İçeriğe atla

Aptamer: Revizyonlar arasındaki fark

Vikipedi, özgür ansiklopedi
[kontrol edilmemiş revizyon][kontrol edilmemiş revizyon]
İçerik silindi İçerik eklendi
TXiKiBoT (mesaj | katkılar)
k Bot değişikliği Ekleniyor: fr:Aptamère
Düzenleme
1. satır: 1. satır:
'''''Aptamerler''''', spesifik hedef moleküllerine bağlanabilen [[peptid]] molekülleri veya oligonükleik asitlerdir. Aptamerler genelde rastgele düzenlenmiş geniş havuzlardaki dizilerden oluşturulmuştur ve [[mRNA]]'nın yapısında da bulunur. Aptamerler temel araştırmalar ve klinik amaçlar için makromoleküler ilaçlar olarak kullanılabilir.
{{düzenle|Mart 2007}}
{{biyokimya-taslak}}
'''''Aptamerler''''', spesifik hedef moleküllerine bağlanabilen [[peptid]] molekülleri veya oligonükleik asitlerdir. Aptamerler genelde rastgele düzenlenmiş geniş havuzlardaki dizilerden oluşturulmuştur ve [[mRNA]]'nın yapısında da bulunur. Aptamerler temel araştırmalar ve klinik amaçlar da makromoleküler ilaçlar olarak kullanılabilir.


Aptamerler aşağıdaki gibi sınıflandırılabilirler.
Aptamerler aşağıdaki gibi sınıflandırılabilirler.


*[[DNA]] veya [[RNA]] aptamerleri, genelde kısa oligonukleit dizileri içerirler.
*[[DNA]] veya [[RNA]] aptamerleri, genelde kısa oligonukleit dizileri içerirler.
*Peptid aptamerleri, kısa değişken peptide domainleri içerir, protein scafffoldunun iki tarafından tutunurlar.
*Peptid aptamerleri, kısa değişken peptid domainleri içerir, [[protein]] scafffoldunun iki tarafından tutunurlar.


===DNA ve RNA aptamerleri===
===DNA ve RNA aptamerleri===


Aptamerler, laboratuvarda düzenlenmiş birer [[nükleik asit]] çeşitidir, ve SELEX (systematic evolution of ligands by exponential enrichment) yöntemiyle oluşturulurlar bu yöntem yenilemeli bir prosesten oluşur, başlangıç kütüphanesi PCR ile çoğaltılır ve RNA'ya transkribe edilir. Hedefe spesifik RNA hedef molekülle ilişkiye sokularak belirlenir ve sıkı bağlanan RNA molekülü ortamdan alınarak [[cDNA]]'ya ters transkribe edilir ve çift sarmal DNA, PCR ile çoğaltılır. Bu zenginleşitirilmiş bağlanma dizileri tekrardan RNA'ya transkribe edilir bu operasyon 5 ile 12 arası tekrarlanarak hedef moleküle en sıkı bağlanan RNA seçilmiş olur. Başta küçük moleküller, [[protein]]ler, [[nükleik asit]]ler, [[hücreler]], [[dokular]], [[organ]]lar olmak üzere çeşitli moleküllere bağlanabilir. Aptamerler, [[biyoteknoloji]]de ve tedavisel uygulamalarda bazı molekülleri (örneğin; biomolekül, antikor) tanımlama özellikleri sebebiyle kullanılır.Ayrıca çabuk sentezlenmeleri ve bir deney tüpünde bile elde edilebilmeleri açısından yaygındırlar.
Aptamerler, laboratuvarda düzenlenmiş birer [[nükleik asit]] çeşididir, ve SELEX ([[İngilizce]]: systematic evolution of ligands by exponential enrichment) yöntemiyle oluşturulurlar. Bu yöntem yinelemeli bir işlemden oluşur. Başlangıç kütüphanesi PCR ile çoğaltılır ve RNA'ya [[transkripsiyon|transkribe edilir]]. Hedefe spesifik RNA hedef molekülle ilişkiye sokularak belirlenir ve sıkı bağlanan RNA molekülü ortamdan alınarak [[cDNA]]'ya ters transkribe edilir. Bunun ardından, çift sarmal DNA, PCR ile çoğaltılır. Bu zenginleşitirilmiş bağlanma dizileri tekrardan RNA'ya transkribe edilir. Bu operasyon 5 ile 12 arası tekrarlanarak hedef moleküle en sıkı bağlanan RNA seçilmiş olur. Başta küçük moleküller, [[protein]]ler, [[nükleik asit]]ler, [[hücre]]ler, [[doku]]lar ve [[organ]]lar olmak üzere çeşitli moleküllere bağlanabilir. Aptamerler, [[biyoteknoloji]]de ve tedavisel uygulamalarda bazı molekülleri (örneğin; biomolekül, [[antikor]]) tanımlama özellikleri sebebiyle kullanılır. Ayrıca çabuk sentezlenmeleri ve bir deney tüpünde bile elde edilebilmeleri açısından yaygındırlar.


===Peptid aptamerleri===
===Peptid aptamerleri===


Peptid aptamerleri, hücre içinde diğer protein ilişkilerinin engellenmesi için oluşturulmuş protein yapılardır. Çiftli sarmal yapıdan oluşur, bu sarmal yapı bağlanma affinitesini çok yüksek seviyelere taşır.
[[Peptid]] aptamerleri, hücre içinde diğer protein ilişkilerinin engellenmesi için oluşturulmuş protein yapılardır. Çiftli sarmal yapıdan oluşur, bu sarmal yapı bağlanma affinitesini çok yüksek seviyelere taşır.


Kullanım alanları:
Kullanım alanları:
24. satır: 22. satır:


==Kaynaklar==
==Kaynaklar==
1. http://www.people.cornell.edu/pages/yc224/aptamer.htm
* http://www.people.cornell.edu/pages/yc224/aptamer.htm
2. http://en.wikipedia.org/wiki/Aptamer
* http://en.wikipedia.org/wiki/Aptamer

{{biyokimya-taslak}}

[[Kategori:Biyokimya]]
[[Kategori:Biyokimya]]



Sayfanın 01.26, 3 Şubat 2010 tarihindeki hâli

Aptamerler, spesifik hedef moleküllerine bağlanabilen peptid molekülleri veya oligonükleik asitlerdir. Aptamerler genelde rastgele düzenlenmiş geniş havuzlardaki dizilerden oluşturulmuştur ve mRNA'nın yapısında da bulunur. Aptamerler temel araştırmalar ve klinik amaçlar için makromoleküler ilaçlar olarak kullanılabilir.

Aptamerler aşağıdaki gibi sınıflandırılabilirler.

  • DNA veya RNA aptamerleri, genelde kısa oligonukleit dizileri içerirler.
  • Peptid aptamerleri, kısa değişken peptid domainleri içerir, protein scafffoldunun iki tarafından tutunurlar.

DNA ve RNA aptamerleri

Aptamerler, laboratuvarda düzenlenmiş birer nükleik asit çeşididir, ve SELEX (İngilizce: systematic evolution of ligands by exponential enrichment) yöntemiyle oluşturulurlar. Bu yöntem yinelemeli bir işlemden oluşur. Başlangıç kütüphanesi PCR ile çoğaltılır ve RNA'ya transkribe edilir. Hedefe spesifik RNA hedef molekülle ilişkiye sokularak belirlenir ve sıkı bağlanan RNA molekülü ortamdan alınarak cDNA'ya ters transkribe edilir. Bunun ardından, çift sarmal DNA, PCR ile çoğaltılır. Bu zenginleşitirilmiş bağlanma dizileri tekrardan RNA'ya transkribe edilir. Bu operasyon 5 ile 12 arası tekrarlanarak hedef moleküle en sıkı bağlanan RNA seçilmiş olur. Başta küçük moleküller, proteinler, nükleik asitler, hücreler, dokular ve organlar olmak üzere çeşitli moleküllere bağlanabilir. Aptamerler, biyoteknolojide ve tedavisel uygulamalarda bazı molekülleri (örneğin; biomolekül, antikor) tanımlama özellikleri sebebiyle kullanılır. Ayrıca çabuk sentezlenmeleri ve bir deney tüpünde bile elde edilebilmeleri açısından yaygındırlar.

Peptid aptamerleri

Peptid aptamerleri, hücre içinde diğer protein ilişkilerinin engellenmesi için oluşturulmuş protein yapılardır. Çiftli sarmal yapıdan oluşur, bu sarmal yapı bağlanma affinitesini çok yüksek seviyelere taşır.

Kullanım alanları:

  • Tedavi amaçlı
  • Hedef onaylama
  • İlaç seçimi
  • Yakınlık ayırımı
  • Diagnostik ve biosensörler

Kaynaklar