Tubulin-specifčni šaperon E jest protein koji je kod ljudi kodiran genom TBCE sa hromosoma 1.[4][5]

TBCE
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4ICU, 4ICV

Identifikatori
AliasiTBCE
Vanjski ID-jeviOMIM: 604934 MGI: 1917680 HomoloGene: 37744 GeneCards: TBCE
Lokacija gena (miš)
Hromosom 13 (miš)
Hrom.Hromosom 13 (miš)[1]
Hromosom 13 (miš)
Genomska lokacija za TBCE
Genomska lokacija za TBCE
Bend13 A1|13 5.29 cMPočetak14,172,534 bp[1]
Kraj14,214,223 bp[1]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija chaperone binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
alpha-tubulin binding
Ćelijska komponenta citoplazma
Mikrotubula
citoskelet
Biološki proces post-chaperonin tubulin folding pathway
Savijanje proteina
GO:0043148 mitotic spindle organization
microtubule cytoskeleton organization
tubulin complex assembly
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_003193
NM_001079515
NM_001287801
NM_001287802

NM_178337

RefSeq (bjelančevina)

NP_001072983
NP_001274730
NP_001274731
NP_003184

NP_848027

Lokacija (UCSC)n/aChr 13: 14.17 – 14.21 Mb
PubMed pretraga[2][3]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 527 aminokiselina, a molekulska težina 59.346 Da.[6]

1020304050
MSDTLTADVIGRRVEVNGEHATVRFAGVVPPVAGPWLGVEWDNPERGKHD
GSHEGTVYFKCRHPTGGSFIRPNKVNFGTDFLTAIKNRYVLEDGPEEDRK
EQIVTIGNKPVETIGFDSIMKQQSQLSKLQEVSLRNCAVSCAGEKGGVAE
ACPNIRKVDLSKNLLSSWDEVIHIADQLRHLEVLNVSENKLKFPSGSVLT
GTLSVLKVLVLNQTGITWAEVLRCVAGCPGLEELYLESNNIFISERPTDV
LQTVKLLDLSSNQLIDENQLYLIAHLPRLEQLILSDTGISSLHFPDAGIG
CKTSMFPSLKYLVVNDNQISQWSFFNELEKLPSLRALSCLRNPLTKEDKE
AETARLLIIASIGQLKTLNKCEILPEERRRAELDYRKAFGNEWKQAGGHK
DPEKNRLSEEFLTAHPRYQFLCLKYGAPEDWELKTQQPLMLKNQLLTLKI
KYPHQLDQKVLEKQLPGSMTIQKVKGLLSRLLKVPVSDLLLSYESPKKPG
REIELENDLKSLQFYSVENGDCLLVRW

Funkcija

uredi

Kofaktor E je jedan od četiri proteina (kofaktori A, D, E i C) koji su uključeni u put koji vodi do pravilno presavijenog beta-tubulina iz međuprodukata savijanja. Vjeruje se da kofaktori A i D igraju ulogu u hvatanju i stabilizaciji intermedijera beta-tubulina u kvazi-nativnoj potvrdi. Kofaktor E vezuje se za kofaktor D/beta-tubulinskog kompleksa; interakcija sa kofaktorom C tada uzrokuje oslobađanje beta-tubulinskih polipeptida koji su predani nativnom stanju. Za ovaj gen su pronađene dvije varijante transkripta koje kodiraju isti protein.[5]

U Sanjad-Sakatijevom sindromu gen TBCE je ili deletiran ili mutiran.

References

uredi
  1. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039233 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ Tian G, Huang Y, Rommelaere H, Vandekerckhove J, Ampe C, Cowan NJ (Sep 1996). "Pathway leading to correctly folded beta-tubulin". Cell. 86 (2): 287–96. doi:10.1016/S0092-8674(00)80100-2. PMID 8706133. S2CID 18359371.
  5. ^ a b "Entrez Gene: TBCE tubulin folding cofactor E".
  6. ^ "UniProt, Q15813" (jezik: engleski). Pristupljeno 20. 12. 2021.

Dopunska litreratura

uredi