Discu 2
Discu 2
Discu 2
Describir en qué consiste la estructura primaria de una proteína y los enlaces que la
estabilizan.
Residuo: este término refleja la pérdida de los elementos del agua cuando un aminoácido
se una a otro. Los enlaces covalentes que las estabilizan son enlaces disulfuro cruzados.
Estructura secundaria de una proteína y los enlaces que estabilizan a la α hélice, hoja
plegada β y triple hélice de la colágena.
La estructura secundaria está constituida por patrones de plegamiento regular entre los
residuos de aminoácidos cercanos en un segmento de la cadena polipeptídica, que se
repite de forma regular dando origen a una estructura periódica.
La Hélice α: es una estructura habitual en las proteínas y la disposición más sencilla que
puede asumir una cadena polipeptídica. En esta estructura el esqueleto polipeptídico se
encuentra estrechamente enrollado alrededor de un eje imaginario dibujado
longitudinalmente por el centro de la hélice y los grupos R de los residuos de aminoácidos.
El giro de la α hélice es dextrógiro en todas las proteínas. La estructura se encuentra
estabilizada por un enlace de hidrógeno entre el átomo de hidrógeno unido al átomo de
nitrógeno electronegativo, de un enlace peptídico y el átomo de oxígeno carbonílico
electronegativo del cuarto aminoácido. Cada vuelta sucesiva de la hélice α mantiene unida
a las vueltas adyacentes mediante tres o cuatro enlaces de hidrógeno que proporcionan a
la estructura global una estabilidad considerable.
a. Fibroína de la seda
b. Fibroina de la tela de araña tiene muchps residuos de glicina y alanina, lo que
permite, un empaquetamiento compacto ya que son los grupos R más pequeños.
Triple hélice colágena: El colágeno es una estructura superenrrollada, pero con estructura
terciaria y cuaternaria específicas: tres cadenas polipeptídicas separadas denominadas α,
están superenrrolladas una alrededor de la otra. En el colágeno el enrollamiento
superhelicoidal es dextrógiro, en sentido opuesto a la hélice levógira de las cadenas alfa.
El colágeno normalmente contiene un 35% de gly, 11% de Ala y 21% de Pro y de 4-Hyp. El
contenido de aminoácidos habituales en el colágeno está relacionado con restricciones
características de la hélice del colágeno. La secuencia de aminoácidos del colágeno
corresponde generalmente a la repetición de un tripeptido del tipo Gly-X-Y donde x es a
menudo Pro e Y es a menudo 4-Hyp. Estos residuos permiten el marcado giro de la hélice
del colágeno. El estrecho empaquetamiento de las cadenas alfa en la triple hélice del
colágeno proporciona más fuerza de tensión que un cable de acero de idéntica sección.
Las fibrillas de colágeno son entramados supramoleculares constituidos por una triple hélice
de moléculas de colágeno. Las cadenas alfa de las moléculas de colágeno y las moléculas
de colágeno de las fibrillas están entrelazadas por enlaces covalentes poco habituales en
los que intervienen residuos de Lys, HyLys (5-hidroxilisina) o His presentes en algunas de
las posiciones de X o Y. La rigidez y la fragilidad cada vez mayores del tejido conjuntivo en
las personas de mayor edad son el resultado de la acumulación de entrecruzamientos
covalentes en las fibrillas de colágeno a medida que envejecemos.
Estructuras terciarias y cuaternarias de una proteína y los enlaces que la estabilizan.
La estructura terciaria es la disposición tridimensional global de todos los átomos de una
proteína. Los giros beta en la cadena polipeptídica, el ángulo y la dirección están
determinados por el número y la localización de aminoácidos específicos como: Prolina,
treonina, seria y son débiles, como las fuerzas de van der Waals, interacciones hidrofóbicas,
fuerzas electrostáticas, dipolo-dipolo. Fuertes como los puentes de disulfuro (enlace
covalente)
Estructura Secundaria.
α Hélice
Hoja Plegada β (paralela y antiparalela)
Triple Hélice de la Colágena
α Hélice
Las estructuras tienen cierta similitud aunque el periodo de repetición es mas corto en la
conformación paralela y los patrones de formación de puentes de hidrogeno son
diferentes.
Las β Queratinas tienen muchos residuos de Gly y Ala, los dos aa con los grupos R mas
pequeños. De hecho en la fibroina de la seda Gly y Ala se alternan a lo largo de grandes
porciones de la secuencia.
Giros β:
En las proteínas globulares con una estructura de plegamiento compacta en torno a un
tercio de los residuos de aminoácidos están en giros o bucles donde la cadena
polipeptídica cambia de dirección. Estos son elementos de conexión que unen tramos
sucesivos de hélices β o conformaciones β.
Los giros β que conectan los extremos adyacentes de dos segmentos de hojas β
antiparalelas son muy frecuentes.
Esta estructura forma un giro cerrado de 180º en el que están implicados cuatro residuos
aminoácidos, con el oxigeno del carbonilo del primer residuo aminoácido formando un
enlace de hidrogeno con el hidrogeno del grupo amino del cuarto.
Los grupos peptídicos de los residuos centrales no participan en ningún enlace de
hidrogeno interresudual. A menudo se encuentran residuos de Gly y Pro en los Giros β en
la glicina porque es un residuo pequeño y flexible y en la prolina por la facilidad con que
los enlaces peptidicos en los que participan el nitrógeno amino de la prolina adoptan la
configuración cis particularmente adecuada para la formación de un giro cerrado.
Estructura Terciaria.
BLOQUE ll
Con base en la clasificación de los aminoácidos por la polaridad del grupo R, analizar
que aminoácidos se encuentran superficialmente, en medio y próximos al grupo
hemo de la hemoglobina y mioglobina
MIOGLOBINA:
En cuando a su composición en aminoácidos, el interior proteico está constituido por
residuos no polares (Leu, Val, Phe, Met), a excepción de dos histidinas (His F8 e His E7),
mientras que en el exterior de la proteína se disponen tanto residuos polares como no
polares. El grupo hemo se localiza en una hendidura apolar de la molécula, dispuesto de
tal forma que sus cadenas laterales de propianato, que son muy polares, quedan hacia el
exterior de la proteína, y queda rodeada por residuos apolares, a excepción de las dos
histidinas, la His F8, que está unida a la quinta posición de coordinación del hierro del hemo,
y la His E7 o distal, que se sitúa próxima a la sexta posición de coordinación del hierro del
hemo ( donde se une el oxígeno), pero sin interaccionar directamente con ella. Esta
disposición del grupo hemo, permite que el hierro del hemo no se oxide, manteniéndose en
su estado de ion ferroso.
HEMOGLOBINA:
Consta de 4 unidades de proteína cada una de ellas con un grupo de hierro-protoporfirina
IX. La secuencia de aminoácidos es la misma en dos de las 4 unidades de proteína y se
designan como cadenas α. Las dos restantes se llaman cadenas β y son similares pero no
exactamente iguales que las α. En la tabla se representan las secuencias de aminoácidos
de las cadenas alfa y beta de la hemoglobina. Las porciones específicas de los polipéptidos
se designan con una o dos letras Lo segmentos correspondientes a las letras A, B, C, D, E,
F, G y H tienen estructuras secundarias α helicoidales las secciones restantes son grupos
terminales codos o segmentos no helicoidales.
Las cadenas α y β de la hemoglobina son muy semejantes a la de la figura en magnitud
estructural. El grupo hemo se encuentra encajado en la oquedad superior de la proteína
globular, siendo su única conexión importante con la proteína la establecida por enlace
coordinado entre él y hierro y el átomo de nitrógeno imidazólico de la histidina en la posición
F8. El grupo hemo, de naturaleza muy similar a un hidrocarburo aromático es mantenido
también en su posición por las fuerzas de Van der Waals que sobre el ejercen los restos
hidrófobos de los aminoácidos que le rodean.
Un estudio revela que los aminoácidos que se encuentran a 0,4 nm de grupo hemo en la
cadena alfa de la hemoglobina son B13 Val, C4 Thr, C7 Try, CD1 Phe, CD3 His, CD4 Phe,
E7 His, E11 Val, F4 Leu, F8 His (cooordinada), FG3 Leu, FG5 Val, G4 Ans, G5 Phe, G8
Leu, H12 Leu, H15 Val y H19 Leu
OBJETIVO 7:
Explicar la estructura del grupo hemo y mencionar las moléculas a partir de las cuales se
origina.
El átomo de hierro del grupo hemo tiene 6 enlaces de coordinación, 4 unidos al anillo
plano de la porfirina en un mismo plano con cada átomo de N y 2 perpendiculares
al plano.
En su vista lateral, los dos enlaces perpendiculares al anillo porfirina, uno para His
F8 y el otro para el 𝑂2 (aunque ese enlace puede unirse al CO y al NO.
El grupo hemo se origina a partir de dos moléculas: Glicina y Succinil-CoA que
producen en un proceso metabólico como se presentan a continuación:
El proceso enzimático que lleva a la producción del grupo hemo, se llama
apropiadamente porfirinosíntesis, ya que todos los intermediarios
son tetrapirroles se clasifican químicamente como porfirinas. La vía se inicia con la
síntesis de ácido D-aminolevulínico (dALA o δALA) a partir del aminoácido glicina y
de succinil-CoA proveniente del ciclo del ácido cítrico. La enzima limitante de
velocidad en esta reacción, la ALA sintasa, se encuentra regulada
negativamente por la concentración de glucosa y hemo. Los mecanismos de
inhibición de la ALAs por hemo o hemina se produce por medio de la disminución
de la estabilidad de la síntesis de ARNm y por la disminución de la incorporación de
ARNm en la mitocondria. Este mecanismo tiene una importancia terapéutica, la
infusión de arginato de heme o hematina y glucosa puede abortar los ataques
de porfiria intermitente aguda en pacientes con un error innato del metabolismo en
este proceso. Y funciona reduciendo la transcripción de la ALA sintasa.
BLOQUE lll
OBJETIVO 8:
La His E7 del sitio de fijación de oxígeno está demasiado alejado (Histidina distal)
para enlazarse el N de su anillo de imidazol con el hierro, pero interacciona con un
ligando del grupo hemo. Este residuo, His F8 forma un enlace de hidrógeno con el
oxígeno, esto impide la formación del enlace con el CO al hemo, siendo este el
responsable de estabilizar el lugar de enlace con el oxígeno.
OBJETIVO 9:
Se define la función de saturación Y como la fracción de ocupación de los centros de unión del
oxigeno. El valor de Y puede oscilar desde 0 hasta 1.
La presión parcial de oxigeno que se requiere para lograr la saturación media de los sitios de
fijación (P50) es de:
Mb + O2 MbO2.
El equilibrio cambia hacia la derecha o hacia la izquierda conforme se añade o se retira oxigeno en
el sistema.
Este efecto se conoce como interacciones entre hem y hem. Aunque resulta mas difícil a la primera
molécula de oxigeno fijarse a la hemoglobina la fijación subsecuente de oxigeno se produce con
afinidad elevada.
OBJETIVO 10
Describir los cambios alostericos en la estructura cuaternaria de la hemoglobina
con la oxigenación y la desoxigenación.
Los efectos alostericos son los que afectan la capacidad de la hemoglobina para fijar al
oxigeno de manera reversible.
Estos efectos solo afectan ala hemoglobina y no ala mioglobina ya que la hemoglobina es
una proteína alosterica mientras que la mioglobina no lo es. Esta diferencia queda
reflejada de tres maneras:
1. La unión de O2 ala Hb favorece nuevas adiciones de O2 a la misma molécula de Hb. O
sea el O2 se une a la Hb cooperativamente en cambio la unión del O2 a la Mioglobina no
es cooperativa.
2. La afinidad de la hemoglobina por el oxigeno depende del pH mientras que la afinidad
de la mioglobina es independiente de el. La molécula de CO2 también afecta a la
capacidad de enlazar oxigeno por parte de la hemoglobina. Tanto el H+ como el CO2
promueven la liberación del H+ y del CO2 que estaban ligados.
3. La afinidad de la hemoglobina por el oxigeno es regulada además por fosfatos
orgánicos tales como el 2,3 bifosfoglicerato (BPG). El resultado es que la hemoglobina
tiene menor afinidad por el oxigeno que la mioglobina.
Las propiedades alostericas de la hemoglobina se producen por la interacción de
subunidades diferentes. La unidad funcional de la hemoglobina es un tetramero que
consta de dos clases de cadenas polipeptidicas.
La oxi y la desoxihb difieren claramente en su estructura cuaternaria.
La molécula oxigenada es mas compacta y se denomina forma R (relajada) y la
desoxihemoglobina forma T (tensa).
LEER
describir los cambios alostericos en la estructura cuaternaria de la hemoglobina,
con laoxigenación (estructura R) y desoxigenación (estructura T).
La proteína alostérica, como consecuencia, puede cambiar su especificidad. Si hay una
determinada concentración de un ligando en el medio, hará que la proteína se más o
menos afín a otro, desplazándose el equilibrio. Las propiedades alostéricas de las
hemoglobinas dependen de sus estructuras cuaternarias, las propiedades de
hemoglobinas individuales son consecuencia de su estructura cuaternaria, así como de
sus estructuras secundaria y terciaria. La estructura cuaternaria de la hemoglobina
confiere notorias propiedades adicionales, ausentes de la mioglobina monoméricas, que
la adaptan a sus funciones biológicas singulares. Las propiedades alostericas (del griego
allos= otro, steros = espacio) dela hemoglobina proporcionan, además, un modelo para
entender otras proteínas alostericas. La hemoglobina es tetramerica, las hemoglobinas
son tetrámeros compuestos depares de dos diferentes subunidades poli peptídicas.
14
Durante la transición de la forma T a la forma R de la hemoglobina, el par de
subunidades α2β2 (verde) rota por 15* respecto al par de subunidades α2β2(amarillo). El eje de rotación
es excéntrico y el par α2β2 también se desvía un poco hacia el eje. En la representación, el par α1β1 de
color marrón claro se muestra fijo,
mientras
que el par α2β2 de subunidades verde se desvía.
OBJETIVO 11:
OBJETIVO 13:
Explicar el efecto Bohr y Haldane en la hemoglobina, su significado y su papel
fisiológico.
Efecto Bohr
Proceso bioquímico que se realiza en los tejidos y consiste en la perdida de la afinidad de
la hemoglobina por el O2 que transporta, y la ganancia de afinidad por los iones Hidrógeno
libres a nivel tisular.
La oxihemoglobina transporta con ella, gracias a sus grupos hemo, 4 moléculas de O2, que
al llegar a los tejidos se encuentra sometidas a una mayor pCO2 y por ende, menor pO2. La
afinidad de la Hb por el O2 será directamente proporcional a la pO2 en que está sometida;
lo que puede traducirse en que al llegar a los tejidos, la Hemoglobina pierde su afinidad por
el O2 que transporta, pues la pO2 tisular es muy baja o nula. Estas 4 moléculas de oxigeno
son liberadas a nivel tisular. De inmediato, dos H+ (protones) producidos a partir de la
hidratación de CO2 intermediada por la Anhidrasa Carbónica, se unen a la hemoglobina
faltante de elementos que transportar, formando así la desoxihemoglobina, la cual regresa
a los pulmones para que se reproduzca el próximo efecto.
Efecto Haldane
OBJETIVO 14:
Explicar por qué las proteínas son la expresión de la información genética y como se
produce la hemoglobina S a nivel tisular.
La estructura primaria de una proteína es el número y secuencia de residuos de
aminoácidos, que está determinada genéticamente y son la expresión de la información
genética; de la estructura 1ª dependen todas las estructuras o niveles de organización de
una proteína y por tanto, su función.
¿Por qué las proteínas son la expresión de la información genética?
Porqué son el resultado de los procesos de duplicación del ADN, el cual se traducirá a
moléculas de ARN que contienen la misma información genética que su ADN formador,
para que este salda del núcleo y llegue a los ribosomas que traducirán y sintetizaran las
proteínas a partir de la información contenida en el ARNm que se alojó.
Las proteínas son sintetizadas, dentro del ribosoma, por los 20 aminoácidos que forman un
complejo junto con su ARNt correspondiente; estos utilizan como código sintetizador, la
información que está contenida en el ARNm, es decir la secuencia de bases nitrogenadas,
las cuales darán paso a la formación de mas aminoácidos, unidos de manera lineal y por
enlaces peptídicos, la cual corresponde a la estructura primaria de una proteína, que como
ya se había dicho antes, es el punto de partida para la consolidación del resto de estructuras
proteicas y por tanto, la determinación de su función.
¿Cómo se produce la Hemoglobina S a nivel molecular?
La HbS surge como producto de una mutación en el cromosoma 11 del ADN del eritoblasto
que posteriormente dará origen al eritrocito falciforme. En el cromosoma 11,
específicamente en la cadena ß de la globina, la ARN polimerasa sintetiza el ARN mutado,
de modo que el material dañado se reproduce; el sexto “codón de inicio” que normalmente
es GAF fue sustituido por uno GTG, los cuales servirán para la traducción de aminoácidos
Glutamato y Valina, respectivamente, en los ribosomas. Y así es como molecularmente la
Hemoglobina normal de secuencias Val-His-Leu-Treo-Pro-Glu-Glu… sufre una mutación
en las bases nitrogenadas de su sexto codón de inicio, lo cual ocasionara la no síntesis de
Glu, sino de Val, estableciendo la secuencia correspondiente a la Hemoglobina S: Val-His-
Leu-Treo-Pro-Val-Glu…
*Material de apoyo:
https://www.youtube.com/watch?v=VEy8TYGs4mA&list=WL&index=12
https://www.youtube.com/watch?v=FBXcJN1ETa4&list=WL&index=11
OBJETIVO 15:
EXPLICAR LA MUTACION MAS COMUN (A NIVEL DE ADN) EN LA ANEMIA DE
CELULAS FALCIFORMES Y EL CAMBIO ESTRUCTURAL A NIVEL DE LA
HEMOGLOBINA Y DEL ERITROCITO
BLOQUE V
SEGÚN EL CASO CLINICO:
16. Explicar las manifestaciones clínicas en el paciente del caso clínico enfatizando
en el origen de la ictericia de piel y conjuntivas.
El paciente del caso clínico presenta una anemia de células falciformes la cual fue
diagnosticada cuando el cumplió 3 años ya que presentaba ictericia en la piel y conjuntivos,
la ictericia en la piel y conjuntivos es provocada en estos pacientes por el exceso de
bilirrubina en la sangre asi como también el bajo nivel de hemoglobina como pudimos ver
en la prueba que se le realizo en la cual la bilirrubina estaba en 2.1 mg/dl cuando a valores
normales debería estar en 1 mg/dl y la hemoglobina estaba a 7g/dl cuando debe estar entre
13 a 17g/dl, pero ¿Por qué el hecho del aumento en la bilirrubina en este tipo de anemía?
Como sabemos la anemia de células falciformes esta basada en el cambio del aminoácido
Glu en la parte superficial de la hemoglobina por el aminoácido Val esto provoca que la
hemoglobina pierda su elasticidad y por eso al depositar el oxigeno en los tejidos esta quede
en forma de hoz o en forma semilunar y se vuelva pegajosa provocando asi una unión con
otras HbS lo que producirá formación de cadenas largas (fibras) estas fibras al ser de mayor
tamaño que la hemoglobina normal suelen dar problemas al momento de cruzar por los
capilares de menor calibre y algunas veces se quedan atorados en ellos provocando una
disfuncionalidad en la mayoría de órganos esenciales, luego estas cadenas largas al llegar
de nuevo a los pulmones se separan de nuevo y se oxigenan regresando a su forma normal
hasta que vuelven a depositar el oxigeno donde se vuelven a adquirir su forma semilunar,
se tiene que los globulos rojos realizan este proceso de oxigenación y desoxigenación en
un promedio de 4 veces por minuto, lo cual significa que la hemoglobina pasa por este
proceso de formación y desformación de fibras repetidamente dañando asi al grupo hemo
de la hemoglobina y al glóbulo rojo hasta que al final se da una hemolisis y el glóbulo rojo
muere, este tipo de anemia también se caracteriza por el hecho de que los globulos rojos
tienen periodos de vida cortos de entre 10 a 20 a diferencia de los normales que viven un
promedio de 120 dias, al haber una destrucción grande de globulos rojos se produce la
anemia y como sabemos al momento de que un glóbulo rojo se destruye se produce
bilirrubina la cual debe ser sintetizada por el hígado para ser convertida en bilirrubina directa
la cual es fácilmente excretada por las heces pero en este tipo de anemias al haber un
exceso de destrucción de globulos rojos los índices de bilirrubina en la sangre son
demasiado altos y el hígado no puede sintetizarlo llegando a producir esto la ictericia en la
piel y en los conjuntivos.
La Anemia de células falciformes es causada por una mutación de gen que ésa lleva a la
producción de hemoglobina de la Hoz, que afecta a la función de los glóbulos rojos en el
cuerpo. Esta mutación se hereda de los padres de un individuo en un modelo recesivo de
un autosoma.
Para cada niño que un par de fuerzas tenga, la ocasión que el niño herede la mutación de
gen sigue siendo lo mismo, sin importar si han afectado a los niños anteriores.
Si solamente un padre es afectado, el niño puede tener un rasgo de la célula falciforme.
Los Niños con una única mutación de gen son generalmente sanos y no experimentan
típicamente efectos secundarios importantes. Sin Embargo, son un portador de la condición
y pueden pasar la enfermedad completa conectado a cualquier niño, si están emparejado
con otra persona con rasgo de la célula falciforme.
Para cada niño que un par de fuerzas tenga, la ocasión que el niño herede la mutación de
gen sigue siendo lo mismo, sin importar si han afectado a los niños anteriores.
VIDEO: https://www.youtube.com/watch?v=Tt08p_xCTUg