Idi na sadržaj

KCNQ2

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
KCNQ2
Identifikatori
AliasiKCNQ2
Vanjski ID-jeviOMIM: 602235 MGI: 1309503 HomoloGene: 26174 GeneCards: KCNQ2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 20 (čovjek)
Hrom.Hromosom 20 (čovjek)[1]
Hromosom 20 (čovjek)
Genomska lokacija za KCNQ2
Genomska lokacija za KCNQ2
Bend20q13.33Početak63,400,208 bp[1]
Kraj63,472,677 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za KCNQ2
Genomska lokacija za KCNQ2
Bend2 H4|2 103.57 cMPočetak180,717,372 bp[2]
Kraj180,777,093 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija ankyrin binding
ion channel activity
voltage-gated ion channel activity
voltage-gated potassium channel activity
potassium channel activity
calmodulin binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
delayed rectifier potassium channel activity
Ćelijska komponenta axon initial segment
Ranvijerov čvor
membrana
integral component of membrane
integral component of plasma membrane
voltage-gated potassium channel complex
ćelijska membrana
Biološki proces regulation of ion transmembrane transport
ion transport
transmembrane transport
nervous system development
chemical synaptic transmission
potassium ion transport
potassium ion transmembrane transport
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_004518
NM_172106
NM_172107
NM_172108
NM_172109

NM_001382235

NM_001003824
NM_001003825
NM_001006668
NM_001006669
NM_001006674

NM_001006675
NM_001006676
NM_001006677
NM_001006678
NM_001006679
NM_001006680
NM_010611
NM_001302888

RefSeq (bjelančevina)
NP_004509
NP_742104
NP_742105
NP_742106
NP_742107

NP_001369164

NP_001003824
NP_001003825
NP_001006669
NP_001006670
NP_001006675

NP_001289817
NP_034741

Lokacija (UCSC)Chr 20: 63.4 – 63.47 MbChr 2: 180.72 – 180.78 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Kv7.2 (KvLQT2) jest naponski i lipidno vođeni kalijski kanalski protein koji je kod ljudi kodiran genom KCNQ2 sa hromosoma 20.

Povezan je sa benignom porodičnom neonatusom epilepsijom.

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 872 aminokiseline, a molekulska težina 95.848 Da. ]].[5]

1020304050
MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKR
GSILSKPRAGGAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVF
LLVFSCLVLSVFSTIKEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGC
CCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSL
RFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGFLCLILASFLV
YLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI
GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATN
LSRTDLHSTWQYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRNLKSK
SGLAFRKDPPPEPSPSKGSPCRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDRVFSSPRGV
AAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKVPKSWSFGDRSRARQAFRIKG
AASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSIRAVCVMRFLV
SKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT
DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGI
PPTETEAYFGAKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKN
FSAPPAAPPVQCPPSTSWQPQSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHER
SLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGNLRDSDTSISIPSVDHEELER
SFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESDTDSDLCTPCG
PPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

M-kanal je sporo aktivirajući i deaktivirajući kalijski kanal koji ima ključnu ulogu u regulaciji neuronske ekscitabilnosti. Formiran je asocijacijom proteina kodiranog ovim genom i srodnog proteina kodiranog genom KCNQ3, oba integralna membranska proteina. Struje M-kanala inhibiraju M1 muskarinski acetilkolinski receptori i aktiviraju retigabin, novi antikonvulzivni lijek. Defekti ovog gena uzrok su benignih porodičnih neonatusih konvulzija tipa 1 (BFNC), takođe poznatih kao epilepsija, benigni neonatusni tip 1 (EBN1). Za ovaj gen je pronađeno najmanje pet varijanti transkripta koje kodiraju pet različitih izoformi.[5]

ICA-069673
Spoj #40 (Amato 2011)
  • ICA-069673: Otvarač kanala na KCNQ2/Q3, 20 puta selektivniji u odnosu na KCNQ3/Q5, nema mjerljive aktivnosti na panelu srčanih ionskih kanala (hERG, Nav1.5, kanali tipa L i KCNQ1) i nema aktivnosti na GABAA kanalima na 10 μM. Niz srodnih benzamida je pokazao aktivnost, od kojih je ovdje prikazan spoj broj 40.[6]
  • ML252: Kanalski inhibitor, IC50 = 70nM.[7] i
  • Fosfatidilinozitol 4,5-bisfosfat (PIP2)

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c ENSG00000281151 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000075043, ENSG00000281151 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000016346 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: KCNQ2 potassium voltage-gated channel, KQT-like subfamily, member 2".
  6. ^ Amato G (2011). "N -Pyridyl and Pyrimidine Benzamides as KCNQ2/Q3 Potassium Channel Openers for the Treatment of Epilepsy". ACS Medicinal Chemistry Letters. 2 (6): 481–484. doi:10.1021/ml200053x. PMC 4018159. PMID 24900334.
  7. ^ Cheung YY, Yu H, Xu K, Zou B, Wu M, McManus OB, Li M, Lindsley CW, Hopkins CR (august 2012). "Discovery of a series of 2-phenyl-N-(2-(pyrrolidin-1-yl)phenyl)acetamides as novel molecular switches that modulate modes of K(v)7.2 (KCNQ2) channel pharmacology: identification of (S)-2-phenyl-N-(2-(pyrrolidin-1-yl)phenyl)butanamide (ML252) as a potent, brain penetrant K(v)7.2 channel inhibitor". Journal of Medicinal Chemistry. 55 (15): 6975–9. doi:10.1021/jm300700v. PMC 3530927. PMID 22793372.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.