Uma revolta liderada pelo governador Teófilo Erótico em 1042 e outra, em 1092, liderada por Rapsomates, foram rapidamente sufocadas pelas forças imperiais. No final do século XII, surgiram novamente tentativas de independência: Isaac Comneno se autoproclamou basileu (imperador) em 1185. A ilha permaneceu sob seu comando até ser capturada por Ricardo Coração de Leão em 1191, na Terceira Cruzada.