Vjerovatna ATP-ovisna RNK-helikaza DDX56 jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom DDX56.[5][6]

DDX56
Identifikatori
AliasiDDX56
Vanjski ID-jeviOMIM: 608023 MGI: 1277172 HomoloGene: 6498 GeneCards: DDX56
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za DDX56
Genomska lokacija za DDX56
Bend7p13Početak44,565,804 bp[1]
Kraj44,575,051 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 11 (miš)
Hrom.Hromosom 11 (miš)[2]
Hromosom 11 (miš)
Genomska lokacija za DDX56
Genomska lokacija za DDX56
Bend11 A1|11 3.94 cMPočetak6,208,919 bp[2]
Kraj6,217,772 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleotide binding
hydrolase activity
ATP binding
GO:0008026 helicase activity
nucleic acid binding
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta membrana
jedro
Jedarce
citoplazma
Biološki proces rRNA processing
RNA secondary structure unwinding
ribosome biogenesis
positive regulation of neuron projection development
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_019082
NM_001257189

NM_026538

RefSeq (bjelančevina)

NP_001244118
NP_061955

NP_080814

Lokacija (UCSC)Chr 7: 44.57 – 44.58 MbChr 11: 6.21 – 6.22 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 547 aminokiselina, а molekulska težina 61.590 Da.[7]

1020304050
MEDSEALGFEHMGLDPRLLQAVTDLGWSRPTLIQEKAIPLALEGKDLLAR
ARTGSGKTAAYAIPMLQLLLHRKATGPVVEQAVRGLVLVPTKELARQAQS
MIQQLATYCARDVRVANVSAAEDSVSQRAVLMEKPDVVVGTPSRILSHLQ
QDSLKLRDSLELLVVDEADLLFSFGFEEELKSLLCHLPRIYQAFLMSATF
NEDVQALKELILHNPVTLKLQESQLPGPDQLQQFQVVCETEEDKFLLLYA
LLKLSLIRGKSLLFVNTLERSYRLRLFLEQFSIPTCVLNGELPLRSRCHI
ISQFNQGFYDCVIATDAEVLGAPVKGKRRGRGPKGDKASDPEAGVARGID
FHHVSAVLNFDLPPTPEAYIHRAGRTARANNPGIVLTFVLPTEQFHLGKI
EELLSGENRGPILLPYQFRMEEIEGFRYRCRDAMRSVTKQAIREARLKEI
KEELLHSEKLKTYFEDNPRDLQLLRHDLPLHPAVVKPHLGHVPDYLVPPA
LRGLVRPHKKRKKLSSSCRKAKRAKSQNPLRSFKHKGKKFRPTAKPS

Funkcija

uredi

Ovaj gen kodira člana proteinske porodice DEAD-kutija. Proteini iz ove kutije, karakterizirani konzerviranim motivom Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), su pretpostavljene RNK-helikaze. Oni su uključeni u brojne ćelijske procese koji uključuju promjenu sekundarne strukture RNK, kao što su inicijacija translacije, jedarna i mitohondrijska prerada, te sklapanje ribosoma i splajsosoma. Na osnovu njihovih obrazaca distribucije, vjeruje se da su neki članovi ove porodice uključeni u embriogenezu, spermatogenezu i ćelijski rast i diobu. Protein kodiran ovim genom pokazuje ARPaznu aktivnost u prisustvu polinukleotida i asocira na nukleoplazmatske 65S preribosomske čestice. Ovaj gen može biti uključen u sintezu ribosoma, najvjerovatnije tokom sastavljanja velike 60S ribosomske podjedinice.[6]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136271 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000004393 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Zirwes RF, Eilbracht J, Kneissel S, Schmidt-Zachmann MS (Jul 2000). "A Novel Helicase-Type Protein in the Nucleolus: Protein NOH61". Mol Biol Cell. 11 (4): 1153–67. doi:10.1091/mbc.11.4.1153. PMC 14838. PMID 10749921.
  6. ^ a b "Entrez Gene: DDX56 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56".
  7. ^ "UniProt, Q9NY93" (jezik: eng). Pristupljeno 24. 9. 2021.CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi