ДНК-фотолиаза: различия между версиями
[отпатрулированная версия] | [отпатрулированная версия] |
Djem92 (обсуждение | вклад) |
м правильное оформление ударений |
||
(не показано 14 промежуточных версий 6 участников) | |||
Строка 7: | Строка 7: | ||
| image = Photolyase 1qnf.png |
| image = Photolyase 1qnf.png |
||
| width = 200px |
| width = 200px |
||
| caption = |
| caption = Деазафлавин-фотолиаза из ''Anacystis nidulans'', иллюстрирующая два светособирающих кофактора: FADH<sup>-</sup> (жёлтый) и 8-HDF (голубой). |
||
}} |
}} |
||
'''ДНК- |
'''ДНК-фотолиа́за''' (от {{lang-el|φωτος}} — свет и {{lang-el|λύνω}} — ослаблять, развязывать) — один из [[фермент|ферментов]] ({{шифр КФ|4.1.99.3}}) [[Репарация ДНК|репарации ДНК]] (класс [[лиазы]]), активация которого происходит под действием видимого света<ref>{{cite doi|10.1073/pnas.1101026108}}</ref>. ДНК-фотолиаза удаляет фотопродукты и [[пиримидиновый димер|пиримидин-пиримидиновые димеры]], образующиеся в молекуле [[ДНК]] под действием коротковолнового УФ-излучения. Процесс, в котором участвует фермент, называется [[Фотореактивация|фотореактивацией]]. Такие фотореактивирующие ферменты имеются у [[Бактерии|бактерий]] и [[простейшие|низших эукариотических организмов]], но в клетках [[млекопитающие|млекопитающих]] они не обнаружены. |
||
== Строение == |
== Строение == |
||
ДНК-фотолиаза [[Кишечная палочка|кишечной палочки]] (''Escherichia Coli'') имеет молекулярную массу 54 кДа. В качестве [[Кофактор|кофактора]], как и у всех фотолиаз выступает [[ФАД]] и дополнительный хромофор в качестве светособирающей антенны. Фермент действует путём переноса электронов, в которой |
ДНК-фотолиаза [[Кишечная палочка|кишечной палочки]] (''Escherichia Coli'') имеет молекулярную массу 54 кДа. В качестве [[Кофактор|кофактора]], как и у всех фотолиаз выступает [[ФАД]] и дополнительный хромофор в качестве светособирающей антенны. Фермент действует путём переноса электронов, в которой восстановлённый ФАДН<sup>-</sup> активируется световой энергией и действует в качестве донора электронов, необходимого для того, чтобы разорвать [[пиримидиновый димер]]<ref>{{cite pmid|12797829}}</ref>. |
||
== Механизм действия == |
== Механизм действия == |
||
[[Файл:Photodimer.png|left|thumb| |
[[Файл:Photodimer.png|left|thumb|400px|alt=Photodimers|Слева: 6,4-фотопродукт (6,4-PP). Справа: циклобутановый димер (CD).]] |
||
При облучении ДНК ультрафиолетовым светом в ней образуются либо циклобутановые димеры между соседними пиримидиновыми основаниями, либо пиримидиновые фотопродукты, такие как 6,4-PP. Такие соединения блокируют [[Репликация ДНК|репликацию ДНК]], и для сохранения жизнеспособности клетки их необходимо удалить. Один из способов удаления пиримидиновых димеров состоит в ферментативном превращении их в мономеры при освещении видимым светом в диапазоне длин волн 300—600 нм. ДНК-фотолиаза образует стабильный комплекс с пиримидиновым димером и, используя энергию поглощённого им света, разрушает димер без разрыва цепей ДНК. |
При облучении ДНК ультрафиолетовым светом в ней образуются либо циклобутановые димеры между соседними пиримидиновыми основаниями, либо пиримидиновые фотопродукты, такие как 6,4-PP. Такие соединения блокируют [[Репликация ДНК|репликацию ДНК]], и для сохранения жизнеспособности клетки их необходимо удалить. Один из способов удаления пиримидиновых димеров состоит в ферментативном превращении их в мономеры при освещении видимым светом в диапазоне длин волн 300—600 нм. ДНК-фотолиаза образует стабильный комплекс с пиримидиновым димером и, используя энергию поглощённого им света, разрушает димер без разрыва цепей ДНК. |
||
== Нахождение в природе == |
== Нахождение в природе == |
||
Фотолиазы были найдены у прокариот, эукариот (простейшие, |
Фотолиазы были найдены у прокариот, эукариот (простейшие, [[плесневые грибы]] ([[дрожжи]]) и некоторые виды насекомых и высших животных) и архей. У человека, как и у многих высших животных, они отсутствуют. |
||
== Примечания == |
== Примечания == |
||
{{примечания}} |
{{примечания}} |
||
{{Репарация ДНК}} |
|||
[[Категория:Репарация ДНК]] |
[[Категория:Репарация ДНК]] |
Текущая версия от 20:33, 26 сентября 2024
ДНК-фотолиаза | |
---|---|
| |
Идентификаторы | |
Шифр КФ | 4.1.99.3 |
Номер CAS | 37290-70-3 |
Базы ферментов | |
IntEnz | IntEnz view |
BRENDA | BRENDA entry |
ExPASy | NiceZyme view |
MetaCyc | metabolic pathway |
KEGG | KEGG entry |
PRIAM | profile |
PDB structures | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
Gene Ontology | AmiGO • EGO |
Поиск | |
PMC | статьи |
PubMed | статьи |
NCBI | NCBI proteins |
CAS | 37290-70-3 |
Медиафайлы на Викискладе |
ДНК-фотолиа́за (от греч. φωτος — свет и греч. λύνω — ослаблять, развязывать) — один из ферментов (шифр КФ 4.1.99.3) репарации ДНК (класс лиазы), активация которого происходит под действием видимого света[1]. ДНК-фотолиаза удаляет фотопродукты и пиримидин-пиримидиновые димеры, образующиеся в молекуле ДНК под действием коротковолнового УФ-излучения. Процесс, в котором участвует фермент, называется фотореактивацией. Такие фотореактивирующие ферменты имеются у бактерий и низших эукариотических организмов, но в клетках млекопитающих они не обнаружены.
Строение
[править | править код]ДНК-фотолиаза кишечной палочки (Escherichia Coli) имеет молекулярную массу 54 кДа. В качестве кофактора, как и у всех фотолиаз выступает ФАД и дополнительный хромофор в качестве светособирающей антенны. Фермент действует путём переноса электронов, в которой восстановлённый ФАДН- активируется световой энергией и действует в качестве донора электронов, необходимого для того, чтобы разорвать пиримидиновый димер[2].
Механизм действия
[править | править код]При облучении ДНК ультрафиолетовым светом в ней образуются либо циклобутановые димеры между соседними пиримидиновыми основаниями, либо пиримидиновые фотопродукты, такие как 6,4-PP. Такие соединения блокируют репликацию ДНК, и для сохранения жизнеспособности клетки их необходимо удалить. Один из способов удаления пиримидиновых димеров состоит в ферментативном превращении их в мономеры при освещении видимым светом в диапазоне длин волн 300—600 нм. ДНК-фотолиаза образует стабильный комплекс с пиримидиновым димером и, используя энергию поглощённого им света, разрушает димер без разрыва цепей ДНК.
Нахождение в природе
[править | править код]Фотолиазы были найдены у прокариот, эукариот (простейшие, плесневые грибы (дрожжи) и некоторые виды насекомых и высших животных) и архей. У человека, как и у многих высших животных, они отсутствуют.
Примечания
[править | править код]- ↑ Thiagarajan V., Byrdin M., Eker A. P. M., Muller P., Brettel K. Kinetics of cyclobutane thymine dimer splitting by DNA photolyase directly monitored in the UV // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2011. — 23 мая (т. 108, № 23). — С. 9402—9407. — ISSN 0027-8424. — doi:10.1073/pnas.1101026108.
- ↑ Sancar A. Structure and function of DNA photolyase and cryptochrome blue-light photoreceptors. (англ.) // Chemical reviews. — 2003. — Vol. 103, no. 6. — P. 2203—2237. — doi:10.1021/cr0204348. — PMID 12797829.