Luciferasa: diferència entre les revisions
Contingut suprimit Contingut afegit
m neteja i estandardització de codi |
m neteja i estandardització de codi |
||
| Línia 5: | Línia 5: | ||
En reaccions de bioluminescència, l'emissió lluminosa es produeix gràcies a l'[[oxidació]] d’un pigment anomenat [[luciferina]], que es troba principalment en alguns bacteris, algues, fongs i animals. |
En reaccions de bioluminescència, l'emissió lluminosa es produeix gràcies a l'[[oxidació]] d’un pigment anomenat [[luciferina]], que es troba principalment en alguns bacteris, algues, fongs i animals. |
||
* luciferina + [[Oxigen|O<sub>2</sub>]] → oxiluciferina + llum |
* luciferina + [[Oxigen|O<sub>2</sub>]] → oxiluciferina + llum |
||
Les reaccions més habituals de bioluminescència alliberen [[diòxid de carboni|CO<sub>2</sub>]] com a producte. La velocitat de la reacció entre la luciferina i l’oxigen és extremadament lenta fins que no és catalitzada per la luciferasa. Aquesta reacció entre la luciferina i la luciferasa a vegades està controlada per la presència de cofactors, tals com ions calci, ions Magnesi o l'[[Adenosina trifosfat|ATP]].<ref name="urlEC 1.13.12.5">{{cite web | url = http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC1/13/12/5.html | title = EC 1.13.12.5 | author = | authorlink = | coauthors = | date = | work = IUBMB Enzyme Nomenclature | publisher = Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB) | pages = | language = | archiveurl = | archivedate = | quote = | accessdate = 2008-10-02}}</ref> |
Les reaccions més habituals de bioluminescència alliberen [[diòxid de carboni|CO<sub>2</sub>]] com a producte. La velocitat de la reacció entre la luciferina i l’oxigen és extremadament lenta fins que no és catalitzada per la luciferasa. Aquesta reacció entre la luciferina i la luciferasa a vegades està controlada per la presència de cofactors, tals com ions calci, ions Magnesi o l'[[Adenosina trifosfat|ATP]].<ref name="urlEC 1.13.12.5">{{cite web | url = http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC1/13/12/5.html | title = EC 1.13.12.5 | author = | authorlink = | coauthors = | date = | work = IUBMB Enzyme Nomenclature | publisher = Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB) | pages = | language = | archiveurl = | archivedate = | quote = | accessdate = 2008-10-02}}</ref> |
||
La reacció catalitzada per la luciferasa de les cuques de llum es duu a terme en dos passos: |
La reacció catalitzada per la luciferasa de les cuques de llum es duu a terme en dos passos: |
||
* luciferina + [[Adenosina trifosfat|ATP]] → adenilat de luciferina + [[Pirofosfat|PP<sub>i</sub>]] |
* luciferina + [[Adenosina trifosfat|ATP]] → adenilat de luciferina + [[Pirofosfat|PP<sub>i</sub>]] |
||
| Línia 14: | Línia 14: | ||
S’ha descobert que una petita diferència estructural en la luciferasa és la responsable del canvi del color d’emissió de la luminescència de groc verdós a vermell. En un estudi, es van analitzar les estructures de la luciferasa salvatge i la luciferasa mutant de color vermell (S286N), provinent de la cuca de llum japonesa anomenada Genji-Botaru (Luciola cruciata), en associació amb DLSA.<ref name="pmid16541080">{{cite journal |author = Nakatsu T, Ichiyama S, Hiratake J, Saldanha A, Kobashi N, Sakata K, Kato H | title = Structural basis for the spectral difference in luciferase bioluminescence | journal = Nature | volume = 440 | issue = 7082 | pages = 372–6 | year = 2006 | month = March | pmid = 16541080 | doi = 10.1038/nature04542| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16541080 | issn = }}</ref> |
S’ha descobert que una petita diferència estructural en la luciferasa és la responsable del canvi del color d’emissió de la luminescència de groc verdós a vermell. En un estudi, es van analitzar les estructures de la luciferasa salvatge i la luciferasa mutant de color vermell (S286N), provinent de la cuca de llum japonesa anomenada Genji-Botaru (Luciola cruciata), en associació amb DLSA.<ref name="pmid16541080">{{cite journal |author = Nakatsu T, Ichiyama S, Hiratake J, Saldanha A, Kobashi N, Sakata K, Kato H | title = Structural basis for the spectral difference in luciferase bioluminescence | journal = Nature | volume = 440 | issue = 7082 | pages = 372–6 | year = 2006 | month = March | pmid = 16541080 | doi = 10.1038/nature04542| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16541080 | issn = }}</ref> |
||
El resultats de l'estudi van demostrar que la luciferasa salvatge unida a la DLSA presentava una “forma tancada” del seu centre actiu, on la cadena lateral de l’aminoàcid 288 ([[isoleucina]]) es trobava desplaçada cap a l’anell [[benzotiazol]] de la DLSA, creant una zona hidròfoba de caràcter rígid. Això provocava una reducció de la pèrdua d'energia que es reflectia en l'emissió d'una llum verda grogosa. |
El resultats de l'estudi van demostrar que la luciferasa salvatge unida a la DLSA presentava una “forma tancada” del seu centre actiu, on la cadena lateral de l’aminoàcid 288 ([[isoleucina]]) es trobava desplaçada cap a l’anell [[benzotiazol]] de la DLSA, creant una zona hidròfoba de caràcter rígid. Això provocava una reducció de la pèrdua d'energia que es reflectia en l'emissió d'una llum verda grogosa. |
||
Per altra banda, la luciferasa mutant S286N unida a la DLSA presentava una “forma oberta” del centre actiu, on la cadena lateral de la isoleucina 288 no es trobava desplaçada en direcció a l’anell benzotiazol de la DLSA, creant així un entorn menys rígid i hidròfob. Aquest nou ambient permetia la pèrdua d’una petita quantitat d’energia de l’estat excitat de l’oxiluciferina, que es traduïa en l’emissió de llum vermella de baixa energia. |
Per altra banda, la luciferasa mutant S286N unida a la DLSA presentava una “forma oberta” del centre actiu, on la cadena lateral de la isoleucina 288 no es trobava desplaçada en direcció a l’anell benzotiazol de la DLSA, creant així un entorn menys rígid i hidròfob. Aquest nou ambient permetia la pèrdua d’una petita quantitat d’energia de l’estat excitat de l’oxiluciferina, que es traduïa en l’emissió de llum vermella de baixa energia. |
||
| Línia 23: | Línia 23: | ||
En les cuques de llum, l’oxigen necessari és aportat a través d’un conducte situat a l’abdomen anomenat tràquea abdominal. La luciferasa és característica de cada espècie de cuca de llum, que es calcula que en són més de 2000. No obstant això, la luciferasa més estudiada és la de la cuca de llum Photinini Photinus pyralis, que té un pH òptim de 7,8.<ref name="pmid9806891">{{cite journal | author = Steghens JP, Min KL, Bernengo JC | title = Firefly luciferase has two nucleotide binding sites: effect of nucleoside monophosphate and CoA on the light-emission spectra | journal = Biochem. J. | volume = 336 ( Pt 1) | issue = | pages = 109–13 | year = 1998 | month = November | pmid = 9806891 | pmc = 1219848 | url = http://www.biochemj.org/bj/336/0109/bj3360109.htm | issn = }}</ref> |
En les cuques de llum, l’oxigen necessari és aportat a través d’un conducte situat a l’abdomen anomenat tràquea abdominal. La luciferasa és característica de cada espècie de cuca de llum, que es calcula que en són més de 2000. No obstant això, la luciferasa més estudiada és la de la cuca de llum Photinini Photinus pyralis, que té un pH òptim de 7,8.<ref name="pmid9806891">{{cite journal | author = Steghens JP, Min KL, Bernengo JC | title = Firefly luciferase has two nucleotide binding sites: effect of nucleoside monophosphate and CoA on the light-emission spectra | journal = Biochem. J. | volume = 336 ( Pt 1) | issue = | pages = 109–13 | year = 1998 | month = November | pmid = 9806891 | pmc = 1219848 | url = http://www.biochemj.org/bj/336/0109/bj3360109.htm | issn = }}</ref> |
||
Una altra luciferasa ben estudiada és la de la Renilla reniformis. En aquest organisme, la luciferasa està fortament associada a una proteïna lligand de luciferina, així com a una ''green fluorescent protein'' ([[GFP]]). El calci provoca l’alliberament de la luciferina (colenterazina) per part de la proteïna lligand de luciferina. Aleshores, el substrat es troba disponible per tal que la luciferasa l’oxidi i sigui degradat a coelenteramida amb una emissió d’energia com a resultat. |
Una altra luciferasa ben estudiada és la de la Renilla reniformis. En aquest organisme, la luciferasa està fortament associada a una proteïna lligand de luciferina, així com a una ''green fluorescent protein'' ([[GFP]]). El calci provoca l’alliberament de la luciferina (colenterazina) per part de la proteïna lligand de luciferina. Aleshores, el substrat es troba disponible per tal que la luciferasa l’oxidi i sigui degradat a coelenteramida amb una emissió d’energia com a resultat. |
||
En absència de la GFP, aquesta energia és alliberada en forma de fotó de llum blava (la seva longitud d’ona màxima és de 482 nm). D’altra banda, en els casos en què la GFP es troba fortament associada, l’energia s’allibera com a un fotó de llum verda (la seva longitud d’ona màxima és de 510 nm). |
En absència de la GFP, aquesta energia és alliberada en forma de fotó de llum blava (la seva longitud d’ona màxima és de 482 nm). D’altra banda, en els casos en què la GFP es troba fortament associada, l’energia s’allibera com a un fotó de llum verda (la seva longitud d’ona màxima és de 510 nm). |
||
La reacció catalitzada és la següent:<ref name="pmid2871634">{{cite journal | author = Shimomura O | title = Bioluminescence in the sea: photoprotein systems | journal = Symp. Soc. Exp. Biol. | volume = 39 | issue = | pages = 351–72 | year = 1985 | pmid = 2871634 | doi = | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2871634 | issn = }}</ref> |
La reacció catalitzada és la següent:<ref name="pmid2871634">{{cite journal | author = Shimomura O | title = Bioluminescence in the sea: photoprotein systems | journal = Symp. Soc. Exp. Biol. | volume = 39 | issue = | pages = 351–72 | year = 1985 | pmid = 2871634 | doi = | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2871634 | issn = }}</ref> |
||
* [[coelenterazina]] + [[Oxigen|O<sub>2</sub>]] → coelenteramida + [[diòxid de carboni|CO<sub>2</sub>]] + fotó de llum |
* [[coelenterazina]] + [[Oxigen|O<sub>2</sub>]] → coelenteramida + [[diòxid de carboni|CO<sub>2</sub>]] + fotó de llum |
||
Recentment, s’ha identificat un nou tipus de luciferasa, que a diferència de les luciferases de les cuques de llum, és secretada de manera natural. Un d'aquests exemples és la luciferasa Metridia (MetLuc), que prové del copèpodes Metrina Longa. |
Recentment, s’ha identificat un nou tipus de luciferasa, que a diferència de les luciferases de les cuques de llum, és secretada de manera natural. Un d'aquests exemples és la luciferasa Metridia (MetLuc), que prové del copèpodes Metrina Longa. |
||
La luciferasa Metrina Longa segrega gens codificats de 24 kDa que contenen un pèptid senyal de 17 residus d’aminoàcids. S’ha descobert que l’alta sensibilitat i intensitat del senyal d’aquesta luciferasa té nombrosos avantatges. A més, la utilització d'aquesta luciferasa específica permet seguir un protocol de no-lisi i fer diversos assaigs amb una mateixa cèl·lula viva.<ref name="PMID: 19277688">{{cite journal | author = Baldwin TO | last2 = Lee | first2 = Jongsung | last3 = Jung | first3 = Eunsun | last4 = Kim | first4 = Sang-Cheol | last5 = Kang | first5 = Jung-Il | last6 = Lee | first6 = Jienny | last7 = Kim | first7 = Yong-Woo | last8 = Sung | first8 = Young Kwan | last9 = Kang | first9 = Hee-Kyoung | title = A cell-based system for screening hair growth-promoting agents. | journal = Archives of Dermatological Research | volume = 301, | pages = 381–385 | year = 2009 | month = June | pmid = 8805542 | doi = 10.1007/s00403-009-0931-0| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8805542 | issn = | issue = 3 }}</ref> |
La luciferasa Metrina Longa segrega gens codificats de 24 kDa que contenen un pèptid senyal de 17 residus d’aminoàcids. S’ha descobert que l’alta sensibilitat i intensitat del senyal d’aquesta luciferasa té nombrosos avantatges. A més, la utilització d'aquesta luciferasa específica permet seguir un protocol de no-lisi i fer diversos assaigs amb una mateixa cèl·lula viva.<ref name="PMID: 19277688">{{cite journal | author = Baldwin TO | last2 = Lee | first2 = Jongsung | last3 = Jung | first3 = Eunsun | last4 = Kim | first4 = Sang-Cheol | last5 = Kang | first5 = Jung-Il | last6 = Lee | first6 = Jienny | last7 = Kim | first7 = Yong-Woo | last8 = Sung | first8 = Young Kwan | last9 = Kang | first9 = Hee-Kyoung | title = A cell-based system for screening hair growth-promoting agents. | journal = Archives of Dermatological Research | volume = 301, | pages = 381–385 | year = 2009 | month = June | pmid = 8805542 | doi = 10.1007/s00403-009-0931-0| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8805542 | issn = | issue = 3 }}</ref> |
||
| Línia 36: | Línia 36: | ||
*En la reacció de la luciferasa, s’emet llum quan aquesta actua sobre la luciferina. L’emissió dels fotons pot ser detectada per un aparell sensible a la llum com ara el luminòmetre o microscòpics òptics modificats. Aquest fet permet l’observació de processos biològics.<ref name="urlIntroduction to Bioluminescence Assays">{{cite web | url = http://www.promega.com/multimedia/bioLum01.htm | title = Introduction to Bioluminescence Assays | author = | authorlink = | coauthors = | date = | work = | publisher = Promega Corporation | pages = | language = | archiveurl = | archivedate = | quote = | accessdate = 2009-03-07}}</ref> |
*En la reacció de la luciferasa, s’emet llum quan aquesta actua sobre la luciferina. L’emissió dels fotons pot ser detectada per un aparell sensible a la llum com ara el luminòmetre o microscòpics òptics modificats. Aquest fet permet l’observació de processos biològics.<ref name="urlIntroduction to Bioluminescence Assays">{{cite web | url = http://www.promega.com/multimedia/bioLum01.htm | title = Introduction to Bioluminescence Assays | author = | authorlink = | coauthors = | date = | work = | publisher = Promega Corporation | pages = | language = | archiveurl = | archivedate = | quote = | accessdate = 2009-03-07}}</ref> |
||
*En la recerca biològica, la luciferasa s’utilitza normalment per avaluar l’activitat transcripcional de cèl·lules a les quals se’ls introdueix una construcció genètica que conté el gen de luciferasa sota el control d’un [[promotor]] d’interès.<ref name="fanwood">{{cite journal | author = Fan F, Wood KV | title = Bioluminescent assays for high-throughput screening | journal = Assay Drug Dev Technol | volume = 5 | issue = 1 | pages = 127–36 | year = 2007 | month = February | pmid = 17355205 | doi = 10.1089/adt.2006.053 | url = http://www.liebertonline.com/doi/abs/10.1089/adt.2006.053 | issn = }}</ref> A més a més, també es pot utilitzar per detectar el nivell d’ATP cel·lular i l’activitat de les quinases.<ref name=fanwood/><ref name="promega">{{cite journal | author = Meisenheimer PL, O’Brien MA, Cali JJ | title = Luminogenic enzyme substrates: The basis for a new paradigm in assay design. | journal = Promega Notes | volume = 100 | issue = | pages = 22–26 | year = 2008 | month = September | pmid = | url = http://www.promega.com/pnotes/100/16620_22/16620_22.pdf | issn = }}</ref> |
*En la recerca biològica, la luciferasa s’utilitza normalment per avaluar l’activitat transcripcional de cèl·lules a les quals se’ls introdueix una construcció genètica que conté el gen de luciferasa sota el control d’un [[promotor]] d’interès.<ref name="fanwood">{{cite journal | author = Fan F, Wood KV | title = Bioluminescent assays for high-throughput screening | journal = Assay Drug Dev Technol | volume = 5 | issue = 1 | pages = 127–36 | year = 2007 | month = February | pmid = 17355205 | doi = 10.1089/adt.2006.053 | url = http://www.liebertonline.com/doi/abs/10.1089/adt.2006.053 | issn = }}</ref> A més a més, també es pot utilitzar per detectar el nivell d’ATP cel·lular i l’activitat de les quinases.<ref name=fanwood/><ref name="promega">{{cite journal | author = Meisenheimer PL, O’Brien MA, Cali JJ | title = Luminogenic enzyme substrates: The basis for a new paradigm in assay design. | journal = Promega Notes | volume = 100 | issue = | pages = 22–26 | year = 2008 | month = September | pmid = | url = http://www.promega.com/pnotes/100/16620_22/16620_22.pdf | issn = }}</ref> |
||
*Diversos tipus de cèl·lules com per exemple les cèl·lules mare de la medul·la òssia o cèl·lules T es poden modificar per a expressar una luciferasa, fet que permet que es puguin observar dins de l'animal de manera no invasiva utilitzant un dispositiu de càrrega acoblada. Aquesta tècnica s’utilitza per fer un seguiment del desenvolupament de certs tumors i analitzar la seva resposta a un determinat tractament en animals model.<ref name="pmid14612492">{{cite journal | author = Lyons SK, Meuwissen R, Krimpenfort P, Berns A | title = The generation of a conditional reporter that enables bioluminescence imaging of Cre/loxP-dependent tumorigenesis in mice | journal = Cancer Res. | volume = 63 | issue = 21 | pages = 7042–6 | year = 2003 | month = November | pmid = 14612492 | url = http://cancerres.aacrjournals.org/cgi/content/abstract/63/21/7042 | issn = }}</ref><ref name="pmid16585152">{{cite journal | author = Becher OJ, Holland EC | title = Genetically engineered models have advantages over xenografts for preclinical studies | journal = Cancer Res. | volume = 66 | issue = 7 | pages = 3355–8, discussion 3358–9 | year = 2006 | month = April | pmid = 16585152 | doi = 10.1158/0008-5472.CAN-05-3827 | url = http://cancerres.aacrjournals.org/content/66/7/3355| issn = }}</ref> Tot i això, cal tenir en compte que la intensitat del senyal mesurat mitjançant la projecció in vivo pot dependre de diferents factors com ara l’absorció de la D-luciferina a través del peritoneu, el flux sanguini, la permeabilitat de la membrana cel·lular, la disponibilitat de cofactors, el pH intracel·lular i la transparència del teixit que el recobreix, a més de la quantitat de luciferasa.<ref>Inoue, Y., Tojo, A., Sekine, R., Soda, Y., Kobayashi, S., Nomura, A., Izawa, K., Kitamura, T., Okubo, T., & Ohtomo, K. (2006). In vitro validation of bioluminescent monitoring of disease progression and therapeutic response in leukaemia model animals. European Journal of Nuclear Medicine & Molecular Imaging, 33(5), 557-565. </ref> Així doncs, cal tenir en compte que aquestes interferències poden causar petites variacions de l'activitat de proliferació del tumor. |
*Diversos tipus de cèl·lules com per exemple les cèl·lules mare de la medul·la òssia o cèl·lules T es poden modificar per a expressar una luciferasa, fet que permet que es puguin observar dins de l'animal de manera no invasiva utilitzant un dispositiu de càrrega acoblada. Aquesta tècnica s’utilitza per fer un seguiment del desenvolupament de certs tumors i analitzar la seva resposta a un determinat tractament en animals model.<ref name="pmid14612492">{{cite journal | author = Lyons SK, Meuwissen R, Krimpenfort P, Berns A | title = The generation of a conditional reporter that enables bioluminescence imaging of Cre/loxP-dependent tumorigenesis in mice | journal = Cancer Res. | volume = 63 | issue = 21 | pages = 7042–6 | year = 2003 | month = November | pmid = 14612492 | url = http://cancerres.aacrjournals.org/cgi/content/abstract/63/21/7042 | issn = }}</ref><ref name="pmid16585152">{{cite journal | author = Becher OJ, Holland EC | title = Genetically engineered models have advantages over xenografts for preclinical studies | journal = Cancer Res. | volume = 66 | issue = 7 | pages = 3355–8, discussion 3358–9 | year = 2006 | month = April | pmid = 16585152 | doi = 10.1158/0008-5472.CAN-05-3827 | url = http://cancerres.aacrjournals.org/content/66/7/3355| issn = }}</ref> Tot i això, cal tenir en compte que la intensitat del senyal mesurat mitjançant la projecció in vivo pot dependre de diferents factors com ara l’absorció de la D-luciferina a través del peritoneu, el flux sanguini, la permeabilitat de la membrana cel·lular, la disponibilitat de cofactors, el pH intracel·lular i la transparència del teixit que el recobreix, a més de la quantitat de luciferasa.<ref>Inoue, Y., Tojo, A., Sekine, R., Soda, Y., Kobayashi, S., Nomura, A., Izawa, K., Kitamura, T., Okubo, T., & Ohtomo, K. (2006). In vitro validation of bioluminescent monitoring of disease progression and therapeutic response in leukaemia model animals. European Journal of Nuclear Medicine & Molecular Imaging, 33(5), 557-565. </ref> Així doncs, cal tenir en compte que aquestes interferències poden causar petites variacions de l'activitat de proliferació del tumor. |
||
*Una de les aplicacions més conegudes de la luciferasa es troba dins del camp de la medicina forense. Aquest enzim s'utilitza en bancs de sang per determinar si els [[glòbuls vermells]] de la sang, anomenats també eritròcits, estan començant a trencar-se. Els investigadors forenses fan servir una solució diluïda que conté l’enzim per descobrir restes de sang que puguin estar a la superfície de l’escena d’un crim. |
*Una de les aplicacions més conegudes de la luciferasa es troba dins del camp de la medicina forense. Aquest enzim s'utilitza en bancs de sang per determinar si els [[glòbuls vermells]] de la sang, anomenats també eritròcits, estan començant a trencar-se. Els investigadors forenses fan servir una solució diluïda que conté l’enzim per descobrir restes de sang que puguin estar a la superfície de l’escena d’un crim. |
||
* La luciferasa és una proteïna sensible a la calor i s’utilitza en estudis de desnaturalització de proteïnes per avaluar la capacitat protectora de les proteïnes de xoc tèrmic ([[HSP]]). |
* La luciferasa és una proteïna sensible a la calor i s’utilitza en estudis de desnaturalització de proteïnes per avaluar la capacitat protectora de les proteïnes de xoc tèrmic ([[HSP]]). |
||
Revisió del 05:31, 26 jul 2020
La luciferasa és un enzim oxidatiu que catalitza l'oxidació de la luciferina i provoca la bioluminescència; és a dir, la producció de llum en organismes vius. El seu nom deriva de l'expressió llatina lucem ferre que significa portador de llum. És present en certs insectes i mol·luscs, tot i que l'exemple més conegut és la luciferasa de les femelles dels lampírids, conegudes vulgarment amb el nom de lluernes o cuques de llum.
A diferència de les fotoproteïnes, que emeten luminescència de forma proporcional a la quantitat de proteïna, l'emissió de llum en el cas de la luciferasa es basa en una reacció formada per un complex enzim (luciferasa) - substrat (luciferina).
Reacció química
En reaccions de bioluminescència, l'emissió lluminosa es produeix gràcies a l'oxidació d’un pigment anomenat luciferina, que es troba principalment en alguns bacteris, algues, fongs i animals.
- luciferina + O2 → oxiluciferina + llum
Les reaccions més habituals de bioluminescència alliberen CO2 com a producte. La velocitat de la reacció entre la luciferina i l’oxigen és extremadament lenta fins que no és catalitzada per la luciferasa. Aquesta reacció entre la luciferina i la luciferasa a vegades està controlada per la presència de cofactors, tals com ions calci, ions Magnesi o l'ATP.[1] La reacció catalitzada per la luciferasa de les cuques de llum es duu a terme en dos passos:
- luciferina + ATP → adenilat de luciferina + PPi
- Adenilat de luciferina + O2 → oxiluciferina + AMP + llum
La reacció és energèticament molt eficient, ja que gairebé tota l’energia es transforma en llum. En comparació, la bombeta incandescent només converteix el 10% de la seva energia en llum.[2]
Diferència espectral en la bioluminescència de la luciferasa
S’ha descobert que una petita diferència estructural en la luciferasa és la responsable del canvi del color d’emissió de la luminescència de groc verdós a vermell. En un estudi, es van analitzar les estructures de la luciferasa salvatge i la luciferasa mutant de color vermell (S286N), provinent de la cuca de llum japonesa anomenada Genji-Botaru (Luciola cruciata), en associació amb DLSA.[3]
El resultats de l'estudi van demostrar que la luciferasa salvatge unida a la DLSA presentava una “forma tancada” del seu centre actiu, on la cadena lateral de l’aminoàcid 288 (isoleucina) es trobava desplaçada cap a l’anell benzotiazol de la DLSA, creant una zona hidròfoba de caràcter rígid. Això provocava una reducció de la pèrdua d'energia que es reflectia en l'emissió d'una llum verda grogosa.
Per altra banda, la luciferasa mutant S286N unida a la DLSA presentava una “forma oberta” del centre actiu, on la cadena lateral de la isoleucina 288 no es trobava desplaçada en direcció a l’anell benzotiazol de la DLSA, creant així un entorn menys rígid i hidròfob. Aquest nou ambient permetia la pèrdua d’una petita quantitat d’energia de l’estat excitat de l’oxiluciferina, que es traduïa en l’emissió de llum vermella de baixa energia.
Exemples
S'ha observat que una gran varietat d’organismes regula la seva producció de llum utilitzant diferents luciferases en diverses reaccions que emeten llum. L’exemple més conegut de tots ells és el de les cuques de llum, tot i que també podem trobar aquest enzim en organismes tan diferents com la gírgola d’olivera (Omphalotus olearius) o nombroses criatures marines i mol·luscs.
En les cuques de llum, l’oxigen necessari és aportat a través d’un conducte situat a l’abdomen anomenat tràquea abdominal. La luciferasa és característica de cada espècie de cuca de llum, que es calcula que en són més de 2000. No obstant això, la luciferasa més estudiada és la de la cuca de llum Photinini Photinus pyralis, que té un pH òptim de 7,8.[4]
Una altra luciferasa ben estudiada és la de la Renilla reniformis. En aquest organisme, la luciferasa està fortament associada a una proteïna lligand de luciferina, així com a una green fluorescent protein (GFP). El calci provoca l’alliberament de la luciferina (colenterazina) per part de la proteïna lligand de luciferina. Aleshores, el substrat es troba disponible per tal que la luciferasa l’oxidi i sigui degradat a coelenteramida amb una emissió d’energia com a resultat. En absència de la GFP, aquesta energia és alliberada en forma de fotó de llum blava (la seva longitud d’ona màxima és de 482 nm). D’altra banda, en els casos en què la GFP es troba fortament associada, l’energia s’allibera com a un fotó de llum verda (la seva longitud d’ona màxima és de 510 nm).
La reacció catalitzada és la següent:[5]
- coelenterazina + O2 → coelenteramida + CO2 + fotó de llum
Recentment, s’ha identificat un nou tipus de luciferasa, que a diferència de les luciferases de les cuques de llum, és secretada de manera natural. Un d'aquests exemples és la luciferasa Metridia (MetLuc), que prové del copèpodes Metrina Longa. La luciferasa Metrina Longa segrega gens codificats de 24 kDa que contenen un pèptid senyal de 17 residus d’aminoàcids. S’ha descobert que l’alta sensibilitat i intensitat del senyal d’aquesta luciferasa té nombrosos avantatges. A més, la utilització d'aquesta luciferasa específica permet seguir un protocol de no-lisi i fer diversos assaigs amb una mateixa cèl·lula viva.[6]
Aplicacions
La luciferasa es pot sintetitzar al laboratori mitjançant l'enginyeria genètica per a diferents utilitats. Els gens de la luciferasa es poden sintetitzar i introduir dins dels organismes o transferir-los dins de les cèl·lules. Alguns dels organismes que han estat modificats genèticament per produir aquest enzim són els ratolins, els cucs de seda i les patates.[7] La luciferasa s’utilitza cada vegada més en més àmbits, així que les seves aplicacions segueixen creixent i sent més nombroses.[8] Entre elles cal destacar:
- En la reacció de la luciferasa, s’emet llum quan aquesta actua sobre la luciferina. L’emissió dels fotons pot ser detectada per un aparell sensible a la llum com ara el luminòmetre o microscòpics òptics modificats. Aquest fet permet l’observació de processos biològics.[9]
- En la recerca biològica, la luciferasa s’utilitza normalment per avaluar l’activitat transcripcional de cèl·lules a les quals se’ls introdueix una construcció genètica que conté el gen de luciferasa sota el control d’un promotor d’interès.[10] A més a més, també es pot utilitzar per detectar el nivell d’ATP cel·lular i l’activitat de les quinases.[10][11]
- Diversos tipus de cèl·lules com per exemple les cèl·lules mare de la medul·la òssia o cèl·lules T es poden modificar per a expressar una luciferasa, fet que permet que es puguin observar dins de l'animal de manera no invasiva utilitzant un dispositiu de càrrega acoblada. Aquesta tècnica s’utilitza per fer un seguiment del desenvolupament de certs tumors i analitzar la seva resposta a un determinat tractament en animals model.[12][13] Tot i això, cal tenir en compte que la intensitat del senyal mesurat mitjançant la projecció in vivo pot dependre de diferents factors com ara l’absorció de la D-luciferina a través del peritoneu, el flux sanguini, la permeabilitat de la membrana cel·lular, la disponibilitat de cofactors, el pH intracel·lular i la transparència del teixit que el recobreix, a més de la quantitat de luciferasa.[14] Així doncs, cal tenir en compte que aquestes interferències poden causar petites variacions de l'activitat de proliferació del tumor.
- Una de les aplicacions més conegudes de la luciferasa es troba dins del camp de la medicina forense. Aquest enzim s'utilitza en bancs de sang per determinar si els glòbuls vermells de la sang, anomenats també eritròcits, estan començant a trencar-se. Els investigadors forenses fan servir una solució diluïda que conté l’enzim per descobrir restes de sang que puguin estar a la superfície de l’escena d’un crim.
- La luciferasa és una proteïna sensible a la calor i s’utilitza en estudis de desnaturalització de proteïnes per avaluar la capacitat protectora de les proteïnes de xoc tèrmic (HSP).
Referències
- ↑ «EC 1.13.12.5». IUBMB Enzyme Nomenclature. Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB). [Consulta: 2 octubre 2008].
- ↑ General Electric TP-110, page 23, table.
- ↑ Nakatsu T, Ichiyama S, Hiratake J, Saldanha A, Kobashi N, Sakata K, Kato H «Structural basis for the spectral difference in luciferase bioluminescence». Nature, vol. 440, 7082, March 2006, pàg. 372–6. DOI: 10.1038/nature04542. PMID: 16541080.
- ↑ Steghens JP, Min KL, Bernengo JC «Firefly luciferase has two nucleotide binding sites: effect of nucleoside monophosphate and CoA on the light-emission spectra». Biochem. J., vol. 336 ( Pt 1), November 1998, pàg. 109–13. PMC: 1219848. PMID: 9806891.
- ↑ Shimomura O «Bioluminescence in the sea: photoprotein systems». Symp. Soc. Exp. Biol., vol. 39, 1985, pàg. 351–72. PMID: 2871634.
- ↑ Baldwin TO; Lee, Jongsung; Jung, Eunsun; Kim, Sang-Cheol; Kang, Jung-Il; Lee, Jienny; Kim, Yong-Woo; Sung, Young Kwan; Kang, Hee-Kyoung «A cell-based system for screening hair growth-promoting agents.». Archives of Dermatological Research, vol. 301,, 3, June 2009, pàg. 381–385. DOI: 10.1007/s00403-009-0931-0. PMID: 8805542.
- ↑ Contag CH, Bachmann MH «Advances in in vivo bioluminescence imaging of gene expression». Annu Rev Biomed Eng, vol. 4, 2002, pàg. 235–60. DOI: 10.1146/annurev.bioeng.4.111901.093336. PMID: 12117758.
- ↑ Massoud TF, Paulmurugan R, De A, Ray P, Gambhir SS «Reporter gene imaging of protein-protein interactions in living subjects». Curr. Opin. Biotechnol., vol. 18, 1, February 2007, pàg. 31–7. DOI: 10.1016/j.copbio.2007.01.007. PMID: 17254764.
- ↑ «Introduction to Bioluminescence Assays». Promega Corporation. [Consulta: 7 març 2009].
- ↑ 10,0 10,1 Fan F, Wood KV «Bioluminescent assays for high-throughput screening». Assay Drug Dev Technol, vol. 5, 1, February 2007, pàg. 127–36. DOI: 10.1089/adt.2006.053. PMID: 17355205.
- ↑ Meisenheimer PL, O’Brien MA, Cali JJ «Luminogenic enzyme substrates: The basis for a new paradigm in assay design.». Promega Notes, vol. 100, September 2008, pàg. 22–26.
- ↑ Lyons SK, Meuwissen R, Krimpenfort P, Berns A «The generation of a conditional reporter that enables bioluminescence imaging of Cre/loxP-dependent tumorigenesis in mice». Cancer Res., vol. 63, 21, November 2003, pàg. 7042–6. PMID: 14612492.
- ↑ Becher OJ, Holland EC «Genetically engineered models have advantages over xenografts for preclinical studies». Cancer Res., vol. 66, 7, April 2006, pàg. 3355–8, discussion 3358–9. DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-05-3827. PMID: 16585152.
- ↑ Inoue, Y., Tojo, A., Sekine, R., Soda, Y., Kobayashi, S., Nomura, A., Izawa, K., Kitamura, T., Okubo, T., & Ohtomo, K. (2006). In vitro validation of bioluminescent monitoring of disease progression and therapeutic response in leukaemia model animals. European Journal of Nuclear Medicine & Molecular Imaging, 33(5), 557-565.
Enllaços externs
A Wikimedia Commons hi ha contingut multimèdia relatiu a: Luciferasa
- Trimmer B, Zayas R, Qazi S, Lewis S, Michel T, Dudzinski D, Aprille J, Lagace C. «Firefly flashes and Nitric Oxide». Tufts University, 28-06-2001. [Consulta: 2 octubre 2008]. (anglès)
- «Trends in development of reporter genes». reportergene.com. [Consulta: 7 març 2009]. (anglès)
- «BL Web: Luciferin types». The Bioluminescence Web Page. University of California, Santa Barbara. [Consulta: 7 març 2009]. (anglès)
- «Bioluminescence Reporters Protocols and Applications Guide». Protocols and applications. Promega Corporation. [Consulta: 7 març 2009]. (anglès)
- «BL Web: Luciferin types». ISCID Encyclopedia of Science and Philosophy. ISCID. [Consulta: 20 abril 2010]. (anglès)