Дачия е създадена през 1999 в самия край на 20 век. Основатели са Марин Левадару, Игор Урсачи, Валерию Плужнич и Александру Скаруба. Тимът е имал сравнително скромни цели – да вземе участие в молдовския шампионат и по-точно в Дивизия А. През 2000 тимът е на лагер в близост до Одеса, а малко по-късно прави и дебюта си в Дивизия А. Тогава Дачия получава и прякора Жълтите вълци. През следващия сезон Дачия доминира в дивизията, а посещава и Германия. Там футболистите виждат нови методи на работа и играят престижни контроли. Печелят си виза за УЕФА Интертото Къп. През следващите години Дачия прави добри игри, но не успява да наруши хегемонията на Шериф Тираспол. През сезон 2010 – 2011 в евротурнирите отстраняват черногорския Зета в 1-вия квалификационен кръг. След това се изправят срещу шведскияКалмар. В гостуването завършват 0 – 0, а жребия отрежда за евентуален противник в 3-тия квалификационен кръг българскияЛевски (София). В домакинството обаче допускат загуба от шведите и отпадат. Все пак през сезон 2010 – 2011 Дачия става шампион на Молдова.