TUNAR

TUNAR
Identifikatori
Aliasi	TUNAR
Vanjski ID-jevi	OMIM: 615719 GeneCards: TUNAR
Ortolozi
	100507043
	n/a
	ENSG00000250366
	n/a
	n; a
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Uzvodno pridružena RNK neuronske diferencijacije TCL1 je dugolančana nekodirajuća RNK koja je kod ljudi kodirana genom TUNAR.^[2] Duge nekodirajuće RNK (lncRNK), poput TUNAR -a, su regulatorne RNK s više od po 200 nukleotida, a koje su uključene u ekspresiju gena. LncRNA se transkribiraju pomoću RNK-polimeraza, 5-prim zatvorene, spojene i poliadenilirane (sažetak Lin wt al., 2014).

Kloniranje i ekspresija

Lin et al. (2014) klonirani mišji Tunar, kojeg su nazvali tuna, linc86023 ili Megamind, iz linije CCE mišjih embrionskih matičnih ćelija (mESC). RACE, praćen Northern blotom i analizom baze podataka, otkrio je dvije varijante prerađene tune koje sadrže 3.181 i 2.876 nukleotida. Analiza baze podataka otkrila je ljudski ortolog, koji je aktivno transkribovan u ljudskim ESC-ima H1 i u neuronima, ali ne i neuronskim jedrima, iz mozga juvenilnih i odraslih. Kvantitativna RT-PCR analiza 15 mišjih tkiva, embriona i ćelija otkrila je najveću ekspresiju tune u mozgu odraslih i kičmenoj moždini, sa znatno nižom ekspresijom u očima odraslih, mESC-ima i 15-dnevnim embrijima miša. TUNA je također bio visoko eksprimiran u ljudskom malom mozgu, s nižom ekspresijom u cijelom mozgu odraslih i fetusa te u sjemenicima odraslih. Analiza mikročipova otkrila je ekspresiju TUNA -e u nekoliko regija ljudskog mozga, ali ne i u neokorteksu. Najveća ekspresija otkrivena je u talamusu. Tuna je obogaćen jedarnom frakcijom mESC-a, ali je pronađen i u citoplazmatskoj frakciji.

Funkcija gena

Lin i dr. (2014) otkrili su da je manipulacija ekspresijom tune u mESC -ima uticala na globalnu ekspresiju gena, s izraženim promjenama u genima uključenim u [[ćelijska differencijacija|diferencijaciju ćelija, proliferaciju, ćelijsku smrt i neurogenezu. Tuna je formirao RNK-multiproteinski kompleks sa Ptbp1, Hnrnpk i Ncl. Ovaj kompleks je posebno obogaćen promotorima Sox2, Nanog i Fgf4. Nokautiranje gena tuna u mESC-ovima smanjilo je ekspresiju plućno-moćnih, moždanih i Oct4 (POU5F1) iRNK, dok je prekomjerna ekspresija tune povećala ekspresiju ovih gena i pospješila ćelijdku proliferaciju. Destrukcija TUNA-e također je blokirala neuronsku diferencijaciju u H9 ljudskih ESC -a.

Lin et al. (2014) odredili su da gen TUNAR ima dva egzona. Analizom genomske sekvence locirali su gen TUNAT na hromosomu 14, sekvenca 14q32. Mapirali su i mišji Tunar na hromosomu 12F1.^[3]

Reference

^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: TCL1A upstream neural differentiation-associated RNA". Pristupljeno 24. 2. 2014.
^ Lin, N., Chang, K.-Y., Li, Z., Gates, K., Rana, Z. A., Dang, J., Zhang, D., Han, T., Yang, C.-S., Cunningham, T. J., Head, S. R., Duester, G., Dong, P. D. S., Rana, T. M. An evolutionarily conserved long noncoding RNA TUNA controls pluripotency and neural lineage commitment. Molec. Cell 53: 1005-1019, 2014. Note: Erratum: Molec. Cell 53: 1067 only, 2014. PubMed: 24530304

Dopunska literatura

Ulitsky I, Shkumatava A, Jan CH, Sive H, Bartel DP (decembar 2011). "Conserved function of lincRNAs in vertebrate embryonic development despite rapid sequence evolution". Cell. 147 (7): 1537–50. doi:10.1016/j.cell.2011.11.055. PMC 3376356. PMID 22196729.

[1] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-2] "Entrez Gene: TCL1A upstream neural differentiation-associated RNA". Pristupljeno 24. 2. 2014.

[3] Lin, N., Chang, K.-Y., Li, Z., Gates, K., Rana, Z. A., Dang, J., Zhang, D., Han, T., Yang, C.-S., Cunningham, T. J., Head, S. R., Duester, G., Dong, P. D. S., Rana, T. M. An evolutionarily conserved long noncoding RNA TUNA controls pluripotency and neural lineage commitment. Molec. Cell 53: 1005-1019, 2014. Note: Erratum: Molec. Cell 53: 1067 only, 2014. PubMed: 24530304

[1]

[2]

[3]