別にモンスターボールに洗脳をする機能なんてないですし ポケモン自身の意思でボールから出ることも可能です。 ゲームシステムとして実装されていないだけで、アニメの描写を見る限りポケモンは結構勝手にボールから出ている描写が見られます。 洗脳云々もあくまでポケモン自身が自分を捕まえた、と言う事でトレーナーの実力を認めているから、とされています。 ボールにそんな機能は元々なく、本当にただの入れ物に過ぎません。 実際交換されたポケモンはジムバッジが無いと命令を平気で無視しますから。 実際、交換をしたポケモンはバッジがないと命令を無視したりします。 メタ的には高レベルポケモンを送り込んで簡単にクリアされてしまうことを防ぐ措置ですが。