Mala C/D kutijska nukleolusna RNK 24 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SNORD24, na hromosomu 9.[3]

SNORD24
Identifikatori
AliasiSNORD24
Vanjski ID-jeviGeneCards: SNORD24
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za SNORD24
Genomska lokacija za SNORD24
Bend9q34.2Početak133,349,396 bp[1]
Kraj133,349,470 bp[1]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

n/a

n/a

RefSeq (bjelančevina)

n/a

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 9: 133.35 – 133.35 Mbn/a
PubMed pretraga[2]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Prema računarskim pretraživanjima banaka sekvenci, u jednoj studiji pozitivno su identificirali novu intronsku snoRNK, U24, kodiranu u genu ribosomnog proteina L7a kod ljudi i kokošo. Kao i ranije prijavljene intronske snoRNK, U24 je lišen 5'-trimetil-kapice. U24 je imunoprecipitiran antifibrilarinskim antitijelom i pokazuje isključivo jedolarnu lokalizaciju u fluorescentnom mikroskopijom nakon in situ hibridizacije s antisensnim oligonukleotidima. U kičmenjaka, U24 je 76 nt duga konzervirana RNK koja je metabolički stabilna, prisutna u približno 14 000 molekula po ljudskoj HeLa ćeliji.

U24 ima 5'-3 'terminalnu C-kutiju D-strukture sa matičnim kutijama, tipsku za nekoliko snoRNK i sadrži dvije 12 nt duge konzervirane sekvence komplementarne 28S rRNK. Stoga je izrazito povezana sa U14, U20 i U21 snoRNK koje također posjeduju duge sekvence komplementarne sa konzerviranim sekvencama zrelih 18S ili 28S rRNK. U 28S rRNK dva trakta koja su komplementarna U24 susjedna su, uključujući nekoliko metiliranih nukleotida i iznenađujuće su blizu, unutar sekundarne strukture rRNK, komplementarnosti snoRNK U18 i U21. Identifikacija gena U24 kvasca Saccharomyces cerevisiae izravno potvrđuje izvanrednu konzerviranost komplementarnosti s 28S rRNK tokom evolucije, ukazujući na ključnu ulogu uparivanja U24 s pre-rRNK u procesu biogeneze ribosoma, što je moguće u kontroli savijanja pre-rRNK. U24 S.cerevisiae je također kodiran intronom, ali nije u istom genu domaćinu kao kod ljudi ili kokoši.[4]

Reference

uredi
  1. ^ a b c ENSG00000280889 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000206611, ENSG00000280889 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ "Entrez Gene: Small nucleolar RNA, C/D box 24".
  4. ^ L H Qu, Y Henry, M Nicoloso, B Michot, M C Azum, M H Renalier, M Caizergues-Ferrer, J P Bachellerie (1995): U24, a novel intron-encoded small nucleolar RNA with two 12 nt long, phylogenetically conserved complementarities to 28S rRNA. Nucleic Acids Res. 23(14):2669-76; pmid: 7651828: pmcid: pmc307091; doi: 10.1093/nar/23.14.2669