Usuari:Mcapdevila/Genoma de la leucèmia limfàtica crònica
![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/89/SEM_Lymphocyte.jpg/180px-SEM_Lymphocyte.jpg)
El genoma de la leucèmia limfàtica crònica , de manera completa en 4 pacients, va ser seqüenciat per primera vegada l'any 2010 i publicat a la revista Nature el 5 de maig de 2011. [1] [2] La seqüenciació del genoma complet de la leucèmia limfàtica crònica permet conèixer els gens mutats-en relació amb els gens normals de cèl·lules no modificades que afecten els diferents malalts-, i establir quines són comuns o freqüents el que permetrà dissenyar tractaments específics per a cada pacient. [3]
La seqüenciació del genoma de la LLC ha estat duta a terme pel Projecte espanyol per a la seqüenciació del genoma de la LLC -amb la participació de més de 60 investigadors de diverses institucions investigadores i sanitàries-dirigits per Elías Campo i Carlos López Otín dins el Projecte Internacional del Genoma del Càncer (International Cancer Genome Consortium). [4] [5]
Projecte Internacional de Genoma del Càncer - ICGC
[modifica]El Consorci Internacional del Genoma del Càncer (ICGC) és l'encarregat d'organitzar i coordinar un gran nombre de projectes de recerca que tenen l'objectiu comú d'aclarir exhaustivament els canvis genètics presents en molts dels càncers que afecten a persones en tothom.
L'objectiu principal és generar bases de dades globals de caràcter públic i obert accessibles a investigadors, metges i altres especialistes sobre les anomalies genòmiques (mutacions somàtiques, expressió anormal de gens, modificacions epigenètiques) en els tumors de 50 tipus diferents de càncer o subtipus de càncer que són de gran importància clínica i social arreu del món. Les dades es posaran a disposició de tota la comunitat investigadora amb la major rapidesa possible, i amb restriccions mínimes, per accelerar la investigació sobre les causes i el control del càncer. El ICGC pretén facilitar la comunicació entre els membres i proporciona un espai per a la coordinació amb l'objectiu de maximitzar l'eficiència entre els científics que treballen per entendre, tractar i prevenir aquestes malalties. [6]
Projecte genoma de la LLC (2009 - 2012)
[modifica]![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0d/Chronic_lymphocytic_leukemia.jpg/220px-Chronic_lymphocytic_leukemia.jpg)
Dins del projecte mundial per a la secuenciación del genoma del càncer gestionat pel Consorci Internacional del Genoma del Càncer (ICGC) Espanya és l'encarregada de la seqüència genòmica de la leucèmia limfàtica crònica [7] a través del Projecte genoma Leucèmia limfàtica crònica - Espanya . L'objectiu és seqüenciar el genoma en nombrosos pacients i poder establir les homogeneïtats, les variabilitats i, si s'escau, un diagnòstic més personalitzat i eficaç. [8] El 15 d'abril de 2010 van ser publicats a Nature els avenços dels primers resultats dels primers 5 genomes complets de pacients amb Els primers cinc genomes de leucèmia limfàtica crònica, El País, 2010.04.14] </ref> [9]
Organismes participants
[modifica]L'organisme director i financer és el Institut de Salut Carles III (organisme públic dependent del Ministeri de Ciència i Innovació d'Espanya). [10] La direcció científica del projecte és a càrrec del Dr Elies Campo i del Dr Carlos López Otín. [11] [12] Dues de les institucions que participen i que tenen més tradició i reconeixement en LLC són el Hospital Clínic i Provincial de Barcelona i l'Hospital clínic de Salamanca. També participen la Universitat d'Oviedo, el Centre de Regulació Genòmica de Barcelona , l'Institut Català d'Oncologia, la Universitat de Deusto, el Centre Nacional d'Investigacions Oncològiques, el Banc Nacional d'ADN i la Universitat de Barcelona, amb el suport tècnic per a la investigació de la Xarxa Temàtica en Investigació Cooperativa en Càncer Investigadors espanyols comencen a seqüenciar el genoma de la leucèmia, HC] </ref>
Publicació Nature del genoma de la LLC el 5 juny 2011
[modifica]El 5 de juny de 2011 va ser publicat a la revista Nature l'article-remès al desembre de 2010 - [13] fruit del treball de l'equip espanyol responsable del genoma de la LLC [7] i membre del International Cancer Genome Consortium. [1] [14]
Contingut de la publicació a Nature
[modifica]![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/6/66/Genome_icon.jpg)
En l'article Whole-genome sequencing identifies Recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia (seqüenciació completa del genoma de la leucèmia limfàtica crònica amb identificació de les mutacions recurrents) pot llegir-se: [1]
« | La leucèmia limfocítica crònica (LLC), la leucèmia més freqüent en adults en els països occidentals, és una malaltia heterogènia amb diagnòstic i evolució clínica variable. Es poden distingir dos subtipus moleculars principals, caracteritzats, respectivament, per un nombre alt o baix de hipermutaciones somàtiques a la regió variable dels gens implicats en la immunoglobulina. Els canvis moleculars que condueixen a la patogènesi de la malaltia són encara poc coneguts. La publicació presenta la realització de la seqüenciació del genoma complet de quatre casos de leucèmia limfàtica crònica (LLC o CLL) així com la identificació de 46 mutacions somàtiques que poden afectar la funció del gen. Una anàlisi més detallada d'aquestes mutacions en 363 pacients amb LLC ha identificat quatre gens que estan mutats de manera recurrent: notch 1 (NOTCH1), exportina 1 (XPO1), diferenciació mieloide del gen de resposta primària 88 (MyD88) i Kelch- like 6 (KLHL6). Les mutacions en MyD88 i KLHL6 predominen en els casos de LLC amb els gens d'immunoglobulina mutat, mentre que les mutacions NOTCH1 i XPO1 es van detectar principalment en pacients amb immunoglobulines sense mutació. Els patrons de mutació somàtica, amb el suport de les anàlisis funcionals i clínics, indiquen clarament que les mutacions recurrents NOTCH1, MyD88 i XPO1 són canvis oncogènics que contribueixen a l'evolució clínica de la malaltia. Fins on sabem, aquest és la primera anàlisi exhaustiva de la LLC que combina la seqüenciació del genoma complet de característiques clíniques i els resultats clínics. És destacable la utilitat d'aquest enfocament per a la identificació de mutacions clínicament rellevants en el càncer. [1] | » |
Autors
[modifica]
Institucions
[modifica]- Institucions espanyoles
- Ministeri de Ciència i Innovació d'Espanya [10]
- Institut de Salut Carles III
- Institut Universitari d'Oncologia Principat d'Astúries - IUOPA - Universitat d'Oviedo
- IDIBAPS - Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer - Barcelona, Espanya - IDIBAPS[16]
- Centre de Regulació Genòmica - CRG-UPF - Universitat Pompeu Fabra
- Centre d'Investigació del Càncer - CIC IBMCC - Hospital Universitari de Salamanca - Universitat de Salamanca - CSIC
- Institut d'Investigació Biomèdica - IRB - Barcelona Supercomputing Center (BSC) o Centre Nacional de Supercomputació (CNS),
- Institut Nacional de Bioinformàtica - INB Universitat de Barcelona
- Centre Nacional de Biotecnologia - CNB-CSIC - Consell Superior d'Investigacions Científiques - Espanya - CNB-CSIC
- Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica - CNAG - Universitat de Barcelona-CNAG-UB-CNAG [17] [18]
- Centre Nacional d'Investigacions Oncològiques - CNIO, Espanya - CNIO [19]
- Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge - IDIBELL
- Institucions britàniques
- Wellcome Trust Sanger Institute - Regne Unit - Sanger Institute, Genome Projects
Vegeu també
[modifica]- Leucèmia limfàtica crònica
- Medicina genòmica
- Genoma
- Genoma humà
- Projecte Genoma Humà
- Cèl·lula mare cancerosa
- Nucli cel·lular
- Micro ARN
- HapMap
- International Cancer Genome Consortium
Enllaços externs
[modifica]- Article a Nature
- Whole-genome sequencing identifies Recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia, Nature (2011) doi: 10.1038/nature10113 5 de juny de 2011
- Pàgines web de ICGC i ICGC-CLL-Espanya
- Altres pàgines
- Institut de Salut Carlos III - Institut de Salut Carles III
- - European Leukemianet - Pàgina principalment
- European Group fred Blood and Marrow Transplantation
- En espanyol
- Espanya estudiarà la leucèmia limfàtica crònica, un treball dirigit pel Clínic de Barcelona amb gran protagonisme del Centre Internacional del Càncer de Salamanca] 4 de desembre de 2008
- AEAL què és la LLC?
- Significació biològica i marcadors pronòstics de la leucèmia limfàtica crònica i entitats relacionades , Emili Montserrat, S. Hematologia. Hospital Clínic i Provincial. Barcelona. Adaptar, Josep Gumà Padró. S. d'Oncologia de l'Hospital St Joan de Reus
- Leucèmia limfoide crònica, Hospital de Clíniques Dr Manuel Quintela, Universitat de la República, Uruguai juny de 2006
- Identificada la primera mutació genètica heretada associada al desenvolupament de leucèmia -alteració DKP1-, Jano Online, 2007.06.01, en espanyol a 'Institut d'Hematologia i Immunologia. Cuba
- Noves claus en el genoma de la leucèmia limfàtica crònica
Referències
[modifica]- ↑ 1,0 1,1 1,2 1,3 Whole-genome sequencing identifies Recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia, Nature (2011) doi: 10.1038/nature10113 5 juny 2011,
- ↑ CLL Genome, Ministeri de Ciència i Innovació, Espanya
- ↑ Espanya posa setge al tipus de leucèmia més comú. Un consorci de 60 investigadors seqüència per primera vegada el genoma de quatre malalts amb la variant crònica de càncer sanguini més freqüent en països desenvolupats. Assenyalen quatre gens que podrien causar la malaltia, 2011.06.05, Nuño Domínguez - Públic (Espanya)
- ↑ ICG - Consortium CLL
- ↑ Cancer Genome ConsortiumConsorcio Internacional del Genoma del Càncer ICGC
- ↑ About ICGC - Consorci Internacional del Genoma del Càncer
- ↑ 7,0 7,1 Chronic Lymphocytic Leukemia - CLL with mutated and unmutated IgVH
- ↑ Seqüenciat el primer genoma d'un espanyol, 2010.04.14, Públic, Espanya
- ↑ Spain - Chronic Lymphocytic Leukemia - CLL with mutated and unmutated IgVH, en ICGC
- ↑ 10,0 10,1 ' Prensa/220509.pdf Ciència i Innovació finança amb 10 M a científics espanyols per a una important investigació sobre leucèmia
- ↑ Scientific Directors: Dr Elías Campo and Dr Carlos López-Otín - Genome Project CLL
- ↑ C3% ADas+camp Notícia Genoma LLC - Elías Camp i Carlos López Otín, a Hospital Clínic de Barcelona
- ↑ Whole-genome sequencing identifies Recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia (Secuenciación completa del genoma de la leucèmia limfàtica crònica amb identificació de les mutacions recurrents)
- ↑ cllgenome.es/welcome-CLL-genome-website CLL Genome, Ministeri de Ciència i Innovació, Espanya posa setge al tipus de leucèmia més comú, 2011.06.05 Públic (Espanya)
- ↑ Structural Rearrangements via local Assembly of Next-Generation Sequence Data, 2010, videoconferència, Wellcome Trust Sanger Institute
- ↑ 16,0 16,1 Oncomorfologia funcional humana i experimental, IDIBPAS
- ↑ CNAG-UB, Universitat de Barclona
- ↑ - Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica, Barcelona
- ↑ CNIO - Centre Nacional d'Investigacions Oncològiques