TMTC1
TMTC1 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | TMTC1 | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | OMIM: 615855 MGI: 3039590 HomoloGene: 65299 GeneCards: TMTC1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 12: 29.5 – 29.78 Mb | Chr 6: 148.13 – 148.35 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
Transmembranski i tetratrikopeptidni protein sa ponavljanjem 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom TMTC1.[5]
Endoplazmatski retikulum (ER) dijelom je organiziran adapterskim proteinima koji stvaraju jedarne velike proteinske komplekse. Ponavljanja tetratrikopeptida (TPR) su dobro proučeni proteinski strukturni motivi koji podržavaju međumolekulske interakcije protein-protein. TMTC1 i TMTC2 su in silico pretragom identificirani kao proteini koji sadrže TPR i koji posjeduju N-terminalne ER ciljane signalne sekvence i više hidrofobnih segmenata, što ukazuje na politopske membranske proteine, koji su usmjereni na sekretorni put.
Različiti citološki i biohemijski testovi korišteni su kako bi se pokazalo da su TMTC1 i TMTC2 oba ER integralna membranska proteina sa više klastera TPR domena orijentiranih unutar lumena ER. Proteomska analiza praćena koimunoprecipitacijskom verifikacijom otkrila je da su oba proteina povezana sa ER pumpom za unos kalcija ERCA2B i TMTC2 također vezana za kalneksin, koji prati vezivanje ugljikohidrata. Mjerenja kalcija u živim ćelijama otkrila su da je prekomjerna ekspresija TMTC1 ili TMTC2 uzrokovala smanjenje kalcija oslobođenog iz ER-a nakon stimulacije, dok je obaranje TMTC1 ili TMTC2 povećalo stimulirano oslobađanje kalcija. Zajedno, ovi rezultati impliciraju TMTC1 i TMTC2 kao ER proteine uključene u homeostazu kalcija u ER.[6]
Aminokiselinska sekvenca
[uredi | uredi izvor]Dužina polipeptidnog lanca je 882 aminokiseline, a molekulska težina 98.847 Da.[7].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MVVTTSARGG | GGDRTPSRRR | GCGLAPAGAA | ALLAGASCLC | YGRSLQGEFV | ||||
HDDVWAIVNN | PDVRPGAPLR | WGIFTNDFWG | KGMAENTSHK | SYRPLCVLTF | ||||
KLNIFLTGMN | PFYFHAVNII | LHCLVTLVLM | YTCDKTVFKN | RGLAFVTALL | ||||
FAVHPIHTEA | VAGIVGRADV | LACLLFLLAF | LSYNRSLDQG | CVGGSFPSTV | ||||
SPFFLLLSLF | LGTCAMLVKE | TGITVFGVCL | VYDLFSLSNK | QDKSSNGALC | ||||
PRSPQQPGSP | QPSSLPGHPH | RENGKQQRFP | HKGAWGGCHS | PLPPEPKSSG | ||||
FPVSPRAVWS | MMRFLTYSYL | LAFNVWLLLA | PVTLCYDWQV | GSIPLVETIW | ||||
DMRNLATIFL | AVVMALLSLH | CLAAFKRLEH | KEVLVGLLFL | VFPFIPASNL | ||||
FFRVGFVVAE | RVLYMPSMGY | CILFVHGLSK | LCTWLNRCGA | TTLIVSTVLL | ||||
LLLFSWKTVK | QNEIWLSRES | LFRSGVQTLP | HNAKVHYNYA | NFLKDQGRNK | ||||
EAIYHYRTAL | KLYPRHASAL | NNLGTLTRDT | AEAKMYYQRA | LQLHPQHNRA | ||||
LFNLGNLLKS | QEKKEEAITL | LKDSIKYGPE | FADAYSSLAS | LLAEQERFKE | ||||
AEEIYQTGIK | NCPDSSDLHN | NYGVFLVDTG | LPEKAVAHYQ | QAIKLSPSHH | ||||
VAMVNLGRLY | RSLGENSMAE | EWYKRALQVA | HKAEILSPLG | ALYYNTGRYE | ||||
EALQIYQEAA | ALQPSQRELR | LALAQVLAVM | GQTKEAEKMT | NHIVSEETGC | ||||
LECYRLLSAI | YSKQENHDKA | LDAIDKALQL | KPKDPKVISE | LFFTKGNQLR | ||||
EQNLLDKAFE | SYRVAVQLNP | DQAQAWMNMG | GIQHIKGKYV | SARAYYERAL | ||||
QLVPDSKLLK | ENLAKLDRLE | KRLQEVREKD | QT |
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
Reference
[uredi | uredi izvor]- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000133687 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030306 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: Transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 1". Pristupljeno 21. 3. 2016.
- ^ Johan C Sunryd , Banyoon Cheon , Jill B Graham , Kristina M Giorda , Rafael A Fissore , Daniel N Hebert (2014): TMTC1 and TMTC2 are novel endoplasmic reticulum tetratricopeptide repeat-containing adapter proteins involved in calcium homeostasis. J Biol Chem, 289(23):16085-99 pmid: 24764305;pmcid: pmc4047382; doi: 10.1074/jbc.m114.554071
- ^ "UniProt, Q8IUR5" (jezik: англ.). Pristupljeno 11 вересня 2017. Provjerite vrijednost datuma u parametru:
|access-date=
(pomoć)CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)