaciones elementales. Gas de electrones en interacción: plasmones.
Interacción electrón-hueco: excitones. Interacción espín-espín: magnones. Interacción
electrón-fonón: polarones.
10. Magnetismo. Diamagnetismo y paramagnetismo. Origen de interacciones magnéticas.
Ferromagnetismo y anti ferromagnetismo. Interacciones de intercambio magnéticas.
Ondas de espín. Magneto resistencia gigante y colosal.
11. Tópicos especiales (Opcional). Superconductividad: Teoría BCS. Termodinámica y
transporte. Invarianza de norma. Teoría Landau-Ginzburg. Electrodinámica. Desorden:
Localización de Anderson. Transición metal-aislante. Efectos de interacción. Efecto
Kondo. Efecto Hall cuántico y sistemas electrónicos correlacionados. Físicas de
sistemas de baja dimensión: sistemas 1D y 2D. Física de superficies.
Bibliografía
• N. W. Ashcroft and N. D. Mermin, Solid state physics, Holt, Rinehart and Winston, 1976.
• C. Kittel, Introduction to solid state physics, John Wiley & Sons, Inc., 1995.
• J. M. Ziman, Principles of the theory of solids, John Wiley & Sons, Inc., 1976.
• M. A. Omar, Elementary solid state physics: principle and applications, Addison-
Wesley, 1975.
180


Física de semiconductores

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-35

Descripción de la asignatura: Dar a conocer una descripción detallada de la física básica de

semiconductores así como una amplia variedad de importantes fenómenos físicos presentes
en éstos, de los simples a los avanzados. Adicionalmente, presentar tópicos recientes de
estructuras cuánticas semiconductoras tales como gases bidimensionales de electrones,
transporte balístico, efecto Hall cuántico y bloqueo de Coulomb.
Contenido:
• Estructura de bandas de semiconductores.

• Estructura de bandas y resonancia ciclotrón.
• Aproximación de masa efectiva.
• Propiedades ópticas.
• Transporte electrónico e interacción electrón-fonón.
• Fenómenos de magneto-transporte.
• Estructuras cuánticas.

Índice temático:
1. Estructura de bandas de semiconductores. Modelo de electrón libre. Teorema de

Bloch. Aproximación de electrones casi libres. Esquema de zona reducida. Método de
pseudopotenciales. Perturbación k·p.
2. Estructura de bandas y resonancia ciclotrón. Resonancia ciclotrón. Análisis de bandas
de valencia. Interacción espín-órbita. No parabolicidad de la banda de conducción.
Movimiento de electrones en un campo magnético y niveles de Landau.
3. Aproximación de masa efectiva. Funciones de Wannier. Aproximación de masa
efectiva. Impurezas intersticiales. Niveles de impurezas en semiconductores
elementales.
4. Propiedades ópticas. Absorción y reflexión. Coeficiente de absorción. Transiciones
indirectas. Excitones. Función dieléctrica. Potencial de deformación. Cambio de la
estructura de bandas vía tensión. Espectroscopia de modulación. Dispersión Raman.
Dispersión de Brillouin. Polaritones. Plasmones.
181


5. Transporte electrónico e interacción electrón-fonón. Vibraciones de la red. Ecuación
de transporte de Boltzmann. Probabilidad de dispersión y elementos de matriz de
transición. Tiempo de relajación y tasa de dispersión. Movilidad.
6. Fenómenos de magneto-transporte. Teoría fenomenología del efecto Hall. Efectos de
magnetoresistencia. Efecto Shubnikov-de Haas. Resonancia magnetofonónica.
7. Estructuras cuánticas. Sistemas de gases electrónicos bidimensionales. Fenómeno de
transporte en gases electrónicos bidimensionales. Superredes. Fenómenos
mesoscópicos.

• C. Hamaguchi, Basic semiconductor physics, Springer, 2001.

• P. Yu and M. Cardona, Fundamentals of semiconductors, Springer, 1996.
• O. Madelung, Introduction to solid state theory, Springer, 1978.
• S. M. Sze and K. K. Ng, Physics of semiconductor devices, John Wiley & Sons, Inc., 2007.

182


Heteroestructuras cuánticas

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-36

Descripción de la asignatura: Proporcionar una descripción detallada de los principios

físicos clave de las heteroestructuras cuánticas. Distinguir claramente entre pozos, hilos y
puntos cuánticos así como las diferentes propiedades y efectos presentes en éstos tanto desde
el punto de vista electrónico, fonónico y óptico como del transporte.
Contenido:
• Electrones en estructuras cuánticas.

• Estructuras cuánticas particulares.
• Vibraciones de la red en estructuras cuánticas.
• Dispersión electrónica en estructuras cuánticas.
• Transporte paralelo en estructuras cuánticas.
• Transporte perpendicular en estructuras cuánticas.

Índice temático:
1. Electrones en estructuras cuánticas. Introducción. Pozos cuánticos: Densidad de

estados, Efectos cuánticos en la parte continua del espectro electrónico. Hilos
cuánticos: Función de onda y sub-bandas de energía, densidad de estados. Puntos
cuánticos: Función de onda y niveles de energía, densidad de estados. Acoplamiento
entre pozos cuánticos. Superredes. Excitones en estructuras cuánticas. Estados ligados
de Coulomb y defectos en estructuras cuánticas.
2. Estructuras cuánticas particulares. Introducción. Espectro electrónico de algunos
materiales semiconductores. Estructuras pseudomórficas. Dispositivos de heterounión
simple: Dopado selectivo. Estructuras cuánticas con modulación de dopado.
3. Vibraciones de la red en estructuras cuánticas. Introducción. Vibraciones de cadenas
lineales de átomos. Caso tridimensional. Fonones. Vibraciones acústicas. Longitudes
de onda cortas y vibraciones ópticas.
4. Dispersión electrónica en estructuras cuánticas. Dispersión elástica en sistemas
electrónicos bidimensionales. Apantallamiento de un gas de electrones bidimensional.
Dispersión por impurezas ionizadas remotas. Dispersión por la rugosidad de las
183


interfaces. Interacción electrón-fonón. Fonones acústicos. Fonones ópticos. Dispersión
de electrones por fonones acústicos y ópticos en: pozos, hilos y puntos cuánticos.
5. Transporte paralelo en estructuras cuánticas. Introducción. Transporte electrónico
lineal. Transporte en campos intensos: Electrones fríos, tibios y calientes, saturación
de la velocidad, efecto Gunn, fonones fuera de equilibrio, efectos de tamaño de
electrones calientes. Electrones calientes en estructuras cuánticas: transporte no
lineal en gases electrónicos bidimensionales, transporte no lineal en hilos cuánticos,
transferencia espacio-real de electrones calientes, otros efectos de transporte en
campos intensos.
6. Transporte perpendicular en estructuras cuánticas. Introducción. Tunelamiento
resonante: tunelamiento coherente y secuencial, resistencia diferencial negativa.
Superredes y dispositivos balísticos de inyección: resistencia diferencial negativa y
transconductancia de dispositivos con superredes balísticas, oscilaciones de Bloch,
escalera de niveles de Wannier-Stark. Transferencia de un solo electrón y bloqueo de
Coulomb.

Bibliografía básica
• V. V. Mitin, V. A. Kochelap, and M. A. Stroscio, Quantum heterostructures:

Microelectronics and optoelectronics, Cambridge University Press, 1999.
• S. M. Sze and K. K. Ng, Physics of semiconductor devices, John Wiley & Sons, Inc., 2007.
• J. H. Davies, The physics of low dimensional semiconductors: an introduction,
Cambridge University Press, 1998.
• S. Datta, Quantum transport: Atom to transistor, Cambridge University Press, 2005.
• C. Hamaguchi, Basic semiconductor physics, Springer, 2001.
• P. Yu and M. Cardona, Fundamentals of semiconductors, Springer, 1996.
• O. Madelung, Introduction to solid state theory, Springer, 1978.

184


Holografía digital

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-37

Descripción de la asignatura: El objetivo del curso es lograr que el alumno aprenda los
principios físicos de la holografía e interferometría holográfica, además de que conozca
algunas aplicaciones importantes en el campo de la metrología óptica. El estudiante
aprenderá a diseñar arreglos holográficos, conocerá los procesos para digitalizar y reconstruir
numéricamente hologramas, y aplicar estas metodologías para medir algunos eventos físicos.
Contenido:
· Fundamentos ópticos de holografía.

· Grabado digital y reconstrucción numérica de campos de onda.
· Interferometría holográfica.
· Evaluación cuantitativa de la fase de interferencia.
· Procesamiento de fase de interferencia.
· Metrología de moteado.

Índice temático:
1. Fundamentos ópticos de holografía. Ondas de luz. Interferencia de luz. Coherencia.

Teoría escalar de difracción. Fenómenos de moteado. Grabado holográfico y
reconstrucción óptica. Elementos de los arreglos holográficos. Cámaras CCD y CMOS.
2. Grabado digital y reconstrucción numérica de campos de onda. Grabado digital de
hologramas. Reconstrucción numérica por medio de la transformada de Fresnel.
Reconstrucción numérica por deconvolución. Otros métodos de reconstrucción
numérica. Análisis ondulatorio en la holografía digital. Aplicaciones no-
interferométricas de la holografía digital.
3. Interferometría Holográfica. Generación de patrones de interferencia holográficos.
Vibración y el vector sensibilidad. Localización de franjas. Mediciones con
interferometría holográfica.
4. Evaluación cuantitativa de la fase de interferencia. El rol de la fase de interferencia.
Perturbación de interferogramas holográficos. Esqueletización de franjas.
Heterodyning temporal. Evaluación por fase muestreada. Evaluación por la
185


transformada de Fourier. Evaluación dinámica. Interferometría holográfica digital.
Demodulación de fase de interferencia.
5. Procesamiento de fase de interferencia. Medición de desplazamientos. Matriz
sensibilidad. Análisis en holografía de tensión y esfuerzos. Métodos híbridos. Análisis
de vibración. Contorneo holográfico. Medición de contornos por medio de holografía
digital. Interferometría holográfica comparativa. Medición rango de extensión.
Campos de índice de refracción en medios transparentes. Detección de defectos por
pruebas holográficas no destructivas.
6. Metrología de moteado. Fotografía de moteado. Electrónica e interferometría de
moteado digital. Holografía de electroóptica. Shearography.

Bibliografía básica
• Optical Metrology, Kjll J. Gasvik, Ed. WILEY third edition, (2003).

• Handbook of holographic interferometry, Thomas Kreis,WILEY-VCH (2005).
• Digital Holography, Uls schnars, Werner Jueptner, Springer (2005).
• Holographic and Speckle Interferometry, R. Jones and C. Wykes, Ed. Cambridge Studies
in Modern Optics, second edition (2001).
• Holographic Interferometry. Charles M. Vest,WILEY (1980).
• Óptica, Eugene Hecht, Addison Wesley, Tercera edición (2000).
• Window (ed.), Strain gauge technology, 2nd ed., London (etc.): Elselvier Applied
Science, (1992).

186


Ingeniería óptica

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-38

Descripción de la asignatura: La ingeniería óptica estudia la generación, detección,

transmisión y manipulación de la luz para diseñar, fabricar y probar dispositivos y sistemas
ópticos. La ingeniería óptica se aplica en sistemas de comunicación, visualizadores,
almacenamiento de datos, iluminación, monitoreo remoto. Se fundamenta en la óptica
geométrica, óptica física y radiometría. En este curso el estudiante aprenderá los principios
básicos del diseño, fabricación y prueba de algunos dispositivos e instrumentos ópticos
tradicionales.
Contenido:
• Conceptos básicos de ingeniería óptica.

• Conceptos básicos de óptica geométrica.
• Materiales ópticos básicos.
• Introducción a la radiometría.
• Análisis de sistemas ópticos.

Índice temático:
1. Conceptos básicos de ingeniería óptica. Introducción a la ingeniería. Panorámica

general de la óptica.
2. Introducción a la radiometría y fotometría. Cantidades radiométricas básicas. La
radiancia y el transporte de energía. Radiometría de imágenes. Radiometría de láseres.
Fotometría e iluminación.
3. Introducción a la ciencia del color. Estructura del ojo humano. Funciones de
respuesta visual. Efectos cromáticos de estímulo visual. Funciones de igualación de
color. Valores triestímulos RGB. Coordenadas cromáticas r-g-b. Ecuaciones
colorimétricas. Coordenadas cromáticas CIE 1931 (x,y,z). Iluminantes y observador
estándar. Mezclas de colores: metámeros y sistemas de fuentes RGB.
4. Introducción a la óptica de colectores y proyectores de luz. Concentración de luz.
Lente esférica y lente asférica. Lente de Fresnel. Reflector cónico. Reflector involuto.
187


Tubo de luz cónico-rectangular. Concentrador parabólico compuesto. Iluminación
Kohler/Abbe. Tubos de luz.
5. Análisis de sistemas ópticos. Telescopios y microscopios. Detectores ópticos.
Espectrofotómetros. Fibras ópticas. Sistemas de iluminación.

• W. J. Smith “Modern Optical Engineering” McGraw-Hill, 3a o 4ª Edición.

• D. Malacara, “Color Vision and Colorimetry: Theory and Applications,” SPIE Press
(2002).
• J. Chaves, Introduction to Nonimaging Optics, CRC Press (2008).
• E. Hecht, “Óptica,” Addison Weley, 3a o 4ª Edición.

188


Introducción al análisis multivariante

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-39

Descripción de la asignatura: El alumno aprenderá los principios básicos del análisis

multivariante de datos, así como la interpretación de resultados y sus aplicaciones.
Contenido:
• Técnicas de análisis multivariante de datos.

• Análisis de componentes principales (pca).
• Calibración multivariante.

Índice temático:
1. Introducción. Observaciones indirectas y correlación. Estructura latente de datos.

Análisis multivariante vs estadística multivariante. Objetivos principales de las
técnicas de análisis multivariante de datos. Técnicas multivariantes.
2. Análisis de componentes principales (pca). Representación de datos en forma
matricial. El espacio de variable-gráfica de objetos en p-dimensiones. Representación
gráfica de objetos en el espacio de variable. La primera componente principal.
Componentes principales de orden mayor. Modelos de componentes principales-
scores y loadings. Objetivos del PCA. Modelos de PC. Interpretando PCA. Algoritmo.
3. Calibracion multivariante. Modelos multivariantes (X, Y): Etapa de calibración.
Modelos multivariantes (X, Y): Etapa de predicción. Requerimientos para la
calibración multivariante. Introducción a la validación de modelos. Número de
componentes. Regresión univariante (y/x) y regresión lineal múltiple (MLR).
Colinealidad. Regresión de componentes principales (PCR). Regresión por mínimos
cuadrados parciales (PLS-R).

• Multivariate Data Analysis-In Practice-, 5th Edition, An introduction to multivariate

Data Analysis and Experimental Design. Kim H. Esbensen. CAMO.
• Multivariate Calibration, Harald Martens and Tormod Næs. John Wiley and Sons.
189


• Practical Guide to Chemometrics, Second edition, Edited by Paul Gemperline. Taylor
and Francis.

190


Introducción a las espectroscopias vibracionales

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-40

Descripción de la asignatura: Este curso se ha diseñado en un orden lógico para presentar al

estudiante los conceptos básicos y fundamentales de las espectroscopias vibracionales, así
como algunas de sus aplicaciones. El curso se ha dividido en cinco temas principales o
unidades. En la primera unidad, se describe el trasfondo histórico que le dio el carácter de
disciplina científica a las espectroscopias ópticas, para posteriormente presentar las bases
teóricas que rigen a las espectroscopias vibracionales (infrarrojo y de dispersión Raman). En
la segunda unidad, se abordan los tópicos referentes a la instrumentación general utilizada
para la obtención de espectros vibracionales, tanto infrarrojos como Raman. Asimismo en esta
unidad, se mostraran las diferentes técnicas y/o variantes de la espectroscopia infrarroja y
Raman. La tercera unidad estará enfocada en dar a conocer las herramientas
computacionales, así como los métodos y criterios utilizados para la interpretación y análisis
de los espectros vibracionales. Posteriormente, en la cuarta unidad del curso se mostrarán los
principios básicos de la simetría molecular (ej. operaciones de simetría, grupos puntuales) y
su relación con los espectros vibracionales. Finalmente, en la quinta unidad, se presentarán
algunas aplicaciones de las espectroscopias vibracionales en diferentes áreas científicas.
Contenido:
• Fundamentos teóricos de la espectroscopia Raman e infrarrojo.

• Instrumentación Raman y FTIR.
• Análisis e interpretación de espectros Raman y FTIR.
• Simetría molecular y tablas de carácter.
• Aplicaciones de la espectroscopia Raman y FTIR.

Índice temático:
1. Fundamentos teóricos de la espectroscopia Raman e infrarrojo. Historia. El

espectro electromagnético- símbolos y unidades. Modos normales de vibración. Reglas
de selección. Origen de los espectros Raman e infrarrojo. Raman versus Infrarrojo.
191


2. Instrumentación Raman y FTIR: Instrumentación Raman. Elementos principales.
Calibración instrumental. Técnicas de medición. Problemas de fluorescencia. Técnicas
experimentales en espectroscopia Raman. Microscopía Raman. Surface-Enhanced
Raman Spectroscopy (SERS). Espectroscopia Raman por imagen. Instrumentación
FTIR. El espectrómetro FTIR. Resolución espectral. Elementos principales. Métodos de
medición de muestras. Técnicas experimentales en espectroscopia IR. Técnicas de
transmisión. Técnicas de reflectancia.
3. Análisis e interpretación de espectros Raman y FTIR. Pre-procesamiento de
espectros. Métodos y criterios para el análisis de espectros. Frecuencias características
de grupos funcionales.
4. Simetría molecular y tablas de carácter. Operaciones y elementos de simetría.
Grupos puntuales. Representación de grupos. Tablas de carácter y modos normales.
5. Aplicaciones de la espectroscopia Raman y FTIR. Aplicaciones en microbiología.
Aplicaciones en medicina. Aplicaciones en el área de alimentos.

• Symmetry and Spectroscopy: An Introduction to Vibrational and Electronic

Spectroscopy, Daniel C. Harris Daniel C. Harris and Michael D. Bertolucci.
• Modern Spectroscopy, J. Michael Hollas, John Wiley and Sons, Ltd.
• Molecular Vibrations: The Theory of Infrared and Raman Vibrational Spectra by Edgar
Bright Wilson, J. C. Decius, and Paul C. Cross.

192


Introducción a la física de bajas temperaturas

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-41

Descripción de la asignatura: Por nuestra experiencia estamos acostumbrados a considerar

que la termodinámica de los sistemas depende de manera definida y clara de las magnitudes
que ayudan a caracterizarlos (volumen, temperatura, presión.), y que las ecuaciones de estado
que involucran a estas cantidades permanecen básicamente invariantes en un amplio margen
de temperatura. La experimentación, y los avances tecnológicos respecto al proceso de
enfriamiento que se desarrollaron en la primera parte del siglo XX dieron como resultado el
descubrimiento de fenómenos físicos que resultaron desconcertantes para el sentido común
de los investigadores de aquellos años. Estados de la materia como la súperfluidez o la
superconductividad resultaron todo un reto para la comunidad científica, y la explicación de
cada uno de ellos dio el mérito suficiente como para recibir el premio Nobel a quienes la
dieron. A baja temperatura la naturaleza muestra sus detalles. Cualidades de la materia que a
alta temperatura ni siquiera pueden ser registradas en los experimentos, a baja temperatura
son determinantes para las propiedades de la Física de los sistemas. En el régimen de baja
temperatura es posible que los subsistemas puedan interactuar entre sí de manera más
amplia, dando lugar a un nuevo orden interno, y permitiéndonos interpretar el mundo que
nos rodea de una manera más amplia.
Contenido:
• Magnitudes termodinámicas.
• Cambios de fase de primera y segunda clase.
• Cualidades de la materia y su representación.
• Cuerpos condensados.
• Funciones de densidad.
• Súper fluidez.
• Superconductividad.
• Condensación de Bose-Einstein.
• Efecto Hall cuántico.

193


Índice temático:
1. Magnitudes Termodinámicas. Determinación de las magnitudes termodinámicas

involucradas en los procesos de bajas temperaturas. Ecuaciones de estado.
2. Cambios de fase de primera y segunda clase. Determinación de las condiciones para
cambios de fase de primera clase. Determinación de las condiciones para cambios de
fase de segunda clase y procesos físicos involucrados. Consecuencias de los cambios
de fase.
3. Cualidades de la materia y su representación. Establecimiento de las características de
la materia en el análisis de su comportamiento. Representación de los cambios en la
materia.
4. Cuerpos condensados. Determinación de variables para cuerpos condensados. Límites.
5. Funciones de densidad. Determinación de la función de densidad para procesos de
baja temperatura. Cambios en la función de densidad.
6. Superfluidez. Determinación de las variables y condiciones para superfluidez.
Determinación de la viscosidad y la transición a superfluidez.
7. Superconductividad. Superconductores tipo I. Ecuación de London. Ecuación BCS y su
solución. Superconductores tipo II. Efecto Meissner.
8. Condensación de Bose-Einstein. Estadística de Bose-Einstein. Hamiltoniano para
sistemas de tipo BE. Funciones de Partición de Gases Cuánticos.
9. Efecto Hall Cuántico. Efecto Hall. Condiciones para Efecto Hall Cuántico.

• A quantum approach to the solid state, Philip L. Taylor, Prentice- Hall, 1970.
• El fascinante mundo de la superconductividad, Rafael Baquero, México 2004.
194


Óptica de Fourier

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-42

Descripción de la asignatura: Este curso se aprenderá a calcular e interpretar el

comportamiento de sistemas ópticos a través de manipulaciones en el espacio Fourier, en
particular en el espacio de frecuencia espacial. Se revisará la teoría escalar de difracción con lo
que se obtendrá las herramientas necesarias para calcular patrones de difracción en el campo
lejano y en el campo cercano. Además, se entenderá el significado físico de las frecuencias
espaciales, para apartir de aquí, poder interpretar la información contenida en imágenes
ópticas.
Contenido:
• Propiedades de la transformada de Fourier.

• Sistemas lineales y convolución.
• Principios de difracción escalar.
• Difracción de Fraunhoffer.
• Difracción de Fresnel.
• Transformada de Fourier con una lente.
• Formación de imágenes en sistemas coherentes e incoherentes.
• Filtraje espacial con el sistema 4f y luz coherente.
• Holografía y reconocimiento de patrones.
• Coherencia óptica.

Índice temático:
1. Propiedades de la transformada de Fourier. Definición de la transformada de Fourier

en 1-D y 2D. La transformada inversa de Fourier. Linealidad de la transformada de
Fourier. Teorema de corrimiento, teorema de cambio de posición, teorema de
Parseval.
195


2. Sistemas lineales y convolución. Definición de un sistema lineal. Superposición y la
definición de la convolución. Sistemas lineales e isoplanáticos. Funciones de
transferencia. Teorema de muestreo.
3. Principios de difracción escalar. La aproximación escalar. Teorema de difracción de
Huygens-Fresnel. Teorema de difracción de Fresnel-Kirchhoff. Condiciones de frontera
de Kirchhoff. Condición de radiación de Sommerfeld. Teorema de difracción de
Rayleigh-Sommerfeld.
4. Difracción de Fraunhoffer. La relación del patrón de difracción de Fraunhoffer con la
transformada de Fourier. Ejemplos de patrones de difracción de Fraunhoffer: rendijas,
rejillas, abertura circular. Aberturas más complicadas.
5. Difracción de Fresnel. Integrales de seno y coseno. Ejemplos de patrones de difracción
de Fresnel: borde, rendija. La transformada fraccional de Fourier. Efecto Talbot.
6. Transformada de Fourier con una lente. La aproximación de una lente delgada. La
función de fase de una lente delgada. La transformada de Fourier con una lente
delgada.
7. Formación de imágenes en sistemas coherentes e incoherentes. Formación de
imágenes como un sistema lineal. Funciones de transferencia en sistemas coherentes e
incoherentes. Función de transferencia de modulación (MTF). Efecto por fuera defoco
en el MTF.
8. Filtraje espacial con el sistema 4f y luz coherente.
9. Holografía y reconocimiento de patrones. Principios de holografía. Holografía de la
transformada de Fourier. Filtros de Van der Lugt. Filtraje espacial con un filtro de Van
der Lugt. Reconocimiento de patrones.
10. Coherencia óptica. Grado de coherencia mutua. Efecto del grado de coherencia mutua
en visibilidad de franjas de interferencia. Medición del grado de coherencia mutua en
espacio y tiempo. Teorema de Van Cittert-Zernike.

§ Goodman, J.W., Introduction to Fourier optics, McGraw-Hill, New York, 1968.

§ Steward, E.G., Fourier optics: an introduction, J. Wiley and Sons, New York, 1983.
§ Gaskill, J.D., Linear systems, Fourier transforms, and optics, J. Wiley and Sons, New
York, 1978.
§ Reynolds, DeVelis, Parrent y Thompson, The new physical optics notebook: tutorials in
Fourier
§ optics, S.P.I.E., Washington D.C., 1989.
§ Born, M. y Wolf, E., Principles of optics, Pergamon, Oxford.

196


Propagación de ondas en medios multicapas

§ Teoría: 6
§ Práctica: 4
§ Autoestudio: 6
§ Requisitos: AFB
§ Clave: AFE-43
Descripción de la asignatura: Estudio de la transmisión de ondas en diferentes rangos de

sistemas físicos yendo del régimen electrónico hasta el electromagnético, tocando el rango
acústico. El análisis se realiza bajo el formalismo de la matriz de transferencia.
Contenido:
• Matriz de transferencia.
• Potenciales cuadrados.
• Potencial tipo delta.
• Solución numérica de la ecuación de Schrödinger.
• Transmisión y reflexión de ondas electromagnéticas en una interfaz.
• Sistema multicapas.
• Cristales fotónicos.
• Materiales izquierdos.
• Ondas acústicas.

Índice temático:
1. Matriz de transferencia. Métodos matemáticos para el análisis de propagación de

ondas en sistemas unidimensionales. Desarrollo de la matriz de transferencia para
análisis de propagación de ondas de partículas cuánticas.
2. Potenciales cuadrados. La barrera de potencial rectangular. Formalismo de la matriz
de transferencia para determinar los coeficientes de transmisión y reflexión.
Formalismo de matriz de transferencia para potenciales complejos.
3. Potencial tipo delta. El potencial tipo delta con aplicación de formalismo de matriz de
transferencia para resolución de problemas.
4. Solución numérica de la ecuación de Schrödinger. La ecuación de Schrödinger
unidimensional. Resolución de la ecuación de Schrödinger por técnicas numéricas
para aplicaciones físicas. Algoritmos numéricos simples y su exactitud.
5. Transmisión y reflexión de ondas electromagnéticas en una interfaz. Análisis del
fenómeno de transmisión y reflexión de ondas electromagnéticas a través de la
197


interface entre dos medios. Requerimiento de la continuidad de las componentes de
los campos eléctricos y magnéticos, La matriz de transferencia para una interface
entre dos medios.
6. Sistema multicapas. La transmisión y reflexión de ondas electromagnéticas TE y TM en
un slab y derivación de su matriz de transferencia. Generalización a sistemas
multicapas periódicos y no-periódicos.
7. Cristales fotónicos. El espectro de las estructuras multicapas periódicas: bandas y gaps
(brechas) e interpretación física.
8. Materiales izquierdos. Breve introducción a las propiedades electromagnéticas de los
materiales izquierdos (metamateriales). Formalismo de matriz de transferencia: sus
propiedades de transmisión tanto para un slab como de una bicapa compuesta por
material izquierdo y derecho.
9. Ondas acústicas. Descripción básica de las ondas acústicas. Condiciones a la frontera
para la construcción de la matriz de transferencia para diferentes sistemas, interface,
slab y sistemas multicapas. Estudio de propiedades de transmisión y reflexión a través
de la matriz de transferencia.

• P. Markos and C. M. Soukoulis, Wave propagation, from electrons to photonic crystals

and left-handed materials, Princenton.
• W. C. Elmore and M. A. Heald, Physics Waves, Dover.
• P. Yeh, Optical waves in layered materials, Wiley Inter-Science.

198


Química de materiales

• Semestre recomendado: 2 o 3
• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-44

Descripción de la asignatura: En este curso se presentarán los aspectos básicos

relacionados con la química de materiales de tal manera que el estudiante comprenda el
mecanismo de las reacciones químicas y la estereoquímica de estos materiales. Además, será
capaz de proponer materiales de inicio para desarrollar la síntesis de compuestos.
Contenido:
• Estequiometria.
• Reacciones acuosas y estequiometria de soluciones.
• El enlace químico: conceptos fundamentales.
• Química de los compuestos de coordinación.
• Equilibrio químico.

Índice temático:
1. Estequiometria. Ecuaciones químicas. Reacciones de combinación y descomposición.

Fórmula y peso molecular. Número de Avogadro y mol. Fórmula molecular obtenida
de la fórmula empírica. Reacciones limitantes.
2. Reacciones acuosas y estequiometría de soluciones. Ecuaciones químicas y reacciones
en solución acuosa. Escritura y balanceo de las ecuaciones químicas. Propiedades de
las soluciones acuosas - electrolitos y no electrolitos. Reacciones de precipitación.
Reacciones ácido-base. Reacciones de oxidación-reducción.
3. Elenlace químico: conceptos fundamentales. Teorías del enlace químico. El enlace
iónico. Formación de iones y redes. Empaquetamiento compacto de esferas. El enlace
covalente. Comparación entre los enlaces iónicos y covalente. Electronegatividad y
número de oxidación. Estructura de Lewis. La regla del octeto.
4. Química de los compuestos de coordinación. El enlace metal-ligando. Compuestos
complejos: química de coordinación. Teoría clásica de la coordinación de Werner.
199


Tipos de ligados. El efecto de ligados y los ligados quelantes. Nomenclatura de los
compuestos de coordinación. Geometría de los compuestos de coordinación. Isomería
de los compuestos de coordinación. Teoría del campo cristalino. Color y magnetismo.
5. Equilibrio químico I. Conceptos fundamentales. Equilibrios homogéneos, heterogéneos
y múltiples. Equilibrios ácido-base. Ácidos débiles y constantes de ionización. Bases
débiles y constantes de ionización. Relación entre las constantes de ionización de
pares conjugados ácido-base. Ácidos dipróticos y polipróticos.
6. Equilibrio químico II. La solubilidad y el producto de solubilidad. Separación de iones
por precipitación fraccionada. El efecto del ion común y la solubilidad. El pH y la
solubilidad. Equilibrios de iones complejos y la solubilidad. Electroquímica y
corrosión.

• Química, Raymond Chang, 4ta edición, McGraw-Hill.

• Química Inorgánica, Principios y Aplicaciones, I.S. Butler, J.F. Harrod, Addison-Wesley.
Fisicoquímica de superficies y sistemas dispersos, Ma. Teresa Toral. Ediciones Urmo.
• Chemistry, The Central Science, T. L. Brown, H. E. LeMay Jr., B. E. Burnsten, C. J.
Murphy, 11 a, ed. Prentice Hall.

200


Técnicas de crecimiento de materiales

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-45

Descripción de la asignatura: En este curso se presentan los conocimientos básicos sobre la

importancia de los materiales precursores en el material a procesar, las distintas técnicas
químicas y físicas de crecimiento y depósito de materiales y como se relacionan sus
propiedades fisicoquímicas del material procesado con el método utilizado de crecimiento, así
como los fundamentos teóricos de los procesos de extracción o reacción de fuentes
precursoras, procesos de transporte de especies, aplicados al crecimiento o depósito en
conjunto con los procesos de difusión superficial y volumétrica en substratos y materiales
Contenido:
• Métodos químicos.
• Tecnología de crecimiento de cristales y preparación de substratos.
• Tecnología de preparación películas delgadas semiconductoras y aislantes.
• Otras técnicas.

Índice temático:
1. Métodos químicos. Sol-gel. Baño químico. Reacción en estado sólido. Aspersión

pirolítica. Depósito químico en fase vapor.
2. Tecnología de crecimiento de cristales y preparación de substratos. Producción de
silicio y de otros semiconductores grado electrónico. Método Czochralsky. Control de
estructura, pureza y defectos. Método de Bridgman. Otros métodos de crecimiento de
cristales. Corte, pulido y limpieza de obleas y otros substratos.
3. Tecnología de preparación películas delgadas semiconductoras y aislantes.
Importancia de las películas delgadas. Teoría sobre el proceso de crecimiento de
películas delgadas. Procesos de epitaxia. Epitaxia en fase líquida (LPE) y epitaxia en
fase vapor (VPE). Técnicas PVD. Epitaxia de haz molecular (MBE) y de haz de iones
(IBE), evaporación térmica y con haz de electrones, erosión catódica, ablación láser.
Técnicas CVD. CVD térmico, CVD asistido por plasma directo (PECVD) y remoto
(RPECVD). Técnicas de rocío pirolítico.
201


4. Otras técnicas. Preparación de aislantes en película delgada, dióxido de silicio, nitruro
de silicio.

• West A.R., Solid State Chemistry and its Applications, John Wiley & Sons, 1984.
• Cheetham A.K., and Day P., Solid State Chemistry. Techniques, Oxford University
Press., 1987.
• Brinker C. J. and Scherer G. W., Sol Gel Science. The Physics and Chemistry of Sol-gel
Processing, Academic Press, 1990.
• Sze S.M., VLSI technology, McGraw- Hill, 1988.
• J. M. Arbelia, A. M, Cintas, Introducción a la ciencia de materiales, Consejo Superior de
Investigaciones Científicas.

202


Geometría discreta

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-46

Descripción de la asignatura: El desarrollo de la geometría computacional y de los métodos

en optimización combinatoria durante los últimos 30 años han dado un notable impulso a la
investigación en geometría discreta. En particular, muchos de estos avances han encontrado
aplicaciones en áreas como la teoría de gráficas, la complejidad computacional, la
combinatoria, etc. El objetivo de este curso es revisar algunos de los métodos de la geometría
discreta que han sido aplicados con éxito a la resolución de problemas que provienen de la
teoría de gráficas.
Contenido:
• Convexidad.
• Conjuntos convexos independientes.
• Problemas sobre incidencias.
• Arreglos de pseudolíneas.
• K-conjuntos

Índice temático:
1. Convexidad. Subespacios lineales y afines. Posición general. Conjuntos convexos.

Combinaciones convexas. Separaciones. Lema de Radon y Teorema de Helly. Teorema
del Ham sandwich.
2. Conjuntos convexos independientes. Teorema de Ramsey. Teorema de Erdӧs-
Szekeres. K-copas y L-tapas. Teorema de los 5-hoyos. Conjuntos de Horton.
3. Problemas sobre incidencias. Incidencias y distancias unitarias. Incidencias punto-
linea vía número de cruce. Distancias distintas vía número de cruce. Incidencias
punto-linea vía cortes. Lema del corte. Lema fuerte del corte.
4. Arreglos de pseudolíneas. Arreglos de hyperplanos. Arreglos de superficies
algebraicas. Arreglos de pseudolíneas. Rectificabilidad de arreglos. Algunos resultados
sobre rectificabilidad. Teorema de Clarkson. Teorema de la zona. Lema del corte
(revisado).
203


5. k-conjuntos. k-conjuntos y líneas bisectrices. Lema de Lovász para k-conjuntos. (<k)-
conjuntos. Número de cruce rectilíneo y k-conjuntos. Cotas generales para el número
de k-conjuntos. Récords actuales.

J. Matoušek, Lectures on Discrete Geometry, 1st. Edition. Springer, 2002.
Peter Brass, William Moser, János Pach, Research problems in Discrete Geometry, 1st. Edition.
Springer, 2005.
204


Geometría Diofantina

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-47

Descripción de la asignatura: Se estudia la maquinaria sobre alturas de Weil con la finalidad

de estudiar puntos enteros o racionales sobre variedades algebraicas.
Contenido:
• Alturas
• Puntos racionales sobre variedades abelianas
• Puntos enteros sobre curvas

Índice temático:
1. Alturas sobre el espacio proyectivo. Alturas sobre variedades. Funciones canónicas de

altura. Funciones canonicas de alturas sobre variedades abelianas. Puntos racionales
sobre variedades. Funciones de altura local.
2. Puntos Racionales sobre variedades abelianas. El teorema débil de Mordell-Weil.
El nucleo de la reducción modulo p.
3. Puntos enteros sobre curvas. Aproximaciones diofantinas. El teorema del
subespacio. S-unidades. El teorema de Siegel.

Bibliografía básica.
• M. Hindry, J. H. Silverman, Diophantine Geometry: an introduction, GTM Springer,

2000.
• E. Bombieri, W. Gubler, Heights in Diophantine Geometry, Cambridge University Press,
2006

205


Superficies algebraicas

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB.
• Clave: AFE-48

Descripción de la asignatura: Se desarrolla la teoría básica de superficies algebraicas,

particularmente superficies complejas proyectivas. El estudiante desarrollará habilidades
para realizar diversos cálculos basados en sucesiones exactas, la descomposición de Zariski y
será capaz de utilizar varios teoremas avanzados de la teoría y dominar la clasificación de
Kodaira-Enriques.
1. Conceptos fundamentales. Índice de intersección. Teorema de Riemann-Roch y

fórmula de Noether. Estructura de las aplicaciones biracionales. Modelos minimales.
Superficies regladas. Teorema de Noether-Enriques. Fibrados proyectivos de rango 2
sobre una curva. Superficies racionales, el plano proyectivo y las superficies de
Hirzebruch. Teorema de Castelnuovo y extinción de la adjunción. Dimensión de
Kodaira. Clasificación de superficies con dimensión de Kodaira 1 y 2. Superficies de
tipo general. Desigualdades clásicas, desigualdad de Noether.
2. Técnicas avanzadas. Teorema del índice de Hodge. Estructura de una fibra.
Descomposición de Zariski y aplicaciones. Teoría de Bogomolov. El Teorema de Reider
y la desigualdad de Bogomolov-Miyaoka. Desigualdad de Miyaoka generalizada.
Superficies de tipo general y aplicaciones pluricanónicas. Superficies extremales y
superficies de Beauville-Catanese.2.5 Fibraciones semiestables. Reducción
semiestable de una fibración. Teorema de Arakelov-Parshin. Número de fibras
singulares.

• Beauville , Surfaces Algébriques Complexes. Astérisque 54, 1978

• Beauville, L’application canonique pour laes surfaces de type général. Inventiones
Math. 55, 1979.
• W. Barth, K. Hulek, C. Peters, A, Van de Ven, Compact Complex Surfaces. Springer
Verlag 2004 (Second Edition).
• L. Badescu. Algebraic surfaces. Springer Verlag 2001.

206


Tópicos Selectos de la Biología

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-49
• Materia asociada a la Línea de investigación: BCMI y BEB.

Descripción de la asignatura: Asignatura establecida para temas de punta dados por

profesores locales o visitantes con temario abierto.
Tópicos Selectos de la Matemática

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-50
• Materia asociada a la Línea de investigación: MBa.


207


Tópicos Selectos de la Física

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos:
• Clave: AFE-51
• Materia asociada a la Línea de investigación: PCFM, MSCM


Tópicos Selectos de las Ciencias Nucleares

• Teoría: 6
• Práctica: 4
• Autoestudio: 6
• Requisitos: AFB
• Clave: AFE-52
• Materia asociada a la Línea de investigación: CN


208

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UNIVERSIDAD

Comités Académicos Doctorales de Orientación (CADO)

Modalidad Educativa: Escolarizada

Grado que se otorga: Doctorado

Título que se obtiene: Doctor en Ciencias

Generación a partir de la que se aplica el programa educativo: 2018

ESTRUCTURA CURRICULAR .................................................................................................. 23

EFICACIA DEL PROGRAMA ..................................................................................................... 57

ANEXO B ..................................................................................................................................... 107

Perfil y requisitos académicos de ingreso

• Demostrar un entendimiento sistemático del campo de estudio y tener las

La descripción y definición de las asignaturas de formación básica y específica; de las

Se considerarán aspirantes todos aquellos interesados que cumplan con el perfil de

A continuación se establecen los parámetros para aceptar o rechazar un aspirante así

El CADO se entrevistará con el aspirante con la finalidad de darle a conocer el proceso

En el momento en que el estudiante es aceptado al programa, se le dará un plazo de

En caso de haber aprobado los exámenes generales bajo la recomendación de cursar

El candidato podrá cursar asignaturas de formación específica dependiendo de la

El candidato a doctor podrá realizar sus actividades de investigación en instituciones

Finalmente, el candidato debe estar dedicado de tiempo completo al cumplimiento de

Asignaturas de Formación Básica (AFB)

Proyecto de Tesis Doctoral

Seminario de Tesis (I, II, III y IV)

Investigación (I, II, III y IV)

Acreditación de Tesis Doctoral

La estructura curricular y la organización de este programa, permiten a un estudiante,

Protocolo de tesis doctoral 10(140 h)=7c 10(150 h)=3c 10

Seminario de protocolo 8 (120 h)=6c 7 (110 h) =2c 8

2 Investigación I 10(140 h)=7c 15(240 h)=5c 12

Seminario de tesis I 8(120 h)=6c 7(110 h) =2c 8

Total semestre 18(260 h)= 13c 22(350 h) =7c (610 h) 20c

Investigación II 10(140 h)=7c 15(240 h)=5c 12

3 Seminario de tesis II 8(120 h)=6c 7(110 h) =2c 8

Biología Evolutiva y Biodiversidad (BEB)

La orientación tiene como objetivo fundamental, la generación de recursos humanos

La Biología Evolutiva estudia los procesos y patrones de la Biodiversidad en todos sus

Las líneas de investigación se abordan en los enfoques macro y

a) La biodiversidad de las interacciones simbióticas de organismos de vida

• Estudios de biodiversidad en diferentes grupos.

• Dra. Melina Del Real Monroy.

Temas Principales de investigacion.

• Biología celular y molecular en estrés biótico y abiótico.

• Dr. Jesús Adrián López.

Ciencias Nucleares (CN)

Partículas, Campos y Física-Matemática (PCFM)

• Dr. Andrew Chubykalo Eugenievich

Modelación, Síntesis y Caracterización de Materiales (MSCM)

• Dr. José de Jesús Araiza Ibarra

Matemáticas Básicas (MBa)

a) Comité Académico Doctoral de Ciencias Básicas (CADCB).

a) Implementar el PADCB y velar por el nivel académico del mismo.

Capítulo III. De los Comités Académicos Doctorales de Orientación

Artículo 12: Son atribuciones y obligaciones del CADO las siguientes:

Capítulo IV. Del comité de tutores

a) Poseer grado de doctor en la disciplina correspondiente o en un área afín.

Capitulo V. Apoyo Administrativo

Capítulo VI. Del ingreso

Artículo 22: Para ser admitido en el Programa de Doctorado en Ciencias Básicas

Artículo 24: La equivalencia de estudios se normará por lo señalado en el Reglamento