Idi na sadržaj

SCN9A

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
SCN9A
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

5EK0

Identifikatori
AliasiSCN9A
Vanjski ID-jeviOMIM: 603415 MGI: 107636 HomoloGene: 2237 GeneCards: SCN9A
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 2 (čovjek)
Hrom.Hromosom 2 (čovjek)[1]
Hromosom 2 (čovjek)
Genomska lokacija za SCN9A
Genomska lokacija za SCN9A
Bend2q24.3Početak166,195,185 bp[1]
Kraj166,376,001 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za SCN9A
Genomska lokacija za SCN9A
Bend2 C1.3|2 39.13 cMPočetak66,310,424 bp[2]
Kraj66,465,306 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija sodium ion binding
sodium channel activity
voltage-gated ion channel activity
ion channel activity
voltage-gated sodium channel activity
Ćelijska komponenta voltage-gated sodium channel complex
integral component of membrane
membrana
integral component of plasma membrane
projekcija ćelije
ćelijska membrana
Akson
Biološki proces membrane depolarization during action potential
sodium ion transport
regulation of ion transmembrane transport
post-embryonic development
ion transport
behavioral response to pain
transmembrane transport
Nocicepcija
inflammatory response
response to toxic substance
neuronal action potential
sodium ion transmembrane transport
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_002977
NM_001365536

NM_001290674
NM_001290675
NM_018852

RefSeq (bjelančevina)

NP_002968
NP_001352465

NP_001277603
NP_001277604

Lokacija (UCSC)Chr 2: 166.2 – 166.38 MbChr 2: 66.31 – 66.47 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Nav1.7 jest natrijski kanal koji je kod ljudi kodiran genom SCN9A sa hromosoma 2.[5][6][7] Obično se eksprimira na visokim nivoima u dva tipa neurona: nociceptivnim (bolnim) neuronima u ganglijskom dorzalnom korijenu (DRG), rigeninusnoj gangliji i neuronima simpatičkih ganglija , koji su dio autonomnog (nevoljnog) nervnog sistema.[8][9]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 1.988 aminokiselina, a molekulska masa 226.372 Da.[8]

1020304050
MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKEEKKDDDEEAPKPS
SDLEAGKQLPFIYGDIPPGMVSEPLEDLDPYYADKKTFIVLNKGKTIFRF
NATPALYMLSPFSPLRRISIKILVHSLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPPD
WTKNVEYTFTGIYTFESLVKILARGFCVGEFTFLRDPWNWLDFVVIVFAY
LTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMI
LTVFCLSVFALIGLQLFMGNLKHKCFRNSLENNETLESIMNTLESEEDFR
KYFYYLEGSKDALLCGFSTDSGQCPEGYTCVKIGRNPDYGYTSFDTFSWA
FLALFRLMTQDYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINLILAV
VAMAYEEQNQANIEEAKQKELEFQQMLDRLKKEQEEAEAIAAAAAEYTSI
RRSRIMGLSESSSETSKLSSKSAKERRNRRKKKNQKKLSSGEEKGDAEKL
SKSESEDSIRRKSFHLGVEGHRRAHEKRLSTPNQSPLSIRGSLFSARRSS
RTSLFSFKGRGRDIGSETEFADDEHSIFGDNESRRGSLFVPHRPQERRSS
NISQASRSPPMLPVNGKMHSAVDCNGVVSLVDGRSALMLPNGQLLPEVII
DKATSDDSGTTNQIHKKRRCSSYLLSEDMLNDPNLRQRAMSRASILTNTV
EELEESRQKCPPWWYRFAHKFLIWNCSPYWIKFKKCIYFIVMDPFVDLAI
TICIVLNTLFMAMEHHPMTEEFKNVLAIGNLVFTGIFAAEMVLKLIAMDP
YEYFQVGWNIFDSLIVTLSLVELFLADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWP
TLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKIN
DDCTLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVYMM
VMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLTAIEEDPDANNLQIAVTRIKKGIN
YVKQTLREFILKAFSKKPKISREIRQAEDLNTKKENYISNHTLAEMSKGH
NFLKEKDKISGFGSSVDKHLMEDSDGQSFIHNPSLTVTVPIAPGESDLEN
MNAEELSSDSDSEYSKVRLNRSSSSECSTVDNPLPGEGEEAEAEPMNSDE
PEACFTDGCVWRFSCCQVNIESGKGKIWWNIRKTCYKIVEHSWFESFIVL
MILLSSGALAFEDIYIERKKTIKIILEYADKIFTYIFILEMLLKWIAYGY
KTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVTLVANTLGYSDLGPIKSLRTLRALRPLRA
LSRFEGMRVVVNALIGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYEC
INTTDGSRFPASQVPNRSECFALMNVSQNVRWKNLKVNFDNVGLGYLSLL
QVATFKGWTIIMYAAVDSVNVDKQPKYEYSLYMYIYFVVFIIFGSFFTLN
LFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRP
GNKIQGCIFDLVTNQAFDISIMVLICLNMVTMMVEKEGQSQHMTEVLYWI
NVVFIILFTGECVLKLISLRHYYFTVGWNIFDFVVVIISIVGMFLADLIE
TYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLVKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLL
LFLVMFIYAIFGMSNFAYVKKEDGINDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGW
DGLLAPILNSKPPDCDPKKVHPGSSVEGDCGNPSVGIFYFVSYIIISFLV
VVNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFS
KLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVL
GESGEMDSLRSQMEERFMSANPSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRAY
RRYRLRQNVKNISSIYIKDGDRDDDLLNKKDMAFDNVNENSSPEKTDATS
STTSPPSYDSVTKPDKEKYEQDRTEKEDKGKDSKESKK

Funkcija

[uredi | uredi izvor]
Struktura ljudskog naponski vođenog natrijevog kanala Nav1.7 u kompleksu sa pomoćnim beta-podjedinicama, ProTx-II i tetrodotoksinom (Y1755 dolje), iz RCSB PDB (6J8J).

Nav1.7 je naponski vođeni natrijski kanal i igra ključnu ulogu u stvaranju i provođenju akcijskih potencijala i stoga je važanza električnu signalizaciju većine ekscitabilnih ćelija. Nav1.7 je prisutan na završecima nerava koji osjećaju bol, nociceptorima, blizu regije gdje je impuls pokrenut. Stimulacija nervnih završetaka nociceptora proizvodi "generatorske potencijale", koji su male promjene napona kroz neuronske membrane. Nav1.7 kanal pojačava ove membranske depolarizacije, a kada razlika membranskog potencijala dostigne određeni prag, neuron se aktivira. U senzornim neuronima, višestruke natrijeve struje zavisne od napona mogu se razlikovati po njihovoj ovisnosti o naponu i po osjetljivosti na blokator natrijskih kanala ([tetrodotoksin]). Nav1.7 kanal proizvodi brzo aktivirajuću i inaktivirajuću struju koja je osjetljiva na nivo tetrodotoksina.[10] Nav1.7 je važan u ranim fazama neuronske elektrogeneze. Aktivnost Nav1.7 sastoji se od sporog prijelaza kanala u neaktivno stanje kada je depolariziran, čak i u manjem stepenu.[11] Ovo svojstvo omogućava da ovi kanali ostanu dostupni za aktivaciju čak i sa malim ili sporo razvijajućim depolarizacijama. Stimulacija nervnih završetaka nociceptora proizvodi "generatorske potencijale", male promjene u naponu na neuronskim membranama.[11] Ovo dovodi neurone do napona koji stimulira Nav1,8, koji ima više depolarizovani prag aktivacije koji proizvodi većinu transmembranske struje, odgovorne za depolarizirajuću fazu akcijskih potencijala.[12]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000169432 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000075316 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Klugbauer N, Lacinova L, Flockerzi V, Hofmann F (mart 1995). "Structure and functional expression of a new member of the tetrodotoxin-sensitive voltage-activated sodium channel family from human neuroendocrine cells". The EMBO Journal. 14 (6): 1084–90. doi:10.1002/j.1460-2075.1995.tb07091.x. PMC 398185. PMID 7720699.
  6. ^ Plummer NW, Meisler MH (april 1999). "Evolution and diversity of mammalian sodium channel genes". Genomics. 57 (2): 323–31. doi:10.1006/geno.1998.5735. PMID 10198179.
  7. ^ Catterall WA, Goldin AL, Waxman SG (decembar 2005). "International Union of Pharmacology. XLVII. Nomenclature and structure-function relationships of voltage-gated sodium channels". Pharmacological Reviews. 57 (4): 397–409. doi:10.1124/pr.57.4.4. PMID 16382098. S2CID 7332624.
  8. ^ a b Raymond CK, Castle J, Garrett-Engele P, Armour CD, Kan Z, Tsinoremas N, Johnson JM (oktobar 2004). "Expression of alternatively spliced sodium channel alpha-subunit genes. Unique splicing patterns are observed in dorsal root ganglia". The Journal of Biological Chemistry. 279 (44): 46234–41. doi:10.1074/jbc.M406387200. PMID 15302875.
  9. ^ Rush AM, Dib-Hajj SD, Liu S, Cummins TR, Black JA, Waxman SG (maj 2006). "A single sodium channel mutation produces hyper- or hypoexcitability in different types of neurons". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103 (21): 8245–50. Bibcode:2006PNAS..103.8245R. doi:10.1073/pnas.0602813103. PMC 1472458. PMID 16702558.
  10. ^ Catterall WA (2000). "Structure and regulation of voltage-gated Ca2+ channels". Annual Review of Cell and Developmental Biology. 16: 521–55. doi:10.1146/annurev.cellbio.16.1.521. PMID 11031246.
  11. ^ a b Cummins TR, Howe JR, Waxman SG (decembar 1998). "Slow closed-state inactivation: a novel mechanism underlying ramp currents in cells expressing the hNE/PN1 sodium channel". The Journal of Neuroscience. 18 (23): 9607–19. doi:10.1523/JNEUROSCI.18-23-09607.1998. PMC 6793269. PMID 9822722.
  12. ^ Renganathan M, Cummins TR, Waxman SG (august 2001). "Contribution of Na(v)1.8 sodium channels to action potential electrogenesis in DRG neurons". Journal of Neurophysiology. 86 (2): 629–40. doi:10.1152/jn.2001.86.2.629. PMID 11495938. S2CID 11579149.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]