はじめに シリーズ Useful R 9 「ドキュメント・プレゼンテーション生成」では、 knitrパッケージを使ってRマークダウンファイルをマークダウンファイルやHTMLファイルに変換する方法を解説しています。 2014年以降、RStudio開発チームはrmarkdownという新しいマークダウン処理用のパッケージ開発を進めています。かなりガチで進めています。 ここではrmarkdownパッケージの特徴や使い方を解説します。 rmarkdownパッケージではrender()という関数でドキュメントを生成します。 ですが、大雑把に言うとrender()はknitr::knit()でRマークダウンからマークダウンに変換して、Pandocを使ってマークダウンをHTMLやPDFなどに変換します。ですので、実際にできることは、ピュアknitrとそう変わりはありません。 なおknitrパッケージのkn
WordPress Publish blog posts from R + knitr to WordPress 2013-02-10 The RWordPress package allows one to publish blog posts from R to WordPress (but please note that this package has not been updated for many years, which is not a good sign). A blog post is essentially an HTML fragment, and knitr can create such a fragment from R Markdown with the markdown package. Below is how to do this with the
2014-07-06 ■knitrのデフォルトmarkdown.cssがくっそ見づらいから修正する R タイトルの通り、knitrで文芸的プログラミングしてコードとドキュメントを一体化できるのはいいんだけど、デフォルト設定のままだとすっごく見づらい。この原因は主に以下の4点。 フォントがsans-serif固定。 フォントサイズが13px。 行間が詰まり過ぎている。 ページの左端に文字が詰まる。 この見づらいレイアウトを修正するにはCustomizing Markdown Rendering – RStudio Supportにあるように、自前のcssを適用して自分好みに変えてやればいい。でも、デフォルトのcssを2度と使う気がない自分のような者やレポート作成するたびに同じ階層にcss用意すんの面倒って人はデフォルトcssであるmarkdown.cssを直接書き換えちゃいましょうっていうお
はじめに シリーズ Useful R 9 「ドキュメント・プレゼンテーション生成」(共立出版）のサポートページです。 シリーズ Useful R / 共立出版サイト / Amazon データの分析に携わる全ての人にとって、分析結果を他人に見せるためのレポート（ドキュメントやプレゼンテーション）の作成は悩みの種です。 レポート作成時のコピペ作業に辟易としている人も多いでしょう。 本書はRにより「素早く、簡単に、間違いのない」レポートを作成するノウハウが満載の書籍です。 現在Rではknitrを中心にドキュメントやプレゼンテーションを作成するツールが急速に整備されつつあります。 knitrはRによる分析結果を使って自動的にレポートを生成するためツールです。 本書によりknitrの基本的な使い方とカスタマイズ方法を習得し、Rを使って効率的にレポートを作成できるようになります。 この他に、ウェブスラ
Update: ravel.org looks like a better solution for knitr in Org-mode. Thanks, Charles Berry. The syntax of knitr/Sweave is not compatible with the Org-mode in Emacs. Ideally we should be able to write an R code chunk like this: #+begin_src R chunk options... x = rnorm(10) plot(x) #+end_src If we want to use knitr in the Org-mode, we have to cheat a little bit by putting the R code chunks in #+begi
楽をしたいという俺のモチベーション 最近 RStudio(Windows)でSweave(.Rnw)を使って一発でpdf作りたい - My Life as a Mock Quant なんてのを書いてますが、やはりTeXはしんどいぞと。俺のようなものには使いこなす事ができないぞという事で、 [(R) Mark down]⇒(Word, TeX(PDF)) なもっと楽できる道を探していきたい。そういうポストの建設予定地で随時更新。あと、俺の手元のWordは2007でやってるんで、そこんとこよろしく。 この辺の試行錯誤をまとめたもの 〜knitr+pandocではじめる〜『R MarkdownでReproducible Research』 from tera monagi 下記内容と重複多数ですが、ご参考。 用意 とりあえずRのコンソールで install.packages("knitr") l
The knitr package provides a lot of chunk options for customizing nearly all components of code chunks, such as the source code, text output, plots, and the language of the chunk. It also offers some options at the package level to customize the knitting process. This page documents all chunk options and package options available in knitr. The default values of these options are in parentheses in
R markdownファイル（Rmd）にRのコード片(以下、chunk)を埋め込む際のオプションがたくさんあって覚えきれないから、よく使いそうなものだけでもまとめておきたい。ここで言うchunkってのはR markdownファイル中に記述することが出来る ```{r eval=FALSE, error=FALSE} opts_chunk$set(prompt=TRUE, message=FALSE) summary(cars) ``` というようなRのコード片の事で、そのオプションってのはこの例だと"eval"や"error"に該当。 opts_chunk$set(prompt=TRUE, message=FALSE) と書いた内容（prompt=TRUE, message=FALSE）に関してはグローバルな設定となるので、他のchunkには書かなくてもここで設定したものが適用される。 要
RでHTMLを書くためのパッケージ。スクリプト上で文章も書けるので、とっても便利なパッケージ。日本語を使用するためにはRstudioが最新のものである必要があるので注意。ホントはSwaveも使いこなしたかったんだけど(pdfがいけるから)どうしても日本語環境にならなくて、一旦保留。しばらくはHTMLでやり過ごす（てか、HTMLをPDFに変換してくれれば良いわけだけど）。→ これに関しては似たようなことができました（このページの下の方に追記しています）。 ＊注）作者ページによると、 「knitrパッケージはR.で動的レポート生成のための明快なエンジンになるように設計されました。Sweaveの中でいくつかの長年の問題を解決し、1つのパッケージに他のアドオンパッケージの機能を兼ね備えています。(knitr ≈ Sweave + cacheSweave + pgfSweave + weaver +
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Rchievement of the day #3: Bloggin’ from R | ASCIImoose: William K. Morris’s Blog
