Manual-Procedimientos-Tecnicos (1) para El Dengue
Manual-Procedimientos-Tecnicos (1) para El Dengue
Manual-Procedimientos-Tecnicos (1) para El Dengue
Oficina Regional de la
Organización Mundial de la Salud
Colaboradores:
INTRODUCCION 3
BIOSEGURIDAD EN EL LABORATORIO 4
ELISA DE INHIBICION 17
HEMAGLUTINACION E INHIBICION DE LA 21
HEMAGLUTINACION
Referencias bibliográficas 71
2
INTRODUCCIÓN
Esta situación que cada vez se hace mas crítica si se tiene en cuenta, que en
10 años han circulado los 4 serotipos del virus del Dengue en la región y los
índices de infestación se han mantenido en altos niveles y hasta se han
incrementado en varios lugares.
Esta guía de diagnostico, elaborada conjuntamente por los países del área y
coordinada por el laboratorio de Virología del Centro Nacional de Diagnostico y
Referencia del Ministerio de Salud de Nicaragua, tiene como principal objetivo
estandarizar el diagnostico de laboratorio de Dengue, para que todos utilicemos
metodologías similares y tengamos un manual que nos oriente al momento de
realizar una técnica especifica.
3
BIOSEGURIDAD EN EL LABORATORIO
4
- El personal de laboratorio debe estar vacunado (de existir la vacuna) contra los
agentes que se trabajan.
- Reportar derrames o accidentes. A las personas expuesta se le debe dar un
seguimiento y tratamiento preventivo si es necesario y este está disponible.
- Debe existir un manual de practicas de seguridad en cada laboratorio, las
personas deben ser adiestrada de acuerdo a este manual.
- Las puertas del laboratorio deben estar cerradas.
- Deben haber señales indicando el potencial peligro de contaminación a la
entrada del laboratorio y la indicación del acceso restringido.
- El estado de salud debe chequearse periódicamente.
NIVELES DE BIOSEGURIDAD
Nivel 1.
Nivel 2
Nivel 3
5
El laboratorio debe estar separado del resto del edificio, lejos del trafico normal.
La entrada debe constar de 2 puertas porque se necesita un ambiente cerrado
protegido por una zona de acceso, entradas y salidas selladas. El acceso es
totalmente controlado. En cada laboratorio debe haber un lavatorio para operar
con el codo o pie y este debe estar colocado cerca de una puerta, las ventanas
deben estar selladas y las puertas que dan acceso al laboratorio deben tener
sistema de autocierre.
Debe haber un flujo de aire unidireccional y el aire que pasa por el laboratorio
debe ser eliminado hacia el exterior y no recircularlo por el resto del edificio. Es
necesario utilizar ropa especial para entra a la zona de trabajo y se prohibe
usarla fuera del laboratorio. Todo el trabajo obligatoriamente debe hacerse
dentro de las cabinas de flujo de aire laminar tipo 1 y 2. Además de los
procedimientos de los niveles 1 y 2, las puertas deben estar cerradas todo el
tiempo mientras se realiza el trabajo y las autoclaves deben estar dentro del
laboratorio. En este nivel la vacunación es obligatoria y sin ella se les niega la
entrada a aquellas personas que no están vacunadas.
Nivel 4
6
ELISA DE CAPTURA DE IGM
PRINCIPIO DE LA TECNICA
Las tiras serán sensibilizadas con una Inmunoglobulina de carnero anti IgM
humana, la cual reaccionara con los anticuerpos de clase IgM presentes en la
muestra del paciente. Al adicionar el antígeno del virus del Dengue (VD) este
reaccionara con las Inmunoglobulinas M capturadas previamente si estas son
específicas para el VD. Posteriormente se adiciona el conjugado, formado por
inmuglobulinas anti VD acopladas a la enzima peroxidasa del rábano. Si las
reacciones previas han sido específicas el conjugado reaccionará con el antígeno
del VD. Cuando se adiciona el substrato este es degradado por la enzima
peroxidasa traduciéndose en un cambio de color en la reacción en las muestras
positivas.
APLICACIÓN:
REACTIVOS:
§ Pipeta automática de 1- 10 ul
§ Pipeta automática de 5 - 50 ul
§ Pipeta automática de 50 - 200 ul
§ Pipetas automática de 1 a 5 ml
7
§ Pipeta multicanal de 50 - 200 ul
§ Tubos de ensayo de vidrio de 13 x 100 mm.
§ Tubos centrífuga 1.5 ml
§ Gradillas
§ Reloj marcador
§ Incubadora a 37°C
§ Lector para placas microelisa
§ Lavador de placas para ELISA
§ Marcadores de Punta fina y punta gruesa
§ Probetas de 100 ml
§ Beakers de 1000 ml
§ Puntas de 1 a 200 ul
§ Puntas de 200 a 1000 ul
PREPARACION DE REACTIVOS:
8
Obtener sueros de personas que nunca hayan padecido de Dengue adicionarles
cloroformo que quede a una dilución final de 10%. Centrifugar durante 10 minutos
a 2000 rpm. Extraer el sobrenadante, el cual se utiliza como SHN.
PROCEDIMIENTO
1- Las tiras de poliestireno son sensibilizadas con anti IgM humana producidas en
carnero a una concentración proteica de 7.5 ug/ml. Se adicionan 100 ul/pozo.
10- Adicionar el conjugado diluido en PBS-T mas 2.5% de SHN, a una concentración
acorde con el título del lote. 50 ul/pozo.
9
12- Lavar 5 veces con PBS-T
18- Validez del procedimiento: Para que la técnica sea considerada válida, se deben
cumplir los siguientes criterios:
a. El valor de la absorbancia del control positivo bajo debe ser mayor que el
valor de corte.
b. El valor de la absorbancia del control positivo alto debe ser 5 veces o más
superior al valor de absorbancia promedio de los controles negativos.
c. El valor de corte es igual a la media de los valores de absorbancias de los
controles negativos multiplicado por 2.
d. Las muestras con valores de absorbancia igual o mayor al valor de corte
serán considerada positivas.
PROCEDIMIENTO
2. Sensibilizar placa.
10
b. Incubar 4 horas a temperatura ambiente ó a 4°C, hasta el momento
de usarlo (guardar en cámara húmeda). Pueden guardarse por 2 ó 3
semanas.
3. Lavado de Placa.
4. Bloqueo.
5. Muestras.
7. Conjugado.
8. Substrato.
- Mezclar 1:1
11
10. Con este substrato el color es azul-verdoso.
Se prepara una dilución 1:25 con agua destilada y queda lista para utilizarla
en las diluciones de las muestras (preparar según necesidad).
2 ml al Vial de Ag X _________ 3 ml
= 15 µl SHN
para 3 ml
S.Lavado
12
Se prepara una solución de lavado al 5% con SHN.
X __________ 5 ml
TECNICA DE ANALISIS
5. Lavar la placa 5 veces con solución de lavado y secar sobre papel toalla.
7. Lavar la placa 5 veces con solución de lavado y secar sobre papel toalla.
8. Dispensar 50µl por pozo del conjugado diluido, incubar 1 hora a 37°C en
cámara húmeda.
9. Lavar la placa 7 veces con solución de lavado y secar sobre papel toalla.
11. Dispensar 100µl en cada pozo e incubar 30 minutos, pasado este tiempo
detener la reacción adicionando 100µl de Acido Sulfúrico al 12.5% en el
mismo sentido en que se añadió el substrato.
12. Leer la microplaca y medir la D.O. a 492 nm ajustar el blanco contra aire.
13
CALCULO DE RESULTADOS.
CONTROL DE CALIDAD
14
Determinación de IgG
( Elisa de Captura. CDC. Atlanta. USA)
PROCEDIMIENTO.
Diluyente estándar:
PBS 7.2 ---------------------100 ml
Tween 20-------------------- 0.05 ml
Suero de cabro 3% ------ 3 ml
6. Lavar 3 veces.
13. Con pipeta multicanal de 25 µl diluir desde la primera fila hasta la ultima
fila
15
ESQUEMA SEROLOGICO
TITULO 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
40 Am m m m m m m m m m m m
160 Bm m m m m m m m m m m m
640 Cm m m m m m m m m m m m
2560 Dm m m m m m m m m m m m
10,240 Em m m m m m m m m m m m
40,960 Fm m m m m m m m m m m m
163,840 Gm m m m m m m m m m m m
655,360 Hm m m m m m m m m m m m
1/100 = 1 ul mas 99 ul
1/ 200 =1-------200
x-------3 ml que se necesitan =
15 ul de dilución 1:100 mas 3 ml de
diluyente.
Notas.
Se debe incluir un control positivo bajo con un punto final de 4 o’ 5
diluciones, y un control positivo alto que tenga un punto final de 7 0’ 8
diluciones. , un control negativo que se pone en la primera fila que se usa
para blanquear todo el plato
Interpretación.
Densidades ópticas > 0.15 son consideradas como positivas, el punto final de
cada suero es la más alta dilución que de una reacción positiva
16
ELISA DE INHIBICION ( Realizado en CNDR- MINSA. Estndarizado en IPK.
Cuba)
PRINCIPIO DE LA TECNICA
REACTIVOS:
§ Pipeta automática de 1- 10 ul
§ Pipeta automática de 5 - 50 ul
§ Pipeta automática de 50 - 200 ul
§ Pipetas automática de 1 a 5 ml.
§ Pipeta multicanal de 50 - 200 ul
§ Tubos de ensayo de vidrio de 13 x 100 mm.
§ Tubos centrífuga 1.5 ml
§ Gradillas
§ Reloj marcador
§ Incubadora a 37°C
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§ Lector para placas microelisa
§ Marcadores de Punta fina y punta gruesa
§ Probetas de 100 ml
§ Beakers de 1000 ml
§ Puntas de 1 a 200 ul
§ Puntas de 200 a 1000 ul
PREPARACION DE REACTIVOS:
1. PBS pH 7.4
PROCEDIMIENTO
18
9. Adicionar las muestras diluidas desde 1/20 hasta 1/20480 en PBS-T
mas 0.5% de BSA. 100 ul/pozo. Adicionar el control negativo diluido
1/20 en 4 pozos y el control positivo diluido 1/5120 en 4 pozos.
10. Incubar a 37º C durante 1 hora.
11. Lavar 3 veces con PBS-T
12. Adicionar 100 ul/pozo del conjugado diluido en PBS-T mas 2.5% de
SHN, según título.
13. Incubar a 37º C durante 1 hora.
14. Lavar 4 veces con PBS-T
15. Adicionar 50 ul/pozo de TMB.
16. Incubar 15 minutos a temperatura ambiente.
17. Detener la reacción con 100ul de ácido sulfúrico 2N
18. Leer un lector de ELISA a una longitud de onda 450/630 nm.
19. Calcular la media de los valores de absorbancia de los controles
negativos (MCN).
20. Calcular el valor de corte: MCN X 0.5.
21. Validez de la técnica:
a. La MCN debe ser igual o mayor a 0.8
b. El control positivo debe presentar valores de absorbancia inferior al valor
de corte.
INTERPRETACIÓN DE LOS RESULTADOS
19
CONTROL DE CALIDAD DE LA TECNICA
20
HEMAGLUTINACION E INHIBICION DE LA HEMAGLUTINACION (Método de
Clark y. Casals, Tomado del manual de procedimientos del IPK. Cuba)
PRINCIPIO DE LA TECNICA
REACTIVOS
- Solución de Alsever
- Glóbulos rojos de gansos adultos machos y de color blanco. Los gansos
serán sangrados cada 6 semanas. Las hembras no se utilizan ya que los
cambios en el ciclo hormonal pueden variar los títulos hemaglutinantes. La
experiencia del CNDR con gansos grises no ha sido satisfactoria.
- Cloruro de Sodio 1.5 M
- Fosfato dibásico de sodio (Na2HPO4. 12 H2O) 0.5M
- Fosfato monobásico de sodio (Na2PO4. 2H2O) 1M
- Acido Bórico 0.5 M
- Solución Borato Salina pH9
- BSA al 4% en buffer Borato Salina (BABS), pH 9.
- Kaolín (lavado en ácido) al 25% en buffer borato salina.
- Antígenos (preparados por el método sacarosa acetona y comprados al
IPK)
EQUIPOS y MATERIALES
- Centrífuga refrigerada
- Placas de Poliestireno de fondo en U
- Pipeta automática de 1- 10 u
- Pipeta automática de 5 - 50 ul
- Pipeta automática de 50 - 200 ul
- Pipetas automática de 1 a 5ml.
- Pipeta multicanal de 50 - 200 ul
- Pipetas Serológicas de 1, 5 y 10 ml
- Pipet Aid
- Tubos de ensayo de vidrio de 13 x 100 mm.
- Tubos centrífuga 1.5 ml
- Gradillas
- Reloj marcador
- Incubadora a 37°C
- Lector para placas microelisa
- Marcadores de Punta fina y punta gruesa
- Probetas de 100 ml
- Beakers de 1000 ml
21
- Puntas de 1 a 200 ul
- Puntas de 200 a 1000 ul
PREPARACION DE REACTIVOS
- Solución de Alsever
NaCL................................................... 4.2 g
- Soluciones stocks
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Tabla de valores de pH ( diluentes de ajustes para los diferentes de pH con los
que se diluyen los glóbulos de ganso).
PH SOLUCIÓN A SOLUCIÓN B
5.75 3.95 ml 97 ml
6.0 12.5 ml 87.5 ml
6.2 22 ml 78 ml
6.4 32 ml 68 ml
6.6 45 ml 55 ml
6.8 55 ml 45 ml
7.0 64 ml 36 ml
7.2 72 ml 28 ml
7.4 79 ml 21 ml
23
veces en buffer borato salina pH 9. Una vez preparada debe utilizarse en una
semana y guardarse a 4º C.
PROCEDIMIENTO
Hemaglutinación
24
5. Hacer diluciones seriadas al doble.
6. Agitar la placa
7. Adicionar 0.025 de glóbulos rojos al 0.5% preparados en cada uno de los
diferentes pH.
8. Agitar y mantener en reposo la placa durante 30-40 minutos a temperatura
ambiente.
9. Determinar el título hemaglutinante de cada pH. El pH óptimo es aquel que
presente mayor título hemaglutinante. Para la IHA se utiliza una dilución del
antígeno que contenga de 4 a 8 unidades hemaglutinante
Patrón de Hemaglutinación:
INHIBICION DE LA HEMAGLUTINACION
Un paciente que presente títulos de anticuerpos por IHA igual o mayor que 1280
se considera un caso probable de Dengue.
25
Un caso de Dengue con una muestra tomada en período convaleciente (7 o mas
días después de iniciado los síntomas) y con un título igual o mayor a 2560 se
considera como un caso secundario de Dengue.
CONTROL DE CALIDAD
26
TITULACION DEL VIRUS DEL DENGUE Y NEUTRALIZACION POR
REDUCCION DE PLACAS ( Morens et al. Tomado del Manual de
Procedimientos del IPK. Cuba)
Medios y Soluciones
6. Medio Overlay
STF 10 ML
Lglutamina 1 ml
2x MEM (MBA) sin Rojo Fenol 100 ml
Carboximetil celulosa 3% estéril 50 ml
Antibióticos 0.2 ml
27
Nafthol Blue Black 1G
Acetato de Sodio 13.6 g
Acido acético glacial 60 ml
H2O a completar 1000 ml
Materiales y Equipos
28
Congelación de las células BHK21
2
1. De un frasco de 150 cm con monocapa casi confluente (3 – 4 días)
desprender las células como se describió anteriormente
2. Colocar la suspensión celular en tubos de centrífuga y centrifugar 3 – 5
minutos a temperatura ambiente a 1000 rpm.
3. Decantar el sobrenadante y resuspender las células en 5 ml de medio MEM
+ glutamina + aminoácidos no esenciales +1 ml de STF. Colocar en un
frasco rotulado con el # 1 que previamente debió estar en baño de hielo.
4. Preparar otro frasco que contenga 4 ml del mismo medio ( sin STF) pero
añadiendo 1 ml de dimetilsulfoxido. Colocarlo sobre el baño de hielo .
Rotular con el # 2. Comprobar que ambos frascos tienen bien mezcladas
sus soluciones.
5. Con una pipeta de 5 ml tomar medio del frasco # 2 y añadir lentamente,
gota a gota y agitando, el contenido del frasco # 2 en el # 1. Siempre en
baño de hielo.
6. Distribuir 1 ml de la suspensión (aproximadamente 1 x 10 células / ml) por
ámpulas ( siempre en frío). Dejar 0.1 ml para la prueba de esterilidad.
7. Guardar durante 1 hora a – 20º C.
8. Colocar las ámpulas en una caja de poliespuma y guardar a – 70º C por
24h. Pasarlas después a nitrógeno líquido.
29
11. Añadir 0.5 ml de medio con CMC. El medio debe tener un pH de 8 – 8.5
para D1,3 y 4. Para D2 puede encontrarse entre 7 – 8.5.
12. Incubar a 37º C por 8 días para D4, 5 días para D2 y 9 días para D1 y D3,
en incubadora de CO2 al 5%.
13. Descartar el medio. Lavar suavemente con agua corriente. Teñir las células
con NBB (0.5ml por pozuelo). Después de 30 minutos lavar con agua de
nuevo. Las placas pueden ser contadas inmediatamente o cuando se
sequen.
Lectura de placas
30
x
P x 20 x 10 = ufp/ml
Donde :
P: es el promedio del número de placas obtenido en la dilución en que se
contaron las placas.
Ejemplo:
NO DE PLACAS PROMEDIO
Virus control 20 20 20 20
Virus + suero 6 4 5 5
31
dilución de suero utilizada, lo cual indicaría si el suero tiene o no
anticuerpos( % de reducción) Cuando este % de reducción es >=50 se
considera que el suero es positivo (presencia de Acs)
2. El suero se prueba en varias diluciones frente a una concentración
constante de virus, esto nos permite conocer el título de anticuerpos del
suero. Para cada dilución de suero se halla el % de reducción del número
de placas. Estos datos se llevan a un papel semilogarítmico, para hallar la
dilución que reduce en 50% el número de placas, la cual representa el título
del suero. Este método también es utilizada para identificar virus, pues se
pone un virus aislado a una concentración constante previamente definida
frente a diluciones de un suero hiperinmune conocido.
32
AISLAMIENTO E IDENTIFICACION VIRAL ( Tomado del Manual de
Procedimiento del IPK. Cuba y Método que se realiza en CNDR- MINSA.
Nicaragua)
1. EQUIPOS
a. Incubadoras de 28º C
b. Flujo Laminar
c. Pipet aids
2. MATERIALES
3. REACTIVOS
a. Medio MEM con Suero Bovino Fetal (SBF)al 10% o medio L15 con SBF al
10%. ( Medio de crecimiento).
b. Alcohol al 70%
c. Cloro al 10%
4. PROCEDIMIENTO
- Pipetas estériles
- Pipet aids
- Mechero
- Beaker con cloro diluido al 10%
2
- Frascos de cultivo de células de 25 cm
- Marcador permanente
- Policías de hule estériles
33
8. Añadir 1 ml de las células desprendidas a los frascos nuevos.
9. Incubar los frascos en una incubadora de 28º C.
III. DESCONGELACION
1. EQUIPOS
- Incubadora de 28º C.
- Gabinete de seguridad
- Mechero
- Pipet aids
- Pipetas automáticas de 20 a 200 ul
2. MATERIALES
2
- Frascos de 25 cm con monocapa celular confluente.
- Pipetas serológicas estériles de 1 ml, 5 ml, 10 ml, 25 ml.
- Marcador permanente
- Tubos de microcentrífugas de 1.5 ml estériles
34
- Toallas de papel
- Guantes
- Hielera
3. REACTIVOS
4. PROCEDIMIENTO
- Medio de mantenimiento
2
- Frasco de 25 cm con monocapa celular confluente
- Tubos de microcentrífuga 1.5 ml
- Pipetas estériles
- Pipet aids
- Mechero
- Beaker con cloro diluido al 10%
- Marcador permanente
- Toallas de papel
2
d. Rotular los frascos de 25 cm con el código de la muestra a inocular
e. Diluir 20 ul del suero a inocular en 180 ml de medio de mantenimiento
f. Descartar el medio del frasco de cultivo en el beaker con cloro al 10%.
g. Agregar lentamente los 200 ul del inóculo sobre la superficie de la
monocapa celular
h. Incubar el frasco inoculado a 28º C durante 1 hora.
i. Adicionar 5 ml de medio de mantenimiento
j. Incubar a 28º C durante 7 días. Revisar diariamente los frascos.
Nota: Algunos sueros pueden dar efecto tóxico, causando desprendimiento celular
a las 24 horas de inoculados, en estos casos se toma 1 ml de medio del frasco y
se inocula en un frasco nuevo.
35
V. IDENTIFICACION VIRAL POR INMUNOFLUORESCENCIA INDIRECTA (IFI)
1. EQUIPOS
- Gabinete de seguridad
- Microcentrífuga
- Pipetas automáticas 20 a 1000 ul
- Incubadora de 37º C
- Congelador de –20º C o –70º C.
2. MATERIALES
3. REACTIVOS
- PBS
- Acetona a 20º C
- Polilisina diluida al 0.005% en agua bidestilada (opcional)
36
- Después de la ultima centrifugación, eliminar el sobrenadante y
resuspender las células en 1 ml de PBS.
- Adicionar 12 a 15 ul de la suspensión celular a cada pozo de la lámina de
fluorescencia.
- Secar a temperatura ambiente
- Poner las láminas en un vaso koplin y adicionar acetona fría (-20º C).
- Dejar con acetona durante 15 minutos
- Eliminar la acetona
- Conservar las láminas a -20º C o –70º C hasta su uso
A. IFI
37
4. Descartar el sobrenadante en Beaker con cloro
8. Secar
14. Dejar secar y agregar 1 gota de Glycerol -/PBS en cada pozo y cubrir con
laminilla cuidando que no quede con exceso de Glycerol.
Interpretación.
40 % células Fluorece------------Positivo +
38
REVERSO TRANSCRIPCION - REACCION EN CADENA DE LA
POLIMERASA ( RT – PCR)
El PCR es un método "in vitro" que usa la síntesis enzimática para replicar
selectivamente una región diana dentro de un DNA de doble cadena, de forma
similar la amplificación de RNA puede ser hecha proporcionando una copia de DNA
complementario (DNAc) que haya sido previamente sintetizada por reverso
transcriptasa.
39
polimerasa DNA que lleva a cabo la síntesis de nuevo DNA de un cebador hacia el
otro en la dirección de 5' a 3'. Este proceso se lleva a cabo a una temperatura de
72oC por un tiempo de 2 minutos.
En este protocolo los procesos de transcripción reversa del ARN del virus de dengue
y amplificación del ADN complementario resultante son combinados y llevado a
cabo en un tubo. El uso de un primer 5’complementario a una secuencia conservada
en los 4 serotipos del virus dengue en combinación con 4 primers 3’, que hibridizan
a secuencias específicas en el genoma de cada uno de los serotipos, permite la
detección simultanea de los 4 serotipos. Los sitios de los primers están designados
para generar productos de diferentes tamaño para cada serotipo, lo cual permite
distinguirlo fácilmente por medio de electroforesis en gel de agarosa. De esta
manera la detección del virus dengue y la identificación del serotipo puede realizarse
en un solo tubo, comenzando con el ARN viral.
40
RT- PCR. Cápside ( Harris et al) ( Realizado en CNDR-MINSA de Nicaragua)
CUARTO GRIS
A. EQUIPOS
- Microcentrífuga
- Calentador o microonda
- Pipetas ajustables 20 ul, 200ul, 1000ul
B. MATERIALES
- Tubos de 1.5 ml
- Puntas de 1 a 200 ul
- Puntas de 200 a 1000 ul
- Tubos plásticos de 15 ml
- Beaker con cloro diluido para desechos
- Marcador permanente
- Cinta de color
- Gradillas para tubos de microcentrifugas
- Guantes.
C. REACTIVOS
- Cloro
- Buffer de lisis*
- Acetato de Sodio 2M pH 4.0
- Fenol equilibrado con agua
- Cloroformo
- Isopropanol
- Etanol al 75% ( preparado con agua bidestilada libre de ARNasa)
- Agua bidestilada estéril, libre de ARNasa ( comercial o tratada con DEPC).
*Buffer de lisis
Isotiocianato de Guanidinium 6 M
Citrato de Na 50 mM
Sarkorsyl 1%
T ARN 20 ug/ml (glucógeno 20 ug/ml)
B- mercaptoetanol 100 mM ( agregue inmediatamente antes de usar el buffer)
PROCEDIMIENTO
41
DESPUÉS DE MANIPULAR CADA MUESTRA, LIMPIAR LA BARRA DE LA PUNTA
DE LA PIPETA CON UNA TOALLA DE PAPEL CON CLORO Y SECARLA CON
OTRA TOALLA DE PAPEL LIMPIO.
13. Dejar secar el sedimento al aire en una posición horizontal por 10 minutos.
42
PREPARACION DE LA MEZCLA PARA RT-PCR DE LA CAPSIDE.
CUARTO BLANCO
EQUIPOS
- Termociclador
- Microcentrífuga
- Pipetas ajustables 20 ul, 200ul, 1000ul.
MATERIALES
REACTIVOS
D1: 5’- TCA ATA TGC TGA AAC GCG CGA GAA ACC G
TS1: 5’- CGT CTC AGT TGA TCC GGC GG
TS2: 5’- CGC CAC AAG GGC CAT GAA CAG
TS3: 5’- TAA CAT CAT CAT GAG ACA GAG C
DEN 4: 5’-TGT TGT CTT AAA CAA GAG AGG TC
KCl 500 mM
Tris- HCl 100 mM pH 8.5
43
Gelatina 0.1%
PROCEDIMIENTO
VOL.MIX 20ul
MUESTRA 5ul
TOTAL 25ul
44
Nota : Mantener siempre los ingredientes y tubos sobre hielo
4. Descongelar las alícuotas de cada reactivo. Mezclar bien cada solución con
vortex (Mantener siempre los ingredientes y tubos sobre hielo).
AMPLIFICACION DE LA MUESTRA
CUARTO NEGRO
EQUIPOS
- Termociclador
- Microcentrífuga
PROGRAMA DE AMPLIFICACION:
45
ANALISIS DEL PRODUCTO
CUARTO NEGRO
EQUIPOS
- Microcentrífuga
- Balanza
- Balanza analítica
- Microonda
- Fuente de poder
- Transiluminador de LUV
- Cámara polaroid con filtro naranja y campana
- Vortex
- Pipetas ajustables 20 ul, 200 ul.
MATERIALES
REACTIVOS
46
PROCEDIMIENTO
10 ul del producto
2 ul de colorante
12. Correr el gel aproximadamente 100 voltio hasta que el azul de bromofenol
haya migrado aproximadamente 70 a 80% a lo largo del gel.
47
RT- PCR. NS3 (Seah et al ) ( Método que se realiza en CNDR-MINSA de
Nicaragua)
CUARTO BLANCO
EQUIPO
- Termociclador
- Microcentrífuga
- Pipetas ajustables 20 ul, 200ul, 1000ul.
MATERIALES
REACTIVOS
48
REACTIVO CONCENTRACI VOLUMEN CON.FINAL
ON
10X Buffer 10x 2.5ul 1x
DNTPs 20mM 1ul 0.8mM
DV1 10uM 2 ul 0.8uM
DSP1 10uM 1.25ul 0.5uM
DSP2 10uM 1.25ul 0.5uM
DSP3 10uM 1.25ul 0.5uM
DSP4 10uM 1.25ul 0.5uM
DTT 100mM 1.25ul 5mM
TMAC 1M 0.75ul 0.03M
BETAINE 4M 3.125ul 0.5M
MgCl 25mM 1.6ul 1.6mM
RAV-2 1U/ul 0.125ul 0.005U/ul
Amplitaq 5U/ul 0.125ul 0.025U/ul
Agua Sigma 1.5ul
VOL.MIX 20ul
MUESTRA 5ul
TOTAL 25ul
KCl 500 mM
Tris- HCl 100 mM pH 8.5
Gelatina 0.1%
PROCEDIMIENTO
49
4. Descongelar las alícuotas de cada reactivo. Mezclar bien cada solución con vortex
(Mantener siempre los ingredientes y tubos sobre hielo).
5. En el cuarto blanco utilizando pipetas de ese cuarto, preparar la mezcla de PCR con
todos los ingredientes excepto las enzimas (Taq polimerasa y la reverso
transcriptasa rav-2).
10. Agregar 5 ul de agua bidestilada al primer tubo para preparar el control negativo del
cuarto blanco.
AMPLIFICACION DE LA MUESTRA
CUARTO NEGRO
EQUIPOS
- Termociclador
- Microcentrífuga
PROGRAMA DE AMPLIFICACION:
50
ANALISIS DEL PRODUCTO
CUARTO NEGRO
EQUIPOS
- Microcentrífuga
- Balanza
- Balanza analítica
- Microonda
- Fuente de poder
- Transiluminador de LUV
- Cámara polaroid con filtro naranja y campana
- Vortex
- Pipetas ajustables 20 ul, 200 ul.
MATERIALES
REACTIVOS
Nota: Utilice guantes todo el tiempo que maneje el carcinógeno bromuro de etidium
51
PROCEDIMIENTO
1. Para cada gel, preparar una solución de 1.5% de agarosa en TBE 1X y calentar
hasta disolver la agarosa
2. Dejar enfriar la solución hasta aproximadamente 55º C. Agregar bromuro de etidium
(10 mg/ml) a una dilución de 1/20000 (Concentración final 0.4 ug/ml).
3. Preparar el gel vertiendo la solución en el molde con cuidado de no hacer burbujas.
4. Preparar buffer de TBE 1X para el gel con bromuro de etidium a una concentración
final de 0.5 ug/ml.
5. Preparar un esquema mostrando el orden de las muestras en el gel.
10 ul del producto
2 ul de colorante
11. Correr el gel aproximadamente 100 voltio hasta que el azul de bromofenol haya
migrado aproximadamente 70 a 80% a lo largo del gel.
52
RT- PCR NESTED (Lanciotti et al)
PREPARACION DE LA MEZCLA .
CUARTO BLANCO
EQUIPOS
- Termociclador
- Microcentrífuga
- Pipetas ajustables 20 ul, 200ul, 1000ul.
MATERIALES
D1: 5’- TCA ATA TGC TGA AAC GCG CGA GAA ACC G 3’
D2: 5’ – TTG CAC CAA CAG TCA ATG TCT TCA GGT TC 3’
TS1: 5’- CGT CTC AGT TGA TCC GGG GG 3’
TS2: 5’- CGC CAC AAG GGC CAT GAA CAG 3’
TS3: 5’- TAA CAT CAT CAT GAG ACA GAG C 3’
TS4: 5’- CTC TGT TGT CTT AAA CAA GAG A 3’
KCl 500 mM
Tris- HCl 100 mM pH 8.5
Gelatina 0.1%
53
PROCEDIMIENTO RT- PCR (Primer round)
D1 50 pmoles
D2 50 pmoles
VOL.MIX 90 ul
MUESTRA 10 ul
TOTAL 100 ul
4. Descongelar las alícuotas de cada reactivo. Mezclar bien cada solución con
vortex y baje líquidos con un golpe de centrífuga (Mantener siempre los
ingredientes y tubos sobre hielo).
54
7. Agregar las enzimas y mezclar bien. Tener cuidado de no producir burbujas.
PROGRAMA DE AMPLIFICACION:
55
NESTED PCR (Segundo round)
D1 50 pmoles
TS1 50 pmoles
TS2 50 pmoles
TS3 50 pmoles
TS4 50 pmoles
VOL.MIX 90 ul
MUESTRA 10 ul
TOTAL 100 ul
4. Descongelar las alícuotas de cada reactivo. Mezclar bien cada solución con
vortex y baje líquidos con un golpe de centrífuga (Mantener siempre los
ingredientes y tubos sobre hielo).
56
7. Agregar la taq polimerasa y mezclar bien. Tener cuidado de no producir
burbujas.
PROGRAMA DE AMPLIFICACION:
CUARTO NEGRO
EQUIPOS
- Microcentrífuga
- Balanza
- Balanza analítica
- Microonda
- Fuente de poder
- Transiluminador de LUV
- Cámara polaroid con filtro naranja y campana
- Vortex
- Pipetas ajustables 20 ul, 200 ul.
MATERIALES
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- Probetas de 100 ml, 250 ml, 1000 ml.
- Papel para pesar
- Cinta adhesiva de color
- Puntas de pipetas 1 a 200 ul
- Beaker con cloro diluido
- Marcador Permanentes
- Gradilla para tubos de microcentrífuga
- Guantes
- Papel parafilms
- Lentes protectores contra LUV
REACTIVOS
PROCEDIMIENTO
13. Cubrir una gradilla para tubos de microcentrífuga con un pedazo de parafilms.
Hacer depresiones en el parafilms sobre los hoyos. Marque el número de las
reacciones sobre el parafilms en el orden predeterminado.
10 ul del producto
2 ul de colorante
58
14. Adicionar las muestras en el gel según el orden predeterminado.
15. Correr el gel aproximadamente 100 voltio hasta que el azul de bromofenol
haya migrado aproximadamente 70 a 80% a lo largo del gel.
Primer PCR
Segundo PCR
1. Utilizar tres áreas diferentes, cada uno designado para una función específica.
Cuarto Gris: Preparación y almacenamiento de la muestra y DNA purificado. Adición
de las muestras a las alícuotas con mezcla (preparación de las reacciones).
59
CONTROLES DE LA TECNICA
1- Control de Agua Gris: Control del agua que se utiliza durante la purificación del ácido
nucleico. No debe aparecer ninguna banda de amplificación a nivel de este control.
4- Control de Agua Blanca: Control del agua que se utiliza durante el proceso de la
mezcla para el PCR. No debe aparecer ninguna banda de amplificación a nivel de
este control.
6- Control de Inhibición: Este control consiste en adicionar ARN viral al ácido nucleico
purificado de una muestra negativa, de existir algún inhibidor de la actividad de la
polimerasa del DNA la banda esperada no aparecerá.
60
Nota los tiempos de toda la noche se pueden sustituir por centrifugación de
3500 r.p.m./5min.
TBE 10X:
BUFER LISIS:
6M de GITC
50mM de Citrato de sodio
1% de sarcosil
20ug/ml de tRNA.
Bmercaptoetanol 100 mM (agregue inmediatamente antes de usar el buffer)
POR CADA 1000ml DE Agua agregar 1ml de DEPC, dejarlo toda la noche
en agitación
61
PRODUCCION DE ANTIGENO POR EL METODO SACAROSA ACETONA
(Tomado del manual de procedimientos del IPK)
La acetona permite un mayor rendimiento viral al actuar sobre los lípidos del
cerebro, la sacarosa protege de la acción de la acetona sobre la envoltura del
virus mediante un mecanismo que aun no ha sido dilucidado pro completo. La
relación entre las concentraciones de sacarosa, cerebro, acetona y agua
parecen ser críticas en el rendimiento viral.
EQUIPOS
- Gabinetes de seguridad
- Centrifuga refrigerada
- Homogenizador mecánico o eléctrico
- Cristalería
REACTIVOS
- Sacarosa
- Acetona (Calidad reactiva a – 70º C)
- Solución Borato salina pH 9 (BS)
- Tris (hidrometil aminometane Gibco 130910)
- B propialactona (BPL) (B prone, Fellows Testaga, Detroid. Michigan)
- Alcohol 70º C
62
EXTRACION DEL ANTIGENO
63
- Durante el proceso de extracción deben reenvasarse varias amputas
conteniendo cerebro de ratón sólo en suspensión al 10% (en PBS o medio
de cultivo mas suero bovino al 5% y 100 Uds./ml de antibiótico) las cuales
se almacenarán a –70º C y servirán como virus semillas para el próximo
pase en ratones y de esta forma conservar el virus.
64
PRODUCCION DE ANTIGENO CELULAR ( Método que se realiza en CNDR-
MINSA de Nicaragua)
EQUIPOS
a. Incubadoras de 28º C
b. Flujo Laminar
c. Pipet aids
MATERIALES
REACTIVOS
a. Medio MEM con Suero Bovino Fetal (SBF)al 10% o medio L15 con SBF al 10%.
(Medio de crecimiento).
b. Alcohol al 70%
c. Cloro al 10%
PROCEDIMIENTO
3. Descartar el sobrenadante.
65
8. Adicionar Tween 20 de tal forma que quede a una concentración final de 1%.
18. Titular por ELISA de captura o ELISA de Inhibición desde 1/5 hasta 1/100 con
una dilución constante del conjugado.
19. Titulo del antígeno se considera como la ultima dilución donde el control
positivo presente un valor de absorbancia cercano a 1, y haya buena
discriminación entre positivo y negativo en el caso de ELISA de captura de
IgM, y con respecto a ELISA de Inhibición se considera él titulo del antígeno
como la ultima dilución donde el control negativo presente un valor de
absorbancia cercano a 1, y haya buena discriminación entre negativo y
positivo.
66
PREPARACION DE CONJUGADO ANTI DENGUE PEROXIDASA (Wilson B
and Nakane P. Método que se realiza en CNDR – MINSA de Nicaragua)
REACTIVOS
- Suero humano con altos títulos hemaglutinante contra el virus del Dengue.
PROCEDIMIENTO
- Descartar el sobrenadante
- Agitar 30 minutos
67
- Descartar el sobrenadante
- Agitar 30 minutos
- Descartar el sobrenadante
- Adicionar 1 ml de PBS.
CONCENTRACIÓN DE INMUNOGLOBULINAS
F: = 2.303/0.28 x %proteína/100
Valores de F y R (280/260)
68
0.846 5.50 0.650
0.822 6.00 0.632
0.801 6.50 0,607
0.781 7.00 0.585
0.767 7.50 0.565
0.753 8.00 0.545
0.730 9.00 0.506
0.705 10.00 0.478
0.671 12.00 0.422
0.644 14.00 0.377
0.615 17.00 0.322
0.505 20.00 0.278
REACTIVOS
• Solución A
• Carbonato de sodio anhidro 0.2 M. 21.2g/litro de H2O destilada.
• Solución B
• Bicarbonato de sodio 0.2 M. 16. 802g/litro de H2O destilada
69
Añada aproximadamente 115 ml de Bórax a 4 litros de ácido bórico. Ajuste pH
7.4.
- Peryodato de Sodio
- Borohidruro de sodio
- Peroxidasa fracción VI
- Inmunoglobulina anti Dengue
PROCEDIMIENTO
70
Referencias bibliográficas
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