Operon
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INTRODUCCIÓN
Lactosa: la lactosa es el azúcar principal en la leche, la lactosa puede ser una comida excelente para
la bacteria E. coli. Sin embargo, solo engullirán la lactosa cuando otros azúcares mejores, como la
glucosa, no están disponibles.
El operón lac es un operón o grupo de genes con un solo promotor (transcrito como un solo ARNm).
Los genes en el operón codifican las proteínas que permiten que las bacterias utilicen la lactosa
como fuente de energía.
El operón de la lactosa en E. coli fue el primer operón descubierto y quizá el mejor conocido. Jacob
y Monod fuenes quienes lo describieron, y todo lo que propusieron a partir de sus datos indirectos
y genéticos se ha visto confirmado con el tiempo gracias a otras técnicas más modernas. La función
del operón lac es la de asegurar la presencia de enzimas implicadas en la degradación de la lactosa
cuando ésta está presente en el medio. Está formado por dos secuencias operadoras seguidas de
tres genes estructurales ligados (Z, Y, y A) que codifican las enzimas que sirven para metabolizar
la lactosa.
El ADN se organiza en genes que almacenan la información genética, y con esto se tiene una clara
concepción sobre cómo son esos genes y cómo se expresan transcribiéndose en ARN que, en la
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inmensa mayoría de los casos, se traduce a proteínas. Entonces surge una pregunta clave en
genética: ¿Cómo se regula la expresión de los genes? En cualquier eucariota superior todas sus
células tienen la misma información genética, pero resulta evidente que, espacial y temporalmente,
todos sus genes no se están expresando a la vez. Por citar unos simples ejemplos, los sistemas
enzimáticos que produce una célula hepática son muy diferentes a los que produce una célula
sanguínea precursora de eritrocitos, muchos genes implicados en el desarrollo de ciertas etapas de
la vida dejan de expresarse en otras, etc. Incluso en un organismo unicelular, como una bacteria, la
producción enzimática no es continua y total, sino que responde a las necesidades celulares.
El análisis de las proteínas de E. coli demuestra que las concentraciones de los casi 4.000
polipéptidos que fabrica varían enormemente. Así, para las proteínas implicadas en el glucólisis
hay más de 100.000 copias por célula, mientras de otras las cantidades son mínimas. Aunque en
bacterias siempre hay un cierto nivel basal de cualquier producto génico, en determinadas
circunstancias las cantidades de ciertas proteínas se incrementan enormemente para después volver
a su estado inicial.
Resulta, además, evidente que los sistemas reguladores de procariotas y eucariotas deben ser
diferentes, en tanto en cuanto que ambos tipos de organismos presentan profundas diferencias en
muchas de sus características vitales. Un procariota es un organismo vivo que crece y se divide
mientras las condiciones del medio sean las adecuadas y mantenga un suministro correcto de
nutrientes. Sus sistemas regulatorios deben estar adaptados para optimizar esas tareas. En el otro
extremo, un eucariota superior con diferentes tejidos y sistemas no sólo crece y se reproduce; pasa
por diferentes etapas de desarrollo y sus células se diferencian y especializan, etc. Todo ello
conlleva profundos cambios morfológicos, fisiológicos y bioquímicos que deben ser mantenidos,
por lo que los genes expresados en unas determinadas etapas y tipos celulares (y también en ellos
en cantidades diferentes) dejan de hacerlo en otros, y viceversa. De esa manera, en la vida adulta,
determinados circuitos están permanentemente cerrados, mientras otros siguen expresándose,
pudiendo hablarse de una regulación irreversible, mientras que cada tipo tisular debe no sólo
realizar sus funciones específicas sino hacerlo del modo adecuado en cada momento (regulación
reversible).
En resumen, resulta obvio que deben existir mecanismos complejos que regulen la expresión de
los genes. De modo general, desde la secuencia de nucleótidos del ADN hasta la proteína, hay
varios niveles en los que se puede ejercer el control: transcripción (y procesamiento en eucariotas),
traducción y funcionalidad de la proteína. En este y el siguiente capítulo abordaremos los distintos
procesos de control del flujo de la información genética. La regulación del proceso de síntesis
proteica podría hacerse a tres niveles: replicación, transcripción y traducción. Sea cual sea, el
resultado final podría consistir en la ausencia de síntesis proteica (cuando no se requiera) o la
síntesis (cuando sea necesaria). De todos los posibles sistemas de regulación, el que actúa a nivel
de la transcripción es el mejor conocido, sobre todo en bacterias, y este modelo, evidentemente el
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más simple, puede servir de base para comprender la regulación de la acción génica en los sistemas
complejos de los organismos superiores.
MARCO TEÓRICO
Genes estructurales:
Gen lac z: Codifica la β-galactosidasa (116 kDa) que, en su forma activa (homotetramérica), se
encarga de hidrolizar el enlace β-glucosídico y liberar glucosa y galactosa. También realiza
la transgalactosidación (transferencia de galactosa a una glucosa) que genera alolactosa (1,6-β,D-
galactopiranosil D-glucopiranosa).
Gen lac y: codifica la proteína galactósido permeasa, cuya función es facilitar el transporte de la
lactosa al interior de la bacteria colocándose en la membrana plasmática y formando un carriel
(proteína transportadora) a mediante un importe de protones y lactosa.
Gen lac a: codifica la tiogalactósido transacetilasa —transfiere acetilos del Ac-CoA a los β-
galactósidos—; no es esencial para el catabolismo de la lactosa, pero parece ser necesaria para
desintoxicar la célula de otros productos que pueden entrar por la acción de la permeasa
Promotor: región del DNA, precedente a los genes estructurales, que reconoce la RNA polimerasa
para llevar a cabo la transcripción.
Operador: región del DNA localizada entre el promotor y el comienzo de los genes estructurales,
que es reconocida por la proteína represora Lac I.
Sitio CRP: Se trata de una secuencia que reconocerá la proteína CRP para regular el operón en
función de la cantidad de glucosa existente.
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Gen represor (lac I): codifica la proteína represora Lac I, que reconoce la región operadora, donde
se une. Impide la transcripción de los genes bajo el control de este promotor pero estimula la unión
de la RNA polimerasa formando lo que se conoce como Complejos Cerrados. Cuando el represor
se retire (en presencia de inductor que en este caso será lactosa o IPTG), la RNA polimerasa estará
lista para formar Complejos Abiertos y empezar la transcripción, es decir, constituye una unidad
de transcripción independiente que se transcribe a partir de su promotor PI. Codifica el represor del
operón que regulará la expresión de los tres genes estructurales anteriores al unirse al operador.
Forma un tetrámero con monómeros de 38 kDa. Se activa o desactiva en función de la ausencia o
presencia del inductor.
El gen que codifica el represor lac se nombra lacI y está bajo el control de su propio promotor. El
gen lacI se encuentra cerca del operón lac, pero no es una parte del operón y se expresa por
separado. lacI se transcribe continuamente, así que su producto proteico –el represor lac– siempre
está presente.
El operón lac se activa por la presencia de un inductor (natural como lactosa o alolactosa, o
sintético como el IPTG). La alolactosa parece que es el inductor natural. El IPTG tiene la ventaja
biotecnológica de que no se metabolliza, por lo que su acción es constante. Cuando la lactosa no
está disponible, el represor lac se une firmemente al operador, y así evita la transcripción por la
ARN polimerasa. Sin embargo, cuando la lactosa está presente, el represor lac pierde su capacidad
de unirse al ADN. Se separa del operador, y despeja el camino para que la ARN polimerasa
transcriba el operón.
ste cambio en el represor lac lo causa la pequeña molécula alolactosa, un isómero (versión
reorganizada) de la lactosa. Cuando se dispone de lactosa, algunas moléculas se convertirán en
alolactosa dentro de la célula. La alolactosa se une al represor lac y hace que cambie de forma para
que ya no pueda unirse al ADN.
La transcripción de los genes estructurales se inicia a partir de las regiones p, y el primer nucleótido
transcrito se encuentra dentro del operador O1, produciéndose un único mRNA policistrónico o
poligénico, es decir una copia de RNA con los tres genes. El control de la transcripción se ejerce
en función de la presencia y ausencia de LacIp y del inductor:
En presencia del inductor, el operón lac se encuentra reprimido no más del 5% del tiempo. En
esta situación se produce la transcripción del mRNA y se sintetizan los tres genes estructurales.
Así, en un ambiente natural, la presencia de lactosa hace que ésta entre por la permeasa, que en el
citoplasma se una al represor LacIp y por tanto se active el operón. El hecho de que exista permeasa
en unas condiciones en las que el operón está reprimido se debe a que la represión no es 100%
eficaz y se produce una pequeña tasa (de hasta el 5%) de inicio de transcripción
Éstas serían las enzimas constitutivas. Para el resto de la producción enzimática celular sí tendría
que darse regulación y esto no es un concepto nuevo. Desde mediados del siglo xx se demostró en
levaduras y bacterias que si en el medio está presente la lactosa se producen determinadas enzimas
de su metabolismo. Este concepto se generalizó, hablándose de que las bacterias se «adaptaban» al
medio ambiente en el que se encontraban, de manera que la presencia o ausencia de muchas
enzimas estaba en relación con los cambios medioambientales; se trataría de enzimas adaptativas.
En 1961, Jacob y Monod propusieron un modo de regulación coordinada para el grupo de genes
que controla el metabolismo de la lac- tosa en E. coli, el «operón lac», estableciendo el «modelo
del operón» como la base para la comprensión de los mecanismos regulatorios de la expresión
genética en procariontes.
Cuando la lactosa está presente, el represor lac pierde su capacidad de unirse al ADN. Esto deja
libre el camino para que la ARN polimerasa se una al promotor y se transcriba el operón lac. Eso
suena como el final de la historia, ¿verdad?
Pues…no exactamente. Resulta que la ARN polimerasa sola no se une muy bien al promotor del
operón lac. Puede que haga algunos transcritos, pero no hará mucho más a menos que consiga
ayuda adicional de la proteína activadora de catabolitos (CAP). CAP se une a una región del
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ADN justo antes del promotor del operón lac y ayuda a que la ARN polimerasa se una al promotor,
lo que promueve altos niveles de transcripción.
Como el represor lac, CAP es codificado por un gen regulador que se encuentra en el cromosoma
bacteriano. El gen para CAP no es parte (ni está cerca) del operón lac.
El gen de CAP se expresa de forma constitutiva o constante. Esto significa que la proteína CAP
siempre está disponible en la célula para unirse a AMPc y “reportar” los niveles de glucosa al
operón lac y otros genes y operones objetivos
CAP no siempre es activa (capaz de unirse al ADN). Su actividad la regula una molécula pequeña
llamada AMP cíclico (AMPc). AMPc es una “señal de hambre” que fabrica E. coli cuando los
niveles de glucosa son bajos. AMPc se une a CAP, cambia su forma y la hace capaz de unirse al
ADN y promover la transcripción. Sin AMPc, CAP no puede unirse al ADN y es inactiva.
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CAP solamente está activa cuando los niveles de glucosa son bajos (los niveles de AMPc son altos).
Así, el operón lac solo puede transcribirse en altos niveles cuando no hay glucosa. Esta estrategia
asegura que las bacterias solamente enciendan el operón lac y empiecen a usar la lactosa después
de que hayan utilizado toda la fuente de energía preferida (glucosa).
Cuando la glucosa se transporta hacia la célula, el proceso de transporte inhibe la síntesis de AMPc.
Así, cuando hay mucha glucosa y está entrando a la célula, no puede hacerse mucho AMPc. Sin
embargo, si poco o nada de glucosa está disponible para el transporte hacia la célula, la síntesis de
AMPc ya no será inhibida y los niveles de AMPc incrementarán.
Como resultado:
Por una parte, cuando se inducía la producción de β -galactosidasa, también se inducía la síntesis
de otras dos enzimas: la galactósido permeasa y la galactósido transacetilasa. La primera de ellas
facilita la entrada de lactosa a la célula bacteriana y la segunda, aunque no está directamente
implicada en el metabolismo de la lactosa, y su función fisiológica permaneció oscura por mucho
tiempo (incluso no se la consideró en muchos de los trabajos originales que resumiremos a
continuación), actualmente se cree que entre sus funciones está la de proteger a otros galactósidos
(mediante acetilación) de la acción degradativa de la β -galactosidasa.
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Tres genes controlaban la síntesis enzimática: lacZ («Z») especificaba la secuencia de aminoácidos
de la galactosidasa, el gen lacy («Y») codificaba la permease y el gen lacA («A») era el responsable
de la síntesis de la galactoside transacetilasa. Se aislaron y caracterizaron muchas mutaciones lac
que eliminaban la función de alguna de estas enzimas (lacZ- , lacY lacA-) y mediante cartografía
genética (a partir de conjugación y transducción especializada, fundamentalmente) se estableció
que los tres genes estaban contiguos, en el orden indicado: lacZ - , lacY - y lacA. Éstos eran los
genes estructurales del sistema lac. Además, se transcribían como un único ARNm policistrónico
y, cuando se provocaba la inducción del sistema, la síntesis del ARNm precedía a la de las enzimas
implicadas.
Todo ello indicaba que los tres genes se regulaban de modo coordinado y, además, parecía que la
regulación se llevaba a cabo a nivel de su transcripción (transcripción en presencia de lactosa/no
transcripción en ausencia de lactosa). Regulando la producción del ARNm se regula- ría la
producción de todo el sistema.
Este descubrimiento resultó muy importante ya que en aquellos años se tenía la idea de que el
inductor, la pequeña molécula de /3-galactósido pudiera dirigir la activación enzimática por
modificación estérica de alguna especie de forma inactiva de la enzima ya preexistente en el medio.
Para abundar en la imposibilidad de este hecho, Jacob y Monod encontraron un inductor no
fisiológico del sistema lac, que, además, no podía ser sustrato de la degradación; se trataba de
isopropil-/3-D-tiogalactósido (IPTG), cuya estructura se muestra en la figura 16.2. Tal molécula
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no tenía afinidad estérica por la molécula de la β -galactosidasa, luego la regulación no podía residir
en la activación de la propia enzima. Había que buscar por otro lado al elemento regulador.
Dentro de los mutantes del gen operón Lac existían unos muy especiales, que se denominaron
mutantes constitutivos, en los que la síntesis enzimática se producía tanto en presencia como en
ausencia de lactosa. La cartografía de estos mutantes mostró que se localizaban en una región del
cromosoma de E. coli cercana a los genes estructurales, pero no exactamente en la misma región.
A ese locus se le llamó lacI («I», de ahora en adelante). El análisis genético de las mutaciones
constitutivas del gen I demostró que eran recesivas (I -) respecto al alelo salvaje.
En las dos primeras filas puede observarse que las bacterias l' sólo sintetizan las enzimas en
presencia del inductor (IPTG) mientras las I - lo hacen siempre (constitutivamente). Al fijarse en
la estirpe 3 de la tabla 16.1, se produce enzima β - galactosidasa (producto del gen Z +) sólo en
presencia de inductor, aunque I* no se encuentra en el mismo segmento de ADN, luego ejerce su
acción en «trans».
Un elemento regulador en «cis» es aquel que ejerce su acción sobre otros genes o secuencias
siempre que se localicen en la misma molécula de ADN, mientras que un elemento regulador en
«trans» es aquel que ejerce su acción sobre otros genes o secuencias que no tienen por qué estar
físicamente sobre el mismo segmento de ADN, luego su acción la ejecuta a través de un factor
difusible. La prueba experimental de la existencia de una molécula represora producida por el gen
I fue llevada a cabo por Pardee, Jacob y Monod y se denominó experimento «Pajamo» (palabra
combinada a partir de las dos primeras letras de cada apellido).
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En la figura 16.3 se resume el procedimiento experimental: después de una conjugación entre Hfr
I + Z + (donante) /F - 1 - Z - (receptora) y eliminadas las donantes una vez completada la
transferencia del cromosoma bacteriano, las bacterias receptoras (I + Z + /I - Z -) recuperan la
capacidad de síntesis de β -galactosidasa en ausencia de inductor (IPTG) durante unas dos horas
(muestra 2) y después la síntesis de enzima finalizaba. Sólo si se añadía inductor continuaba la
síntesis enzimática (muestra l).
La explicación de estos hechos es la siguiente: el citoplasma de las bacterias receptoras carecía del
producto del gen I + (la molécula represora) por lo que la β -galactosidasa se empezaba a sintetizar
(a partir del gen Z + suministrado por la donante); pero, al mismo tiempo, se empezaban a sintetizar
moléculas represoras, producto del gen / + (también suministrado por la donante) y, cuando su
concentración en el medio celular era lo suficientemente elevada, empezaba a ejercer su acción
represora sobre el sistema lac.
Si no se suministraba inductor la síntesis de enzima se detenía (muestra 1). Sólo si éste se añadía
el represor se inactivaba y se mantenía la síntesis enzimática. Puesto que el represor ejerce su acción
sobre el conjunto de los genes estructurales (acción pleiotrópica), el modelo predijo la existencia
de una región receptora de su acción mediante la formación de un complejo estérico específico.
Esa región fue denominada «operador» (O) proponiendo que debía estar próxima a los genes
estructurales. Se descubrieron mutantes constitutivos de esa región (0 c) capaces de sintetizar las
enzimas en ausencia de inductor (en tasas menores que las inducidas, pero muy por encima de los
niveles basales).
A diferencia de lo que había ocurrido con los mutantes constitutivos del gen I, experimentos de
conjugación (tabla 16.3) demostraron que los mutantes O c eran dominantes en cis, tal como debía
esperarse de una región cercana y unida físicamente a los genes estructurales, receptora de la acción
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de la molécula represora. Precisamente fue mapeada delante del gen Z. En 1961, con todas estas
evidencias experimentales, Jacob y Monod (que recibieron el Premio Nobel 4 años más tarde)
propusieron un modelo de control negativo de la regulación al que denominaron modelo del operón
(fig. 16.4), en el que un grupo de genes se regula y expresa coordinadamente. La unidad genética
de expresión coordinada era el operón, formado por los genes estructurales y su región adyacente
(el operador), que puede esquematizarse como OYZA. El operón se encuentra bajo el control
negativo del producto del gen I. El control negativo quiere expresar el modo de ejercer la regulación
el producto del gen I, es decir, que la transcripción se produce cuando el represor no está unido al
operador. En esas condiciones, se dice que el operador está abierto (fig. 16.4b), y cerrado cuando
está bloqueado por la proteína represora (fig. 16.4a).
Un control positivo, por el contrario, indicaría que la acción de una molécula reguladora es la de
unirse a su secuencia receptora para que se produzca la transcripción, actuaría promoviendo la
transcripción, siendo un activador. Más adelante veremos ejemplos de control positivo de la
transcripción. A la luz del modelo se acentúa la comprensión del modo de actuación de los distintos
mutantes encontrados.
El análisis genético de mutaciones para todos los genes y el operador fue mucho más extenso que
lo mostrado aquí. Se aislaron y combinaron muchos tipos de mutantes para llegar a establecer las
características esenciales de los elementos del sistema. Así, por ejemplo, se aislaron mutaciones
opuestas a I-, llamadas Pen las que, en lugar de afectarse la interacción con el operador, como
ocurría con las primeras, se impedía la unión con la lactosa, reprimiendo la síntesis de las enzimas.
Estos mutantes eran dominantes en trans, respecto al gen I normal.
Merece recordarse en este punto que el modelo del operón se publica cuando están en plena
efervescencia las experimentaciones acerca de la posible existencia de un intermediario entre el
ADN y las proteínas y, en su trabajo, Jacob y Monod lo sugieren (incluso en un primer momento
apuntan a que el represor fuese ARN). Posteriormente, el modelo se fue completando y
perfeccionando, sin que, en ningún caso, esto quiera quitar importancia a la propuesta inicial de
Jacob y Monod. Unos años después se aisló el represor, que ha sido caracterizado, demostrándose
que se trata de una proteína homotetramérica, con monómeros de 136 aminoácidos que presentan
cuatro sitios de unión a lactosa y un sitio de unión al operador (pero no a los mutantes O c.
REPRESIÓN POR CATABOLITOS Cuando la bacteria E. coli crece en un medio que contiene glucosa, prefiere
este azúcar como fuente de energía y como consecuencia los operones que ponen producen las enzimas
necesarias para obtener energía de otros azúcares están bloqueados. Uno de los catabolitos del
metabolismo de la glucosa actúa sobre el AMP cíclico (AMPc). El AMP cíclico (AMPc) es necesario para la
transcripción de todos los operones que son inhibidos por el catabolismo de la glucosa. Es decir, para que
se transcriban los genes del operón lactosa se necesitan niveles elevados de AMPc. Esto mismo sucede
con los operones de arabinosa, maltosa, galactosa, etc.. Se trata. por tanto de un sistema general de
control positivo que se denomina represión catabólica. Cuando E. coli crece en un medio con glucosa, los
niveles de AMPc son muy bajos y como consecuencia no se transcriben los operones de otros azúcares.
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Aún no se conoce el motivo por el que los niveles de AMPc son bajos cuando E. coli crece en un medio con
glucosa como fuente de energía. Cuando E. coli crece en un medio sin glucosa pero con lactosa los niveles
de AMPc son altos, el AMPc se une a la proteína receptora receptora de AMPc (CRP) activándola y la
proteína activada CRP-AMPc a su vez estimula la transcripción de los genes estructurales del operón
lactosa y de otros operones de azúcares. La proteína activadora por catabolitos (CAP) es un dímero que al
unirse al AMPc se activa y estimula la transcripción de los genes del operón lactosa, de manera que la
proteína activadora CAP-AMPc es necesaria para la unión de la ARN-polimerasa al promotor de los genes
del operón lactosa. La proteína activadora CAPAMPc parece ser que se une a la región promotora cerca
del nucleótido que ocupa la posición -60 (60 nucleótidos antes del comienzo del gen z). Los mutantes que
afectan a la adenilato ciclasa, enzima que transforma el ATP en AMPc, muestran niveles muy bajos de
expresión de los genes del operón lactosa, debido a que los niveles de AMPc son muy bajos en ausencia
de glucosa. Los mutantes que afectan a la proteína CRP o CAP también presentan niveles muy bajos de
expresión de los genes del operón lactosa en ausencia de glucosa. EL OPERÓN TRIPTÓFANO El operón
triptófano (operón trp) es un sistema de tipo represible, ya que el aminoácido triptófano (Correpresor)
impide la expresión de los genes necesarios para su propia síntesis cuando hay niveles elevados de
triptófano. Sin embargo, en ausencia de triptófano o a niveles muy bajos se transcriben los genes del
operón trp. Los elementos del operón trp son en esencia semejantes a los del operón lactosa: Genes
estructurales: existen cinco genes estructurales en el siguiente orden trpE-trpDtrpC-trpB-trpA. Elementos
de control: promotor (P) y operador (O). El promotor y el operador están al lado de los genes estructurales
y en el siguiente orden: P O trpE-trpD-trpC-trpB-trpA. Curiosamente, las enzimas codificadas por estos
cinco genes estructurales actúan en la ruta metabólica de síntesis del triptófano en el mismo orden en el
que se encuentran los genes en el cromosoma. Gen regulador (trpR): codifica para la proteína reguladora.
Este gen se encuentra en otra región del cromosoma bacteriano aunque no muy lejos del operón.
Correpresor: triptófano. En el siguiente esquema se indican los elementos del Operón Triptófano:
La glucosa no debe estar disponible: cuando la glucosa no está disponible, AMPc se une a
CAP, lo que permite que CAP pueda unirse al ADN. Al estar unida CAP, ayuda a que la
ARN polimerasa se pegue al promotor del operón lac.
La lactosa debe estar disponible: si la lactosa está disponible, el represor lacserá liberado
del operador (por unión de la alolactosa). Esto permite que la ARN polimerasa avance sobre
el ADN y transcriba el operón.
Estos dos eventos en combinación –la unión del activador y la liberación del represor– permiten
que la ARN polimerasa se una fuertemente al promotor y le dé una trayectoria clara para la
transcripción. Juntos llevan a una fuerte transcripción del operón lac y a la producción de las
enzimas necesarias para la utilización de la lactosa.
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¿Qué es lo activa al operón lac?
Para utilizar la lactosa, las bacterias deben expresar los genes del operón lac, que codifica enzimas
claves para el consumo y el metabolismo de la lactosa. Para ser tan eficiente como sea posible, E.
coli debe expresar el operón lac solamente cuando se cumplan dos condiciones:
¿Cómo se detectan los niveles de lactosa y de glucosa y cómo los cambios en los niveles afectan
la transcripción del operón lac?
La otra, la proteína activadora por catabólico (CAP), actúa como un sensor de glucosa.
Estas proteínas se fijan al ADN del operón lac y regulan su transcripción con base en los niveles
de lactosa y de glucosa. Veamos cómo funciona esto.
El operón lac se activa por la presencia de un inductor (natural como lactosa o alolactosa, o sintético
como el IPTG). La alolactosa parece que es el inductor natural. El IPTG tiene la ventaja
biotecnológica de que no se metaboliza, por lo que su acción es constante.
La transcripción de los genes estructurales se inicia dentro del operador O1, produciéndose un
único mRNA policistrónico o poligénico, es decir una copia de RNA con los tres genes. El control
de la transcripción se ejerce en función de la presencia y ausencia de LacIp y del inductor:
En ausencia del inductor, el represor lacI se expresa, reconoce el operador y se une a él impidiendo
el acceso de la RNA-polimerasa, con lo que el operón está reprimido.
En presencia del inductor, éste se une a la mitad C-terminal del represor, reduciendo su afinidad
por el operador, con lo que la RNA-polimerasa puede acceder al promotor, transcribiendo los genes
estructurales
En presencia del inductor, el operón lac no se encuentra reprimido más del 5% del tiempo. En esta
situación se produce la transcripción del mRNA y se sintetizan los tres genes estructurales. Así, en
un ambiente natural, la presencia de lactosa hace que ésta entre por la permeasa, que en el
citoplasma se una al represor LacIp y por tanto se active el operón. El hecho de que exista permeasa
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en unas condiciones en las que el operón está reprimido se debe a que la represión no es 100%
eficaz y se produce una pequeña tasa de inicio de transcripción
El operón arabinosa (ara) de Escherichi coli es un sistema más complejo que el descrito de la
lactosa. La arabinosa, una pentosa, puede ser usada como sustrato metabólico a través de la vía de
las pentosas-fosfato; las enzimas necesarias para su metabolización son: arabinosa isomerasa,
ribulosa quinasa y ribulosa-5-fosfato epimerasa que están codificadas por los genes estructurales
araA, araB y araD. El operón ara incluye además de los tres genes estructurales: a) una región
reguladora que a su vez tiene dos operadores araO1 y araO2, b) un sitio de unión para la proteína
reguladora (araC) denominado araI (I=inductor), c) un promotor adyacente a araI y en la
proximidad del promotor se encuentra, d) un sitio de unión para la CAP-AMPc.
La proteína araC está codificada por un gen araC próximo que se transcribe desde su propio
promotor (próximo a araO1) en dirección opuesta a los genes estructurales. El papel de la proteína
es complejo, ya que es capaz de regular su propia síntesis uniéndose a araO1 y cuando su
concentración supera las cuarenta copias por célula reprime su síntesis. Respecto a los genes
estructurales, actúa también como un regulador positivo y negativo, uniéndose a araO2 y a araI, lo
cual permite una acción distinta dependiendo de las siguientes condiciones metabólicas:
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a) Si la glucosa es abundante y la arabinosa es escasa: la proteína reguladora araC se une en dos
puntos, a araO2 y araI formándose un lazo de ADN que no permite la transcripción de los genes
estructurales.
c) Si ambos son escasos o ambos son abundantes, el sistema de regulación no está claro aunque se
sabe que hay represión.
En Escherichia coli existe un acoplamiento entre transcripción y traducción, de tal manera que
cuando el extremo 5' del ARNm está disponible, comienza a ser traducido sin esperar a que finalice
la síntesis íntegra del ARNm. Este acoplamiento permite el desarrollo de un mecanismo de
regulación conocido como atenuación, y cuyo ejemplo más característico es el operón trp u operón
de síntesis del triptófano.
La síntesis proteica necesita como sustrato aminoácidos, y Escherichia coli posee las enzimas para
la síntesis de todos los aminoácidos. Los genes que codifican las enzimas implicadas en la ruta
sintética de cada aminoácido se encuentran agrupados en una unidad de operación u operón. El
operón triptófano (trp) agrupa cinco genes estructurales que codifican las enzimas necesarias para
sintetizar triptófano a partir de su precursor. El ARNm poligénico de este operón tiene una vida
media corta de unos 3 minutos permitiendo a la célula respuestas muy rápidas frente a las
necesidades de este aminoácido.
El represor trp es una proteína dimérica; cuando el triptófano es abundante, el aminoácido se une
al represor, provocando en éste un cambio conformacional que le capacita para unirse al operador.
Al estar prácticamente solapados operador y promotor la unión del represor impide la
incorporación de la ARN polimerasa y la formación de las enzimas. Hasta aquí sería un sencillo
sistema de regulación negativo por represor, sin embargo, cuando se modifica la concentración de
triptófano el sistema es capaz de graduar su respuesta permitiendo que la velocidad de síntesis de
las enzimas pueda variar en un margen estimado de unas 700 veces.
El ARNm en su extremo 5' tiene cuatro secuencias localizadas en una región denominada guía,
situada antes de los codones de los genes estructurales. Las secuencias 3 y 4 de la región guía
forman la secuencia atenuadora, debido a que el contenido en bases que presentan da lugar a la
formación de una horquilla que impide la continuación de la traducción.
La mayor parte de los aminoácidos tienen operones para su biosíntesis que utilizan un sistema de
regulación por atenuación muy parecido al comentado, con el objeto de sintetizar únicamente
aquellos aminoácidos que son necesarios. Los péptidos guía son moléculas de pequeño tamaño; el
del triptófano tiene 14 aminoácidos siendo dos de ellos triptófano; o el de la fenilalanina que tiene
15 aminoácidos de los que siete son fenilalanina. Así, sin necesidad de consumir una gran cantidad
de energía, el péptido guía actúa como un sensible medidor de la concentración del aminoácido.
En las bacterias, a pesar de ser organismos unicelulares, también es necesaria regular la expresión
de los genes adaptándola a las necesidades ambientales. Es un principio de economía celular el que
la expresión de los genes está regulada según las circunstancias celulares. Un buen ejemplo de esta
situación en bacterias es la regulación de las enzimas implicadas en el metabolismo de los azúcares.
Las bacterias pueden emplear para obtener energía distintas fuentes de carbono, como la glucosa,
lactosa, galactosa, maltosa, ramnosa y xilosa. Existen enzimas capaces de introducir cada uno de
estos azúcares en la bacteria y enzimas capaces de romperlos para obtener energía. Lógicamente,
sería un despilfarro energético producir simultáneamente todos los enzimas necesarios para
metabolizar los diferentes azúcares mencionados. Por consiguiente, sería mucho más económico
para la célula producir solamente las enzimas necesarias en cada momento, es decir, si en el medio
en el que vive la bacteria la principal fuente de carbono es la lactosa, solamente se expresarían los
genes necesarios para metabolizar la lactosa, mientras que los otros genes no se expresarían. Por
tanto, es esencial que exista un mecanismo de regulación de la expresión génica, de manera que
los genes se expresen cuando sea necesario.
Replicación
Transcripción
Traducción.
De los tres niveles de regulación, uno de los mejor conocidos actualmente es la regulación durante
la transcripción. Aunque la regulación de la transcripción en eucariontes es más compleja que en
bacterias, muchos de sus aspectos son similares. Por tanto, comenzaremos por el estudio de la
regulación de la transcripción en bacterias.
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SISTEMAS CONSTITUTIVOS Y SISTEMAS ADAPTATIVOS
Es evidente que existen algunos procesos metabólicos que son necesarios para el funcionamiento
normal de casi todas las células, de manera que existen una serie de necesidades básicas para el
mantenimiento normal de una célula. Por consiguiente, los genes que codifican para las enzimas
necesarias para el metabolismo básico celular se están expresando continuamente, es decir, se
expresan de forma constitutiva o continua. Por tal motivo, a este tipo de genes se les denomina,
"genes que guardan la casa" o genes constitutivos. Estos genes que se están expresando
continuamente no significa que su actividad no esté regulada, simplemente están sometidos a un
tipo de regulación diferente que hace que se estén expresando siempre. Los genes constitutivos
codifican para sistemas enzimáticos constitutivos, que se necesitan siempre para la actividad
normal de la célula.
Frente a los genes constitutivos, nos encontramos con los genes que se expresan solamente en
determinadas situaciones y que, por consiguiente, codifican para enzimas que solamente se
necesitan en momentos concretos. A este tipo de genes se les llama genes adaptativos y a las
enzimas codificadas por ellos, sistemas enzimáticos adaptativos. Se denominan así pensando en
que se expresan cuando la célula se adapta a una determinada situación ambiental. En algunos
libros de texto se denomina a este tipo de genes, genes regulados, sin embargo, esta nomenclatura
no es demasiado buena, ya que parece que los únicos genes cuya expresión está regulada serían
estos.
Sistemas inducibles: cuando el sustrato sobre el que va actuar la enzima provoca la síntesis del
enzima. Al efecto del sustrato se le denomina inducción positiva. Por ejemplo, en E. coli en
ausencia de galactósido (sustrato) hay de una diez unidades de galactosidasa (enzima) por
miligramo de materia seca, mientras que en presencia de galactósido se detectan hasta 10.000
unidades de galactosidasa por miligramo de materia seca. Al compuesto que desencadena la síntesis
del enzima se le denomina Inductor.
Sistemas represibles: cuando el producto final de la reacción que cataliza el enzima impide la
síntesis de la misma. Este fenómeno recibe el nombre de inducción negativa. Al compuesto que
impide la síntesis del enzima se le denomina correpresor.
Los sistemas represibles se corresponden con procesos síntesis o Anabolismo, por ejemplo el
operón triptófano y el operón histina. Se trata de las rutas metabólicas que conducen a la síntesis
de triptófano y síntesis de histidina.
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ELEMENTOS DEL OPERÓN
Jacob, Monod y colaboradores analizaron el sistema de la lactosa en E. coli, de manera que los
resultados de sus estudios permitieron establecer el modelo genético del Operón que permite
comprender como tiene lugar la regulación de la expresión génica en bacterias. Jacob y Monod
recibieron en 1965 el Premio Nobel pos estas investigaciones.
Un Operón es grupo de genes estructurales cuya expresión está regulada por los mismos elementos
de control (promotor y operador) y genes reguladores.
Los genes estructurales: llevan información para polipéptidos. Se trata de los genes cuya
expresión está regulada. Los operones bacterianos suelen contener varios genes estructurales, son
poligénicos o policistrónicos. Hay algunos operones bacterianos que tienen un solo gene
estructural. Los operones eucarióticos suelen contener un sólo gen estructural siendo
monocistrónicos.
El promotor (P): se trata de un elemento de control que es una región del ADN con una secuencia
que es reconocida por la ARN polimerasa para comenzar la transcripción. Se encuentra
inmediatamente antes de los genes estructurales. Abreviadamente se le designa por la letra P.
El operador (O): se trata de otro elemento de control que es una región del ADN con una secuencia
que es reconocida por la proteína reguladora. El operador se sitúa entre la región promotora y los
genes estructurales. Abreviadamente se le designa por la letra O.
El gen regulador (i): secuencia de ADN que codifica para la proteína reguladora que reconoce la
secuencia de la región del operador. El gen regulador está cerca de los genes estructurales del
operón pero no está inmediatamente al lado. Abreviadamente se le denomina gen i.
Proteína reguladora: proteína codificada por el gen regulador. Está proteína se une a la región
del operador. Inductor: sustrato o compuesto cuya presencia induce la expresión de los genes.
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El Operón lactosa, que abreviadamente se denomina Operón lac, es un sistema inducible que está
bajo control negativo, de manera que la proteína reguladora, producto del gen regulador i, es un
represor que impide la expresión de los genes estructurales en ausencia del inductor. El inductor
del sistema es la lactosa. Como veremos más adelante, el operón lac también está bajo control
positivo, ya que existe otra proteína que estimula la transcripción de los genes estructurales.
El gen z+: codifica para la b-galactosidasa que cataliza la hidrolisis de la lactosa en glucosa más
galactosa.
El gen y+: codifica para la galactósido permeasa que transporta b-galactósidos al interior de la
célula bacteriana.
El gen a+: codifica para la tiogalactósido transacetilasa que cataliza la transferencia del grupo
acetil del acetil Coenzima A al 6-OH de un aceptor tiogalatósido. Este gen no está relacionado con
el metabolismo de la lactosa.
Sin embargo, en presencia del inductor (la lactosa), este se une a la proteína reguladora que cambia
su conformación y se suelta de la región operadora dejando acceso libre a la ARN polimerasa para
que se una a la región promotora y se transcriban los genes estructurales. Por consiguiente, la
presencia del inductor hace que se expresen los genes estructurales del operón, necesarios para
metabolizar la lactosa.
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También es conveniente recordar que los tres genes estructurales del operón lactosa se transcriben
juntos en un mismo ARNm, es decir que los ARN mensajeros de bacterias suelen ser
policistrónicos, poligénicos o multigénicos. Sin embargo, en eucariontes los mensajreos suelen sen
monocistrónicos o monogénicos, es decir, corresponden a la transcripción de un solo gen
estructural.
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En la siguiente tabla se muestra la expresión de los genes del operón lactosa en ausencia y en
presencia del inductor (lactosa) en una bacteria normal i + p o z + y + a+. SI = significa que se
expresan, NO = significa que no se expresan.
El conocimiento profundo del funcionamiento del operón lactosa se obtuvo gracias a la obtención
de mutantes que afectaban a los genes estructurales, a los elementos de control (promotor y
operador) y al gen regulador. Además, también fue muy importante el estudio del operón lactosa
en bacterias diploides parciales o merocigotos.
Bacteria diploide parcial o merocigoto: bacteria que tiene parte de sus genes en dos dosis. Lo
habitual en las bacterias es que los genes estén en una sola dosis, ya que se trata de individuos
haploides. Sin embargo, a veces es posible mediante conjugación entre una bacteria donadora F+
y una receptora F- , obtener bacterias descendientes diploides parciales o merocigotos. Sin
embargo, estos diploides parciales son inestables. Por tal motivo, fue muy importante el
descubrimiento de bacterias F' que tienen en el factor sexual (plasmidio) parte del cromosoma
principal bacteriano. En el caso del estudio del operón lactosa, se consiguieron factores F' que
tenían incorporado exclusivamente los genes del operón lactosa. De esta forma, una bactería con
un factor F' de estas características tiene dos veces los genes del operón lactosa, una en el
cromosoma principal y otra en el factor F'.
Los primeros mutantes fueron aislados por Lederberg y colaboradores y afectaban a los genes
estructurales (z, y, a). Se dedujo que los estos genes estaban juntos y en el orden z-y-a. Los mutantes
en estos genes se denominan z- , y- e a- y ,dan lugar a alteraciones en la estructura de las enzimas
codificadas por estos genes.
Jacob y Monod aislaron bacterias mutantes i - y OC que afectan al gen regulador (i) que lleva
información para la proteína reguladora y a la región operadora (O), respectivamente. Ambos son
mutantes de tipo constitutivo.
Mutantes constitutivos: son aquellos en los que siempre se expresan o transcriben los genes del
operón lactosa, independientemente de si está o no está presente el inductor.
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La mutación constitutiva i- altera la estructura de la proteína reguladora o proteína represora
de manera que ya no es capaz de unirse a la región operadora. Por tanto, esta alteración
afecta a la región de la proteína represora encargada de unirse al operador. Al no poder
unirse la proteína represora al operador, la región promotora queda asequible para la ARN
polimerasa y se produce la transcripción de los genes estructurales en ausencia de inductor
(lactosa). La proteína represora es un tetrámero (cuatro cadenas polipeptídicas idénticas).
Es importante destacar que tanto la mutación i- como la OC actúan simultáneamente sobre los tres
genes estructurales del operón lactosa. En la siguiente tabla se indica la expresión de los genes del
operón lactosa en los dos mutantes constitutivos estudiados, en el regulador constitutivo (i- ) y en
el operador constitutivo (OC).
También es importante conocer lo que sucede en los diploides parciales o merocigotos que
contienen una región operadora normal y una región operadora mutante constitutiva, es decir,
bacterias diploides parciales O/OC.
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Sin embargo, en los diploides parciales con un gen regulador normal y un gen regulador mutante
constitutivo, es decir, en baterias diploides parciales i +/i- , el gen regulador normal i + es
dominante en posición TRANS, es decir, ejerce su efecto sobre los genes estructurales de la misma
molécula de ADN en que está la mutación del gen regulador y también sobre los genes estructurales
de otra molécula de ADN diferente. Por tanto, el gen regulador codifica para una proteína o
producto difusible que puede ejercer su efecto en diferentes moléculas de ADN. En el siguiente
diploide parcial i +P O z+y+a+/ i- P O z+y+a+ en ausencia de lactosa no hay expresión de los genes
estructurales mientras que en presencia de lactosa si se expresan. Esto se debe a que la proteína
represora normal producida por el gen i + al ser difusible se puede unir a ambas regiones
operadoras. En el siguiente esquema se indica lo que sucede en un diploide parcial i +/i- en ausencia
de inductor de inductor.
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En la siguiente tabla se indica la expresión de los genes del operón lactosa en los dos diplides
parciales, uno con en el regulador constitutivo (i- ) y el otro con en el operador constitutivo (OC).
Mutantes del Promotor (OO): estos mutantes presentan una alteración en la secuencia de bases
nitrogenadas de la región promotora, como consecuencia la ARN-polimerasa no reconoce la
secuencia promotora y, por consiguiente, no se produce la transcripción de los genes estructurales.
A estos mutantes se les ha denominado "Operador cero" (OO), pero es necesario recordar que
afectan a la región promotora.
Además de los mutantes anteriormente indicados también se han obtenido otros tipos de mutantes
que afectan al gen regulador. Entre estos mutantes se encuentran los siguientes:
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Mutante i- : la primera mutación que hemos visto es el mutante i - que ya hemos dicho que es
recesivo con respecto al i + en los diploides parciales (i +/i- ). Da lugar a un represor que es inactivo.
Mutante iQ: mutación en el promotor del gen regulador que codifica para la proteína represora (i
Q): la consecuencia es que no aparece proteína represora y, por tanto, siempre se están expresando
los genes del operón lactosa tanto en ausencia como en presencia del inductor. Se trata, por
consiguiente, de un mutante de tipo constitutivo.
Mutante i-d: afecta al gen estructural de la proteína represora en la región que codifica para el
extremo amino terminal (NH2). Esta región es la encargada de reconocer la región operadora. La
proteína represora mutante se une al inductor (al IPTG) pero no es capaz de unirse al operador.
Esta mutación es dominante sobre la i + en los diploides parciales (i +/i-d). En los diploides
parciales la proteína represora mutante no se une a las regiones operadoras y se produce siempre
la trascripción de los genes estructurales.
Mutante iS: afecta al gen estructural de la proteína represora modificando la parte central de la
proteína encargada de unirse al inductor (al IPTG). La proteína represora mutante se une al
operador pero no es capaz de reconocer al inductor (IPTG). Se trata de un mutante que está siempre
reprimido en el que no se expresan los genes del operón lactosa ya que la proteína represora está
permanentemente unida a la región operadora y no se suelta a pesar de añadir el inductor. Este
mutante es dominante sobre i + en los diploides parciales (i +/iS). En los diploides parciales el
represor mutante se une a ambas regiones operadoras bloqueando la transcripción de los genes
estructurales.
Cuando la bacteria E. coli crece en un medio que contiene glucosa, prefiere este azúcar como fuente
de energía y como consecuencia los operones que ponen producen las enzimas necesarias para
obtener energía de otros azúcares están bloqueados. Uno de los catabolitos del metabolismo de la
glucosa actúa sobre el AMP cíclico (AMPc). El AMP cíclico (AMPc) es necesario para la
transcripción de todos los operones que son inhibidos por el catabolismo de la glucosa. Es decir,
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para que se transcriban los genes del operón lactosa se necesitan niveles elevados de AMPc. Esto
mismo sucede con los operones de arabinosa, maltosa, galactosa, etc.. Se trata. por tanto de un
sistema general de control positivo que se denomina represión catabólica. Cuando E. coli crece en
un medio con glucosa, los niveles de AMPc son muy bajos y como consecuencia no se transcriben
los operones de otros azúcares. Aún no se conoce el motivo por el que los niveles de AMPc son
bajos cuando E. coli crece en un medio con glucosa como fuente de energía.
Cuando E. coli crece en un medio sin glucosa pero con lactosa los niveles de AMPc son altos, el
AMPc se une a la proteína receptora receptora de AMPc (CRP) activándola y la proteína activada
CRP-AMPc a su vez estimula la transcripción de los genes estructurales del operón lactosa y de
otros operones de azúcares. La proteína activadora por catabolitos (CAP) es un dímero que al unirse
al AMPc se activa y estimula la transcripción de los genes del operón lactosa, de manera que la
proteína activadora CAP-AMPc es necesaria para la unión de la ARN-polimerasa al promotor de
los genes del operón lactosa. La proteína activadora CAPAMPc parece ser que se une a la región
promotora cerca del nucleótido que ocupa la posición -60 (60 nucleótidos antes del comienzo del
gen z). Los mutantes que afectan a la adenilato ciclasa, enzima que transforma el ATP en AMPc,
muestran niveles muy bajos de expresión de los genes del operón lactosa, debido a que los niveles
de AMPc son muy bajos en ausencia de glucosa. Los mutantes que afectan a la proteína CRP o
CAP también presentan niveles muy bajos de expresión de los genes del operón lactosa en ausencia
de glucosa.
CONCLUSIONES
5. El operón lac es un operón o grupo de genes con un solo promotor (transcrito como un solo
ARNm). Los genes en el operón codifican las proteínas que permiten que las bacterias
utilicen la lactosa como fuente de energía
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6. Glucosa presente, lactosa ausente: no ocurre la transcripción del operón lac. Eso es porque
el represor lac permanece unido al operador y previene la transcripción por la ARN
polimerasa. Además, los niveles de AMPc son bajos porque los niveles de glucosa son
altos, así que CAP está inactiva y no puede unirse al ADN.
7. Glucosa presente, lactosa presente: se da la transcripción del operón lac a un nivel bajo. El
represor lac es liberado del operador porque el inductor (alolactosa) está presente. Los
niveles de AMPc, sin embargo, son bajos porque hay glucosa. Entonces, CAP permanece
inactiva y no puede unirse al ADN, así que la transcripción solo ocurre a un nivel bajo o
pobre.
8. Glucosa ausente, lactosa ausente: no ocurre transcripción del operón lac. Los niveles de
AMPc son altos porque los niveles de glucosa son bajos, así que CAP está activa y estará
unida al ADN. Sin embargo, el represor lactambién estará unido al operador (debido a la
ausencia de alolactosa), y actúa como barrera a la ARN polimerasa y previene la
transcripción.
9. Glucosa ausente, lactosa presente: ocurre una fuerte transcripción del operón lac. El
represor lac es liberado del operador porque el inductor (alolactosa) está presente. Los
niveles de AMPc son altos porque no hay glucosa, así que CAP está activa y unida al ADN.
CAP ayuda a que la ARN polimerasa se una al promotor, lo que permite altos niveles de
transcripción.
WEBGRAFIA
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