Moléculas para El Metabolismo
Moléculas para El Metabolismo
Moléculas para El Metabolismo
Los organismos vivos controlan su composicin mediante una compleja red de reacciones qumicas
T02.1
Comprensin
Aplicaciones
La urea como ejemplo de un compuesto producido por
organismos vivos, pero que tambin puede sintetizarse
artificialmente.
Habilidades experimentales
1. Biologa molecular.
La biologa molecular explica los procesos vivos aludiendo a las sustancias qumicas
implicadas.
2. La sntesis de urea.
Refutacin de teoras: la sntesis artificial de la urea ayud a refutar el vitalismo.
Una de las teoras ampliamente extendidas hasta hace 200 aos era la filosofa
del vitalismo, la creencia de que los seres vivos y las cosas inanimadas se
diferencian fundamentalmente porque los seres vivos tienen un elemento o
principio vitalista no fsico (chispa vital, energa vital, psique o alma) que hace
que los compuestos qumicos de los seres vivos (compuestos orgnicos) slo
se pueden producir dentro de los propios seres vivos. Esta teora tena mucho
arraigo en medicina y se pensaba que las enfermedades eran producto de un
desequilibrio entre las fuerzas vitales o humores del cuerpo, que afectaban no
slo a la salud sino tambin a la personalidad o temperamento de las
personas.
La urea es un ejemplo de compuesto orgnico que forma parte de la orina
y que se produce en el rin. En 1828 el qumico alemn Friedrich Whler
sintetiz urea artificialmente a partir de compuestos inorgnicos
(isocianato de plata y cloruro de amonio). Fue el primer compuesto
orgnico que se sintetiz artificialmente, sin que ningn principio vital
hubiese estado involucrado. El logro de Whler es que fue la primera
prueba en contra de la teora del vitalismo. Ayud a falsar la teora, pero
esto no hizo que todos los bilogos la abandonaran de inmediato.
Generalmente se requieren varias pruebas en contra de una teora para
que la mayora de los bilogos acepten la falsacin y, a veces, las
controversias continan durante decenios.
Aunque los bilogos aceptan ahora que los procesos en los organismos vivos se rigen por las mismas
fuerzas qumicas y fsicas que en la materia no viva, sigue habiendo algunos compuestos orgnicos
que no han sido sintetizados artificialmente. Por ejemplo, es an imposible hacer protenas
complejas como la hemoglobina, sin poder utilizar los ribosomas y otros componentes de las clulas.
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2. La sntesis de la urea.
La urea como ejemplo de un compuesto producido por organismos
vivos, pero que tambin puede sintetizarse artificialmente.
La urea es un compuesto con una estructura
molecular relativamente simple que contiene
nitrgeno.
Es un componente de la orina donde se descubri
por primera vez.
Se produce cuando hay un exceso de aminocidos
en el cuerpo, como un medio de excretar el
nitrgeno de los aminocidos, que de otro modo se
acumulara en forma de amonaco txico.
Para ello se utiliza un ciclo de reacciones,
catalizadas por enzimas: el ciclo de la urea. Este
ciclo ocurre en el hgado.
A continuacin, la urea es transportada por el
torrente sanguneo a los riones donde se filtra y
es expulsada fuera del cuerpo a travs de la orina.
CO2 + NH3
Enzima 1
carbamil fosfato
ornitina
urea
Enzima 2
Enzima 5
arginina
citrulina
fumarato
Aspartato
Enzima 3
Enzima 4
arginosuccinato
Desechos nitrogenados.
Cuando los aminocidos y cidos
nucleicos se metabolizan, el
subproducto inmediato es el
amonaco, que es muy txico para
el organismo, pero que puede ser
eliminado:
Directamente como amonaco
al exterior en invertebrados
acuticos o a travs de las
branquias en los peces
telesteos.
O se convierte en urea, en el
caso de los mamferos, que es
menos txica y se disuelve en
agua.
O se convierte en cido rico,
en el caso de las aves y los
reptiles terrestres, que es
insoluble en agua. La
produccin de cido rico es
energticamente ms costosa
que los otros mecanismos, pero
tambin ahorra que se excrete
agua.
Amonaco como
subproducto
Eliminado directamente
Convertido
en urea
Convertido en
cido rico
Amonaco
Urea
cido rico
Mamferos, anfibios y
peces cartilaginosos
Reptiles, aves
e insectos
Bioelementos secundarios.
Forman parte de todos los
organismos vivos, aunque en
menor proporcin que los
anteriores (3,9%). Son: Na, K, Ca,
Mg , Cl y Fe.
Oligoelementos. Aunque se encuentran en trazas, en proporciones inferiores al 0,1 % (en cantidades
superiores son txicos), estos elementos son imprescindibles, pues desempean funciones esenciales en
diferentes procesos bioqumicos y fisiolgicos. Algunos oligoelementos, como Cu, Zn, Mn, I, Ni y Co, aparecen
en la mayora de los organismos y otros, como Si, F, Cr, Li, B, Mo y Al, solo estn presentes en grupos
El carbono tiene cuatro electrones en su ltima capa, por lo que puede formar hasta cuatro enlaces
covalentes, ms que ningn otro bioelemento.
Estructura del tomo de
carbono con cuatro electrones
de valencia en su segunda capa
(la cual necesita otros cuatro
electrones para completar el
mximo de ocho), por lo que
puede formar hasta cuatro
enlaces covalentes (simples,
dobles o triples).
Los enlaces carbono-carbono pueden originar una gran variedad de molculas complejas, con forma
de cadena lineal o cclica, ramificada o sin ramificar.
Variedad de tipos de cadenas carbonadas:
lineal
lineal ramificada
cclica
doble cclica
Frmula semidesarrollada
Metano
Etanol
cido actico
CH4
CH2 OH
CH3 COOH
Frmula molecular
CH4
CH3O
C 2 H4 O 2
En los compuestos
orgnicos es frecuente la
existencia de ismeros:
molculas que tienen la
misma frmula molecular
pero distinta frmula
desarrollada:
C6H12O6
Glucosa
C6H12O6
Galactosa
Frmulas desarrolladas:
Frmulas estructurales:
C6H12O6
Fructosa
Aminocido
Grupo
funciona
l
Hidroxil
o
Carbonil
o
Frmula
estructural
Ejemplo
Etanol
CHO
Acetaldehdo
COOH
cido actico
NH2
Alanina
SH
Cistena
Carboxil
o
Amino
Electronegatividades relativas
de algunos tomos
tomo
Electronegatividad
3.5
3.0
2.5
2.1
Sulfhidril
o
Fosfato
PO42-
Glicerol fosfato
Metilo
CH3
Alanina
Encontra
do en
xidos de carbono
Carbonatos
Compuestos inorgnicos
(no sintetizados por los seres vivos
pero imprescindibles para ellos)
Agua
Sales minerales (carbonatos,
fosfatos, cloruro sdico, amonio,
etc.)
Gases (oxgeno, dixido de carbono,
etc.)
Biomolculas
Compuestos orgnicos
(sintetizados por los seres vivos y
con estructura a base de carbono)
G L C I D O S
5. Dibujo de molculas.
Dibujo de diagramas moleculares de la glucosa, la ribosa, un cido graso saturado y
un aminocido comn.
Para dibujar estas molculas se aconseja seguir la siguiente secuencia de pasos:
a. Dibujar primero el esqueleto carbonado.
b. Aadir los grupos funcionales.
c. Completar con tomos de hidrgeno los enlaces libres.
d. Contar el nmero de tomos de cada tipo y ver si coincide con la frmula molecular.
Compactar la frmula desarrollada sin perder la forma tridimensional.
En el caso de la glucosa (C6 H12 O6) los pasos seran:
C6
C5
HO
O
C4
a.
O
C
C OH
C
C
C
OH
OH
OH
C1
C3
C2
b.
H
HO
H C
O H
C OH H C
C
C
OH
OH
H
OH
c.
Completar con H
d.
Compactar parcialmente
HO
C4
a.
C2
HO
C
O
C OH
C
C
C
OH
OH
OH
C1
C3
b.
H
O
C OH H C
C
C
OH
OH
H
OH
c.
Completar con H
d.
Compactar parcialmente
6. Identificacin de molculas.
Identificacin de compuestos bioqumicos tales como los azcares, los lpidos o los
aminocidos a partir de diagramas moleculares.
A partir de un modelo molecular, sabras decir de qu tipo de molculas se tratan?
Las protenas contienen C, H, O y N, mientras que los hidratos de carbono y lpidos contienen C, H y O,
pero no N.
Muchas protenas contienen azufre (S) pero los hidratos de carbono y lpidos no.
Los hidratos de carbono contienen tomos de C, H y O en una proporcin de 1:2:1. Por ejemplo,
glucosa (C6H12O6) o sacarosa (C12H22O11).
Los lpidos contienen relativamente bastante menos oxgeno que los hidratos de carbono. Por ejemplo,
cido oleico (C18H14O2).
Actividad:
Construccin de biomolculas
http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Main_Page
1.
2.
3.
4.
Actividad:
Construccin de biomolculas
aminocido
(elige uno cualquiera)
glucosa
ribosa
Descrgate el software
http://www.acdlabs.com/resources/freeware/chemsketch/
aqu:
Y un tutorial aqu:
http://difusion.df.uba.
ar/ConectarIgualdad/tutorial_de_acdchemsketch_freew
are.pdf
7. Metabolismo.
El metabolismo es el conjunto de todas las reacciones catalizadas por enzimas en
una clula o un organismo.
La mayora de las reacciones del metabolismo ocurren en el interior de la clula, aunque algunas
son extracelulares. El metabolismo consta de numerosas vas o rutas metablicas en las que un
sustrato inicial es transformado paso a paso, mediante pequeas transformaciones qumicas, en
uno o varios productos finales. La mayor parte son cadenas de reacciones, aunque tambin hay
ciclos.
E
E
E
E
E
B1
D2
Sustrato
inicial
F3
metabolitos
Producto
final
http://www.sabiduria.com/turismo/images/metro-londres.gif
http://visual.ly/metabolism-map
http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?map01100
Metabolitos
intermedios
http://highered.mcgraw-hill.com/olc/dl/120070/bio09.swf
Producto final
La inhibicin por el producto final detiene la ruta metablica e impide que se produzca
un exceso de producto final. Es un mecanismo habitual de control del metabolismo.
Productos finales
pobres en energa
Catabolismo:
reacciones en las que se libera energa
ADP + P
ATP
Molculas
precursoras
Macromolculas
de la clula
Protenas
Polisacridos
Lpidos
cidos nucleicos
CO2
H2O
NH3
Anabolismo:
Reacciones en las que se requiere energa
Aminocidos
Monosacridos
cidos grasos
Nucletidos
http://laguna.fmedic.unam.mx/lenpres/
8. Anabolismo.
El anabolismo es la sntesis de molculas complejas a partir de molculas ms
simples, incluida la formacin de macromolculas a partir de monmeros, por
reacciones de condensacin.
Metabolismo a menudo se divide en dos partes, el anabolismo y el catabolismo. El anabolismo
son las reacciones en las que se sintetizan molculas ms grandes a partir de otras molculas
precursoras ms pequeas. Por ejemplo recuerda los esteroides anablicos (como la
testosterona) que son hormonas que promueven el desarrollo del cuerpo. Las reacciones
anablicas requieren energa, que se suministra generalmente en forma de ATP.
En el anabolismo se incluyen estos procesos:
La sntesis de protenas mediante los ribosomas.
La sntesis de ADN durante la replicacin.
La fotosntesis, incluyendo la produccin de glucosa a partir de dixido de carbono y agua.
La sntesis de glcidos o hidratos de carbono complejos como almidn, celulosa o glucgeno.
Muchas biomolculas son macromolculas que se obtienen cuando se unen entre s muchas
unidades (monmeros). Con unas pocas unidades diferentes se pueden formar infinidad de
macromolculas, dependiendo cuntas se unan y en qu orden.
Las macromolculas se pliegan y doblan en el espacio adoptando figuras tridimensionales
especficas, que dependen del tipo y secuencia de monmeros, lo cual determinar a su vez que
funcionen o no.
B
C
B
C
D A C DA B B
D A B DC A D
CDA
C BA
En todos los grupos de compuestos orgnicos (glcidos, lpidos, protenas y cidos nucleicos)
hay molculas ms pequeas (unidades o monmeros) y macromolculas (polmeros).
Monmeros
Polmeros
Lpidos
cidos grasos
Triglicridos y otros
lpidos
Glcidos
Monosacridos
Polisacridos
Protenas
Aminocidos
Polipptidos y
Protenas
cidos nucleicos
Nucletidos
ADN y ARN
Polmero
Monmero
Triglicrido
cido graso
Lpido
Estructura celular
Polmero
Monmero
Glcidos
Estructura celular
Cromosoma
Almidn (polisacrido)
Cadena de ADN
Glucosa (monosacrido)
Nucletido
Protenas
cidos nucleicos
Granos de almidn en
cloroplastos
Filamento intermedio
Polipptido
Aminocido
9. Catabolismo.
El catabolismo es la descomposicin de molculas complejas en molculas ms
simples, incluida la hidrlisis de macromolculas en monmeros.
El catabolismo es la parte del metabolismo en la cual las molculas ms grandes se descomponen en
otras ms pequeas. Las reacciones catablicas liberan energa y en algunos casos esta energa se
captura en forma de ATP, que luego puede ser utilizado por la clula. El catabolismo incluye, por
ejemplo:
La digestin de la comida en la boca, en el
estmago y en el intestino delgado.
La respiracin celular en la cual la glucosa o los
lpidos son oxidados hasta dixido de carbono y
agua.
La digestin de los compuestos de carbono
complejos presentes en la materia orgnica
muerta por los descomponedores (bacterias y
hongos saprtrofos).
La degradacin de aminocidos y nucletidos
hasta amonaco, urea o cido rico.
A. Reaccin de condensacin o
deshidratacin.
Unin de dos monmeros
con separacin de una
molcula de agua. Reaccin
tpica del anabolismo
B.
Reaccin de hidrlisis.
Separacin de monmeros
aadiendo una molcula de
agua. Reaccin tpica del
catabolismo.