Opće fragilno mjesto afidikolinskog tipa fra(3) (p24.2) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FRA3A sa hromosoma 3.[2]

FRA3A
Identifikatori
AliasiFRA3A
Vanjski ID-jeviGeneCards: FRA3A
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

n/a

n/a

RefSeq (bjelančevina)

n/a

n/a

Lokacija (UCSC)n/an/a
PubMed pretraga[1]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Funkcija

uredi

Većinu anaerobnih infekcija kod ljudi uzrokuje Bacteroides fragilis. Prisustvo ostrva patogenosti u genomu razlikuje patogene i komensalne sojeve B. fragilis. Ostrvo kodira metaloproteinazu II (MPII), potencijalni protein virulencije, jedan od tri homologna fragilizinska izozima (FRA; takođe nazvan toksin B. fragilis ili BFT). U jednoj studiji iz 2014., podnesen je izvještaj o biohemijskim pokazateljima strukturno-funkcionalnih karakteristikama otoka proteazne patogenosti B. fragilis i kristalnoj strukturi MPII pri rezoluciji 2,13 Å, u kombinaciji s detaljnom karakterizacijom preferencija cijepanja MPII i FRA3 (kao predstavnika izoforme FRA)d. Identificirani su korištenjem testa cepanja peptida velike propusnosti sa 18.583 supstratnih peptida. Predlaženo je da se evolucija MPII katalitskog domena može pratiti do ljudskih i arhebakterijskih proteinaza, dok je za MPII i FRA specifična nabrani prodomen.

Zaključeno je da je katalitski domen i MPII i FRA3 evoluirao različito u odnosu na prodomen, i da je prodomen evoluirao specifično, kako bi odgovarao patogenosti B. fragilis. Sve u svemu, dobijeni podaci pružaju uvid u evoluciju specifičnosti cijepanja i mehanizama aktivacije u virulentnim metaloproteinazama.[3]

Reference

uredi
  1. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  2. ^ "Entrez Gene: Fragile site, aphidicolin type, common, fra(3)(p24.2)". Pristupljeno 5. 8. 2014.
  3. ^ Robert C Liddington, Piotr Cieplak, Igor A Kozlov, Alex Y Strongin (2014): Structural and functional diversity of metalloproteinases encoded by the Bacteroides fragilis pathogenicity island, FEBS J281(11): 2487-502; pmid: 24698179; pmcid: pmc4047133; doi: 10.1111/febs.12804