AISLAMIENTO Y CARACTERIZACIÓN DE BACTERIAS CAPACES DE

DEGRADAR CIANURO PRESENTES EN TANQUES DE ALMACENAMIENTO

DE CIANURO EN UNA MINA DE ORO DEL MUNICIPIO DE BUENOS AIRES
CAUCA

Sara Eugenia Rodallega Nazarit

Universidad Icesi
Facultad de Ciencias Naturales
Química Farmacéutica
Santiago de Cali
2015
 AISLAMIENTO Y CARACTERIZACIÓN DE BACTERIAS CAPACES DE
DEGRADAR CIANURO PRESENTES EN TANQUES DE ALMACENAMIENTO
DE CIANURO EN UNA MINA DE ORO DEL MUNICIPIO DE BUENOS AIRES
CAUCA

Sara Eugenia Rodallega Nazarit

Trabajo de grado para optar al título de pregrado en QUÍMICA

FARMACÉUTICA

Tutor del proyecto de investigación:

Dr. Aram Joel Panay Escobar

Universidad Icesi
Facultad de Ciencias Naturales
Química Farmacéutica
Santiago de Cali
2015
 APROBADO

_____________________ _____________________

(Nombre correspondiente) (Nombre correspondiente)

Evaluador Evaluador

_____________________ _____________________

(Nombre correspondiente) (Nombre correspondiente)

Director del Proyecto Co- Director del Proyecto
 AGRADECIMIENTOS

Al finalizar este trabajo de investigación, quiero agradecer a Dios por haberme

permitido tener un año más de vida y darme la capacidad física e intelectual
para desarrollar este proyecto académico.

A mi familia por apoyarme en cada meta que me propongo y brindarme la

oportunidad de recibir una formación académica.

A mi director de proyecto Aram Joel Panay, por haberme brindado su

conocimiento y apoyo, y en especial a la investigadora Catalina Mosquera
porque su apoyo y colaboración fue una gran ayuda para culminar con éxito
este trabajo.

4
 CONTENIDO

Página

RESUMEN DEL PROYECTO……………………………………………………..10

1. INTRODUCCION…………………………………………………………………....11
2. DESCRIPCIÓN DEL PROYECTO………………………………………………...12
2.1 PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA…………………………………………12
2.2 MARCO TEÓRICO Y ESTADO DEL ARTE………………………………….15
2.3 OBJETIVOS……………………………………………………………………...23
Generales………………………………………………………………………...23
Específicos……………………………………………………………………….23
2.4 METODOLOGÍA……...………………………………………………………….24
Recolección de muestras……………………………………………………...24
Aislamiento y selección...............................................................................25
Determinación del crecimiento microbiano…………………………………...25
Preservación de las muestras ………………………………………………....25
Verificación de la capacidad degradadora de cianuro................................26
Cuantificación de degradación de cianuro..................................................26
Identificación bacteriano………………………………………………………...27
2.5 RESULTADOS…...……………………………………………….....................29
Crecimiento bacteriano………………………………………………………....29
Evaluación de la tolerancia a cianuro…………………………………………29
Cuantificación de degradación de cianuro……………………………………30
Identificación de bacterias……………………………………………………...35
2.6 DISCUSION……………………………………………………………………...37
2.7 CONCLUSIONES………………………………………………………………..41
2.8 RECOMENDACIONES………………………………………………………....42
3.11BIBLIOGRAFIA…………………………………………………………………43
ANEXOS………………………………………………………………………….46

5
 LISTA DE TABLAS

Página

Tabla 1. Rutas de degradación de cianuro por parte de bacterias y

hongos……………………………………………………………………………………18

Tabla 2. Resultados de la Cuantificación de la degradación de cianuro………..34

Tabla 3. Identificación fenotípica de la bacteria aislada en medio

selectivo………………………………………………………………………………….35

Tabla 4. Resultado de la caracterización bioquímica de la bacteria #1 con la

prueba API 20 E…………………………………………………………………………36

6
 LISTA DE GRAFICAS

Página

Grafica 1. Comparación del número de UFC/mL en cada protocolo de crecimiento.

ME: medio enriquecido, MS: medio…………………………………………………..29

Grafica 2. Evaluación del crecimiento bacteriano a cuatro concentraciones de

KCN ………………………………………………………………………………………30

Grafica 3. Variación de la concentración de cianuro de potasio (48.2 ppm) en la

muestra y en el control, durante 7 días de
estudio……………………………………………………………………………………31

Grafica 4. Evaluación del crecimiento bacteriano durante 7 días en agar selectivo

con una concentración de 50 ppm de KCN …………………………………………31

Grafica 5. Variación de la concentración de cianuro de potasio (122ppm) en la

muestra y en el control, durante 11 días de
estudio…………………………….……………………………………………………..32

Grafica 6. Evaluación del crecimiento bacteriano durante 11 días en agar selectivo

con una concentración de 50 ppm de KCN………………………………………….32

7
 LISTA DE FIGURAS

Página

Figura 1. Efectos de la minería ilegal en el cauce y en zonas aledañas al rio Teta.

Fuente: revista semana……………..……………………………...............................13

Figura 2. Minas de oro al norte del Cuaca. Fuente: Periódico El Espectador.......16

Figura 3. Estructura de valencia del ion cianuro…………………………………….16

Figura 4. a) Canal donde ocurre el reemplazo electroquímico del oro por el zinc;
b) tanque de almacenamiento de cianuro de potasio; c) mina de oro en el
municipio de Buenos Aires Cauca ........................................................................24

Figura 5. Resultado de la tinción de Gram de la bacteria #1………………………..35

Figura 6. Morfología externa de la bacteria #1……………………………………….35

8
 LISTA DE ANEXOS

Página

Anexo 1. Resultado de la caracterización bioquímica de la bacteria #1 con la

prueba API 20E………………………………………………………………………….46

Anexo 2. Curva de calibración con 5 concentraciones de KCN, para determinar la

degradación biológica de 48.2 ppm de cianuro de potasio ……………………….46

Anexo 3. Curva de calibración con 5 concentraciones de KCN, para determinar la

degradación biológica de 122ppm de cianuro de potasio …………………………47

9
 RESUMEN

El conocimiento científico acerca del papel que desempeñan los microorganismos

en el tratamiento de agentes contaminantes del medio ambiente como el cianuro,
es esencial para controlar los daños que puede ocasionar el uso inadecuado de
esta sustancia. En este trabajo, se aisló una cepa bacteriana de un tanque de
almacenamiento de cianuro, en una mina de oro en el municipio de Buenos Aires
Cauca y posteriormente se estudió su capacidad degradadora de cianuro. Para el
aislamiento se empleó un medio selectivo con cianuro de potasio como única
fuente de carbono y energía; se logró aislar una cepa bacteriana Gram negativa,
que se identificó fenotípicamente como del género Estreptococo. Su capacidad
degradadora se evaluó a escala de laboratorio durante 8 días, empleando un
electrodo ion selectivo al cianuro; la cepa presentó un porcentaje de remoción
aproximadamente del 30% del cianuro presente en el medio.

Palabras claves: bacterias degradadoras de cianuro, cianuro, minería de oro y

biorremediación.

ABSTRACT
The scientific understanding about the role microorganisms play in the treatment of
pollution agents such as cyanide is essential to come out with possible ways to
control the damages that can be caused by the inappropriate use of this
substance. In this work a bacterial strain from a cyanide storage tank was isolated
at a gold mine in the city of Buenos Aires Cauca. The bacteria was isolated using,
a selective medium with potassium cyanide with only carbon and energy source.
The isolated bacteria was a Gram negative bacterial strain, which was identified
phenotypically as the genus Streptococcus. Its degrading capacity was evaluated
on a laboratory scale for 8 days using a cyanide ion selective electrode; the strain
showed a percentage removal of about 30% of the initial cyanide present in the
media.

Keywords: cyanide degrading bacteria, cyanide, gold mining and bioremediation.

10
 1. INTRODUCCION

La minería de oro es una actividad que tiene una alta incidencia en la

contaminación ambiental, puesto que hace uso de sustancias químicas como el
cianuro. Cuando la práctica minera se contextualiza en el panorama de la
clandestinidad, el efecto negativo que se genera en el medio ambiente puede ser
mucho más alto, puesto que no se hace un tratamiento adecuado para desactivar
el cianuro, es decir transformarlo en compuestos menos tóxicos.

El cianuro, es una sustancia ampliamente utilizada a nivel industrial; este

compuesto se caracteriza por ser muy toxico para los seres vivos, ya que actúa
rápidamente sobre el sistema respiratorio impidiendo el uso de oxigeno mediante
la inhibición de la enzima citocromo oxidasa (Guerrero, 2010). Comercialmente el
cianuro se presenta como cianuro de hidrogeno (HCN), cianuro de sodio (NaCN)
o cianuro de potasio (KCN). El cianuro de sodio es un reactivo químico que
disuelve el oro en agua, con lo cual se ve favorecida su posterior separación de
otros metales (Garcés et al., 2006)

La biorremediación es una técnica empleada para eliminar contaminantes

ambientales, ya que hace uso de microorganismos y plantas que tienen la
capacidad de degradar compuestos químicos y transfórmalos en otros menos
tóxicos para el medio ambiente. Teniendo en cuenta que los microorganismo
como bacterias, hongos entre otros, se encuentran en todos los ecosistemas, el
mismo foco de contaminación como en el caso de la minera, constituye
posiblemente una fuente rica en microorganismos, que presenten la capacidad de
degradar las sustancias químicas que se emplean; por ello, se recurre a obtener
muestras de agua en tanques de almacenamiento de cianuro en una mina de oro.

Algunos investigadores han realizado estudios con microorganismos y han

encontrado diferentes rutas para la degradación de cianuro por parte de bacterias
y hongos, conduciendo en la mayoría de los casos a la conversión del cianuro a
amonio como producto final (Castillo, 2005); esto permite tener herramientas de
base, orientadas a que el panorama de investigación sea menos complejo.

El presente estudio permitió la caracterización de una cepa bacteriana, utilizando

medios de cultivos enriquecidos y selectivos que proporcionó al microorganismo
una fuente de carbono y de nitrógeno; y finalmente para poder evaluar la
capacidad degradadora de cianuro se hace necesario el empleo de un electro de
ion selectivo al compuesto y un correcto tratamiento de los datos obtenidos. Los
resultados obtenidos permitirán tener una base, para futuros estudios de
biorremediación donde se empleen bacterias con capacidad de degradar cianuro.

11
 2. DESCRIPCIÓN DEL PROYECTO

2.1 PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA

La extracción de oro juega un papel importante en Colombia, puesto que

representa una de las mayores fuentes de ingreso económico para el país. En un
artículo de la contraloría se menciona que la minería pasó a convertirse en una
actividad de gran importancia en la economía nacional en la medida en que los
mercados internacionales, en particular de oro y carbón, se tornaron muy
atractivos por demanda y precio (Procuraduría General de la Nación, 2014). La
importancia dada a la minería es tan significativa, que el Plan Nacional de
Desarrollo 2010 – 2014 - “Prosperidad para todos” – la identifica como una de las
Locomotoras de crecimiento, proyectando para el año 2014 una producción 72
toneladas/año de oro y 124 Millones de toneladas/año de carbón (Torres et al.,
2013). Según la Unidad de Planeación Minero Energética (Unidad de Planeación
Minero Energética, UPME, 2005), la industria minera es uno de los sectores más
dinámicos en la economía colombiana y representa la segunda actividad con
mayor crecimiento, con un 7.12% en 2005 del PIB, sus exportaciones crecieron a
un ritmo de 23.01% y representaron 19.84% de las exportaciones totales del país
(Lachaud & Maldonado, 2011) .
La práctica minera se contextualiza desde dos panoramas: el primero en donde la
actividad minera es formal y a gran escala; y el segundo en donde la minería
parece ser a menor escala pero surge desde la informalidad (Suárez, 2011).
Debido a la finalidad de este proyecto, este último panorama es el que compete
analizar, puesto que esta práctica desde la clandestinidad puede tener un grande
impacto negativo en el medio ambiente. Debido a que se desaprovechan
abiertamente los recursos naturales no renovables, se afecta de manera sensible
fauna, flora, aire, agua y suelo, genera sobre costos en el uso de recursos
imprescindibles para la vida y genera pasivos ambientales (Torres et al., 2013)
A menudo las minas de oro ilegal o artesanal emplean grandes cantidades de
cianuro para separar el oro de otros metales presentes, pero el subproducto de
este proceso - el ion cianuro- es arrojado a las fuentes acuíferas donde se
constituye en un potente problema de contaminación ambiental. Es debido a esta
situación que se hace necesario buscar estrategias de biorremediación que
ayuden a minimizar el impacto negativo que esta práctica causa en el medio
ambiente; en la medida en que se producen grandes cantidades de cianuro cada
año, se hace necesario el uso de varios métodos fisicoquímicos para degradar
este compuesto. Sin embargo, la mayoría de estos procedimientos son costosos,
pueden producir alteraciones en los suelos y Los fluidos de extracción pueden
aumentar la movilidad de los contaminantes (Luque & cols., 2007).
De este modo, los métodos biológicos alternativos para eliminar el exceso de
cianuro en el ambiente están siendo diseñados bajo la base de la diversidad
metabólica de las bacterias y hongos, los cuales se adaptan a condiciones

12
extremas de crecimiento (Luque & cols., 2007). Por lo tanto, el aislamiento y la
identificación de bacterias en muestras de aguas procedentes de zonas mineras,
es una estrategia que podría ser viable para encontrar organismos eficaces en la
biorremediación de cianuro. El cianuro, por ser un compuesto natural, puede ser
biodegradable. A pesar de que es un inhibidor metabólico, se han aislado
organismos capaces de utilizarlo como fuente de nitrógeno. Por este motivo para
la eliminación del cianuro se pueden emplear desde los lodos activados hasta
enzimas puras, dependiendo de la complejidad y variabilidad del efluente a tratar
(Castillo, 2005).
En los alrededores del río Teta, en el municipio de Buenos Aires Cauca, desde
hace varios años existe presencia de actividad minera, y por lo que se puede
divisar al recorrer sus alrededores ha causado un impacto negativo y de gran
magnitud en la flora y fauna de la zona (ver figura 1). En recorridos realizados por
las defensorías delegadas para los indígenas y las minorías étnicas, para los
derechos colectivos y del ambiente en el departamento del cauca, se evidencio la
destrucción que sufren los ríos Ovejas, Teta y Quinamayó, cuyo cauce ha sido
desviado y sus aguas profundamente contaminadas por la remoción de tierras, la
formación de montañas con material estéril y el vertimiento de sustancias químicas
para el proceso de separación y recolección del oro (Periódico Proclama, 09 mayo
de 2015). Se espera que las posibles bacterias encontradas en las muestras,
presenten la capacidad de incorporar el nitrógeno y el carbono provenientes del
cianuro a sus rutas metabólicas, lo cual sería un indicativo de que pueden
degradar el compuesto.

Figura 1. Efectos de la minería ilegal en el cauce y en zonas aledañas al rio Teta. Fuente: revista
semana, 29/01/2015.

13
En este trabajo se pretende dar respuesta a la siguiente pregunta de investigación:
¿Existen bacterias con capacidad de degradar cianuro en una mina de oro en el
municipio de Buenos Aires Cauca?

14
 2.2 MARCO TEÓRICO Y ESTADO DEL ARTE

Colombia es un país que se caracteriza por presentar una alta riqueza de

sustancias de explotación minera a lo largo de todo el territorio nacional, entre las
que se pueden encontrar un gran porcentaje de minerales: oro, carbón, platino,
níquel entre otros. Debido a la riqueza del subsuelo la minería en Colombia
durante del siglo XX tuvo un alto crecimiento, pero a partir de esa época la minería
tradicional, como fuente de ingresos y de empleo, ha venido creciendo en el país
sin control alguno. Hoy por hoy, en Colombia la minería ilegal de oro se encuentra
como una actividad altamente demandada, lo cual se logra evidenciar en un gran
porcentaje de la población y en el impacto ambiental que causa (Procuraduría
general de la nación, 2011). Por tal motivo, como se plantea en un artículo de la
Universidad Militar Nueva Granda “No se puede llegar a pensar que la minería
ilegal solo impacta en términos legales, puesto que tiene amplísimas
consecuencias en sectores ambientales, económicos, de legitimidad Estatal y de
seguridad” (Montero, 2012). Todo este fenómeno se puede ilustrar en el caso
particular del río Dagua en el departamento del Valle del Cauca, donde la minería
ilegal de oro ha dejado erosión y socavación de sus márgenes, por construcción
de las fosas, así como la perdida de cobertura vegetal protectora. La
contaminación del río con productos químicos como el mercurio y el cianuro
utilizados en la extracción del oro disminuyó la potabilización del agua para el
consumo humano, restringiendo el derecho fundamental al agua potable de las
personas de la zona y causo un impacto catastrófico e irreversible en el medio
ambiente y, por ende, en la diversidad biológica (Torres et al., 2013).
La verdadera problemática con respecto a la actividad minera en Colombia, surge
a raíz del poco control gubernamental en la mayoría de los casos para la
extracción del oro: se permite que se empleen sustancias altamente toxicas para
el medio ambiente como el cianuro; y además se entregan muchos títulos sin
algún criterio formalmente definido. Un periodista del periódico El Espectador dice
que Cifras de Catastro y Registro minero señalan que de los títulos otorgados en
Colombia, el 43% es para la explotación de oro y el 25% para carbón. Estos dos
materiales terminan en países extranjeros: el 99% del oro extraído es para
exportación y lo mismo sucede con el 95% del carbón. Para la Contraloría,
además de representar fuertes daños ambientales, se trata de un modelo que no
genera encadenamientos productivos y no dinamiza directamente la economía
(Calle, 2013). También se puede asociar a esta problemática la falta de
oportunidades laborales y el hecho de que la minería ilegal ha venido nutriendo de
dinero las arcas de organizaciones criminales, incluyendo grupos guerrilleros y
bandas de delincuentes a lo largo y ancho del país (Revista Semana, 01 de abril
de 2015).
Uno de los departamentos con una alta incidencia de actividad minera en estos
momentos es el Cauca, en donde la explotación de oro de forma ilegal alcanza un
porcentaje mucho mayor respecto a la forma legal, dejando un alto impacto

15
negativo en el medio ambiente. En el caso particular del municipio de Buenos
Aires, ubicado al norte del departamento, esta actividad se lleva a cabo
constantemente y en una gran parte del territorio, y a raíz de eso se evidencia
como algunos ríos, especialmente el río Teta, se han deteriorado porque la
mayoría de minas de oro están en zonas aledañas a esta fuente hídrica como se
observa a continuación.

Figura 2. Minas de oro al norte del Cuaca. Fuente: Periódico El Espectador (2012).

Cianuro y Biorremediación
La industria minera, en particular la industria minera del oro, ha estado utilizando
el cianuro en sus procesos productivos durante muchas décadas. Aunque el
cianuro es una sustancia muy tóxica, en realidad es una sustancia química
ampliamente utilizada, esencial para el mundo moderno. La clave para su uso
seguro es la implementación de sólidas prácticas de manejo, pero esto no es algo
que se realice a menudo.

Figura 3. Estructura de valencia del ion cianuro

El ion cianuro como se puede observar en su estructura, se caracteriza por la

presencia de la unidad química formada por el enlace carbono nitrógeno, y es
potencialmente letal ya que actúa rápidamente sobre el sistema respiratorio,
impidiendo el uso del oxígeno mediante la inhibición de la acción de las enzimas
respiratorias. Una vez que se encuentra en el torrente sanguíneo, el cianuro forma
un complejo estable con la citocromo oxidasa, una enzima que promueve el

16
traspaso de electrones a las mitocondrias de las células durante la síntesis de
adenosin trifosfato (ATP).Si la citocromo oxidasa no funciona correctamente las
células no consiguen aprovechar el oxígeno del torrente sanguíneo, lo que causa
hipoxia citotóxica o asfixia celular. La falta de oxígeno provoca que el metabolismo
cambie de aerobio a anaerobio, lo que conlleva a la acumulación de lactato en la
sangre. El efecto conjunto de la hipoxia y la acidosis láctica provoca una depresión
en el sistema nervioso central que causa paro respiratorio y resulta mortal
(Guerrero, 2010).
Además del hombre, los animales se ven afectados por los efectos del cianuro,
por ejemplo las aves migratorias y acuáticas que llegan a pozos con altos
contenidos de cianuro; pero el componente más vulnerable del ecosistema a los
impactos adversos de una exposición al cianuro lo constituye la vida acuática. Los
organismos acuáticos son más sensibles a los efectos tóxicos de este reactivo, y
físicamente no es posible evitar su ingreso a los cuerpos de agua (Guerrero,
2010).
Básicamente el cianuro se presenta como cianuro de hidrogeno (HCN), cianuro
de sodio (NaCN) o cianuro de potasio (KCN). El cianuro de sodio es un reactivo
químico que disuelve el oro en agua, con lo cual se ve favorecida su posterior
separación de otros metales a través de la siguiente reacción:
2Au(s) + 2H2O + 4NaCN + O2 → 2NaAu(CN)2(aq) + 2NaOH + H2O2
(Garcés et al., 2006).
Para recuperar el oro del complejo formado con el cianuro de sodio, se hace uso
del principio de la precipitación empleando polvo de zinc, lo cual está basado en
el hecho de que el oro es electronegativo respecto al zinc, ocurriendo un
reemplazo electroquímico del oro por el zinc, seguido por el desplazamiento del
hidrógeno del agua por el sodio según la siguiente reacción:

NaAu (CN)2 + 2NaCN + Zn + H2O → Na2Zn(CN)4 + Au + H2 + NaOH

(Ortiz, 2011)

Suarez plantea que: “Sin lugar a dudas, hoy en día, la minería es la actividad de
origen antrópico que mayor impacto está causando sobre los recursos naturales
del país” (Suárez, 2011). Esto es realmente cierto, pues es una de las principales
actividades económicas en Colombia y se puede poner en práctica con mucha
facilidad, porque en muchos de los lugares en donde ocurre no existe un control
fuerte del gobierno para mitigar el impacto ambiental que se causa en la
naturaleza.
Existen en la actualidad estrategias para disminuir los efectos tóxicos de muchas
sustancias en la naturaleza, como el empleo de sustancias químicas, la
biorremediación entre otras. Esta última es una técnica que puede llegar a ser
eficaz, eficiente y segura. Esta tecnología utiliza el potencial metabólico,

17
fundamentalmente de bacterias, para transformar contaminantes orgánicos en
compuestos más simples poco o nada contaminantes porque utilizan la sustancia
en particular como fuente de carbono y energía necesarios para sus funciones
metabólicas y crecimiento (Garcés et al., 2006).
Garcés plantea, en su artículo sobre “Aislamiento de consorcio de
microorganismos degradadores de cianuro”, que el ion cianuro puede ser
metabolizado por organismos tales como hongos y bacterias, que lo emplean
como fuente de carbono y nitrógeno. Por ejemplo, Bacillus ipeeaterium transforma
cianuro de potasio en ácido aspártico, asparagina y el dióxido de carbono libre o
unido al cianuro en carbonato y amoníaco, Pseudomonas pseudoalcaligenes
CECT534, bajo condiciones alcalinas, consumen el cianuro y lo transforman en
amoníaco y Fusarium solani IHEM 8026 degrada el cianuro de potasio a ácido
fórmico (Garcés et al., 2006).
En un trabajo de investigación titulado “Aislamiento e identificación de bacterias
capaces de degradar cianuro presentes en muestras obtenidas del proceso de
extracción de almidón de yuca”, se plantea que los microorganismos que tienen la
capacidad de degradar cianuro no presentan envenenamiento sujeto a la
sustancia, puesto que algunos de ellos cuentan con rutas alternativas para la
producción de ATP y otros poseen una oxidasa diferente a la citocromo C oxidasa
(enzima inhibida directamente por el cianuro). Sin embargo, en mamíferos, el
cianuro es un inhibidor enzimático que bloquea la producción de ATP (Adenosín
Trifosfato) induciendo a la hipoxia celular (J.N Siedow, 1995).
Todos los organismos cianógenos y algunos no cianógenos, han desarrollado
mecanismos de resistencia frente a este tóxico, esto se debe a la síntesis de una
oxidasa alternativa insensible a cianuro y la inducción de un potente sistema de
adquisición de metales. Aunque se han descrito varias rutas de degradación de
cianuro, la mayoría tienen en común la conversión de éste a amonio como
producto final. Las diferentes rutas para la degradación de cianuro por parte de
bacterias y hongos se resumen en la siguiente tabla (Castillo, 2005).

Tabla 1. Rutas de degradación de cianuro

Enzimas Origen microbiano

Cianuro monoxigenasa
Pseudomonas sp.
+ +
HCN+ O2 + H +NADPH→ HOCN + NADP +H2O

Cianasa
Escherichia coli, Rhodococcus
HOCN+H2O→ CO2 +NH3 rhodochrous

18
Cianuro dioxigenasa Pseudomonas fluorescens,
Pseudomomas cereus, Bacillus
+ +
HCN +O2 + H + NADPH→ CO2 +NH3 + NADP pumillus

Cianuro hidratasa

HCN + H2O→ HCONH2 Hongos patógenos

Nitrilo hidratasa Pseudomonas, Corynebacterium,

Brevibacterium
R-CN +H2O → RCONH2

Cianidasa Alcaligenes xylosooxidans

HCN+2H2O → HCO2H +NH3

Nitrilasa Klebsiella, Arthrobacter,

Pseudomonas, Nocardia
R-CN +2H2O→ RCO2H + NH3

Rodanasa Thiobacillus denitrificans, Bacillus

subtilis, Bacillus stearothermophilus
2 2- 2-
HCN +S O3 → SO3 +HSCN

Cianoalanina sintetasa
-
CyS +HCN → β-cianoalanina +HS Bacillus magaterium

A partir de esta tabla, se puede evidenciar que son diversos los mecanismos
empleados para utilizar o romper la molécula de cianuro. Uno de los mecanismos
involucra a la enzima cianuro hidratasa, que resulta en la conversión irreversible
del cianuro en formamida, que finalmente es transformada en CO2 y NH3. El
cianuro también puede ser convertido en -cianoalanina o en un - aminonitrilo por la
-cianoalanina sintetasa, seguida de la hidrólisis de los productos para liberar un
ácido y NH3. Una tercera ruta, involucra la utilización de la cianuro monoxigenasa
para catalizar la conversión de HCN en cianato (HOCN), lo que lleva a una
descomposición catalítica mediada por otra enzima, cianasa para producir CO2 y
NH3. La cianasa es inducible con el cianato, mientras que la enzima cianuro
monoxigenasa no lo es. Algunas cepas bacterianas transforman directamente
cianuro en CO2 y NH3 por medio de la cianuro dioxigenasa, pero sin la formación
de cianato como intermediario (Guerrero, 2010).Se puede observar en la tabla 1,
que la cianidasa resulta especialmente interesante, ya que no necesita cofactores
y produce directamente amoniaco y ácido fórmico, utilizando cianuro y agua como
únicos sustratos (Castillo, 2005).
Como todo proceso tecnológico la biorremediación tiene ventajas y desventajas, lo
cual dependerá de que tan factible puede ser aplicarla en condiciones de campo y
que tan respetuosa es con el entorno natural en el que tiene que desarrollarse. Por
ello cuando se logra aislar y caracterizar organismos con capacidad de degradar

19
contaminantes ambientales el paso a seguir es evaluar cómo se va implementar la
técnica, ya que teniendo en cuenta el movimiento o no de la matriz contaminada,
las técnicas de biorremediación pueden dividirse en dos: in situ y ex situ. En la
primera, los suelos y las aguas contaminadas son tratados en el propio lugar de la
contaminación sin transformación. En la segunda, implica la excavación o traslado
de los suelos contaminados; y en el caso de las aguas, significa el bombeo-
tratamiento-recarga o traslado a reactores .La selección de la técnica depende de
tres principios básicos: la bioquímica, que es la posibilidad de que el contaminante
sea transformado biológicamente; la biodisponibilidad, que es la accesibilidad del
microorganismo al contaminante; y la bioactividad, que es la oportunidad de
optimizar la actividad biológica (Barrios, 2011).
La biorremediación de aguas se efectúa en algunos casos mediante el bombeo-
tratamiento-recarga que consiste en extraer el agua, promover la biodegradación
de los contaminantes en reactores y posteriormente devolverla al acuífero, o bien,
inyectar nutrientes y bacterias. De manera que se establece una recirculación y el
sitio mismo se convierte en un biorreactor (Barrios, 2011). En el caso particular
del uso de bacterias para eliminar las sustancias químicas dañinas, el suelo y el
agua debe tener la temperatura, los nutrientes y la cantidad de oxígeno
apropiados. Esas condiciones permiten que las bacterias crezcan y se
multipliquen, y asimilen más sustancias químicas. Cuando las condiciones no son
las adecuadas, las bacterias crecen muy despacio o mueren, o incluso pueden
crear sustancias químicas más dañinas. Una vez que se han eliminado las
sustancias químicas dañinas, las bacterias ya no tienen sustrato disponible y
mueren. (Higuera & Oyarzun, 2011)
Las metodologías tradicionalmente utilizadas para el estudio de los procesos de
biorremediación consistían en la utilización de métodos microbiológicos
convencionales para la obtención de consorcios con capacidad de degradar
contaminantes. Sin embargo, desde hace tiempo se ha puesto de manifiesto la
necesidad de utilizar métodos que no requieran un paso previo de cultivo, dado
que una gran parte de los microorganismos presentes en los ambientes naturales
no pueden crecer en medios de cultivo sintéticos (Martínez & Gaju, 2005).
Actualmente existe una tecnología muy eficiente para la biorremediación de
efluentes que consiste en el uso de tapetes microbianos, teniendo como ventaja
primero que resulta de bajo costo comparada con otras técnicas de
biorremediación y segundo es ambientalmente compatible. Con esta herramienta
la biorremediación de agua la realizan de manera natural comunidades autótrofas
y heterótrofas que forman una biopelicula o tapete microbiano (Jiménez et al.,
2015).
Los tapetes microbianos son ecosistemas naturales donde microorganismos
pertenecientes a diferentes grupos fisiológicos se agrupan en unos pocos
milímetros de espesor. En ellos pueden establecerse complejas comunidades
microbianas que se estratifican en profundidad, dependiendo de los abruptos

20
gradientes de luz, oxígeno, potencial redox que se generan, y de su propia
fisiología (Martínez & Gaju, 2005).
La comunidad de microorganismos que constituyen el tapete microbiano es
inmovilizada sobre una matriz inerte (no tóxica) de polyester de baja densidad.
Esta matriz está conformada por una estructura fibrosa de composición ligera y
alta porosidad (con una relación superficie- volumen alta), que facilita la fijación
estratificada de los microorganismos (principalmente bacterias, cianobacterias y
microalgas) y el paso del agua residual a través del tapete microbiano; esta
tecnología, evita el lavado de células del sistema (Jiménez et al., 2015).

Identificación de bacterias y cuantificación de cianuro

Existen diversas técnicas para realizar caracterización de microorganismos como
por ejemplo, las pruebas moleculares como la secuenciación del gen 16S rRNA,
métodos proteómicos como la espectrometría de masas y métodos fenotípicos de
identificación como las pruebas bioquímicas.
En el caso de la identificación de bacterias empleando ARNr 16S, el cual es un
polirribonucleotido, codificado por el gen rrs, también denominado ADN ribosomal
16S, se puede obtener información filogenética y taxonómica de bacterias a partir
de su secuencia. Esta molécula presenta una serie de características, las cuales
fundamentan su empleo como herramienta filogenética y taxonómica: primero,
porque se trata de una molécula antigua, presente en todas las bacterias actuales;
segundo, porque su estructura y función han permanecido constantes durante un
tiempo muy prolongado; tercero, porque los cambios ocurren de manera
suficientemente lenta, como para aportar información acerca de todos los
procariotas y además, porque los ARNr contienen suficiente variabilidad para
diferenciar no solo los organismos más lejanos, sino también los más próximos ;
cuarto, porque presenta un tamaño (1500nt) lo suficientemente largo para
minimizar las fluctuaciones estadísticas (Rodicio & Mendoza, 2004).
Por otra parte, la identificación también se puede realizar empleando pruebas
bioquímicas utilizando un equipo VITEK® y mediante espectrometría de masas.
Las pruebas bioquímicas permiten determinar las características metabólicas de
las bacterias. Algunas de estas pruebas son técnicas rápidas, ya que evalúan la
presencia de una enzima preformada y su lectura varía entre unos segundos hasta
unas horas. Otras pruebas requieren para su lectura el crecimiento del
microorganismo con una incubación previa de 18 a 48h. A este grupo pertenecen
la mayoría de las pruebas que detectan componentes metabólicos o aquellas que
determinan la sensibilidad de un microorganismo a una sustancia dada tras cultivo
en medios de identificación, que contienen el sustrato a metabolizar (Fernández et
al., 2010).

21
 En el caso de la espectrometría de masas es una técnica analítica que permite
analizar con gran precisión la composición de diferentes elementos químicos, al
permitir la medición de iones derivados de moléculas, separándolos en función de
su relación masa/carga (m/z). En el espectrómetro de masas se produce la
separación de las especies iónicas de la muestra en función de su masa. Una
variante de la técnica, es la espectrometría de masas MALDI-TOF, la cual es de
gran interés en microbiología en la identificación bacteriana basada en la
detección de proteínas ribosómicas S y L. La ventaja de este método es que es
capaz de realizar la identificación de bacterias enteras, sin necesidad de largos
procedimientos previos como la extracción de proteínas, digestión, purificación, etc
(Fernández et al., 2010).
Para medir la concentración del ion cianuro en el medio y poder estimar si las
posibles bacterias son capaces de degradar la sustancia, se empleará un
electrodo selectivo al ion cianuro, este utiliza una membrana de ion selectivo que
permite que únicamente los iones cianuro lo penetren. Además, es un electrodo
indicador que necesita trabajar siempre junto a uno de referencia. La ventajas que
presenta es que realiza las mediciones de forma simple, rápida y precisa (Crison,
2012).

22
 2.3 OBJETIVOS

Objetivo general

Aislar bacterias capaces de degradar cianuro, presentes en muestras de agua

de un tanque de almacenamiento de cianuro, en una mina de oro.

Objetivos específicos

1. Aislar las bacterias capaces de sobrevivir en un medio con cianuro,

encontradas en muestras de agua provenientes de tanques de
almacenamiento de cianuro en una mina de oro.
Indicador: Bacterias aisladas capaces de crecer en un medio selectivo.

2. Cuantificar la remoción del cianuro por parte de las bacterias aisladas

mediante el empleo de un electrodo selectivo al ion cianuro.
Indicador: Concentración de cianuro removido

3. Identificar las bacterias capaces de degradar el cianuro mediante pruebas

bioquímicas y espectrometría de masas.
Indicador: Identificación del género de las bacterias aisladas

23
 2.4 METODOLOGÍA

2.4.1 RECOLECCIÓN DE MUESTRAS

Las muestras fueron tomadas de un canal (punto donde se daba la separación del
cianuro unido al oro) que conducía a un tanque de almacenamiento de cianuro en
una mina de oro en el municipio de Buenos Aires Cauca (ver figura 4). 50 mL de
muestra fueron envasados y conservados en tubos falcón estériles, a temperatura
ambiente y posteriormente se trasladaron al laboratorio para su procesamiento
antes de que transcurrieran 24 h.

Figura 4. a) Canal donde ocurre el reemplazo electroquímico del oro por el zinc; b) tanque de
almacenamiento de cianuro; c) mina de oro en el municipio de Buenos Aires Cuca.

24
2.4.2 AISLAMIENTO Y SELECCIÓN DE MICROORGANISMOS
En el proceso de aislamiento y selección primaria se emplearon dos protocolos de
discriminación, denominados A (crecimiento en medio sólido) y B (pre-crecimiento
en medio líquido). En el protocolo A se disolvió 1 mL de muestra en 9 mL de agua
destilada y luego se realizaron diluciones en serie hasta 10 -7, las cuales se
hicieron por triplicado. Posterior a ese proceso se realizó la siembra en placas de
0.1 mL de cada dilución en un medio selectivo que contenía : KH 2PO4 2,7 g,
K2HPO4 3,5 g y 10 mL de una solución de sales (FeSO4•7H2O 300 mg,
MgCl2•6H2O 180 mg, Co(NO3)2•6H2O 130 mg, CaCl2 40 mg, ZnSO4 40 mg y MoO3
20 mg, en un litro de agua desionizada), agar 18 g y KCN 25 mg/L, en 1 litro de
agua desionizada como única fuente de carbono y nitrógeno. Las muestras se
incubaron durante 7 días a 30°C.
En el protocolo B se tomó por duplicado 10 mL de muestra y se disolvieron en 90
mL de medio selectivo líquido y en 90 mL de medio enriquecido liquido; las
muestras se incubaron a 30°C por 7 días en un shaker con agitación a 180 rpm. El
medio enriquecido contenía lo siguiente: KH2PO4, 1,36 g/L; (NH4)2SO4, 0,5 g/L;
MgSO4 x 7H2O, 0,2 g/L; CaCl x 2H2O, 0,01g/L; así como elementos traza: FeSO4 x
7H2O mg/L, 5,0; MnSO4 x 7H2O, 2,5 mg/L; Na2MoO4 x 2H2O, 2,5 mg/L; Na2HPO4,
2,13mg/L y como fuente de carbono se utilizó Glucosa 10 g/L a un pH de 7,2.
Trascurrido los días de incubación se realizaron diluciones en serio hasta 10 -7 de
cada uno de los medios por triplicado, tomando 1 mL de muestra y depositándola
en 9 mL de agua destilada; posteriormente se realizó la siembra de 1 mL de cada
dilución de medio rico liquido en medio rico sólido y de medio selectivo liquido en
medio selectivo sólido. Las muestras se incubaron a 30°C por 7 días.
Determinación del crecimiento bacteriano
Para la determinación de la población microbiana, se realizó un recuento directo
en placa, pero sin el uso de un microscopio óptico, puesto que las colonias tenían
un tamaño considerable, lo que permitía contarlas a simple vista. El conteo de
unidades formadora de colonias (UFC) se llevó a cabo en la dilución 10 -3 para las
muestras del protocolo B y en la dilución 10-1 para las muestras del protocolo A.
Preservación de las muestras
Las muestras que correspondían a las diluciones 10-1 y 10-2 fueron
criopreservadas. Para este proceso se adicionó 500 μL de medio enriquecido a las
placas y se frotaron con una aza de vidrio en forma de L. Posteriormente se
tomaron los 500 μL que ya contenían los microorganismos y se mezclaron en un
tubo eppendorf de 1.5 mL con 500 μL de glicerol al 50%; finalmente las muestras
se llevaron a la nevera a una temperatura de -80°C.

25
 2.4.3 VERIFICACIÓN DE LA CAPACIDAD DEGRADADORA DE CIANURO

Para verificar la capacidad degradadora de cianuro de las colonias bacterianas,

se realizó la evaluación de su crecimiento en placas que contenían KCN como
única fuente de carbono y nitrógeno, como se indicó en la etapa de aislamiento y
selección.

2.4.4 CUANTIFICACIÓN DE LA DEGRADACIÓN DE CIANURO

Nota : De esta etapa en adelante se trabajó únicamente con la bacteria aislada en

el protocolo A- medio selectivo (identificada como bacteria #1), puesto que el
consorcio bacteriano del protocolo B se contaminó con hongos.
El medio selectivo empleado en las siguientes etapas es diferente al de la etapa
de selección y aislamiento, y presenta los siguientes componentes: 1 L buffer
fosfato de sodio 25 Mm pH 8, K2SO4 0.17 g/L, Mg SO₄x7H₂O 0.2 g/L, CaCl x
2H2O, 0,01 g/L, FeSO4 x 7H2O 5.0 mg/L, MnSO4 x 7H2O 2,5 mg/L, Na2MoO4 x
2H2O 2,5 mg /L, Co(NO3)2 x6H2O 1.3 mg/L, 10 mL de una solución de sulfato de
zinc 40 ppm y 50 mL de solución de KCN de 1000 ppm.
Optimización de la concentración de cianuro para el crecimiento bacteriano

Para determinar la máxima concentración de cianuro en la cual la bacteria #1

presenta crecimiento, se tomaron 200 μL de muestra (crecimiento previo en
medio selectivo líquido durante 5 días) y se sembraron en placas con medio solido
selectivo a 4 concentraciones de cianuro, 50 ppm, 100ppm, 250ppm y finalmente
500 ppm.
Preparación de muestras para cuantificación de KCN

Se tomó aproximadamente 50 μL de la bacteria #1 criopreservada y se depositó

en un erlenmeyer estériles de 50 ml, con 50 ml de medio enriquecido, se incubó
a 30 °C por 5 días en un shaker con agitación a 180 rpm; trascurrido los 5 días, se
observó un alto crecimiento.
Posterior al periodo de incubación, se tomó por triplicado 5 mL de la muestra y se
inocularon en erlenmeyers estériles de 50 mL, con 50 mL de medio selectivo; las
muestras se taparon con papel parafilm y papel aluminio, para ser llevadas a 30
°C en un shaker con agitación a 180 rpm .Se tomaron 4 controles, de los cuales 3
se ubicaron en el shaker y el otro en una nevera a 2 °C.

26
Curva de calibración

Se preparó 100 mL de una solución patrón de 1000 ppm de KCN no hidratado en

agua destilada y se construyó una curva de calibración con cinco concentraciones
(5, 25, 50, 70 y 150 ppm); se empleó como solución matriz los componentes del
medio selectivo sin la adición del cianuro.
Cuantificación de CN- usando el electrodo ion selectivo

La biodegradación de cianuro por las cepas bacteriana se estudió en un periodo

de 8 días y se dio seguimiento cada dos días empleando un medio cultivo
selectivo. Para ello, se realizaron medidas de pH y de ion cianuro, empleando un
pH- metro y un electrodo ion selectivo respectivamente. En esta etapa se realizó la
lectura de las concentraciones de la curva de calibración partiendo de la más
diluida a la más concentrada y seguido la lectura de las muestras, sumergiendo el
electrodo en la solución; los datos se obtuvieron en milivoltios y se reportaron
cuando se tornaron constantes.
Determinación de la eficiencia de remoción
El porcentaje de eficiencia de remoción se determina así:

Dónde:
Ci: concentración inicial de ion cianuro en ppm (mg/L)
Cf: concentración final de ion cianuro en ppm (mg/L)

2.4.5 IDENTIFICACIÓN MICROBIANA

La cepa de estudio se caracterizó fenotípicamente mediante pruebas

morfológicas y bioquímicas.
Para la caracterización bioquímica se hizo uso del método API 20E, que consiste
en 23 pruebas enfocadas a la identificación de enterobacterias y otros bacilos
Gram negativos; para este proceso la muestra se sembró en agar enriquecido y
se incubo durante 3 días a 30 °C; posteriormente se llevó a cabo la inoculación de
las celdas, que luego fueron llevadas a una incubadora por un periodo de 48 horas
a 35 °C. Se determinó la presencia de las siguientes enzimas: oxidasa, evaluando
la aparición de un color violeta o purpura al exponer la colonia al reactivo de
oxidasa y catalasa, evaluando la aparición de burbujas al adicionar al
microorganismo peróxido de hidrogeno. Simultáneamente se realizó una tinción
de Gram para evaluar si la bacteria objeto de estudio era Gram (-) o Gram (+).

27
El análisis macroscópico se llevó a cabo mediante el uso de un estereoscopio,
donde se definió la forma de la colonia.

28
 2.5 RESULTADOS

Determinación del Crecimiento bacteriano

Dilución inicial de la muestras en los protocolos de crecimiento : Los resultados del

gráfico 1 muestran una diferencia muy marcada entre los diferentes protocolos de
crecimiento; se observa un mayor número de UFC/mL en el protocolo B- medio
enriquecido, seguido del protocolo B-medio selectivo y finalmente protocolo C-
medio selectivo.

120000

100000

80000
UFC/mL

60000

40000

20000

0
Protocolo A Protocolo B Protocolo B
(MS) (ME) (MS)

Gráfica 1. Comparación del numero de UFC/mL en cada protocolo de

crecimiento. ME: medio enriquecido , MS: medio selectivo

Evaluación de la tolerancia a cianuro

Con el objetivo de determinar la concentración óptima de cianuro en la cual se

evidenciara un mayor crecimiento bacteriano, se sometió la bacteria #1 a 4
concentraciones de cianuro. En la gráfica 2 se observa que la máxima
concentración en la cual la bacteria presenta el menor crecimiento corresponde
a 100 ppm de KCN, mientras que a una concentración de 50 ppm se exhibe el
mayor crecimiento; en las concentraciones correspondientes a 250 ppm y 500
ppm no se evidenció crecimiento bacteriano.

29
 7000000

6000000

5000000

UFC/mL
4000000

3000000

2000000

1000000

0
50 100 250 500
KCN (ppm)

Gráfica2. Evaluación del crecimiento bacteriano a 4 concentraciones de KCN

Cuantificación de la degradación de cianuro

Se realizó una curva de calibración con 5 concentraciones conocidas de KCN,

empleando como matriz la solución de sales y el buffer fosfato; La curva de
calibración presentó un coeficiente de correlación de 0.999, lo que indica que
existe una buena linealidad entre los datos.
Con la ecuación de la recta obtenida se determina la concentración de KCN en el
trascurso del tiempo. En el caso de la cuantificación de la degradación de 48.2
ppm de KCN se tiene:

Ecuación 1. ))

Teniendo en cuenta que la concentración donde se tiene un mayor crecimiento

bacteriano corresponde a 50 ppm de KCN, se emplea esta para realizar la etapa
de cuantificación .En la gráfica 3 se observa la variación de la concentración de
cianuro de potasio durante un periodo de 7 días, tanto en la muestra como en los
controles

30
 60

50

40

KCN (ppm) 30 Bacteria #1 30 °C

Control 30 °C
20
Control 2 °C

10

0
0 2 4 6 8
Días análisis

Gráfica 3. Variación de la concentración (48.2 ppm) de cianuro en la muestra

y en los controles, durante 8 días de estudio.

Con el objetivo de determinar el número de UFC/mL al inicio del estudio y en la

culminación del mismo, se determina en medio selectivo la variación de la
población microbiana en la gráfica 4.

300000000

250000000
200000000
UFC/mL

150000000
100000000
50000000
0
1
7

Días de crecimiento

Gráfica 4. Evaluación del crecimiento bacteriano en un periodo de 7 días en

agar selectivo, con una concentración de 50 ppm de KCN.

31
Como en la gráfica 2, se observa que a una concentración de 100 ppm la bacteria
crece, se realiza nuevamente la cuantificación para estimar el porcentaje de
degradación a una concentración de 122 ppm de KCN.

140

120

100
KCN (ppm)

80
Bacteria #1 30 °C
60
Control 30 °C
40 Control 2 °C

20

0
0 5 10 15
Días análisis

Gráfica 5. Variación de la concentración (122 ppm) de cianuro en la muestra

y los controles, en un periodo de 11 días.

140000000
120000000
100000000
UFC/mL

80000000
60000000
40000000
20000000
0
1
11

Días de crecimiento

Grafica 6. Evaluación del crecimiento bacteriano en un periodo de 11 días

en agar selectivo, con una concentración de 50 ppm de KCN.

32
Determinación del porcentaje de remoción

Ecuación 2.

Dónde:
Ci: concentración inicial de ion cianuro en ppm (mg/L)
Cf: concentración final de ion cianuro en ppm (mg/L)

 Para una concentración inicial de 48.2 ppm de KCN

Degradación biológica sin corrección con el control

Control: Evaporación por factores ambientales

Degradación biológica corregida con el control

29.2 %

 Para una concentración inicial de 122 ppm de KCN

Degradación biológica sin corrección con el control

33
 Control: Evaporación por factores ambientales

Degradación biológica corregida con el control

Tabla 2. Resultados de la Cuantificación de la degradación de cianuro

Estudio 1 Estudio 2
48.2 ppm KCN 122.0 ppm
KCN

Disminución de cianuro total por 37.3% 30.4%

degradación biológica y factores
externos (T, pH etc.)

Diminución de cianuro total por factores 8.1% 8.4%

externos (T, pH etc.)

Disminución de cianuro total por 29.2% 22.1%

degradación biológica

34
Identificación bacteriana

Con el objetivo de poder estimar la posible identidad de la bacteria #1, se muestra

a continuación los resultados obtenidos del análisis bioquímico y morfológico que
se realizó.

Tabla 3. Identificación fenotípica de la bacteria #1 aislada en medio selectivo

Prueba Resultado

Tinción de Gram Estreptococo Gram (-)

Catalasa Positivo

Oxidasa Negativo

API20E Escherichia Coli 1

Morfología externa Irregular, ondulado

(forma , borde )

Figura 5. Resultado de la tinción de Figura 6. Morfología externa de la

Gram de la bacteria #1. bacteria #1.

35
Tabla 4. Resultado de la caracterización bioquímica de la bacteria #1 con la
prueba API 20 E.

Prueba Reacción /enzima Resultado/coloración

ONPG Beta-galactosidasa + ( amarillo )

ADH Arginina deshidrolasa + (rojo )

LDC Lisina descarboxilasa + (rojo )

ODC Ornitina descarboxilasa + (rojo- naranja )

CIT Utilización del citrato + (azul oscuro )

H2S Producción de H2S - (no precipitado negro )

URE Ureasa + (rojo-naranja )

TDA Triptófano desaminasa - (amarillo )

IND Producción de indol - (amarillo )

VP Producción de acetoína (Voges-Proskauer) + (rojo)

GEL Gelatinasa - (no difusión de pigmento )

GLU Fermentación /oxidación de glucosa - (Azul)

MAN Fermentación/oxidación de manitol - (Azul)

INO Fermentación/oxidación de inositol - (Azul)

SOR Fermentación/oxidación de sorbitol + ( amarillo )

RHA Fermentación/oxidación de ramnosa + ( amarillo )

SAC Fermentación/oxidación de sacarosa - (Azul)

MEL Fermentación/oxidación de melobiosa + ( amarillo )

AMY Fermentación/oxidación de amigdalina - (Azul)

ARA Fermentación/oxidación de arabinosa + ( amarillo )

OX Citocromo oxidasa - (amarillo)

Positivo (+); Negativo (-)

36
 2.6 DISCUSIÓN

La selección del sitio de muestreo en la mina de oro, garantizó que los

microorganismos aislados estuvieran en presencia del contaminante (cianuro) en
su ambiente natural. Se asume que la presencia de cianuro en el sitio de
recolección de las muestras permitió el crecimiento de colonias bacterianas
capaces de degradarlo. Estas se cultivaron inicialmente en medio enriquecido y
finalmente en presencia de cianuro, lo que favoreció la expresión de las enzimas
involucradas en el metabolismo y el aislamiento de las nuevas colonias
degradadoras de este compuesto.
Los dos protocolos de crecimiento descritos en la metodología, se realizaron con
el objetivo de estimar cómo era el crecimiento bacteriano, al exponer la muestra
del ambiente natural directamente en un medio selectivo sólido y por otra parte,
someterla a una fase de pre-crecimiento en medio líquido enriquecido y selectivo.
La gráfica 1 muestra el resultado del número de UFC/ mL en cada protocolo de
crecimiento; se evidencia un alto crecimiento en el protocolo B-medio enriquecido,
ya que se cuenta con una fuente de sustancias nutritivas normales para el
crecimiento de cualquier tipo de bacteria, y por ende se espera tener colonias que
sean capaces de sobrevivir en un medio con cianuro, aunque no lo degraden; en
el protocolo B- medio selectivo el número de UFC/mL es menor, puesto que se
espera que únicamente las bacterias que tienen la capacidad de degradar el
cianuro puedan crecer en el medio, y finalmente en el protocolo A- medio selectivo
solido se obtuvo el menor número de UFC/mL. Con esto concluimos que, es
necesario exponer las bacterias a un pre- crecimiento en medio líquido para
obtener un mayor número de microorganismos, esta metodología la
recomendamos para estudios de este tipo, donde se desee tener un rango más
amplio de bacterias.
Para continuar con las siguientes fases propuestas (cuantificación e identificación )
se trabajó únicamente con la colonia obtenida en el protocolo A (bacteria #1), por
dos razones : primero, porque el hecho de que la bacteria creciera directamente
en medio selectivo sin una fase de pre-crecimiento en medio rico, fue un buen
indicativo de su capacidad degradadora; segundo, porque los consorcios de
bacterias obtenidos en el protocolo B, se contaminaron con hongos lo cual
dificultaba su uso para posteriores análisis. También en esta etapa, se realizó una
modificación al medio selectivo utilizado en la fase de aislamiento y selección;
dicha modificación consistió en incorporar todos los componentes del medio
enriquecido, con el objetivo de brindar todos los nutrientes para obtener un mayor
crecimiento bacteriano.
La determinación de la concentración óptima de cianuro de potasio, arrojo como
se observa en la gráfica 2, que a una concentración de 50 ppm la bacteria tiene
mayor capacidad de vivir y degradar el cianuro, puesto que se tiene un
crecimiento bacteriano más alto; por otro lado, se observó que la concentración
máxima de cianuro en la cual todavía se evidencia crecimiento bacteriano,

37
corresponde a 100 ppm, mientras que en 250 y 500 ppm no hubo crecimiento.
Este análisis es de gran importancia, puesto que permite establecer las
condiciones en las cuales se debe realizar la etapa de la cuantificación y de esa
manera poder estimar con mayor certeza el poder de degradación de la bacteria.
En este estudio se logró verificar la capacidad degradadora de la bacteria #1, al
evaluar la variación de la concentración de cianuro en un periodo de 7 días (ver
gráfica 3.), partiendo de una concentración inicial de 48.2 ppm de KCN; la cepa #1
removió aproximadamente el 30% del cianuro total en la muestra. Por otra parte,
se quiso analizar el porcentaje de biodegradación a una concentración aproximada
de 100 ppm de KCN, puesto que en la gráfica 2 se observa que allí todavía hay
crecimiento bacteriano; se partió de una concentración inicial de 122.0 ppm y se
llegó a una concentración final de 84.9 ppm de KCN (ver gráfica 5).Con el
resultado anterior se obtuvo una biodegradación equivalente al 22.1% (ver tabla
2.). Al comparar los resultados de ambas cuantificaciones se corrobora que
realmente la concentración óptima en la cual la bacteria tiene un mayor
crecimiento, corresponde a 48.2 ppm de KCN; lo anterior se concluye, puesto que
en los 7 días que duró la cuantificación con la concentración de 48.2 ppm la
degradación fue mucho mayor respecto al otro análisis que se realizó en periodo
de 11 días.
Una aspecto importante para evitar tener datos erróneos de la biodegradación del
cianuro es la evaporación, ya que las sales simples de cianuro (cianuro de sodio y
cianuro de potasio) en agua, suelen evaporarse al formar cianuro de hidrogeno
(HCN); a un valor de pH de 9.3 la mitad del cianuro total existe como HCN y la otra
mitad como ion CN- , por otro lado a pH menores que 8.4 más del 90% existe
como HCN (Domínguez & Cobos, 2008). Se debe tener en cuenta que el cianuro
de hidrogeno (HCN) tiene una presión de vapor relativamente alta, 100 KPa a 26
°C, por lo cual se volatiliza con rapidez en superficies liquidas a condiciones
ambientales, causando una disminución de la concentración del ion cianuro en la
solución. La velocidad de volatilización depende entonces de la concentración de
HCN, en función de la concentración de cianuro total, del pH, del área superficial,
de la profundidad de la solución, y la temperatura (Domínguez & Cobos, 2008).
Por lo anterior, en este estudio se empleó un buffer fosfato a pH 8 para evitar en
gran medida la conversión del cianuro total en cianuro de hidrógeno.
Teniendo en cuenta que el fenómeno de la evaporación depende en cierta
medida de la temperatura, se realizaron dos controles que fueron sometidos 30 °C
y 2 °C, para evaluar la influencia de esta variable en la tasa de evaporación; en
las gráficas 3 y 5 se observa que en los dos estudios a 122 ppm y 48.2 ppm de
KCN, no existen diferencias significativas entre los controles y la muestra. Esto
indica que en este caso la evaporación no juega un papel en la eliminación de
cianuro, por el contrario la disminución de la concentración de cianuro se debe
únicamente a la capacidad degradadora de la bacteria. Por otro lado, también se
puede atribuir a la disminución del cianuro de potasio en los controles, errores

38
sistemáticos de tipo instrumental y personal; tales como mal calibración del
electrodo y una mala lectura de los datos arrojados por el equipo.
Aunque la cepa logró degradar un buen porcentaje del cianuro total en la muestra,
este valor no logra ser mayor al 50%; lo anterior se pude deber a que como se
desconocía la identidad de la bacteria, posiblemente no se suministró los
requerimientos nutricionales correctos para garantizar un mayor crecimiento
bacteriano y obtener un alto porcentaje de degradación. Por otra parte, también
se puede considerar el hecho de que la bacteria solo pueda degradar ese
porcentaje de cianuro, pero aun así puede tolerar el resto sin afectar su
supervivencia.
Teniendo en cuenta que la bacteria #1 presenta la capacidad de degradar el
cianuro, es decir que posiblemente lo puede emplear como fuente de carbono,
nitrógeno y energía, o únicamente utilizar una de ellas, puesto que se desconoce a
ciencias ciertas este panorama, se espera que a mayor tiempo de exposición en
el medio selectivo aumente el número de unidades formadoras de colonia (UFC) y
que a la vez aumente la degradación del cianuro. En las gráficas 4 y 6 se logra
corroborar esta hipótesis y se observa que finalizado el proceso de análisis el
número de UFC a aumento más del 50% en las dos cuantificaciones.
Uno de los objetivos del proyecto estaba orientado a realizar la identificación de
las posibles bacterias encontradas en la mina de oro y que a su vez evidenciaran
su capacidad degradadora de cianuro; cabe mencionar que debido a que durante
la fase experimental hubo retrasos en cuanto al cumplimiento del segundo objetivo
del proyecto, no se tubo a tiempo los resultados de la degradación, los cuales eran
decisivos para determinar qué tan conveniente era realizar la inversión para enviar
al extranjero la muestra, y de ese modo tener una identificación a nivel molecular.
Por otra parte la regulación colombiana (Decisión N° 391 de la comunidad Andina)
que establece el Régimen Común sobre Acceso a los Recursos Genéticos,
plantea que para sacar muestras biológicas del país, se debe realizar una solicitud
donde se incluya toda la información relevante del proyecto de investigación y
otras disposiciones; el proceso de análisis de la solicitud tiene un periodo total de
45 días hábiles, por lo tanto el tiempo estimado para terminar el proyecto no era
suficiente para esperar la respuesta de la solicitud y en el caso de que fuera
positiva enviar la muestra a identificar.
El poder tener certeza de la identidad de la cepa bacteriana con la que se está
realizando un estudio determinado, es de gran importancia, puesto que permite
tener una base de conocimiento, para optimizar las condiciones de crecimiento a
nivel de laboratorio a través de la caracterización bioquímica que se expone en la
literatura. La identificación de la bacteriana #1 se llevó a cabo fenotípicamente
mediante pruebas morfológicas y bioquímicas. Se aisló una cepa bacteriana
Gram negativa, que se identificó fenotípicamente como del género Estreptococo,
mediante la prueba de tinción de Gram (ver tabla 3 y figura 5); por otra parte la
prueba API20E utilizada para identificar entero bacterias- oxidasas negativas,

39
arrojo que la bacteria aislada correspondía a la especie Escherichia Coli, lo cual
se contradice con el resultado de la tinción de Gram, puesto que esta última
corresponde fenotípicamente a un bacilo. Este resultado no tiene mucha
relevancia ni ofrece un buena probabilidad de la identidad de la cepa bacteriana,
por el contrario lo que indica es el perfil bioquímico de la bacteria (ver tabla 4). La
caracterización de la morfología externa de la bacteria indica que presenta una
forma irregular y un borde ondulado (ver figura 6).
Teniendo en cuenta que hoy en día, ya se han descrito varias rutas de
degradación de cianuro, sería un aspecto muy importante en futuros estudios
poder determinar cuál es la ruta bioquímica que la bacteria #1 emplea para
degradar el cianuro; a pesar de que el porcentaje de degradación no fue muy alto,
los resultados indican que realmente se encontró una cepa bacteriana con
capacidad biodegradadora de cianuro. Dada la importancia del cianuro en la
extracción de metales preciosos como lo es oro y el impacto que genera en el
medio ambiente, es necesario que se sigan estableciendo estrategias de
biorremediación a través de estudios en laboratorios con microorganismos tales
como las bacterias y que se evalúe que tan factible puede ser aplicar dicha técnica
en condiciones de campo, garantizando que esta sea respetuosa con el entorno
natural en el que tiene que desarrollarse.

40
 2.7 CONCLUSIONES

1. Dada la importancia del cianuro en la extracción de metales preciosos como

lo es oro, se deben establecer en lo posible estrategias de biorremediación
para minimizar el efecto que hoy en día su uso ha generado en el medio
ambiente.

2. Mediante estudios en el laboratorio se aisló una cepa bacteriana Gram

negativa, que se identificó fenotípicamente como del género Estreptococo;
se determinó que la cepa bacteriana removió aproximadamente el 30% del
cianuro total presente en la muestra; lo anterior da buenos indicios de su
capacidad biodegradadora y de su posible utilización en técnicas de
biorremediación.

3. El trabajo en un laboratorio de investigación se torna tedioso, en la medida

que se trabaja con microorganismos de identidad desconocida, pues esto
hace difícil optimizar las condiciones de crecimiento en los medios de
cultivos selectivos que se emplean; por ende es necesario partir de un
conocimiento previo.

41
 2.8 RECOMENDACIONES

Se recomienda para futuros estudios con la cepa bacteriana aislada, realizar

como objetivo principal la identificación, para poder optimizar las condiciones
de crecimiento y lograr tener mejores resultados. Por otro lado, es importante
que durante el estudio se pueda brindar a la bacteria las condiciones del
ambiente natural (temperatura, pH, humedad, luz, etc.) de donde se ha
extraído, para garantizar la supervivencia del microorganismo y de eso modo
que los resultados obtenidos estén más orientados hacia condiciones reales
áreas contaminadas.

También se recomienda aprovechar la biodiversidad encontrada en la mina

de oro para futuras investigaciones.

42
 3.11 BIBLIOGRAFIA

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lideres-que-se-oponen-a-la-mineria-ilegal-en-el-norte-del-cauca.html

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4

45
 ANEXOS

Anexo 1. Resultado de la caracterización bioquímica de la bacteria #1 con la

prueba API 20 E.

Anexo 2 .Curva de calibración con 5 concentraciones de KCN, para determinar la

degradación biológica de 48.2 ppm de cianuro de potasio.

-50 y = -58,056x - 126,81

R² = 0,999
-100
KCN(mv)

-150

-200

-250

-300
0 0,5 1 1,5 2 2,5
Log ppm de KCN

46
Anexo 2. Curva de calibración con 5 concentraciones de KCN, para determinar la
degradación biológica de 122 ppm de cianuro de potasio.

-50
y = -52,653x - 131,68
-100 R² = 0,9963
KCN (mv)

-150

-200

-250

-300
0 0,5 1 1,5 2 2,5
Log ppm KCN

47