تولى الأمانة العامة منذ تأسيس الجبهة [[جورج حبش]] إلى أن تنحى في مؤتمرها السادس عام 2000 ليخلفه [[أبو علي مصطفى|مصطفى الزبيريالزبري]] (أبو علي مصطفى) الذي عاد إلى مناطق الحكم الذاتي الفلسطيني واغتيل يوم 27 أغسطس [[2001]]. خلفه [[أحمد سعدات|احمد سعدات]] الذي اعتقلته السلطة الفلسطينية بعد أن اتهمته وزملاءه إسرائيل بالوقوف وراء [[اغتيال رحبعام زئيفي|اغتيال وزير السياحة الإسرائيلي]] [[رحبعام زئيفي]] ردا على اغتيال أبي علي مصطفى. حوكم سعدات و4 من أعضاء الجبهة الشعبية وسجنوا في سجن [[أريحا|اريحا]] الفلسطيني ووضع تحت حراسة رجال أمن بريطانيين وأمريكان بعد صفقة بين رئيس [[السلطة الوطنية الفلسطينية|السلطة الفلسطينية]] وكل من [[الولايات المتحدة]] و[[المملكة المتحدة|بريطانيا]] و[[إسرائيل]]، وبالمقابل خففت إسرائيل حصارها عن عرفات<ref>{{استشهاد ويب
