DNK stega
DNK stega, poznata i kao klizeća stega, je proteinska struktura koja služi kao faktor progresije DNK replikacije. Ona je kritična komponenta DNK polimeraze III. Klamfa se vezuje za DNK polimerazu i sprečava disocijaciju tog enzima sa templata DNK lanca. Protein–protein interakcije između stege i proteaze su jače i specifičnije nego direktne interakcije između polimeraze i templeta, DNK lanca. Jedan od korak koji ogračava brzinu reakcije DNK sinteze je vezivanje polimeraze sa DNK templetom, te prisustvo klizeće stege dramatično povećava broj nukleotida koje polimeraza može da doda u rastući lanac tokom pojedinačnog vezivanja. Prisustvo DNK stege može da povisi brzinu DNK sinteze oko 1.000 puta.[2]
Pogled od gore i sa strane na homotrimer ljudske PCNA klizne stege (boje duge, N-terminus = plavo, C-terminus = crveno) sa dvolančanom DNK u centralnoj pori (magenta).[1]
Reference
uredi- ↑ PDB 1W60; Kontopidis G, Wu SY, Zheleva DI, Taylor P, McInnes C, Lane DP, Fischer PM, Walkinshaw MD (February 2005). „Structural and biochemical studies of human proliferating cell nuclear antigen complexes provide a rationale for cyclin association and inhibitor design”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 (6): 1871–6. DOI:10.1073/pnas.0406540102. PMC 548533. PMID 15681588.
- ↑ V. Mizrahi, R. N. Henrie, J. F. Marlier, K. A. Johnson, S. J. Benkovic (1985). „Rate-limiting steps in the DNA polymerase I reaction pathway”. Biochemistry 24 (15): 4010–4018. DOI:10.1021/bi00336a031.
Literatura
uredi- Clamping down on pathogenic bacteria[mrtav link] – how to shut down a key DNA polymerase complex. Quips at PDBe
- Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A, Levine M, Losick R (2004). Molecular Biology of the Gene. San Francisco: Pearson/Benjamin Cummings.