Nella stagione 2013-2014 il Mantova disputa il terzo campionato consecutivo in Lega Pro Seconda Divisione, e il diciassettesimo nella storia del club in Serie C2 / Lega Pro Seconda Divisione. i biancorossi iniziano la stagione con alla guida Antonio Sala che, dopo essere stato sostituito a settembre da Gianni Migliorini, torna alla guida subito dopo nello stesso mese. Intanto il Mantova supera la fase eliminatoria a gironi della Coppa Italia Lega Pro eliminando Pavia e Castiglione, per poi essere eliminata nel primo turno ad eliminazione dal Delta Porto Tolle sconfitto (3-1) a Rovigo. La squadra virgiliana, dopo aver di nuovo cambiato allenatore a novembre con Carlo Sabatini, conclude il campionato al settimo posto del girone A con 52 punti, conquistando la diretta ammissione alla nuova terza serie. Passano al nuovo campionato di Lega Pro le prime nove classificate, il Mantova centra l'obiettivo stagionale per quattro punti. Le ultime nove del girone retrocedono in Serie D. Roberto Floriano, attaccante nato in Germania e proveniente dalla Pistoiese con 19 reti è stato il miglior realizzatore mantovano, secondo nella classifica dei marcatori del girone A alle spalle di Massimiliano Varricchio della Spal.
Dopo tre anni il Mantova cambia sponsor tecnico, affidandosi a Givova[1].
La prima maglia è, per la prima volta dopo un decennio, prevalentemente rossa, con una banda trasversale bianca a riprendere lo schema tradizionale della divisa virgiliana. La maglia da trasferta è invece celeste con pantaloncini bianchi, in riferimento ai colori originali del club. La terza divisa è nera con dettagli dorati, una novità assoluta per i biancorossi.
Lo sponsor ufficiale è Daga sulla prima e sulla terza divisa, mentre sulla seconda è Datacol.