Histon H3
| Histon H3, porodica 3A (H3.3A) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Histon H3 | |||||||
| Identifikatori | |||||||
| Simbol | H3F3A | ||||||
| Alt. simboli | H3F3 | ||||||
| NCBI gen | 3020 | ||||||
| HGNC | 4764 | ||||||
| OMIM | 601128 | ||||||
| RefSeq | NM_002107 | ||||||
| UniProt | Q66I33 | ||||||
| Ostali podaci | |||||||
| Lokus | Hrom. 1 q41 | ||||||
| |||||||
| Histon H3, porodica 3B (H3.3B) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||
| Identifikatori | |||||||
| Simbol | H3F3B | ||||||
| NCBI gen | 3021 | ||||||
| HGNC | 4765 | ||||||
| OMIM | 601058 | ||||||
| RefSeq | NM_005324 | ||||||
| UniProt | P84243 | ||||||
| Ostali podaci | |||||||
| Lokus | Hrom. 17 q25 | ||||||
| |||||||
Histon H3 je jedan od pet glavnih histona uključenih u strukturu hromatina u eukariotskim ćelijama.[1][2] Sa glavnim globularnim domenom i dugim N-terminalni rep, H3 je uključen u strukturu nukleosomske strukture 'perli na niti. Histonski proteini su visoko posttranslacijsko modificirani međutim histon H3 je najopsežnije modificiran od pet histona. Sam izraz "Histone H3" namerno je dvosmislen jer ne pravi razliku između varijanti sekvence ili stanja modifikacije. Histon H3 je važan protein u novom polju epigenetike, gdje se smatra da njegove varijante sekvence i varijabilna stanja modifikacije igraju ulogu u dinamičkoj i dugoročnoj regulaciji gena.
N-terminal H3 viri iz globulastog nukleosomskog jezgra i podložan je posttranslacijskim modifikacijama koje utiču na ćelijske procese. Ove modifikacije uključuju kovalentno vezivanje metil ili acetil grupa za lizinske i argininske aminokiseline i fosforilaciju serin ili treonin. Di- i trimetilacija lizina 9 povezana je sa represijom i heterohromatin om (vidi H3K9me2 i H3K9me3), dok monometilacija K4 (K4 odgovara ostatku lizina na 4. poziciji) (vidi H3K4me1), povezan je sa aktivnim genima.[3][4] Sa glavnim globulastim domenom i dugim N-terminalnim repom, H3 je uključen u strukturu nukleosomske strukture 'perli na niti'. Histonski proteini su visoko posttranslacijsko modificirani; međutim histon H3 je najopsežnije modificiran od pet histona. Sam termin "histon H3" namjerno je dvosmislen jer ne pravi razliku između varijanti sekvence ili stanja modifikacije. Histon H3 je važan protein u novom polju epigenetike, gdje se smatra da njegove varijante sekvence i varijabilna stanja modifikacije imaju ulogu u dinamičkoj i dugoročnoj regulaciji gena.[5][6] Utvrđeno je da histon H3.3 ima važnu ulogu u održavanju integriteta genoma tokom razvoja sisara.[7] Varijante histona iz različitih organizama, njihova klasifikacija i specifične karakteristike varijanti mogu se naći na "HistoneDB - sa varijantama " bazi podataka.
Genetika
[uredi | uredi izvor]Histon H3 je kodiran sa nekoliko gena u ljudskom genomu, uključujući:
- H3.1: HIST1H3A, HIST1H3B, HIST1H3C, HIST1H3D, HIST1H3E, HIST1H3F, HIST1H3G, HIST1H3H, HIST1H3I, HIST1H3J
- H3.2: HIST2H3A, HIST2H3C, HIST2H3D
- H3.3: H3F3A, H3F3B
Također pogledajte
[uredi | uredi izvor]Reference
[uredi | uredi izvor]- ^ Bhasin M, Reinherz EL, Reche PA (2006). "Recognition and classification of histones using support vector machine" (PDF). Journal of Computational Biology. 13 (1): 102–12. doi:10.1089/cmb.2006.13.102. PMID 16472024.
- ^ Hartl DL, Freifelder D, Snyder LA (1988). Basic Genetics. Boston: Jones and Bartlett Publishers. ISBN 978-0-86720-090-4.
- ^ Rosenfeld JA, Wang Z, Schones DE, Zhao K, DeSalle R, Zhang MQ (mart 2009). "Determination of enriched histone modifications in non-genic portions of the human genome". BMC Genomics. 10: 143. doi:10.1186/1471-2164-10-143. PMC 2667539. PMID 19335899.
- ^ Lachner M, O'Carroll D, Rea S, Mechtler K, Jenuwein T (Mar 2001). "Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins". Nature. 410 (6824): 116–20. Bibcode:2001Natur.410..116L. doi:10.1038/35065132. PMID 11242053. S2CID 4331863.
- ^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (Nov 2002). "The human and mouse replication-dependent histone genes". Genomics. 80 (5): 487–98. doi:10.1016/S0888-7543(02)96850-3. PMID 12408966.
- ^ Hake SB, Garcia BA, Duncan EM, Kauer M, Dellaire G, Shabanowitz J, Bazett-Jones DP, Allis CD, Hunt DF (Jan 2006). "Expression patterns and post-translational modifications associated with mammalian histone H3 variants". The Journal of Biological Chemistry. 281 (1): 559–68. doi:10.1074/jbc.M509266200. PMID 16267050.
- ^ Jang CW, Shibata Y, Starmer J, Yee D, Magnuson T (Jul 2015). "Histone H3.3 maintains genome integrity during mammalian development". Genes & Development. 29 (13): 1377–92. doi:10.1101/gad.264150.115. PMC 4511213. PMID 26159997.