UniProt

base de données biologiques, base de données en ligne, bibliothèque de données, base de données orientée graphe, ELIXIR Core Data Resource
Partie de	Web sémantique, Diagramme de données liées ouvertes, Institut suisse de bioinformatique, ELIXIR EMBL-EBI Node
Pays	Royaume-Uni, Suisse, États-Unis
Créé par	Institut européen de bio-informatique, Institut suisse de bioinformatique, Protein Information Resource
Collaborateur ou collaboratrice au travail de création	International Society for Biocuration
Langue de l'œuvre, du nom ou du terme	anglais
Opérateur	Institut européen de bio-informatique, Institut suisse de bioinformatique, Protein Information Resource
Site officiel	https://www.uniprot.org/, http://www.uniprot.org/
URL	https://sparql.uniprot.org/
Point d'accès SPARQL	https://sparql.uniprot.org/sparql
Licence	Creative Commons Attribution-NoDerivs 3.0 Unported, Creative Commons Attribution 4.0 International
Statut des droits d'auteur	sous droit d'auteur
Maintenance assurée par	Alex Bateman, Sandra Orchard, Alan J Bridge
Point d'accès API	https://www.ebi.ac.uk/proteins/api/swagger.json

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UniProt est une base de données de séquences de protéines. Son nom dérive de la contraction de Universal Protein Resource (base de données universelle de protéines). C'est une base de données ouverte, stable et accessible en ligne, elle est issue de la consolidation de l'ensemble des données produites par la communauté scientifique. UniProt est une base annotée, hiérarchisée où chaque séquence est accompagnée d'un ensemble riche de métadonnées et de liens vers de nombreuses autres bases de données : bibliographiques, phylogénétiques, nucléotidiques^[1]... Outre la séquence en acides aminés des protéines, UniProt fournit des informations sur leur fonction et leur structure ainsi que des liens vers d'autres bases de données.

UniProt combine les données des bases Swiss-Prot, TrEMBL et Protein Information Resource (PIR) et est mise à jour régulièrement. Ses données reposent entre autres sur le serveur ExPASy de l'Institut suisse de bioinformatique et celui de l'EBI. Ces serveurs proposent en particulier la recherche de séquences homologues dans la base au moyen d'outils d'alignement de séquences comme FASTA ou BLAST.

Notes et références

↑ (en) Uniprot Consortium, « The Universal Protein Resource (UniProt) », Nucleic Acids Res., vol. 35,‎ 2007, D193-7 (PMID 17142230, DOI 10.1093/nar/gkl929)

Voir aussi

Articles connexes

Liens externes

Sites officiels : (en) www.uniprot.org et (en) www.uniprot.org

[1] (en) Uniprot Consortium, « The Universal Protein Resource (UniProt) », Nucleic Acids Res., vol. 35,‎ 2007, D193-7 (PMID 17142230, DOI 10.1093/nar/gkl929)

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