TFIIA-alfa i betoliki faktor jest protein koji je kod ljudi kodiran genom GTF2A1L sa hromosoma 2.[4][5][6][7]

GTF2A1L
Identifikatori
AliasiGTF2A1L
Vanjski ID-jeviOMIM: 605358 MGI: 1919078 HomoloGene: 86732 GeneCards: GTF2A1L
Lokacija gena (miš)
Hromosom 17 (miš)
Hrom.Hromosom 17 (miš)[1]
Hromosom 17 (miš)
Genomska lokacija za GTF2A1L
Genomska lokacija za GTF2A1L
Bend17|17 E4Početak88,976,088 bp[1]
Kraj89,022,580 bp[1]
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa DNK
GO:0001105 transcription coactivator activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta transcription factor TFIIA complex
jedro
citoplazma
Biološki proces transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription by RNA polymerase II
kognitivna funkcija
transcription, DNA-templated
positive regulation of nucleic acid-templated transcription
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_172196
NM_001193487
NM_006872

NM_023630

RefSeq (bjelančevina)

NP_001180416
NP_006863

NP_076119

Lokacija (UCSC)n/aChr 17: 88.98 – 89.02 Mb
PubMed pretraga[2][3]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Amiokiselininska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 478 aminokiselina, a molkekulska iežina 52.444 Da.[8]

1020304050
MACLNPVPKLYRSVIEDVIEGVRNLFAEEGIEEQVLKDLKQLWETKVLQS
KATEDFFRNSIQSPLFTLQLPHSLHQTLQSSTASLVIPAGRTLPSFTTAE
LGTSNSSANFTFPGYPIHVPAGVTLQTVSGHLYKVNVPIMVTETSGRAGI
LQHPIQQVFQQLGQPSVIQTSVPQLNPWSLQATTEKSQRIETVLQQPAIL
PSGPVDRKHLENATSDILVSPGNEHKIVPEALLCHQESSHYISLPGVVFS
PQVSQTNSNVESVLSGSASMAQNLHDESLSTSPHGALHQHVTDIQLHILK
NRMYGCDSVKQPRNIEEPSNIPVSEKDSNSQVDLSIRVTDDDIGEIIQVD
GSGDTSSNEEIGSTRDADENEFLGNIDGGDLKVPEEEADSISNEDSATNS
SDNEDPQVNIVEEDPLNSGDDVSEQDVPDLFDTDNVIVCQYDKIHRSKNK
WKFYLKDGVMCFGGRDYVFAKAIGDAEW

Funkcija

uredi

Sklapanje i stabilnost kompleksa preinicijacije transkripcije RNK-polimeraze II na promotoru eukariotskog jedra uključuje efekte TFIIA na interakciju između TATA-vezivanja proteina (TBP) i DNK.

Ovaj gen kodira pandan koji je specifičan za zametnu ćeliju velike (alfa/beta) podjedinice općeg transkripcionog faktora TFIIA koji je u stanju da stabilizuje vezivanje TBP za DNK i može biti jedinstveno važan za biologiju sjemenika. Uočeno je da alternativna prerada za ovaj lokus daje dvije varijante transkripta, koje kodiraju različite izoforme.

Kotranskripcija ovog gena i susjednog uzvodnog gena stvara rijetki transkript (SALF), koji kodira fuzijski protein koji se sastoji od sekvence koja dijeli identitet sa svakim pojedinačnim genskim proizvodom.[7]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024154 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ Upadhyaya AB, Lee SH, DeJong J (Jul 1999). "Identification of a general transcription factor TFIIAalpha/beta homolog selectively expressed in testis". J Biol Chem. 274 (25): 18040–8. doi:10.1074/jbc.274.25.18040. PMID 10364255.
  5. ^ Xie W, Han S, Khan M, DeJong J (maj 2002). "Regulation of ALF gene expression in somatic and male germ line tissues involves partial and site-specific patterns of methylation". J Biol Chem. 277 (20): 17765–74. doi:10.1074/jbc.M200954200. PMID 11889132.
  6. ^ Huang M, Wang H, Li J, Zhou Z, Du Y, Lin M, Sha J (Mar 2006). "Involvement of ALF in human spermatogenesis and male infertility". Int J Mol Med. 17 (4): 599–604. doi:10.3892/ijmm.17.4.599. PMID 16525715.
  7. ^ a b "Entrez Gene: ALF TFIIA-alpha/beta-like factor".
  8. ^ "UniProt, Q9UNN4" (jezik: engleski). Pristupljeno 12. 11. 2021.

Dopunska literatura

uredi