Champignon-algue
Phycomycètes
Ne doit pas être confondu avec les lichens, qui sont des associations entre un champignon et une algue.
Les « champignons-algues », ou Phycomycètes, sont des organismes de petite taille dont la systématique a longtemps fait débat. Ils montrent en effet des points communs avec les algues, notamment au niveau de leurs structures reproductrices, tout en ayant un mode de vie typiquement fongique, qui les rapproche des champignons.
Dans les classifications modernes, basées sur des critères phylogénétiques, ce regroupement n'a plus qu'une valeur descriptive et forme un ensemble polyphylétique dont l'usage est à proscrire. Certains de ses membres sont désormais classés parmi les Hétérocontes, un groupe de protistes qui comptent aussi de nombreuses algues, comme les Diatomées et les Algues brunes.
Histoire
modifierEn 1858, le botaniste allemand Nathanael Pringsheim relève les affinités morphologiques des structures reproductrices de certains champignons « inférieurs », comme Saprolegnia, avec celles de l'algue jaune-verte Vaucheria[1]. Le mycologue Anton de Bary crée en 1873 la classe des Phycomycetes (construit sur les racines grecques phyco, « algue », et myco, « champignon ») pour regrouper ces organismes. Selon sa théorie, ils auraient évolué à partir d'ancêtres de type algue en perdant leur chlorophylle et en changeant leur mode de nutrition pour adopter celui des champignons, l'absorbotrophie. Les opposants de cette hypothèse affirment que les ressemblances avec les algues proviennent au contraire de développements parallèles au sein de lignées distinctes[2]. Malgré ces observations et des contestations précoces[3], les champignons-algues restent étudiés par les mycologues et sont classés dans le règne des Fungi, au même niveau que les Ascomycètes et les Basidiomycètes, jusque dans les années 1960[4].
Par la suite, plusieurs études mettent en évidence des différences fondamentales entre certains Phycomycètes et le reste du règne fongique : ils utilisent des voies métaboliques distinctes[5],[6] et leurs parois cellulaires sont majoritairement constitués de cellulose, et non pas de chitine[7]. Dans les années 1980, Thomas Cavalier-Smith reconnait que les principales lignées de Phycomycètes ne doivent plus être considérées comme des champignons, et il crée le groupe des Pseudofungi pour les différencier. Il classe ces organismes dans un nouveau règne, les Chromistes, qui rassemble également les Diatomées et les Algues brunes[8],[9]. Cette séparation est entérinée quelques années plus tard par les premières analyses phylogénétiques moléculaires, qui démontrent que les champignons-algues n'entretiennent aucun lien évolutif en commun avec les champignons vrais[10],[11].
Étendue et caractéristiques
modifierLes principaux traits distinctifs des Phycomycètes étaient le caractère cœnocytique de leur thalle, ainsi que leur multiplication asexuée à l'aide de spores flagellées, analogues aux gamètes des algues. Le groupe a eu des dimensions variables selon les auteurs, et a parfois été synonyme de « champignons inférieurs », par opposition aux « champignons supérieurs » formant des structures de reproduction multicellulaire (sporophores). Il rassemblait classiquement les Oomycètes, les Chytridiomycètes et les Hyphochytridiomycètes[12], et a pu englober également les Plasmodiophoromycètes, les Zygomycètes et les Trichomycètes[13].
Dans une définition plus restreinte, le terme « champignon-algue » peut s'appliquer aux groupes de champignons exclus du règne des Fungi et appartenant désormais aux Hétérocontes. Ils sont caractérisés par un mode de vie aquatique et une reproduction assurée par des cellules nageuses présentant deux flagelles distincts. Les principaux groupes sont les Oomycètes (700 espèces), les Hyphochytridiomycètes (20 espèces) et les Labyrinthulomycètes (anciennement rattachés aux Myxomycètes, 40 espèces)[14].
Notes et références
modifier- Lévesque 2011.
- (en) B. R. Vashishta, A. K. Sinha et Anil Kumar, Botany for degree students : Fungi, New Dehli, S. Chand and company Ltd., (1re éd. 1962), 794 p. (ISBN 93-5253-300-3, lire en ligne), p. 251.
- (en) Ernst A. Bessey, « Some Problems in Fungus Phylogeny », Mycologia, vol. 34, no 4, , p. 355–379 (DOI 10.1080/00275514.1942.12020906).
- (en) G. C. Ainsworth et G. R. Bisby, Dictionary of the fungi, Kew, The Commonwealth Mycological Institute, , 5e éd., 547 p.
- (en) Henry J. Vogel, « Lysine Synthesis and Phytogeny of Lower Fungi : Some Chytrids versus Hyphochytrium », Nature, vol. 189, no 4769, , p. 1026–1027 (DOI 10.1038/1891026a0).
- (en) H. B. LéJOHN, « Enzyme Regulation, Lysine Pathways and Cell Wall Structures as Indicators of Major Lines of Evolution in Fungi », Nature, vol. 231, no 5299, , p. 164–168 (DOI 10.1038/231164a0).
- (en) S. Bartnicki-Garcia, « Cell wall differentiation in the phycomycetes », Phytopathology, vol. 59, no 8, , p. 1065–1071 (PMID 5822692).
- (en) Thomas Cavalier-Smith, « Eukaryote kingdoms: Seven or nine? », Biosystems, vol. 14, nos 3-4, , p. 461–481 (DOI 10.1016/0303-2647(81)90050-2).
- (en) Thomas Cavalier-Smith, « The origin of fungi and pseudofungi », dans A. D. M. Rayner, C. M. Brasier & D. Moore, Evolutionary biology of the fungi, Cambridge, Cambridge University Press, , p. 339–353.
- (en) J. H. Gunderson, H. Elwood, A. Ingold et K. Kindle, « Phylogenetic relationships between chlorophytes, chrysophytes, and oomycetes. », Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 84, no 16, , p. 5823–5827 (DOI 10.1073/pnas.84.16.5823).
- (en) Helga Förster, Michael O. Coffey, Hille Elwood et Mitchell L. Sogin, « Sequence Analysis of the Small Subunit Ribosomal Rnas of Three Zoosporic Fungi and Implications for Fungal Evolution », Mycologia, vol. 82, no 3, , p. 306–312 (DOI 10.1080/00275514.1990.12025885).
- Selosse et Durrieu 2004, p. 98.
- (en) Kara Rogers, « Phycomycetes », sur Britannica (consulté le ).
- Bouchet et al. 2005, p. 8.
Annexes
modifierBibliographie
modifier- Marc-André Selosse et Guy Durrieu, « Une classification mycologique phylogénétique francophone (en 2003) », Acta Botanica Gallica, vol. 151, no 1, , p. 73–102 (ISSN 1253-8078 et 2166-3408, DOI 10.1080/12538078.2004.10516022, lire en ligne, consulté le ).
- Philippe Bouchet, Jean-Louis Guignard, Yves-François Pouchus et Jean Villard, Les champignons : mycologie fondamentale et appliquée, Issy-les-Moulineaux, Masson, , 2e éd., 191 p. (ISBN 2-294-02116-9, lire en ligne), chap. 3 (« Champignons-algues »), p. 8-16.
- (en) C. André Lévesque, « Fifty years of oomycetes—from consolidation to evolutionary and genomic exploration », Fungal Diversity, vol. 50, no 1, , p. 35–46 (DOI 10.1007/s13225-011-0128-7).
