Shugoshin-liki prorein 2 (S. pombe), znan I kao SGOL2, jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SGOL2 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom sa hromosoma 2.[5][6]

SGOL2
Identifikatori
AliasiSGO2
Vanjski ID-jeviOMIM: 612425 MGI: 1098767 HomoloGene: 51867 GeneCards: SGO2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 2 (čovjek)
Hrom.Hromosom 2 (čovjek)[1]
Hromosom 2 (čovjek)
Genomska lokacija za SGOL2
Genomska lokacija za SGOL2
Bend2q33.1Početak200,510,008 bp[1]
Kraj200,584,096 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za SGOL2
Genomska lokacija za SGOL2
Bend1 C1.3|1 28.86 cMPočetak58,035,130 bp[2]
Kraj58,065,058 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta hromosom
citosol
Primarno suženje
jedro
kinetohor
GO:0034990 mitotic cohesin complex
nukleoplazma
nuclear body
Biološki proces Ćelijska dioba
hromosomska segregacija
ćelijski ciklus
meiotic sister chromatid cohesion, centromeric
GO:0007126 Mejoza
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001160033
NM_001160046
NM_152524

NM_001177867
NM_199007

RefSeq (bjelančevina)

NP_001153505
NP_001153518
NP_689737

NP_001171338
NP_950172

Lokacija (UCSC)Chr 2: 200.51 – 200.58 MbChr 1: 58.04 – 58.07 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 1.265 aminokiselina, a molekulska težina 144.739 Da.[7]

1020304050
MECPVMETGSLFTSGIKRHLKDKRISKTTKLNVSLASKIKTKILNNSSIF
KISLKHNNRALAQALSREKENSRRITTEKMLLQKEVEKLNFENTFLRLKL
NNLNKKLIDIEALMNNNLITAIEMSSLSEFHQSSFLLSASKKKRISKQCK
LMRLPFARVPLTSNDDEDEDKEKMQCDNNIKSKTLPDIPSSGSTTQPLST
QDNSEVLFLKENNQNVYGLDDSEHISSIVDVPPRESHSHSDQSSKTSLMS
EMRNAQSIGRRWEKPSPSNVTERKKRGSSWESNNLSADTPCATVLDKQHI
SSPELNCNNEINGHTNETNTEMQRNKQDLPGLSSESAREPNAECMNQIED
NDDFQLQKTVYDADMDLTASEVSKIVTVSTGIKKKSNKKTNEHGMKTFRK
VKDSSSEKKRERSKRQFKNSSDVDIGEKIENRTERSDVLDGKRGAEDPGF
IFNNEQLAQMNEQLAQVNELKKMTLQTGFEQGDRENVLCNKKEKRITNEQ
EETYSLSQSSGKFHQESKFDKGQNSLTCNKSKASRQTFVIHKLEKDNLLP
NQKDKVTIYENLDVTNEFHTANLSTKDNGNLCDYGTHNILDLKKYVTDIQ
PSEQNESNINKLRKKVNRKTEIISGMNHMYEDNDKDVVHGLKKGNFFFKT
QEDKEPISENIEVSKELQIPALSTRDNENQCDYRTQNVLGLQKQITNMYP
VQQNESKVNKKLRQKVNRKTEIISEVNHLDNDKSIEYTVKSHSLFLTQKD
KEIIPGNLEDPSEFETPALSTKDSGNLYDSEIQNVLGVKHGHDMQPACQN
DSKIGKKPRLNVCQKSEIIPETNQIYENDNKGVHDLEKDNFFSLTPKDKE
TISENLQVTNEFQTVDLLIKDNGNLCDYDTQNILELKKYVTDRKSAEQNE
SKINKLRNKVNWKTEIISEMNQIYEDNDKDAHVQESYTKDLDFKVNKSKQ
KLECQDIINKHYMEVNSNEKESCDQILDSYKVVKKRKKESSCKAKNILTK
AKNKLASQLTESSQTSISLESDLKHITSEADSDPGNPVELCKTQKQSTTT
LNKKDLPFVEEIKEGECQVKKVNKMTSKSKKRKTSIDPSPESHEVMERIL
DSVQGKSTVSEQADKENNLENEKMVKNKPDFYTKAFRSLSEIHSPNIQDS
SFDSVREGLVPLSVSSGKNVIIKENFALECSPAFQVSDDEHEKMNKMKFK
VNRRTQKSGIGDRPLQDLSNTSFVSNNTAESENKSEDLSSERTSRRRRCT
PFYFKEPSLRDKMRR

Funkcija

uredi

Shugoshin-liki protein 2 (SGOL2) je jedan od dva sisarska ortologa iz Shugoshin/Mei-S322 porodice proteina koji regulišu sestrinsku hromatidnunu koheziju zaštitom integriteta multiproteinskog kompleksa nazvanog kohezin.[8] Ovaj zaštitni sistem je neophodan za vjernu segregaciju hromosoma tokom mitoza i mejoza, što je fizička osnova Mendelovog nasljeđa.

Modelni organizmi

uredi
Fenotip Sgol2 nokaut-miševa
Svojstvo Fenotip
Vijabilnost homozigota Normalan
Plodnost Normalan
Tlelesna težina Normalan
Anksioznost otgvorenog polja Normalan
Neurološka procjena Normalan
Jačina stiska Normalan
Test vruće ploče Normalan
Dismorfologija Normalan
Indirektna kalorimetrija Normalan
Test tolerancije glukoze Normalan
Slušni odgovor moždanog stabla Normalan
DEXA Normalan
Radiografija Normalan
Tjelasna temperatura Normalan
Morfologija oka Normalan
Klinička hemija Normalan
Hematologija Normalan
Mikronukleus test Normalan
Težina srca Normalan
Histopatologija kože Normalan
Salmonella infekcija Normalan[9]
Citrobacter infekcija Normalan[10]
  • Svi testovi i analuitze su prema[11][12]

|[13][14][15]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163535 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026039 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: SGOL2 shugoshin-like 2 (S. pombe)".
  6. ^ Kitajima TS; Kawashima SA; Watanabe Y (februar 2004). "The conserved kinetochore protein shugoshin protects centromeric cohesion during meiosis". Nature. 427 (6974): 510–7. Bibcode:2004Natur.427..510K. doi:10.1038/nature02312. PMID 14730319. S2CID 4400426.
  7. ^ "UniProt, Q562F6" (jezik: engleski). Pristupljeno 19. 11. 2021.
  8. ^ Kitajima TS; Sakuno T; Ishiguro K; Iemura S; Natsume T; Kawashima SA; Watanabe Y (maj 2006). "Shugoshin collaborates with protein phosphatase 2A to protect cohesin". Nature. 441 (7089): 46–52. Bibcode:2006Natur.441...46K. doi:10.1038/nature04663. PMID 16541025. S2CID 4425074.
  9. ^ "Salmonella infection data for Sgol2". Wellcome Trust Sanger Institute.
  10. ^ "Citrobacter infection data for Sgol2". Wellcome Trust Sanger Institute.
  11. ^ Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88 (S248). doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  12. ^ Mouse Resources Portal, Wellcome Trust Sanger Institute.
  13. ^ Skarnes, W. C.; Rosen, B.; West, A. P.; Koutsourakis, M.; Bushell, W.; Iyer, V.; Mujica, A. O.; Thomas, M.; Harrow, J.; Cox, T.; Jackson, D.; Severin, J.; Biggs, P.; Fu, J.; Nefedov, M.; De Jong, P. J.; Stewart, A. F.; Bradley, A. (2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–342. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
  14. ^ Dolgin E (juni 2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
  15. ^ Collins FS; Rossant J; Wurst W (januar 2007). "A mouse for all reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.

Dopunska literatura

uredi