BRCA1-pridruženi ATM aktivator 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom BRAT1.[5]

BRAT1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4IFI

Identifikatori
AliasiBRAT1
Vanjski ID-jeviOMIM: 614506 MGI: 1891679 HomoloGene: 16776 GeneCards: BRAT1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za BRAT1
Genomska lokacija za BRAT1
Bend7p22.3Početak2,537,810 bp[1]
Kraj2,555,694 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 5 (miš)
Hrom.Hromosom 5 (miš)[2]
Hromosom 5 (miš)
Genomska lokacija za BRAT1
Genomska lokacija za BRAT1
Bend5|5 G2Početak140,690,766 bp[2]
Kraj140,705,134 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta citoplazma
membrana
jedro
nukleoplazma
Biološki proces mitochondrion localization
response to ionizing radiation
Ćelijski rast
positive regulation of protein phosphorylation
Ćelijska proliferacija
Ćelijska migracija
glucose metabolic process
cellular response to DNA damage stimulus
GO:0097285 apoptoza
positive regulation of cell growth
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_152743
NM_001350626
NM_001350627

NM_001276287
NM_172724
NM_181066

RefSeq (bjelančevina)

NP_689956
NP_001337555
NP_001337556

NP_001263216
NP_851411

Lokacija (UCSC)Chr 7: 2.54 – 2.56 MbChr 5: 140.69 – 140.71 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 821 aminokiselina, а molekulska težina 88.119 Da.[6]

1020304050
MDPECAQLLPALCAVLVDPRQPVADDTCLEKLLDWFKTVTEGESSVVLLQ
EHPCLVELLSHVLKVQDLSSGVLSFSLRLAGTFAAQENCFQYLQQGELLP
GLFGEPGPLGRATWAVPTVRSGWIQGLRSLAQHPSALRFLADHGAVDTIF
SLQGDSSLFVASAASQLLVHVLALSMRGGAEGQPCLPGGDWPACAQKIMD
HVEESLCSAATPKVTQALNVLTTTFGRCQSPWTEALWVRLSPRVACLLER
DPIPAAHSFVDLLLCVARSPVFSSSDGSLWETVARALSCLGPTHMGPLAL
GILKLEHCPQALRTQAFQVLLQPLACVLKATVQAPGPPGLLDGTADDATT
VDTLLASKSSCAGLLCRTLAHLEELQPLPQRPSPWPQASLLGATVTVLRL
CDGSAAPASSVGGHLCGTLAGCVRVQRAALDFLGTLSQGTGPQELVTQAL
AVLLECLESPGSSPTVLKKAFQATLRWLLSSPKTPGCSDLGPLIPQFLRE
LFPVLQKRLCHPCWEVRDSALEFLTQLSRHWGGQADFRCALLASEVPQLA
LQLLQDPESYVRASAVTAMGQLSSQGLHAPTSPEHAEARQSLFLELLHIL
SVDSEGFPRRAVMQVFTEWLRDGHADAAQDTEQFVATVLQAASRDLDWEV
RAQGLELALVFLGQTLGPPRTHCPYAVALPEVAPAQPLTEALRALCHVGL
FDFAFCALFDCDRPVAQKSCDLLLFLRDKIASYSSLREARGSPNTASAEA
TLPRWRAGEQAQPPGDQEPEAVLAMLRSLDLEGLRSTLAESSDHVEKSPQ
SLLQDMLATGGFLQGDEADCY

Funkcija

uredi

Protein kodiran ovim sveprisutno izraženim genom stupa u interakciju s proteinom koji potiskuje tumor BRCA1 (rak dojke 1) i ATM (ataksija telangiektazija) mutiranim proteinom. Smatra se da je ATM glavni kontrolor signalnih puteva kontrolni punkt ćelijskog ciklusa koji su potrebni za ćelijske odgovore na oštećenje DNK, kao što su dvolančani prekidi koji su inducirani ionizirajućim zračenjem i kompleksima sa BRCA1 u multiproteinskom kompleksu BASC (kompleks za nadzor genoma povezan sa BRAC1). Smatra se da protein kodiran ovim genom ima ulogu u putu oštećenja DNK, koji reguliraju BRCA1 i ATM.[5]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000106009 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000148 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: BRCA1-associated ATM activator 1".
  6. ^ "UniProt, Q6PJG6" (jezik: engleski). Pristupljeno 23. 9. 2021.

Vanjski linkovi

uredi
  • Lokacija ljudskog genoma BRAT1 i stranica sa detaljima o genu BRAT1 u UCSC Genome Browseru.
  • PDBe-KB provides an overview of all the structure information available in the PDB for Human BRCA1-associated ATM activator